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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2025-10-06 |
TCF7 enhances pulmonary hypertension by boosting stressed natural killer cells and their interaction with pulmonary arterial smooth muscle cells
2025-May-29, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03276-9
PMID:40442690
|
研究论文 | 本研究揭示TCF7通过增强应激自然杀伤细胞及其与肺动脉平滑肌细胞的相互作用加剧肺动脉高压 | 首次发现TCF7在应激NK细胞中的关键作用及其通过SPP1分泌促进肺动脉平滑肌细胞增殖迁移的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞系,人类样本验证仍需进一步开展 | 探究自然杀伤细胞在肺动脉高压中的作用机制及TCF7的调控功能 | 人类PAH患者、MCT诱导PH大鼠模型、Tcf7条件性敲除小鼠、NK92细胞系和原代人肺动脉平滑肌细胞 | 单细胞生物学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, 基因敲除, 病毒载体过表达, 细胞培养 | 动物模型, 细胞模型 | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 蛋白质数据 | 人类PAH患者和PH大鼠肺组织单细胞数据, 多种基因工程动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 302 | 2025-10-06 |
Atherosclerosis enhances the efficacy of liposome-encapsulated bromocriptine in reducing the incidence of prolactinemia in pituitary tumors
2025-May-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03465-0
PMID:40442804
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研究论文 | 本研究探讨动脉粥样硬化如何增强脂质体包裹溴隐亭对垂体泌乳素瘤伴高泌乳素血症的治疗效果 | 首次报道利用动脉粥样硬化小鼠模型中血脑屏障改变增强纳米颗粒介导的溴隐亭递送至下丘脑的策略 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探索动脉粥样硬化对纳米载体药物递送效率的影响及其在泌乳素瘤治疗中的应用 | 垂体泌乳素瘤伴高泌乳素血症患者和动脉粥样硬化小鼠模型 | NA | 垂体肿瘤/泌乳素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、药物浓度数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 303 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals the role of GTF2F2 in ovarian cancer oncogenesis and progression
2025-May-29, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-025-01686-3
PMID:40442848
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了卵巢癌恶性上皮细胞的异质性,并构建了基于UBE2C+上皮亚群的风险评分模型 | 首次识别出三种主要恶性上皮细胞亚群,发现UBE2C+Epi亚群具有更高干性和侵袭性,并验证了GTF2F2基因在卵巢癌进展中的关键作用 | 研究仅使用ES-2卵巢癌细胞系进行验证,样本来源和数量有限 | 探究卵巢癌恶性上皮细胞的异质性及其在治疗和预后中的意义 | 卵巢癌恶性上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,拷贝数变异分析,细胞间通讯分析,基因敲低实验,Western blot | LASSO回归,多变量Cox回归 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 304 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal the pathogenesis of chronic granulomatous disease in a natural model
2025-May-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115612
PMID:40272982
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示慢性肉芽肿病在自然模型中的发病机制 | 通过环境控制建立自然CGD模型,发现促炎性NOS2中性粒细胞和促纤维化MMP12巨噬细胞在肉芽肿形成中的空间分布特征 | 研究仅限于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明慢性肉芽肿病中肉芽肿形成的分子机制 | Ncf2基因缺陷小鼠的肺组织 | 数字病理学 | 慢性肉芽肿病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,空间定位数据 | Ncf2缺陷小鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 305 | 2025-10-06 |
Universal fibroblasts across tissues can differentiate into niche cells for hematopoietic stem cells
2025-May-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115620
PMID:40315055
|
研究论文 | 本研究证明存在于多种组织中的通用成纤维细胞能够分化为具有造血干细胞维持功能的骨髓CAR/LepR生态位细胞 | 首次提供直接证据表明骨骼系统外的通用成纤维细胞能够分化为骨髓特异性造血干细胞生态位细胞 | NA | 探究通用成纤维细胞分化为造血干细胞生态位细胞的潜能 | CD248通用成纤维细胞、造血干细胞、CAR/LepR生态位细胞 | 单细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 306 | 2025-10-06 |
Fitness and transcriptional plasticity of human breast cancer single-cell-derived clones
2025-May-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115699
PMID:40359107
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术结合细胞条形码,系统分析了人类乳腺癌单细胞衍生克隆的适应性与转录可塑性 | 首次将细胞条形码与单细胞RNA测序结合,直接关联单细胞转录组与体内克隆生长特性 | 研究仅基于26个患者来源的乳腺癌异种移植模型,样本来源相对有限 | 探索乳腺癌克隆适应性与转录可塑性的分子机制 | 人类乳腺癌单细胞衍生克隆 | 单细胞生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 慢病毒细胞条形码 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 26个患者来源的乳腺癌异种移植模型,110个异种移植样本,20,000多个单细胞衍生克隆,167,375个单细胞RNA谱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 307 | 2025-10-06 |
Time-resolved single-cell atlas identifies the spatiotemporal transcription dynamics in vernalization response in Brassica rapa
2025-May-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115725
PMID:40378040
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了芸苔属植物春化过程中时空转录动态特征 | 首次在单细胞水平解析芸苔春化反应的时空转录动态,发现叶肉细胞对低温响应最显著,并揭示春化通过数字细胞响应的定量调控机制 | 研究仅针对芸苔属植物,其他温带植物的春化机制可能有所不同 | 探究春化过程中单细胞水平的基因表达动态和时空调控机制 | 芸苔属植物(Brassica rapa) | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 308 | 2025-10-06 |
The impact of breast radiotherapy on the tumor genome and immune ecosystem
2025-May-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115703
PMID:40378044
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术探索放疗对乳腺癌肿瘤基因组和免疫微环境的影响 | 首次在雌激素受体阳性乳腺癌患者中结合单细胞DNA和RNA测序,系统分析放疗前后肿瘤基因组和免疫细胞群的动态变化 | 样本量较小(20例患者),仅分析了放疗后7天的短期效应 | 阐明放疗如何调节乳腺癌肿瘤微环境 | 20例雌激素受体阳性乳腺癌患者接受新辅助放疗前后的肿瘤活检样本 | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞DNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 20例患者,放疗前后配对样本 | NA | 单细胞DNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 309 | 2025-10-06 |
AI-Assisted Hypothesis Generation to Address Challenges in Cardiotoxicity Research: Simulation Study Using ChatGPT With GPT-4o
2025-May-15, Journal of medical Internet research
IF:5.8Q1
DOI:10.2196/66161
PMID:40373295
|
研究论文 | 本研究探索ChatGPT与GPT-4o在生成心脏毒性研究创新假设方面的能力 | 首次系统评估AI模型在心脏毒性研究领域生成创新假设的潜力 | 实验设计常被认为过于理想化,需要更多实际考量 | 探索AI辅助假设生成在解决心脏毒性研究挑战中的应用 | 心脏毒性研究的五大挑战:机制复杂性、患者变异性、检测灵敏度不足、可靠生物标志物缺乏、动物模型局限性 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | AI辅助假设生成,文献检索验证 | GPT-4o | 文本 | 96个生成假设,其中5个被选为最有前景的假设 | OpenAI | 大型语言模型 | ChatGPT | GPT-4o模型 |
| 310 | 2025-10-06 |
Co-targeting of epigenetic regulators and BCL-XL improves efficacy of immune checkpoint blockade therapy in multiple solid tumors
2025-May-30, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02352-4
PMID:40442785
|
研究论文 | 本研究开发了一种联合表观遗传调节剂、BCL-XL抑制剂和免疫检查点阻断的三联疗法,在多种实体瘤模型中显示出显著抗肿瘤效果 | 发现实体瘤对表观遗传药物与BCL-XL抑制剂的联合治疗具有独特依赖性,并首次将这种组合与免疫检查点阻断联合应用 | 研究主要基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探索表观遗传调节剂与促凋亡药物联合治疗在实体瘤中的疗效机制 | 人类和小鼠实体瘤细胞系,包括肺癌、结直肠癌、乳腺癌、黑色素瘤和胶质母细胞瘤 | 肿瘤免疫学 | 多种实体瘤 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 大量来自患者和小鼠模型的实体瘤细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 311 | 2025-10-06 |
Mendelian randomization reveals limited causal effects of genetic variants on cervical cancer risk: insights from immune cell populations
2025-May-29, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02819-2
PMID:40439950
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化方法评估免疫细胞相关遗传变异与宫颈癌风险的因果关系 | 首次系统评估免疫细胞亚群遗传变异对宫颈癌风险的因果效应 | 仅发现弱相关性,遗传效应有限 | 探究免疫细胞遗传变异与宫颈癌风险的因果关系 | 宫颈癌患者和免疫细胞亚群 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序 | 逆方差加权, MR-Egger, 简单中位数, 加权中位数 | 遗传数据, 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 312 | 2025-10-06 |
Identification of novel therapeutic targets in hepatitis-B virus-associated membranous nephropathy using scRNA-seq and machine learning
2025-May-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-03625-0
PMID:40442195
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习识别了乙型肝炎病毒相关膜性肾病中的新型治疗靶点 | 首次结合单细胞RNA测序和机器学习方法揭示miR-223-3p通过调控CRIM1表达在HBV-MN发病机制中的关键作用 | NA | 阐明miR-223-3p和CRIM1在乙型肝炎病毒相关膜性肾病中的分子机制 | 乙型肝炎病毒相关膜性肾病患者的足细胞 | 机器学习 | 乙型肝炎病毒相关膜性肾病 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 双荧光素酶报告基因检测 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 313 | 2025-10-06 |
Disulfide bond-related gene signature development for bladder cancer prognosis prediction and immune microenvironment characterization
2025-May-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-03974-w
PMID:40442298
|
研究论文 | 开发基于二硫键相关基因特征的膀胱癌预后预测模型并表征免疫微环境特征 | 首次构建二硫键相关预后特征模型,整合十种机器学习算法,通过单细胞RNA测序揭示细胞亚型特异性表达模式 | NA | 开发膀胱癌预后预测模型并分析免疫微环境特征 | 膀胱癌患者和膀胱癌细胞系 | 机器学习 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR | StepCox[backward]算法 | 基因表达数据 | TCGA和GEO队列数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 314 | 2025-10-06 |
Elucidating the Prognostic and Therapeutic Implications of Insulin Resistance Genes in Breast Cancer: A Machine Learning-Powered Analysis
2025-May-13, Biology
DOI:10.3390/biology14050539
PMID:40427728
|
研究论文 | 本研究利用机器学习算法构建基于胰岛素抵抗相关基因的乳腺癌预后模型 | 首次开发基于七个胰岛素抵抗枢纽基因的预后特征,并在多个独立队列中验证其预测能力 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步前瞻性研究验证 | 阐明胰岛素抵抗基因在乳腺癌中的预后和治疗意义 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,机器学习算法 | 机器学习预后模型 | 基因表达数据 | METABRIC和三个GSE数据集的多队列验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 315 | 2025-10-06 |
Molecular and Biophysical Perspectives on Dormancy Breaking: Lessons from Yeast Spore
2025-May-11, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15050701
PMID:40427594
|
综述 | 本文系统总结了酵母孢子休眠与复苏的分子机制和生物物理特性 | 整合单细胞RNA测序、蛋白质组学和活细胞成像等多学科方法,揭示细胞质流动性在休眠调控中的新作用 | 主要基于酵母模型的研究发现,在其他生物系统中的普适性仍需验证 | 阐明细胞休眠状态与增殖状态转换的分子和生物物理机制 | 酵母孢子及其他休眠生物系统 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学分析, 活细胞成像 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 316 | 2025-10-06 |
Evaluation of out-of-distribution detection methods for data shifts in single-cell transcriptomics
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf239
PMID:40439669
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研究论文 | 评估六种分布外检测方法在单细胞转录组学数据偏移中的表现 | 首次将计算机视觉领域的分布外检测方法应用于单细胞转录组学中的新细胞类型识别和数据偏移检测 | 仅评估了六种OOD方法,未涵盖所有可能的检测方法 | 提高单细胞转录组学中细胞类型自动注释的准确性和可靠性 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | LogitNorm, MC dropout, Deep Ensembles, Energy-based OOD, Deep NN, Posterior networks | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 317 | 2025-10-06 |
scaLR: a low-resource deep neural network-based platform for single cell analysis and biomarker discovery
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf243
PMID:40439670
|
研究论文 | 开发了一个名为scaLR的低资源深度神经网络平台,用于单细胞分析和生物标志物发现 | 提出了一种新颖的特征提取算法,通过特征子集训练和重要性评估来选择top-K特征,显著降低了计算资源需求 | NA | 开发低计算资源需求的单细胞分析平台 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络(DNN) | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | scaLR平台 | 基于Python的单细胞分析平台,支持数据处理、特征提取、训练、评估和下游分析 |
| 318 | 2025-06-01 |
Unravelling heart failure cellular signalling heterogeneity with spatial transcriptomics
2025-May-30, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehaf311
PMID:40444774
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 319 | 2025-06-01 |
Single-cell sequencing atlas construction for tracheobronchial adenoid cystic carcinoma
2025-May-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06622-z
PMID:40448199
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 320 | 2025-10-06 |
An Arabidopsis single-nucleus atlas decodes leaf senescence and nutrient allocation
2025-May-29, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.03.024
PMID:40220755
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研究论文 | 本研究通过构建拟南芥单核转录组图谱,揭示了叶片衰老和养分分配的系统性调控机制 | 首次构建了包含20个组织、超过100万个核的拟南芥单核转录组图谱;开发了两种分子指标在单细胞分辨率下量化叶片细胞衰老状态;通过时间分辨采样揭示了主要叶细胞类型间高度协调的衰老进程 | 研究仅限于拟南芥模型植物,结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 | 解析叶片衰老和养分分配的系统性调控机制 | 拟南芥多个发育阶段的20个组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 加权基因共表达网络分析 | 单核转录组数据 | 超过100万个核,来自20个组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |