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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2025-05-28 |
Author Correction: Left atrial single-cell transcriptomics reveals amphiregulin as a surrogate marker for atrial fibrillation
2025-May-26, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08195-5
PMID:40419725
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 482 | 2025-10-06 |
An inducible mouse model of osteogenesis imperfecta type V reveals aberrant osteogenesis caused by Ifitm5 c.-14C>T mutation
2025-May-24, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/jbmr/zjaf022
PMID:39908237
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研究论文 | 本研究通过构建可诱导的Ifitm5 c.-14C>T突变小鼠模型,揭示了V型成骨不全症的致病机制 | 首次开发了可诱导的Ifitm5 c.-14C>T突变小鼠模型,克服了以往模型胚胎致死的问题,并整合单细胞转录组分析 | 研究主要聚焦于小鼠模型,人类临床转化的适用性仍需进一步验证 | 探究V型成骨不全症中MALEP-IFITM5蛋白的致病机制 | Ifitm5 c.-14C>T突变小鼠模型 | 遗传学 | 成骨不全症 | 单细胞RNA测序,Cre-loxP诱导系统 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据,组织学数据 | 多种Cre品系的Ifitm5突变小鼠(Prx1-Cre、Col1a1-Cre、Ocn-Cre) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 483 | 2025-10-06 |
Unraveling the significance of cuproptosis in hepatocellular carcinoma heterogeneity and tumor microenvironment through integrated single-cell sequencing and machine learning approaches
2025-May-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02696-9
PMID:40411678
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研究论文 | 通过整合单细胞测序和机器学习方法揭示铜死亡在肝细胞癌异质性和肿瘤微环境中的重要性 | 首次系统性地将铜死亡与HCC细胞亚群异质性联系起来,并构建了基于铜死亡相关基因的风险评分模型和预后列线图 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步实验验证 | 探索铜死亡在肝细胞癌异质性和肿瘤微环境中的作用机制 | 肝细胞癌患者单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据 | 生物信息学, 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习 | LASSO回归, Cox回归, WGCNA, 风险评分模型 | 基因表达数据, 临床数据 | 来自GEO、TCGA和ICGC数据库的多个队列样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 484 | 2025-10-06 |
Prognostic model identification of ribosome biogenesis-related genes in pancreatic cancer based on multiple machine learning analyses
2025-May-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02733-7
PMID:40411705
|
研究论文 | 本研究通过多机器学习分析识别胰腺癌中核糖体生物合成相关基因的预后模型 | 首次系统筛选胰腺癌中核糖体生物合成相关预后基因并构建九基因风险模型,结合单细胞RNA测序验证关键基因表达模式 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证机制 | 探索核糖体生物合成在胰腺癌中的分子机制并开发预后预测模型 | 胰腺癌患者基因表达数据 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,机器学习算法 | Cox回归,机器学习算法 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的胰腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | GSE155698数据集 |
| 485 | 2025-10-06 |
Compromised efferocytosis during aging is related to COVID-19 severity in mice
2025-May-24, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2025.05.008
PMID:40419113
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研究论文 | 本研究通过建立衰老小鼠COVID-19模型,揭示了衰老个体中胞葬作用受损与COVID-19严重程度的相关机制 | 首次在衰老小鼠模型中证明SARS-CoV-2感染导致胞葬作用受损,并阐明其与过度炎症反应的关联 | 研究基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究衰老个体中COVID-19病情加重的免疫机制 | 年轻和衰老小鼠的肺组织免疫细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻和衰老小鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 486 | 2025-10-06 |
AI-Driven Multiscale Study on the Mechanism of Polygonati Rhizoma in Regulating Immune Function in STAD
2025-May-20, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c00981
PMID:40415801
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研究论文 | 本研究通过AI驱动的多尺度分析方法揭示了黄精在胃腺癌中调节免疫功能的分子机制 | 首次结合AI驱动的网络药理学、生物信息学和单细胞RNA测序技术系统研究黄精在STAD中的多靶点免疫调节机制 | 研究主要基于计算预测和体外实验,需要进一步的体内实验和临床研究验证 | 探索黄精在胃腺癌中调节肿瘤免疫微环境的多靶点作用机制 | 黄精活性成分、胃腺癌细胞系HGC-27、消化系统肿瘤的单细胞数据 | 生物信息学 | 胃腺癌 | 单细胞RNA测序,网络药理学,分子对接,分子动力学模拟 | 机器学习算法 | 基因表达数据,单细胞数据 | 5589个免疫相关基因,18个重叠差异表达基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 487 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing in Incontinentia Pigmenti With Neonatal Encephalopathy Reveals Broad Immune Activation Moderated by Steroids
2025-May, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200358
PMID:40020213
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究色素失禁症伴新生儿脑病患者的免疫激活状态及类固醇治疗的影响 | 首次在单个色素失禁症新生儿患者中应用单细胞RNA测序技术,揭示类固醇治疗对免疫激活的调节作用 | 研究仅基于单个病例(n=1),样本量有限 | 探究色素失禁症伴新生儿脑病的细胞特异性基因表达及类固醇治疗机制 | 色素失禁症新生儿患者与健康对照幼儿 | 单细胞测序 | 色素失禁症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 1例IP患者(治疗前后) + 1例健康对照,共20,411个细胞 | HIVE | 单细胞RNA-seq | HIVE单细胞系统 | HIVEsingle-cell system |
| 488 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing and traditional RNA sequencing reveals the role of cancer-associated fibroblasts in head and neck squamous cell carcinomas cohort
2025-May-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02507-1
PMID:40407978
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和传统RNA测序分析,揭示了癌症相关成纤维细胞在头颈部鳞状细胞癌中的作用 | 构建了基于CAF相关基因的新型预后预测模型和列线图,首次系统评估CAF在HNSC中的预后价值 | 基于TCGA数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 研究癌症相关成纤维细胞在头颈部鳞状细胞癌中的作用及预后价值 | 头颈部鳞状细胞癌患者和癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序,ssGSEA,差异表达分析,Cox回归,LASSO回归,通路富集分析 | LASSO回归模型,多变量Cox回归模型,列线图 | 基因表达数据,临床数据 | TCGA HNSC队列 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 489 | 2025-10-06 |
Oligodendrocyte-astrocyte crosstalk in Parkinson's disease mediates neuronal ferroptosis via the FGF signaling pathway
2025-May-23, NPJ Parkinson's disease
DOI:10.1038/s41531-025-00995-0
PMID:40410211
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学揭示了帕金森病中少突胶质细胞与星形胶质细胞通过FGF信号通路介导神经元铁死亡的机制 | 首次发现少突胶质细胞-星形胶质细胞串扰在帕金森病神经元铁死亡中的关键作用,并阐明FGF信号通路在此过程中的具体机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证尚不充分;铁死亡的具体分子机制仍需进一步探索 | 探究帕金森病中少突胶质细胞与星形胶质细胞的相互作用及其在神经元铁死亡中的作用机制 | 帕金森病小鼠模型中的少突胶质细胞、星形胶质细胞和多巴胺神经元 | 神经科学 | 帕金森病 | 单核测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 帕金森病小鼠模型 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 490 | 2025-10-06 |
Metabolic modeling elucidates phenformin and atpenin A5 as broad-spectrum antiviral drugs against RNA viruses
2025-May-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08148-y
PMID:40410544
|
研究论文 | 本研究通过代谢建模发现苯乙双胍和atpenin A5可作为广谱抗RNA病毒药物 | 开发了利用单细胞RNA测序数据评估病毒感染期间细胞代谢的计算工作流程,首次将宿主代谢确立为广谱抗病毒策略的药物靶点 | 研究主要基于计算预测和体外验证,体内实验仅针对SARS-CoV-2在叙利亚仓鼠模型中进行了验证 | 开发广谱抗病毒疗法,评估细胞代谢在病毒感染中的作用 | SARS-CoV-2、甲型流感病毒、登革热病毒和呼吸道合胞病毒 | 计算生物学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序,代谢建模 | 计算工作流程 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 491 | 2025-10-06 |
Machine learning explores the prognostic and immuno-oncological impact of mitochondrial unfolded protein response in CESC
2025-May-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02723-9
PMID:40410615
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研究论文 | 本研究通过机器学习分析线粒体未折叠蛋白反应基因在宫颈鳞癌和腺癌中的预后价值及免疫肿瘤学影响 | 首次发现ATF5通过调控P-stalk核糖体功能连接免疫反应的新机制,揭示了UPRmt在塑造肿瘤免疫微环境中的新作用 | 研究基于TCGA数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证机制 | 探索线粒体未折叠蛋白反应在宫颈癌中的预后价值和免疫调节作用 | 宫颈鳞状细胞癌和宫颈腺癌患者 | 机器学习 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,多组学分析,基因集富集分析 | 机器学习 | 基因组数据,转录组数据,临床数据 | TCGA数据库中的CESC样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 492 | 2025-10-06 |
GPx3 marks adipocyte lineage commitment in bone marrow stromal cells
2025-May-23, Journal of orthopaedic surgery and research
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s13018-025-05908-8
PMID:40410842
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析发现GPx3在骨髓基质细胞向脂肪细胞谱系分化过程中的关键作用 | 首次揭示GPx3在骨髓脂肪组织形成中的特异性表达模式及其在脂肪生成中的调控功能 | 研究主要基于公共数据集再分析和体外实验,缺乏体内功能验证 | 探究骨髓脂肪组织形成的分子机制 | 骨髓基质细胞及其脂肪细胞分化过程 | 分子生物学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序, RNA干扰, 转录组分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 公共数据集和体外培养细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 493 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveal high T cell and monocyte status as predictive and prognostic markers in pancreatic cancer
2025-May-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06599-9
PMID:40410886
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术探索胰腺导管腺癌的预测和预后标志物 | 首次使用数字空间分析技术比较新辅助化疗前后胰腺癌的免疫微环境差异 | 样本量较小(48例),需要更大规模研究验证 | 发现胰腺导管腺癌的预测和预后因素 | 胰腺导管腺癌患者手术切除组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 数字空间分析,免疫组织化学分析 | NA | 空间转录组数据,免疫组织化学图像 | 48例胰腺导管腺癌手术病例 | NA | 空间转录组学 | NA | 数字空间分析技术 |
| 494 | 2025-10-06 |
Blocking the HIF-1α/glycolysis axis inhibits allergic airway inflammation by reducing ILC2 metabolism and function
2025-May, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16361
PMID:39462230
|
研究论文 | 本研究揭示了HIF-1α/糖酵解轴在调控ILC2细胞代谢和功能中的关键作用,及其在过敏性气道炎症中的潜在免疫治疗价值 | 首次系统阐明HIF-1α通过调控糖酵解通路影响ILC2细胞功能,并验证其在哮喘发病机制中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究HIF-1α/糖酵解轴在ILC2介导的过敏性气道炎症中的作用机制 | 小鼠和人类第2组先天淋巴样细胞(ILC2) | 免疫代谢 | 哮喘 | 单细胞测序、qPCR、转录组分析、代谢分析、染色质免疫沉淀 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、代谢数据、表观遗传数据 | 小鼠模型和人类哮喘患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 495 | 2025-10-06 |
NAE1 protein: a prognostic, immunomodulatory, and therapeutic biomarker associated with neddylation in hepatocellular carcinoma
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143539
PMID:40300298
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现NAE1蛋白可作为肝细胞癌的预后、免疫调节和治疗生物标志物 | 首次系统揭示NAE1在肝细胞癌中的预后价值、免疫调节功能及作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于生物信息学分析,需要更多实验验证 | 探索neddylation相关基因在肝细胞癌中的生物标志物潜力 | 肝细胞癌患者和细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 加权基因共表达网络分析,机器学习,单细胞RNA测序,分子对接 | Cox回归模型,机器学习模型 | 基因表达数据,临床数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 496 | 2025-10-06 |
[The effects of resveratrol on osteosarcoma cells: Regulation of the interaction between JAK2/STAT3 signaling pathway and tumor immune microenvironment]
2025-May, Xi bao yu fen zi mian yi xue za zhi = Chinese journal of cellular and molecular immunology
PMID:40415621
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研究论文 | 本研究探讨白藜芦醇通过调控JAK2/STAT3信号通路对骨肉瘤肿瘤免疫微环境的影响 | 首次在单细胞水平揭示白藜芦醇通过抑制JAK2/STAT3信号通路促进CD8 T细胞浸润的机制 | 仅使用小鼠移植瘤模型,缺乏临床样本验证 | 研究白藜芦醇对骨肉瘤肿瘤微环境的调控作用 | LM8骨肉瘤细胞和C57BL/6小鼠移植瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 骨肉瘤 | 单细胞测序, 免疫组织化学, Western blotting | 动物模型 | 单细胞测序数据, 蛋白质印迹数据, 组织切片图像 | C57BL/6小鼠移植瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 497 | 2025-10-06 |
PTMA controls cardiomyocyte proliferation and cardiac repair by enhancing STAT3 acetylation
2025-May-23, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt9446
PMID:40408476
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现PTMA通过增强STAT3乙酰化调控心肌细胞增殖和心脏修复 | 首次鉴定PTMA为驱动心肌细胞增殖的关键因子,并阐明其通过抑制MBD3/HDAC1 NuRD复合物增强STAT3乙酰化的新机制 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验,尚未在人体临床试验中验证 | 探索促进心肌细胞增殖和心脏再生的关键分子机制 | 小鼠、大鼠胚胎心肌细胞,新生小鼠心脏,人iPSC来源的心肌细胞 | 分子生物学 | 缺血性心肌损伤 | 单细胞RNA测序,AAV9基因过表达,条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据,细胞增殖数据 | 胚胎心脏单细胞RNA测序样本,原代小鼠和大鼠心肌细胞,人iPSC来源心肌细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 498 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing of baseline PBMCs predicts ICI efficacy and irAE severity in patients with NSCLC
2025-May-22, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011636
PMID:40404203
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研究论文 | 通过基线PBMC的单细胞RNA测序预测NSCLC患者ICI疗效和irAE严重程度 | 首次利用治疗前PBMC的单细胞RNA测序数据同时预测ICI疗效和irAE严重程度,发现PRF1和GZMB表达与良好预后和降低irAE严重程度均相关 | 样本量较小(33例患者),需要更大规模研究验证 | 开发预测非小细胞肺癌患者免疫检查点抑制剂疗效和免疫相关不良事件严重程度的生物标志物 | 非小细胞肺癌患者治疗前外周血单个核细胞 | 单细胞测序分析 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 细胞因子珠阵列 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 33例NSCLC患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 499 | 2025-10-06 |
Machine learning using scRNA-seq Combined with bulk-seq to identify lactylation-related hub genes in carotid arteriosclerosis
2025-May-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-00834-5
PMID:40404675
|
研究论文 | 本研究结合单细胞转录组和批量转录组数据,通过机器学习方法鉴定颈动脉粥样硬化中乳酸化相关枢纽基因 | 首次结合scRNA-seq和bulk-seq数据系统分析颈动脉粥样硬化中的乳酸化相关基因,并构建诊断模型 | NA | 研究颈动脉粥样硬化斑块形成的免疫景观,探索乳酸化相关基因的诊断生物标志物 | 颈动脉粥样硬化样本 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 机器学习算法 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 500 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing and transcriptomic data reveal that P65 activation significantly promotes microglia-mediated neuroinflammation after ischemic stroke
2025-May-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-00524-2
PMID:40404711
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了P65激活在缺血性中风后小胶质细胞介导的神经炎症中的关键作用 | 首次识别出Cx3cr1+和Cdk1+两种小胶质细胞亚型在脑缺血再灌注损伤后的动态变化,并证实P65是驱动炎症反应的关键转录因子 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系,需要进一步在人类样本中验证 | 探究脑缺血再灌注损伤中小胶质细胞介导的神经炎症机制 | 小鼠脑缺血再灌注模型和OGD/R处理的BV2小胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序, qPCR, Western blotting, 免疫荧光染色 | Seurat, Monocle2, CytoTRACE, Mfuzz | 单细胞转录组数据 | 5个数据集(GSE227651, GSE104036, GSE116878, GSE249957, GSE22255) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |