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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2025-10-06 |
A novel NFKB1 agonist remodels tumor microenvironment and activates dendritic cells to promote anti-tumor immunity in colorectal cancer
2025-May-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06576-2
PMID:40394677
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研究论文 | 本研究鉴定了一种新型NFKB1激动剂F1929-1458,通过重塑肿瘤微环境和激活树突状细胞促进抗肿瘤免疫 | 首次发现NFKB1激动剂可通过诱导肿瘤细胞释放DAMPs激活树突状细胞的cGAS-STING和NLRP3炎症小体通路 | 研究主要基于小鼠结直肠癌模型,人体应用效果需进一步验证 | 开发能够同时靶向癌症干细胞和肿瘤微环境的治疗策略 | 结直肠癌肿瘤微环境、树突状细胞、T细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞测序、小分子pull-down质谱、细胞热位移分析、分子对接 | NA | 单细胞测序数据、质谱数据 | 果蝇干细胞肿瘤模型、小鼠结直肠癌移植瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 502 | 2025-10-06 |
Non-variable RNA deletion using the CRISPR-Cas9 technique demonstrated improved outcomes in human intestine single-cell RNA sequencing data, even at half sequencing depths
2025-May-20, Genomics & informatics
DOI:10.1186/s44342-025-00043-6
PMID:40394729
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研究论文 | 本研究开发了一种基于CRISPR-Cas9的方法,用于在单细胞RNA测序中特异性去除非可变RNA,从而改善数据质量并降低测序成本 | 首次将CRISPR-Cas9技术应用于单细胞RNA测序中非可变RNA的靶向删除,相比计算方法能更有效地减少非可变基因表达 | 研究仅针对人类肠道组织,未验证在其他组织类型中的适用性;样本量相对有限 | 开发一种物理方法改善单细胞RNA测序数据质量,减少非可变RNA的影响 | 人类肠道组织的单细胞RNA测序数据 | 单细胞测序 | NA | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 17名患者的肠道组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 503 | 2025-10-06 |
Neoadjuvant with low-dose radiotherapy, tislelizumab, albumin-bound paclitaxel, and cisplatin for resectable locally advanced head and neck squamous cell carcinoma: phase II single-arm trial
2025-May-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59865-1
PMID:40382318
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研究论文 | 本研究评估低剂量放疗联合替雷利珠单抗、白蛋白结合型紫杉醇和顺铂新辅助治疗可切除局部晚期头颈部鳞状细胞癌的疗效和安全性 | 首次将低剂量放疗与PD-1抑制剂替雷利珠单抗及化疗联合用于HNSCC新辅助治疗,并利用单细胞RNA测序分析肿瘤微环境重塑 | 单臂II期试验设计,样本量较小(28例患者),缺乏对照组比较 | 评估新辅助低剂量放疗联合免疫化疗方案在局部晚期头颈部鳞癌中的病理完全缓解率和安全性 | 未经治疗的III-IVB期头颈部鳞状细胞癌患者 | 临床肿瘤学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据,基因表达数据 | 28例患者(23例接受手术) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 504 | 2025-10-06 |
Integrating HiTOP and RDoC frameworks part II: shared and distinct biological mechanisms of externalizing and internalizing psychopathology
2025-May-09, Psychological medicine
IF:5.9Q1
DOI:10.1017/S0033291725000819
PMID:40340892
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法探索HiTOP框架中外化与内化精神病理学的共享和独特生物学机制 | 首次将HiTOP和RDoC框架整合,通过多组学方法系统分析外化与内化精神病理学的生物学机制 | 研究依赖于已有的全基因组关联研究数据,未进行新的实验验证 | 探索精神病理学的外化与内化维度在RDoC分析单元中的生物学基础 | 精神病理学的外化(EXT)、内化(INT)及其共享(EXT+INT)维度 | 精神疾病生物学机制研究 | 精神病理学 | 多组学分析、全基因组关联研究、单细胞RNA测序、磁共振成像 | 因果推断分析 | 基因组数据、基因表达数据、脑影像数据 | 基于同伴文章Part I的全基因组关联研究数据 | NA | 单细胞RNA测序、磁共振成像 | NA | NA |
| 505 | 2025-10-06 |
OLS4: a new Ontology Lookup Service for a growing interdisciplinary knowledge ecosystem
2025-May-06, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf279
PMID:40323307
|
研究论文 | 本文介绍了OLS4,一个用于生物信息学和化学领域本体搜索的新版本服务 | 实现完整的OWL2规范,支持多语言国际化,提供新的用户界面和外部数据库链接功能 | NA | 开发支持日益增长的本体生态系统的新一代本体查找服务 | 生物信息学和化学领域的本体和注释数据 | 生物信息学 | NA | 本体搜索技术 | NA | 本体数据 | NA | EMBL-EBI | 本体搜索服务 | OLS4 | 开源本体查找服务,支持OWL2规范和多语言界面 |
| 506 | 2025-10-06 |
Fate mapping in mouse demonstrates early secretory differentiation directly from Lgr5+ intestinal stem cells
2025-05-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.12.023
PMID:39793582
|
研究论文 | 本研究通过整合定量命运图谱、数学建模和单细胞RNA测序,揭示了小鼠肠道隐窝维持的细胞机制 | 首次证明分泌系分化直接从Lgr5+肠道干细胞发生,而非传统认为的经过TA细胞阶段 | 研究仅限于小鼠模型,人类肠道上皮可能存在差异 | 解析肠道上皮稳态维持的细胞水平调控机制 | 小鼠肠道上皮干细胞和祖细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 命运图谱, 数学建模 | NA | 基因表达数据, 细胞命运追踪数据 | 三种互补的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 507 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq identifies protracted mouse germline X chromosome reactivation dynamics directed by a PRC2-dependent mechanism
2025-05-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.12.028
PMID:39798575
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究小鼠雌性原始生殖细胞中X染色体再激活的动态过程及其调控机制 | 首次在单细胞水平精确描绘X染色体再激活的动力学过程,揭示PRC2依赖的表观遗传机制在调控该过程中的关键作用 | 研究仅针对小鼠模型,人类生殖细胞中X染色体再激活机制可能有所不同 | 阐明雌性原始生殖细胞中X染色体再激活的分子机制和动力学特征 | 小鼠胚胎生殖细胞(从迁移期原始生殖细胞到性腺生殖细胞) | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 染色质分析 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据 | 小鼠胚胎发育不同阶段(E9.5至E16.5)的雌性生殖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 508 | 2025-10-06 |
Stemness in flux: Dissecting intestinal crypt organization with multimodal approaches
2025-05-05, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.04.003
PMID:40328226
|
研究论文 | 通过整合谱系追踪、单细胞RNA测序和数学模型,揭示隐窝底部干细胞在分泌和吸收谱系分化决策中的核心作用 | 首次结合多模态方法系统解析肠道隐窝组织机制,阐明Lgr5细胞在维持肠道上皮稳态中的关键功能 | NA | 探究肠道隐窝组织中干细胞谱系分化的调控机制 | 肠道隐窝干细胞 | 发育生物学 | NA | 谱系追踪, 单细胞RNA测序, 数学建模 | 数学模型 | 基因表达数据, 谱系追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 509 | 2025-10-06 |
KLRG1 identifies regulatory T cells with mitochondrial alterations that accumulate with aging
2025-May, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-00855-9
PMID:40307497
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别了随衰老积累的KLRG1+调节性T细胞亚群,并揭示了其线粒体改变和功能特征 | 首次发现表达KLRG1的调节性T细胞亚群随衰老积累,并揭示其具有线粒体改变和促炎表型的功能特征 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 鉴定与衰老相关的T细胞亚群及其功能特征 | CD4 T细胞,特别是调节性T细胞 | 免疫学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 小鼠和人类样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 510 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA and Transcriptome Sequencing to Analyze the Role of Lactate Metabolism in Traumatic Brain Injury Astrocytes
2025-May, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.70428
PMID:40395067
|
研究论文 | 通过单细胞RNA和转录组测序分析乳酸代谢在创伤性脑损伤星形胶质细胞中的作用 | 首次在单细胞分辨率下揭示创伤性脑损伤后星形胶质细胞中乳酸代谢的关键作用,并鉴定出Ndufb9和Cox8a作为关键代谢基因 | 研究仅使用小鼠模型,样本量有限,且仅观察了急性和亚急性两个时间点 | 探索创伤性脑损伤后乳酸代谢在脑细胞中的作用机制 | 10周龄雄性C57BL/6J小鼠的额叶皮层组织 | 单细胞测序分析 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序,转录组测序,UMAP降维,差异表达基因分析,GO和KEGG富集分析 | 小鼠创伤性脑损伤模型 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确样本数量,使用小鼠额叶皮层组织在损伤后24小时和7天两个时间点 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 511 | 2025-10-06 |
Dual cytokine-engineered macrophages rejuvenate the tumor microenvironment and enhance anti-PD-1 therapy in renal cell carcinoma
2025-05-27, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114725
PMID:40294469
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研究论文 | 开发双细胞因子工程化巨噬细胞通过递送IL-12和CXCL-9重编程肿瘤微环境并增强肾细胞癌的抗PD-1治疗效果 | 首创双细胞因子工程化巨噬细胞平台,同时递送IL-12和CXCL-9协同重塑肿瘤免疫微环境 | NA | 克服肾细胞癌对PD-1阻断疗法的耐药性 | 肾细胞癌肿瘤微环境中的巨噬细胞和免疫细胞 | 免疫治疗 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 512 | 2025-10-06 |
Bisecting GlcNAc expression by bone marrow stromal cells modulates TGF-β1-driven macrophage polarization in myeloid leukemias
2025-May-22, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2024.287091
PMID:40400458
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研究论文 | 本研究探讨骨髓基质细胞中双分GlcNAc表达通过TGF-β1驱动髓系白血病中巨噬细胞极化的机制 | 首次揭示骨髓基质细胞特定糖基化修饰(双分GlcNAc水平降低)通过TGF-β1分泌促进M2型巨噬细胞极化的新机制 | 研究主要聚焦于MDS/AML模型,其他类型白血病的适用性需进一步验证 | 阐明骨髓微环境中糖基化修饰对巨噬细胞极化的调控机制 | 骨髓基质细胞、肿瘤相关巨噬细胞、CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 髓系白血病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组织化学 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 513 | 2025-10-06 |
Myeloid Cells in Abdominal Aortic Aneurysm
2025-May-22, Current atherosclerosis reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1007/s11883-025-01302-1
PMID:40402405
|
综述 | 本综述系统阐述了髓系细胞在腹主动脉瘤发病机制中的关键作用及其靶向治疗潜力 | 整合单细胞RNA测序揭示的髓系细胞多样性,提出克隆造血和训练免疫作为髓系细胞参与AAA的新机制,探讨纳米颗粒靶向治疗的创新策略 | 临床转化面临微环境串扰和潜在脱靶效应的挑战,需要更精确的靶向治疗策略 | 阐明髓系细胞在腹主动脉瘤发病机制中的作用并探索靶向治疗可能性 | 腹主动脉瘤中的各类髓系细胞(巨噬细胞、中性粒细胞、树突状细胞、嗜酸性粒细胞、髓源性抑制细胞) | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间多组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 514 | 2025-10-06 |
Mucinous breast cancer organoids: an in vitro research model
2025-May-19, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02586-0
PMID:40388071
|
研究论文 | 首次建立黏液性乳腺癌患者来源类器官模型并验证其生物学特性 | 首次报道黏液性乳腺癌类器官模型,填补了该亚型体外研究模型的空白 | 仅基于单例患者样本,样本量有限 | 建立可靠的黏液性乳腺癌体外研究模型 | 黏液性乳腺癌患者来源的类器官 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,组织化学染色,免疫组织化学,药物敏感性测试 | 患者来源类器官模型 | 单细胞RNA测序数据,组织图像数据 | 1例64岁中国女性黏液性乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 515 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-sequencing reveals early mitochondrial dysfunction unique to motor neurons shared across FUS- and TARDBP-ALS
2025-May-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59679-1
PMID:40389397
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示FUS和TARDBP基因突变导致的ALS中运动神经元特有的早期线粒体功能障碍 | 首次在单细胞水平证明FUS和TARDBP突变ALS共享运动神经元特异性线粒体功能障碍,且与蛋白质错误定位无关 | 研究基于诱导多能干细胞衍生的神经元模型,可能无法完全模拟体内复杂环境 | 探究FUS和TARDBP基因突变导致ALS的选择性运动神经元退化的共同机制 | 等基因诱导多能干细胞衍生的运动神经元和中间神经元 | 单细胞基因组学 | 肌萎缩侧索硬化症(ALS) | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 四种基因型(FUS P525L, FUS R495X, TARDBP M337V, FUS敲除)的神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 516 | 2025-10-06 |
A CRISPR/Cas9-based enhancement of high-throughput single-cell transcriptomics
2025-May-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59880-2
PMID:40389438
|
研究论文 | 开发了一种基于CRISPR/Cas9的单细胞转录组测序增强方法scCLEAN,通过重新分配测序reads提高低丰度转录本的检测能力 | 利用CRISPR/Cas9的可编程性靶向去除少量转录组,同时重新分配约一半的测序reads,将测序重点转向低丰度转录本 | 在某些生物环境中应用可能不适宜,具体适用场景需要进一步明确 | 解决单细胞RNA测序中高丰度转录本掩盖低丰度转录本检测的问题 | 异质性免疫细胞和同质性血管平滑肌细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序,CRISPR/Cas9,第三代测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多种人类组织和细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞MAS-Seq | NA | NA |
| 517 | 2025-10-06 |
Focusing on DC cells to optimize the prediction of prognosis and innovative treatment strategies for colon cancer
2025-May-19, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-01792-8
PMID:40389562
|
研究论文 | 本研究通过识别树突状细胞相关基因构建风险评分系统,用于预测结肠癌预后和免疫治疗反应 | 首次开发基于树突状细胞相关基因的预后指数(DCRI),并发现PPP2CB作为结肠癌保护性因子 | 研究基于回顾性数据,需要前瞻性临床试验验证 | 优化结肠癌预后预测和创新治疗策略 | 结肠腺癌(COAD)患者 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序, WGCNA, LASSO-Cox分析 | 风险评分模型 | 转录组数据, 临床数据 | TCGA和GEO数据库的结肠癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 518 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic landscape reveals complex cellular heterogeneity and dysregulated signaling pathways in nasopharyngeal carcinoma
2025-May-19, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02506-2
PMID:40389670
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学系统分析鼻咽癌肿瘤微环境中不同细胞类型的转录特征及其在肿瘤发展中的作用 | 首次在单细胞分辨率层面全面揭示鼻咽癌肿瘤微环境的细胞异质性和信号通路失调 | NA | 系统分析鼻咽癌不同细胞类型的转录特征及其在肿瘤发展中的作用 | 鼻咽癌组织和正常组织样本 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 519 | 2025-10-06 |
Novel marker genes and small molecule drugs for radiotherapy resistance in cervical cancer identified based on single-cell multi-omics analysis
2025-May-19, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02532-0
PMID:40389794
|
研究论文 | 通过单细胞多组学和机器学习方法识别宫颈癌放疗抵抗的分子标志物和潜在治疗药物 | 整合单细胞多组学数据构建稳健的预后模型,识别与放疗抵抗相关的关键细胞类型和分子标记 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要实验验证和前瞻性研究确认 | 探索宫颈癌放疗抵抗的分子机制并开发预后预测模型 | 宫颈癌患者 | 机器学习 | 宫颈癌 | 单细胞测序, 转录组测序, 甲基化测序 | Cox回归 | 基因表达数据, 甲基化数据, 单细胞数据 | 43,475个细胞 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 520 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell and bulk RNA profiles to uncover glutamine metabolism's role in prognosis and immune dynamics in multiple myeloma
2025-May-19, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14239-0
PMID:40389878
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,揭示了谷氨酰胺代谢相关基因在多发性骨髓瘤预后和免疫动态中的作用 | 首次系统性地整合单细胞和bulk RNA测序数据,识别谷氨酰胺代谢相关基因在多发性骨髓瘤中的预后价值和治疗意义 | 基于公共多组学队列数据,需要进一步实验验证 | 识别谷氨酰胺代谢相关基因驱动的肿瘤特征,并建立其作为预后生物标志物和治疗靶点的临床效用 | 多发性骨髓瘤患者样本 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞测序, bulk RNA测序, 转录组分析, shRNA敲低 | 加权共表达网络分析, Cox比例风险模型 | RNA测序数据 | 多个独立多发性骨髓瘤队列 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |