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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2025-10-06 |
Bronchopulmonary dysplasia with pulmonary hypertension associates with semaphorin signaling loss and functionally decreased FOXF1 expression
2025-May-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60371-7
PMID:40442177
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析早产儿肺组织,发现BPD合并PH与信号素信号通路缺失及FOXF1表达降低相关 | 首次在人类早产儿肺组织中鉴定出BPD+PH特有的ANKRD1表达异常毛细血管细胞状态,并揭示信号素引导通路缺陷与FOXF1表达降低的关联 | 样本量有限,主要基于观察性数据,需要进一步功能验证 | 探索支气管肺发育不良合并肺动脉高压的细胞和分子驱动机制 | 早产儿肺组织(包括BPD和BPD+PH患者)及足月婴儿肺组织 | 单细胞基因组学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 早产儿和足月婴儿肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 282 | 2025-10-06 |
[Progress in investigating astrocyte heterogeneity after spinal cord injury based on single-cell sequencing technology]
2025-May-25, Zhongguo gu shang = China journal of orthopaedics and traumatology
|
综述 | 基于单细胞测序技术研究脊髓损伤后星形胶质细胞异质性的进展综述 | 利用单细胞测序技术揭示脊髓损伤后星形胶质细胞的异质性及其与神经再生修复的关联 | 目前所有发现仍需更多基础研究和足够临床试验验证 | 探讨单细胞测序技术在脊髓损伤后星形胶质细胞研究中的应用进展 | 脊髓损伤后的星形胶质细胞 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 283 | 2025-10-06 |
ICOS+CD4+ T cells define a high susceptibility to anti-PD-1 therapy-induced lung pathogenesis
2025-May-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.186483
PMID:40198121
|
研究论文 | 本研究揭示了ICOS+CD4+ T细胞在抗PD-1治疗诱导的肺毒性中的关键作用及其与衰老环境的关联 | 首次发现衰老环境中ICOS+CD4+ T细胞的活化是抗PD-(L)1治疗诱发肺毒性的关键机制,并证实ICOS-ICOSL相互作用是该过程的核心环节 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步扩大样本量 | 探索抗PD-(L)1免疫治疗引发免疫相关不良事件(irAEs)的细胞机制 | 荷瘤老年小鼠模型、肺癌患者样本 | 免疫学 | 肺癌 | 单细胞转录组测序、过继性T细胞转移 | 小鼠肿瘤模型 | 单细胞RNA测序数据、流式细胞术数据 | 老年和年轻荷瘤小鼠、癌症患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 284 | 2025-10-06 |
Characterization of a pathogenic nonmigratory fibroblast population in systemic sclerosis skin
2025-May-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.185618
PMID:40232859
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研究论文 | 本研究通过分离系统性硬化症皮肤中的非迁移性成纤维细胞群体,揭示了其在疾病不同阶段的致病机制 | 首次分离并表征了传统外植体培养方法无法获得的非迁移性成纤维细胞群体,发现其具有独特的致病特征 | 研究样本量有限,需要进一步验证在不同疾病亚组中的普适性 | 阐明系统性硬化症皮肤中不同成纤维细胞群体的致病机制和功能差异 | 系统性硬化症患者的皮肤成纤维细胞 | 病理生物学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 多通道免疫荧光, 体外功能研究 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 285 | 2025-10-06 |
Transcriptional signatures of endothelial cells shape immune responses in cardiopulmonary health and disease
2025-May-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.191059
PMID:40401523
|
综述 | 本文综述了心肺血管内皮细胞通过转录特征调控免疫反应在健康和疾病状态中的作用 | 揭示了心肺血管系统中内皮细胞亚群具有特异性免疫调节功能,及其在疾病中的转录重编程机制 | NA | 探讨内皮细胞在心肺健康与疾病中的免疫调节功能 | 心肺血管内皮细胞及其亚群 | 单细胞生物学 | 心肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 286 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing and Inferred Protein Activity Analysis Reveal a Distinct Tumor Phenotype in Early-Onset Colorectal Cancer Patients
