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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
321 2025-10-06
Elucidating the Prognostic and Therapeutic Implications of Insulin Resistance Genes in Breast Cancer: A Machine Learning-Powered Analysis
2025-May-13, Biology
研究论文 本研究利用机器学习算法构建基于胰岛素抵抗相关基因的乳腺癌预后模型 首次开发基于七个胰岛素抵抗枢纽基因的预后特征,并在多个独立队列中验证其预测能力 研究基于公共数据库数据,需要进一步前瞻性研究验证 阐明胰岛素抵抗基因在乳腺癌中的预后和治疗意义 乳腺癌患者 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序,机器学习算法 机器学习预后模型 基因表达数据 METABRIC和三个GSE数据集的多队列验证 NA 单细胞RNA-seq NA NA
322 2025-10-06
Molecular and Biophysical Perspectives on Dormancy Breaking: Lessons from Yeast Spore
2025-May-11, Biomolecules IF:4.8Q1
综述 本文系统总结了酵母孢子休眠与复苏的分子机制和生物物理特性 整合单细胞RNA测序、蛋白质组学和活细胞成像等多学科方法,揭示细胞质流动性在休眠调控中的新作用 主要基于酵母模型的研究发现,在其他生物系统中的普适性仍需验证 阐明细胞休眠状态与增殖状态转换的分子和生物物理机制 酵母孢子及其他休眠生物系统 分子生物学 NA 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学分析, 活细胞成像 NA 基因表达数据, 蛋白质组数据, 影像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
323 2025-10-06
Evaluation of out-of-distribution detection methods for data shifts in single-cell transcriptomics
2025-May-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 评估六种分布外检测方法在单细胞转录组学数据偏移中的表现 首次将计算机视觉领域的分布外检测方法应用于单细胞转录组学中的新细胞类型识别和数据偏移检测 仅评估了六种OOD方法,未涵盖所有可能的检测方法 提高单细胞转录组学中细胞类型自动注释的准确性和可靠性 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 LogitNorm, MC dropout, Deep Ensembles, Energy-based OOD, Deep NN, Posterior networks 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
324 2025-10-06
scaLR: a low-resource deep neural network-based platform for single cell analysis and biomarker discovery
2025-May-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 开发了一个名为scaLR的低资源深度神经网络平台,用于单细胞分析和生物标志物发现 提出了一种新颖的特征提取算法,通过特征子集训练和重要性评估来选择top-K特征,显著降低了计算资源需求 NA 开发低计算资源需求的单细胞分析平台 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 深度神经网络(DNN) 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq scaLR平台 基于Python的单细胞分析平台,支持数据处理、特征提取、训练、评估和下游分析
325 2025-06-01
Unravelling heart failure cellular signalling heterogeneity with spatial transcriptomics
2025-May-30, European heart journal IF:37.6Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
326 2025-06-01
Single-cell sequencing atlas construction for tracheobronchial adenoid cystic carcinoma
2025-May-30, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
327 2025-10-06
An Arabidopsis single-nucleus atlas decodes leaf senescence and nutrient allocation
2025-May-29, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本研究通过构建拟南芥单核转录组图谱,揭示了叶片衰老和养分分配的系统性调控机制 首次构建了包含20个组织、超过100万个核的拟南芥单核转录组图谱;开发了两种分子指标在单细胞分辨率下量化叶片细胞衰老状态;通过时间分辨采样揭示了主要叶细胞类型间高度协调的衰老进程 研究仅限于拟南芥模型植物,结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 解析叶片衰老和养分分配的系统性调控机制 拟南芥多个发育阶段的20个组织 植物生物学 NA 单细胞RNA测序 加权基因共表达网络分析 单核转录组数据 超过100万个核,来自20个组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
328 2025-10-06
Unraveling the mechanisms of irAEs in endometrial cancer immunotherapy: insights from FAERS and scRNA-seq data
2025-May-28, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 整合FAERS数据库和单细胞转录组数据研究子宫内膜癌免疫治疗中PD-1抑制剂相关不良事件的机制 首次将FAERS数据库与单细胞RNA测序数据相结合,揭示PD-1抑制剂通过补偿性激活CXCR4和CXCR6通路导致免疫相关不良事件的新机制 需要进一步的临床研究和机制研究来验证这些发现 研究子宫内膜癌免疫治疗中PD-1抑制剂相关不良事件的潜在机制 子宫内膜癌患者和免疫检查点抑制剂相关不良事件 数字病理学 子宫内膜癌 单细胞RNA测序, 数据库分析 Weibull模型, 贝叶斯置信传播神经网络, 伽马泊松收缩器 单细胞转录组数据, 药物不良事件报告数据 从FAERS数据库中检索21,838,627份药物相关报告,其中2,202份与免疫检查点抑制剂相关 NA 单细胞RNA-seq NA NA
329 2025-10-06
Deciphering the cellular and molecular landscape of cervical cancer progression through single-cell and spatial transcriptomics
2025-May-28, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 通过单细胞和空间转录组学技术解析宫颈癌进展过程中的细胞和分子景观 整合单细胞RNA测序和空间转录组学方法,首次系统揭示SPP1+巨噬细胞通过SPP1-CD44信号轴在宫颈癌免疫抑制微环境中的关键作用 未明确说明样本数量和研究队列的多样性限制 全面表征宫颈癌进展过程中的肿瘤微环境动态变化 正常宫颈组织、HPV感染宫颈组织、高级别鳞状上皮内病变和浸润性宫颈癌组织样本 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
330 2025-10-06
Natural killer cells adopt an activated and decidual-like phenotype after autologous hematopoietic stem cell transplantation in children with cancer
2025-May-28, Communications medicine IF:5.4Q1
研究论文 本研究揭示了儿童癌症患者在自体造血干细胞移植后自然杀伤细胞呈现活化及蜕膜样表型的动态变化 首次在儿童自体造血干细胞移植后发现自然杀伤细胞获得短暂性蜕膜样表型,并阐明IL-15和TGF-β联合诱导这一独特表型的机制 样本量较小(13名儿童患者),缺乏长期随访数据 探究儿童癌症患者自体造血干细胞移植后自然杀伤细胞的动态功能变化 13名儿童癌症患者(3-11岁)及8名健康成人供者 免疫学 癌症 多参数流式细胞术,单细胞RNA测序,细胞因子检测 NA 流式细胞数据,单细胞转录组数据,血浆细胞因子数据 13名儿童患者,8名健康成人供者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
331 2025-10-06
ITIH4 attenuates acute lung injury by Fe-containing particulate matter in mice via Hippo pathway in type II alveolar epithelial cells
2025-May-28, Respiratory research IF:4.7Q1
研究论文 本研究探讨了ITIH4通过调节II型肺泡上皮细胞中的Hippo通路减轻含铁颗粒物诱导的小鼠急性肺损伤 首次揭示ITIH4通过调节II型肺泡上皮细胞中Hippo通路来减轻含铁颗粒物诱导的急性肺损伤 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证 探究ITIH4对含铁颗粒物诱导的急性肺损伤的保护作用及机制 C57BL/6JNarl和B6.Sftpc-CreERT2;Ai14(RCL-tdT)-D小鼠 呼吸系统疾病研究 急性肺损伤 单细胞RNA测序, ICP-MS, 单细胞ICP-MS NA 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞计数数据 小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
332 2025-10-06
AAV-mediated silencing of Sox4 leads to long-term amelioration of liver phenotypes in mouse models of Alagille syndrome
2025-May-28, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 本研究通过AAV介导的Sox4基因沉默,在小鼠Alagille综合征模型中实现了肝脏表型的长期改善 首次证明AAV介导的Sox4基因沉默可改善Alagille综合征肝脏表型,并发现Sox4/SOX4在患者肝脏中表达增加 研究基于小鼠模型,临床转化仍需进一步验证 寻找治疗Alagille综合征胆汁管缺乏的新治疗靶点 Alagille综合征小鼠模型和人类肝脏样本 基因治疗 Alagille综合征 单细胞RNA测序, RNAscope, 腺相关病毒介导的基因沉默 NA 基因表达数据, 组织学图像, 血清化学数据 临床前小鼠模型和人类肝脏样本 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
333 2025-10-06
Comparative analysis of the syncytiotrophoblast in placenta tissue and trophoblast organoids using snRNA sequencing
2025-May-27, eLife IF:6.4Q1
研究论文 通过单核RNA测序比较胎盘组织与滋养层类器官中合体滋养层的异质性 首次在合体滋养层中鉴定出三种核亚型,并建立滋养层类器官作为研究模型 RYBP敲除未影响细胞融合但导致基因表达改变,机制尚未完全阐明 解析合体滋养层分化过程及核异质性 人类胎盘组织和滋养层类器官 单细胞组学 胎盘发育 单核RNA测序,单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 早孕期胎盘、足月胎盘及滋养层类器官样本 NA 单核RNA-seq,单细胞RNA-seq NA NA
334 2025-10-06
Single cell RNA sequencing reveals the role of local renin-angiotensin system in regulating ovarian physiological cycle and promoting PCOS
2025-May-27, Cell death discovery IF:6.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示卵巢局部肾素-血管紧张素系统在调节生理周期和促进多囊卵巢综合征中的作用机制 首次在单细胞水平揭示卵巢局部RAS在发情周期中的动态变化,并发现AngII与IRS1/PI3K/AKT通路串扰导致胰岛素抵抗的潜在机制 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 探究卵巢局部肾素-血管紧张素系统在生理周期和PCOS发病机制中的作用 小鼠卵巢细胞 单细胞组学 多囊卵巢综合征 单细胞RNA测序 PCOS小鼠模型 单细胞转录组数据 小鼠卵巢单细胞数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
335 2025-10-06
Deep exploration of logical models of cell differentiation in human preimplantation embryos
2025-May-27, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1
研究论文 开发了SCIBORG计算工具,通过整合单细胞转录组数据和先验知识网络来推断基因调控的布尔网络模型 提出SCIBORG方法,使用逻辑编程处理单细胞数据高维搜索空间,无需扰动数据即可构建动态布尔网络模型 模型验证仅通过计算机模拟进行,细胞分类准确率为67%-73%,缺乏实验验证 模拟人类胚胎植入前滋养外胚层细胞分化过程中的基因调控网络 人类胚胎植入前滋养外胚层细胞 计算生物学 NA 单细胞转录组测序,布尔网络建模,逻辑编程 布尔网络 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
336 2025-10-06
Novel ribosome biogenesis-related biomarkers and therapeutic targets identified in psoriasis
2025-May-27, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究通过生物信息学分析鉴定出11个与核糖体生物合成相关的银屑病生物标志物,并验证了MPHOSPH6和ISG20的潜在治疗价值 首次系统性地将核糖体生物合成过程与银屑病发病机制联系起来,并通过多组学数据分析鉴定出关键生物标志物 研究主要基于生物信息学分析,实验验证相对有限,需要进一步的功能性研究确认机制 探索核糖体生物合成在银屑病发病机制中的作用,并寻找新的生物标志物和治疗靶点 银屑病患者转录组数据 生物信息学 银屑病 转录组测序,单细胞RNA测序,差异表达分析,加权基因共表达网络分析,蛋白质相互作用分析,分子对接 NA 转录组数据,单细胞RNA测序数据 来自GEO数据库的多个数据集 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
337 2025-10-06
A robust multi-scale clustering framework for single-cell RNA-seq data analysis
2025-May-27, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 提出一种用于单细胞RNA测序数据分析的鲁棒多尺度聚类框架 结合多维PCA降维、K-means聚类和加权集成元聚类方法,并通过自注意力驱动的Transformer模型优化聚类性能 NA 解决单细胞RNA测序数据高维度、稀疏性和噪声带来的聚类挑战 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 Transformer, K-means, PCA 基因表达数据 八个单细胞RNA测序数据集(包括PBMC5k数据集) NA 单细胞RNA-seq NA NA
338 2025-10-06
Optimized culturing yields high success rates and preserves molecular heterogeneity, enabling personalized screening for high-grade gliomas
2025-May-27, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 开发了一种优化的高级别胶质瘤细胞培养方案,显著提高培养成功率并保留肿瘤分子异质性 结合超声抽吸和3D组织片段培养方法,实现96%的高成功率,并首次证明超声抽吸来源的培养物具有更高转录组异质性 研究样本数量有限(114例),且仅针对高级别胶质瘤 建立可靠的患者来源胶质瘤细胞培养模型以支持精准医疗 高级别胶质瘤患者手术标本 数字病理 脑癌 单细胞测序,拷贝数分析 细胞培养模型 基因组数据,转录组数据 114例高级别胶质瘤标本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
339 2025-10-06
Ligustrazine nano-drug delivery system ameliorates doxorubicin-mediated myocardial injury via piezo-type mechanosensitive ion channel component 1-prohibitin 2-mediated mitochondrial quality surveillance
2025-May-27, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 本研究开发了川芎嗪纳米递送系统,通过PIEZO1-TMBIM6调控PHB2磷酸化轴改善阿霉素诱导的心肌损伤 首次发现川芎嗪纳米递送系统通过PIEZO1-TMBIM6-PHB2Ser91/Ser176磷酸化轴调控线粒体质量监测的新机制 NA 探究川芎嗪纳米递送系统改善阿霉素心肌损伤的作用机制 基因修饰小鼠模型、阿霉素诱导的心肌病体内外模型 NA 心肌病 单细胞测序、分子生物学、整合药理学 NA NA NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
340 2025-10-06
Semaglultide targets Spp1+ microglia/macrophage to attenuate neuroinflammation following perioperative stroke
2025-May-27, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现围手术期缺血性脑卒中中存在独特的Spp1阳性巨噬细胞/小胶质细胞亚群,并证明索马鲁肽可通过靶向该细胞亚群减轻神经炎症 首次在围手术期缺血性脑卒中模型中鉴定出具有抗炎特性和脂质代谢重编程特征的Spp1阳性巨噬细胞/小胶质细胞亚群,并发现GLP1R激动剂索马鲁肽可上调该保护性细胞亚群 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类患者中验证;观察时间较短(仅至术后3天) 探究围手术期缺血性脑卒中中神经免疫反应的机制及索马鲁肽的治疗潜力 围手术期缺血性脑卒中模型小鼠的脑组织免疫细胞 神经科学 缺血性脑卒中 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色, 高参数流式细胞术, RNA测序 NA 单细胞转录组数据, 流式细胞数据, 免疫荧光图像 围手术期缺血性脑卒中模型小鼠 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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