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当前共找到 813 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-05 |
HemaScope: A Tool for Analyzing Single-cell and Spatial Transcriptomics Data of Hematopoietic Cells
2025-May-30, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf002
PMID:39862439
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研究论文 | 开发用于造血细胞单细胞和空间转录组数据分析的专业生物信息学工具包HemaScope | 首个专门针对造血细胞设计的集成分析工具包，整合单细胞RNA测序和空间转录组分析功能，提供多种用户友好部署形式 | 工具主要针对造血细胞设计，在其他细胞类型中的应用可能需要调整 | 开发专门用于造血细胞单细胞和空间转录组数据分析的生物信息学工具 | 造血细胞，包括人类骨髓细胞、小鼠急性髓系白血病细胞、血管免疫母细胞T细胞淋巴瘤和原发性中枢神经系统淋巴瘤 | 生物信息学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 42 | 2025-10-05 |
Single-cell analyses identify monocyte gene expression profiles that influence HIV-1 reservoir size in acutely treated cohorts
2025-May-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59833-9
PMID:40442100
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现单核细胞IL1B基因表达与HIV-1病毒库大小呈负相关 | 首次通过单细胞RNA测序揭示单核细胞IL1B表达与HIV-1病毒库大小的负相关性及其潜在机制 | 样本量较小且仅包含男性患者，研究结果需在更广泛人群中验证 | 研究宿主基因表达对HIV-1病毒库大小的影响 | 急性感染期开始ART治疗的HIV-1感染者外周血细胞 | 单细胞基因组学 | HIV/AIDS | 单细胞RNA测序，完整前病毒DNA检测 | 差异表达分析，相互作用建模 | 单细胞RNA测序数据 | 两个队列：14名男性（发现队列）和38名男性（验证队列） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 43 | 2025-10-05 |
Apoptosis inhibition reprograms alveolar myofibroblasts toward ductal myofibroblasts
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.26.654588
PMID:40492191
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研究论文 | 本研究通过抑制肺泡肌成纤维细胞凋亡，揭示了其向导管肌成纤维细胞重编程的命运可塑性 | 首次通过诱导性BCL2过表达证明肺泡肌成纤维细胞在凋亡抑制后能成熟为导管肌成纤维细胞 | 研究主要基于小鼠模型，人类细胞中的可塑性尚未验证 | 探究肺间充质细胞的命运可塑性和凋亡清除机制 | 小鼠肺泡肌成纤维细胞和导管肌成纤维细胞 | 细胞生物学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序, 谱系追踪, 诱导性基因过表达 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据, 成像数据 | 使用三种独立Cre驱动品系的小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2025-10-05 |
WFDC3 identified as a prognostic and immune biomarker in pancreatic cancer
2025-May-08, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2025.12444
PMID:40350979
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证，发现WFDC3在胰腺癌中高表达并促进肿瘤转移和免疫逃逸 | 首次系统揭示WFDC3在胰腺癌中的促癌功能及其通过诱导上皮间质转化和抑制T细胞毒性介导免疫逃逸的机制 | WFDCs在肿瘤进展中的具体作用机制仍需进一步深入研究 | 探究WFDC家族成员在胰腺癌发生发展中的作用及其临床意义 | 胰腺癌组织和细胞 | 生物信息学 | 胰腺癌 | RNA测序, 功能富集分析, CCK-8增殖实验, EdU检测, transwell实验, 免疫荧光染色, 流式细胞术, LDH释放实验, Western blotting, qRT-PCR | LASSO回归模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | TCGA和GEO数据库中的胰腺癌数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 45 | 2025-10-05 |
INLAomics for Scalable and Interpretable Spatial Multiomic Data Integration
2025-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.02.651831
PMID:40654897
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研究论文 | 开发INLAomics框架用于空间多组学数据的可扩展和可解释集成分析 | 提出基于多元分层贝叶斯框架的空间多组学集成方法，克服现有方法忽略空间背景和可解释性差的局限 | 未提及具体的数据规模限制或计算资源需求 | 开发可扩展且可解释的空间多组学数据集成方法 | 空间转录组数据和基于抗体的蛋白质组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，抗体蛋白质组学 | 多元分层贝叶斯框架 | 空间多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞多组学 | NA | NA |
| 46 | 2025-10-05 |
Spatially resolved transcriptomic profiling for glomerular and tubulointerstitial gene expression in C3 glomerulopathy
2025-May, Clinical kidney journal
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/ckj/sfaf139
PMID:40416397
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研究论文 | 本研究利用空间转录组技术分析C3肾小球病的肾小球和肾小管间质基因表达特征 | 首次应用空间转录组技术对C3肾小球病进行亚结构特异性基因表达谱分析 | 样本量较小（仅3例C3G病例），需要更大规模研究验证 | 探究C3肾小球病的转录组特征和病理机制 | 人类肾脏活检标本（C3G患者、供体肾脏和其他肾小球肾炎患者） | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 3例C3G病例、7例供体对照、41例其他肾小球肾炎疾病对照 | NA | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx Digital Spatial Profiler与福尔马林固定石蜡包埋肾脏活检标本 |
| 47 | 2025-10-05 |
Heterogeneity of mature oligodendrocytes in the central nervous system
2025-May-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00055
PMID:38934385
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综述 | 本文系统总结了成熟少突胶质细胞在中枢神经系统中的异质性特征 | 整合了从20世纪早期研究到现代单细胞技术的证据，首次全面梳理成熟少突胶质细胞的功能和分子多样性 | 细胞亚型分类存在简化风险，且现有研究受限于时间分辨率和技术手段 | 探讨成熟少突胶质细胞在中枢神经系统中的异质性特征 | 成熟少突胶质细胞 | 神经科学 | 多发性硬化症,阿尔茨海默病,精神疾病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学,单细胞蛋白质组学 | NA | 转录组数据,形态学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 48 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptome of retinal myeloid cells in response to transplantation of human neurons reveals reversibility of microglial activation
2025-May-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.16.654622
PMID:40475635
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了视网膜移植后人源神经元引发的髓系细胞激活机制及其可逆性 | 首次在视网膜移植模型中揭示微胶质细胞激活的双向可逆轨迹 | 仅观察移植后3天的早期反应，缺乏长期动态监测数据 | 探究视网膜移植后宿主髓系细胞的激活机制和异质性 | 小鼠视网膜中的髓系细胞（微胶质细胞/巨噬细胞） | 单细胞转录组学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序，RNA Velocity分析，流式细胞分选，免疫荧光染色 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据，图像数据 | 多个视网膜样本，每个样本最多10,000个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 49 | 2025-10-05 |
Single-cell dynamics of breakthrough toxicities after anakinra prophylaxis for axicabtagene ciloleucel in lymphoma
2025-May-13, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024015161
PMID:39928957
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研究论文 | 本研究评估阿那白滞素预防性用药对淋巴瘤患者接受CAR-T细胞治疗后突破性毒性的效果，并通过单细胞RNA测序分析毒性发生的分子机制 | 首次结合阿那白滞素预防性用药与单细胞RNA测序技术，揭示CAR-T治疗相关突破性毒性的分子机制，特别是IFN-γ通路的关键作用 | 每日一次预防性阿那白滞素对大多数患者不足以预防需要住院治疗的毒性反应 | 评估阿那白滞素预防CAR-T细胞治疗相关毒性的效果，并探索突破性毒性的分子机制 | 接受axicabtagene ciloleucel治疗的大细胞淋巴瘤患者 | 单细胞测序分析 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据，细胞因子数据 | 临床试验患者群体（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 50 | 2025-10-05 |
Characterization of hyperoxia-induced senescent lung macrophages in neonatal mice
2025-May-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.09.652066
PMID:40654880
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研究论文 | 本研究通过重新分析单细胞RNA测序数据，表征了新生小鼠高氧诱导的衰老肺巨噬细胞特征 | 首次系统性地表征了高氧诱导的衰老肺巨噬细胞的异质性、组织分布和代谢失调特征 | 研究基于小鼠模型，结果向人类早产儿支气管肺发育不良的转化需要进一步验证 | 研究高氧暴露对新生小鼠肺巨噬细胞衰老的影响及其特征 | 新生小鼠的肺组织细胞 | 单细胞转录组学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | GSE207866数据集中的小鼠肺组织细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 51 | 2025-10-05 |
Antiviral CD4 + T and myeloid cell responses to influenza vaccines are attenuated in older adults
2025-May-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.30.651528
PMID:40654992
|
研究论文 | 本研究探讨老年人对流感疫苗的免疫反应差异，发现其CD4+T细胞和髓系细胞抗病毒反应减弱 | 首次结合单细胞转录组学揭示老年人髓系细胞干扰素转录特征减弱导致抗病毒T细胞反应下降 | 研究样本量有限，未涉及其他年龄组或不同疫苗类型的比较 | 研究老年人对流感疫苗的免疫反应特征及其与年龄相关的差异 | 老年人和年轻成年人的免疫细胞样本 | 免疫学 | 老年疾病 | 单细胞转录组学，体外实验，离体实验 | NA | 转录组数据，实验数据 | 未明确样本数量的人类样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2025-10-05 |
Pan-cancer landscape of basement membrane: multi-omics research and single-cell sequencing validation
2025 May-Jun, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.1080/15384101.2025.2539645
PMID:40799172
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研究论文 | 通过多组学分析和单细胞测序验证，研究基底膜在泛癌中的调控机制及其与肿瘤免疫的关系 | 首次系统描绘基底膜在33种癌症中的全景特征，结合多组学数据与单细胞测序验证基底膜重塑在免疫调节中的主动作用 | 研究主要基于TCGA数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证机制 | 探索基底膜调控基因与肿瘤免疫功能障碍的关系 | 33种癌症的基因表达数据和肿瘤微环境 | 生物信息学 | 泛癌研究 | 单细胞RNA测序,免疫组化,基因集富集分析 | 单样本基因集富集分析 | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 33种癌症的TCGA数据集 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2025-10-05 |
A novel frameshift mutation in Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 1 (PIK3R1) causes immunodeficiency and Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS)
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.655625
PMID:40568112
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研究论文 | 本研究通过鉴定PIK3R1基因的新型移码突变，揭示了其在免疫缺陷和肌萎缩侧索硬化症发病机制中的作用 | 首次报道PIK3R1基因c.1710dup移码突变导致单倍体不足，并通过iPSC模型证明其对神经元功能和存活的影响 | 研究基于单例患者样本，需要更大样本量验证 | 探究PIK3R1基因突变在免疫缺陷和神经系统疾病中的致病机制 | 携带PIK3R1 c.1710dup突变的常见变异型免疫缺陷患者及其iPSC衍生细胞模型 | 遗传学与神经科学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞RNA测序，iPSC技术，脑类器官培养 | iPSC衍生运动神经元和脑类器官模型 | 基因测序数据，单细胞转录组数据，细胞功能数据 | 1例患者及其iPSC衍生细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 54 | 2025-10-05 |
Alternatively activated monocyte-derived myeloid cells promote extracellular pathogen persistence within pulmonary fungal granulomas
2025-May-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.655817
PMID:40568097
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研究论文 | 本研究揭示了CD4 T辅助2细胞通过替代性激活单核来源髓系细胞抑制肺部真菌清除的新机制 | 发现替代性激活的髓系细胞并非真菌内在复制场所，且真菌主要存在于细胞外环境，提出了T辅助2细胞-髓系细胞环路驱动细胞外真菌持续存在的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究潜伏性真菌感染中无法产生灭菌免疫的机制 | 隐球菌肉芽肿的免疫动态和细胞结构 | 空间转录组学 | 真菌感染 | 空间转录组学, 流式细胞术, 命运图谱, 小鼠遗传工具 | NA | 空间转录组数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 55 | 2025-10-05 |
Trajectories of macrophage ontogeny and reprogramming in cancer
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112498
PMID:40475851
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了肿瘤相关巨噬细胞的发育轨迹及其在癌症免疫治疗中的重编程机制 | 首次通过伪时间分析揭示了巨噬细胞从免疫刺激状态向免疫抑制状态的发育轨迹，并发现特定基因失活可阻断这一过程 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探索肿瘤相关巨噬细胞的发育轨迹及其在免疫治疗中的作用机制 | 肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 小鼠癌症模型和癌症患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 56 | 2025-10-05 |
Orchestration of Skin Pathology in Cutaneous Lupus Erythematosus by HLA Class I Down-Regulated Senescent Epidermal Basal Cells
2025-May-19, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43244
PMID:40386939
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研究论文 | 本研究通过分析皮肤红斑狼疮患者样本和系统性红斑狼疮小鼠模型，揭示了衰老表皮基底细胞通过调控HLA I类分子表达在疾病发病机制中的关键作用 | 首次发现衰老表皮基底细胞通过异质性HLA I类分子表达调控CD8阳性T细胞毒性，创建了促进正常表皮细胞凋亡的微环境 | 样本量相对有限（CLE患者n=68，对照组n=4），且主要依赖公共数据库数据 | 探究衰老表皮基底细胞在皮肤红斑狼疮发病机制中的作用 | 皮肤红斑狼疮患者皮肤样本、系统性红斑狼疮小鼠模型 | 数字病理学 | 皮肤红斑狼疮 | 单细胞RNA测序，基因芯片分析，体外实验 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | CLE患者68例，对照组4例；单细胞测序CLE患者7例，对照组14例；SLE患者17例 | NCBI | 单细胞RNA-seq，基因芯片 | GEO数据库 | GSE184989基因芯片数据，GSE186476单细胞RNA测序数据，AMP Phase 1-Metro数据集 |
| 57 | 2025-10-05 |
scDILT: A Model-Based and Constrained Deep Learning Framework for Single-Cell Data Integration, Label Transferring, and Clustering
2025 May-Jun, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3553068
PMID:40811359
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研究论文 | 开发了一种基于条件自编码器和深度嵌入聚类的单细胞数据整合工具scDILT，用于数据整合、标签转移和聚类分析 | 首次提出同时使用同质约束和异质约束来保持参考数据集细胞聚类模式并将新数据集细胞映射到注释聚类 | NA | 开发能够同时实现单细胞数据整合、标签转移和聚类的计算框架 | 单细胞RNA测序数据和多组学单细胞数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞多组学 | 条件自编码器，深度嵌入聚类 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞多组学 | NA | NA |
| 58 | 2025-10-05 |
An engineered viral protein activates STAT5 to prevent T cell suppression
2025-05-23, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adn9633
PMID:40408430
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研究论文 | 本研究通过工程化病毒蛋白激活STAT5来增强T细胞功能并防止其耗竭 | 利用工程化的疱疹病毒TIP蛋白构建非经典平台，强制招募LCK激酶直接激活STAT蛋白，实现细胞因子非依赖的STAT激活 | 研究主要关注STAT5激活，对其他STAT蛋白的应用效果需要进一步验证 | 开发增强T细胞疗法效力的新策略 | CD8+ T细胞 | 免疫工程 | 癌症 | 单细胞转录组学、蛋白质工程 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 59 | 2025-10-05 |
Enhanced Production of Lipid Mediators in Plasma and Activation of DNA Damage Pathways in PBMCs Are Correlated With the Severity of Ancestral SARS-CoV-2 Infection
2025-May-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202403195R
PMID:40322970
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研究论文 | 本研究通过分析PBMCs和血浆样本，揭示了特定脂质介质与DNA损伤通路激活与SARS-CoV-2感染严重程度的相关性 | 首次将脂质代谢物变化与DNA损伤通路激活联系起来，并发现不同鼻咽细胞类型中类二十烷酸合成基因的特异性上调 | 样本量有限（10名感染者和10名未感染者），且为观察性研究无法确定因果关系 | 探索遗传因素和脂质代谢物与严重SARS-CoV-2感染的关联机制 | COVID-19患者和健康对照者的PBMCs、血浆及鼻咽拭子样本 | 生物信息学 | COVID-19 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 脂肪酸组分析 | NA | 基因表达数据, 脂质代谢数据 | 20名患者（10名感染者+10名未感染者）的PBMCs和血浆，58名参与者的鼻咽拭子 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2025-10-06 |
A Multimodal Spatial and Epigenomic Atlas of Human Adult Lung Topography
2025-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.655666
PMID:40475598
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研究论文 | 构建了人类成人肺部的多模态空间和表观基因组图谱 | 整合了snRNA-seq和SNARE-seq2技术，首次在相同细胞核内同时分析染色质可及性和基因表达，并通过MERFISH空间转录组学定位了25种细胞群体 | 仅使用11名健康成年人的样本，样本规模相对有限 | 开发高分辨率肺部疾病易感空间生态位参考图谱 | 人类成人肺部组织 | 空间转录组学 | 肺部疾病 | snRNA-seq, SNARE-seq2, MERFISH, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞核RNA测序, 染色质可及性, 空间转录组, 蛋白质标记 | 49个肺组织块，746,047个细胞核，来自11名健康成年人 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | SNARE-seq2（同时检测染色质可及性和基因表达）, MERFISH（空间转录组学） |