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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2025-10-06 |
Systematic evaluation of single-cell RNA-seq analyses performance based on long-read sequencing platforms
2025-May, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.05.020
PMID:38782298
|
研究论文 | 系统评估基于长读长测序平台的单细胞RNA-seq分析性能 | 首次系统比较牛津纳米孔和PacBio长读长测序技术在单细胞RNA-seq分析中的性能表现 | 仅评估了两种长读长测序平台,未涵盖其他新兴技术 | 评估长读长测序平台在单细胞转录组分析中的性能表现 | 单细胞cDNA文库 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序, 长读长测序 | NA | 测序数据 | 不同细胞数量的单细胞cDNA文库 | Oxford Nanopore Technologies, Pacific Biosciences | 单细胞RNA-seq, 长读长测序 | ONT, PacBio | 第三代测序技术平台 |
| 302 | 2025-10-06 |
Sympathetic hyperinnervation drives abdominal aortic aneurysm development by promoting vascular smooth muscle cell phenotypic switching
2025-May, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.05.028
PMID:38821358
|
研究论文 | 本研究揭示了交感神经过度支配通过促进血管平滑肌细胞表型转换驱动腹主动脉瘤发展的机制 | 首次发现交感神经过度支配在腹主动脉瘤中的作用,并阐明其通过eATP-P2rx4-p38信号通路和破骨样细胞分泌Sema4D的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究交感神经过度支配在腹主动脉瘤发展中的作用及分子机制 | 小鼠腹主动脉瘤模型和腹主动脉瘤患者组织样本 | 分子病理学 | 腹主动脉瘤 | Western blotting, 免疫化学染色, 单细胞RNA测序, 转录组分析 | 基因敲除小鼠模型(Sema4D-/-) | 蛋白质印迹数据, 免疫染色图像, 单细胞转录组数据 | 小鼠模型和人类患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 303 | 2025-10-06 |
Comprehensive single-cell analysis deciphered the immunoregulatory mechanism of TPPU in alleviating sepsis-related acute liver injury
2025-May, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.02.018
PMID:39956402
|
研究论文 | 通过单细胞分析揭示TPPU通过调节巨噬细胞和中性粒细胞缓解脓毒症相关急性肝损伤的免疫调节机制 | 首次在单细胞分辨率下系统阐明sEH抑制剂TPPU通过促进抗炎性M2样巨噬细胞和CAMP+NGP+CD177+中性粒细胞扩增,并抑制CCL6-CCR1信号通路来改善脓毒症肝损伤 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探究TPPU在缓解脓毒症相关急性肝损伤中的免疫调节机制 | 脓毒症相关急性肝损伤小鼠模型 | 单细胞分析 | 脓毒症相关急性肝损伤 | 飞行时间流式细胞术,单细胞RNA测序,蛋白质组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,蛋白质组数据,流式细胞数据 | 小鼠肝组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,飞行时间流式细胞术 | NA | NA |
| 304 | 2025-10-06 |
Anoikis in hepatocellular carcinoma: genetic alterations and immune microenvironment insights from single-cell and computational analysis
2025-May-31, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02770-2
PMID:40447878
|
研究论文 | 通过单细胞测序和计算分析研究肝细胞癌中失巢凋亡的遗传改变和免疫微环境特征 | 首次结合单细胞测序和101种机器学习算法构建失巢凋亡相关预后模型,揭示KPNA2基因在肝癌中的致癌作用 | 研究样本量有限,主要依赖公共数据库数据,需要更多临床样本验证 | 分析肝细胞癌的细胞异质性并构建失巢凋亡相关预后模型 | 肝细胞癌患者样本和Hep-3B细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序, qPCR, shRNA基因敲除 | AUCell算法, Cox回归, 多种机器学习算法 | 单细胞测序数据, 基因表达数据, 临床样本 | 来自GEO、TCGA和ICGC数据库的多个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 305 | 2025-10-06 |
GSTM1 suppresses cardiac fibrosis post-myocardial infarction through inhibiting lipid peroxidation and ferroptosis
2025-May-31, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-025-00610-6
PMID:40448227
|
研究论文 | 本研究探讨了GSTM1通过抑制脂质过氧化和铁死亡来减轻心肌梗死后心脏纤维化的作用机制 | 首次发现GSTM1在心肌梗死后心脏成纤维细胞中表达下调,并通过调节脂质代谢和铁死亡通路抑制纤维化进程 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,在人类患者中的验证仍需进一步研究 | 探究GSTM1在心肌梗死后心脏纤维化中的作用及其分子机制 | 小鼠心脏成纤维细胞、人类扩张型心肌病患者心脏组织 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 蛋白质组学、单细胞RNA测序、Western blotting、免疫荧光、实时定量PCR、转录组学、脂质过氧化检测 | NA | 蛋白质数据、基因表达数据、细胞表型数据 | 小鼠冠状动脉结扎模型、人类扩张型心肌病患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq、蛋白质组学 | NA | NA |
| 306 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial transcriptome analyses reveal tumor heterogeneity and immune remodeling involved in pituitary neuroendocrine tumor progression
2025-May-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60028-5
PMID:40442104
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析揭示垂体神经内分泌肿瘤的异质性和免疫重塑机制 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学分析垂体神经内分泌肿瘤,识别了与肿瘤进展相关的侵袭性肿瘤亚群和SPP1+肿瘤相关巨噬细胞的作用机制 | 样本量相对有限(57个组织样本),机制研究需要进一步实验验证 | 探索垂体神经内分泌肿瘤进展和侵袭的分子机制 | 垂体神经内分泌肿瘤(PitNETs)组织和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 57个组织样本,超过177,000个细胞和35,000个spots | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 307 | 2025-10-06 |
Identification of predictors for bacterial meningitis diagnosis based on transcriptomics and genetic analysis
2025-May-30, AMB Express
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s13568-025-01893-7
PMID:40445403
|
研究论文 | 本研究通过转录组学和遗传分析识别细菌性脑膜炎的诊断预测因子 | 首次通过整合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和伪时间分析等方法,系统识别了RNF144B和FYN作为细菌性脑膜炎的潜在生物标志物 | 研究样本量有限,需要在更大队列中验证生物标志物的临床适用性 | 改善细菌性脑膜炎的诊断和治疗策略 | 细菌性脑膜炎患者的免疫相关基因和免疫细胞 | 生物信息学 | 细菌性脑膜炎 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 差异基因表达分析, 共表达网络分析, 基因集富集分析, 伪时间分析 | NA | 转录组数据, 遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 308 | 2025-10-06 |
Development of an immune scoring system based on exosome-related gene expression for prognosis and treatment response prediction in breast cancer
2025-May-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02702-0
PMID:40445462
|
研究论文 | 基于外泌体相关基因表达开发免疫评分系统,用于乳腺癌预后和治疗反应预测 | 首次将外泌体相关基因与免疫评分系统结合,建立了新的乳腺癌预后预测模型 | 研究基于回顾性数据,需要前瞻性研究进一步验证 | 开发基于外泌体相关基因的免疫评分系统,预测乳腺癌预后和治疗反应 | 乳腺癌患者及其基因表达数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, qPCR, 免疫印迹 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 多个数据集的乳腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 309 | 2025-10-06 |
TCF7 enhances pulmonary hypertension by boosting stressed natural killer cells and their interaction with pulmonary arterial smooth muscle cells
2025-May-29, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03276-9
PMID:40442690
|
研究论文 | 本研究揭示TCF7通过增强应激自然杀伤细胞及其与肺动脉平滑肌细胞的相互作用加剧肺动脉高压 | 首次发现TCF7在应激NK细胞中的关键作用及其通过SPP1分泌促进肺动脉平滑肌细胞增殖迁移的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞系,人类样本验证仍需进一步开展 | 探究自然杀伤细胞在肺动脉高压中的作用机制及TCF7的调控功能 | 人类PAH患者、MCT诱导PH大鼠模型、Tcf7条件性敲除小鼠、NK92细胞系和原代人肺动脉平滑肌细胞 | 单细胞生物学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, 基因敲除, 病毒载体过表达, 细胞培养 | 动物模型, 细胞模型 | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 | 人类PAH患者和PH大鼠肺组织单细胞数据, 多种基因工程动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 310 | 2025-10-06 |
Atherosclerosis enhances the efficacy of liposome-encapsulated bromocriptine in reducing the incidence of prolactinemia in pituitary tumors
2025-May-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03465-0
PMID:40442804
|
研究论文 | 本研究探讨动脉粥样硬化如何增强脂质体包裹溴隐亭对垂体泌乳素瘤伴高泌乳素血症的治疗效果 | 首次报道利用动脉粥样硬化小鼠模型中血脑屏障改变增强纳米颗粒介导的溴隐亭递送至下丘脑的策略 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探索动脉粥样硬化对纳米载体药物递送效率的影响及其在泌乳素瘤治疗中的应用 | 垂体泌乳素瘤伴高泌乳素血症患者和动脉粥样硬化小鼠模型 | NA | 垂体肿瘤/泌乳素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、药物浓度数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 311 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the role of GTF2F2 in ovarian cancer oncogenesis and progression
2025-May-29, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-025-01686-3
PMID:40442848
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了卵巢癌恶性上皮细胞的异质性,并构建了基于UBE2C+上皮亚群的风险评分模型 | 首次识别出三种主要恶性上皮细胞亚群,发现UBE2C+Epi亚群具有更高干性和侵袭性,并验证了GTF2F2基因在卵巢癌进展中的关键作用 | 研究仅使用ES-2卵巢癌细胞系进行验证,样本来源和数量有限 | 探究卵巢癌恶性上皮细胞的异质性及其在治疗和预后中的意义 | 卵巢癌恶性上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,拷贝数变异分析,细胞间通讯分析,基因敲低实验,Western blot | LASSO回归,多变量Cox回归 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 312 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal the pathogenesis of chronic granulomatous disease in a natural model
2025-May-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115612
PMID:40272982
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示慢性肉芽肿病在自然模型中的发病机制 | 通过环境控制建立自然CGD模型,发现促炎性NOS2中性粒细胞和促纤维化MMP12巨噬细胞在肉芽肿形成中的空间分布特征 | 研究仅限于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明慢性肉芽肿病中肉芽肿形成的分子机制 | Ncf2基因缺陷小鼠的肺组织 | 数字病理学 | 慢性肉芽肿病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,空间定位数据 | Ncf2缺陷小鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 313 | 2025-10-06 |
Universal fibroblasts across tissues can differentiate into niche cells for hematopoietic stem cells
2025-May-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115620
PMID:40315055
|
研究论文 | 本研究证明存在于多种组织中的通用成纤维细胞能够分化为具有造血干细胞维持功能的骨髓CAR/LepR生态位细胞 | 首次提供直接证据表明骨骼系统外的通用成纤维细胞能够分化为骨髓特异性造血干细胞生态位细胞 | NA | 探究通用成纤维细胞分化为造血干细胞生态位细胞的潜能 | CD248通用成纤维细胞、造血干细胞、CAR/LepR生态位细胞 | 单细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 314 | 2025-10-06 |
Fitness and transcriptional plasticity of human breast cancer single-cell-derived clones
2025-May-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115699
PMID:40359107
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术结合细胞条形码,系统分析了人类乳腺癌单细胞衍生克隆的适应性与转录可塑性 | 首次将细胞条形码与单细胞RNA测序结合,直接关联单细胞转录组与体内克隆生长特性 | 研究仅基于26个患者来源的乳腺癌异种移植模型,样本来源相对有限 | 探索乳腺癌克隆适应性与转录可塑性的分子机制 | 人类乳腺癌单细胞衍生克隆 | 单细胞生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 慢病毒细胞条形码 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 26个患者来源的乳腺癌异种移植模型,110个异种移植样本,20,000多个单细胞衍生克隆,167,375个单细胞RNA谱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 315 | 2025-10-06 |
Time-resolved single-cell atlas identifies the spatiotemporal transcription dynamics in vernalization response in Brassica rapa
2025-May-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115725
PMID:40378040
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了芸苔属植物春化过程中时空转录动态特征 | 首次在单细胞水平解析芸苔春化反应的时空转录动态,发现叶肉细胞对低温响应最显著,并揭示春化通过数字细胞响应的定量调控机制 | 研究仅针对芸苔属植物,其他温带植物的春化机制可能有所不同 | 探究春化过程中单细胞水平的基因表达动态和时空调控机制 | 芸苔属植物(Brassica rapa) | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 316 | 2025-10-06 |
AI-Assisted Hypothesis Generation to Address Challenges in Cardiotoxicity Research: Simulation Study Using ChatGPT With GPT-4o
2025-May-15, Journal of medical Internet research
IF:5.8Q1
DOI:10.2196/66161
PMID:40373295
|
研究论文 | 本研究探索ChatGPT与GPT-4o在生成心脏毒性研究创新假设方面的能力 | 首次系统评估AI模型在心脏毒性研究领域生成创新假设的潜力 | 实验设计常被认为过于理想化,需要更多实际考量 | 探索AI辅助假设生成在解决心脏毒性研究挑战中的应用 | 心脏毒性研究的五大挑战:机制复杂性、患者变异性、检测灵敏度不足、可靠生物标志物缺乏、动物模型局限性 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | AI辅助假设生成,文献检索验证 | GPT-4o | 文本 | 96个生成假设,其中5个被选为最有前景的假设 | OpenAI | 大型语言模型 | ChatGPT | GPT-4o模型 |
| 317 | 2025-10-06 |
Co-targeting of epigenetic regulators and BCL-XL improves efficacy of immune checkpoint blockade therapy in multiple solid tumors
2025-May-30, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02352-4
PMID:40442785
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研究论文 | 本研究开发了一种联合表观遗传调节剂、BCL-XL抑制剂和免疫检查点阻断的三联疗法,在多种实体瘤模型中显示出显著抗肿瘤效果 | 发现实体瘤对表观遗传药物与BCL-XL抑制剂的联合治疗具有独特依赖性,并首次将这种组合与免疫检查点阻断联合应用 | 研究主要基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探索表观遗传调节剂与促凋亡药物联合治疗在实体瘤中的疗效机制 | 人类和小鼠实体瘤细胞系,包括肺癌、结直肠癌、乳腺癌、黑色素瘤和胶质母细胞瘤 | 肿瘤免疫学 | 多种实体瘤 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 大量来自患者和小鼠模型的实体瘤细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 318 | 2025-10-06 |
Mendelian randomization reveals limited causal effects of genetic variants on cervical cancer risk: insights from immune cell populations
2025-May-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02819-2
PMID:40439950
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研究论文 | 通过孟德尔随机化方法评估免疫细胞相关遗传变异与宫颈癌风险的因果关系 | 首次系统评估免疫细胞亚群遗传变异对宫颈癌风险的因果效应 | 仅发现弱相关性,遗传效应有限 | 探究免疫细胞遗传变异与宫颈癌风险的因果关系 | 宫颈癌患者和免疫细胞亚群 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序 | 逆方差加权, MR-Egger, 简单中位数, 加权中位数 | 遗传数据, 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 319 | 2025-10-06 |
Identification of novel therapeutic targets in hepatitis-B virus-associated membranous nephropathy using scRNA-seq and machine learning
2025-May-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-03625-0
PMID:40442195
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习识别了乙型肝炎病毒相关膜性肾病中的新型治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序和机器学习方法揭示miR-223-3p通过调控CRIM1表达在HBV-MN发病机制中的关键作用 | NA | 阐明miR-223-3p和CRIM1在乙型肝炎病毒相关膜性肾病中的分子机制 | 乙型肝炎病毒相关膜性肾病患者的足细胞 | 机器学习 | 乙型肝炎病毒相关膜性肾病 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 双荧光素酶报告基因检测 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 320 | 2025-10-06 |
Disulfide bond-related gene signature development for bladder cancer prognosis prediction and immune microenvironment characterization
2025-May-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-03974-w
PMID:40442298
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研究论文 | 开发基于二硫键相关基因特征的膀胱癌预后预测模型并表征免疫微环境特征 | 首次构建二硫键相关预后特征模型,整合十种机器学习算法,通过单细胞RNA测序揭示细胞亚型特异性表达模式 | NA | 开发膀胱癌预后预测模型并分析免疫微环境特征 | 膀胱癌患者和膀胱癌细胞系 | 机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR | StepCox[backward]算法 | 基因表达数据 | TCGA和GEO队列数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |