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当前共找到 799 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2025-10-06 |
Identification of programmed cell death-related genes and construction of a prognostic model in oral squamous cell carcinoma using single-cell and transcriptome analysis
2025-May-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02520-4
PMID:40346375
|
研究论文 | 通过单细胞和转录组分析识别口腔鳞状细胞癌中程序性细胞死亡相关基因并构建预后模型 | 首次结合单细胞RNA测序和转录组数据分析口腔鳞状细胞癌的程序性细胞死亡相关基因，并建立五基因预后特征模型 | 研究样本量有限，需要更多独立队列验证模型的普适性 | 构建口腔鳞状细胞癌的预后预测模型 | 口腔鳞状细胞癌患者肿瘤组织和健康组织样本 | 生物信息学 | 口腔鳞状细胞癌 | RNA测序，单细胞RNA测序 | Cox回归模型，LASSO回归 | 基因表达数据 | 341个肿瘤组织，31个健康样本，6个单细胞样本，76个验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 622 | 2025-10-06 |
Multi-omics integration reveals Vha68-3 as a testicular aging-specific factor that coordinates spermatid elongation through mitochondrial metabolic homeostasis
2025-May-09, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-025-00737-3
PMID:40346547
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研究论文 | 本研究通过多组学整合分析发现Vha68-3作为睾丸衰老特异性因子，通过调控线粒体代谢稳态协调精子细胞伸长过程 | 首次鉴定Vha68-3作为睾丸特异性V型ATP合酶亚基在睾丸衰老中的关键作用，揭示了其通过调控丙酮酸代谢通路影响精子细胞伸长的分子机制 | 研究主要基于果蝇模型，在哺乳动物中的适用性需要进一步验证 | 探究线粒体在睾丸衰老过程中影响精子发生的分子机制 | 果蝇睾丸组织及精子细胞 | 多组学整合分析 | 男性生殖系统疾病 | CRISPR/Cas9基因编辑，免疫荧光染色，透射电子显微镜，单细胞RNA测序，转录组-代谢组关联分析，液相色谱-串联质谱 | 基因敲除模型 | 单细胞转录组数据，代谢组数据，蛋白质互作数据，显微图像数据 | 果蝇睾丸组织样本 | NA | 单细胞RNA测序，代谢组学，蛋白质组学 | NA | NA |
| 623 | 2025-10-06 |
S100A9 as a potential novel target for experimental autoimmune cystitis and interstitial cystitis/bladder pain syndrome
2025-May-09, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00763-5
PMID:40346703
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和分子生物学实验发现S100A9是间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征的关键促炎分子，并通过TLR4信号通路加剧膀胱组织损伤 | 首次揭示S100A9在IC/BPS发病机制中的核心作用，并证明靶向S100A9可显著减轻病理过程 | 研究主要基于小鼠模型，在人类患者中的验证仍需进一步研究 | 阐明IC/BPS的关键靶点和潜在机制，寻找有效治疗靶点 | 实验性自身免疫性膀胱炎小鼠模型、基因敲除小鼠和IC/BPS患者 | 单细胞生物学 | 间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组测序, 分子生物学实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 624 | 2025-10-06 |
Integrative Analysis Reveals Genes Causal Relation with Ovarian Cancer and aging
2025-May-09, Current topics in medicinal chemistry
IF:2.9Q3
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、GWAS和eQTL数据，识别并验证了与卵巢癌和衰老相关的单核细胞亚型关键基因及其因果关系 | 首次整合单细胞RNA测序、GWAS和eQTL数据，采用SMR和HEIDI方法系统识别卵巢癌与衰老相关的因果基因 | 研究基于欧洲人群数据，样本代表性有限；部分基因表达模式存在矛盾 | 识别和验证与卵巢癌和衰老相关的单核细胞亚型关键基因及其潜在因果关系 | 单核细胞亚型（经典单核细胞、中间单核细胞、髓样树突状细胞） | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, GWAS, eQTL, SMR分析, HEIDI检验 | 孟德尔随机化 | 单细胞RNA测序数据, GWAS数据, eQTL数据 | 123,280个细胞，GWAS包含14,049个样本和40,941个对照 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 625 | 2025-10-06 |
scMUSCL: multi-source transfer learning for clustering scRNA-seq data
2025-May-06, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf137
PMID:40152244
|
研究论文 | 提出一种名为scMUSCL的新型迁移学习方法，通过利用多个注释参考数据集的知识来改善单细胞RNA测序数据的聚类效果 | 开发了首个多源迁移学习框架用于单细胞聚类，无需预先知道目标数据集的聚类数量，且无需进行批次校正 | NA | 提高单细胞RNA测序数据的聚类性能 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 基因表达数据 | 20个真实数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 626 | 2025-10-06 |
Mechanistic insights into EIF6 as a target of Apigenin in alleviating chondrocyte senescence
2025-May, Experimental gerontology
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.exger.2025.112725
PMID:40049422
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研究论文 | 本研究揭示芹菜素通过上调EIF6表达缓解软骨细胞衰老的机制 | 首次发现EIF6是芹菜素在膝骨关节炎中的关键靶点，并验证其通过上调EIF6表达抑制软骨细胞衰老 | 研究主要基于体外细胞实验，需要进一步体内实验验证 | 探究芹菜素在膝骨关节炎治疗中的作用靶点和机制 | 人类软骨组织和SW1353软骨肉瘤细胞系 | 生物医学 | 膝骨关节炎 | 网络药理学, 孟德尔随机化分析, 分子对接, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 分子对接数据, 细胞实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 627 | 2025-10-06 |
Targeting p53 for immune modulation: Exploring its functions in tumor immunity and inflammation
2025-May-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217614
PMID:40054656
|
综述 | 本文综述了p53在肿瘤免疫和炎症中的双重调节功能及其治疗潜力 | 系统阐述p53在先天性与适应性免疫中的协调作用，揭示其通过免疫原性细胞死亡和NF-κB信号通路参与炎症调节的新机制 | 属于理论综述，缺乏原始实验数据验证具体机制 | 探索p53在免疫调节和肿瘤免疫治疗中的功能与临床应用 | p53蛋白的免疫调节功能及其与免疫细胞（巨噬细胞、树突状细胞、NK细胞、T细胞、B细胞）的相互作用 | 分子免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序、CRISPR筛选 | NA | 文献资料 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 628 | 2025-10-06 |
Integration of bulk and single-cell RNA sequencing reveals dynamic changes in epidermal cells
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142601
PMID:40158578
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序技术，揭示了牦牛表皮细胞在毛囊周期中的动态变化和调控机制 | 首次结合bulk和单细胞RNA测序技术系统研究牦牛毛囊周期中表皮细胞的时空动态变化和分化轨迹 | 研究仅针对牦牛模型，结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 | 探究毛囊周期中表皮细胞群体的分子调控机制 | 牦牛表皮细胞 | 单细胞组学 | NA | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 毛囊周期的生长期、退行期和休止期样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 629 | 2025-10-06 |
Roles of innate immune system and receptor Dectin-1 in synovium and cartilage homeostasis of osteoarthritis
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142669
PMID:40164261
|
研究论文 | 本研究探讨先天免疫系统及受体Dectin-1在骨关节炎滑膜和软骨稳态中的作用机制 | 首次构建骨关节炎诊断模型并发现HLA-DRA+细胞为关键细胞群，揭示Dectin-1通过Dectin-1/Syk/NF-κB通路调控巨噬细胞M1极化的新机制 | 先天免疫机制仍需进一步探索，实验验证部分仅聚焦Dectin-1功能 | 探究先天免疫在骨关节炎滑膜炎中的具体作用机制 | 骨关节炎患者的滑膜组织和细胞群 | 生物医学 | 骨关节炎 | RNA测序, 单细胞测序, 机器学习算法 | 机器学习诊断模型 | 基因表达数据, 单细胞数据 | NA | NA | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | NA |
| 630 | 2025-10-06 |
Hepatic immune environment differences among common mouse strains in models of MASH and liver cancer
2025-May, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2025.101380
PMID:40342632
|
研究论文 | 比较常见小鼠品系在MASH和肝癌模型中的肝脏免疫环境差异 | 首次系统比较C57BL/6、BALB/c和FVB/N小鼠在健康、MASH和HCC状态下的肝脏免疫景观差异，并进行跨物种验证 | 样本量较小（每组n=4），仅使用公开scRNA-seq数据集进行验证 | 研究不同小鼠品系肝脏免疫环境的差异及其在人类疾病模型中的适用性 | C57BL/6、BALB/c和FVB/N小鼠品系 | 免疫学 | 肝癌 | 高维光谱流式细胞术，scRNA-seq | NA | 流式细胞数据，单细胞RNA测序数据 | 每组4只小鼠，共多个实验条件 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 631 | 2025-05-12 |
The MYC/TXNIP axis mediates NCL-Suppressed CD8+T cell immune response in lung adenocarcinoma
2025-May-09, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01224-3
PMID:40346484
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研究论文 | 本研究探讨了核仁蛋白NCL通过MYC/TXNIP轴调节CD8+T细胞的葡萄糖代谢和免疫功能，从而影响肺腺癌的免疫逃逸 | 揭示了NCL通过MYC/TXNIP轴调控CD8+T细胞葡萄糖代谢的新机制 | 研究主要基于体外和小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探究NCL在T细胞葡萄糖代谢和肺腺癌免疫逃逸中的作用 | CD8+T细胞和肺腺癌细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、原位移植小鼠模型 | NA | 基因表达数据、实验数据 | 来自GEO和TCGA的数据库数据，以及体外和小鼠实验样本 | NA | NA | NA | NA |
| 632 | 2025-05-12 |
Single-cell and bulk transcriptome sequencing identifies circadian rhythm disruption and cluster-specific clinical insights in colorectal tumorigenesis
2025-May-08, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02521-3
PMID:40338428
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research paper | 该研究通过单细胞和批量转录组测序，探讨了结直肠癌（CRC）中昼夜节律（CR）的失调，并构建了CR亚型分类器，分析了不同CR簇的预后意义、肿瘤微环境状态及对免疫检查点阻断（ICB）治疗的反应 | 首次在CRC中构建了CR亚型分类器和CR评分系统（CRS），揭示了CR基因与CRC预后之间的潜在联系，并识别了影响CRC预后的潜在靶基因 | 研究样本量有限，且未进行实验验证CR基因与CRC预后的直接因果关系 | 探讨昼夜节律失调在结直肠癌发生发展中的作用，并开发基于CR相关基因的预后模型 | 结直肠癌患者及其肿瘤组织 | digital pathology | colorectal cancer | bulk and single-cell RNA sequencing | machine learning | RNA-seq data | 未明确提及具体样本数量，但涉及CRC患者和正常组织的转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 633 | 2025-05-12 |
Isoform-resolution single-cell RNA sequencing reveals the transcriptional panorama of adult Baoshan pig testis cells
2025-May-08, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11636-4
PMID:40340725
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研究论文 | 本研究通过整合长读长（Nanopore）和短读长（Illumina）单细胞RNA测序技术，对保山猪睾丸细胞进行了转录组分析，揭示了睾丸细胞的异质性和精子发生的分子调控机制 | 首次在保山猪睾丸中应用长读长和短读长单细胞RNA测序技术，全面解析了睾丸细胞的转录组特征和精子发生的动态过程 | 研究仅针对保山猪睾丸细胞，结果可能不适用于其他物种或猪的其他品种 | 解析猪睾丸细胞的异质性和精子发生的分子调控机制 | 保山猪睾丸细胞 | 生殖生物学 | NA | Nanopore长读长测序, Illumina短读长测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 11,520个单细胞和23,402个基因 | NA | NA | NA | NA |
| 634 | 2025-05-12 |
Single-cell multi-omics delineates the dynamics of distinct epigenetic codes coordinating mouse gastrulation
2025-May-08, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11619-5
PMID:40340740
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术描绘了小鼠原肠胚形成过程中不同表观遗传代码的动态变化 | 整合scRNA-seq和单细胞ChIP-seq分析揭示了增强子激活与基因表达之间的'时间滞后'过渡模式，并构建了以关键转录因子为中心的基因调控网络 | 研究仅关注H3K27ac和H3K4me1两种组蛋白修饰，可能忽略了其他重要的表观遗传调控机制 | 阐明表观遗传重编程在小鼠原肠胚形成过程中的分子协调机制 | 小鼠胚胎 | 表观遗传学 | 先天性疾病 | 单细胞ChIP-seq, scRNA-seq | NA | 表观遗传组数据, 转录组数据 | 六个连续时间点收集的小鼠胚胎样本 | NA | NA | NA | NA |
| 635 | 2025-05-12 |
Transcriptome-wide analysis reveals potential roles of CFD and ANGPTL4 in fibroblasts regulating B cell lineage for extracellular matrix-driven clustering and novel avenues for immunotherapy in breast cancer
2025-May-08, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01237-y
PMID:40340806
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研究论文 | 通过转录组和基因组数据分析乳腺癌中细胞外基质（ECM）的组成模式及其生物学功能，并探索其对免疫治疗的影响 | 首次识别了乳腺癌中三种不同的ECM簇，并发现ANGPTL4+和CFD+成纤维细胞通过不同信号通路调控B细胞谱系，为免疫治疗提供了新的生物标志物 | 研究主要依赖公共数据库数据，缺乏实验验证 | 探索乳腺癌中ECM的组成模式及其在肿瘤微环境中的作用，以及其对免疫治疗的影响 | 乳腺癌患者 | 数字病理 | 乳腺癌 | 转录组分析、单细胞RNA测序、机器学习 | 非负矩阵分解（NMF）、加权基因共表达网络分析（WGCNA） | 转录组数据、基因组数据 | TCGA数据库中的乳腺癌患者数据，以及10个独立公共队列（共6,736例样本） | NA | NA | NA | NA |
| 636 | 2025-05-12 |
Identification of the "Collagen-Macrophage" sub-category of patients with colorectal cancer as an extension of the CMS4 subtype with THBS2 as a therapeutic target
2025-May-08, BMC gastroenterology
IF:2.5Q2
DOI:10.1186/s12876-025-03918-8
PMID:40340827
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research paper | 该研究通过整合结肠癌转录组和单细胞转录组数据集，识别出一类富含'胶原蛋白-TAMs'的结直肠癌患者亚群，称为CM类，并发现CAF衍生的THBS2可作为潜在生物标志物 | 提出了一种新的结直肠癌患者分类系统CM类，作为传统CMS分类系统的扩展，并发现THBS2作为新的潜在免疫治疗联合靶点 | 未提及研究样本的具体数量或研究人群的详细信息 | 提高结直肠癌的分类准确性和治疗效果 | 结直肠癌患者及其肿瘤微环境 | digital pathology | colorectal cancer | 转录组测序, 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 637 | 2025-05-12 |
High-throughput strategies for monoclonal antibody screening: advances and challenges
2025-May-08, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-025-00513-z
PMID:40340930
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综述 | 本文综述了高通量单克隆抗体筛选策略的最新进展与挑战 | 介绍了抗体库展示、单B细胞抗体技术和单细胞测序等新技术，显著降低了成本并提高了抗体开发效率 | 未具体讨论这些新技术在实际应用中可能遇到的具体技术障碍或限制条件 | 探讨高通量抗体开发的最新进展及其相对于传统方法的潜在优势 | 单克隆抗体的高通量筛选技术 | 生物医学工程 | NA | 抗体库展示、单B细胞抗体技术、单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 638 | 2025-05-12 |
The cancer stem cells characteristics analysis of LGR5 + cells that influence lung cancer risk by using single cell RNA-seq analysis
2025-May-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-00585-3
PMID:40341189
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research paper | 通过单细胞RNA测序分析LGR5+细胞的癌症干细胞特性，研究其对肺癌风险的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别LGR5+干细胞在肺腺癌进展中的关键作用，并发现其hub基因如HLA-DPB1、CD74、CTSH和HLA-DRB5介导独特的转录状态 | 研究仅基于公开数据库GSE149655的数据，实验验证部分仅使用了BEAS-2B和A549细胞系，可能无法完全代表临床样本的复杂性 | 探索肺腺癌中癌症干细胞的特性及其在癌症进展中的作用 | 肺腺癌(LUAD)中的LGR5+干细胞 | digital pathology | lung cancer | single cell RNA-seq, qRT-PCR, western blotting, wound healing, trans-well assays, EdU tests, flow cytometry | NA | RNA-seq数据 | GSE149655数据集中的单细胞RNA-seq数据，以及BEAS-2B和A549细胞系 | NA | NA | NA | NA |
| 639 | 2025-05-12 |
Integrated analysis of MIOX gene in prognosis of clear-cell renal cell carcinoma
2025-May-08, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07698-7
PMID:40341358
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研究论文 | 本研究通过整合分析MIOX基因在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)预后中的作用，揭示了其作为独立预后标志物的潜力 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组分析确定了MIOX在ccRCC中的特异性，并验证了其作为独立预后标志物的价值 | 研究主要基于TCGA数据库，缺乏外部验证队列 | 探索铁死亡相关基因对ccRCC患者预后的影响 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者 | 癌症基因组学 | 肾癌 | scRNA-seq, 空间转录组分析, Lasso回归分析, Kaplan-Meier分析 | NA | 基因表达数据 | TCGA数据库中的ccRCC样本与正常组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 640 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals an Aggressive Basal-Like Tumor Cell Subpopulation Associated With Poor Prognosis in Intrahepatic Cholangiocarcinoma
2025-May, Journal of gastroenterology and hepatology
IF:3.7Q2
DOI:10.1111/jgh.16915
PMID:39993788
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析发现与肝内胆管癌不良预后相关的侵袭性基底样肿瘤细胞亚群 | 首次在肝内胆管癌中鉴定出具有基底上皮特征的侵袭性肿瘤细胞亚群，并揭示其通过HGF-MET轴与炎症性癌相关成纤维细胞的相互作用机制 | 样本量相对有限（23例患者），需要更大规模研究验证发现 | 解析肝内胆管癌的肿瘤异质性并识别新的治疗靶点 | 肝内胆管癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 免疫组织化学染色, 多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, bulk RNA-seq数据, 图像数据 | 26个肿瘤样本（来自23例患者）+ 6个肿瘤切片（来自6例患者）+ 两个公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |