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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2025-10-06 |
Correction: Desterke et al. Single-Cell RNA-Seq Analysis Links DNMT3B and PFKFB4 Transcriptional Profiles with Metastatic Traits in Hepatoblastoma. Biomolecules 2024, 14, 1394
2025-May-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15060769
PMID:40563546
|
更正 | 对已发表论文中错误的修正说明 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 302 | 2025-10-06 |
Multi-Transcriptomic Analysis Reveals GSC-Driven MES-Like Differentiation via EMT in GBM Cell-Cell Communication
2025-May-26, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13061304
PMID:40564022
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研究论文 | 通过多转录组分析揭示胶质母细胞瘤中胶质瘤干细胞通过EMT驱动间充质样分化的细胞间通讯模式 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组数据系统分析GSC通过EMT介导的细胞通讯机制 | 研究主要基于生物信息学分析,需要实验验证EMT通路在GSC分化中的具体作用机制 | 探索胶质母细胞瘤中胶质瘤干细胞的细胞间通讯模式及其对肿瘤进展的影响 | 胶质母细胞瘤中的胶质瘤干细胞及其他肿瘤细胞 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组,基因集富集分析 | CellChat, ssGSEA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组 | NA | NA |
| 303 | 2025-10-06 |
Evaluation of the Effects of the Quaternary Ammonium Silane K21 on Zebrafish Viability, Toxicity, Growth, and Development
2025-May-22, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13061267
PMID:40563986
|
研究论文 | 评估季铵硅烷K21对斑马鱼存活率、毒性、生长和发育的影响 | 首次系统评估K21在斑马鱼多代发育中的生物学效应,并发现其可能激活新的生长加速通路 | 研究主要基于斑马鱼模型,在人类应用中的效果仍需进一步验证 | 探索K21分子在人类健康保护和疾病防治中的潜在应用 | 野生型、Casper透明皮肤突变型和转基因斑马鱼品系,以及卤虫 | 毒理学与发育生物学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序,连续稀释法,急性和慢性暴露研究 | NA | 基因表达数据,发育表型数据 | 多个发育阶段(胚胎、幼虫、幼鱼、成鱼)的斑马鱼和卤虫样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 304 | 2025-10-06 |
Mapping Inherited Genetic Variation with Opposite Effects on Autoimmune Disease and Four Cancer Types Identifies Candidate Drug Targets Associated with the Anti-Tumor Immune Response
2025-May-14, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16050575
PMID:40428397
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研究论文 | 通过基因组关联研究识别对自身免疫疾病和癌症具有相反效应的遗传变异,发现潜在的癌症免疫治疗靶点 | 首次系统性地识别对自身免疫疾病和四种癌症类型具有相反效应的遗传变异,并验证其作为免疫治疗靶点的潜力 | 研究局限于四种特定癌症类型和七种自身免疫疾病,需要进一步实验验证 | 识别具有相反效应于自身免疫疾病和癌症的遗传变异,发现新的癌症免疫治疗靶点 | 乳腺癌、前列腺癌、卵巢癌和子宫内膜癌患者(240,540例)及自身免疫疾病患者(112,631例)的基因组数据 | 基因组学 | 多种癌症和自身免疫疾病 | GWAS, 元分析, RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, eQTL分析 | 固定效应元分析, 连锁不平衡聚类 | 基因组关联数据, 转录组数据 | 240,540例癌症患者/317,000例对照, 112,631例自身免疫疾病患者/895,386例对照 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 305 | 2025-10-06 |
Integrative single-cell RNA sequencing and mendelian randomization analysis reveal the potential role of synaptic vesicle cycling-related genes in Alzheimer's disease
2025-May, The journal of prevention of Alzheimer's disease
DOI:10.1016/j.tjpad.2025.100097
PMID:40021385
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,揭示了突触小泡循环相关基因在阿尔茨海默病中的潜在作用 | 首次结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析识别出四个突触小泡循环相关基因作为AD的保护因子 | 研究数据完全来源于公共数据库,缺乏实验验证 | 探索突触小泡循环相关基因在阿尔茨海默病中的潜在作用机制 | 阿尔茨海默病患者和健康个体的基因表达数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 差异表达分析 | 列线图 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 306 | 2025-10-06 |
Candidate Biomarkers for Hard-to-Heal Wounds Revealed by Single-Cell RNA Sequencing of Wound Fluid in Murine Wound Models
2025 May-Jun, Wound repair and regeneration : official publication of the Wound Healing Society [and] the European Tissue Repair Society
IF:3.8Q1
DOI:10.1111/wrr.70038
PMID:40444294
|
研究论文 | 通过小鼠伤口模型中伤口液的单细胞RNA测序揭示难愈合伤口的候选生物标志物 | 首次使用伤口液细胞进行单细胞RNA测序分析,识别不同延迟愈合伤口模型中的共同生物标志物 | 样本收集困难,研究仅限于小鼠模型,尚未在临床环境中验证 | 探索不依赖单一病理学的因素,填补当前伤口管理空白 | 小鼠伤口模型中的伤口液细胞 | 单细胞组学 | 伤口愈合障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三种代表性延迟伤口模型(老年、糖尿病和脂多糖诱导炎症模型)与正常年轻小鼠的比较 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 307 | 2025-10-06 |
Targeting BATF2-RGS2 axis reduces T-cell exhaustion and restores anti-tumor immunity
2025-May-30, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02351-5
PMID:40442751
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研究论文 | 本研究揭示BATF2-RGS2轴在调控T细胞耗竭和肿瘤免疫逃逸中的关键作用 | 首次发现BATF2通过转录调控RGS2驱动T细胞耗竭,并证明靶向该轴可增强抗肿瘤免疫 | 样本量较小(6例患者),主要基于小鼠模型,临床转化需进一步验证 | 探究RGS2在肺癌免疫调控中的作用及BATF2-RGS2轴的调控机制 | 肺癌患者样本、小鼠模型、CD8+ T细胞、3LL癌细胞 | 免疫学 | 肺癌 | 单细胞转录组分析、荧光素酶报告基因检测、体外共培养 | 基因敲除小鼠模型、肿瘤类器官模型 | 转录组数据、细胞实验数据 | 6例肺癌患者,多种基因型小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 308 | 2025-10-06 |
Identification of Synovial Lymphatics in the TMJ and their Roles in Arthritis and Pain
2025-May-30, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6683299/v1
PMID:40502768
|
研究论文 | 本研究首次发现颞下颌关节中存在滑膜淋巴管,并揭示其在关节炎和疼痛中的作用机制 | 首次在颞下颌关节中鉴定出滑膜淋巴系统,并证明淋巴功能障碍会驱动关节炎和疼痛的发生 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究颞下颌关节滑膜淋巴系统的存在及其在关节炎和疼痛中的作用 | 基因报告小鼠、人类组织样本 | 生物医学研究 | 颞下颌关节关节炎 | 基因报告技术、组织透明化、3D体积成像、功能遗传学、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 小鼠模型和人类组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 309 | 2025-10-06 |
Bridging Large Language Models and Single-Cell Transcriptomics in Dissecting Selective Motor Neuron Vulnerability
2025-May-12, ArXiv
PMID:40463696
|
研究论文 | 提出一个利用大语言模型和单细胞转录组学分析选择性运动神经元易损性的新框架 | 首次将基因特异性文本注释与单细胞RNA测序数据结合,通过表达加权平均生成生物学背景化的细胞嵌入表示 | NA | 解析选择性运动神经元易损性,改进细胞类型识别和功能分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 自然语言处理,计算生物学 | 运动神经元疾病 | 单细胞RNA测序 | 大语言模型,BioBERT,SciBERT | 文本,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 310 | 2025-10-06 |
Oligodendroglia vulnerability in the human dorsal striatum in Parkinson's disease
2025-05-05, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-025-02884-5
PMID:40323467
|
研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学揭示帕金森病患者背侧纹状体中少突胶质细胞的脆弱性 | 首次在人类帕金森病背侧纹状体中系统鉴定出15种少突胶质细胞亚类,其中4种为疾病特异性群体,并发现其热休克蛋白过表达、髓鞘形成异常和细胞通讯受损等特征 | 研究样本量未明确说明,仅提及分析了约20万个少突胶质细胞核 | 阐明帕金森病中少突胶质细胞的多样性及其在疾病中的变化 | 人类尾状核和壳核(背侧纹状体)组织样本 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 约200,000个少突胶质细胞核(来自帕金森病患者和对照脑组织捐赠者) | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 311 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals shared clonal signatures in nonmalignant B and tumor cells in T-prolymphocytic leukemia
2025-May, Blood neoplasia
DOI:10.1016/j.bneo.2025.100076
PMID:40453149
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示T细胞前淋巴细胞白血病中非恶性B细胞与肿瘤细胞共享的克隆特征 | 首次在单细胞水平证实T-PLL中非恶性B细胞与克隆性T细胞存在共享突变 | 样本量有限(16例患者),仅对9例患者获得复发样本 | 阐明T细胞前淋巴细胞白血病的克隆起源和进化动力学 | 16例T-PLL患者的非恶性细胞和肿瘤细胞 | 单细胞基因组学 | 白血病 | 靶向二代测序, 液滴数字PCR, 单细胞多组学分析 | NA | 基因组DNA, 细胞表面蛋白标记 | 16例T-PLL患者,其中9例有配对的诊断和复发样本 | Mission Bio | 单细胞多组学 | Tapestri Platform | Mission Bio Tapestri单细胞分析平台 |
| 312 | 2025-10-06 |
Multitissue single-cell analysis reveals differential cellular and molecular sensitivity between fructose and high-fat high-sucrose diets
2025-May-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115690
PMID:40349341
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研究论文 | 通过多组织单细胞分析比较果糖和高脂高糖饮食对代谢综合征的细胞和分子敏感性差异 | 首次在多组织水平系统比较不同饮食模式的细胞类型特异性反应,发现mt-Rnr2作为共同调节因子通过刺激产热缓解代谢综合征 | 研究仅基于小鼠模型,人类相关性需进一步验证 | 阐明不同饮食诱导代谢综合征的组织和细胞类型特异性作用机制 | 小鼠的下丘脑、肝脏、脂肪组织和小肠 | 单细胞组学 | 代谢综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个组织的小鼠样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 313 | 2025-10-06 |
Identification of core genes in acute kidney injury: evidence from multi-omics human transcriptomic data and in vivo models
2025-May-30, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2024-677
PMID:40529024
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研究论文 | 本研究通过整合多组学人类转录组数据和体内实验验证,识别了急性肾损伤的核心基因 | 首次将人类多组学数据与小鼠模型验证相结合,识别出SUGCT作为与肾小管线粒体代谢和免疫平衡相关的新型AKI核心基因 | 样本量相对有限(67例AKI患者和20例对照),需要在更大队列中进一步验证 | 识别急性肾损伤的核心基因并探索其机制 | 急性肾损伤患者和小鼠模型 | 生物信息学 | 急性肾损伤 | 转录组测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, RT-qPCR, Western blot, 免疫组织化学 | 列线图模型, WGCNA | 转录组数据, 基因表达数据 | 67例AKI患者和20例对照的人类样本,以及小鼠模型 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 314 | 2025-10-06 |
Development of a prognostic model for overall survival in neuroblastoma based on Schwann cell-specific genes, clinical predictors, and MYCN amplification
2025-May-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-2048
PMID:40530123
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研究论文 | 开发基于雪旺细胞特异性基因、临床预测因子和MYCN扩增的神经母细胞瘤总体生存预后模型 | 首次将肿瘤微环境中雪旺细胞特异性基因与临床因素和分子标志物整合构建神经母细胞瘤预后模型 | 样本量相对有限,训练集和测试集患者年龄分布存在差异 | 提高神经母细胞瘤总体生存预测准确性 | 神经母细胞瘤患者 | 生物信息学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,Cox回归分析 | 预后预测模型 | 基因表达数据,临床数据 | 训练集238例,测试集106例,单细胞数据16例患者(160,910个细胞) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 315 | 2025-10-06 |
Tolerance and heteroresistance to echinocandins in Candida auris: conceptual issues, clinical implications, and outstanding questions
2025-May-27, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00161-25
PMID:40237528
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综述 | 探讨耳念珠菌对棘白菌素的耐受性和异质性耐药现象及其临床意义 | 首次系统阐述耳念珠菌对棘白菌素的耐受性与异质性耐药概念差异及其临床关联 | 临床意义尚不明确,缺乏与治疗失败相关的数据支持 | 阐明耳念珠菌对棘白菌素的适应性耐药机制及其临床影响 | 耳念珠菌及其对棘白菌素的耐药表型 | 微生物耐药性研究 | 真菌感染 | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 316 | 2025-10-06 |
Efficient profiling of total RNA in single cells with STORM-seq
2025-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2022.03.14.484332
PMID:40475517
|
研究论文 | 开发了一种名为STORM-seq的单细胞总RNA测序技术,能够高效分析单细胞中的非编码转录本和全长RNA | 提出了首个使用随机六聚体引物和核糖体RNA去除的单细胞总RNA测序方案,无需专业液体处理设备即可构建迄今为止复杂度最高的单细胞RNA测序文库 | 未明确说明技术验证的样本规模和适用范围 | 开发更准确、易用的单细胞总RNA测序技术以解决现有方法的局限性 | 单细胞中的总RNA,包括非编码转录本、转座子元件和增强子RNA | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞总RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | STORM-seq | 基于随机六聚体引物的核糖体RNA去除单细胞总RNA测序方案 |
| 317 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome atlas of spontaneous dry age-related macular degeneration in macaques
2025-May, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2023.02.028
PMID:40528953
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研究论文 | 构建了老年非人灵长类自发性干性年龄相关性黄斑变性的单细胞视网膜转录图谱 | 首次在非人灵长类模型中建立SD-AMD的单细胞转录图谱,揭示了铁死亡在疾病发病机制中的新作用 | 研究基于非人灵长类模型,结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 | 阐明自发性干性年龄相关性黄斑变性的发病机制 | 老年非人灵长类(猕猴)的视网膜组织 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 老年猕猴视网膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 318 | 2025-10-06 |
Insulin-Degrading Enzyme Regulates mRNA Processing and May Interact with the CCR4-NOT Complex
2025-05-28, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14110792
PMID:40497968
|
研究论文 | 本研究探索胰岛素降解酶在mRNA处理和蛋白质稳态中的新功能 | 首次发现胰岛素降解酶与CCR4-NOT复合物相互作用,并提出其通过协调去腺苷酸化和蛋白酶功能调控蛋白质表达的新机制 | 提出的模型仍为推测性,需要进一步实验验证 | 阐明胰岛素降解酶在细胞生理和蛋白质稳态中的更广泛功能 | 人和小鼠胰岛细胞 | 分子生物学 | NA | 蛋白质组学,转录组学,单细胞转录组,邻近生物素化 | NA | 蛋白质组数据,转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 319 | 2025-10-06 |
Molecular Fingerprint of Endocannabinoid Signaling in the Developing Paraventricular Nucleus of the Hypothalamus as Revealed by Single-Cell RNA-Seq and In Situ Hybridization
2025-05-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14110788
PMID:40497964
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和原位杂交技术揭示了小鼠下丘脑室旁核发育过程中内源性大麻素信号传导的分子特征 | 首次在分子定义的神经元和星形胶质细胞中绘制了2-AG和AEA信号传导的时空图谱,发现了从Dagla到Daglb的发育转换 | 研究仅限于小鼠模型,且某些大麻素受体亚型的mRNA未能检测到 | 阐明下丘脑室旁核发育过程中内源性大麻素信号传导的纳米结构 | 小鼠胚胎期和出生后发育阶段的下丘脑室旁核神经元和星形胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 原位杂交, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 小鼠胚胎期和出生后发育阶段的脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 320 | 2025-10-06 |
The cGAS/STING Pathway: Friend or Foe in Regulating Cardiomyopathy
2025-05-25, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14110778
PMID:40497954
|
综述 | 本文系统探讨cGAS/STING信号通路在心肌病炎症调控中的双重作用及治疗潜力 | 整合单细胞RNA测序数据与系统文献综述,揭示cGAS/STING通路在心肌病中的调控机制和潜在治疗靶点 | cGAS/STING通路在心肌病中的具体分子机制仍不明确且存在争议,需未来研究验证 | 阐明cGAS/STING信号通路在心肌病炎症反应中的调控作用及治疗干预策略 | 心肌病相关的炎症机制和cGAS/STING信号通路 | 自然语言处理 | 心肌病 | 单细胞RNA测序, 文献综述 | NA | 文本数据, 测序数据 | 公开可用的人类单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |