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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-04-18 |
Reparative immunological consequences of stem cell transplantation as a cellular therapy for refractory Crohn's disease
2025-May-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333558
PMID:39961646
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研究论文 | 本研究探讨了自体造血干细胞移植作为难治性克罗恩病细胞疗法的免疫修复机制 | 首次通过单细胞RNA测序和质谱流式技术揭示了干细胞移植后肠道髓系谱系的重建过程,并发现了造血干细胞亚群的功能异质性 | 样本量较小(n=19),且为单臂II期研究,缺乏对照组 | 理解干细胞移植后免疫系统重建机制,探索其作为细胞疗法治疗难治性克罗恩病的可行性 | 难治性克罗恩病患者(n=19)的血液和肠道样本,以及患者造血干细胞在小鼠异种移植模型中的功能 | NA | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),质谱流式细胞术(CyTOF),小鼠异种移植模型 | NA | 单细胞转录组数据,质谱流式细胞数据 | 19名难治性克罗恩病患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 42 | 2026-04-17 |
Library-based single-cell analysis of CAR signaling reveals drivers of in vivo persistence
2025-May-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101260
PMID:40215972
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研究论文 | 本文利用单细胞测序技术,系统研究了CAR-T细胞中不同细胞内信号域(ICD)架构如何通过信号传导影响T细胞功能,特别关注其在体内持久性和抗肿瘤效果中的作用 | 首次通过单细胞测序系统性地将多样化的CAR信号输入映射到转录输出,识别出与特定ICD架构相关的独特强直信号特征,该特征驱动了在液体肿瘤中的持久体内持久性和疗效 | 研究发现识别的强直信号特征在实体瘤中未表现出相同的驱动持久性和疗效的效果 | 解码CAR信号传导的设计原则,以指导优化用于体内功能的下一代ICD架构的理性设计 | 表达嵌合抗原受体(CARs)的工程化T细胞及其细胞内信号域(ICD) | 单细胞分析 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2026-04-11 |
Aberrant STAT signaling drives T cell dysregulation in a targetable pediatric sepsis endotype
2025-May-23, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.06.11.24308709
PMID:38946991
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研究论文 | 本研究通过整合深度免疫表型、血浆蛋白质组学、单细胞转录组学和磷酸流式细胞术,揭示了儿童脓毒症中IL-6/IFN-γ驱动的T细胞功能障碍作为一种独特的免疫失调内型 | 首次在儿童脓毒症中通过多组学方法识别出由IL-6和IFN-γ驱动的高严重性免疫亚群,并发现STAT1和STAT3的基线过度激活导致T细胞功能障碍 | 样本量相对较小(88名儿童),且为前瞻性队列研究,需要更大规模验证 | 阐明儿童脓毒症免疫异质性的机制,以开发靶向治疗 | 88名危重病儿童 | 数字病理学 | 脓毒症 | 深度免疫表型、血浆蛋白质组学、单细胞转录组学、磷酸流式细胞术、T细胞受体库分析 | 无监督聚类 | 血浆样本、单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据 | 88名危重病儿童 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 44 | 2026-04-10 |
Single-cell elderly blood-CSF atlas implicates peripherally influenced immune dysregulation in normal pressure hydrocephalus
2025-May-13, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412159122
PMID:40324076
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了特发性正常压力脑积水患者外周血和脑脊液的细胞图谱,揭示了与认知功能下降相关的免疫失调 | 首次创建了特发性正常压力脑积水的单细胞转录组图谱,并发现了外周血和脑脊液单核细胞的促炎性改变与认知功能的相关性 | 样本仅来自特发性正常压力脑积水患者,缺乏健康对照组或其他神经系统疾病对照 | 探究特发性正常压力脑积水的免疫失调机制及其与认知功能的关系 | 特发性正常压力脑积水患者的外周血和脑脊液细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 140,207个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2026-04-07 |
SARS-CoV-2 induced immune perturbations in infants vary with disease severity and differ from adults' responses
2025-May-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59411-z
PMID:40379618
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和血清分析,揭示了SARS-CoV-2感染婴儿的免疫反应特征,并与成人进行比较 | 首次系统研究重症COVID-19住院婴儿的免疫反应,发现婴儿与成人在T细胞和B细胞中的干扰素刺激基因签名存在显著差异 | 样本量较小(n=26),且仅针对住院婴儿,可能无法代表所有感染婴儿群体 | 探究SARS-CoV-2感染婴儿的免疫反应差异及其与疾病严重程度和成人反应的比较 | SARS-CoV-2感染的婴儿(n=26,包括亚急性、中度和重症)及匹配的对照组婴儿(n=14) | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),血清细胞因子分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,血清浓度数据 | 40名婴儿(26名感染,14名对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 46 | 2026-04-04 |
Randomized phase 2 trial of pembrolizumab alone or in combination with low dose chemotherapy for patients with non-small cell lung cancer and poor performance status
2025-May, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.lungcan.2025.108513
PMID:40203764
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研究论文 | 本研究是一项随机II期临床试验,旨在比较帕博利珠单抗单药与联合低剂量化疗在体能状态差的晚期非小细胞肺癌患者中的疗效和安全性 | 首次在体能状态差(ECOG PS 2)的晚期NSCLC患者中,直接比较帕博利珠单抗单药与联合极低剂量化疗的疗效,并探索了基于血液的生物标志物,包括使用流式细胞术和单细胞测序分析免疫细胞 | 样本量较小(共43例患者),研究为II期试验,需要更大规模的III期试验验证结果;生物标志物分析为可选项目,样本量有限 | 确定帕博利珠单抗单药或联合低剂量化疗在体能状态差的晚期非小细胞肺癌患者中的最佳治疗方案 | 晚期非小细胞肺癌且ECOG体能状态评分为2的患者 | NA | 肺癌 | 流式细胞术,单细胞测序 | NA | 临床数据,血液样本数据 | 43例患者(每组20例可评估疗效),其中20例提供了可选血液样本用于生物标志物分析 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 47 | 2026-04-03 |
Single-cell RNA sequencing and functional analysis reveal the role of altered glycosylation levels of hepatic macrophages in liver cirrhosis
2025-05, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-025-02218-y
PMID:39888412
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能分析,揭示了肝巨噬细胞糖基化水平改变在肝硬化中的作用 | 首次在单细胞水平上结合糖基化和转录组数据,分析肝硬化中免疫细胞糖基化模式的变化及其功能影响,特别是巨噬细胞在免疫微环境重塑中的核心作用 | 研究基于现有数据,样本量可能有限,且未进行实验验证糖基化靶向治疗策略的有效性 | 探究肝硬化中免疫细胞糖基化水平的变化及其在疾病进展中的作用 | 肝硬化患者和健康对照者的肝组织样本 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 肝硬化与健康对照肝组织样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2026-04-01 |
Spatial transcriptomics from pancreas and local draining lymph node tissue reveals a lymphotoxin-β signature in human type 1 diabetes
2025-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.19.654940
PMID:40475580
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学探索了1型糖尿病自然史中胰腺及胰腺引流淋巴结的炎症反应特征 | 首次在人类1型糖尿病中结合空间转录组学与公共单细胞RNA测序数据,揭示了胰腺及引流淋巴结中淋巴毒素-β等特异性炎症特征 | 样本来源有限,仅包括非糖尿病患者和高风险自身抗体阳性个体,未涵盖疾病所有阶段 | 解析1型糖尿病发病过程中胰腺及引流淋巴结的炎症分子特征 | 人类胰腺组织及胰腺引流淋巴结组织 | 空间转录组学 | 1型糖尿病 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 包括非糖尿病患者和高风险自身抗体阳性个体的胰腺及淋巴结样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2026-03-31 |
Pseudoassembly of k-mers
2025-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.11.653354
PMID:40463286
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研究论文 | 本文介绍了一种通过彩色de Bruijn图识别基因组序列变异的方法,并实现了名为klue的程序进行伪组装 | 提出基于彩色de Bruijn图的伪组装方法,能够从单细胞RNA-seq数据中识别细胞类型特异性变异 | NA | 开发一种识别基因组序列变异的新方法 | 小鼠黑色素瘤模型中的单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA-seq | 彩色de Bruijn图 | 基因组序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 50 | 2026-03-31 |
Molecular and Biophysical Perspectives on Dormancy Breaking: Lessons from Yeast Spore
2025-05-11, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15050701
PMID:40427594
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综述 | 本文综述了当前关于细胞休眠分子机制的知识,特别聚焦于两种主要酵母模型,并总结了通过单细胞RNA-seq、蛋白质组学分析和活细胞成像等多方面方法揭示的基因表达、蛋白质组组成和活力的动态变化 | 整合了分子和生物物理视角,特别是通过研究细胞质流动性变化来理解休眠细胞调控,提供了对休眠和休眠打破过程的新理解 | NA | 阐明休眠和休眠打破的分子和生物物理原理 | 酵母孢子作为模型系统,以及广泛的物种如细菌、真菌、植物和缓步动物 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学分析, 活细胞成像 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 51 | 2026-03-28 |
Longitudinal single cell RNA-sequencing reveals evolution of micro- and macro-states in chronic myeloid leukemia
2025-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.14.653262
PMID:40661452
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研究论文 | 本文通过纵向单细胞RNA测序研究慢性髓系白血病的进展,揭示了微观和宏观转录状态的演变 | 利用状态转移理论,揭示了细胞类型特异性贡献如何调控稳健的疾病表型状态转移,建立了从单细胞尺度到宏观状态水平的理论框架 | NA | 探索单细胞与批量转录组学中癌症特异性信息内容,解析离散疾病定义状态如何从噪声单细胞数据中涌现 | 慢性髓系白血病 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2026-03-28 |
Claudin18.2-positive gastric cancer-specific changes in neoadjuvant chemotherapy-driven immunosuppressive tumor microenvironment
2025-May, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-02981-y
PMID:40128286
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光分析,揭示了CLDN18.2阳性胃癌在新辅助化疗驱动下肿瘤微环境的特异性免疫抑制变化 | 首次在单细胞水平上揭示了CLDN18.2阳性胃癌化疗后独特的免疫抑制微环境变化,包括NK细胞ADCC相关基因下调、Tregs和TAMs中TGFB1表达上调,以及特定的细胞间相互作用信号通路 | 样本量较小(37例GC样本,其中仅11例CLDN18.2阳性),且为观察性研究,需要更大样本和功能验证实验 | 探究CLDN18.2阳性胃癌在新辅助化疗作用下肿瘤微环境的特异性变化,以解释化疗联合抗CLDN18.2抗体疗效有限的原因 | 胃癌组织样本,特别是CLDN18.2阳性和阴性的胃癌患者样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,免疫荧光图像数据 | 37例胃癌样本(包括11例CLDN18.2阳性和26例CLDN18.2阴性样本) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 53 | 2026-03-25 |
Tissue signatures of human macrophages during homeostasis and activation
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.655632
PMID:40501660
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研究论文 | 本研究利用多模态单细胞测序技术,定义了来自不同组织(肺、小肠、脾脏、骨髓和淋巴结)的人类巨噬细胞在稳态和激活状态下的组织特异性特征 | 首次系统性地描绘了人类黏膜和淋巴器官中巨噬细胞在稳态和激活状态下的组织特异性转录和蛋白特征,并揭示了这些特征在极化刺激下仍能保持 | 研究样本来源于器官捐献者,可能无法完全代表所有生理或病理状态;未涵盖所有人体组织 | 阐明人类巨噬细胞在不同组织(特别是黏膜和淋巴器官)中的身份如何与其定居部位耦合,并在激活和极化过程中维持 | 从个体器官捐献者分离的肺、小肠、脾脏、骨髓和淋巴结组织中的巨噬细胞和单核细胞 | 单细胞组学 | NA | 多模态单细胞测序,刺激实验 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白数据 | 来自个体器官捐献者的多个组织样本(肺、小肠、脾脏、骨髓、淋巴结) | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 54 | 2026-03-24 |
Synergistic effects of PA (S184N) and PB2 (E627K) mutations on the increased pathogenicity of H3N2 canine influenza virus infections in mice and dogs
2025-05-20, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01984-24
PMID:40183583
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研究论文 | 本研究揭示了PA(S184N)和PB2(E627K)突变对H3N2犬流感病毒在小鼠和犬中致病性增强的协同作用及其分子机制 | 首次通过小鼠体内连续传代建立了致死性H3N2犬流感病毒感染模型,并揭示了PA(S184N)和PB2(E627K)突变协同增强病毒致病性的新机制,同时利用单细胞RNA测序在单细胞水平阐明了病毒逃逸宿主抗病毒反应的机制 | 研究主要基于小鼠和犬的感染模型,对人类感染的直接风险评估仍需进一步研究;单细胞测序分析仅针对小鼠肺组织,犬类组织的免疫反应机制可能有所不同 | 阐明H3N2犬流感病毒适应哺乳动物的分子机制,评估其跨物种传播风险 | H3N2犬流感病毒(CIV)及其突变株,感染的小鼠和犬 | 病毒学与传染病学 | 流感病毒感染 | 病毒连续传代、突变鉴定、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因序列数据、单细胞转录组数据、病毒滴度数据 | 小鼠和犬的感染模型(具体数量未在摘要中明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 55 | 2026-03-20 |
Glucagon-like peptide-1 receptor signaling activation in alveolar type II cells enhances lung development in neonatal rats exposed to hyperoxia
2025-05, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103586
PMID:40080965
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研究论文 | 本研究探讨了胰高血糖素样肽-1受体(GLP-1R)在新生大鼠高氧暴露模型中通过调节肺泡II型细胞的线粒体分裂和糖代谢促进肺发育的作用机制 | 首次揭示了GLP-1R在肺泡II型细胞中通过m6A甲基化修饰调控线粒体分裂和糖代谢,从而影响肺发育的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,尚未在临床样本中验证,且机制研究集中在METTL14介导的m6A修饰,可能存在其他调控途径 | 探索GLP-1R在调节肺发育中的作用及其潜在机制,特别是在支气管肺发育不良(BPD)模型中的应用 | 新生Sprague-Dawley大鼠的肺组织、原代肺泡II型细胞和RLE-6TN细胞系 | NA | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序、Western blotting、免疫荧光染色、Seahorse XF96代谢分析、RT-qPCR、MeRIP-qPCR | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、代谢数据 | 新生大鼠分组(高氧组与对照组),在出生后3、7、10、14天提取肺组织,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 56 | 2026-03-20 |
Extracellular vesicle-packaged GBP2 from macrophages aggravates sepsis-induced acute lung injury by promoting ferroptosis in pulmonary vascular endothelial cells
2025-05, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2025.103614
PMID:40156957
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研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞来源的细胞外囊泡通过递送GBP2蛋白,与OTUD5结合并促进GPX4泛素化,从而诱导肺血管内皮细胞铁死亡,加剧脓毒症诱导的急性肺损伤的机制 | 首次发现巨噬细胞来源的EVs通过GBP2-OTUD5-GPX4轴驱动内皮细胞铁死亡,并筛选出靶向GBP2的小分子化合物Plantainoside D,为si-ALI提供了新的治疗靶点 | 研究主要在细胞和小鼠模型中进行,临床转化潜力需进一步验证;GBP2在其他细胞类型中的作用未明确 | 阐明巨噬细胞来源的细胞外囊泡在脓毒症诱导的急性肺损伤中的作用机制,并探索潜在治疗策略 | 巨噬细胞(THP-1、RAW264.7)、肺血管内皮细胞、脓毒症患者外周血样本、CLP小鼠模型 | 分子病理学 | 脓毒症诱导的急性肺损伤 | 蛋白质组测序、转录组测序、单细胞测序、RNA干扰、腺相关病毒转染、分子对接、分子动力学模拟、细胞热位移分析 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞数据 | 脓毒症患者外周血样本、细胞系(THP-1、RAW264.7)、CLP小鼠模型 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 57 | 2026-03-18 |
PINK1 link mitochondria-ER contacts controls deposition of intramuscular fat in pigs
2025-05-20, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151672
PMID:40138759
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研究论文 | 本研究探讨了PINK1蛋白通过调控线粒体-内质网相互作用来调节猪肌肉内脂肪沉积的分子机制 | 首次揭示了PINK1在猪肌肉内脂肪沉积中的关键作用,并发现其通过调控线粒体-内质网接触来影响脂肪沉积过程 | 研究主要基于猪模型,结果在人类或其他物种中的适用性尚需验证 | 探究PINK1如何调控猪肌肉内脂肪沉积的分子机制 | 猪的肌肉组织、纤维-脂肪祖细胞和脂肪细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个猪品种的肌肉组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 58 | 2026-03-18 |
Dissecting the Single-Cell Diversity and Heterogeneity Underlying Cervical Precancerous Lesions and Cancer Tissues
2025-05, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-024-01695-5
PMID:39354287
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研究论文 | 本文通过整合单细胞数据集,研究了从宫颈癌前病变到宫颈鳞状细胞癌的细胞多样性和异质性 | 利用单细胞组成数据分析(scCODA)揭示细胞类型组成变化,并通过ATAC-seq分析将表观遗传改变与基因表达谱关联,识别了关键转录因子(如YY1) | 研究依赖于现有数据集整合,可能受样本来源和技术差异影响,且新队列数据(HRA001742)的相似性评估仅基于逻辑回归模型 | 探究宫颈癌前病变到宫颈鳞状细胞癌的细胞多样性和异质性,为靶向治疗提供基础 | 正常组织、癌旁组织、癌前病变和宫颈肿瘤的单细胞数据 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, RT-qPCR, 免疫组化(IHC) | 逻辑回归模型 | 单细胞测序数据, 表观遗传数据, 基因表达数据 | 四个单细胞数据集,包括正常组织、癌旁组织、癌前病变和宫颈肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 59 | 2026-03-17 |
Single-cell profiling demonstrates the combined effect of wheeze phenotype and infant viral infection on airway epithelial development
2025-May-23, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adr9995
PMID:40408478
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了2至3岁儿童鼻气道上皮细胞的发育表型,探讨了喘息表型和婴儿期呼吸道合胞病毒感染对气道上皮发育的联合影响 | 首次在预先设计的嵌套出生队列中,结合喘息表型和RSV感染状态,使用单细胞RNA测序技术系统表征了儿童气道上皮的发育异常和免疫反应变化 | 研究样本局限于特定年龄段的儿童,且为观察性研究,难以确定因果关系 | 阐明哮喘儿童气道上皮的发育机制,特别是喘息表型和早期RSV感染对其的影响 | 2至3岁儿童的鼻气道上皮细胞 | 数字病理学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自四个互斥组的儿童(喘息/非喘息与RSV感染/未感染组合) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2026-03-17 |
Single-cell transcriptomics reveals targeted modulation of inflammatory repertoire by SOCE blockers
2025-May-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.28.651042
PMID:40654653
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学研究了SOCE阻断剂BTP2和CM4620对人类外周血单个核细胞中免疫细胞炎症反应的靶向调节作用 | 首次利用多重单细胞RNA测序揭示SOCE阻断剂对CD8效应T细胞、NK细胞和CD4调节性T细胞炎症基因表达的差异性调控,显示其比传统免疫抑制剂更具选择性 | 研究仅基于体外多克隆刺激的正常人PBMCs,未涉及体内模型或疾病状态,且SOCE阻断剂的作用机制仍需进一步探索 | 探究SOCE阻断剂对免疫细胞功能的调控机制及其治疗潜力 | 正常人外周血单个核细胞(PBMCs) | 单细胞转录组学 | 免疫介导性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量,使用正常人PBMCs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |