单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 800 篇文献，本页显示第 361 - 380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 361 | 2025-10-06 |
PPY-Induced iCAFs Cultivate an Immunosuppressive Microenvironment in Pancreatic Cancer
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413432
PMID:40162859
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现胰腺癌细胞分泌的PPY蛋白是诱导炎症性癌症相关成纤维细胞(iCAFs)的关键因子，并揭示其通过EGFR激活非经典NF-κB通路机制 | 首次发现胃肠道激素PPY作为iCAFs的新型诱导剂，相比已知诱导剂可能具有更小的全身性副作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 探索胰腺癌免疫抑制微环境的形成机制并寻找改善免疫治疗效果的策略 | 胰腺导管腺癌(PDAC)微环境中的炎症性癌症相关成纤维细胞(iCAFs) | 单细胞测序分析 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组织化学(mIHC), mRNA测序, 免疫沉淀-质谱联用, 分子对接, PET-CT成像 | KPC(Kras; Trp53; Pdx1-Cre)小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 组织图像数据, 蛋白质相互作用数据 | 人类PDAC组织芯片, 小鼠原位移植瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 362 | 2025-10-06 |
CD47-amyloid-β-CD74 signaling triggers adaptive immunosuppression in sepsis
2025-May, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00442-4
PMID:40185975
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脓毒症中CD47-淀粉样蛋白β-CD74信号通路诱导适应性免疫抑制的新机制 | 首次发现CD47通过诱导淀粉样蛋白β产生，与B细胞上的CD74相互作用导致B细胞抑制，从而引发适应性免疫抑制的新信号通路 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 阐明脓毒症中宿主反应失调导致免疫抑制的分子机制 | 脓毒症患者和小鼠模型的免疫细胞 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 常规RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 363 | 2025-10-06 |
From Invaginating Site to Deep Lesion: Spatial Transcriptomics Unravels Ectopic Endometrial Penetration Features in Adenomyosis
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411752
PMID:40190183
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学揭示子宫腺肌症中子宫内膜异位浸润的分子机制 | 首次绘制了子宫腺肌症从内陷部位到深部病变的空间转录组图谱，并建立了首个子宫腺肌症转录组学网络资源 | NA | 阐明子宫腺肌症内陷结构的分子机制 | 子宫腺肌症患者的子宫内膜内陷部位和异位病变 | 数字病理学 | 子宫腺肌症 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序解卷积, 组织学技术, 体外实验 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 364 | 2025-10-06 |
Malignant Hepatoblast-Like Cells Sustain Stemness via IGF2-Dependent Cholesterol Accumulation in Hepatoblastoma
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407671
PMID:40271711
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析鉴定肝母细胞瘤中的恶性肝母细胞样细胞亚群及其通过IGF2依赖的胆固醇积累维持干细胞特性的机制 | 首次在肝母细胞瘤中鉴定出恶性肝母细胞样细胞亚群，揭示其通过IGF2/SREBF2通路促进胆固醇异常积累维持干细胞特性的新机制 | 研究主要基于单细胞转录组数据分析，需要进一步的实验验证机制 | 探索肝母细胞瘤的发病机制和潜在治疗靶点 | 肝母细胞瘤患者样本 | 数字病理学 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 365 | 2025-10-06 |
Pooled tagging and hydrophobic targeting of endogenous proteins for unbiased mapping of unfolded protein responses
2025-May-01, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2025.04.002
PMID:40273915
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研究论文 | 开发了一种内源性蛋白质标记方法，用于系统研究蛋白质组动态和未折叠蛋白质响应 | 建立了结合高通量成像和单细胞RNA测序的方法，首次实现了对空间限制性蛋白质错误折叠响应的无偏映射 | NA | 系统研究蛋白质组组织、调控和功能，特别是蛋白质质量控制响应机制 | 内源性HaloTag标记的蛋白质库 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 高通量成像, 原位条形码测序 | NA | 图像数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 366 | 2025-10-06 |
Mas Signaling Potentiates Neutrophil Extracellular Traps Formation Induced by Endothelial Cells Derived S1P in Mice with Acute Liver Failure
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411428
PMID:40285622
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研究论文 | 本研究探讨Mas信号通路在急性肝衰竭中通过FXR-S1P轴促进中性粒细胞胞外诱捕网形成的作用机制 | 首次揭示Mas信号通过调控肠道菌群代谢产物DCA激活肝脏FXR-S1P轴，进而促进内皮细胞介导的NETs形成 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人体验证；机制研究主要基于基因敲除和代谢组学分析 | 阐明Mas信号在急性肝衰竭中调控中性粒细胞胞外诱捕网形成的分子机制 | Mas1基因敲除小鼠和野生型小鼠（6-8周龄雄性） | 分子生物学 | 急性肝衰竭 | 单细胞测序、代谢组学分析、基因敲除技术 | NA | 基因表达数据、代谢组数据、单细胞测序数据 | Mas1基因敲除和野生型小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 367 | 2025-10-06 |
MEA-seqX: High-Resolution Profiling of Large-Scale Electrophysiological and Transcriptional Network Dynamics
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202412373
PMID:40304297
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研究论文 | 介绍MEA-seqX平台用于同时记录和分析分子与电生理网络活动 | 首次整合高密度微电极阵列、空间转录组学、光学成像和先进计算策略，实现分子和电生理网络活动的同步记录 | 仅在小鼠海马体经验依赖性可塑性模型中验证 | 解码分子事件与神经元活动之间的相互影响关系 | 小鼠海马体神经元网络 | 神经科学,计算生物学 | NA | 空间转录组学,光学成像,电生理记录 | 机器学习算法,图论分析 | 电生理信号,基因表达数据,图像数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞分析 | MEA-seqX | 整合高密度微电极阵列、空间转录组学和光学成像的多模态平台 |
| 368 | 2025-10-06 |
Lactylation-Driven NUPR1 Promotes Immunosuppression of Tumor-Infiltrating Macrophages in Hepatocellular Carcinoma
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413095
PMID:40305758
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研究论文 | 本研究揭示NUPR1通过乳酸化修饰在肝细胞癌肿瘤浸润巨噬细胞中驱动免疫抑制的新机制 | 首次发现肿瘤来源的乳酸通过组蛋白乳酸化上调巨噬细胞中NUPR1表达，形成促进免疫抑制的正反馈循环 | 临床前模型研究，需要进一步临床验证 | 探究NUPR1在肝细胞癌肿瘤微环境免疫抑制中的作用机制 | 肿瘤相关巨噬细胞和CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，功能验证实验 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 369 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing of the Primary Visual Cortex in Mice With Optic Nerve Injury
2025-May-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.5.31
PMID:40408096
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究视神经损伤后小鼠初级视皮层的损伤变化及胶质细胞异质性 | 首次在单细胞水平揭示视神经损伤后初级视皮层中星形胶质细胞和小胶质细胞的异质性及伪时间轨迹 | 研究仅针对小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究视神经损伤后初级视皮层的损伤机制及胶质细胞异质性 | 小鼠初级视皮层组织 | 单细胞测序分析 | 视神经损伤 | 单细胞RNA测序, qPCR, Western blot, 免疫荧光 | Seurat, cellchat, CytoTRACE | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量的小鼠初级视皮层组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 370 | 2025-10-06 |
STExplore: An Integrated Online Platform for Comprehensive Analysis and Visualization of Spatial Transcriptomics Data
2025-05, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401272
PMID:40045664
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研究论文 | 开发了一个集成在线平台STExplore，用于空间转录组数据的全面分析和可视化 | 支持多种空间转录组技术，整合单细胞RNA测序数据，提供完整分析流程和交互式可视化功能 | 未在摘要中明确说明平台的具体限制 | 解决现有空间转录组分析平台在技术兼容性、多组学数据整合和分析流程完整性方面的挑战 | 空间转录组数据，包括胚胎大脑发育、阿尔茨海默病和脑组织结构的案例研究 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据，基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | STExplore平台 | 支持测序基和图像基方法的在线分析平台，包含预处理、数据整合、聚类分析、基因水平分析和细胞间通讯研究 |
| 371 | 2025-10-06 |
Fibroblast reprogramming in the dura mater of NTG-induced migraine-related chronic hypersensitivity model drives monocyte infiltration via Angptl1-dependent stromal signaling
2025-May-26, The journal of headache and pain
IF:7.3Q1
DOI:10.1186/s10194-025-02058-4
PMID:40419944
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了硝酸甘油诱导的偏头痛模型中硬脑膜成纤维细胞重编程通过Angptl1信号驱动单细胞浸润的机制 | 首次在偏头痛慢性超敏模型中鉴定出促炎性成纤维细胞亚群扩张及其通过Angptl1介导的基质-免疫细胞串扰机制 | 需要人类样本验证，动物模型可能无法完全模拟人类偏头痛病理 | 解析偏头痛慢性超敏的硬脑膜基质-免疫细胞相互作用机制 | 硝酸甘油诱导的偏头痛模型小鼠的硬脑膜组织 | 单细胞组学 | 偏头痛 | 单细胞RNA测序, GWAS整合分析, 细胞间相互作用网络分析, 转录调控分析 | NA | 单细胞转录组数据, 基因组关联数据 | 偏头痛模型小鼠硬脑膜组织（具体样本数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 372 | 2025-10-06 |
Revealing a novel Decorin-expressing tumor stromal subset in hepatocellular carcinoma via integrative analysis single-cell RNA sequencing
2025-May-26, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03811-0
PMID:40420150
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研究论文 | 通过整合分析单细胞RNA测序数据，揭示了肝细胞癌中表达Decorin的新型肿瘤基质亚群及其临床意义 | 首次在肝细胞癌中发现高表达DCN及相关硫酸软骨素合成酶的独特肿瘤基质亚群，并建立了六基因DCN相关特征作为预后标志物 | DCN在肝癌微环境中的具体作用机制仍需进一步验证 | 探究Decorin在肝细胞癌肿瘤微环境中的作用和潜在治疗价值 | 肝细胞癌组织、肿瘤微环境中的基质细胞 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, Western blot | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 373 | 2025-10-06 |
Targeting of the IL-33/Wnt axis restricts breast cancer stemness and metastasis
2025-May-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-03260-9
PMID:40414980
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研究论文 | 本研究揭示了IL-33通过激活Wnt/β-catenin信号通路促进乳腺癌干细胞特性和转移的新机制 | 首次阐明IL-33通过自分泌方式经Wnt通路调控乳腺癌干细胞特性，并提出AAV介导的ST2沉默新型治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究IL-33/Wnt轴在乳腺癌干细胞特性和转移中的作用机制 | 乳腺癌细胞系(4T1, MDA-MB-231)和转基因小鼠模型(MMTV-PyMT) | 癌症生物学 | 乳腺癌 | CRISPR/Cas9, 单细胞RNA测序, 腺相关病毒(AAV)基因沉默 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 多种乳腺癌细胞系和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 374 | 2025-10-06 |
The antioxidant stress effect of granulin precursor in vitiligo
2025-May-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-03486-7
PMID:40415096
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研究论文 | 本研究探讨了颗粒体蛋白前体通过颗粒体蛋白-sortilin 1配体-受体相互作用在白癜风中对黑素细胞氧化应激的保护作用 | 首次发现颗粒体蛋白-sortilin 1配体-受体作为黑素细胞与其他皮肤细胞通讯的关键桥梁，并阐明其在白癜风中通过激活抗氧化系统保护黑素细胞的机制 | 研究主要基于体外实验，缺乏体内实验验证；相互作用抑制剂的具体作用机制尚未完全阐明 | 探究细胞间信号传导在黑素细胞丢失中的作用机制 | 白癜风患者皮肤细胞，特别是黑素细胞 | 皮肤病学 | 白癜风 | 单细胞测序，微阵列数据分析，体外实验 | NA | 基因表达数据，蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 375 | 2025-10-06 |
Targeting PIK3CB/YAP1 improves the sensitivity of paclitaxel by suppressing aging in head and neck squamous tumor cells
2025-May-24, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03818-7
PMID:40413541
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研究论文 | 本研究探讨PIK3CB/YAP1通路通过抑制衰老增强头颈部鳞状细胞癌对紫杉醇化疗敏感性的机制 | 首次揭示PIK3CB通过YAP1通路调控肿瘤细胞衰老并影响化疗敏感性的机制，并验证navitoclax与紫杉醇联合治疗的协同效应 | 研究主要基于体外实验和公共数据库分析，缺乏体内动物模型验证 | 探索提高头颈部鳞状细胞癌化疗敏感性的新策略 | 头颈部鳞状细胞癌细胞 | 癌症生物学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 免疫组织化学、细胞增殖检测、DNA复制分析、集落形成实验、单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、临床数据 | 公共数据库（GEO、TCGA、HPA）数据及实验细胞系 | NA | 单细胞转录组学, 蛋白质组学, 批量转录组学 | NA | NA |
| 376 | 2025-10-06 |
Identification of key genes and diagnostic biomarkers for peripheral atherosclerosis: A multi-omics approach
2025-May-23, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000042437
PMID:40419934
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研究论文 | 本研究通过多组学方法识别外周动脉粥样硬化的关键基因和诊断生物标志物 | 整合基因组学、转录组学和孟德尔随机化分析，首次系统鉴定6个PAS关键基因并构建高精度诊断模型 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 识别外周动脉粥样硬化的分子生物标志物并阐明其发病机制 | 外周动脉粥样硬化患者基因表达数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,基因表达分析,孟德尔随机化分析 | 诊断列线图模型 | 基因表达数据 | 2个GEO数据集(GSE28829,GSE100927)和独立验证数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,全基因组关联研究,表达数量性状位点分析 | NA | NA |
| 377 | 2025-10-06 |
Identification of Prognostic Biomarkers of Ovarian High-Grade Serous Carcinoma: A Preliminary Study Using Spatial Transcriptome Analysis and Multispectral Imaging
2025-05-08, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14100681
PMID:40422184
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研究论文 | 本研究利用空间转录组分析和多光谱成像技术识别卵巢高级别浆液性癌的预后生物标志物 | 首次结合GeoMx平台的空间转录组学和多光谱免疫荧光技术分析HGSC的肿瘤微环境空间特征 | 初步研究，样本量有限 | 识别与卵巢高级别浆液性癌疾病进展相关的生物标志物 | 卵巢高级别浆液性癌患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 空间转录组学, 多光谱免疫荧光 | NA | 空间转录组数据, 多光谱图像 | NA | NA | 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx平台 |
| 378 | 2025-10-06 |
m2ST: dual multi-scale graph clustering for spatially resolved transcriptomics
2025-May-06, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf221
PMID:40272889
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研究论文 | 提出一种名为m2ST的双重多尺度图聚类方法，用于空间转录组数据的空间域注释 | 采用多尺度掩码图自编码器提取不同尺度表示，引入随机掩码机制和缩放余弦误差损失函数，开发专门的多尺度聚类框架整合尺度共性和特异性信息 | 论文未明确说明方法的具体局限性 | 提高空间转录组数据空间聚类的准确性和鲁棒性 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 图神经网络，掩码图自编码器 | 空间转录组数据 | 多个空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 379 | 2025-10-06 |
Improving Spatial Transcriptomics with Membrane-Based Boundary Definition and Enhanced Single-Cell Resolution
2025-05, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401056
PMID:39871658
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研究论文 | 提出了一种基于细胞膜标记的空间转录组学新方法，通过遗传编码荧光蛋白精确定义细胞边界 | 首次使用细胞膜标记而非传统的核染色或数学推断方法来定义细胞边界，显著提高了基因捕获数量和细胞类型识别精度 | NA | 改进空间转录组学技术的细胞边界定义和单细胞分辨率 | 小鼠和蝾螈的肝脏、大脑和肠道组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间基因表达数据，荧光图像 | 小鼠和蝾螈的多个器官组织样本 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | 基于细胞膜标记的空间转录组学方法 |
| 380 | 2025-10-06 |
Exploring the co-morbid relationship between Alzheimer's disease and lung cancer in the 5xFAD transgenic mouse model
2025-May, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.12527
PMID:39930922
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研究论文 | 本研究通过建立5xFAD转基因小鼠共病模型，探索阿尔茨海默病对肺癌发展的抑制作用机制 | 首次在5xFAD转基因小鼠模型中建立AD与肺癌共病模型，揭示铁稳态失衡和免疫细胞浸润在AD抑制肺癌进展中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 阐明阿尔茨海默病抑制肺癌发展的分子机制 | 5xFAD转基因小鼠和野生型小鼠 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病,肺癌 | 单细胞测序,组织病理学分析,分子病理学分析 | 动物模型 | 测序数据,图像数据 | 5xFAD转基因小鼠和野生型小鼠群体 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |