单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 800 篇文献，本页显示第 281 - 300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2025-10-06 |
Exploring the potential function of high expression of ANAPC1 in regulating ubiquitination in hepatocellular carcinoma
2025-May-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v17.i5.103594
PMID:40487972
|
研究论文 | 本研究探讨ANAPC1在肝细胞癌中通过泛素化途径调控细胞周期和代谢水平的潜在功能 | 首次整合多种数据源全面研究ANAPC1在肝细胞癌中的表达及其通过泛素化途径的调控机制 | 研究主要基于细胞系和测序数据，缺乏体内实验验证 | 阐明ANAPC1在肝细胞癌中的表达及其与泛素化相关的潜在调控机制 | 肝细胞癌组织样本和JHH2等肝癌细胞系 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | RNA测序、微阵列、免疫组化、单细胞RNA测序、CRISPR基因敲除 | NA | RNA测序数据、微阵列数据、免疫组化图像、单细胞RNA测序数据 | 多种肝细胞癌组织和细胞系样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 282 | 2025-10-06 |
Expression of Immune-Related Genes and Possible Regulatory Mechanisms in Chronic Antibody-Mediated Rejection after Kidney Transplantation
2025-May, Archivos espanoles de urologia
IF:0.6Q4
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析慢性抗体介导排斥反应患者外周血单核细胞中免疫相关基因的表达模式和调控机制 | 首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，系统分析cABMR患者外周血单核细胞与肾脏组织中免疫相关基因的共同表达特征及关键转录因子 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；样本来源有限 | 阐明肾脏移植后慢性抗体介导排斥反应中免疫相关基因的表达模式和潜在调控机制 | 慢性抗体介导排斥反应患者的外周血单核细胞和肾脏组织 | 生物信息学 | 肾脏移植排斥反应 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 生物信息学分析 | AUCell软件包, STRING数据库分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 283 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveals an anti-tumor neutrophil subgroup in microwave thermochemotherapy-treated lip cancer
2025-05-13, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-025-00366-8
PMID:40360503
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示微波热化疗治疗唇癌中抗肿瘤中性粒细胞亚群的作用机制 | 首次发现微波热化疗通过增强血液灌注诱导抗肿瘤中性粒细胞(N1-TANs)浸润，并鉴定MX2作为N1-TANs标志物，开发了基于H&E图像的深度学习预测模型 | 研究样本量有限，机制验证主要基于转录组数据，需要进一步实验验证 | 探究微波热化疗治疗唇鳞状细胞癌的免疫调节机制 | 唇鳞状细胞癌患者肿瘤组织中的免疫细胞和肿瘤微环境 | 数字病理 | 唇癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 深度学习 | 深度学习模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, H&E染色图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 284 | 2025-10-06 |
Longitudinal scRNA-seq of retinal organoids derived from Stargardt disease patient with ABCA4 mutation
2025-May-27, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-05079-5
PMID:40425564
|
研究论文 | 本研究利用携带ABCA4基因突变的Stargardt病患者来源iPSC生成视网膜类器官，并进行纵向单细胞RNA测序分析 | 首次在携带中国STGD患者最常见ABCA4突变的视网膜类器官模型中开展纵向单细胞转录组研究 | 研究仅针对特定ABCA4突变类型，且类器官模型可能无法完全模拟体内视网膜微环境 | 研究ABCA4基因突变相关的Stargardt病发病机制 | 患者来源iPSC生成的视网膜类器官 | 单细胞组学 | Stargardt病（遗传性视网膜变性） | 单细胞RNA测序 | 视网膜类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 5个主要发育阶段（40、90、150、200和260天）的视网膜类器官样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 285 | 2025-10-06 |
Single-cell meta-analysis of T cells reveals clonal dynamics of response to checkpoint immunotherapy
2025-May-14, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100842
PMID:40187353
|
研究论文 | 通过单细胞元分析揭示T细胞克隆在免疫检查点抑制剂治疗中的动态变化及其与临床反应的关联 | 首次在六种癌症类型中系统分析T细胞克隆动态，发现基于扩增CD8克隆的响应特征能区分治疗应答者与非应答者 | 样本来源和癌症类型有限，需要更大规模验证 | 研究T细胞克隆在免疫检查点抑制剂治疗中的动态变化及其与临床结果的关系 | 767,606个T细胞，来自460个样本，涵盖6种癌症类型 | 单细胞生物学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序，T细胞受体测序 | 基因轨迹分析 | 单细胞转录组数据，T细胞受体序列数据 | 460个样本，767,606个T细胞 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 286 | 2025-10-06 |
Competing dynamic gene regulatory networks involved in fibroblast reprogramming to hematopoietic progenitor cells
2025-05-13, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102473
PMID:40185089
|
研究论文 | 本研究通过建立成纤维细胞重编程为造血祖细胞的诱导系统，揭示了重编程过程中的基因调控网络动态竞争机制 | 首次发现重编程中间阶段存在相互竞争的命运决定，并通过抑制神经元命运相关信号通路提高了重编程效率 | 研究仅关注了SCL和LMO2两个转录因子诱导的重编程过程，可能未涵盖其他潜在重编程途径 | 探究成纤维细胞重编程为造血祖细胞的分子机制并提高重编程效率 | 成纤维细胞及其重编程过程中产生的造血祖细胞 | 基因调控与细胞重编程 | 造血系统疾病 | 单细胞RNA测序，转录组分析，表观基因组分析 | 基因调控网络分析 | 基因表达数据，表观遗传数据 | 不同重编程阶段的细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 287 | 2025-10-06 |
An unconventional T cell nexus drives HCK-mediated chronic obstructive pulmonary disease in mice
2025-May, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.105707
PMID:40245497
|
研究论文 | 本研究揭示了HCK通过调控非常规T细胞轴驱动IL-17A/G-CSF/粒细胞介导的慢性阻塞性肺疾病病理机制 | 首次发现HCK作为顶端调控因子通过Vγ6Vδ1 T细胞和黏膜相关恒定T细胞驱动IL-17A/G-CSF/粒细胞轴介导的COPD病理过程 | 研究主要基于基因工程小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明HCK在慢性阻塞性肺疾病发病机制中的具体作用通路 | 基因靶向小鼠（Hck功能获得性突变）、骨髓嵌合体、特异性敲除小鼠 | 病理机制研究 | 慢性阻塞性肺疾病 | 组织病理学、形态计量学、流式细胞术、单细胞测序 | 基因工程小鼠模型 | 组织图像、细胞表型、基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 288 | 2025-10-06 |
The deubiquitinase OTUD3 plays a neuroprotective role by reducing ferroptosis induced by cerebral ischaemia reperfusion via stabilizing PLK1 via deubiquitination
2025-May, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70347
PMID:40462502
|
研究论文 | 本研究揭示去泛素化酶OTUD3通过稳定PLK1表达抑制铁死亡，在脑缺血再灌注损伤中发挥神经保护作用 | 首次阐明OTUD3通过去泛素化PLK1（靶向K48连接的泛素化）调节PI3K/AKT通路并抑制铁死亡的神经保护机制 | NA | 探究OTUD3在脑缺血再灌注损伤中的神经保护作用机制 | 小鼠神经元、原代皮层神经元、脑缺血再灌注模型小鼠 | 神经科学 | 脑卒中 | 共免疫沉淀-质谱分析、单细胞测序、氧糖剥夺模型、泛素化实验 | NA | 分子生物学数据、行为学数据、细胞活力数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 289 | 2025-10-06 |
Case report: single-cell transcriptome sequencing reveals the clonal origin of mature plasmacytoid dendritic cell proliferation in early T-cell precursor lymphoblastic leukemia
2025-May, Annals of hematology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s00277-025-06301-5
PMID:40085211
|
病例报告 | 通过单细胞转录组测序揭示早期T细胞前体淋巴细胞白血病中成熟浆细胞样树突状细胞增殖的克隆起源 | 首次在淋巴系统恶性肿瘤中发现MPDCP，并通过单细胞RNA测序技术揭示T-ALL原始细胞与pDCs之间的转录连续性 | 仅为单个病例报告，需要进一步研究确认发现并探索临床意义 | 探讨MPDCP在淋巴系统恶性肿瘤中的存在及其与淋巴细胞分化的潜在联系 | 一名69岁男性早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病伴MPDCP患者 | 单细胞测序分析 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 290 | 2025-10-06 |
Identification of molecular clusters and a risk prognosis model for diffuse large B-cell lymphoma based on lactate metabolism-related genes
2025-May, Annals of hematology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s00277-025-06321-1
PMID:40186663
|
研究论文 | 基于乳酸代谢相关基因构建弥漫性大B细胞淋巴瘤分子分型和风险预后模型 | 首次基于乳酸代谢相关基因构建DLBCL预后模型，发现高风险患者具有不良临床特征、侵袭性免疫微环境和治疗反应差的特点 | 使用公共数据集进行分析，需要进一步实验验证 | 探索乳酸代谢相关基因与DLBCL预后及免疫微环境的关联 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者和细胞系 | 生物信息学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序，Cox回归，LASSO回归 | 风险预后模型，列线图 | 基因表达数据，临床数据 | 来自GSE10846和GSE87371数据集的样本 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 291 | 2025-10-06 |
M-band wavelet-based multi-view clustering of cells
2025-May, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013060
PMID:40408513
|
研究论文 | 提出基于M-band小波的单细胞RNA测序多视图聚类方法WMC | 首次将M-band小波分析与UMAP结合应用于scRNA-seq数据，能够发现稀有细胞类型并进行多视图聚类 | NA | 开发新的单细胞RNA测序数据分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 小波分析, UMAP, 多视图聚类 | 基因表达矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 292 | 2025-10-06 |
Multi-Omics Biomarkers for Predicting Efficacy of Biologic and Small-Molecule Therapies in Adults With Inflammatory Bowel Disease: A Systematic Review
2025-05, United European gastroenterology journal
IF:5.8Q1
DOI:10.1002/ueg2.12720
PMID:39656426
|
综述 | 系统评估预测炎症性肠病患者对生物制剂和小分子药物疗效的多组学生物标志物 | 重点关注整合多组学数据集的模型影响，并评估对多种治疗干预反应具有特异性影响的生物标志物 | 基于PubMed文献的系统综述，可能存在发表偏倚和文献覆盖不全的限制 | 推进精准医学领域，通过生物标志物预测炎症性肠病治疗疗效 | 成人炎症性肠病患者 | 生物医学 | 炎症性肠病 | 多组学方法包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、微生物组学、代谢组学 | 多组学整合模型 | 多组学数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 293 | 2025-10-06 |
Patient-Derived Three-Dimensional Lung Tumor Models to Evaluate Response to Immunotherapy
2025-May-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.19.654890
PMID:40475675
|
研究论文 | 开发了一种新型患者来源三维肺肿瘤模型用于评估免疫检查点抑制剂的治疗反应 | 建立了能够维持人类细胞外基质特征、细胞间相互作用和组织结构的三维肺肿瘤模型，可模拟肿瘤微环境并快速评估免疫治疗反应 | 模型仍需进一步验证其与临床实际治疗反应的一致性 | 评估免疫检查点抑制剂在肺肿瘤中的治疗反应并开发预测生物标志物 | 非小细胞肺癌患者来源的三维肺肿瘤模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | 三维肿瘤模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 294 | 2025-10-06 |
Integrating bulk RNA-seq and scRNA-seq analyses with machine learning to predict platinum response and prognosis in ovarian cancer
2025-May-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-99930-9
PMID:40450069
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA-seq和scRNA-seq数据，结合机器学习方法开发了预测卵巢癌铂类化疗反应和预后的模型 | 首次结合单细胞转录组和批量RNA-seq数据，利用机器学习识别出5个基因标志物构建铂类反应预测模型 | 样本量相对有限，需要在更大规模队列中进一步验证模型的泛化能力 | 开发预测卵巢癌患者铂类化疗反应和预后的生物标志物模型 | 卵巢癌患者 | 机器学习 | 卵巢癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 机器学习 | 随机森林 | 基因表达数据 | 包含训练队列和GSE63885独立验证队列 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 295 | 2025-10-06 |
Shared roles of immune and stromal cells in the pathogenesis of human bronchiolitis obliterans syndrome
2025-May-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.176596
PMID:40232854
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析闭塞性细支气管炎综合征患者肺组织，揭示免疫细胞和基质细胞在疾病发病机制中的共同作用 | 首次在CLAD-BOS和cGVHD-BOS两种疾病中发现CD8+组织驻留记忆T细胞的扩增群体，并识别出功能失调的基质细胞 | 样本量较小（仅10例样本），且为移植后肺组织样本 | 理解闭塞性细支气管炎综合征的疾病机制 | 人类肺移植和造血干细胞移植后发生BOS的患者肺组织 | 单细胞组学 | 肺移植并发症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10例样本（4例CLAD-BOS，3例cGVHD-BOS，3例对照） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 296 | 2025-10-06 |
Csf1r⁻ macrophages govern the second wave of neutrophils for bone repair
2025-May-22, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6695752/v1
PMID:40470192
|
研究论文 | 本研究鉴定了一种独特的骨导向巨噬细胞亚群，揭示了其通过调控前中性粒细胞和骨髓基质细胞促进骨修复的新机制 | 首次发现并表征了具有特定表达谱(F4/80⁺ Csf1r⁻ Cx3cr1hi Ccr2hi)的骨导向巨噬细胞亚群，阐明了其在建立骨再生微环境中的关键作用 | NA | 探究巨噬细胞在骨组织再生中的具体机制和细胞类型 | 骨导向巨噬细胞、前中性粒细胞、LepR⁺骨髓基质细胞 | 组织再生医学 | 骨损伤 | 组织学分析、流式细胞术、RNA-seq、scRNA-seq | NA | 基因表达数据、转录组数据 | 使用条件性基因敲除小鼠模型(Axin2-Cre; tdTomato, Inhba, Wls) | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 297 | 2025-10-06 |
Development of a machine learning-based predictive risk model combining fatty acid metabolism and ferroptosis for immunotherapy response and prognosis in prostate cancer
2025-May-13, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02484-5
PMID:40355680
|
研究论文 | 开发基于脂肪酸代谢和铁死亡的机器学习预测模型，用于前列腺癌免疫治疗反应和预后评估 | 首次整合铁死亡和脂肪酸代谢基因构建前列腺癌预后模型，结合多组学数据和机器学习算法 | 模型验证队列相对有限，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 构建前列腺癌预后预测模型并指导个性化治疗 | 前列腺癌患者 | 机器学习 | 前列腺癌 | RNA测序，单细胞RNA测序，空间转录组学 | Lasso + 随机生存森林 | 基因表达数据 | TCGA-PRAD数据集和DFKZ队列 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 298 | 2025-10-06 |
IFN-γ and donor leukocyte infusions for relapsed myeloblastic malignancies after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation
2025-May-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.190655
PMID:40131369
|
研究论文 | 评估IFN-γ联合供者淋巴细胞输注治疗异基因造血干细胞移植后复发髓系恶性肿瘤的安全性和有效性 | 首次在临床试验中验证IFN-γ可增强髓系母细胞对同种异体反应性T细胞的敏感性，并采用单细胞RNA测序技术分析体内IFN-γ反应通路激活情况 | I期临床试验样本量较小，需要更大规模研究验证疗效 | 评估IFN-γ联合DLI治疗异基因造血干细胞移植后复发髓系恶性肿瘤的安全性和初步疗效 | 异基因造血干细胞移植后复发的急性髓系白血病或骨髓增生异常综合征患者 | 血液肿瘤学 | 急性髓系白血病,骨髓增生异常综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 7名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 299 | 2025-10-06 |
Progressive accumulation of circulating CD27-CD28- effector/memory CD8+ T cells in patients with lung cancer blunts responses to immune checkpoint inhibitor therapy
2025-May, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01448-7
PMID:40307573
|
研究论文 | 本研究揭示肺癌患者外周血中CD27-CD28-效应/记忆CD8+ T细胞的渐进性积累会削弱对免疫检查点抑制剂治疗的反应 | 首次系统揭示肺癌通过诱导整个CD8+ T细胞群体的稳态失调来系统性地抵消潜在肿瘤反应性CD8+ T细胞 | 研究主要关注肺癌患者，结果在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 探究肺癌如何系统性地影响CD8+ T细胞区室及其对免疫治疗反应的影响 | 肺癌患者的外周血CD8+ T细胞 | 免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 来自四个独立队列的224名肺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 300 | 2025-10-06 |
Cancer-associated fibroblast-derived fibulin-5 promotes epithelial-mesenchymal transition in diffuse-type gastric cancer via cAMP response element-binding protein pathway, showing poor prognosis
2025-May, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01447-8
PMID:40369121
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析发现癌症相关成纤维细胞分泌的fibulin-5通过CREB通路促进弥漫型胃癌的上皮-间质转化，并与不良预后相关 | 首次系统鉴定弥漫型胃癌特异性生物标志物，揭示CAF来源的fibulin-5通过CREB通路促进EMT的新机制 | 研究主要基于数据库分析和体外实验，需要更多体内实验验证 | 鉴定弥漫型胃癌特异性生物标志物并探索其分子机制 | 弥漫型胃癌患者样本、癌症相关成纤维细胞、胃癌细胞系、类器官 | 癌症生物学 | 胃癌 | RNA测序、免疫组织化学染色、单细胞RNA测序、原代细胞培养、类器官培养、共培养系统 | 数学建模、信号网络分析 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、临床病理数据 | 三个基因组数据库（TCGA、GSE62254、GSE26253）及组织微阵列样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |