单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 800 篇文献，本页显示第 581 - 600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2025-10-06 |
Epigenetic reprogramming of the host immune system during acute HIV
2025-May-01, Current opinion in HIV and AIDS
IF:4.5Q1
DOI:10.1097/COH.0000000000000935
PMID:40178436
|
综述 | 探讨急性HIV感染期间表观遗传机制如何驱动免疫失调并促进病毒持续存在 | 整合基因组DNA甲基化分析、单细胞转录组学和染色质可及性检测等前沿技术揭示HIV劫持宿主表观基因组的新机制 | NA | 阐明急性HIV感染中表观遗传重编程对免疫系统的调控机制 | HIV感染期间的宿主免疫系统和表观遗传变化 | 表观遗传学 | HIV/AIDS | 全基因组DNA甲基化分析, 单细胞转录组学, 染色质可及性检测 | NA | 表观遗传数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 582 | 2025-10-06 |
Genetic regulation of gene expression across multiple tissues in chickens
2025-May, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02155-9
PMID:40200121
|
研究论文 | 本研究通过整合多种基因组数据构建了鸡多组织调控变异图谱 | 首次系统性地构建了鸡多组织调控变异图谱，揭示了数百万个调控变异对基因表达和转录后修饰的影响 | 作为初步图谱，可能尚未完全覆盖所有组织类型和调控机制 | 系统表征鸡基因组功能变异并构建调控变异图谱 | 鸡的28个不同组织 | 基因组学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 全基因组测序 | NA | 基因组序列数据, 基因表达数据 | 7,015个批量RNA-seq样本, 127,598个单细胞, 2,869个全基因组序列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 全基因组测序 | NA | NA |
| 583 | 2025-10-06 |
Unraveling the Heterogeneity of CD8+ T-Cell Subsets in Liver Cirrhosis: Implications for Disease Progression
2025-May-15, Gut and liver
IF:3.4Q2
DOI:10.5009/gnl230345
PMID:38623058
|
研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞测序分析揭示了肝硬化中CD8+ T细胞的异质性及其在疾病进展中的作用 | 首次在肝硬化中系统鉴定出8种CD8+ T细胞亚型，特别是发现CXCL13+ Tex细胞这一终末耗竭亚型与疾病严重程度相关 | 研究主要基于测序数据分析，需要进一步实验验证这些细胞亚型的具体功能机制 | 阐明肝硬化中CD8+ T细胞的异质性及其在疾病进展中的分子机制 | 肝硬化患者的CD8+ T细胞 | 单细胞生物学 | 肝硬化 | 转录组测序, 单细胞测序 | 加权基因共表达网络分析, 谱系追踪, 差异分析 | RNA-seq数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 584 | 2025-05-16 |
Pdgfrβ marks distinct mesenchymal and pericyte populations within the periosteum with overlapping cellular features
2025-May-15, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf020
PMID:40237625
|
研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和转基因小鼠模型，探讨了骨膜中Pdgfrβ阳性细胞的异质性及其在骨修复中的作用 | 揭示了骨膜中Pdgfrβ阳性细胞的不同亚群，包括间充质细胞和周细胞，并分析了它们的增殖、迁移和成骨能力 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证 | 探讨骨膜中Pdgfrβ阳性细胞的异质性及其在骨修复中的作用 | 小鼠长骨骨膜中的Pdgfrβ阳性细胞 | 细胞生物学 | 骨疾病 | 单细胞RNA测序，转基因小鼠模型 | Pdgfrβ-CreERT2-mT/mG报告小鼠 | 基因表达数据，组织学数据 | 转基因小鼠模型中的Pdgfrβ阳性细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 585 | 2025-10-06 |
IAP dependency of T-cell prolymphocytic leukemia identified by high-throughput drug screening
2025-May-15, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027171
PMID:39869826
|
研究论文 | 通过高通量药物筛选识别T细胞幼淋巴细胞白血病对IAP抑制剂的依赖性 | 首次系统绘制T-PLL的药物敏感性图谱，发现其对IAP抑制剂、核输出抑制剂和自噬抑制剂的特异性脆弱性 | 研究基于体外实验，样本量相对有限（30例患者样本） | 发现T-PLL的新治疗靶点和治疗策略 | T细胞幼淋巴细胞白血病（T-PLL）患者原代细胞 | 肿瘤学研究 | 白血病 | 高通量药物筛选，RNA测序，单细胞RNA测序，光谱流式细胞术 | NA | 药物敏感性数据，基因表达数据，细胞表型数据 | 30例原代患者样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 586 | 2025-05-16 |
Evidence of secondary Notch signaling within the rat small intestine
2025-May-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204277
PMID:40371707
|
research paper | 该研究探讨了大鼠小肠中一种罕见的上皮细胞群体CFTR高表达细胞（CHEs）的特定形成机制 | 揭示了CHEs通过Notch信号通路的二次激活从其他分泌细胞中分化出来的新机制 | 研究主要基于大鼠模型，未在小鼠中发现CHEs，可能限制结果的普遍性 | 理解小肠分泌细胞谱系的多样性形成机制 | 大鼠小肠中的CFTR高表达细胞（CHEs） | 分子生物学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），假时间轨迹分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 587 | 2025-10-06 |
Single cell multiome analysis of the bovine placenta identifies gene regulatory networks in trophoblast differentiation†
2025-May-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf036
PMID:39987557
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了牛胎盘发育过程中的染色质可及性景观和基因调控网络 | 首次在牛胎盘中应用10X Genomics多组学平台同时分析单细胞转录组和染色质可及性，揭示了滋养层细胞分化的调控机制 | 仅分析了妊娠第40天和第170天两个时间点，可能无法完全捕捉发育过程中的连续动态变化 | 探究牛胎盘发育过程中滋养层细胞分化的基因调控机制 | 牛胎盘组织 | 单细胞多组学 | 生殖疾病 | 单细胞多组学测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据，单细胞ATAC-seq数据 | 妊娠第40天和第170天的牛胎盘样本 | 10x Genomics | single-cell multi-omics, snRNA-seq, snATAC-seq | 10x Genomics multiome平台 | 10X Genomics多组学平台（同时进行单细胞核RNA-seq和单细胞核ATAC-seq） |
| 588 | 2025-10-06 |
Parvalbumin neurons mediate neurological phenotypes of anti-NMDAR encephalitis
2025-May-13, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awae374
PMID:40071389
|
研究论文 | 本研究揭示了小白蛋白神经元在抗NMDAR脑炎神经症状中的关键作用机制 | 首次证明抗NMDAR IgG直接导致小白蛋白神经元功能障碍，并通过光遗传学技术成功逆转认知缺陷 | 动物模型可能无法完全模拟人类疾病复杂性，研究主要聚焦于mPFC和海马区 | 阐明抗NMDAR脑炎认知缺陷的神经病理机制 | 小鼠模型及其中前额叶皮层和海马区的小白蛋白神经元 | 神经科学 | 自身免疫性脑炎 | 免疫组织化学染色、电生理记录、光遗传学、化学遗传学、单细胞测序 | 动物疾病模型 | 电生理数据、基因表达数据、行为学数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 589 | 2025-05-16 |
KLHL17 as a Prognostic Indicator and Therapeutic Target in Cervical Cancer: A Comprehensive Analysis
2025-May-13, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
|
research paper | 该研究通过生物信息学分析和实验验证，探讨了KLHL17在宫颈癌中的表达模式及其作为预后指标和治疗靶点的潜力 | 首次全面分析了KLHL17在宫颈癌中的表达模式、临床相关性及其与免疫细胞浸润、免疫检查点基因表达和微卫星不稳定性的关联 | 研究主要基于TCGA数据库和细胞系实验，缺乏大规模临床样本验证 | 阐明KLHL17在宫颈癌中的生物学功能和临床意义 | 宫颈癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 生物信息学分析、qRT-PCR、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、临床数据 | TCGA数据库中的宫颈癌样本和GSE145372数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 590 | 2025-05-16 |
snPATHO-seq: A Detailed Protocol for Single Nucleus RNA Sequencing From FFPE
2025-May-05, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5291
PMID:40364991
|
research paper | 介绍了一种名为snPATHO-seq的稳健且适应性强的单核RNA测序方法，用于从FFPE组织中生成高质量的转录组数据 | snPATHO-seq通过优化的核分离和10× Genomics Flex检测，有效减少了组织碎片并保持了RNA完整性，优于现有的FFPE工作流程 | 未明确提及方法的局限性 | 开发一种能够从FFPE组织中生成高质量单核转录组数据的方法，以推动单细胞组学在转化和临床研究中的应用 | FFPE组织样本，包括乳腺癌等疾病组织 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单核RNA测序（snRNA-seq），10× Genomics Flex检测 | NA | 转录组数据 | 多样化的FFPE样本，包括疾病组织 | NA | NA | NA | NA |
| 591 | 2025-10-06 |
CALB1 and RPL23 Are Essential for Maintaining Oocyte Quality and Function During Aging
2025-May, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14466
PMID:39748132
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序发现CALB1和RPL23是维持衰老过程中卵母细胞质量的关键基因 | 首次在单细胞分辨率下揭示钙离子稳态失调是卵母细胞衰老的核心特征，并鉴定出CALB1和RPL23两个关键调控基因 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类卵母细胞中验证 | 探究卵母细胞衰老的分子机制 | 年轻和年老雌性小鼠的卵母细胞 | 生殖生物学 | 生殖衰老 | 单细胞转录组测序, 蛋白质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 年轻和年老小鼠的卵母细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 592 | 2025-10-06 |
CTHRC1 expresses in cancer-associated fibroblasts and is associated with resistance to anti-androgen therapy in prostate cancer
2025-May, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01624-z
PMID:40009323
|
研究论文 | 本研究探讨CTHRC1在前列腺癌中的表达及其与抗雄激素治疗耐药性的关联 | 首次发现CTHRC1在肌成纤维细胞样癌症相关成纤维细胞中表达，并通过CCN2/CAV1/AR通路调控雄激素受体信号传导 | 研究数据均来自公开数据库，缺乏实验验证 | 探索CTHRC1在前列腺癌中的表达、基因功能及其预后价值 | 前列腺癌组织和正常前列腺组织 | 生物信息学 | 前列腺癌 | RNA测序，单细胞RNA测序，免疫组织化学染色 | CIBERSORT算法 | RNA测序数据，单细胞RNA测序数据 | 1999例前列腺癌病例和531例正常对照，来自7个前列腺原发肿瘤的62,995个细胞 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 593 | 2025-05-16 |
scSDNE: A semi-supervised method for inferring cell-cell interactions based on graph embedding
2025-May, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013027
PMID:40333631
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scSDNE的半监督图嵌入模型，用于推断基于配体-受体（L-R）相互作用的细胞间通讯 | scSDNE模型利用深度学习将相互作用细胞中的基因映射到一个共享的潜在空间，并结合基因调控信息提高推断的准确性和生物学可解释性 | NA | 全面理解细胞间复杂的相互作用机制 | 细胞间通讯中的配体-受体相互作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 半监督图嵌入模型（scSDNE） | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 594 | 2025-05-16 |
SCGB3A1-Epi and KLK10-Epi Crosstalk With Fibroblasts Promotes Liver Metastasis of Breast Cancer and Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2025-May, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70904
PMID:40357856
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序揭示了乳腺癌和胰腺导管腺癌肝转移的关键上皮细胞亚型及其与成纤维细胞的相互作用机制 | 首次鉴定出SCGB3A1-Epi和KLK10-Epi作为乳腺癌和PDAC肝转移的关键驱动亚型，并揭示了它们与成纤维细胞的特定配体-受体相互作用 | 研究主要基于单细胞测序数据，需要进一步的体内外实验验证这些发现 | 阐明乳腺癌和胰腺导管腺癌肝转移的细胞亚型及其作用机制 | 乳腺癌和胰腺导管腺癌(PDAC)的肝转移样本 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌, 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 595 | 2025-05-16 |
Identification and Validation of Potential Immune-Related Genes for Endometriosis
2025-May, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.70091
PMID:40367358
|
研究论文 | 通过综合生物信息学分析和免疫组化验证，识别和验证子宫内膜异位症中潜在的免疫相关基因 | 使用单细胞RNA测序和传统批量RNA测序数据结合机器学习技术，识别出与子宫内膜异位症相关的特征性免疫基因TGFBR1和GIMAP4 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能受到样本量和数据质量的限制 | 识别和验证子宫内膜异位症中潜在的免疫相关基因 | 子宫内膜异位症患者的子宫内膜组织 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, IHC | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的子宫内膜异位症患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 596 | 2025-10-06 |
Vagus nerve modulates acute-on-chronic liver failure progression via CXCL9
2025-May-05, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003104
PMID:38945689
|
研究论文 | 本研究揭示了迷走神经通过调控巨噬细胞产生CXCL9参与慢加急性肝衰竭发展的神经免疫通讯机制 | 首次发现迷走神经-巨噬细胞-CXCL9轴的神经免疫通讯在ACLF发展中的关键作用 | 动物模型与人类疾病存在差异，临床转化需要进一步验证 | 探索ACLF发病机制中的关键分子及迷走神经与免疫紊乱的神经免疫通讯 | ACLF模型小鼠和ACLF患者 | 免疫学 | 肝病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫组化,免疫荧光,CRISPR/Cas9技术 | 动物模型 | 蛋白质组学数据,单细胞转录组数据,病理图像 | ACLF模型小鼠和ACLF患者（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学分析 | NA | NA |
| 597 | 2025-10-06 |
Inhibition of DOCK1 suppresses Notch signalling pathway and impairs leukaemogenesis
2025-May-12, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.20140
PMID:40355246
|
研究论文 | 本研究揭示了DOCK1通过调控Notch信号通路促进急性髓系白血病发生发展的机制 | 首次系统阐明DOCK1在AML中的致病作用及其通过Notch信号通路调控白血病干细胞功能的机制 | 研究主要基于临床样本分析和动物模型，需要进一步验证在人类原代AML细胞中的适用性 | 探究DOCK1在急性髓系白血病中的病理作用及其分子机制 | 341名新发非M3型AML患者、白血病细胞系、异种移植模型和Dock1条件性基因敲除小鼠 | 癌症生物学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序、转录组分析、基因敲除技术 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 341名AML患者、多种细胞系和动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 598 | 2025-10-06 |
High-resolution spatial transcriptomics and cell lineage analysis reveal spatiotemporal cell fate determination during craniofacial development
2025-May-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59206-2
PMID:40355462
|
研究论文 | 通过高分辨率空间转录组学和细胞谱系分析揭示颅面发育过程中细胞命运决定的时空动态 | 首次构建了小鼠腭发育过程中颅神经嵴细胞来源间充质谱系分化的高分辨率时空转录组图谱，并发现Sox9+异质性间充质祖细胞群在腭发育起始前就已激活早期谱系特异性标记 | 研究局限于小鼠模型，需要进一步验证在人类发育中的适用性 | 解析颅面发育过程中细胞命运决定的分子机制 | 小鼠颅神经嵴细胞来源的间充质细胞 | 空间转录组学 | 发育生物学 | 空间转录组学，细胞谱系追踪 | NA | 空间转录组数据 | E12.5至E15.5胚胎期小鼠组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 599 | 2025-05-14 |
Simultaneous single-cell sequencing of RNA and DNA at scale with DEFND-seq
2025-May-12, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00853-y
PMID:40355601
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 600 | 2025-10-06 |
IL-11/IL-11R signal inhibition by 9MW3811 remodels immune tumor microenvironment and enhances anti-tumor efficacy of PD-1 blockade
2025-May-12, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00913-w
PMID:40355638
|
研究论文 | 介绍一种靶向IL-11信号通路的单克隆抗体9MW3811，通过重塑肿瘤免疫微环境增强PD-1阻断疗法的抗肿瘤效果 | 首次证明9MW3811可通过调节XCL1和CCL7逆转T细胞耗竭，并与抗PD-1疗法产生协同作用，即使在PD-1无应答模型中仍有效 | 目前研究仅限于小鼠模型，临床疗效尚待验证 | 开发靶向IL-11信号通路的抗肿瘤治疗策略 | IL-11/IL-11R信号通路和肿瘤免疫微环境 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |