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当前共找到 799 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2025-10-06 |
RNAcare: integrating clinical data with transcriptomic evidence using rheumatoid arthritis as a case study
2025-May-21, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-025-02162-z
PMID:40399884
|
研究论文 | 开发了一个整合临床数据与转录组学证据的计算平台RNAcare，以类风湿关节炎为例进行验证 | 提供交互式、可重复的解决方案，能够直接整合基因表达数据与临床特征，支持患者特异性分析 | 作为概念验证仅以类风湿关节炎为例，平台在更广泛疾病中的应用仍需验证 | 开发一个便于临床医生使用的转录组数据分析工具，探索基因表达与临床结局的关系 | 类风湿关节炎患者样本及其临床数据 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 转录组分析，机器学习 | 机器学习 | 基因表达数据，临床数据 | NA | NA | RNA-seq | NA | NA |
| 442 | 2025-10-06 |
Targeting CD74 in microglia to modulate experimental cerebral ischemia and reperfusion injury: insights from Single-Cell and bulk transcriptomics
2025-May-21, Molecular brain
IF:3.3Q2
DOI:10.1186/s13041-025-01197-8
PMID:40400029
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量转录组学分析，探索CD74在小胶质细胞中对脑缺血再灌注损伤的调控作用 | 首次发现CD74在小胶质细胞中的上调与神经炎症相关，并通过基因敲除实验证实其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于动物模型，尚未在人类临床中得到验证 | 探索CD74在脑缺血再灌注损伤中的作用机制及治疗潜力 | 小鼠小胶质细胞及脑缺血再灌注损伤模型 | 神经科学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 基因敲除 | CX3CR1Cre/ERT2转基因小鼠模型 | 基因表达数据, 行为学数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 443 | 2025-10-06 |
Spatially resolved mapping of cells associated with human complex traits
2025-May, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08757-x
PMID:40108460
|
研究论文 | 开发了一种整合空间转录组数据和全基因组关联研究的方法，用于在空间分辨率下绘制与人类复杂性状相关的细胞分布 | 提出了首个将空间转录组数据与GWAS汇总统计数据整合的方法，实现了复杂性状相关细胞的空间定位 | 方法验证主要基于胚胎期数据集，在成人组织中的应用需要进一步验证 | 开发空间解析的性状相关细胞定位方法，增进对疾病病理的理解 | 人类复杂性状相关细胞，特别是精神分裂症和抑郁症相关的谷氨酸能神经元 | 空间转录组学 | 精神分裂症, 抑郁症 | 空间转录组学, 全基因组关联研究 | gsMap | 空间转录组数据, GWAS汇总统计数据 | 覆盖25个器官的胚胎空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 444 | 2025-10-06 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveals a Stereoscopic Response of Rice Leaf Cells to Magnaporthe oryzae Infection
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202416846
PMID:40123572
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术揭示了水稻叶片细胞对稻瘟病菌感染的三维免疫响应机制 | 首次结合单细胞和空间转录组学技术构建水稻叶片细胞图谱，揭示了细胞特异性及多维度的免疫响应模式 | 研究主要聚焦转录组层面，对蛋白质水平和代谢物动态变化的验证仍需进一步研究 | 探究水稻叶片细胞对稻瘟病菌感染的免疫响应机制 | 水稻叶片细胞 | 植物生物学 | 植物真菌病害 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 236,708个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 445 | 2025-10-06 |
Halofuginone Disrupted Collagen Deposition via mTOR-eIF2α-ATF4 Axis to Enhance Chemosensitivity in Ovarian Cancer
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202416523
PMID:40126173
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现靶向胶原蛋白可重塑卵巢癌细胞外基质，并鉴定出卤夫酮通过mTOR-eIF2α-ATF4轴抑制COL1A1产生以增强化疗敏感性 | 首次建立22基因基质组特征预测卵巢癌化疗反应，发现卤夫酮通过调控mTOR-eIF2α-ATF4轴和巨噬细胞极化重塑肿瘤微环境 | NA | 探索靶向细胞外基质重塑增强卵巢癌化疗敏感性的策略 | 卵巢癌相关成纤维细胞、肿瘤相关巨噬细胞、CD8+ T细胞 | 肿瘤微环境研究 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 446 | 2025-10-06 |
PRMT1 Ablation in Endothelial Cells Causes Endothelial Dysfunction and Aggravates COPD Attributable to Dysregulated NF-κB Signaling
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411514
PMID:40135804
|
研究论文 | 本研究探讨PRMT1在内皮细胞中的功能及其在慢性阻塞性肺病发病机制中的作用 | 首次揭示PRMT1通过调控NF-κB信号通路防止内皮功能障碍和衰老的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明PRMT1在内皮细胞中的功能及其在COPD发病机制中的作用 | 内皮细胞、内皮特异性PRMT1敲除小鼠、COPD模型 | 分子生物学 | 慢性阻塞性肺病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 447 | 2025-10-06 |
Neuron-like macrophage differentiation via the APOE-TREM2 axis contributes to chronic pain in nasopharyngeal carcinoma
2025-May-20, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-025-10035-5
PMID:40392335
|
研究论文 | 本研究揭示了鼻咽癌中APOE-TREM2轴通过促进巨噬细胞向神经元样分化导致慢性疼痛的新机制 | 首次发现肿瘤相关巨噬细胞通过APOE-TREM2轴发生神经元样分化并参与鼻咽癌慢性疼痛的形成 | 动物模型与人类疾病存在差异，临床转化需要进一步验证 | 阐明APOE-TREM2轴在鼻咽癌慢性疼痛中的作用机制 | 鼻咽癌组织、巨噬细胞、小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，体外共培养，基因敲除 | 动物疾病模型 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | TCGA鼻咽癌数据集和单细胞测序样本 | NA | 单细胞RNA测序，转录组测序 | NA | NA |
| 448 | 2025-10-06 |
ACSS2 mediates an epigenetic pathway to regulate β-cell adaptation during gestation in mice
2025-May-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58322-3
PMID:40393969
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了小鼠妊娠期β细胞适应的表观遗传调控机制 | 首次在单细胞水平发现ACSS2介导的乙酰-CoA生物合成和组蛋白乙酰化在β细胞妊娠适应中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探索妊娠期胰腺β细胞适应性变化的分子机制 | 小鼠胰腺β细胞 | 单细胞生物学 | 妊娠期糖尿病 | 单细胞转录组测序，遗传分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 449 | 2025-10-06 |
CellFM: a large-scale foundation model pre-trained on transcriptomics of 100 million human cells
2025-May-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59926-5
PMID:40393991
|
研究论文 | 本研究开发了一个基于1亿个人类细胞转录组数据预训练的大规模基础模型CellFM | 使用1亿个细胞的大规模数据集训练包含8亿参数的细胞基础模型，在模型规模和训练数据量上超越现有模型 | NA | 开发能够统一表示细胞状态的单细胞基础模型 | 人类单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | RetNet | 基因表达数据 | 1亿个人类细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 450 | 2025-10-06 |
TGF-β signaling redirects Sox11 gene regulatory activity to promote partial EMT and collective invasion of oncogenically transformed intestinal organoids
2025-May-20, Oncogenesis
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s41389-025-00560-7
PMID:40393982
|
研究论文 | 本研究利用结直肠癌驱动突变肠道类器官模型，揭示TGF-β信号通过重编程Sox11基因调控活性促进部分上皮间质转化和集体侵袭的机制 | 首次发现Sox11作为关键转录因子在TGF-β1诱导的部分上皮间质转化和集体侵袭中的必要性作用，并揭示其在正常肠道功能和肿瘤抑制中的双重功能 | Sox11对于TGF-β1诱导的表型是必要但不充分的，其具体作用机制仍需进一步研究 | 探究TGF-β1诱导的部分上皮间质转化和集体侵袭的调控机制 | 携带结直肠癌驱动突变的肠道类器官 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 功能丧失和过表达实验 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 肠道类器官模型和人类结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 451 | 2025-10-06 |
The unique hypertrophic and fibrotic features of neonatal right ventricle in response to pressure overload
2025-May-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-01427-y
PMID:40394014
|
研究论文 | 本研究建立了新生大鼠/小鼠右心室压力超负荷模型，揭示了新生儿右心室对压力超负荷反应的独特肥大和纤维化特征 | 首次建立了新生儿右心室压力超负荷模型，并通过单细胞RNA测序揭示了与成人不同的分子特征 | 研究仅针对新生儿期右心室反应，未涉及其他发育阶段或左心室变化 | 研究儿科心力衰竭的发病机制，特别是右心室压力超负荷引起的病理变化 | 新生大鼠和小鼠的右心室组织及心肌细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 组织染色 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 新生大鼠和小鼠右心室组织 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 452 | 2025-10-06 |
Sphingolipid metabolism-related genes as diagnostic markers in pneumonia-induced sepsis: the AUG model
2025-May-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-01150-8
PMID:40394027
|
研究论文 | 本研究识别了与鞘脂代谢相关的ACER3、UGCG和GBA基因作为肺炎诱导脓毒症的诊断标志物，并构建了AUG预测模型 | 首次发现鞘脂代谢相关基因ACER3、UGCG和GBA组成的AUG模型在肺炎诱导脓毒症中的诊断价值，并揭示了其通过免疫细胞死亡途径和MIF信号参与疾病进程的机制 | 样本量相对有限（临床队列仅62例），需要更大规模的多中心研究验证 | 识别肺炎诱导脓毒症的生物标志物和治疗靶点 | 肺炎诱导脓毒症患者、肺炎患者和健康对照者 | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序、单细胞转录组测序 | 基因特征模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 训练集GSE65682、验证集E-MTAB-1548和E-MTAB-5273、临床队列62例（20例PIS、31例肺炎、11例健康对照） | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 453 | 2025-10-06 |
Decoding the impact of MMP1+ malignant subsets on tumor-immune interactions: insights from single-cell and spatial transcriptomics
2025-May-20, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02503-y
PMID:40394037
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学解析MMP1+恶性细胞亚群对肿瘤-免疫相互作用的影响 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学揭示MMP1+恶性细胞通过CXCL16-CXCR6和ANXA1-FPR3信号轴调控肿瘤免疫微环境的机制 | 未明确说明研究涉及的具体肿瘤类型和样本数量 | 探究MMP1在肿瘤进展和免疫调节中的作用机制 | MMP1+恶性细胞及其与免疫细胞（巨噬细胞和CD8+ T细胞）的相互作用 | 单细胞组学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 454 | 2025-10-06 |
Multimodal spatial proteomic profiling in acute myeloid leukemia
2025-May-20, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00897-7
PMID:40394148
|
研究论文 | 本研究通过开发多模态空间蛋白质组学方法，揭示了急性髓系白血病骨髓微环境中的三级淋巴样结构及其临床意义 | 开发了基于组织微阵列的高通量空间免疫荧光和质谱流式成像技术，首次在骨髓中发现并验证了三级淋巴样结构的存在 | 骨髓脱钙和自发荧光可能对成像质量产生影响，方法在其他骨髓疾病中的适用性需要进一步验证 | 解析急性髓系白血病骨髓微环境中白血病细胞与免疫细胞的相互作用机制 | 急性髓系白血病患者的骨髓微环境 | 空间蛋白质组学 | 急性髓系白血病 | 空间免疫荧光成像, 质谱流式成像, 空间转录组学 | 无偏聚类分析, 空间K函数分析 | 蛋白质组数据, 转录组数据, 影像数据 | 480例患者转录组数据集 | NA | 空间蛋白质组学, 空间转录组学 | NA | 组织微阵列基础上的高通量空间成像平台 |
| 455 | 2025-10-06 |
HSD17B1-mediated trophoblast differentiation lowers estrogen levels in early-onset preeclampsia
2025-May-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-02490-1
PMID:40394177
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现HSD17B1是早发性子痫前期发病机制中的核心失调节点 | 首次揭示HSD17B1作为滋养细胞-内分泌串扰的主协调因子在EOPE发病机制中的关键作用 | 研究样本量有限，需要更大规模验证；机制研究主要基于体外细胞模型 | 探究早发性子痫前期伴胎儿生长受限的发病机制 | 胎盘滋养细胞亚型、临床胎盘样本、BeWo滋养细胞模型 | 单细胞测序分析 | 子痫前期 | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 蛋白质印迹, 基因敲低 | 多模态计算分析 | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | EOPE-FGR和正常妊娠的胎盘样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 456 | 2025-10-06 |
Pyroptosis drives tumor progression and immune evasion in Hepatocellular Carcinoma: a single-cell and spatial transcriptomic study
2025-May-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02421-6
PMID:40394449
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析揭示CHMP4B作为肝细胞癌中焦亡关键基因，促进肿瘤进展和免疫逃逸 | 首次在肝细胞癌中整合单细胞RNA测序和空间转录组数据，鉴定CHMP4B作为焦亡关键调控基因及其在肿瘤免疫微环境中的作用机制 | 样本量有限（10例HCC患者），需要更大数据集和多组学方法进一步验证 | 研究焦亡相关基因在肝细胞癌中的表达及其对预后和肿瘤微环境的影响 | 肝细胞癌患者组织样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | LASSO回归, 机器学习 | 基因表达数据 | 10例HCC患者单细胞数据，TCGA批量RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 457 | 2025-10-06 |
Scmaskgan: masked multi-scale CNN and attention-enhanced GAN for scRNA-seq dropout imputation
2025-May-20, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06138-9
PMID:40394489
|
研究论文 | 提出scMASKGAN方法，通过将矩阵填补转化为像素修复任务来解决scRNA-seq数据中的dropout事件 | 整合掩码机制、多尺度CNN、注意力机制和残差网络，结合细胞类型标签约束，将矩阵填补转化为像素修复任务 | NA | 改进单细胞RNA测序数据中dropout事件的填补效果 | 单细胞RNA测序数据和神经母细胞瘤样本 | 机器学习 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | CNN, GAN, 注意力机制, ResNet | 基因表达数据 | 10个神经母细胞瘤样本和7种不同数据类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 458 | 2025-10-06 |
A novel NFKB1 agonist remodels tumor microenvironment and activates dendritic cells to promote anti-tumor immunity in colorectal cancer
2025-May-20, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06576-2
PMID:40394677
|
研究论文 | 本研究鉴定了一种新型NFKB1激动剂F1929-1458，通过重塑肿瘤微环境和激活树突状细胞促进抗肿瘤免疫 | 首次发现NFKB1激动剂可通过诱导肿瘤细胞释放DAMPs激活树突状细胞的cGAS-STING和NLRP3炎症小体通路 | 研究主要基于小鼠结直肠癌模型，人体应用效果需进一步验证 | 开发能够同时靶向癌症干细胞和肿瘤微环境的治疗策略 | 结直肠癌肿瘤微环境、树突状细胞、T细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞测序、小分子pull-down质谱、细胞热位移分析、分子对接 | NA | 单细胞测序数据、质谱数据 | 果蝇干细胞肿瘤模型、小鼠结直肠癌移植瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 459 | 2025-10-06 |
Non-variable RNA deletion using the CRISPR-Cas9 technique demonstrated improved outcomes in human intestine single-cell RNA sequencing data, even at half sequencing depths
2025-May-20, Genomics & informatics
DOI:10.1186/s44342-025-00043-6
PMID:40394729
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研究论文 | 本研究开发了一种基于CRISPR-Cas9的方法，用于在单细胞RNA测序中特异性去除非可变RNA，从而改善数据质量并降低测序成本 | 首次将CRISPR-Cas9技术应用于单细胞RNA测序中非可变RNA的靶向删除，相比计算方法能更有效地减少非可变基因表达 | 研究仅针对人类肠道组织，未验证在其他组织类型中的适用性；样本量相对有限 | 开发一种物理方法改善单细胞RNA测序数据质量，减少非可变RNA的影响 | 人类肠道组织的单细胞RNA测序数据 | 单细胞测序 | NA | CRISPR-Cas9, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 17名患者的肠道组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 460 | 2025-10-06 |
Neoadjuvant with low-dose radiotherapy, tislelizumab, albumin-bound paclitaxel, and cisplatin for resectable locally advanced head and neck squamous cell carcinoma: phase II single-arm trial
2025-May-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59865-1
PMID:40382318
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研究论文 | 本研究评估低剂量放疗联合替雷利珠单抗、白蛋白结合型紫杉醇和顺铂新辅助治疗可切除局部晚期头颈部鳞状细胞癌的疗效和安全性 | 首次将低剂量放疗与PD-1抑制剂替雷利珠单抗及化疗联合用于HNSCC新辅助治疗，并利用单细胞RNA测序分析肿瘤微环境重塑 | 单臂II期试验设计，样本量较小（28例患者），缺乏对照组比较 | 评估新辅助低剂量放疗联合免疫化疗方案在局部晚期头颈部鳞癌中的病理完全缓解率和安全性 | 未经治疗的III-IVB期头颈部鳞状细胞癌患者 | 临床肿瘤学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据，基因表达数据 | 28例患者（23例接受手术） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |