单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 813 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2025-10-06 |
A regulatory variant rs9379874 in T1D risk region 6p22.2 affects BTN3A1 expression regulating T cell function
2025-May, Acta diabetologica
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s00592-024-02389-9
PMID:39417845
|
研究论文 | 本研究通过功能基因组学方法鉴定了6p22.2区域中影响BTN3A1表达的功能性变异rs9379874及其在1型糖尿病发病机制中的作用 | 首次在6p22.2风险区域鉴定出功能性变异rs9379874，揭示其通过结合FOXA1调控BTN3A1表达影响T细胞功能的机制 | rs4320356变异与胰岛功能或自身免疫无显著关联，研究未完全阐明所有临床特征的遗传基础 | 揭示6p22.2风险区域与1型糖尿病亚群及相关临床特征的关联，鉴定该区域的致病变异和靶基因 | 2608例1型糖尿病患者和4814例健康对照，来自中国东部、中部和南部地区 | 功能基因组学 | 1型糖尿病 | GWAS, 生物信息学分析, 双荧光素酶报告基因检测, eQTL分析, 单细胞RNA测序分析 | NA | 基因分型数据, 表达数据, 表观遗传数据 | 7422个样本（2608例患者+4814例对照） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 402 | 2025-05-28 |
Author Correction: Left atrial single-cell transcriptomics reveals amphiregulin as a surrogate marker for atrial fibrillation
2025-May-26, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08195-5
PMID:40419725
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 403 | 2025-10-06 |
An inducible mouse model of osteogenesis imperfecta type V reveals aberrant osteogenesis caused by Ifitm5 c.-14C>T mutation
2025-May-24, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/jbmr/zjaf022
PMID:39908237
|
研究论文 | 本研究通过构建可诱导的Ifitm5 c.-14C>T突变小鼠模型，揭示了V型成骨不全症的致病机制 | 首次开发了可诱导的Ifitm5 c.-14C>T突变小鼠模型，克服了以往模型胚胎致死的问题，并整合单细胞转录组分析 | 研究主要聚焦于小鼠模型，人类临床转化的适用性仍需进一步验证 | 探究V型成骨不全症中MALEP-IFITM5蛋白的致病机制 | Ifitm5 c.-14C>T突变小鼠模型 | 遗传学 | 成骨不全症 | 单细胞RNA测序，Cre-loxP诱导系统 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据，组织学数据 | 多种Cre品系的Ifitm5突变小鼠（Prx1-Cre、Col1a1-Cre、Ocn-Cre） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 404 | 2025-10-06 |
Unraveling the significance of cuproptosis in hepatocellular carcinoma heterogeneity and tumor microenvironment through integrated single-cell sequencing and machine learning approaches
2025-May-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02696-9
PMID:40411678
|
研究论文 | 通过整合单细胞测序和机器学习方法揭示铜死亡在肝细胞癌异质性和肿瘤微环境中的重要性 | 首次系统性地将铜死亡与HCC细胞亚群异质性联系起来，并构建了基于铜死亡相关基因的风险评分模型和预后列线图 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，需要进一步实验验证 | 探索铜死亡在肝细胞癌异质性和肿瘤微环境中的作用机制 | 肝细胞癌患者单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据 | 生物信息学, 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习 | LASSO回归, Cox回归, WGCNA, 风险评分模型 | 基因表达数据, 临床数据 | 来自GEO、TCGA和ICGC数据库的多个队列样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 405 | 2025-10-06 |
Prognostic model identification of ribosome biogenesis-related genes in pancreatic cancer based on multiple machine learning analyses
2025-May-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02733-7
PMID:40411705
|
研究论文 | 本研究通过多机器学习分析识别胰腺癌中核糖体生物合成相关基因的预后模型 | 首次系统筛选胰腺癌中核糖体生物合成相关预后基因并构建九基因风险模型，结合单细胞RNA测序验证关键基因表达模式 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证机制 | 探索核糖体生物合成在胰腺癌中的分子机制并开发预后预测模型 | 胰腺癌患者基因表达数据 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，机器学习算法 | Cox回归，机器学习算法 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的胰腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | GSE155698数据集 |
| 406 | 2025-10-06 |
Compromised efferocytosis during aging is related to COVID-19 severity in mice
2025-May-24, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2025.05.008
PMID:40419113
|
研究论文 | 本研究通过建立衰老小鼠COVID-19模型，揭示了衰老个体中胞葬作用受损与COVID-19严重程度的相关机制 | 首次在衰老小鼠模型中证明SARS-CoV-2感染导致胞葬作用受损，并阐明其与过度炎症反应的关联 | 研究基于小鼠模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究衰老个体中COVID-19病情加重的免疫机制 | 年轻和衰老小鼠的肺组织免疫细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻和衰老小鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 407 | 2025-10-06 |
Controlling Human Stem Cell-Derived Islet Composition Using Magnetic Sorting
2025-May-21, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.29030
PMID:40400171
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过磁激活细胞分选技术富集干细胞衍生胰岛中功能性β细胞的方法 | 首次使用CD49a标记通过磁分选技术控制干细胞衍生胰岛的细胞组成，显著提高了β细胞比例和功能 | 研究主要关注CD49a标记的富集效果，对其他细胞类型的影响和长期安全性需要进一步验证 | 改善干细胞衍生胰岛的细胞组成和功能，提高其治疗1型糖尿病的疗效 | 人类多能干细胞衍生的胰岛细胞 | 细胞生物学 | 1型糖尿病 | 磁激活细胞分选，单细胞RNA测序，免疫染色 | NA | 基因表达数据，蛋白质表达数据 | 人类多能干细胞衍生的胰岛细胞，移植到糖尿病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 408 | 2025-10-06 |
AI-Driven Multiscale Study on the Mechanism of Polygonati Rhizoma in Regulating Immune Function in STAD
2025-May-20, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c00981
PMID:40415801
|
研究论文 | 本研究通过AI驱动的多尺度分析方法揭示了黄精在胃腺癌中调节免疫功能的分子机制 | 首次结合AI驱动的网络药理学、生物信息学和单细胞RNA测序技术系统研究黄精在STAD中的多靶点免疫调节机制 | 研究主要基于计算预测和体外实验，需要进一步的体内实验和临床研究验证 | 探索黄精在胃腺癌中调节肿瘤免疫微环境的多靶点作用机制 | 黄精活性成分、胃腺癌细胞系HGC-27、消化系统肿瘤的单细胞数据 | 生物信息学 | 胃腺癌 | 单细胞RNA测序,网络药理学,分子对接,分子动力学模拟 | 机器学习算法 | 基因表达数据,单细胞数据 | 5589个免疫相关基因,18个重叠差异表达基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 409 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing in Incontinentia Pigmenti With Neonatal Encephalopathy Reveals Broad Immune Activation Moderated by Steroids
2025-May, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200358
PMID:40020213
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究色素失禁症伴新生儿脑病患者的免疫激活状态及类固醇治疗的影响 | 首次在单个色素失禁症新生儿患者中应用单细胞RNA测序技术，揭示类固醇治疗对免疫激活的调节作用 | 研究仅基于单个病例(n=1)，样本量有限 | 探究色素失禁症伴新生儿脑病的细胞特异性基因表达及类固醇治疗机制 | 色素失禁症新生儿患者与健康对照幼儿 | 单细胞测序 | 色素失禁症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 1例IP患者(治疗前后) + 1例健康对照，共20,411个细胞 | HIVE | 单细胞RNA-seq | HIVE单细胞系统 | HIVEsingle-cell system |
| 410 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal transcriptome atlas of developing mouse lung
2025-May-30, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2025.03.012
PMID:40118721
|
研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据，构建了小鼠肺发育的时空转录组图谱 | 首次报道了发育中肺脏的全面时空转录组图谱，揭示了10个关键空间功能域和谱系特化的转录因子调控网络 | 研究仅聚焦小鼠模型，未直接验证人类肺发育过程 | 解析哺乳动物肺脏功能发育过程中的细胞类型时空组织机制 | 发育中小鼠肺组织（E12.5至P0阶段） | 空间转录组学 | 肺发育疾病 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | E12.5至P0多个发育时间点的小鼠肺组织样本 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 411 | 2025-10-06 |
An automatic annotation tool and reference database for T cell subtypes and states at single-cell resolution
2025-May-30, Science bulletin
IF:18.8Q1
DOI:10.1016/j.scib.2025.02.043
PMID:40157887
|
研究论文 | 开发了自动注释工具STCAT和参考数据库TCellAtlas，用于单细胞分辨率下的T细胞亚型和状态分析 | 构建了最大的人类T细胞参考数据集，开发了基于分层模型和标记校正的自动注释工具STCAT，准确率比现有工具提高28% | NA | 建立T细胞亚型和状态的参考数据库及自动注释工具，促进T细胞免疫和肿瘤免疫学研究 | 人类T细胞 | 生物信息学 | 肺癌, COVID-19, 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 分层模型 | 单细胞RNA测序数据 | 1,348,268个T细胞，来自35种条件和16种组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 412 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing and traditional RNA sequencing reveals the role of cancer-associated fibroblasts in head and neck squamous cell carcinomas cohort
2025-May-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02507-1
PMID:40407978
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和传统RNA测序分析，揭示了癌症相关成纤维细胞在头颈部鳞状细胞癌中的作用 | 构建了基于CAF相关基因的新型预后预测模型和列线图，首次系统评估CAF在HNSC中的预后价值 | 基于TCGA数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 研究癌症相关成纤维细胞在头颈部鳞状细胞癌中的作用及预后价值 | 头颈部鳞状细胞癌患者和癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,RNA测序,ssGSEA,差异表达分析,Cox回归,LASSO回归,通路富集分析 | LASSO回归模型,多变量Cox回归模型,列线图 | 基因表达数据,临床数据 | TCGA HNSC队列 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 413 | 2025-10-06 |
Oligodendrocyte-astrocyte crosstalk in Parkinson's disease mediates neuronal ferroptosis via the FGF signaling pathway
2025-May-23, NPJ Parkinson's disease
DOI:10.1038/s41531-025-00995-0
PMID:40410211
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学揭示了帕金森病中少突胶质细胞与星形胶质细胞通过FGF信号通路介导神经元铁死亡的机制 | 首次发现少突胶质细胞-星形胶质细胞串扰在帕金森病神经元铁死亡中的关键作用，并阐明FGF信号通路在此过程中的具体机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证尚不充分；铁死亡的具体分子机制仍需进一步探索 | 探究帕金森病中少突胶质细胞与星形胶质细胞的相互作用及其在神经元铁死亡中的作用机制 | 帕金森病小鼠模型中的少突胶质细胞、星形胶质细胞和多巴胺神经元 | 神经科学 | 帕金森病 | 单核测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 帕金森病小鼠模型 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 414 | 2025-10-06 |
Metabolic modeling elucidates phenformin and atpenin A5 as broad-spectrum antiviral drugs against RNA viruses
2025-May-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08148-y
PMID:40410544
|
研究论文 | 本研究通过代谢建模发现苯乙双胍和atpenin A5可作为广谱抗RNA病毒药物 | 开发了利用单细胞RNA测序数据评估病毒感染期间细胞代谢的计算工作流程，首次将宿主代谢确立为广谱抗病毒策略的药物靶点 | 研究主要基于计算预测和体外验证，体内实验仅针对SARS-CoV-2在叙利亚仓鼠模型中进行了验证 | 开发广谱抗病毒疗法，评估细胞代谢在病毒感染中的作用 | SARS-CoV-2、甲型流感病毒、登革热病毒和呼吸道合胞病毒 | 计算生物学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序，代谢建模 | 计算工作流程 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 415 | 2025-10-06 |
Machine learning explores the prognostic and immuno-oncological impact of mitochondrial unfolded protein response in CESC
2025-May-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02723-9
PMID:40410615
|
研究论文 | 本研究通过机器学习分析线粒体未折叠蛋白反应基因在宫颈鳞癌和腺癌中的预后价值及免疫肿瘤学影响 | 首次发现ATF5通过调控P-stalk核糖体功能连接免疫反应的新机制，揭示了UPRmt在塑造肿瘤免疫微环境中的新作用 | 研究基于TCGA数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证机制 | 探索线粒体未折叠蛋白反应在宫颈癌中的预后价值和免疫调节作用 | 宫颈鳞状细胞癌和宫颈腺癌患者 | 机器学习 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序，多组学分析，基因集富集分析 | 机器学习 | 基因组数据，转录组数据，临床数据 | TCGA数据库中的CESC样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 416 | 2025-10-06 |
GPx3 marks adipocyte lineage commitment in bone marrow stromal cells
2025-May-23, Journal of orthopaedic surgery and research
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s13018-025-05908-8
PMID:40410842
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析发现GPx3在骨髓基质细胞向脂肪细胞谱系分化过程中的关键作用 | 首次揭示GPx3在骨髓脂肪组织形成中的特异性表达模式及其在脂肪生成中的调控功能 | 研究主要基于公共数据集再分析和体外实验，缺乏体内功能验证 | 探究骨髓脂肪组织形成的分子机制 | 骨髓基质细胞及其脂肪细胞分化过程 | 分子生物学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序, RNA干扰, 转录组分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 公共数据集和体外培养细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 417 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveal high T cell and monocyte status as predictive and prognostic markers in pancreatic cancer
2025-May-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06599-9
PMID:40410886
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术探索胰腺导管腺癌的预测和预后标志物 | 首次使用数字空间分析技术比较新辅助化疗前后胰腺癌的免疫微环境差异 | 样本量较小（48例），需要更大规模研究验证 | 发现胰腺导管腺癌的预测和预后因素 | 胰腺导管腺癌患者手术切除组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 数字空间分析，免疫组织化学分析 | NA | 空间转录组数据，免疫组织化学图像 | 48例胰腺导管腺癌手术病例 | NA | 空间转录组学 | NA | 数字空间分析技术 |
| 418 | 2025-10-06 |
Etiology-based Molecular Characterization of Hepatocellular Carcinoma Reveals SQLE's Contribution to Immunosuppressive Microenvironment
2025-May-22, Current cancer drug targets
IF:2.3Q3
|
研究论文 | 本研究基于病因对肝细胞癌进行分子特征分析，发现SQLE在病毒性肝炎相关HCC中过表达并促进免疫抑制微环境形成 | 首次从全病因角度对肝细胞癌进行分子特征分析，发现SQLE在病毒性肝炎相关HCC中的特异性作用机制 | 基于TCGA数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 探索肝细胞癌的病因特异性特征，揭示潜在治疗靶点 | 肝细胞癌患者 | 数字病理 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞转录组, 空间转录组 | NA | 基因表达数据, 临床病理数据 | TCGA-LIHC队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 419 | 2025-10-06 |
Paired mutation calling and spatial transcriptomics identify cellular neighbourhoods dictating the neoplastic outcome of colitis
2025-May-08, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6401505/v1
PMID:40386410
|
研究论文 | 本研究通过结合谱系追踪、建模、突变分析和空间转录组学，探索了结肠炎相关肿瘤发生过程中细胞环境对克隆命运的影响 | 首次将配对突变检测与空间转录组学相结合，识别出决定结肠炎肿瘤结局的细胞邻域，提出了修复性组织环境促进肿瘤发生的新模型 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究细胞环境如何影响突变克隆的流行和扩张，以及这如何影响结肠炎的肿瘤结局 | 结肠炎相关肿瘤发生的小鼠模型 | 空间转录组学 | 结肠炎相关癌症 | 谱系追踪, 建模, 突变分析, 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据, 突变数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 420 | 2025-10-06 |
Blocking the HIF-1α/glycolysis axis inhibits allergic airway inflammation by reducing ILC2 metabolism and function
2025-May, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16361
PMID:39462230
|
研究论文 | 本研究揭示了HIF-1α/糖酵解轴在调控ILC2细胞代谢和功能中的关键作用，及其在过敏性气道炎症中的潜在免疫治疗价值 | 首次系统阐明HIF-1α通过调控糖酵解通路影响ILC2细胞功能，并验证其在哮喘发病机制中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究HIF-1α/糖酵解轴在ILC2介导的过敏性气道炎症中的作用机制 | 小鼠和人类第2组先天淋巴样细胞(ILC2) | 免疫代谢 | 哮喘 | 单细胞测序、qPCR、转录组分析、代谢分析、染色质免疫沉淀 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、代谢数据、表观遗传数据 | 小鼠模型和人类哮喘患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |