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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2025-10-06 |
BAX-mediated ammonia-driven cell death: a novel prognostic and therapeutic target in clear cell renal cell carcinoma
2025-May-17, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-025-00764-3
PMID:40382614
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研究论文 | 本研究构建了透明细胞肾细胞癌的氨相关特征模型,发现BAX介导的氨驱动细胞死亡通路可作为预后标志物和治疗靶点 | 首次在ccRCC中系统研究氨相关细胞死亡机制,鉴定BAX为关键基因并揭示其与免疫抑制细胞的相互作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,需要更多体内实验验证 | 探索氨相关细胞死亡在透明细胞肾细胞癌中的预后和治疗价值 | 透明细胞肾细胞癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序,细胞增殖实验,克隆形成实验,迁移和侵袭实验 | 预后模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 多个独立队列包括TCGA、PMID 35,440,542队列、E-MTAB-1980和GSE29609 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 502 | 2025-10-06 |
Navigating single-cell RNA-sequencing: protocols, tools, databases, and applications
2025-May-17, Genomics & informatics
DOI:10.1186/s44342-025-00044-5
PMID:40382658
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综述 | 本文全面探讨了单细胞RNA测序技术的协议、工具、数据库和应用领域 | 系统性地总结了单细胞RNA测序数据分析的挑战与优化方法,强调了增强单细胞水平分辨率和准确性的创新技术 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据和研究 | 探讨单细胞RNA测序技术的发展现状、挑战和应用前景 | 单细胞RNA测序技术及其在生物医学研究中的应用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 503 | 2025-10-06 |
A single-cell transcriptomic atlas of immune cells in Wilson disease identifies copper-specific immune regulation
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112450
PMID:40384935
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序构建威尔逊病免疫细胞图谱,揭示铜特异性免疫调控机制 | 首次在威尔逊病中建立单细胞水平的免疫细胞图谱,发现铜浓度异常对HLA分子表达和抗原处理通路的影响 | 样本量有限,主要关注外周血单个核细胞,未涉及其他组织类型 | 研究铜代谢异常对免疫调控和造血发育的影响机制 | 威尔逊病患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 威尔逊病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 威尔逊病患者和健康供者的PBMCs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 504 | 2025-10-06 |
Overcoming myeloid-driven resistance to CAR T therapy by targeting SPP1
2025-May-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.01.646202
PMID:40236117
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现SPP1+巨噬细胞在胶质瘤CAR T细胞治疗耐药性中的关键作用,并证实抗SPP1抗体可逆转免疫抑制微环境 | 首次通过单细胞RNA测序揭示SPP1+巨噬细胞在CAR T治疗耐药中的核心机制,并证明靶向SPP1可有效克服耐药性 | 研究主要聚焦胶质瘤模型,在其他实体瘤中的普适性需要进一步验证 | 探索实体瘤对CAR T细胞治疗产生耐药性的机制并开发克服策略 | 胶质瘤患者样本和干扰素信号缺陷的同源小鼠模型 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 41例胶质瘤患者样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 505 | 2025-10-06 |
Subcellular level spatial transcriptomics with PHOTON
2025-May-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59801-3
PMID:40368943
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PHOTON的高分辨率空间转录组学方法,能够在亚细胞水平分析RNA的空间分布 | 开发了结合高分辨率成像与高通量测序的PHOTON方法,首次实现亚细胞分辨率的空间转录组分析 | NA | 开发能够分析RNA亚细胞空间分布的新技术方法 | 卵巢颗粒细胞、核仁、线粒体、应激颗粒等亚细胞结构 | 空间转录组学 | NA | 高分辨率成像、高通量测序 | NA | 空间转录组数据、图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | PHOTON | 结合高分辨率成像与高通量测序的空间转录组平台,具有亚细胞分辨率 |
| 506 | 2025-10-06 |
Smooth muscle cells and fibroblasts in the ascending aorta exhibit minor differences between embryonic origins in angiotensin II-driven transcriptional alterations
2025-May-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-99862-4
PMID:40360730
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析血管紧张素II诱导下升主动脉中不同胚胎来源平滑肌细胞和成纤维细胞的转录组差异 | 首次在血管紧张素II诱导的主动脉病变前期,系统比较了第二心区和非第二心区来源细胞的转录组响应差异,并发现了一个新的成纤维细胞亚群 | 研究仅关注病变前期阶段,未涉及疾病进展后期;样本量相对有限;差异表现较为轻微 | 探究不同胚胎来源细胞在血管紧张素II诱导的胸主动脉病变中的特异性响应 | 小鼠升主动脉中的平滑肌细胞和成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | 胸主动脉病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Mef2c-Cre R26RmT/mG转基因小鼠,基线组和血管紧张素II输注3天组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 507 | 2025-10-06 |
Glial changes and gene expression in Alzheimer's disease from snRNA-Seq and spatial transcriptomics
2025-May, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.1177/13872877251330320
PMID:40267277
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研究论文 | 本研究整合单核RNA测序和空间转录组学数据,分析阿尔茨海默病中胶质细胞的变化和基因表达特征 | 首次将SEA-AD单核测序数据与空间转录组学整合,系统量化AD易感脑区的细胞变化 | 研究样本来源有限,仅关注前额叶皮层和颞回区域 | 阐明阿尔茨海默病进展中细胞水平的变化机制 | 阿尔茨海默病患者前额叶皮层和颞回脑组织 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 508 | 2025-10-06 |
The cell-intrinsic circadian clock is dispensable for lateral posterior clock neuron regulation of Drosophila rest-activity rhythms
2025-May, Neurobiology of sleep and circadian rhythms
DOI:10.1016/j.nbscr.2025.100124
PMID:40386580
|
研究论文 | 本研究通过基因工具探究了果蝇侧后时钟神经元在调节休息-活动节律中的作用 | 发现侧后时钟神经元可作为驱动振荡器,在缺乏细胞内在分子时钟的情况下仍能传递昼夜节律信息 | 研究仅限于果蝇模型,未在其他生物体中验证 | 探究分子时钟功能和神经元活动在侧后时钟神经元调节休息-活动节律中的作用 | 果蝇侧后时钟神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞测序, CRISPR基因编辑, 基因沉默 | NA | 基因表达数据, 行为数据 | 约240个大脑时钟神经元分为约20个亚群 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 509 | 2025-05-20 |
Integration of Bulk RNA and Single-Cell Analyses Reveal Distinct Expression Patterns of Anoikis-Related Genes and the Immunosuppressive Role of NQO1+ Macrophages in Hepatocellular Carcinoma
2025-May-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501310R
PMID:40386974
|
研究论文 | 本研究通过整合批量RNA和单细胞RNA测序分析,探讨了anoikis相关基因(ARGs)在肝细胞癌(HCC)中的预后价值及其对免疫抑制微环境的影响 | 建立了一个包含11个ARGs的anoikis相关基因风险评分模型(ARGRS),并通过单细胞RNA测序评估了ARGs在HCC中的异质性,同时揭示了NQO1+巨噬细胞的免疫抑制作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内实验验证 | 探讨ARGs在HCC中的预后价值及其对免疫抑制微环境的影响 | 肝细胞癌(HCC)患者和NQO1+巨噬细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 批量RNA测序和单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 机器学习模型 | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 510 | 2025-10-06 |
Cutaneous granulomas: mechanisms, cellular interactions and therapeutic insights
2025-May-19, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf096
PMID:40080709
|
综述 | 本文系统综述皮肤肉芽肿的形成机制、细胞相互作用及治疗前景 | 重点关注TREM2+巨噬细胞在肉芽肿形成中的作用及单细胞RNA测序技术揭示的细胞异质性 | 肉芽肿形成的精确过程及其功能意义仍不明确 | 探讨肉芽肿的本质及其在皮肤疾病中的形成机制 | 皮肤肉芽肿及相关疾病(结节病、环状肉芽肿、结核、麻风等) | NA | 皮肤肉芽肿性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 511 | 2025-05-20 |
Scar-associated macrophages and biliary epithelial cells interaction exacerbates hepatic fibrosis in biliary atresia
2025-May-18, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-025-04100-2
PMID:40383871
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间定位数据,揭示了胆道闭锁(BA)肝脏中疤痕相关巨噬细胞(SAMs)和胆道上皮细胞(BECs)的相互作用如何加剧肝纤维化 | 首次发现SAMs通过调节BECs的上皮-间质转化(EMT)促进肝纤维化进展,并识别出BA诊断的生物标志物 | 样本量较小(仅8例组织样本),且缺乏长期随访数据验证治疗效果 | 探究BA肝脏微环境变化及其在肝纤维化中的作用机制 | 胆道闭锁患者的肝脏组织 | 单细胞转录组学 | 胆道闭锁 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 8例肝脏组织(2例正常组织,2例胆总管囊肿组织,4例BA组织) | NA | NA | NA | NA |
| 512 | 2025-10-06 |
New insights into tumor microenvironment and HPV integrations in cervical cancer pathogenesis revealed by single-cell transcriptome data
2025-May-17, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf027
PMID:40151001
|
研究论文 | 通过单细胞转录组数据分析宫颈癌肿瘤微环境和HPV整合事件 | 开发了从单细胞RNA测序数据识别HPV整合事件的方法,发现了新的HPV重复整合基因 | 样本量相对有限,仅分析了特定疾病阶段的患者 | 研究宫颈癌发病机制中细胞异质性与HPV整合的关联 | 正常患者和三个疾病阶段(HSIL、MIC、CSCC)的宫颈组织 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 正常患者和三个疾病阶段患者的宫颈组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 513 | 2025-10-06 |
Engineering sonogenetic EchoBack-CAR T cells
2025-May-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.02.035
PMID:40179881
|
研究论文 | 开发了可通过聚焦超声激活的声遗传学EchoBack-CAR T细胞,用于实体瘤治疗 | 通过筛选超敏感热休克启动子库并结合CAR信号正反馈回路,实现了聚焦超声刺激下的长效CAR表达 | NA | 开发更安全有效的CAR-T细胞疗法治疗实体瘤 | 胶质母细胞瘤和前列腺癌 | 细胞工程 | 胶质母细胞瘤,前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 514 | 2025-10-06 |
Rorγt-positive dendritic cells are required for the induction of peripheral regulatory T cells in response to oral antigens
2025-May-15, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.03.020
PMID:40185101
|
研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型揭示了Rorγt阳性树突状细胞在口服抗原诱导外周调节性T细胞形成中的关键作用 | 首次通过特异性删除Rorc基因的顺式调控元件构建了RORγt抗原呈递细胞减少的小鼠模型,并证实了RORγt树突状细胞(而非ILC3s)在外周Treg诱导中的特异性功能 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类系统中验证;对RORγt树突状细胞的具体作用机制仍需进一步探索 | 探究RORγt阳性抗原呈递细胞在肠道免疫耐受建立中的作用机制 | 基因工程小鼠模型、RORγt阳性树突状细胞、外周调节性T细胞 | 免疫学 | 食物过敏、炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、谱系追踪 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 515 | 2025-10-06 |
DNA hypermethylation of PLTP mediated by DNMT3B aggravates vascular dysfunction in diabetic retinopathy via the AKT/GSK3β signaling pathway
2025-May-17, Clinical epigenetics
IF:4.8Q1
DOI:10.1186/s13148-025-01874-4
PMID:40380281
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研究论文 | 本研究揭示DNMT3B介导的PLTP基因DNA高甲基化通过AKT/GSK3β信号通路加重糖尿病视网膜病变中的血管功能障碍 | 首次发现DNMT3B介导的PLTP启动子高甲基化在糖尿病视网膜病变血管功能障碍中的关键作用机制 | 研究主要基于细胞和小鼠模型,需要进一步临床验证 | 阐明PLTP在糖尿病视网膜病变血管功能障碍中的作用及DNA甲基化调控机制 | 人视网膜微血管内皮细胞和高糖处理的糖尿病小鼠模型 | 分子生物学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞测序,转录组测序,免疫共沉淀,荧光素酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据,甲基化数据,蛋白互作数据 | 细胞系和小鼠模型 | NA | 单细胞测序,转录组测序 | NA | NA |
| 516 | 2025-10-06 |
Anti-BCL2 therapy eliminates giant congenital melanocytic nevus by senolytic and immune induction
2025-May-16, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02247-2
PMID:40374605
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研究论文 | 本研究通过抗BCL2疗法成功消除巨大先天性黑色素细胞痣,揭示了衰老细胞清除和免疫诱导的双重作用机制 | 首次发现BCL2在GCMN的衰老细胞和增殖细胞中表达,并证明BCL2抑制剂通过衰老细胞清除和激活中性粒细胞免疫反应的双重机制治疗GCMN | 研究主要基于动物模型,需要进一步临床试验验证 | 开发治疗巨大先天性黑色素细胞痣的有效疗法 | 巨大先天性黑色素细胞痣患者样本、患者来源异种移植模型、转基因小鼠模型 | 疾病治疗研究 | 皮肤疾病 | 单细胞测序、免疫染色、体外细胞毒性实验 | 患者来源异种移植模型、转基因动物模型 | 基因表达数据、组织学图像、细胞功能数据 | 多种基因突变的GCMN患者样本及动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 517 | 2025-10-06 |
Integrating multi-omics data to identify the role of Aggrephagy-related genes in tumor microenvironment and key tumorigenesis factors of GB from the perspective of single-cell sequencing
2025-May-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02431-4
PMID:40377747
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研究论文 | 通过单细胞测序技术探索聚集性自噬相关基因在胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的作用及其与肿瘤发生的关系 | 首次从单细胞测序角度系统研究聚集性自噬相关基因在胶质母细胞瘤中的作用,发现TUBA1C和UBB作为潜在治疗靶点 | NA | 揭示聚集性自噬相关基因在胶质母细胞瘤肿瘤微环境和肿瘤发生中的关键作用 | 胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的细胞亚型 | 单细胞测序 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序,非负矩阵分解,分子对接分析 | 非负矩阵分解 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 518 | 2025-10-06 |
Deciphering the interaction between the expression of LRP2 served as a mitochondrial metabolism-related gene and prognosis in colon cancer integrating multi-omics analysis
2025-May-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02568-2
PMID:40377809
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨线粒体代谢相关基因LRP2在结肠癌中的表达及其预后价值 | 首次将LRP2鉴定为结肠癌中线粒体代谢相关关键基因,并系统验证其与预后、病理分期和药物敏感性的关联 | 研究样本量有限,机制研究深度不足,需要更多实验验证LRP2的具体作用机制 | 探索LRP2在结肠癌中的表达特征及其临床预后价值 | 结肠腺癌患者样本和结肠癌细胞系 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞测序,转录组学,免疫组化,细胞增殖检测 | Cox回归分析,共识聚类 | 基因表达数据,临床数据,细胞实验数据 | TCGA数据库结肠癌样本和GEO数据库验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 519 | 2025-10-06 |
Sialyltransferase gene signature as a predictor of prognosis and therapeutic response in kidney renal clear cell carcinoma
2025-May-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02566-4
PMID:40377806
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研究论文 | 本研究基于唾液酸转移酶相关基因构建了一个预测肾透明细胞癌预后和治疗反应的预后模型 | 首次基于唾液酸转移酶相关基因构建KIRC预后模型,并通过单细胞RNA测序分析揭示了唾液酸化在肿瘤微环境中的关键作用 | 研究主要依赖公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 开发基于唾液酸转移酶相关基因的预后模型,预测KIRC患者的预后和治疗反应 | 肾透明细胞癌患者 | 生物信息学 | 肾癌 | RNA-Seq, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | Cox回归风险模型 | 基因表达数据 | TCGA和ICGC数据库中的KIRC样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 520 | 2025-10-06 |
The critical role of BMP signaling in gastric epithelial cell differentiation revealed by organoids
2025-May-16, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00237-x
PMID:40377813
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研究论文 | 本研究通过胃类器官模型揭示了BMP信号在胃上皮细胞分化中的关键作用 | 发现BMP4信号刺激pit细胞和壁细胞分化,鉴定Zbtb7b为pit细胞分化的新调控因子,并揭示小鼠与人类在壁细胞和主细胞分化要求上的差异 | 研究主要基于体外类器官模型,需要进一步在体内验证 | 阐明胃上皮细胞分化的分子调控机制 | 小鼠和人类胃类器官 | 发育生物学 | 胃疾病 | 单细胞RNA测序,信号通路调控,类器官培养 | 类器官模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |