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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2025-10-06 |
Elucidating the tumor microenvironment interactions in breast, cervical, and ovarian cancer through single-cell RNA sequencing
2025-May-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-03017-4
PMID:40404741
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析乳腺癌、宫颈癌和卵巢癌中肿瘤微环境的细胞互作机制 | 首次在妇科肿瘤中系统鉴定四种癌症相关成纤维细胞亚型并揭示其功能差异,发现TAMs通过VEGFA_VEGFR2信号通路促进血管生成 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证和临床样本验证 | 阐明妇科肿瘤微环境中关键细胞类型及其相互作用机制 | 乳腺癌、宫颈癌和卵巢癌肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌,宫颈癌,卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | SingleR, CellChat | 单细胞转录组数据 | 来自GEO数据库的妇科肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 502 | 2025-10-06 |
Single cell analysis of diverse immune cell in pneumococcal meningitis
2025-May-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-02258-7
PMID:40404806
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析肺炎链球菌脑膜炎患者的免疫细胞组成和功能变化 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘肺炎链球菌脑膜炎的免疫细胞转录组景观 | 样本量有限,仅分析外周血单个核细胞 | 解析肺炎链球菌脑膜炎中的免疫反应机制 | 肺炎链球菌脑膜炎患者和健康个体的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 脑膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | PM患者和健康个体(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 503 | 2025-10-06 |
Integrating Mendelian randomization and multi-transcriptomic analyses to unveil the genetic association risk of regulatory T cell-mediated free cholesterol and gastric cancer
2025-May-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02739-1
PMID:40405007
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研究论文 | 本研究整合孟德尔随机化和多转录组分析,揭示调节性T细胞介导的游离胆固醇与胃癌的遗传关联风险 | 首次结合孟德尔随机化和多组学方法系统分析游离胆固醇通过调节性T细胞影响胃癌的因果机制 | 依赖于公开数据库数据,需要进一步实验验证具体分子机制 | 探究游离胆固醇与胃癌的因果关系及调节性T细胞的中介作用 | 233种代谢物、731种免疫细胞与胃癌的关联 | 生物信息学 | 胃癌 | 孟德尔随机化, 转录组分析, 单细胞测序 | 两样本孟德尔随机化, 多变量孟德尔随机化 | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞测序数据 | GWAS数据库和TCGA数据库样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 全基因组关联分析 | NA | NA |
| 504 | 2025-10-06 |
Identification of shared mechanisms between Alzheimer's disease and atherosclerosis by integrated bioinformatics analysis
2025-May-22, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-02642-z
PMID:40405226
|
研究论文 | 通过整合生物信息学分析识别阿尔茨海默病与动脉粥样硬化的共同机制 | 首次通过多方法整合分析发现WIPF3基因在两种疾病中的核心作用,并揭示炎症在疾病共发生中的关键机制 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 探索阿尔茨海默病与动脉粥样硬化的共同发病机制 | AD脑组织和动脉粥样硬化斑块的测序数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病,动脉粥样硬化 | bulk sequencing, 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析, Lasso Cox回归, 随机森林 | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 505 | 2025-10-06 |
Identification of m5C RNA modification-related gene signature for predicting prognosis and immune microenvironment-related characteristics of heart failure
2025-May-22, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-025-00454-z
PMID:40405297
|
研究论文 | 本研究通过机器学习方法识别了m5C RNA修饰相关基因特征,用于预测心力衰竭预后和免疫微环境特征 | 首次系统研究m5C RNA修饰在心力衰竭中的作用及其与免疫微环境的关系,建立了基于4个m5C生物标志物的诊断模型 | 研究主要基于公共数据集,需要更多独立队列验证;动物实验样本量有限 | 探索m5C RNA修饰在心力衰竭中的作用机制及其临床意义 | 心力衰竭患者样本和心肌梗死后心力衰竭大鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, scRNA-seq, qRT-PCR, western blot | 随机森林, LASSO逻辑回归, SVM-RFE, 共识聚类 | 基因表达数据 | 训练集:200例HF患者和166例对照;验证集:GSE183852单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 506 | 2025-10-06 |
Unveiling the hidden dance: SPP1 + macrophages identified in ulcerative colitis reveal crosstalk with CHI3L1 + fibroblasts
2025-May-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06565-5
PMID:40399882
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别了溃疡性结肠炎中SPP1+巨噬细胞和CHI3L1+成纤维细胞的关键作用及其相互作用机制 | 首次发现SPP1+巨噬细胞与CHI3L1+成纤维细胞在溃疡性结肠炎炎症部位的富集现象及其在疾病进展中的关键通讯作用 | 样本来源有限,主要基于公共数据库验证,需要更大规模样本验证研究结果 | 探索巨噬细胞和成纤维细胞在溃疡性结肠炎发病机制中的具体作用及其相互作用 | 溃疡性结肠炎患者的外周血和结肠活检样本中的巨噬细胞和成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术, 多重免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 流式细胞数据, 免疫组化数据 | UC患者的外周血和结肠活检样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 507 | 2025-10-06 |
Long noncoding RNAs in familial hypercholesterolemia: biomarkers, therapeutics, and AI in precision medicine
2025-May-21, Lipids in health and disease
IF:3.9Q2
DOI:10.1186/s12944-025-02605-7
PMID:40399983
|
综述 | 探讨长链非编码RNA在家族性高胆固醇血症中的作用及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 整合AI驱动的lncRNA发现与单细胞转录组学技术,提出lncRNA作为新型生物标志物和治疗靶点的创新应用 | 生物标志物验证、RNA递送效率和监管审批等临床转化挑战尚未解决 | 研究lncRNA在家族性高胆固醇血症精准医疗中的应用前景 | 家族性高胆固醇血症患者及相关lncRNA(LeXis、CHROME、H19) | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学,AI驱动的lncRNA发现 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 508 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomics Uncovers Core Signature for Regulating Mitochondrial Homeostasis During Testicular Ageing
2025-May, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13797
PMID:39731228
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示果蝇睾丸衰老过程中线粒体稳态调控的核心特征 | 首次在果蝇睾丸衰老模型中系统揭示线粒体功能失调特征及关键调控基因 | 研究仅限于果蝇模型,未在哺乳动物中验证 | 探究睾丸衰老过程中线粒体稳态的调控机制 | 年轻和年老果蝇的睾丸组织 | 单细胞组学 | 生殖系统衰老 | 单细胞RNA测序 | 拟时序轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 年轻和年老果蝇睾丸样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 509 | 2025-05-11 |
Unraveling Tissue Complexity Through Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2025-May, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202500710
PMID:40342283
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 510 | 2025-10-06 |
Optineurin Cooperates With NRF2 to Regulate Tooth Root Morphogenesis by Controlling Mitochondrial Dynamics and Apoptosis
2025-May, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13799
PMID:39762159
|
研究论文 | 本研究揭示了Optineurin通过与NRF2协同调控线粒体动力学和细胞凋亡在牙齿根部形态发生中的关键作用 | 首次发现OPTN与NRF2协同调控线粒体分裂机制,通过DRP1磷酸化和BCL2转录影响牙根发育 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究OPTN在牙齿根部发育中的作用机制 | 小鼠牙齿(E16.5、P1、P7)及人类胚胎和成人牙齿样本,根尖乳头干细胞(SCAPs) | 发育生物学 | 牙齿发育异常 | 单细胞测序,RNA-seq分析,体外细胞培养,离体器官培养 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | 多个发育时间点的小鼠牙齿样本及人类牙齿样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 511 | 2025-05-25 |
Confronting the challenge of cell segmentation in spatial transcriptomics
2025-May-23, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02717-z
PMID:40410420
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 512 | 2025-10-06 |
Identification of cell specific biomarkers for intellectual disability via single cell RNA sequencing and transcriptomic bioinformatics approaches
2025-May-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85162-4
PMID:40399537
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和转录组生物信息学方法识别与智力障碍相关的T细胞特异性生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和转录组数据分析识别智力障碍中T细胞特异性生物标志物,发现6个核糖体蛋白作为枢纽基因 | 未提及样本量大小和研究人群特征,功能验证不足 | 寻找可用于智力障碍诊断和评估的T细胞相关生物标志物 | 智力障碍患者的T细胞(CD4和CD8) | 生物信息学 | 智力障碍 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 蛋白-蛋白相互作用网络分析 | 生物信息学分析流程 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 513 | 2025-10-06 |
Inflammatory metabolite 7α,25-OHC promotes TIMP1 expression in COVID-19 monocytes through synergy effect of SMARCC1/JUND/H3K27ac
2025-May-21, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05721-w
PMID:40399563
|
研究论文 | 本研究揭示炎症代谢物7α,25-OHC通过SMARCC1/JUND/H3K27ac协同作用促进COVID-19单核细胞中TIMP1表达的分子机制 | 首次发现7α,25-OHC通过增强SMARCC1-JUND相互作用调控TIMP1表达的新机制,并阐明其在COVID-19炎症反应中的关键作用 | 机制研究主要基于体外实验,需要更多体内实验验证 | 探究COVID-19患者单核细胞中染色质重塑因子调控炎症反应的分子机制 | COVID-19患者的单核细胞 | 表观遗传学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 共免疫沉淀, ChIP-qPCR | NA | 单细胞测序数据, 表观遗传数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 514 | 2025-10-06 |
Targeting CD74 in microglia to modulate experimental cerebral ischemia and reperfusion injury: insights from Single-Cell and bulk transcriptomics
2025-May-21, Molecular brain
IF:3.3Q2
DOI:10.1186/s13041-025-01197-8
PMID:40400029
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量转录组学分析,探索CD74在小胶质细胞中对脑缺血再灌注损伤的调控作用 | 首次发现CD74在小胶质细胞中的上调与神经炎症相关,并通过基因敲除实验证实其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于动物模型,尚未在人类临床中得到验证 | 探索CD74在脑缺血再灌注损伤中的作用机制及治疗潜力 | 小鼠小胶质细胞及脑缺血再灌注损伤模型 | 神经科学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 基因敲除 | CX3CR1Cre/ERT2转基因小鼠模型 | 基因表达数据, 行为学数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 515 | 2025-10-06 |
Spatially resolved mapping of cells associated with human complex traits
2025-May, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08757-x
PMID:40108460
|
研究论文 | 开发了一种整合空间转录组数据和全基因组关联研究的方法,用于在空间分辨率下绘制与人类复杂性状相关的细胞分布 | 提出了首个将空间转录组数据与GWAS汇总统计数据整合的方法,实现了复杂性状相关细胞的空间定位 | 方法验证主要基于胚胎期数据集,在成人组织中的应用需要进一步验证 | 开发空间解析的性状相关细胞定位方法,增进对疾病病理的理解 | 人类复杂性状相关细胞,特别是精神分裂症和抑郁症相关的谷氨酸能神经元 | 空间转录组学 | 精神分裂症, 抑郁症 | 空间转录组学, 全基因组关联研究 | gsMap | 空间转录组数据, GWAS汇总统计数据 | 覆盖25个器官的胚胎空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 516 | 2025-10-06 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveals a Stereoscopic Response of Rice Leaf Cells to Magnaporthe oryzae Infection
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202416846
PMID:40123572
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术揭示了水稻叶片细胞对稻瘟病菌感染的三维免疫响应机制 | 首次结合单细胞和空间转录组学技术构建水稻叶片细胞图谱,揭示了细胞特异性及多维度的免疫响应模式 | 研究主要聚焦转录组层面,对蛋白质水平和代谢物动态变化的验证仍需进一步研究 | 探究水稻叶片细胞对稻瘟病菌感染的免疫响应机制 | 水稻叶片细胞 | 植物生物学 | 植物真菌病害 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 236,708个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 517 | 2025-10-06 |
Halofuginone Disrupted Collagen Deposition via mTOR-eIF2α-ATF4 Axis to Enhance Chemosensitivity in Ovarian Cancer
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202416523
PMID:40126173
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现靶向胶原蛋白可重塑卵巢癌细胞外基质,并鉴定出卤夫酮通过mTOR-eIF2α-ATF4轴抑制COL1A1产生以增强化疗敏感性 | 首次建立22基因基质组特征预测卵巢癌化疗反应,发现卤夫酮通过调控mTOR-eIF2α-ATF4轴和巨噬细胞极化重塑肿瘤微环境 | NA | 探索靶向细胞外基质重塑增强卵巢癌化疗敏感性的策略 | 卵巢癌相关成纤维细胞、肿瘤相关巨噬细胞、CD8+ T细胞 | 肿瘤微环境研究 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 518 | 2025-10-06 |
PRMT1 Ablation in Endothelial Cells Causes Endothelial Dysfunction and Aggravates COPD Attributable to Dysregulated NF-κB Signaling
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411514
PMID:40135804
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研究论文 | 本研究探讨PRMT1在内皮细胞中的功能及其在慢性阻塞性肺病发病机制中的作用 | 首次揭示PRMT1通过调控NF-κB信号通路防止内皮功能障碍和衰老的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 阐明PRMT1在内皮细胞中的功能及其在COPD发病机制中的作用 | 内皮细胞、内皮特异性PRMT1敲除小鼠、COPD模型 | 分子生物学 | 慢性阻塞性肺病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 519 | 2025-10-06 |
Neuron-like macrophage differentiation via the APOE-TREM2 axis contributes to chronic pain in nasopharyngeal carcinoma
2025-May-20, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-025-10035-5
PMID:40392335
|
研究论文 | 本研究揭示了鼻咽癌中APOE-TREM2轴通过促进巨噬细胞向神经元样分化导致慢性疼痛的新机制 | 首次发现肿瘤相关巨噬细胞通过APOE-TREM2轴发生神经元样分化并参与鼻咽癌慢性疼痛的形成 | 动物模型与人类疾病存在差异,临床转化需要进一步验证 | 阐明APOE-TREM2轴在鼻咽癌慢性疼痛中的作用机制 | 鼻咽癌组织、巨噬细胞、小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,体外共培养,基因敲除 | 动物疾病模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | TCGA鼻咽癌数据集和单细胞测序样本 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
| 520 | 2025-10-06 |
ACSS2 mediates an epigenetic pathway to regulate β-cell adaptation during gestation in mice
2025-May-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58322-3
PMID:40393969
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了小鼠妊娠期β细胞适应的表观遗传调控机制 | 首次在单细胞水平发现ACSS2介导的乙酰-CoA生物合成和组蛋白乙酰化在β细胞妊娠适应中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 探索妊娠期胰腺β细胞适应性变化的分子机制 | 小鼠胰腺β细胞 | 单细胞生物学 | 妊娠期糖尿病 | 单细胞转录组测序,遗传分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |