单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 802 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-06-29 |
Integration of Single-Cell RNA Sequencing Data and Bulk Sequencing Data to Characterise the CD8+ T-Cell Exhaustion Mediated Immune Microenvironment in CRC
2025-05, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70556
PMID:40356050
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量测序数据，研究结直肠癌中CD8+ T细胞耗竭介导的免疫微环境 | 首次通过整合单细胞和批量测序数据，系统揭示结直肠癌中CD8+ T细胞耗竭的免疫微环境特征，并发现MIF和CD99是T细胞耗竭的关键调控因子 | 未明确提及，但可能包括样本量有限、需进一步验证机制、XGBoost模型的泛化性待评估 | 阐明结直肠癌中CD8+ T细胞耗竭的免疫微环境机制，并开发预后模型以改善免疫治疗 | 结直肠癌组织中的CD8+ T细胞及上皮细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、批量测序、CellChat | XGBoost | 单细胞基因表达数据、批量基因表达数据 | 未明确提及样本数量，但包含肿瘤组织的单细胞和批量数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 22 | 2026-06-26 |
Avian photoreceptor homologies and the origin of double cones
2025-May-19, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2025.02.040
PMID:40250431
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析新生鸡视网膜，追踪鸟类感光细胞与其他脊椎动物的进化关系，揭示双锥体感光细胞的独特起源 | 首次提出鸟类双锥体感光细胞（DC-P和DC-A）分别起源于祖先红锥体和蓝锥体，并通过CRISPR敲除、转录因子表达和顺式调控分析提供了多重证据 | 仅使用鸡作为模型，未涵盖所有鸟类物种；CRISPR实验仅验证了THRB的作用，其他转录因子的功能尚未确认 | 阐明鸟类感光细胞与其他脊椎动物感光细胞的进化同源性，尤其聚焦双锥体感光细胞的起源 | 新生鸡的视网膜细胞，以及绿安乐蜥视网膜细胞用于跨物种比较 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），CRISPR基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据 | 新生鸡视网膜样本，未明确具体数量；绿安乐蜥视网膜样本用于比较 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于scRNA-seq文库构建 |
| 23 | 2026-06-20 |
Atf3 + senescent chondrocytes mediate meniscus degeneration in aging
2025-05-15, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-025-03566-z
PMID:40375324
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序鉴定Atf3+衰老软骨细胞在衰老过程中介导半月板退变的关键作用 | 首次利用单细胞RNA测序解析大鼠半月板衰老过程中细胞组成变化，并发现Atf3+衰老软骨细胞是驱动半月板退变的关键致病细胞群，揭示了ANGPTL4-SDC4信号轴在其中的作用 | 仅基于大鼠模型，未在人体样本中验证；未深入探讨Atf3+细胞的分子调控机制及治疗靶点的体内干预效果 | 表征半月板衰老相关的细胞和分子变化，识别关键致病细胞群和信号通路 | 大鼠半月板组织（年轻12周龄与老年24月龄） | 机器学习 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大鼠半月板组织样本（年轻组与老年组） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 24 | 2026-06-19 |
Antiviral CD4 + T and myeloid cell responses to influenza vaccines are attenuated in older adults
2025-May-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.30.651528
PMID:40654992
|
研究论文 | 结合体外和离体实验及人类样本，探究老年人在接种流感疫苗后B细胞、CD4+ T细胞和髓系细胞反应的差异 | 首次通过单细胞转录组学揭示老年人T辅助细胞和髓系细胞中干扰素转录信号减弱，并指出髓系细胞转录编程改变是抗病毒T细胞反应降低的原因 | 未明确疫苗配方对髓系细胞反应的具体影响机制，且样本量可能有限 | 评估老年人对流感疫苗的细胞免疫反应，尤其是CD4+ T细胞和髓系细胞反应，并分析年龄相关免疫衰减的机制 | 年轻人和老年人的外周血免疫细胞（B细胞、CD4+ T细胞和髓系细胞） | 数字病理学 | 老年性疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及年轻和老年人类样本（具体数量未在摘要中明确） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'文库制备 |
| 25 | 2026-06-18 |
Identification and Validation of Potential Immune-Related Genes for Endometriosis
2025-05, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.70091
PMID:40367358
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和免疫组化验证，识别并验证子宫内膜异位症中的潜在免疫相关基因 | 综合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，结合机器学习算法，首次识别出TGFBR1和GIMAP4分别为在位和异位子宫内膜的特征免疫基因 | 研究主要基于公共数据库数据，样本量有限，且免疫组化验证仅针对两个基因，可能需要更多临床样本和功能实验进一步验证 | 识别并验证子宫内膜异位症中潜在的免疫相关基因 | 子宫内膜异位症患者的在位内膜和异位内膜组织样本 | 机器学习 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、免疫组化 | 机器学习模型（未具体说明类型） | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量，使用了GEO数据库中的公共数据 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 26 | 2026-06-17 |
Aberrant STAT signaling drives T cell dysregulation in a targetable pediatric sepsis endotype
2025-May-23, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.06.11.24308709
PMID:38946991
|
研究论文 | 通过整合深度免疫表型分析、血浆蛋白质组学、单细胞转录组学和磷酸流式细胞术，在88名危重症儿童的前瞻性队列中鉴定了儿童脓毒症的一个免疫亚型，其特征为IL-6/IFN-γ驱动的T细胞功能异常，并指出JAK/STAT轴作为潜在免疫调节治疗靶点 | 首次通过整合多组学方法在儿童脓毒症中定义了一个以IL-6/IFN-γ驱动T细胞功能障碍为特征的免疫亚型，并揭示STAT信号异常在其中的关键作用，为靶向治疗提供了新方向 | 样本量较小（88名儿童），且为单中心研究，可能限制结果的普适性；未对JAK/STAT抑制剂进行干预性验证 | 阐明儿童脓毒症中导致疾病异质性的免疫机制，并识别可靶向的免疫亚型 | 88名危重症儿童 | 机器学习 | 脓毒症 | RNA-seq, 血浆蛋白质组学, 磷酸流式细胞术 | 无监督聚类 | 血浆细胞因子数据、单细胞转录组数据、蛋白质组数据、流式细胞术数据 | 88名危重症儿童 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 27 | 2026-06-17 |
Spatially Resolved Panoramic in vivo CRISPR Screen via Perturb-DBiT
2025-May-08, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6481967/v1
PMID:40386382
|
研究论文 | 提出Perturb-DBiT方法，实现在同一组织切片上同时进行空间全转录组RNA和单导向RNA的共测序，用于全景式体内CRISPR筛选 | 首次实现空间分辨的体内CRISPR筛选，能够同时测序全转录组总RNA和sgRNA，并检测小RNA和长链非编码RNA的调控变化 | 当前方法仅能检测小规模扰动面板和少量蛋白编码RNA，本文虽有所突破但可能仍存在组织处理复杂度及适用性限制 | 开发一种可在天然组织环境中无偏检测基因扰动对RNA调控、细胞动力学及组织结构影响的空间全转录组CRISPR筛选方法 | 人类癌症转移定植模型和免疫健全同源小鼠模型中的肿瘤组织切片 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学、CRISPR筛选、全转录组测序 | NA | 空间转录组数据、总RNA测序数据、sgRNA测序数据 | 人类癌症转移定植模型中的肿瘤集落连续组织切片，以及免疫健全同源小鼠模型的肿瘤组织切片 | NA | 空间转录组学 | Perturb-DBiT | Perturb-DBiT方法用于空间全转录组总RNA和sgRNA的碱基层面共测序 |
| 28 | 2026-06-17 |
Exploring OLR1-mediated inflammatory mechanisms in the hematoma microenvironment of acute intracerebral hemorrhage
2025-05-07, Neuroscience
IF:2.9Q2
|
研究论文 | 探索OLR1介导的急性脑出血血肿微环境中的炎症机制 | 首次通过单细胞RNA测序和生物信息学分析揭示了OLR1在急性脑出血血肿微环境中的上调及其与单核细胞和巨噬细胞活性的相关性，提出OLR1作为潜在生物标志物和治疗靶点 | 未明确说明局限性 | 研究OLR1在急性脑出血血肿微环境中的免疫反应和疾病进展中的作用 | 急性脑出血患者的外周血、脑组织和血肿样本 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序，实时定量PCR | NA | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | 来自GEO数据集的多个数据集，包括外周血、脑组织和血肿样本，具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 29 | 2026-06-17 |
Harnessing omics data for drug discovery and development in ovarian aging
2025-05-01, Human reproduction update
IF:14.8Q1
DOI:10.1093/humupd/dmaf002
PMID:39977580
|
综述 | 本文综述了多组学数据在卵巢衰老药物发现与开发中的应用，包括基因组、转录组、蛋白质组、代谢组和微生物组数据 | 综合了从组织水平和单细胞视角分析卵巢衰老相关的多组学数据，并探讨如何利用这些新兴数据集识别新药靶点以指导治疗策略 | 未提及具体限制，但可能包括现有数据源的不足或方法的局限性 | 综合卵巢衰老相关的多组学数据，探索如何利用这些数据发现新药靶点并指导治疗策略 | 卵巢衰老相关机制及潜在药物靶点 | 机器学习 | 卵巢衰老 | 多组学、单细胞技术、空间转录组学 | 深度学习、机器学习 | 多组学数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Visium | 单细胞多组学和空间转录组学平台用于组织分析 |
| 30 | 2026-05-31 |
Targeting caseinolytic mitochondrial matrix peptidase, a novel contributor to the pathobiology of high-risk multiple myeloma
2025-May-29, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024024781
PMID:39912779
|
research paper | 利用单细胞转录组学发现CLPP是高风险多发性骨髓瘤病理生物学的新贡献者，并验证其作为治疗靶点的潜力 | 首次确定酪蛋白水解线粒体基质肽酶（CLPP）在多发性骨髓瘤高危行为中的关键作用及其作为治疗靶点的可行性 | 对CLPP在骨髓瘤进展中的详细分子机制阐述可能不够深入，且临床前研究结果尚需临床验证 | 探究高风险多发性骨髓瘤的病理生物学机制及潜在治疗靶点 | 多发性骨髓瘤患者CD138+肿瘤浆细胞及正常浆细胞 | machine learning | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 涉及新诊断和复发/难治性多发性骨髓瘤患者样本 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台 |
| 31 | 2026-05-31 |
Exploring the co-morbid relationship between Alzheimer's disease and lung cancer in the 5xFAD transgenic mouse model
2025-05, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.12527
PMID:39930922
|
研究论文 | 本研究利用5xFAD转基因小鼠模型探讨阿尔茨海默病与肺癌之间的共病关系，并揭示AD抑制肺癌发展的潜在机制 | 首次通过共病小鼠模型结合单细胞测序技术，揭示阿尔茨海默病通过铁稳态失衡、氧化应激增强及免疫细胞浸润（CD8+ T细胞和自然杀伤细胞）抑制肺癌发展的机制 | 未提及具体局限性，但可能涉及模型转化到临床的适用性及样本量问题 | 探究阿尔茨海默病与肺癌之间拮抗关系的分子机制 | 5xFAD转基因小鼠模型中的阿尔茨海默病与肺癌共病现象 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病、肺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | 未明确样本数量，涉及5xFAD转基因小鼠和野生型小鼠 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 32 | 2026-05-30 |
Dual roles of IRE1α inhibition in reversing mitochondrial ROS-induced CD8+ T-cell senescence and exerting direct antitumor effects in multiple myeloma
2025-May-26, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-011044
PMID:40425229
|
研究论文 | IRE1α抑制在逆转线粒体ROS诱导的多发性骨髓瘤CD8+ T细胞衰老和直接抗肿瘤效应中的双重作用 | 首次发现IRE1α抑制可通过减少线粒体ROS产生来逆转CD8+ T细胞衰老，并直接抑制骨髓瘤细胞，提出了针对多发性骨髓瘤的新型双重治疗策略 | 未明确IRE1α抑制在健康T细胞中的长期安全性，且需要进一步验证其在不同多发性骨髓瘤亚型中的效果 | 探索IRE1α抑制对多发性骨髓瘤中CD8+ T细胞衰老的逆转作用及其直接抗肿瘤效应 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓CD8+ T细胞和Vk*MYC小鼠模型的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、流式细胞术数据 | 多发性骨髓瘤患者骨髓CD8+ T细胞和健康供体骨髓CD8+ T细胞（具体数量未提供）以及Vk*MYC小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 33 | 2026-05-30 |
Blockade of CLEVER-1 restrains immune evasion and enhances anti-PD-1 immunotherapy in gastric cancer
2025-May-22, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-011080
PMID:40404204
|
研究论文 | 研究CLEVER-1在胃癌免疫逃逸中的作用并评估其与抗PD-1免疫治疗的协同效应 | 首次揭示CLEVER-1+肿瘤相关巨噬细胞在胃癌微环境中的免疫抑制功能，并提出联合靶向CLEVER-1和PD-1的双重阻断策略 | 研究主要基于体外实验和公共数据库分析，缺乏体内模型验证和更大规模临床队列的确认 | 探索CLEVER-1在胃癌免疫治疗中的临床意义和治疗潜力 | 胃癌患者肿瘤组织样本和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光,流式细胞术,RNA测序 | NA | 基因表达数据,图像数据 | 两个独立的胃癌队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 公共数据集GSE183904 |
| 34 | 2026-05-30 |
INBRX-106: a hexavalent OX40 agonist that drives superior antitumor responses via optimized receptor clustering
2025-May-21, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011524
PMID:40404202
|
研究论文 | 开发了一种六价OX40激动剂INBRX-106，通过优化受体簇集驱动卓越的抗肿瘤T细胞反应 | 首次开发六价OX40激动剂以增强受体簇集，独立于Fc介导的交联，克服传统二价激动剂信号激活不足的局限 | 尚未充分探索长期毒性和联合用药的最佳方案 | 评估六价OX40激动剂INBRX-106在增强受体簇集、信号传导和抗肿瘤T细胞免疫中的疗效 | INBRX-106药物对T细胞激活、增殖和抗肿瘤效应的影响 | 机器学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床样本、小鼠模型 | I/II期临床试验（NCT04198766）的患者血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 35 | 2026-05-30 |
Spatial transcriptomics highlights B cells as key contributors to a complete and durable response to chemo-immunotherapy in a patient with resectable NSCLC
2025-May-11, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011563
PMID:40350207
|
研究论文 | 通过空间转录组学和多组学分析，揭示B细胞在可切除非小细胞肺癌患者对化疗免疫治疗完全持久应答中的关键作用 | 首次利用空间转录组学结合单细胞RNA测序和血清蛋白质组学，深入剖析单个患者的肿瘤免疫微环境，发现不同成熟状态的B细胞在肿瘤清除中的关键作用，并观察到三级淋巴结构的形成 | 该研究为单个病例报告，样本量有限，结论的普适性需更大规模研究验证 | 探索可切除非小细胞肺癌患者对新辅助化疗免疫治疗产生完全病理应答和持久无事件生存的分子机制 | 一名可切除非小细胞肺癌伴孤立同步脑转移患者的治疗前脑转移组织和治疗后原发肺肿瘤组织 | 数字病理学, 机器学习 | 非小细胞肺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 血清蛋白质组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据 | 1例患者的2个组织样本（治疗前脑转移组织和治疗后原发肺肿瘤组织）及血清样本 | 10x Genomics, Illumina | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Visium空间转录组学平台, Illumina NovaSeq测序平台用于单细胞RNA测序 |
| 36 | 2026-05-30 |
Blocking LIF and PD-L1 enhances the antitumor efficacy of SBRT in murine PDAC models
2025-May-07, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010820
PMID:40341024
|
research paper | 研究在胰腺导管腺癌模型中阻断LIF和PD-L1联合立体定向放射治疗（SBRT）的抗肿瘤效果 | 首次在胰腺癌模型中评估同时阻断LIF和PD-L1与SBRT三联疗法的抗肿瘤效应，并揭示其通过免疫刺激微环境增强CD8+ T细胞浸润和激活的机制 | 该研究仅基于小鼠原位胰腺肿瘤模型，缺乏对人类患者的验证；且未深入探讨长期系统性抗肿瘤记忆的维持机制 | 探讨LIF阻断联合标准治疗方案（如放疗和免疫检查点抑制剂）的潜力，重点评估三联疗法（SBRT+抗LIF+抗PD-L1）对胰腺肿瘤的疗效及免疫机制 | 小鼠原位胰腺肿瘤模型及肝再攻击模型中的肿瘤组织和免疫细胞 | machine learning | 胰腺导管腺癌（胰腺癌） | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, Luminex检测 | NA | 基因表达数据，免疫细胞图谱 | 多个小鼠原位胰腺肿瘤模型和肝再攻击模型 | Illumina, 10x Genomics | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | Illumina NovaSeq, 10x Chromium | bulk RNA测序使用Illumina平台；单细胞RNA测序使用10x Chromium系统 |
| 37 | 2026-05-30 |
Combination of HDAC inhibition and cytokine enhances therapeutic HPV vaccine therapy
2025-May-02, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-011074
PMID:40316302
|
研究论文 | 评估HDAC抑制剂恩替诺特与免疫细胞因子NHS-IL12联合HPV疫苗PDS0101在HPV16阳性肿瘤模型中的抗肿瘤疗效 | 首次发现恩替诺特三联疗法（HPV疫苗+NHS-IL12+恩替诺特）在抗PD-1难治性HPV16阳性肿瘤模型中优于抗PD-1联合方案，并揭示其通过增强CD8+ T细胞浸润、细胞毒性和促进肿瘤相关巨噬细胞向M1样促炎表型分化的双重机制 | 该研究仅限于小鼠模型，缺乏临床患者数据验证；恩替诺特三联疗法的最佳剂量和给药方案尚未优化 | 探索HPV16特异性治疗性疫苗PDS0101联合肿瘤靶向免疫细胞因子NHS-IL12及HDAC抑制剂恩替诺特在HPV相关恶性肿瘤中的治疗潜力 | HPV16阳性、抗PD-1难治的TC-1和mEER小鼠肿瘤模型 | 机器学习 | HPV相关恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序、T细胞受体富集 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肿瘤样本（具体数量未在摘要中说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序结合TCR富集 |
| 38 | 2026-05-29 |
MIC-Drop-seq: Scalable single-cell phenotyping of mutant vertebrate embryos
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.27.656468
PMID:40502104
|
research paper | 提出了MIC-Drop-seq方法，将高通量基因破坏与多重单细胞RNA测序结合，用于斑马鱼胚胎的大规模表型分析 | 通过Multiplexed Intermixed CRISPR Droplets技术同时破坏50个转录调控因子，结合多重scRNAseq实现单细胞水平的大规模遗传筛选，能捕获细胞外效应并发现新功能 | NA | 开发可扩展的单细胞表型分析方法，用于大规模绘制脊椎动物胚胎基因功能图谱 | 斑马鱼胚胎中的50个转录调控因子突变体 | machine learning | NA | CRISPR, 单细胞RNA测序（scRNAseq）, 液滴微流控 | NA | RNA测序数据 | 1000个斑马鱼胚胎 | Illumina | 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 多重单细胞RNA测序与液滴微流控系统结合 |
| 39 | 2026-05-27 |
scE2EGAE: enhancing single-cell RNA-Seq data analysis through an end-to-end cell-graph-learnable graph autoencoder with differentiable edge sampling
2025-05-27, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-025-00616-z
PMID:40426257
|
研究论文 | 提出了一种名为scE2EGAE的端到端细胞图可学习图自编码器，通过可微分的边采样增强单细胞RNA-Seq数据分析 | 首次在训练过程中学习细胞图而非使用固定k近邻图，通过直通估计器和Gumbel-Softmax实现可微分边采样 | 未明确说明局限性 | 通过可学习的细胞图构建提升单细胞RNA-Seq数据下游分析性能 | 单细胞RNA测序数据中的细胞关系和基因表达 | 机器学习 | NA | scRNA-Seq | 图自编码器（GAE） | 基因表达数据 | 八个公开的scRNA-Seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 40 | 2026-05-27 |
Reparative immunological consequences of stem cell transplantation as a cellular therapy for refractory Crohn's disease
2025-05-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333558
PMID:39961646
|
研究论文 | 探讨自体造血干细胞移植作为难治性克罗恩病细胞疗法的免疫修复后果 | 首次揭示造血干细胞移植通过作用于髓系细胞尤其是巨噬细胞来修复难治性克罗恩病患者的免疫系统，并发现克罗恩病中造血干细胞亚群存在未被认知的功能异质性 | 样本量较小（n=19），且为单中心研究，可能影响结果的普遍性 | 理解造血干细胞移植后免疫系统重建机制及其作为细胞疗法修复免疫细胞群体的潜力 | 难治性克罗恩病成人患者 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序，质谱流式细胞术 | 小鼠异种移植模型 | 单细胞转录组数据，细胞表型数据 | 19名活动性临床和内镜疾病且对现有治疗无效的克罗恩病成人患者 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞质谱流式 | NA | NA |