2025-May-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.15.653154
PMID:40462964
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和蛋白活性分析揭示早发性结直肠癌的独特肿瘤表型 | 首次结合单细胞RNA测序和VIPER蛋白活性推断方法,识别出EO-CRC中TLR4/CCR5高表达的上皮亚群和成纤维细胞富集特征 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证发现 | 比较早发性和晚发性结直肠癌的分子特征和肿瘤微环境差异 | 结直肠癌患者组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 基因调控网络分析 | VIPER | 单细胞转录组数据, 蛋白活性数据, 免疫荧光图像 | 整合公共数据和内部临床样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 287 | 2025-10-06 |
High-Resolution Spatial Profiling of Microglia Reveals Proximity Associated Immunometabolic Reprogramming in Alzheimer's Disease
2025-May-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.16.654329
PMID:40462993
|
研究论文 | 本研究利用高分辨率空间转录组学揭示阿尔茨海默病中斑块邻近小胶质细胞的免疫代谢重编程 | 首次通过高分辨率空间转录组学解析小胶质细胞亚型分布及其与淀粉样斑块邻近关系的代谢通路变化 | 研究基于小鼠模型和有限的人类尸检组织,样本量相对有限 | 探究阿尔茨海默病病理特征邻近性对小胶质细胞基因表达的影响 | 小胶质细胞、淀粉样斑块、tau病理 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、机器学习 | 机器学习 | 空间基因表达数据 | 三种小鼠模型(PS19、APP/PS1、5xFAD)和人类尸检背外侧前额叶皮层组织 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium平台配合完全定制化基因panel |
| 288 | 2025-10-06 |
PML1-Mediated Feedforward Loop Through PI3K and MAPK Axes Drives Endocrine Resistance
2025-May-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.15.653365
PMID:40463196
|
研究论文 | 本研究揭示了PML1通过PI3K和MAPK信号轴驱动乳腺癌内分泌耐药的新机制 | 首次发现PML1介导的前馈循环机制是内分泌耐药的关键驱动因素,并证明三氧化二砷可有效破坏该循环 | 研究主要基于细胞模型,需要进一步临床验证 | 探索乳腺癌内分泌耐药机制并寻找克服耐药的治疗策略 | 雌激素受体阳性乳腺癌细胞 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 多种内分泌耐药乳腺癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 289 | 2025-10-06 |
Klf9 promotes the repair of myocardial infarction by regulating macrophage recruitment and polarization
2025-May-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.187072
PMID:40198141
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子Klf9通过调控IFN-γ/STAT1信号通路调节巨噬细胞募集和极化,促进心肌梗死后的修复过程 | 首次发现Klf9通过直接结合Stat1基因启动子调控其转录,进而影响巨噬细胞在心肌梗死后的动态变化过程 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究Klf9在心肌梗死后巨噬细胞表型和功能调控中的作用机制 | 小鼠心肌梗死模型中的巨噬细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | 野生型和Klf9敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 290 | 2025-10-06 |
The brain-body circuit mediates acute stress-induced antiinflammatory reflex in bacterial cystitis by suppressing ILC2 activation
2025-May-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.189362
PMID:40100274
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研究论文 | 本研究揭示了急性应激通过脑-体回路抑制ILC2细胞活化从而缓解细菌性膀胱炎炎症反应的机制 | 首次发现急性应激通过下丘脑-垂体-肾上腺轴和糖皮质激素信号通路抑制ILC2细胞活化,介导抗炎反射 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床验证 | 阐明心理应激通过脑-体回路调节膀胱感染免疫反应的机制 | 尿路感染小鼠模型和膀胱免疫细胞 | 免疫学 | 泌尿系统感染 | 单细胞RNA测序,逆行标记 | 动物模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 291 | 2025-10-06 |
Target Screening and Single Cell Analysis of Diabetic Retinopathy and Hepatocarcinoma
2025-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70521
PMID:40293350
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析识别肝细胞癌与糖尿病视网膜病变之间的共享基因和通路 | 首次发现铁蛋白吞噬相关基因在HCC和DR中的共同作用机制,并构建了具有高诊断效能的机器学习模型 | 研究主要基于公共数据库数据,实验验证相对有限 | 探索肝细胞癌与糖尿病视网膜病变之间的共同病理机制和潜在治疗靶点 | 肝细胞癌患者样本和糖尿病视网膜病变大鼠视网膜样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌, 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 机器学习 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | GEO数据集GSM7494113, GSE209872, GSE160306 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 292 | 2025-10-06 |
A Robust Kernel-Based Workflow for Niche Trajectory Analysis
2025-05, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401199
PMID:40411819
|
研究论文 | 提出一种基于核函数的生态位轨迹分析工作流程,用于建模组织微环境的空间连续变化 | 开发了无需细胞类型注释的核函数策略,将生态位结构建模为基因表达空间的连续函数 | NA | 改进空间转录组数据分析方法,提高生态位轨迹分析的稳健性和准确性 | 组织微环境的空间变化 | 空间转录组学 | 组织损伤相关疾病 | 核函数方法,细胞类型反卷积分析 | 核函数模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 293 | 2025-10-06 |
TRAF3 as a potential diagnostic biomarker for recurrent pregnancy loss: insights from single-cell transcriptomics and machine learning
2025-May-31, BMC pregnancy and childbirth
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s12884-025-07742-6
PMID:40450232
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析和机器学习技术,探索TRAF3作为复发性流产潜在诊断标志物的价值 | 首次结合单细胞转录组学和机器学习方法鉴定TRAF3作为RPL的诊断标志物,并发现特定dNK细胞亚型在RPL中的作用机制 | 样本量有限,需要更大规模的研究验证诊断模型的临床适用性 | 探索复发性流产的发病机制并寻找潜在诊断标志物和治疗靶点 | 复发性流产患者和正常妊娠女性的蜕膜组织 | 生物信息学 | 复发性流产 | 单细胞转录组测序, RT-PCR, 免疫组织化学, 分子对接分析 | 机器学习, WGCNA | 单细胞转录组数据 | RPL患者和正常妊娠女性的蜕膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 294 | 2025-10-06 |
Temporally resolved single-cell RNA sequencing reveals protective and pathological responses during herpes simplex virus CNS infection
2025-May-31, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03471-x
PMID:40450318
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研究论文 | 本研究通过时间分辨单细胞RNA测序揭示了单纯疱疹病毒中枢神经系统感染期间的保护性和病理性免疫反应 | 首次在时间维度上解析HSV-1感染中枢神经系统期间的单细胞转录组动态变化,并识别出病毒特异性激活的小胶质细胞亚群 | 研究仅限于小鼠模型,人类相关性需要进一步验证;空间转录组分析可能受技术分辨率限制 | 阐明HSV-1感染中枢神经系统期间的免疫细胞动态和分子机制 | HSV-1感染的小鼠脑干组织 | 单细胞组学 | 病毒感染性脑炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | HSV-1感染小鼠模型 | NanoString | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx空间转录组技术 |
| 295 | 2025-10-06 |
Human endothelial cells promote a human neural stem cell type B phenotype via Notch signaling
2025-May-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60194-6
PMID:40447618
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研究论文 | 研究发现人内皮细胞通过Notch信号通路促进人神经干细胞向B型表型分化 | 首次揭示人内皮细胞通过Notch-DLL4信号轴调控人神经干细胞B型表型,并鉴定了S100A6和LeX作为人B型细胞新标志物 | 研究主要关注Notch信号通路,可能还存在其他调控机制未探索 | 探究人内皮细胞与人神经干细胞间的相互作用机制 | 人神经干细胞和人内皮细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,免疫染色 | NA | 基因表达数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 296 | 2025-10-06 |
Immunogenicity and cellular response of a herpes zoster virus gEgI fusion protein adjuvanted with CpG-emulsion in mice
2025-May-30, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03423-w
PMID:40448056
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研究论文 | 本研究开发了一种新型带状疱疹疫苗,通过gEgI融合蛋白与CpG-乳剂复合佐剂XUA09C的组合,在小鼠模型中评估其免疫原性和细胞免疫反应 | 开发了gE和gI的融合蛋白疫苗,并采用新型复合佐剂XUA09C,相比现有疫苗Shingrix能诱导更强的T细胞反应和早期免疫激活 | 研究目前仅限于小鼠模型,尚未进行人体临床试验 | 开发更安全、更易获取的带状疱疹疫苗替代方案 | 成年小鼠、VZV预免疫小鼠和老年小鼠 | 免疫学 | 带状疱疹 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠群体(成年、VZV预免疫、老年) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 297 | 2025-10-06 |
Multiplex imaging reveals novel patterns of MRTFA/B activation in the breast cancer microenvironment
2025-May-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06559-3
PMID:40448123
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研究论文 | 通过多重成像技术研究MRTFA/B在乳腺癌微环境中的表达模式和激活状态 | 首次在人类乳腺癌中发现MRTFA/B在肿瘤微环境中的差异表达模式,特别是MRTFA在非裔美国患者转移瘤中高表达及其在血管周围抗原呈递细胞中的特异性表达 | 研究主要基于组织微阵列和生物信息学分析,需要进一步功能验证实验 | 探究MRTFA/B转录因子在乳腺癌进展和转移中的作用机制 | 乳腺癌组织样本、肿瘤微环境细胞(癌细胞、内皮细胞、抗原呈递细胞) | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多重免疫荧光、生物信息学分析、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 两个乳腺癌组织微阵列(CHTN_BrCaProg3和UIC-001-TMA),包含原发肿瘤和淋巴结转移样本 | Broad Institute | 单细胞RNA测序 | NA | Broad Institute单细胞RNA测序门户 |
| 298 | 2025-10-06 |
INBRX-106: a hexavalent OX40 agonist that drives superior antitumor responses via optimized receptor clustering
2025-May-21, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011524
PMID:40404202
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研究论文 | 本文介绍了一种新型六价OX40激动剂INBRX-106,通过优化受体聚类增强抗肿瘤免疫反应 | 开发了首个六价OX40激动剂,能够独立于Fc介导的交联实现优化的受体三聚体结合,显著增强下游信号传导 | NA | 评估六价OX40激动剂INBRX-106在增强抗肿瘤T细胞反应中的疗效和机制 | T细胞、小鼠肿瘤模型、离体人类样本、临床试验患者样本 | 免疫治疗 | 癌症 | NF-kß报告基因检测、共聚焦显微镜、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 分子信号数据、细胞图像、基因表达数据、临床样本数据 | 小鼠肿瘤模型、离体人类样本、I/II期临床试验患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 299 | 2025-06-04 |
Correction to: "GnRH-Gonadotropes Interactions Revealed by Pituitary Single-cell Transcriptomics in Zebrafish"
2025-May-19, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqaf098
PMID:40457745
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 300 | 2025-10-06 |
PERK+ Macrophages Drive Immunotherapy Resistance in Lymph Node Metastases of Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-May-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3135
PMID:40036693
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研究论文 | 本研究系统评估了口腔鳞状细胞癌淋巴结转移灶对新辅助免疫治疗的病理反应差异,并发现PERK+巨噬细胞是导致治疗抵抗的关键因素 | 首次在淋巴结转移灶中发现PERK+巨噬细胞通过内质网应激反应和细胞外基质重塑导致免疫治疗抵抗 | 样本量有限,研究结果需要在更大规模临床试验中验证 | 评估口腔鳞癌淋巴结转移灶对免疫治疗的病理反应并寻找改善治疗效果的潜在靶点 | 口腔鳞状细胞癌患者及其淋巴结转移灶 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞转录组学,空间转录组学,多重免疫组化 | NA | 转录组数据,图像数据 | 参与II期临床试验的口腔鳞癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |