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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2025-10-06 |
scRDEN: single-cell dynamic gene rank differential expression network and robust trajectory inference
2025-May-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-01969-1
PMID:40374885
|
研究论文 | 提出scRDEN方法用于单细胞动态基因排序差异表达网络构建和稳健的轨迹推断 | 将不稳定的基因表达值转换为相对稳定的基因-基因相互作用,提取差异表达顺序,并整合不同降维方法的表达特征 | NA | 深入理解细胞命运决定的异质性,分析动态调控变化并准确推断分化轨迹 | 人和小鼠细胞分化过程中的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | scRDEN网络模型 | 单细胞RNA测序数据 | 五个已发表数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 542 | 2025-10-06 |
Deciphering the role of acetylation-related gene NAT10 in colon cancer progression and immune evasion: implications for overcoming drug resistance
2025-May-15, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02617-w
PMID:40374962
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了乙酰化相关基因NAT10在结肠癌进展和免疫逃逸中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法系统研究NAT10在结肠癌中的致病机制和免疫逃逸特性 | 研究主要基于公共数据集,缺乏实验验证;样本来源和数量可能存在限制 | 阐明乙酰化相关基因在结肠癌进展和免疫逃逸中的作用机制 | 结肠癌患者样本中的上皮细胞和免疫细胞 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 孟德尔随机化, 全基因组关联分析 | 细胞-细胞相互作用模型, 生存分析模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 空间转录组数据 | 来自GSE132465、UCSC Xena、GeneCards和TCGA等公共数据库的结肠癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 543 | 2025-10-06 |
Atf3 + senescent chondrocytes mediate meniscus degeneration in aging
2025-May-15, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-025-03566-z
PMID:40375324
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了Atf3+衰老软骨细胞在衰老半月板退行性变中的关键作用及其通过ANGPTL4信号通路介导的机制 | 首次在衰老半月板中鉴定出Atf3+衰老软骨细胞这一关键致病细胞群,并发现其通过ANGPTL4-SDC4轴介导的信号通路驱动半月板退行性变 | 研究仅使用大鼠模型,样本量相对有限,需要进一步在人类组织中验证 | 阐明衰老半月板的细胞和分子机制,识别关键致病细胞群和信号通路 | 年轻(12周)和老年(24个月)大鼠的半月板组织 | 单细胞转录组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 组织学分析, 流式细胞术 | Seurat, Monocle 2, CellChat | 单细胞转录组数据, 组织图像数据 | 年轻和老年大鼠半月板组织(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 544 | 2025-10-06 |
Characterization and prognostic of CD8 + TIM3 + CD101 + T cells in glioblastoma multiforme
2025-May-15, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01390-1
PMID:40375334
|
研究论文 | 本研究通过分析多形性胶质母细胞瘤中的CD8+TIM3+CD101+T细胞特征,建立了预后模型并探索了治疗策略 | 首次系统表征GBM中CCT细胞的基因表达特征,构建了包含22个基因特征的预后模型,并揭示了CD8+TIM3+CD101-T细胞向CCT细胞的分化轨迹 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 研究多形性胶质母细胞瘤中CCT细胞的分子特征及其在肿瘤进展和免疫逃逸中的作用 | 多形性胶质母细胞瘤患者样本和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 多形性胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,全基因组表达谱分析,功能富集分析 | LASSO回归模型 | 基因表达数据,临床数据,单核苷酸突变数据 | 来自TCGA、CGGA和GEO数据库的GBM样本 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组测序 | NA | NA |
| 545 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing of bone marrow reveals the immune response mechanisms of lymphocytes under avian leukosis virus subgroup J infection
2025-May, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.104995
PMID:40121758
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析禽白血病病毒J亚型感染下鸡骨髓淋巴细胞的免疫应答机制 | 首次在单细胞水平揭示ALV-J感染下骨髓淋巴细胞各亚群的免疫应答特征,发现Rho家族GTP酶信号通路在病毒感染细胞中的激活 | 仅分析了骨髓淋巴细胞,未涉及其他免疫器官;样本量有限 | 探究ALV-J感染下骨髓淋巴细胞的免疫应答机制 | 鸡骨髓淋巴细胞 | 单细胞测序 | 禽白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 546 | 2025-10-06 |
Neural ensembles that encode nocifensive mechanical and heat pain in mouse spinal cord
2025-May, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-01921-6
PMID:40128392
|
研究论文 | 本研究通过遗传捕获、活性操纵和单细胞RNA测序技术,识别了小鼠脊髓中编码机械性和热痛的不同神经集群 | 首次在成年小鼠脊髓中识别出分别编码机械性和热痛的特异性神经集群,并发现多模态Gal抑制神经元在疼痛传导中的门控作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证 | 探索脊髓神经回路如何区分不同性质的有害信息 | 成年小鼠脊髓神经回路 | 神经科学 | 疼痛相关疾病 | 遗传捕获、活性操纵、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、行为数据 | 成年小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 547 | 2025-10-06 |
Single-cell multi-omics profiling uncovers the immune heterogeneity in HIV-infected immunological non-responders
2025-May, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105667
PMID:40184908
|
研究论文 | 通过单细胞多组学分析揭示HIV感染免疫无应答者的免疫异质性 | 开发了scGeneANOVA差异基因分析工具和VILDA病毒转录本检测工具,首次在单细胞水平系统揭示INRs的干扰素信号通路失调机制 | 样本量相对有限,研究仅基于外周血单个核细胞,未涉及组织驻留免疫细胞 | 探究HIV感染免疫无应答者免疫重建失败的机制 | HIV感染免疫无应答者(INRs)、免疫应答者(IRs)和健康对照(HCs)的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | HIV/AIDS | 单细胞RNA测序, 单细胞VDJ测序 | 混合模型差异基因分析工具(scGeneANOVA) | 单细胞转录组数据, T细胞受体序列数据 | INRs、IRs和HCs的外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞VDJ测序 | NA | NA |
| 548 | 2025-10-06 |
Bifunctional chemokine-nanobody fusion protein enhances neutrophil recruitment to impede Acanthamoeba immune evasion
2025-May, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105685
PMID:40222104
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示棘阿米巴角膜炎的免疫逃避机制,并开发了双功能纳米抗体-趋化因子融合蛋白增强中性粒细胞招募 | 首次发现棘阿米巴通过抑制CXCL通路减少中性粒细胞招募的免疫逃避机制,并创新性地开发了具有双重功能的抗体-趋化因子融合蛋白 | 样本量较小(仅9例患者),需要更大规模研究验证 | 研究棘阿米巴角膜炎的免疫景观,开发免疫治疗新方法 | 角膜炎患者角膜组织(棘阿米巴、真菌和细菌性角膜炎各3例) | 数字病理学 | 角膜炎 | 单细胞转录组测序,生物信息学分析,CellChat分析,纳米抗体筛选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 9例患者角膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 549 | 2025-10-06 |
CKAP5 deficiency induces premature ovarian insufficiency
2025-May, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105718
PMID:40252251
|
研究论文 | 本研究揭示了CKAP5基因缺陷通过影响自噬和DNA损伤修复导致早发性卵巢功能不全的机制 | 首次发现CKAP5是卵巢衰老的关键枢纽基因,并阐明其通过ATG7促进自噬和通过ATM支持DNA损伤修复的双重调控机制 | 样本量相对有限,需要更大规模的人群验证CKAP5变异与POI的关联 | 阐明CKAP5在卵巢功能和生育能力调控中的作用 | 人类颗粒细胞、POI患者、Ckap5杂合敲除小鼠 | 生殖医学 | 早发性卵巢功能不全 | bulk RNA测序, 单细胞转录组分析, 下一代测序, 基因负荷分析 | 基因敲除小鼠模型 | RNA测序数据, 转录组数据 | POI患者和对照个体的下一代测序队列,杂合Ckap5敲除小鼠 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞转录组分析 | NA | NA |
| 550 | 2025-10-06 |
Single-cell spatial transcriptomics of tertiary lymphoid organ-like structures in human atherosclerotic plaques
2025-May, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00639-9
PMID:40295810
|
研究论文 | 本研究通过单细胞空间转录组技术揭示了人类动脉粥样硬化斑块中三级淋巴样器官样结构的存在特征及其临床意义 | 首次构建人类动脉粥样硬化斑块的空间分辨单细胞转录组图谱,发现斑块三级淋巴器官并揭示其与脑血管事件的关联机制 | 研究样本量有限,斑块三级淋巴器官在疾病中的具体作用机制仍需进一步验证 | 探索人类动脉粥样硬化斑块中三级淋巴样器官的结构特征和免疫功能 | 人类动脉粥样硬化斑块组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 551 | 2025-10-06 |
Intratumoral Fusobacterium nucleatum Recruits Tumor-Associated Neutrophils to Promote Gastric Cancer Progression and Immune Evasion
2025-May-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2580
PMID:39992708
|
研究论文 | 本研究揭示了肿瘤内具核梭杆菌通过招募肿瘤相关中性粒细胞促进胃癌进展和免疫逃逸的机制 | 首次发现具核梭杆菌通过激活IL17/NF-κB/RelB信号通路招募肿瘤相关中性粒细胞,并促进其分化为促肿瘤亚型 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需进一步扩大 | 探究肿瘤内微生物群在胃癌恶性进展中对肿瘤免疫微环境的影响 | 胃癌组织和具核梭杆菌感染的小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 16S rRNA扩增子测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因测序数据,组织样本 | 人类胃癌组织样本和小鼠模型 | NA | 16S rRNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 552 | 2025-10-06 |
IGFBP3 enhances adipose-derived stem cell function in soft tissue injury repair via ITGB1 and ERK pathway activation
2025-May-15, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-025-10024-8
PMID:40369223
|
研究论文 | 本研究揭示了IGFBP3通过增强ITGB1表达和激活ERK通路促进脂肪来源干细胞修复软组织损伤的分子机制 | 首次结合单细胞多组学技术和3D生物打印模型系统阐明IGFBP3在ADSCs修复软组织损伤中的功能机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探究IGFBP3蛋白在脂肪来源干细胞修复软组织损伤中的分子机制 | 脂肪来源干细胞(ADSCs)和软组织损伤模型 | 组织工程与再生医学 | 软组织损伤 | 单细胞RNA测序, 3D生物打印, 慢病毒转染, 傅里叶变换红外光谱, X射线衍射, SEM, TEM | 动物模型, 3D生物打印模型 | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 小鼠软组织损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序, 3D生物打印 | NA | NA |
| 553 | 2025-10-06 |
scRNA-seq and scATAC-seq reveal that Sertoli cell mediates spermatogenesis disorders through stage-specific communications in non-obstructive azoospermia
2025-May-15, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97958
PMID:40371706
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序揭示支持细胞在非梗阻性无精子症中介导精子发生障碍的阶段特异性通讯机制 | 识别了12种生殖细胞亚型和8种支持细胞亚型,发现三种新型支持细胞亚型表型,揭示了生殖细胞与支持细胞亚型间阶段特异性匹配的相互作用模式 | 样本量相对有限,研究主要聚焦于睾丸组织,未涉及其他生殖系统组织 | 探究非梗阻性无精子症中精子发生障碍的细胞类型特异性异常机制 | 梗阻性无精子症和非梗阻性无精子症患者的睾丸组织 | 单细胞组学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据, 组织图像数据 | 梗阻性无精子症和非梗阻性无精子症患者的睾丸组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 554 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals immunological link between house dust mite allergy and childhood asthma
2025-May-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-01538-6
PMID:40368964
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示儿童尘螨过敏与哮喘之间的免疫学联系 | 首次在单细胞分辨率下系统分析尘螨过敏哮喘儿童的免疫特征,识别出HLA-DR和HLA-DP作为主要标志性受体 | 样本量较小(仅8名儿童),缺乏外部验证队列 | 探索儿童尘螨过敏哮喘的免疫学特征并寻找诊断标志物 | 8名4-11岁医生确诊哮喘儿童的外周血单个核细胞 | 单细胞基因组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归,机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | 8名哮喘儿童 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 555 | 2025-10-06 |
The surface protein Gbp of Fusobacterium nucleatum inhibits osteogenic differentiation by inactivating the Wnt/β-catenin pathway via binding to Annexin A2
2025-May-14, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06569-1
PMID:40369630
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研究论文 | 本研究揭示了具核梭杆菌表面蛋白Gbp通过结合Annexin A2抑制Wnt/β-catenin通路从而阻碍成骨分化的分子机制 | 首次发现具核梭杆菌效应蛋白Gbp通过结合宿主蛋白ANXA2破坏ANXA2/GSK3β复合物进而抑制Wnt/β-catenin通路的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,临床转化价值需进一步验证 | 阐明牙周炎中成骨细胞功能障碍的细胞和分子机制 | 人牙龈组织、小鼠实验性牙周炎模型、原代成骨细胞 | 单细胞生物学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序,转录组分析,GSEA,PPI网络 | NA | 单细胞RNA测序数据,转录组数据 | 牙周炎患者和健康对照的人牙龈组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 556 | 2025-10-06 |
Disrupting lipid homeostasis with CAV2 in OSCC triggers apoptosis, lipolysis, and mitochondrial dysfunction by transcriptional repression of PPARγ
2025-May-14, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01399-6
PMID:40369665
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研究论文 | 本研究探讨CAV2通过转录抑制PPARγ破坏口腔鳞癌脂质稳态并诱导细胞凋亡、脂解和线粒体功能障碍的机制 | 首次揭示CAV2通过PPARγ/NCOR1轴调控口腔鳞癌脂质稳态的新机制,并发现PPARγ反向激动剂T0070907可增强CAV2敲低效应 | 研究主要基于细胞系和裸鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 阐明CAV2在口腔鳞癌脂质代谢异常和恶性进展中的作用机制 | 口腔鳞癌细胞系和裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞测序,RNA测序,脂质组学,分子对接,Seahorse能量代谢分析 | 基因敲低模型 | 转录组数据,脂质组数据,功能实验数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 557 | 2025-10-06 |
A Cold-Active Protease Tissue Dissociation Protocol for the Preservation of the Tendon Fibroblast Transcriptome
2025-May-05, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5293
PMID:40364987
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研究论文 | 开发了一种使用冷活性蛋白酶在4°C下解离组织的方案,以更好地保存肌腱成纤维细胞的转录组 | 首次证明冷活性蛋白酶解离能减少肌腱细胞转录应激并更好地保留细胞类型特异性基因表达 | 仅在小鼠肌腱和韧带组织中验证,未在其他组织类型中测试 | 开发能更好保存组织原生转录组的组织解离方法 | 斑马鱼肌腱和韧带组织中的肌腱成纤维细胞 | 单细胞测序 | NA | bulk RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | bulk RNA-seq | NA | NA |
| 558 | 2025-10-06 |
Targeting HPV for the prevention, diagnosis, and treatment of cervical cancer
2025-May-02, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjae046
PMID:39402008
|
综述 | 本综述聚焦人乳头瘤病毒在宫颈癌预防、诊断和治疗中的关键作用,特别关注筛查和疾病干预的最新进展 | 整合HPV检测与现有筛查方法提高灵敏度与特异性,探索HPV相关生物标志物用于个性化干预,开发预防性和治疗性HPV疫苗及三级预防策略 | 未提及具体研究方法的局限性,作为综述文章缺乏原始数据支持 | 探讨HPV在宫颈癌预防、诊断和治疗中的作用机制及临床应用 | 人乳头瘤病毒及其相关宫颈癌 | NA | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序分析,类器官模型开发 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 559 | 2025-10-06 |
High-Viability Circulating Tumor Cells Sorting From Whole Blood at Single Cell Level Using Laser-Induced Forward Transfer-Assisted Microfiltration
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202414195
PMID:39868845
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研究论文 | 开发了一种激光诱导正向转移辅助微过滤系统,用于从全血中高效分离和回收高活性循环肿瘤细胞 | 采用激光诱导正向转移技术结合双阶梯微过滤器,实现高捕获效率和单细胞高存活率回收 | NA | 开发高效分离循环肿瘤细胞的技术方法 | 循环肿瘤细胞 | 生物医学工程 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 560 | 2025-10-06 |
Dissecting the Spatial and Single-Cell Transcriptomic Architecture of Cancer Stem Cell Niche Driving Tumor Progression in Gastric Cancer
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413019
PMID:39950944
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研究论文 | 通过空间和单细胞转录组测序解析胃癌中癌症干细胞微环境的转录特征及其在肿瘤进展中的作用 | 首次结合空间转录组和单细胞RNA测序技术揭示胃癌干细胞微环境的细胞组成和信号通路,发现iCAFs来源的AREG通过SOX9和ERBB2轴促进肿瘤干性和耐药性 | 样本量相对有限(32例),缺乏功能性验证实验 | 解析胃癌中癌症干细胞微环境的转录特征及其在肿瘤进展中的作用机制 | 人类胃黏膜组织(不同恶性阶段) | 数字病理学 | 胃癌 | 空间转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 32例人类胃黏膜组织 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |