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当前共找到 800 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-01-08 |
Time-Varying Gene Regulatory Networks Inference Using KL Divergence from Single Cell Data
2025-May, Proceedings of the ... International Conference on Bioinformatics and Biomedical Technology
DOI:10.1109/icbbt65815.2025.11276344
PMID:41488127
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研究论文 | 本文提出了一种基于KL散度的新框架，用于从时间序列单细胞RNA测序数据中推断时变基因调控网络 | 整合KL散度的时间变异测量、自回归模型和正则化方法，以应对高维、稀疏和时序异质性的挑战 | NA | 从时间序列单细胞RNA测序数据中准确重建动态基因调控网络 | 10基因合成数据集和THP-1单核细胞分化数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自回归模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 42 | 2026-01-06 |
Mapping satellite glial cell heterogeneity reveals distinct spatial organization and signifies functional diversity in the dorsal root ganglion
2025-May-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.19.654813
PMID:40475507
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研究论文 | 本研究首次全面表征了小鼠背根神经节中卫星胶质细胞的异质性，并通过整合单细胞RNA测序与免疫组化等技术，识别、验证并空间定位了四个不同的SGC亚群 | 首次在小鼠背根神经节中对卫星胶质细胞异质性进行综合表征，识别并空间定位了四个功能不同的SGC亚群，并在人类DRG中发现了内外双层SGC结构 | NA | 探究背根神经节中卫星胶质细胞的异质性、空间分布及其潜在功能意义 | 小鼠和人类背根神经节中的卫星胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 原位杂交, 先进成像技术 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 43 | 2026-01-06 |
High-Sensitivity PD-L1 Staining Using Clone 73-10 Antibody and Spatial Transcriptomics for Precise Expression Analysis in Non-Tumorous, Intraepithelial Neoplasia, and Squamous Cell Carcinoma of Head and Neck
2025-May-20, Head and neck pathology
DOI:10.1007/s12105-025-01798-8
PMID:40392349
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研究论文 | 本研究利用高灵敏度克隆73-10抗体和空间转录组学技术，评估头颈部鳞状细胞癌中PD-L1的表达，旨在扩大免疫检查点抑制剂治疗的适用患者范围 | 首次结合高灵敏度克隆73-10抗体和空间转录组学分析，系统评估PD-L1在头颈部鳞状细胞癌、上皮内瘤变及正常组织中的表达，并揭示其与免疫微环境及预后的关联 | 样本量相对有限（94例临床样本，其中6例进行空间转录组学分析），且为单中心研究，可能影响结果的普遍性 | 评估PD-L1在头颈部鳞状细胞癌中的表达，探索其作为免疫治疗生物标志物的潜力，以优化患者筛选策略 | 头颈部鳞状细胞癌患者组织样本，包括癌组织、配对的上皮内瘤变及正常口腔黏膜 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 免疫组织化学染色，空间转录组学 | NA | 组织图像，转录组数据 | 94例头颈部鳞状细胞癌临床样本，包括配对的鳞状上皮内瘤变和正常口腔黏膜样本，其中6例进行了空间转录组学分析 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 44 | 2026-01-04 |
Pseudoassembly of k-mers
2025-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.11.653354
PMID:40463286
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研究论文 | 本文介绍了一种通过彩色de Bruijn图识别基因组序列变异的方法，并实现了名为klue的程序 | 提出了一种基于k-mer伪组装的方法，用于识别单细胞RNA-seq数据中的细胞类型特异性变异 | NA | 开发一种识别基因组序列变异的新方法 | 小鼠黑色素瘤模型中的单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA-seq | 彩色de Bruijn图 | 基因组序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2026-01-02 |
Resident CD24 +LCN2 + LPCs aggravate fibrosis and inflammatory progression via the recruitment of TPPP3 +COL10A1 + macrophages in NASH
2025-May-16, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025081
PMID:40380802
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研究论文 | 本研究揭示了在非酒精性脂肪性肝炎（NASH）中，驻留的CD24+LCN2+肝脏祖细胞（LPCs）通过招募TPPP3+COL10A1+巨噬细胞亚型，加剧纤维化和炎症进展 | 首次在人类NASH中鉴定出驻留的CD24+LCN2+ LPCs，并阐明其通过促进促炎性巨噬细胞亚型（MP-2，标记为COL10A1和TPPP3）的激活来驱动纤维化的分子机制 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和计算分析，虽然在小鼠模型和人类样本中进行了验证，但具体的功能机制和靶向干预策略仍需进一步实验验证 | 探究人类NASH中肝脏祖细胞（LPCs）的分子表型及其调控机制，特别是在纤维化和炎症进展中的作用 | 人类NASH患者的肝脏样本、NASH小鼠模型（CDAHFD和HFD）以及相关的RNA测序数据集 | 单细胞组学 | 非酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNA测序、细胞通讯分析（CellChat和NicheNet） | NA | 单细胞RNA测序数据、RNA测序数据 | 临床NASH样本、NASH小鼠模型及人类NASH肝脏样本（具体数量未在摘要中明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 46 | 2026-01-02 |
Randomized phase 2 trial of pembrolizumab alone or in combination with low dose chemotherapy for patients with non-small cell lung cancer and poor performance status
2025-May, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.lungcan.2025.108513
PMID:40203764
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研究论文 | 本研究是一项针对体能状态不佳的晚期非小细胞肺癌患者的随机II期临床试验，比较了帕博利珠单抗单药与联合低剂量化疗的疗效 | 首次在体能状态不佳（ECOG PS 2）的晚期NSCLC患者中，直接比较帕博利珠单抗单药与联合极低剂量化疗的疗效，并探索了相关的血液生物标志物 | 样本量较小（共43例患者），为II期研究，需要更大规模的III期试验验证结果 | 确定对于体能状态不佳的晚期非小细胞肺癌患者，帕博利珠单抗联合低剂量化疗是否比单药帕博利珠单抗更有效 | 晚期非小细胞肺癌且ECOG体能状态评分为2的患者 | NA | 肺癌 | 流式细胞术, 单细胞测序 | NA | 临床数据, 血液样本 | 43名患者（每组20名可评估疗效），其中20名提供了可选血液样本用于生物标志物分析 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 47 | 2025-12-24 |
EnrichSci: Transcript-guided Targeted Cell Enrichment for Scalable Single-Cell RNA Sequencing
2025-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.02.651937
PMID:40654882
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研究论文 | 本研究开发了一种名为EnrichSci的可扩展单细胞RNA测序平台，用于靶向富集和解析复杂组织中稀有细胞类型的转录组动态 | 结合杂交链式反应RNA FISH与组合索引技术，实现了无需微流控的靶向细胞富集，并首次在单细胞水平揭示了衰老过程中少突胶质细胞亚型的转录后调控特征 | 研究目前仅在小鼠脑衰老模型中验证，尚未在人类样本或其他疾病模型中广泛应用 | 开发可扩展的靶向单细胞转录组测序技术，以解析复杂组织中稀有细胞类型的分子动态 | 衰老小鼠脑组织中的少突胶质细胞及其亚型 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序，杂交链式反应RNA FISH，组合索引 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | EnrichSci | 结合杂交链式反应RNA FISH与组合索引的微流控-free单核转录组测序平台 |
| 48 | 2025-12-20 |
Resolving Leukemia Heterogeneity and Lineage Aberrations with HematoMap
2025-05-30, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf005
PMID:39945785
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据构建了正常造血过程的综合参考层次结构，并开发了HematoMap工具，用于解析白血病异质性和谱系异常 | 开发了基于余弦距离算法的似然评分系统，能够将白血病细胞精确映射到正常造血层次结构，并创建了用户友好的R包HematoMap用于可视化分析 | 研究主要基于25名健康供体的数据构建参考层次，样本量相对有限，且主要针对AML和BCP-ALL两种白血病类型 | 解析白血病异质性，将白血病细胞精确映射到正常造血层次结构，以理解疾病起源和发展机制 | 急性髓系白血病（AML）和B细胞前体急性淋巴细胞白血病（BCP-ALL）患者的白血病细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | LASSO（最小绝对收缩和选择算子）评分模型 | 单细胞RNA测序数据，批量RNA测序数据 | 25名健康供体的超过100,000个骨髓单个核细胞，以及AML和BCP-ALL患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2025-12-19 |
Temporal transcriptomic changes in the THY-Tau22 mouse model of tauopathy display cell type- and sex-specific differences
2025-05-07, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02013-z
PMID:40336141
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了THY-Tau22小鼠模型中tau蛋白病的性别和年龄依赖性转录组变化 | 首次在THY-Tau22小鼠模型中系统揭示了tau蛋白病相关的性别特异性转录组变化及其年龄依赖性演化 | 研究仅基于小鼠模型，人类数据的验证有限，且样本年龄点较少 | 探究阿尔茨海默病相关tau蛋白病中性别特异性和性别二态性转录组变化的细胞类型特异性及年龄依赖性 | THY-Tau22转基因小鼠和野生型小鼠的皮质组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 17月龄和7月龄的THY-Tau22及野生型小鼠皮质组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 50 | 2025-12-17 |
EryDB: A Transcriptomic Profile Database for Erythropoiesis and Erythroid-related Diseases
2025-05-30, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae029
PMID:39436241
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研究论文 | 本文介绍了EryDB，一个专为红细胞生成和红细胞相关疾病设计的开放获取转录组数据库，整合了多种物种和疾病的数据 | EryDB是首个全面整合红细胞生成和红细胞相关疾病转录组数据的数据库，支持单细胞和批量RNA测序数据的计算分析 | 数据库目前仅包含三个物种的数据，可能未覆盖所有相关疾病或组织类型 | 构建一个综合数据库以促进红细胞生成和红细胞相关疾病的基因表达数据挖掘和大规模研究 | 红细胞生成过程、红细胞相关疾病以及来自人类、小鼠和斑马鱼的转录组数据 | 生物信息学 | 红细胞相关疾病 | RNA测序（包括单细胞和批量RNA测序） | NA | 转录组数据 | 3803个样本和1,187,119个单细胞，来自107项公共研究 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 51 | 2025-12-17 |
CIEC: Cross-tissue Immune Cell Type Enrichment and Expression Map Visualization for Cancer
2025-05-10, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae067
PMID:39363510
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研究论文 | 本文介绍了一个名为CIEC的基于网络的应用程序，用于跨组织免疫细胞类型或状态的富集分析和可视化，以探索癌症患者的免疫细胞特征 | 首次开发了一个集成数据库和富集分析的网络应用程序，用于估计跨组织免疫细胞类型或状态，并提供了多组织免疫细胞特征的全面分析界面 | 样本量相对有限（323名患者），且仅覆盖了特定癌症类型和组织的480个样本，可能无法代表所有癌症或免疫细胞状态 | 通过整合单细胞转录组测序数据，构建跨组织免疫细胞类型/状态图谱，以深入理解肿瘤免疫系统并指导癌症免疫生物标志物开发和免疫治疗策略 | 癌症患者的免疫细胞，包括来自原发性肿瘤、邻近正常组织、淋巴结、转移组织和外周血的样本 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞转录组测序 | KOBAS算法 | 单细胞RNA-seq数据 | 323名癌症患者的480个样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2025-12-16 |
Brain tumors induce immunoregulatory dendritic cells in draining lymph nodes that can be targeted by OX40 agonist treatment
2025-May-19, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011548
PMID:40389372
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研究论文 | 本研究探讨了脑肿瘤如何诱导引流淋巴结中的免疫调节性树突状细胞，并发现OX40激动剂治疗可靶向这些细胞 | 揭示了脑肿瘤引流淋巴结中树突状细胞的独特免疫调节功能，并首次将OX40信号通路与CCR7+OX40+树突状细胞的直接作用及对T细胞的间接影响联系起来 | 研究基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；未详细探讨其他免疫细胞或信号通路在脑肿瘤免疫微环境中的潜在作用 | 研究脑肿瘤免疫微环境中树突状细胞的免疫调节功能及其对治疗反应的影响 | 小鼠胶质瘤和淋巴瘤模型中的树突状细胞及T细胞 | 免疫学 | 脑肿瘤 | 高分辨率流式细胞术、单细胞RNA测序、体外和体内功能表征 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据 | 小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2025-12-15 |
O-GlcNAcylation stabilized WTAP promotes GBM malignant progression in an N6-methyladenosine-dependent manner
2025-May-15, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noae268
PMID:39671515
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研究论文 | 本文探讨了O-GlcNAcylation稳定的WTAP通过N6-甲基腺苷依赖方式促进胶质母细胞瘤恶性进展的机制 | 揭示了WTAP通过O-GlcNAcylation和去泛素化增强稳定性，调控LOXL2的m6A修饰，进而影响胶质母细胞瘤干细胞间充质转化和免疫微环境形成的新机制 | NA | 研究m6A在胶质母细胞瘤免疫抑制微环境形成中的作用机制 | 间充质胶质母细胞瘤干细胞和髓源性巨噬细胞 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、bulk RNA-seq、质谱分析、RNA免疫沉淀、共免疫沉淀 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 54 | 2025-12-15 |
scRegulate: Single-Cell Regulatory-Embedded Variational Inference of Transcription Factor Activity from Gene Expression
2025-May-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.17.649372
PMID:40654959
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scRegulate的生成式深度学习框架，用于从单细胞RNA测序数据中推断转录因子活性 | scRegulate通过变分推理整合基因调控网络先验知识，提供了一种可扩展且生物学可解释的解决方案，能够捕获新颖、动态和上下文特定的调控相互作用 | NA | 开发一种从单细胞RNA测序数据中准确推断转录因子活性的计算方法 | 转录因子活性和基因调控网络 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 生成式深度学习框架，变分推理 | 单细胞RNA测序数据 | 多个公共实验和合成数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 55 | 2025-12-11 |
Spatiotemporal Single-Cell Analysis Reveals T Cell Clonal Dynamics and Phenotypic Plasticity in Human Graft-versus-Host Disease
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.24.655962
PMID:40501545
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研究论文 | 本研究通过时空单细胞分析揭示了人类移植物抗宿主病中T细胞克隆动态和表型可塑性 | 开发了新型计算工具DecompTCR用于纵向TCR分析，并结合多组学技术揭示了GVHD中T细胞克隆扩增与疾病严重性的关联 | 样本量相对较小（27例患者），且主要关注肠道组织，可能未全面覆盖其他器官的免疫反应 | 解析异基因造血细胞移植后急性移植物抗宿主病的T细胞介导病理机制 | 27例异基因造血细胞移植受者的血液和肠道组织样本 | 数字病理学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA/TCR测序、空间转录组学、混合淋巴细胞反应克隆指纹识别、TCR克隆分型 | NA | 单细胞RNA-seq数据、TCR序列数据、空间转录组数据 | 27例异基因造血细胞移植受者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 56 | 2025-12-06 |
Machine learning and single-cell analysis uncover distinctive characteristics of CD300LG within the TNBC immune microenvironment: experimental validation
2025-May-17, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01690-3
PMID:40382513
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研究论文 | 本研究通过机器学习与单细胞分析，揭示了CD300LG在三阴性乳腺癌免疫微环境中的独特作用，并进行了实验验证 | 首次结合四种机器学习算法与单细胞测序数据，系统鉴定CD300LG作为TNBC独特的预后生物标志物，并阐明其与免疫浸润、细胞周期及肿瘤侵袭的关联 | 未明确说明样本的具体来源与数量细节，机器学习模型的泛化能力需进一步验证 | 探究CD300LG在三阴性乳腺癌肿瘤微环境中的关键功能及其作为治疗靶点的潜力 | 三阴性乳腺癌患者的转录组数据、单细胞测序数据及肿瘤组织样本 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色，转录组分析 | 多种机器学习算法（包括CIBERSORT, ssGSEA, TIDE, TCGA算法） | 转录组数据，单细胞测序数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 57 | 2025-12-04 |
Immune cell type divergence in a basal chordate
2025-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.20.655184
PMID:40661343
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序等技术，定义了基础脊索动物血细胞状态的身份，揭示了其分化层次和免疫细胞类型的多样性 | 首次在基础脊索动物中应用单细胞RNA测序结合杂交和活体报告基因技术，系统性地定义了血细胞状态，并扩展了脊索动物免疫细胞的已知谱系 | 研究主要基于单一物种，且无脊椎动物免疫细胞的分子特征描述有限，与脊椎动物免疫细胞类型的同源性仍不明确 | 探究基础脊索动物免疫细胞类型的进化与分化，以理解细胞类型在进化中的适应性变化 | 基础脊索动物的循环血细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 杂交, 活体报告基因 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 58 | 2025-12-04 |
Neural signaling contributes to heart formation and growth in the invertebrate chordate, Ciona robusta
2025-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.28.651085
PMID:40654768
|
研究论文 | 本研究揭示了神经肽速激肽与经典Wnt信号通路共同调控海鞘心肌祖细胞增殖的机制 | 首次在海鞘模型中阐明神经信号（速激肽）与Wnt信号协同调控心脏发育，并发现神经元细胞直接支配心肌祖细胞 | 研究主要基于无脊椎脊索动物模型，结论在脊椎动物中的普适性需进一步验证 | 探究神经信号在心脏发育与生长调控中的作用机制 | 海鞘（Ciona robusta）成体心脏组织 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CRISPR-Cas9基因敲除、药理学抑制 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 59 | 2025-11-22 |
White and Brown Adipose Tissue Share a Common Fibro-Adipogenic Progenitor Population
2025-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.28.656577
PMID:40501707
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现白色和棕色脂肪组织共享共同的纤维-脂肪生成祖细胞群 | 首次在棕色脂肪组织中鉴定出纤维-脂肪生成祖细胞样细胞，扩展了脂肪祖细胞群的认识 | 使用体外培养的原代前脂肪细胞，可能无法完全反映体内情况 | 研究脂肪组织异质性及其祖细胞身份 | 培养的原代白色和棕色前脂肪细胞 | 单细胞生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析、调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 60 | 2025-11-18 |
Single-Cell RNA Sequencing of Ewing Sarcoma Tumors Demonstrates Transcriptional Heterogeneity and Clonal Evolution
2025-May-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2040
PMID:40029262
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析尤文肉瘤肿瘤的转录异质性和克隆进化 | 首次在尤文肉瘤中应用单细胞RNA测序揭示肿瘤转录异质性、克隆进化及免疫抑制微环境，并发现TSPAN8作为潜在治疗靶点 | 样本量较小（7名未治疗患者），循环肿瘤细胞验证使用独立队列 | 探究尤文肉瘤肿瘤异质性及其对治疗的意义 | 尤文肉瘤患者肿瘤组织、肿瘤微环境和循环肿瘤细胞 | 单细胞测序分析 | 尤文肉瘤 | 单细胞RNA测序，免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 7名未治疗尤文肉瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |