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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2025-05-12 |
Identification of the "Collagen-Macrophage" sub-category of patients with colorectal cancer as an extension of the CMS4 subtype with THBS2 as a therapeutic target
2025-May-08, BMC gastroenterology
IF:2.5Q2
DOI:10.1186/s12876-025-03918-8
PMID:40340827
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research paper | 该研究通过整合结肠癌转录组和单细胞转录组数据集,识别出一类富含'胶原蛋白-TAMs'的结直肠癌患者亚群,称为CM类,并发现CAF衍生的THBS2可作为潜在生物标志物 | 提出了一种新的结直肠癌患者分类系统CM类,作为传统CMS分类系统的扩展,并发现THBS2作为新的潜在免疫治疗联合靶点 | 未提及研究样本的具体数量或研究人群的详细信息 | 提高结直肠癌的分类准确性和治疗效果 | 结直肠癌患者及其肿瘤微环境 | digital pathology | colorectal cancer | 转录组测序, 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 642 | 2025-05-12 |
High-throughput strategies for monoclonal antibody screening: advances and challenges
2025-May-08, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-025-00513-z
PMID:40340930
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综述 | 本文综述了高通量单克隆抗体筛选策略的最新进展与挑战 | 介绍了抗体库展示、单B细胞抗体技术和单细胞测序等新技术,显著降低了成本并提高了抗体开发效率 | 未具体讨论这些新技术在实际应用中可能遇到的具体技术障碍或限制条件 | 探讨高通量抗体开发的最新进展及其相对于传统方法的潜在优势 | 单克隆抗体的高通量筛选技术 | 生物医学工程 | NA | 抗体库展示、单B细胞抗体技术、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 643 | 2025-05-12 |
The cancer stem cells characteristics analysis of LGR5 + cells that influence lung cancer risk by using single cell RNA-seq analysis
2025-May-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-00585-3
PMID:40341189
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research paper | 通过单细胞RNA测序分析LGR5+细胞的癌症干细胞特性,研究其对肺癌风险的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别LGR5+干细胞在肺腺癌进展中的关键作用,并发现其hub基因如HLA-DPB1、CD74、CTSH和HLA-DRB5介导独特的转录状态 | 研究仅基于公开数据库GSE149655的数据,实验验证部分仅使用了BEAS-2B和A549细胞系,可能无法完全代表临床样本的复杂性 | 探索肺腺癌中癌症干细胞的特性及其在癌症进展中的作用 | 肺腺癌(LUAD)中的LGR5+干细胞 | digital pathology | lung cancer | single cell RNA-seq, qRT-PCR, western blotting, wound healing, trans-well assays, EdU tests, flow cytometry | NA | RNA-seq数据 | GSE149655数据集中的单细胞RNA-seq数据,以及BEAS-2B和A549细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 644 | 2025-05-12 |
Integrated analysis of MIOX gene in prognosis of clear-cell renal cell carcinoma
2025-May-08, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07698-7
PMID:40341358
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研究论文 | 本研究通过整合分析MIOX基因在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)预后中的作用,揭示了其作为独立预后标志物的潜力 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组分析确定了MIOX在ccRCC中的特异性,并验证了其作为独立预后标志物的价值 | 研究主要基于TCGA数据库,缺乏外部验证队列 | 探索铁死亡相关基因对ccRCC患者预后的影响 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者 | 癌症基因组学 | 肾癌 | scRNA-seq, 空间转录组分析, Lasso回归分析, Kaplan-Meier分析 | NA | 基因表达数据 | TCGA数据库中的ccRCC样本与正常组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 645 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals an Aggressive Basal-Like Tumor Cell Subpopulation Associated With Poor Prognosis in Intrahepatic Cholangiocarcinoma
2025-May, Journal of gastroenterology and hepatology
IF:3.7Q2
DOI:10.1111/jgh.16915
PMID:39993788
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析发现与肝内胆管癌不良预后相关的侵袭性基底样肿瘤细胞亚群 | 首次在肝内胆管癌中鉴定出具有基底上皮特征的侵袭性肿瘤细胞亚群,并揭示其通过HGF-MET轴与炎症性癌相关成纤维细胞的相互作用机制 | 样本量相对有限(23例患者),需要更大规模研究验证发现 | 解析肝内胆管癌的肿瘤异质性并识别新的治疗靶点 | 肝内胆管癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 免疫组织化学染色, 多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, bulk RNA-seq数据, 图像数据 | 26个肿瘤样本(来自23例患者)+ 6个肿瘤切片(来自6例患者)+ 两个公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 646 | 2025-10-06 |
Centromere protein U mediates the ubiquitination and degradation of RPS3 to facilitate temozolomide resistance in glioblastoma
2025-May, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy
IF:15.8Q1
DOI:10.1016/j.drup.2025.101214
PMID:40023134
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研究论文 | 本研究揭示了着丝粒蛋白U通过介导RPS3的泛素化降解促进胶质母细胞瘤对替莫唑胺耐药的新机制 | 首次发现CENPU通过TRIM5α介导RPS3在K214位点的多聚泛素化降解,激活ERK1/2通路并上调RAD51表达,从而增强DNA损伤修复能力 | NA | 阐明胶质母细胞瘤对替莫唑胺耐药的分子机制并探索增强其敏感性的方法 | 胶质母细胞瘤类器官、胶质瘤小鼠模型、胶质母细胞瘤细胞 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序、单细胞测序、免疫组织化学、免疫荧光、慢病毒转导、免疫共沉淀、质谱分析、碱性彗星实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、组织病理学图像 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 647 | 2025-10-06 |
Hydrogen sulfide improves depression-like behaviors in CUMS-induced mice by regulating autophagy
2025-May, Psychoneuroendocrinology
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.psyneuen.2025.107418
PMID:40023886
|
研究论文 | 本研究探讨硫化氢通过调节自噬改善CUMS诱导小鼠抑郁样行为的机制 | 首次揭示硫化氢通过激活PI3K/AKT/mTOR信号通路抑制自噬,改善突触可塑性损伤,发挥抗抑郁作用 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探究硫化氢通过PI3K/AKT/mTOR信号通路调节自噬和突触可塑性的抗抑郁机制 | 慢性不可预见温和应激(CUMS)诱导的抑郁模型小鼠 | 神经科学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 蛋白质印迹 | 动物行为学模型 | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 行为学数据 | CUMS诱导的抑郁模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 648 | 2025-05-12 |
Characterising Shared and Specific Cell-Cell Communication in Cardiomyopathy Subtypes From Single-Cell Transcriptomics Data
2025-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70554
PMID:40344498
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研究论文 | 通过单细胞转录组数据分析心肌病亚型中细胞间通讯的共同和特异性特征 | 揭示了心肌病亚型中细胞间通讯的共同和特异性通路,为靶向治疗提供了新见解 | 研究仅基于转录组数据,未考虑蛋白质水平和功能验证 | 解析心肌病亚型中细胞间通讯的分子机制 | 心律失常性心肌病(ACM)、扩张型心肌病(DCM)、肥厚型心肌病(HCM)和缺血性心肌病(ICM)患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 来自ACM、DCM、HCM、ICM患者和健康供体的心室区域样本 | NA | NA | NA | NA |
| 649 | 2025-05-11 |
Mature tertiary lymphoid structures evoke intra-tumoral T and B cell responses via progenitor exhausted CD4+ T cells in head and neck cancer
2025-May-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59341-w
PMID:40335494
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research paper | 研究头颈癌中成熟三级淋巴结构(mTLS)通过祖细胞耗竭的CD4+ T细胞促进肿瘤内T和B细胞反应的机制 | 揭示了mTLS通过祖细胞耗竭的CD4+ T细胞激活B细胞和DC-LAMP树突状细胞,从而支持CD8+ T细胞活化的新机制 | 研究仅针对头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者,未涉及其他癌症类型 | 探究mTLS在肿瘤免疫中的作用机制及其对免疫检查点阻断(ICB)治疗反应的影响 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者的肿瘤组织 | 肿瘤免疫学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序、抗原受体测序和空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)患者肿瘤组织样本(具体数量未提及) | NA | NA | NA | NA |
| 650 | 2025-05-11 |
Spatial transcriptomics reveals tumor microenvironment heterogeneity in EBV positive diffuse large B cell lymphoma
2025-May-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-00410-x
PMID:40335578
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研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术,研究EBV阳性弥漫大B细胞淋巴瘤的肿瘤微环境异质性及其与预后的关系 | 首次整合10X Visium空间转录组学和scRNA-seq技术,揭示EBV+DLBCL中PD-1/PD-L1信号通路的免疫抑制特性,并验证PD-1/PD-L1抑制剂BMS202的治疗潜力 | 研究样本量未明确说明,且功能验证仅限于EBV+Farage细胞系 | 探究EBV+DLBCL肿瘤微环境异质性及其对患者生存的影响 | EBV阳性弥漫大B细胞淋巴瘤(EBV+DLBCL) | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 10X Visium空间转录组学、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 651 | 2025-05-11 |
Immunodynamic axis of fibroblast-driven neutrophil infiltration in acute pancreatitis: NF-κB-HIF-1α-CXCL1
2025-May-07, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-025-00734-6
PMID:40335899
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研究论文 | 本研究揭示了成纤维细胞通过NF-κB-HIF-1α-CXCL1信号轴驱动中性粒细胞浸润在急性胰腺炎中的免疫动力学机制 | 首次证明成纤维细胞激活是中性粒细胞浸润的免疫驱动因素之一,并阐明NF-κB-HIF-1α通路驱动的糖酵解是成纤维细胞分泌CXCL1趋化中性粒细胞的内在分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证不足 | 阐明急性胰腺炎中成纤维细胞驱动中性粒细胞过度浸润的分子机制 | C57BL/6J小鼠模型和人类胰腺星状细胞 | 免疫学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、细胞迁移实验、细胞转染、免疫荧光、流式细胞术、Western blot、RT-qPCR、共免疫沉淀(co-IP) | 小鼠急性胰腺炎模型 | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据 | 未明确说明具体样本数量,使用C57BL/6J小鼠和人类胰腺星状细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 652 | 2025-05-11 |
Surgery/anesthesia may cause monocytes to promote tumor development
2025-May-07, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01213-6
PMID:40335909
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术探讨了手术/麻醉对围手术期外周血单个核细胞的影响 | 首次在围手术期使用单细胞测序技术深入分析手术/麻醉对免疫细胞的影响,特别是发现单核细胞可能促进肿瘤发展 | 样本量较小(仅4名患者),观察时间较短(仅48小时) | 研究手术/麻醉对围手术期患者免疫系统的影响 | 接受大手术患者的围手术期外周血单个核细胞 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞测序, RT-PCR | NA | 单细胞RNA测序数据 | 4名手术患者 | NA | NA | NA | NA |
| 653 | 2025-05-11 |
PAQR5 drives the malignant progression and shapes the immunosuppressive microenvironment of hepatocellular carcinoma by activating the NF-κB signaling
2025-May-07, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00785-z
PMID:40336138
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研究论文 | 本研究揭示了PAQR5通过激活NF-κB信号通路促进肝细胞癌(HCC)恶性进展和免疫抑制微环境形成的分子机制 | 首次系统阐明了PAQR5在HCC中的致癌作用机制,并通过多组学分析和实验验证揭示了其通过ERK/NF-κB信号轴驱动肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于细胞和动物模型,临床转化应用仍需进一步验证 | 阐明PAQR5在肝细胞癌进展中的作用机制及其对肿瘤免疫微环境的调控 | 肝细胞癌组织和细胞系 | 肿瘤生物学 | 肝细胞癌 | 多组学分析(包括bulk转录组、单细胞转录组和空间转录组)、体外实验和体内实验 | NA | 转录组数据、实验数据 | 未明确说明具体样本量,但涉及多个转录组队列和实验模型 | NA | NA | NA | NA |
| 654 | 2025-05-10 |
Loss of ADAP1/CentA1 Protects Against Autoimmune Demyelination
2025-May-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202403078R
PMID:40326762
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研究论文 | 本文研究了ADAP1/CentA1在中枢神经系统自身免疫中的作用,发现其缺失可以部分抵抗实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)的发展 | 揭示了ADAP1/CentA1在中枢神经系统自身免疫中的新功能,特别是在调节Tregs、单核细胞和NK细胞功能方面的作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性的验证尚不充分 | 探究ADAP1/CentA1在中枢神经系统自身免疫疾病中的机制作用 | ADAP1/CentA1缺陷小鼠和实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)模型 | 神经免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | EAE小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 655 | 2025-05-10 |
Allometry of cell types in planarians by single-cell transcriptomics
2025-May-09, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adm7042
PMID:40333969
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research paper | 研究通过单细胞RNA测序技术探索了涡虫中细胞类型的异速生长关系 | 首次利用scRNA-seq技术研究涡虫细胞类型的异速生长,揭示了不同大小涡虫中细胞类型比例的变化及其与能量储存的关系 | 研究仅针对无性繁殖的涡虫,结果可能不适用于其他生物 | 探索细胞类型异速生长的分子和细胞机制 | 无性繁殖的涡虫 | 单细胞转录组学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 不同大小的涡虫样本 | NA | NA | NA | NA |
| 656 | 2025-05-10 |
Impaired ketogenesis in Leydig Cells drives testicular aging
2025-May-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59591-8
PMID:40328805
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研究论文 | 该研究揭示了睾丸衰老过程中Leydig细胞酮生成受损的关键作用及其机制 | 首次发现Leydig细胞中酮生成关键酶Hmgcs2表达随年龄下降,并阐明β-羟基丁酸通过Foxo3a延缓细胞衰老的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类睾丸衰老的类似机制仍需验证 | 探究睾丸衰老的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 年轻与老年小鼠的Leydig细胞 | 生殖生物学 | 睾丸功能障碍 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 小鼠衰老模型 | 基因表达数据、代谢物浓度数据 | 年轻与老年小鼠睾丸组织及Leydig细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 657 | 2025-05-10 |
Integrative bioinformatics and machine learning identify key crosstalk genes and immune interactions in head and neck cancer and Hodgkin lymphoma
2025-May-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-99017-5
PMID:40328901
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research paper | 该研究通过整合生物信息学和机器学习技术,识别头颈癌和霍奇金淋巴瘤中的关键交叉基因和免疫相互作用 | 首次探索头颈癌和霍奇金淋巴瘤之间的分子交叉作用,并利用机器学习算法筛选关键生物标志物 | 研究依赖于公开数据集,未进行实验验证 | 阐明头颈癌和霍奇金淋巴瘤的共享分子机制,识别潜在诊断生物标志物和治疗靶点 | 头颈鳞状细胞癌(HNSCC)和霍奇金淋巴瘤(HL) | 生物信息学 | 头颈癌, 霍奇金淋巴瘤 | RNA测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 加权基因共表达网络分析(WGCNA) | LASSO回归, 随机森林, SVM-RFE | RNA测序数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 658 | 2025-05-10 |
Recurrence of acute allergic asthma depends on the role of ILC2 driven by Il1rl1 signaling
2025-May-06, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02220-0
PMID:40329299
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研究论文 | 研究通过建立急性过敏性哮喘复发小鼠模型,揭示了ILC2s通过Il1rl1信号通路在哮喘复发中的关键作用 | 首次发现ILC2s通过Il1rl1信号通路驱动急性过敏性哮喘的复发,并验证了Il1rl1缺失可显著抑制哮喘复发 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类患者中验证 | 探索哮喘复发的细胞和分子机制,寻找预防哮喘恶化的新治疗策略 | 急性过敏性哮喘小鼠模型 | 免疫学 | 哮喘 | 单细胞转录组学、流式细胞术、基因敲除实验 | 小鼠模型 | 转录组数据、流式细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 659 | 2025-05-10 |
Investigating the mechanisms by which low NAT1 expression in tumor cells contributes to chemo-resistance in colorectal cancer
2025-May-06, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-025-01882-4
PMID:40329330
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研究论文 | 研究低NAT1表达在结直肠癌细胞中如何导致化疗耐药性的机制 | 揭示了NAT1在调节化疗敏感性、细胞代谢和血管生成中的多方面作用,并提出了NAT1作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,临床前和临床验证仍需进一步研究 | 评估NAT1在介导结直肠癌化疗耐药性中的作用,寻找克服这一临床挑战的新策略 | 结直肠癌细胞系CaCO2和HCT116,以及肿瘤组织和邻近正常组织 | 癌症研究 | 结直肠癌 | 生物信息学分析、代谢组学、下一代测序(NGS)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、Cellchat检测、Western blot | NA | 基因表达数据、代谢数据、蛋白质数据 | 结直肠癌细胞系和肿瘤组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 660 | 2025-05-10 |
Integrative epidemiology and immunotranscriptomics uncover a risk and potential mechanism for cutaneous lymphoma unmasking or progression with dupilumab therapy
2025-May, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.10.028
PMID:39521279
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研究论文 | 本研究通过流行病学和免疫转录组学方法,探讨了dupilumab治疗与皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)发生或进展的风险及潜在机制 | 首次结合FDA不良事件报告系统(FAERS)和大规模RNA测序数据,揭示了dupilumab可能通过IL-13受体阻断机制促进CTCL的潜在风险 | 研究基于FAERS数据库的回顾性分析,存在报告偏倚,且缺乏实验验证 | 评估dupilumab与CTCL关联的安全信号并探究其潜在机制 | 使用dupilumab治疗的患者及CTCL病例 | 免疫学与肿瘤学 | 皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL) | RNA测序(包括bulk和单细胞RNA测序) | NA | 药物不良事件报告数据、转录组数据 | FAERS数据库中181,575份dupilumab相关不良事件报告(其中606例为肿瘤报告) | NA | NA | NA | NA |