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当前共找到 813 篇文献，本页显示第 581 - 600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2025-05-17 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Stem Cell-Derived Exosomes Attenuate Inflammatory Gene Expression in Pulmonary Oxygen Toxicity
2025-May-07, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26094462
PMID:40362698
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术揭示了干细胞来源的外泌体在减轻肺氧毒性炎症基因表达中的作用 | 首次报道了外泌体在肺氧毒性中的作用及机制，并整合了单细胞RNA测序和批量分析技术 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探究干细胞外泌体保护肺组织的机制及潜在分子调控网络 | 小鼠肺氧毒性模型 | 单细胞转录组学 | 肺氧毒性 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 582 | 2025-05-17 |
A Transfer Learning Framework for Predicting and Interpreting Drug Responses via Single-Cell RNA-Seq Data
2025-May-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26094365
PMID:40362602
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research paper | 提出一个基于迁移学习的框架，通过单细胞RNA测序数据预测和解释药物反应 | 设计了一个共享编码器将批量和单细胞测序数据投影到统一的潜在空间进行药物反应预测，并通过先验生物知识引导的稀疏解码器增强可解释性 | 临床样本获取有限，且单细胞RNA测序药物反应数据的系统收集和利用仍有限 | 提高药物反应预测的性能和可解释性，理解药物反应的分子机制 | 单细胞RNA测序药物反应数据集 | machine learning | cancer | scRNA-seq | transfer learning | RNA sequencing data | 五个精选的单细胞RNA测序数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 583 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial transcriptomic analyses reveal transcriptional cell lineage heterogeneity in extracranial arteriovenous malformation
2025-May, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2025.02.005
PMID:40118698
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析揭示颅外动静脉畸形中转录细胞谱系异质性 | 首次在单细胞分辨率下整合scRNA-seq和空间转录组数据，揭示eAVMs中内皮细胞、血管周围细胞和免疫细胞的异质性状态及细胞间相互作用 | 样本量有限（9个eAVMs样本和2个对照），空间转录组分析仅在一个eAVM样本中进行 | 在单细胞水平生成eAVMs分子信息概览，解析其转录异质性 | 颅外动静脉畸形组织样本 | 数字病理学 | 血管畸形 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | 9个eAVMs样本和2个非病变组织对照样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组技术 |
| 584 | 2025-10-06 |
Neuronal activity modulates the expression of secretagogin, a Ca2+ sensor protein, during mammalian forebrain development
2025-May, Acta physiologica (Oxford, England)
DOI:10.1111/apha.70031
PMID:40165367
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研究论文 | 本研究揭示了分泌抑制素在哺乳动物前脑发育过程中的表达受神经元活动调控 | 首次证明分泌抑制素表达具有神经元活动依赖性，并发现其在唐氏综合征胎儿中的表达延迟 | 研究主要集中于前脑区域，其他脑区的研究相对有限 | 探究分泌抑制素在神经系统中的表达调控机制及其作为神经元标志物的可靠性 | 人类胎儿前脑、小鼠皮层神经元、SH-SY5Y神经母细胞瘤细胞 | 神经科学 | 唐氏综合征 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 细胞培养 | Scgn-iCre::Ai9转基因小鼠模型 | 基因表达数据, 组织图像 | 人类胎儿样本（包括唐氏综合征和年龄匹配对照）、小鼠模型、细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 585 | 2025-10-06 |
Epigenetic reprogramming of the host immune system during acute HIV
2025-May-01, Current opinion in HIV and AIDS
IF:4.5Q1
DOI:10.1097/COH.0000000000000935
PMID:40178436
|
综述 | 探讨急性HIV感染期间表观遗传机制如何驱动免疫失调并促进病毒持续存在 | 整合基因组DNA甲基化分析、单细胞转录组学和染色质可及性检测等前沿技术揭示HIV劫持宿主表观基因组的新机制 | NA | 阐明急性HIV感染中表观遗传重编程对免疫系统的调控机制 | HIV感染期间的宿主免疫系统和表观遗传变化 | 表观遗传学 | HIV/AIDS | 全基因组DNA甲基化分析, 单细胞转录组学, 染色质可及性检测 | NA | 表观遗传数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 586 | 2025-10-06 |
Genetic regulation of gene expression across multiple tissues in chickens
2025-May, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02155-9
PMID:40200121
|
研究论文 | 本研究通过整合多种基因组数据构建了鸡多组织调控变异图谱 | 首次系统性地构建了鸡多组织调控变异图谱，揭示了数百万个调控变异对基因表达和转录后修饰的影响 | 作为初步图谱，可能尚未完全覆盖所有组织类型和调控机制 | 系统表征鸡基因组功能变异并构建调控变异图谱 | 鸡的28个不同组织 | 基因组学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 全基因组测序 | NA | 基因组序列数据, 基因表达数据 | 7,015个批量RNA-seq样本, 127,598个单细胞, 2,869个全基因组序列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 全基因组测序 | NA | NA |
| 587 | 2025-10-06 |
PINK1 link mitochondria-ER contacts controls deposition of intramuscular fat in pigs
2025-May-20, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151672
PMID:40138759
|
研究论文 | 本研究探讨PINK1通过调控线粒体-内质网相互作用调节猪肌内脂肪沉积的分子机制 | 首次揭示PINK1在猪肌内脂肪沉积中通过调控线粒体-内质网接触发挥作用 | PINK1在猪肌内脂肪沉积中的具体调控网络仍需进一步研究 | 探究PINK1调控猪肌内脂肪沉积的分子机制 | 猪的纤维-脂肪祖细胞和脂肪细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个猪品种的纤维-脂肪祖细胞和脂肪细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 588 | 2025-10-06 |
Unraveling the Heterogeneity of CD8+ T-Cell Subsets in Liver Cirrhosis: Implications for Disease Progression
2025-May-15, Gut and liver
IF:3.4Q2
DOI:10.5009/gnl230345
PMID:38623058
|
研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞测序分析揭示了肝硬化中CD8+ T细胞的异质性及其在疾病进展中的作用 | 首次在肝硬化中系统鉴定出8种CD8+ T细胞亚型，特别是发现CXCL13+ Tex细胞这一终末耗竭亚型与疾病严重程度相关 | 研究主要基于测序数据分析，需要进一步实验验证这些细胞亚型的具体功能机制 | 阐明肝硬化中CD8+ T细胞的异质性及其在疾病进展中的分子机制 | 肝硬化患者的CD8+ T细胞 | 单细胞生物学 | 肝硬化 | 转录组测序, 单细胞测序 | 加权基因共表达网络分析, 谱系追踪, 差异分析 | RNA-seq数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 589 | 2025-05-16 |
Pdgfrβ marks distinct mesenchymal and pericyte populations within the periosteum with overlapping cellular features
2025-May-15, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf020
PMID:40237625
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和转基因小鼠模型，探讨了骨膜中Pdgfrβ阳性细胞的异质性及其在骨修复中的作用 | 揭示了骨膜中Pdgfrβ阳性细胞的不同亚群，包括间充质细胞和周细胞，并分析了它们的增殖、迁移和成骨能力 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证 | 探讨骨膜中Pdgfrβ阳性细胞的异质性及其在骨修复中的作用 | 小鼠长骨骨膜中的Pdgfrβ阳性细胞 | 细胞生物学 | 骨疾病 | 单细胞RNA测序，转基因小鼠模型 | Pdgfrβ-CreERT2-mT/mG报告小鼠 | 基因表达数据，组织学数据 | 转基因小鼠模型中的Pdgfrβ阳性细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 590 | 2025-10-06 |
IAP dependency of T-cell prolymphocytic leukemia identified by high-throughput drug screening
2025-May-15, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027171
PMID:39869826
|
研究论文 | 通过高通量药物筛选识别T细胞幼淋巴细胞白血病对IAP抑制剂的依赖性 | 首次系统绘制T-PLL的药物敏感性图谱，发现其对IAP抑制剂、核输出抑制剂和自噬抑制剂的特异性脆弱性 | 研究基于体外实验，样本量相对有限（30例患者样本） | 发现T-PLL的新治疗靶点和治疗策略 | T细胞幼淋巴细胞白血病（T-PLL）患者原代细胞 | 肿瘤学研究 | 白血病 | 高通量药物筛选，RNA测序，单细胞RNA测序，光谱流式细胞术 | NA | 药物敏感性数据，基因表达数据，细胞表型数据 | 30例原代患者样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 591 | 2025-05-16 |
Evidence of secondary Notch signaling within the rat small intestine
2025-May-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204277
PMID:40371707
|
research paper | 该研究探讨了大鼠小肠中一种罕见的上皮细胞群体CFTR高表达细胞（CHEs）的特定形成机制 | 揭示了CHEs通过Notch信号通路的二次激活从其他分泌细胞中分化出来的新机制 | 研究主要基于大鼠模型，未在小鼠中发现CHEs，可能限制结果的普遍性 | 理解小肠分泌细胞谱系的多样性形成机制 | 大鼠小肠中的CFTR高表达细胞（CHEs） | 分子生物学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），假时间轨迹分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 592 | 2025-10-06 |
Single cell multiome analysis of the bovine placenta identifies gene regulatory networks in trophoblast differentiation†
2025-May-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf036
PMID:39987557
|
研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析揭示了牛胎盘发育过程中的染色质可及性景观和基因调控网络 | 首次在牛胎盘中应用10X Genomics多组学平台同时分析单细胞转录组和染色质可及性，揭示了滋养层细胞分化的调控机制 | 仅分析了妊娠第40天和第170天两个时间点，可能无法完全捕捉发育过程中的连续动态变化 | 探究牛胎盘发育过程中滋养层细胞分化的基因调控机制 | 牛胎盘组织 | 单细胞多组学 | 生殖疾病 | 单细胞多组学测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据，单细胞ATAC-seq数据 | 妊娠第40天和第170天的牛胎盘样本 | 10x Genomics | single-cell multi-omics, snRNA-seq, snATAC-seq | 10x Genomics multiome平台 | 10X Genomics多组学平台（同时进行单细胞核RNA-seq和单细胞核ATAC-seq） |
| 593 | 2025-10-06 |
Parvalbumin neurons mediate neurological phenotypes of anti-NMDAR encephalitis
2025-May-13, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awae374
PMID:40071389
|
研究论文 | 本研究揭示了小白蛋白神经元在抗NMDAR脑炎神经症状中的关键作用机制 | 首次证明抗NMDAR IgG直接导致小白蛋白神经元功能障碍，并通过光遗传学技术成功逆转认知缺陷 | 动物模型可能无法完全模拟人类疾病复杂性，研究主要聚焦于mPFC和海马区 | 阐明抗NMDAR脑炎认知缺陷的神经病理机制 | 小鼠模型及其中前额叶皮层和海马区的小白蛋白神经元 | 神经科学 | 自身免疫性脑炎 | 免疫组织化学染色、电生理记录、光遗传学、化学遗传学、单细胞测序 | 动物疾病模型 | 电生理数据、基因表达数据、行为学数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 594 | 2025-05-16 |
KLHL17 as a Prognostic Indicator and Therapeutic Target in Cervical Cancer: A Comprehensive Analysis
2025-May-13, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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research paper | 该研究通过生物信息学分析和实验验证，探讨了KLHL17在宫颈癌中的表达模式及其作为预后指标和治疗靶点的潜力 | 首次全面分析了KLHL17在宫颈癌中的表达模式、临床相关性及其与免疫细胞浸润、免疫检查点基因表达和微卫星不稳定性的关联 | 研究主要基于TCGA数据库和细胞系实验，缺乏大规模临床样本验证 | 阐明KLHL17在宫颈癌中的生物学功能和临床意义 | 宫颈癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 生物信息学分析、qRT-PCR、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、临床数据 | TCGA数据库中的宫颈癌样本和GSE145372数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 595 | 2025-05-16 |
snPATHO-seq: A Detailed Protocol for Single Nucleus RNA Sequencing From FFPE
2025-May-05, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5291
PMID:40364991
|
research paper | 介绍了一种名为snPATHO-seq的稳健且适应性强的单核RNA测序方法，用于从FFPE组织中生成高质量的转录组数据 | snPATHO-seq通过优化的核分离和10× Genomics Flex检测，有效减少了组织碎片并保持了RNA完整性，优于现有的FFPE工作流程 | 未明确提及方法的局限性 | 开发一种能够从FFPE组织中生成高质量单核转录组数据的方法，以推动单细胞组学在转化和临床研究中的应用 | FFPE组织样本，包括乳腺癌等疾病组织 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单核RNA测序（snRNA-seq），10× Genomics Flex检测 | NA | 转录组数据 | 多样化的FFPE样本，包括疾病组织 | NA | NA | NA | NA |
| 596 | 2025-10-06 |
CALB1 and RPL23 Are Essential for Maintaining Oocyte Quality and Function During Aging
2025-May, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14466
PMID:39748132
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序发现CALB1和RPL23是维持衰老过程中卵母细胞质量的关键基因 | 首次在单细胞分辨率下揭示钙离子稳态失调是卵母细胞衰老的核心特征，并鉴定出CALB1和RPL23两个关键调控基因 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类卵母细胞中验证 | 探究卵母细胞衰老的分子机制 | 年轻和年老雌性小鼠的卵母细胞 | 生殖生物学 | 生殖衰老 | 单细胞转录组测序, 蛋白质组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 年轻和年老小鼠的卵母细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 597 | 2025-10-06 |
CTHRC1 expresses in cancer-associated fibroblasts and is associated with resistance to anti-androgen therapy in prostate cancer
2025-May, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01624-z
PMID:40009323
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研究论文 | 本研究探讨CTHRC1在前列腺癌中的表达及其与抗雄激素治疗耐药性的关联 | 首次发现CTHRC1在肌成纤维细胞样癌症相关成纤维细胞中表达，并通过CCN2/CAV1/AR通路调控雄激素受体信号传导 | 研究数据均来自公开数据库，缺乏实验验证 | 探索CTHRC1在前列腺癌中的表达、基因功能及其预后价值 | 前列腺癌组织和正常前列腺组织 | 生物信息学 | 前列腺癌 | RNA测序，单细胞RNA测序，免疫组织化学染色 | CIBERSORT算法 | RNA测序数据，单细胞RNA测序数据 | 1999例前列腺癌病例和531例正常对照，来自7个前列腺原发肿瘤的62,995个细胞 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 598 | 2025-05-16 |
scSDNE: A semi-supervised method for inferring cell-cell interactions based on graph embedding
2025-May, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013027
PMID:40333631
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scSDNE的半监督图嵌入模型，用于推断基于配体-受体（L-R）相互作用的细胞间通讯 | scSDNE模型利用深度学习将相互作用细胞中的基因映射到一个共享的潜在空间，并结合基因调控信息提高推断的准确性和生物学可解释性 | NA | 全面理解细胞间复杂的相互作用机制 | 细胞间通讯中的配体-受体相互作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 半监督图嵌入模型（scSDNE） | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 599 | 2025-05-16 |
SCGB3A1-Epi and KLK10-Epi Crosstalk With Fibroblasts Promotes Liver Metastasis of Breast Cancer and Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2025-May, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70904
PMID:40357856
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序揭示了乳腺癌和胰腺导管腺癌肝转移的关键上皮细胞亚型及其与成纤维细胞的相互作用机制 | 首次鉴定出SCGB3A1-Epi和KLK10-Epi作为乳腺癌和PDAC肝转移的关键驱动亚型，并揭示了它们与成纤维细胞的特定配体-受体相互作用 | 研究主要基于单细胞测序数据，需要进一步的体内外实验验证这些发现 | 阐明乳腺癌和胰腺导管腺癌肝转移的细胞亚型及其作用机制 | 乳腺癌和胰腺导管腺癌(PDAC)的肝转移样本 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌, 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 600 | 2025-05-16 |
Identification and Validation of Potential Immune-Related Genes for Endometriosis
2025-May, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.70091
PMID:40367358
|
研究论文 | 通过综合生物信息学分析和免疫组化验证，识别和验证子宫内膜异位症中潜在的免疫相关基因 | 使用单细胞RNA测序和传统批量RNA测序数据结合机器学习技术，识别出与子宫内膜异位症相关的特征性免疫基因TGFBR1和GIMAP4 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能受到样本量和数据质量的限制 | 识别和验证子宫内膜异位症中潜在的免疫相关基因 | 子宫内膜异位症患者的子宫内膜组织 | 生物信息学 | 子宫内膜异位症 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, IHC | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的子宫内膜异位症患者样本 | NA | NA | NA | NA |