本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2025-05-10 |
Allometry of cell types in planarians by single-cell transcriptomics
2025-May-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm7042
PMID:40333969
|
research paper | 研究通过单细胞RNA测序技术探索了涡虫中细胞类型的异速生长关系 | 首次利用scRNA-seq技术研究涡虫细胞类型的异速生长,揭示了不同大小涡虫中细胞类型比例的变化及其与能量储存的关系 | 研究仅针对无性繁殖的涡虫,结果可能不适用于其他生物 | 探索细胞类型异速生长的分子和细胞机制 | 无性繁殖的涡虫 | 单细胞转录组学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 不同大小的涡虫样本 | NA | NA | NA | NA |
| 662 | 2025-05-10 |
Impaired ketogenesis in Leydig Cells drives testicular aging
2025-May-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59591-8
PMID:40328805
|
研究论文 | 该研究揭示了睾丸衰老过程中Leydig细胞酮生成受损的关键作用及其机制 | 首次发现Leydig细胞中酮生成关键酶Hmgcs2表达随年龄下降,并阐明β-羟基丁酸通过Foxo3a延缓细胞衰老的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类睾丸衰老的类似机制仍需验证 | 探究睾丸衰老的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 年轻与老年小鼠的Leydig细胞 | 生殖生物学 | 睾丸功能障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 小鼠衰老模型 | 基因表达数据、代谢物浓度数据 | 年轻与老年小鼠睾丸组织及Leydig细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 663 | 2025-05-10 |
Integrative bioinformatics and machine learning identify key crosstalk genes and immune interactions in head and neck cancer and Hodgkin lymphoma
2025-May-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-99017-5
PMID:40328901
|
research paper | 该研究通过整合生物信息学和机器学习技术,识别头颈癌和霍奇金淋巴瘤中的关键交叉基因和免疫相互作用 | 首次探索头颈癌和霍奇金淋巴瘤之间的分子交叉作用,并利用机器学习算法筛选关键生物标志物 | 研究依赖于公开数据集,未进行实验验证 | 阐明头颈癌和霍奇金淋巴瘤的共享分子机制,识别潜在诊断生物标志物和治疗靶点 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)和霍奇金淋巴瘤(HL) | 生物信息学 | 头颈癌, 霍奇金淋巴瘤 | RNA测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 加权基因共表达网络分析(WGCNA) | LASSO回归, 随机森林, SVM-RFE | RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 664 | 2025-05-10 |
Recurrence of acute allergic asthma depends on the role of ILC2 driven by Il1rl1 signaling
2025-May-06, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02220-0
PMID:40329299
|
研究论文 | 研究通过建立急性过敏性哮喘复发小鼠模型,揭示了ILC2s通过Il1rl1信号通路在哮喘复发中的关键作用 | 首次发现ILC2s通过Il1rl1信号通路驱动急性过敏性哮喘的复发,并验证了Il1rl1缺失可显著抑制哮喘复发 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类患者中验证 | 探索哮喘复发的细胞和分子机制,寻找预防哮喘恶化的新治疗策略 | 急性过敏性哮喘小鼠模型 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞转录组学、流式细胞术、基因敲除实验 | 小鼠模型 | 转录组数据、流式细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 665 | 2025-05-10 |
Investigating the mechanisms by which low NAT1 expression in tumor cells contributes to chemo-resistance in colorectal cancer
2025-May-06, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-025-01882-4
PMID:40329330
|
研究论文 | 研究低NAT1表达在结直肠癌细胞中如何导致化疗耐药性的机制 | 揭示了NAT1在调节化疗敏感性、细胞代谢和血管生成中的多方面作用,并提出了NAT1作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,临床前和临床验证仍需进一步研究 | 评估NAT1在介导结直肠癌化疗耐药性中的作用,寻找克服这一临床挑战的新策略 | 结直肠癌细胞系CaCO2和HCT116,以及肿瘤组织和邻近正常组织 | 癌症研究 | 结直肠癌 | 生物信息学分析、代谢组学、下一代测序(NGS)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、Cellchat检测、Western blot | NA | 基因表达数据、代谢数据、蛋白质数据 | 结直肠癌细胞系和肿瘤组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 666 | 2025-05-10 |
Integrative epidemiology and immunotranscriptomics uncover a risk and potential mechanism for cutaneous lymphoma unmasking or progression with dupilumab therapy
2025-May, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.10.028
PMID:39521279
|
研究论文 | 本研究通过流行病学和免疫转录组学方法,探讨了dupilumab治疗与皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)发生或进展的风险及潜在机制 | 首次结合FDA不良事件报告系统(FAERS)和大规模RNA测序数据,揭示了dupilumab可能通过IL-13受体阻断机制促进CTCL的潜在风险 | 研究基于FAERS数据库的回顾性分析,存在报告偏倚,且缺乏实验验证 | 评估dupilumab与CTCL关联的安全信号并探究其潜在机制 | 使用dupilumab治疗的患者及CTCL病例 | 免疫学与肿瘤学 | 皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL) | RNA测序(包括bulk和单细胞RNA测序) | NA | 药物不良事件报告数据、转录组数据 | FAERS数据库中181,575份dupilumab相关不良事件报告(其中606例为肿瘤报告) | NA | NA | NA | NA |
| 667 | 2025-05-08 |
Abnormal lineage differentiation of peri-implantation aneuploid embryos revealed by single-cell RNA sequencing
2025-May, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70326
PMID:40329849
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 668 | 2025-05-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Immune Landscape of Granulomatous Mastitis
2025-May-08, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02310-8
PMID:40338490
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示肉芽肿性乳腺炎的免疫图谱 | 首次使用单细胞RNA测序技术对肉芽肿性乳腺炎病变组织与正常乳腺组织进行比较分析,揭示了免疫细胞的浸润情况、免疫紊乱现象以及多种信号通路的异常激活 | 研究样本量未明确说明,可能影响结果的普遍性 | 探究肉芽肿性乳腺炎的免疫学特征和潜在发病机制 | 肉芽肿性乳腺炎病变组织和正常乳腺组织 | 数字病理学 | 乳腺炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 669 | 2025-05-09 |
Single-cell RNA Sequencing Analysis Reveals the Regulatory Functions of Copines Family Genes in Testicular Cancer Progression
2025-May-06, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
|
研究论文 | 本研究基于单细胞数据探讨了Copines家族基因在睾丸癌不同细胞亚群中的表达模式及调控功能 | 首次在单细胞水平上研究Copines家族基因在睾丸癌中的调控作用 | NA | 探究Copines家族基因在睾丸癌中的调控机制 | 睾丸癌细胞亚群 | 数字病理学 | 睾丸癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 670 | 2025-05-09 |
Integrated multiomics and Mendelian randomization identify CHIT1 as a novel sepsis biomarker and therapeutic target
2025-May-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-99619-z
PMID:40325173
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和孟德尔随机化方法,发现CHIT1作为脓毒症的新型生物标志物和治疗靶点 | 首次将CHIT1鉴定为脓毒症的新生物标志物和潜在药物靶点,揭示了其在加剧中性粒细胞过度炎症和免疫抑制中的作用 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床验证 | 寻找能预测脓毒症患者预后的新关键生物标志物并探索其分子机制 | 脓毒症患者 | 生物信息学 | 脓毒症 | 批量转录组测序、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、孟德尔随机化(MR)分析 | 单变量Cox回归模型 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE65682等)和eQTLGen Consortium及IEU OpenGWAS项目数据 | NA | NA | NA | NA |
| 671 | 2025-05-09 |
Modulation of senescent Lepr+ skeletal stem cells via suppression of leptin-induced STAT3‒FGF7 axis activation alleviates abnormal subchondral bone remodeling and osteoarthritis progression
2025-May-05, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04342-1
PMID:40325465
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体内外实验,揭示了瘦素受体阳性骨骼干细胞(Lepr+ SSCs)在骨关节炎(OA)进展中的衰老机制及其通过STAT3-FGF7轴加剧软骨下骨异常重塑的作用 | 首次揭示了Lepr+ SSCs通过瘦素-Lepr信号通路激活STAT3-FGF7轴促进OA进展的新机制,为OA治疗提供了新的靶点 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类OA患者中进行验证 | 探究骨骼干细胞衰老在骨关节炎进展中的作用及其分子机制 | 小鼠创伤后骨关节炎(PTOA)模型中的Lepr+骨骼干细胞 | 骨生物学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、microCT、病理分析 | 小鼠PTOA模型 | 基因表达数据、影像数据、组织病理数据 | 未明确说明具体样本数量(小鼠模型) | NA | NA | NA | NA |
| 672 | 2025-05-09 |
BRAF mutation cancer, colorectal cancer, tumor associated lymph node structure and immune microenvironment study: MAPK protein kinase molecular action and SIRPG-CD47 protein signaling pathway
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142191
PMID:40101830
|
研究论文 | 本研究探讨了BRAF基因突变对结直肠癌免疫微环境重塑的影响,特别是对肿瘤相关淋巴结构成熟和功能的影响 | 通过单细胞RNA测序、伪时间轨迹分析和空间转录组分析,揭示了BRAF突变对T细胞亚群和B细胞亚群的影响,以及其在肿瘤免疫微环境重塑中的作用 | 研究样本量未明确说明,可能影响结果的普遍性 | 系统评估BRAF基因突变对结直肠癌免疫微环境重塑的影响 | 结直肠癌患者的临床样本 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、伪时间轨迹分析、空间转录组分析、免疫组织化学、多重荧光染色技术 | NA | RNA测序数据、免疫组织化学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 673 | 2025-05-08 |
ABCC3 Is a Differential Marker of CYP11B2-Negative Zona Glomerulosa Cells in Human Adrenal Cortex
2025-May-07, Endocrine pathology
IF:11.3Q1
DOI:10.1007/s12022-025-09862-3
PMID:40332623
|
research paper | 该研究探讨了ABCC3在人肾上腺皮质中的表达和功能,特别是在原发性醛固酮增多症背景下,与CYP11B2的关系 | 发现ABCC3作为CYP11B2阴性ZG细胞的新标记物,为区分正常肾上腺分区和醛固酮生成病变提供了新的组织病理学工具 | 研究主要关注ABCC3在特定肾上腺病变中的表达模式,未涉及其在其他疾病或组织中的潜在作用 | 研究ABCC3在人肾上腺皮质中的表达和功能,特别是在原发性醛固酮增多症中的作用 | 人肾上腺皮质细胞、醛固酮生成腺瘤(APAs)、皮质醇生成腺瘤和非功能性腺瘤 | 分子生物学 | 原发性醛固酮增多症 | 空间转录组学、免疫荧光共定位 | NA | mRNA/蛋白质表达数据 | 多种肾上腺腺瘤样本(APAs、皮质醇生成腺瘤、非功能性腺瘤)及相邻肾上腺皮质组织 | NA | NA | NA | NA |
| 674 | 2025-05-08 |
Single-cell analysis reveals the implication of vascular endothelial cell-intrinsic ANGPT2 in human intracranial aneurysm
2025-May-06, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae186
PMID:39187926
|
research paper | 通过单细胞RNA测序揭示血管内皮细胞内在的ANGPT2在人颅内动脉瘤中的意义 | 首次通过单细胞RNA测序全面分析颅内动脉瘤的细胞组成和血管内皮细胞的转录组变化,并发现ANGPT2在动脉瘤形成中的作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,需要进一步的实验验证 | 探索颅内动脉瘤的发病机制和潜在治疗靶点 | 人颅内动脉瘤和对照动脉组织 | digital pathology | cardiovascular disease | scRNA-seq | zebrafish model | RNA sequencing data | 43,462个细胞的转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 675 | 2025-05-07 |
Single-cell RNA Sequencing Identifies Prognostic Biomarkers in Extramedullary Multiple Myeloma
2025-May-05, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术识别了髓外多发性骨髓瘤的预后生物标志物 | 利用LASSO方法开发预后特征,并通过外部MM队列验证其效能,揭示了CD4+ T细胞作为与MM进展相关的主要免疫细胞类型 | 研究依赖于公共数据库的转录组数据,可能受限于数据的质量和样本量 | 研究与髓外进展相关的多发性骨髓瘤克隆进化特征,识别新的预后生物标志物 | 多发性骨髓瘤(MM)患者 | digital pathology | multiple myeloma | scRNA-seq, LASSO | risk score model | transcriptomic profiles, scRNA-seq data | 126 DEGs identified, external MM cohorts for validation | NA | NA | NA | NA |
| 676 | 2025-05-07 |
Identifying the Pattern Characteristics of Anoikis-Related Genes in Keloid
2025-May, Advances in wound care
IF:5.8Q1
DOI:10.1089/wound.2024.0027
PMID:38775414
|
research paper | 该研究首次全面分析了anoikis相关基因(ARGs)在瘢痕疙瘩(KD)中的作用,并鉴定了六个核心ARGs | 首次研究ARGs在KD中的潜在价值,并鉴定了六个核心ARGs及其与KD免疫浸润的关联 | 研究仅基于三个KF RNA-seq数据集,样本量有限 | 探究ARGs在KD中的表达特征及其分子机制 | 瘢痕疙瘩(KD)和anoikis相关基因(ARGs) | 生物信息学 | 瘢痕疙瘩 | RNA-seq, 单细胞测序, LASSO-Cox回归分析 | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | 三个KF RNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 677 | 2025-05-07 |
Exploring genetic and immune cell dynamics in systemic lupus erythematosus patients with Epstein-Barr virus infection via machine learning
2025-May-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keae537
PMID:39361430
|
research paper | 本研究通过机器学习方法探索系统性红斑狼疮(SLE)患者与EB病毒感染相关的关键基因和免疫细胞动态 | 首次识别出IFI27作为SLE患者EBV感染的关键基因,并揭示了其对CD4 CTL和B细胞亚型的影响 | 研究样本量有限,且仅基于公开数据集分析 | 阐明SLE患者EBV感染的分子机制并寻找潜在诊断和治疗靶点 | 系统性红斑狼疮患者与EB病毒感染 | machine learning | systemic lupus erythematosus | RNA-seq, single-cell RNA sequencing, CIBERSORTx | machine-learning algorithms | gene expression data | 多个GEO数据集(GSE50772、GSE81622、GSE85599、GSE45918) | NA | NA | NA | NA |
| 678 | 2025-05-07 |
Single-cell multiomics reveals a gene regulatory circuit driving leukemia cell differentiation
2025-May, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03309-z
PMID:39984714
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了ATRA诱导白血病细胞分化的基因调控回路 | 整合单细胞染色质可及性和转录组分析,发现SPI1和CEBPE组成的正反馈基因调控回路驱动白血病细胞分化 | 研究主要基于NB4细胞系,在其他白血病细胞类型中的普适性需要进一步验证 | 探索ATRA诱导急性早幼粒细胞白血病细胞分化的调控机制 | PML/RARα急性早幼粒细胞白血病(APL)细胞系NB4,以及非APL白血病细胞系HL60和K562 | 单细胞多组学 | 急性早幼粒细胞白血病 | 单细胞染色质可及性分析,单细胞转录组分析 | NA | 单细胞多组学数据 | NB4、HL60和K562白血病细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 679 | 2025-10-07 |
TREM2+ macrophages accumulate in childhood IgA nephropathy and soluble TREM2 represents a reliable non-invasive biomarker
2025-May-05, Experimental physiology
IF:2.6Q2
DOI:10.1113/EP092716
PMID:40321057
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现儿童IgA肾病中TREM2+巨噬细胞积累,并证实血浆可溶性TREM2可作为该病的非侵入性生物标志物 | 首次在儿童IgA肾病中发现TREM2+巨噬细胞亚群的积累,并验证血浆sTREM2水平与疾病严重程度的相关性 | 样本量有限(38例患者),需更大规模研究验证 | 探索儿童IgA肾病的发病机制并寻找非侵入性生物标志物 | 儿童IgA肾病患者 | 单细胞测序 | IgA肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 38例儿童IgA肾病患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 680 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics of human skin reveals age-associated specificity of distinct cell populations
2025-May-05, Archives of dermatological research
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s00403-025-04222-x
PMID:40323328
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示人类皮肤细胞在衰老过程中的功能特化和分子变化 | 首次在避光区域皮肤中系统揭示衰老相关的细胞特异性变化和细胞间通讯减少 | 样本量相对有限,仅关注健康供体的避光区域皮肤 | 阐明皮肤细胞在衰老过程中的分子和功能动态变化 | 人类皮肤细胞,重点关注真皮成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 皮肤衰老 | 单细胞RNA测序,差异基因表达分析,GO富集分析,KEGG通路分析,伪时序分析,CellChat分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过5,000个细胞,包括成纤维细胞、角质形成细胞和免疫细胞等多种皮肤细胞类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |