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当前共找到 813 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2025-05-25 |
Confronting the challenge of cell segmentation in spatial transcriptomics
2025-May-23, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02717-z
PMID:40410420
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 442 | 2025-10-06 |
Combining spatial transcriptomics and ECM imaging in 3D for mapping cellular interactions in the tumor microenvironment
2025-May-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101261
PMID:40220761
|
研究论文 | 本研究通过整合3D空间转录组学和ECM成像技术，系统性地绘制了肺癌肿瘤微环境中细胞间相互作用图谱 | 首次将3D空间转录组学与细胞外基质成像技术相结合，突破了传统2D组织切片的限制，能够同时分析细胞-细胞相互作用和ECM重塑 | 仅基于一例临床肺癌样本的概念验证研究，样本量有限 | 系统量化肿瘤微环境中分子状态、细胞间相互作用和细胞外基质重塑 | 临床肺癌样本中的恶性细胞、非恶性细胞和细胞外基质 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学, ECM成像, 3D组织重建 | NA | 空间转录组数据, 图像数据 | 1例临床肺癌样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞空间转录组 | NA | NA |
| 443 | 2025-10-06 |
Scalable image-based visualization and alignment of spatial transcriptomics datasets
2025-May-21, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101264
PMID:40267922
|
研究论文 | 提出基于图像的可视化计算框架STIM，用于空间转录组数据集的展示与对齐 | 首次将ImgLib2和BigDataViewer图像数据框架应用于空间转录组数据分析，支持不规则测量间距和任意空间分辨率的数据处理 | NA | 开发可扩展的空间转录组数据可视化与对齐方法 | 小鼠脑组织连续切片和人类转移性淋巴结切片的空间转录组数据 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组技术 | NA | 空间转录组测序数据 | 13个小鼠脑组织连续切片和19个人类转移性淋巴结切片 | NA | 空间转录组 | NA | NA |
| 444 | 2025-10-06 |
Identification of cell specific biomarkers for intellectual disability via single cell RNA sequencing and transcriptomic bioinformatics approaches
2025-May-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85162-4
PMID:40399537
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和转录组生物信息学方法识别与智力障碍相关的T细胞特异性生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和转录组数据分析识别智力障碍中T细胞特异性生物标志物，发现6个核糖体蛋白作为枢纽基因 | 未提及样本量大小和研究人群特征，功能验证不足 | 寻找可用于智力障碍诊断和评估的T细胞相关生物标志物 | 智力障碍患者的T细胞（CD4和CD8） | 生物信息学 | 智力障碍 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 蛋白-蛋白相互作用网络分析 | 生物信息学分析流程 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 445 | 2025-10-06 |
Inflammatory metabolite 7α,25-OHC promotes TIMP1 expression in COVID-19 monocytes through synergy effect of SMARCC1/JUND/H3K27ac
2025-May-21, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05721-w
PMID:40399563
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研究论文 | 本研究揭示炎症代谢物7α,25-OHC通过SMARCC1/JUND/H3K27ac协同作用促进COVID-19单核细胞中TIMP1表达的分子机制 | 首次发现7α,25-OHC通过增强SMARCC1-JUND相互作用调控TIMP1表达的新机制，并阐明其在COVID-19炎症反应中的关键作用 | 机制研究主要基于体外实验，需要更多体内实验验证 | 探究COVID-19患者单核细胞中染色质重塑因子调控炎症反应的分子机制 | COVID-19患者的单核细胞 | 表观遗传学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 共免疫沉淀, ChIP-qPCR | NA | 单细胞测序数据, 表观遗传数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq | NA | NA |
| 446 | 2025-10-06 |
RNAcare: integrating clinical data with transcriptomic evidence using rheumatoid arthritis as a case study
2025-May-21, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-025-02162-z
PMID:40399884
|
研究论文 | 开发了一个整合临床数据与转录组学证据的计算平台RNAcare，以类风湿关节炎为例进行验证 | 提供交互式、可重复的解决方案，能够直接整合基因表达数据与临床特征，支持患者特异性分析 | 作为概念验证仅以类风湿关节炎为例，平台在更广泛疾病中的应用仍需验证 | 开发一个便于临床医生使用的转录组数据分析工具，探索基因表达与临床结局的关系 | 类风湿关节炎患者样本及其临床数据 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 转录组分析，机器学习 | 机器学习 | 基因表达数据，临床数据 | NA | NA | RNA-seq | NA | NA |
| 447 | 2025-10-06 |
Targeting CD74 in microglia to modulate experimental cerebral ischemia and reperfusion injury: insights from Single-Cell and bulk transcriptomics
2025-May-21, Molecular brain
IF:3.3Q2
DOI:10.1186/s13041-025-01197-8
PMID:40400029
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量转录组学分析，探索CD74在小胶质细胞中对脑缺血再灌注损伤的调控作用 | 首次发现CD74在小胶质细胞中的上调与神经炎症相关，并通过基因敲除实验证实其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于动物模型，尚未在人类临床中得到验证 | 探索CD74在脑缺血再灌注损伤中的作用机制及治疗潜力 | 小鼠小胶质细胞及脑缺血再灌注损伤模型 | 神经科学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 基因敲除 | CX3CR1Cre/ERT2转基因小鼠模型 | 基因表达数据, 行为学数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 448 | 2025-10-06 |
Spatially resolved mapping of cells associated with human complex traits
2025-May, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08757-x
PMID:40108460
|
研究论文 | 开发了一种整合空间转录组数据和全基因组关联研究的方法，用于在空间分辨率下绘制与人类复杂性状相关的细胞分布 | 提出了首个将空间转录组数据与GWAS汇总统计数据整合的方法，实现了复杂性状相关细胞的空间定位 | 方法验证主要基于胚胎期数据集，在成人组织中的应用需要进一步验证 | 开发空间解析的性状相关细胞定位方法，增进对疾病病理的理解 | 人类复杂性状相关细胞，特别是精神分裂症和抑郁症相关的谷氨酸能神经元 | 空间转录组学 | 精神分裂症, 抑郁症 | 空间转录组学, 全基因组关联研究 | gsMap | 空间转录组数据, GWAS汇总统计数据 | 覆盖25个器官的胚胎空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 449 | 2025-10-06 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics Reveals a Stereoscopic Response of Rice Leaf Cells to Magnaporthe oryzae Infection
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202416846
PMID:40123572
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术揭示了水稻叶片细胞对稻瘟病菌感染的三维免疫响应机制 | 首次结合单细胞和空间转录组学技术构建水稻叶片细胞图谱，揭示了细胞特异性及多维度的免疫响应模式 | 研究主要聚焦转录组层面，对蛋白质水平和代谢物动态变化的验证仍需进一步研究 | 探究水稻叶片细胞对稻瘟病菌感染的免疫响应机制 | 水稻叶片细胞 | 植物生物学 | 植物真菌病害 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 236,708个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 450 | 2025-10-06 |
Halofuginone Disrupted Collagen Deposition via mTOR-eIF2α-ATF4 Axis to Enhance Chemosensitivity in Ovarian Cancer
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202416523
PMID:40126173
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现靶向胶原蛋白可重塑卵巢癌细胞外基质，并鉴定出卤夫酮通过mTOR-eIF2α-ATF4轴抑制COL1A1产生以增强化疗敏感性 | 首次建立22基因基质组特征预测卵巢癌化疗反应，发现卤夫酮通过调控mTOR-eIF2α-ATF4轴和巨噬细胞极化重塑肿瘤微环境 | NA | 探索靶向细胞外基质重塑增强卵巢癌化疗敏感性的策略 | 卵巢癌相关成纤维细胞、肿瘤相关巨噬细胞、CD8+ T细胞 | 肿瘤微环境研究 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 451 | 2025-10-06 |
PRMT1 Ablation in Endothelial Cells Causes Endothelial Dysfunction and Aggravates COPD Attributable to Dysregulated NF-κB Signaling
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411514
PMID:40135804
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研究论文 | 本研究探讨PRMT1在内皮细胞中的功能及其在慢性阻塞性肺病发病机制中的作用 | 首次揭示PRMT1通过调控NF-κB信号通路防止内皮功能障碍和衰老的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明PRMT1在内皮细胞中的功能及其在COPD发病机制中的作用 | 内皮细胞、内皮特异性PRMT1敲除小鼠、COPD模型 | 分子生物学 | 慢性阻塞性肺病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 452 | 2025-10-06 |
High-Sensitivity PD-L1 Staining Using Clone 73-10 Antibody and Spatial Transcriptomics for Precise Expression Analysis in Non-Tumorous, Intraepithelial Neoplasia, and Squamous Cell Carcinoma of Head and Neck
2025-May-20, Head and neck pathology
DOI:10.1007/s12105-025-01798-8
PMID:40392349
|
研究论文 | 本研究使用高灵敏度克隆73-10抗体和空间转录组学技术评估头颈部鳞状细胞癌中PD-L1表达 | 首次结合高灵敏度克隆73-10抗体和空间转录组学技术系统分析头颈部鳞状细胞癌中PD-L1表达模式 | 样本量相对有限，空间转录组学分析仅包含6对样本 | 评估PD-L1在头颈部鳞状细胞癌中的表达模式，探索其与免疫治疗资格的相关性 | 头颈部鳞状细胞癌患者组织样本，包括癌组织、相邻鳞状上皮内瘤变和正常口腔黏膜 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 免疫组织化学染色，空间转录组学，通路分析 | NA | 组织切片图像，基因表达数据 | 94例头颈部鳞状细胞癌临床样本，包含配对的相邻鳞状上皮内瘤变和正常口腔黏膜样本，其中6对样本进行空间转录组学分析 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 453 | 2025-10-06 |
Neuron-like macrophage differentiation via the APOE-TREM2 axis contributes to chronic pain in nasopharyngeal carcinoma
2025-May-20, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-025-10035-5
PMID:40392335
|
研究论文 | 本研究揭示了鼻咽癌中APOE-TREM2轴通过促进巨噬细胞向神经元样分化导致慢性疼痛的新机制 | 首次发现肿瘤相关巨噬细胞通过APOE-TREM2轴发生神经元样分化并参与鼻咽癌慢性疼痛的形成 | 动物模型与人类疾病存在差异，临床转化需要进一步验证 | 阐明APOE-TREM2轴在鼻咽癌慢性疼痛中的作用机制 | 鼻咽癌组织、巨噬细胞、小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，体外共培养，基因敲除 | 动物疾病模型 | 基因表达数据，单细胞测序数据 | TCGA鼻咽癌数据集和单细胞测序样本 | NA | 单细胞RNA测序，转录组测序 | NA | NA |
| 454 | 2025-10-06 |
ACSS2 mediates an epigenetic pathway to regulate β-cell adaptation during gestation in mice
2025-May-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58322-3
PMID:40393969
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了小鼠妊娠期β细胞适应的表观遗传调控机制 | 首次在单细胞水平发现ACSS2介导的乙酰-CoA生物合成和组蛋白乙酰化在β细胞妊娠适应中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探索妊娠期胰腺β细胞适应性变化的分子机制 | 小鼠胰腺β细胞 | 单细胞生物学 | 妊娠期糖尿病 | 单细胞转录组测序，遗传分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 455 | 2025-10-06 |
CellFM: a large-scale foundation model pre-trained on transcriptomics of 100 million human cells
2025-May-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59926-5
PMID:40393991
|
研究论文 | 本研究开发了一个基于1亿个人类细胞转录组数据预训练的大规模基础模型CellFM | 使用1亿个细胞的大规模数据集训练包含8亿参数的细胞基础模型，在模型规模和训练数据量上超越现有模型 | NA | 开发能够统一表示细胞状态的单细胞基础模型 | 人类单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | RetNet | 基因表达数据 | 1亿个人类细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 456 | 2025-10-06 |
TGF-β signaling redirects Sox11 gene regulatory activity to promote partial EMT and collective invasion of oncogenically transformed intestinal organoids
2025-May-20, Oncogenesis
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s41389-025-00560-7
PMID:40393982
|
研究论文 | 本研究利用结直肠癌驱动突变肠道类器官模型，揭示TGF-β信号通过重编程Sox11基因调控活性促进部分上皮间质转化和集体侵袭的机制 | 首次发现Sox11作为关键转录因子在TGF-β1诱导的部分上皮间质转化和集体侵袭中的必要性作用，并揭示其在正常肠道功能和肿瘤抑制中的双重功能 | Sox11对于TGF-β1诱导的表型是必要但不充分的，其具体作用机制仍需进一步研究 | 探究TGF-β1诱导的部分上皮间质转化和集体侵袭的调控机制 | 携带结直肠癌驱动突变的肠道类器官 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 功能丧失和过表达实验 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 肠道类器官模型和人类结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 457 | 2025-10-06 |
The unique hypertrophic and fibrotic features of neonatal right ventricle in response to pressure overload
2025-May-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-01427-y
PMID:40394014
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研究论文 | 本研究建立了新生大鼠/小鼠右心室压力超负荷模型，揭示了新生儿右心室对压力超负荷反应的独特肥大和纤维化特征 | 首次建立了新生儿右心室压力超负荷模型，并通过单细胞RNA测序揭示了与成人不同的分子特征 | 研究仅针对新生儿期右心室反应，未涉及其他发育阶段或左心室变化 | 研究儿科心力衰竭的发病机制，特别是右心室压力超负荷引起的病理变化 | 新生大鼠和小鼠的右心室组织及心肌细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 组织染色 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 新生大鼠和小鼠右心室组织 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 458 | 2025-10-06 |
Sphingolipid metabolism-related genes as diagnostic markers in pneumonia-induced sepsis: the AUG model
2025-May-20, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-01150-8
PMID:40394027
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研究论文 | 本研究识别了与鞘脂代谢相关的ACER3、UGCG和GBA基因作为肺炎诱导脓毒症的诊断标志物，并构建了AUG预测模型 | 首次发现鞘脂代谢相关基因ACER3、UGCG和GBA组成的AUG模型在肺炎诱导脓毒症中的诊断价值，并揭示了其通过免疫细胞死亡途径和MIF信号参与疾病进程的机制 | 样本量相对有限（临床队列仅62例），需要更大规模的多中心研究验证 | 识别肺炎诱导脓毒症的生物标志物和治疗靶点 | 肺炎诱导脓毒症患者、肺炎患者和健康对照者 | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序、单细胞转录组测序 | 基因特征模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 训练集GSE65682、验证集E-MTAB-1548和E-MTAB-5273、临床队列62例（20例PIS、31例肺炎、11例健康对照） | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 459 | 2025-10-06 |
Decoding the impact of MMP1+ malignant subsets on tumor-immune interactions: insights from single-cell and spatial transcriptomics
2025-May-20, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02503-y
PMID:40394037
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学解析MMP1+恶性细胞亚群对肿瘤-免疫相互作用的影响 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学揭示MMP1+恶性细胞通过CXCL16-CXCR6和ANXA1-FPR3信号轴调控肿瘤免疫微环境的机制 | 未明确说明研究涉及的具体肿瘤类型和样本数量 | 探究MMP1在肿瘤进展和免疫调节中的作用机制 | MMP1+恶性细胞及其与免疫细胞（巨噬细胞和CD8+ T细胞）的相互作用 | 单细胞组学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 460 | 2025-10-06 |
Multimodal spatial proteomic profiling in acute myeloid leukemia
2025-May-20, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00897-7
PMID:40394148
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研究论文 | 本研究通过开发多模态空间蛋白质组学方法，揭示了急性髓系白血病骨髓微环境中的三级淋巴样结构及其临床意义 | 开发了基于组织微阵列的高通量空间免疫荧光和质谱流式成像技术，首次在骨髓中发现并验证了三级淋巴样结构的存在 | 骨髓脱钙和自发荧光可能对成像质量产生影响，方法在其他骨髓疾病中的适用性需要进一步验证 | 解析急性髓系白血病骨髓微环境中白血病细胞与免疫细胞的相互作用机制 | 急性髓系白血病患者的骨髓微环境 | 空间蛋白质组学 | 急性髓系白血病 | 空间免疫荧光成像, 质谱流式成像, 空间转录组学 | 无偏聚类分析, 空间K函数分析 | 蛋白质组数据, 转录组数据, 影像数据 | 480例患者转录组数据集 | NA | 空间蛋白质组学, 空间转录组学 | NA | 组织微阵列基础上的高通量空间成像平台 |