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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 281 | 2025-10-06 |
Klf9 promotes the repair of myocardial infarction by regulating macrophage recruitment and polarization
2025-May-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.187072
PMID:40198141
|
研究论文 | 本研究揭示了转录因子Klf9通过调控IFN-γ/STAT1信号通路调节巨噬细胞募集和极化,促进心肌梗死后的修复过程 | 首次发现Klf9通过直接结合Stat1基因启动子调控其转录,进而影响巨噬细胞在心肌梗死后的动态变化过程 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究Klf9在心肌梗死后巨噬细胞表型和功能调控中的作用机制 | 小鼠心肌梗死模型中的巨噬细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | 野生型和Klf9敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 282 | 2025-10-06 |
The brain-body circuit mediates acute stress-induced antiinflammatory reflex in bacterial cystitis by suppressing ILC2 activation
2025-May-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.189362
PMID:40100274
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研究论文 | 本研究揭示了急性应激通过脑-体回路抑制ILC2细胞活化从而缓解细菌性膀胱炎炎症反应的机制 | 首次发现急性应激通过下丘脑-垂体-肾上腺轴和糖皮质激素信号通路抑制ILC2细胞活化,介导抗炎反射 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床验证 | 阐明心理应激通过脑-体回路调节膀胱感染免疫反应的机制 | 尿路感染小鼠模型和膀胱免疫细胞 | 免疫学 | 泌尿系统感染 | 单细胞RNA测序,逆行标记 | 动物模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 283 | 2025-10-06 |
Target Screening and Single Cell Analysis of Diabetic Retinopathy and Hepatocarcinoma
2025-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70521
PMID:40293350
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析识别肝细胞癌与糖尿病视网膜病变之间的共享基因和通路 | 首次发现铁蛋白吞噬相关基因在HCC和DR中的共同作用机制,并构建了具有高诊断效能的机器学习模型 | 研究主要基于公共数据库数据,实验验证相对有限 | 探索肝细胞癌与糖尿病视网膜病变之间的共同病理机制和潜在治疗靶点 | 肝细胞癌患者样本和糖尿病视网膜病变大鼠视网膜样本 | 生物信息学 | 肝细胞癌, 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 机器学习 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | GEO数据集GSM7494113, GSE209872, GSE160306 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 284 | 2025-10-06 |
A Robust Kernel-Based Workflow for Niche Trajectory Analysis
2025-05, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401199
PMID:40411819
|
研究论文 | 提出一种基于核函数的生态位轨迹分析工作流程,用于建模组织微环境的空间连续变化 | 开发了无需细胞类型注释的核函数策略,将生态位结构建模为基因表达空间的连续函数 | NA | 改进空间转录组数据分析方法,提高生态位轨迹分析的稳健性和准确性 | 组织微环境的空间变化 | 空间转录组学 | 组织损伤相关疾病 | 核函数方法,细胞类型反卷积分析 | 核函数模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 285 | 2025-10-06 |
TRAF3 as a potential diagnostic biomarker for recurrent pregnancy loss: insights from single-cell transcriptomics and machine learning
2025-May-31, BMC pregnancy and childbirth
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s12884-025-07742-6
PMID:40450232
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析和机器学习技术,探索TRAF3作为复发性流产潜在诊断标志物的价值 | 首次结合单细胞转录组学和机器学习方法鉴定TRAF3作为RPL的诊断标志物,并发现特定dNK细胞亚型在RPL中的作用机制 | 样本量有限,需要更大规模的研究验证诊断模型的临床适用性 | 探索复发性流产的发病机制并寻找潜在诊断标志物和治疗靶点 | 复发性流产患者和正常妊娠女性的蜕膜组织 | 生物信息学 | 复发性流产 | 单细胞转录组测序, RT-PCR, 免疫组织化学, 分子对接分析 | 机器学习, WGCNA | 单细胞转录组数据 | RPL患者和正常妊娠女性的蜕膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 286 | 2025-10-06 |
Temporally resolved single-cell RNA sequencing reveals protective and pathological responses during herpes simplex virus CNS infection
2025-May-31, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03471-x
PMID:40450318
|
研究论文 | 本研究通过时间分辨单细胞RNA测序揭示了单纯疱疹病毒中枢神经系统感染期间的保护性和病理性免疫反应 | 首次在时间维度上解析HSV-1感染中枢神经系统期间的单细胞转录组动态变化,并识别出病毒特异性激活的小胶质细胞亚群 | 研究仅限于小鼠模型,人类相关性需要进一步验证;空间转录组分析可能受技术分辨率限制 | 阐明HSV-1感染中枢神经系统期间的免疫细胞动态和分子机制 | HSV-1感染的小鼠脑干组织 | 单细胞组学 | 病毒感染性脑炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | HSV-1感染小鼠模型 | NanoString | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx空间转录组技术 |
| 287 | 2025-10-06 |
Human endothelial cells promote a human neural stem cell type B phenotype via Notch signaling
2025-May-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60194-6
PMID:40447618
|
研究论文 | 研究发现人内皮细胞通过Notch信号通路促进人神经干细胞向B型表型分化 | 首次揭示人内皮细胞通过Notch-DLL4信号轴调控人神经干细胞B型表型,并鉴定了S100A6和LeX作为人B型细胞新标志物 | 研究主要关注Notch信号通路,可能还存在其他调控机制未探索 | 探究人内皮细胞与人神经干细胞间的相互作用机制 | 人神经干细胞和人内皮细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,免疫染色 | NA | 基因表达数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 288 | 2025-10-06 |
Immunogenicity and cellular response of a herpes zoster virus gEgI fusion protein adjuvanted with CpG-emulsion in mice
2025-May-30, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03423-w
PMID:40448056
|
研究论文 | 本研究开发了一种新型带状疱疹疫苗,通过gEgI融合蛋白与CpG-乳剂复合佐剂XUA09C的组合,在小鼠模型中评估其免疫原性和细胞免疫反应 | 开发了gE和gI的融合蛋白疫苗,并采用新型复合佐剂XUA09C,相比现有疫苗Shingrix能诱导更强的T细胞反应和早期免疫激活 | 研究目前仅限于小鼠模型,尚未进行人体临床试验 | 开发更安全、更易获取的带状疱疹疫苗替代方案 | 成年小鼠、VZV预免疫小鼠和老年小鼠 | 免疫学 | 带状疱疹 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠群体(成年、VZV预免疫、老年) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 289 | 2025-10-06 |
Multiplex imaging reveals novel patterns of MRTFA/B activation in the breast cancer microenvironment
2025-May-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06559-3
PMID:40448123
|
研究论文 | 通过多重成像技术研究MRTFA/B在乳腺癌微环境中的表达模式和激活状态 | 首次在人类乳腺癌中发现MRTFA/B在肿瘤微环境中的差异表达模式,特别是MRTFA在非裔美国患者转移瘤中高表达及其在血管周围抗原呈递细胞中的特异性表达 | 研究主要基于组织微阵列和生物信息学分析,需要进一步功能验证实验 | 探究MRTFA/B转录因子在乳腺癌进展和转移中的作用机制 | 乳腺癌组织样本、肿瘤微环境细胞(癌细胞、内皮细胞、抗原呈递细胞) | 数字病理学 | 乳腺癌 | 多重免疫荧光、生物信息学分析、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 两个乳腺癌组织微阵列(CHTN_BrCaProg3和UIC-001-TMA),包含原发肿瘤和淋巴结转移样本 | Broad Institute | 单细胞RNA测序 | NA | Broad Institute单细胞RNA测序门户 |
| 290 | 2025-10-06 |
INBRX-106: a hexavalent OX40 agonist that drives superior antitumor responses via optimized receptor clustering
2025-May-21, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011524
PMID:40404202
|
研究论文 | 本文介绍了一种新型六价OX40激动剂INBRX-106,通过优化受体聚类增强抗肿瘤免疫反应 | 开发了首个六价OX40激动剂,能够独立于Fc介导的交联实现优化的受体三聚体结合,显著增强下游信号传导 | NA | 评估六价OX40激动剂INBRX-106在增强抗肿瘤T细胞反应中的疗效和机制 | T细胞、小鼠肿瘤模型、离体人类样本、临床试验患者样本 | 免疫治疗 | 癌症 | NF-kß报告基因检测、共聚焦显微镜、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 分子信号数据、细胞图像、基因表达数据、临床样本数据 | 小鼠肿瘤模型、离体人类样本、I/II期临床试验患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 291 | 2025-06-04 |
Correction to: "GnRH-Gonadotropes Interactions Revealed by Pituitary Single-cell Transcriptomics in Zebrafish"
2025-May-19, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqaf098
PMID:40457745
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 292 | 2025-10-06 |
PERK+ Macrophages Drive Immunotherapy Resistance in Lymph Node Metastases of Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-May-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3135
PMID:40036693
|
研究论文 | 本研究系统评估了口腔鳞状细胞癌淋巴结转移灶对新辅助免疫治疗的病理反应差异,并发现PERK+巨噬细胞是导致治疗抵抗的关键因素 | 首次在淋巴结转移灶中发现PERK+巨噬细胞通过内质网应激反应和细胞外基质重塑导致免疫治疗抵抗 | 样本量有限,研究结果需要在更大规模临床试验中验证 | 评估口腔鳞癌淋巴结转移灶对免疫治疗的病理反应并寻找改善治疗效果的潜在靶点 | 口腔鳞状细胞癌患者及其淋巴结转移灶 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞转录组学,空间转录组学,多重免疫组化 | NA | 转录组数据,图像数据 | 参与II期临床试验的口腔鳞癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 293 | 2025-10-06 |
Systematic evaluation of single-cell RNA-seq analyses performance based on long-read sequencing platforms
2025-May, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.05.020
PMID:38782298
|
研究论文 | 系统评估基于长读长测序平台的单细胞RNA-seq分析性能 | 首次系统比较牛津纳米孔和PacBio长读长测序技术在单细胞RNA-seq分析中的性能表现 | 仅评估了两种长读长测序平台,未涵盖其他新兴技术 | 评估长读长测序平台在单细胞转录组分析中的性能表现 | 单细胞cDNA文库 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序, 长读长测序 | NA | 测序数据 | 不同细胞数量的单细胞cDNA文库 | Oxford Nanopore Technologies, Pacific Biosciences | 单细胞RNA-seq, 长读长测序 | ONT, PacBio | 第三代测序技术平台 |
| 294 | 2025-10-06 |
Sympathetic hyperinnervation drives abdominal aortic aneurysm development by promoting vascular smooth muscle cell phenotypic switching
2025-May, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.05.028
PMID:38821358
|
研究论文 | 本研究揭示了交感神经过度支配通过促进血管平滑肌细胞表型转换驱动腹主动脉瘤发展的机制 | 首次发现交感神经过度支配在腹主动脉瘤中的作用,并阐明其通过eATP-P2rx4-p38信号通路和破骨样细胞分泌Sema4D的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 探究交感神经过度支配在腹主动脉瘤发展中的作用及分子机制 | 小鼠腹主动脉瘤模型和腹主动脉瘤患者组织样本 | 分子病理学 | 腹主动脉瘤 | Western blotting, 免疫化学染色, 单细胞RNA测序, 转录组分析 | 基因敲除小鼠模型(Sema4D-/-) | 蛋白质印迹数据, 免疫染色图像, 单细胞转录组数据 | 小鼠模型和人类患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 295 | 2025-10-06 |
Comprehensive single-cell analysis deciphered the immunoregulatory mechanism of TPPU in alleviating sepsis-related acute liver injury
2025-May, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.02.018
PMID:39956402
|
研究论文 | 通过单细胞分析揭示TPPU通过调节巨噬细胞和中性粒细胞缓解脓毒症相关急性肝损伤的免疫调节机制 | 首次在单细胞分辨率下系统阐明sEH抑制剂TPPU通过促进抗炎性M2样巨噬细胞和CAMP+NGP+CD177+中性粒细胞扩增,并抑制CCL6-CCR1信号通路来改善脓毒症肝损伤 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探究TPPU在缓解脓毒症相关急性肝损伤中的免疫调节机制 | 脓毒症相关急性肝损伤小鼠模型 | 单细胞分析 | 脓毒症相关急性肝损伤 | 飞行时间流式细胞术,单细胞RNA测序,蛋白质组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,蛋白质组数据,流式细胞数据 | 小鼠肝组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,飞行时间流式细胞术 | NA | NA |
| 296 | 2025-10-06 |
Anoikis in hepatocellular carcinoma: genetic alterations and immune microenvironment insights from single-cell and computational analysis
2025-May-31, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02770-2
PMID:40447878
|
研究论文 | 通过单细胞测序和计算分析研究肝细胞癌中失巢凋亡的遗传改变和免疫微环境特征 | 首次结合单细胞测序和101种机器学习算法构建失巢凋亡相关预后模型,揭示KPNA2基因在肝癌中的致癌作用 | 研究样本量有限,主要依赖公共数据库数据,需要更多临床样本验证 | 分析肝细胞癌的细胞异质性并构建失巢凋亡相关预后模型 | 肝细胞癌患者样本和Hep-3B细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序, qPCR, shRNA基因敲除 | AUCell算法, Cox回归, 多种机器学习算法 | 单细胞测序数据, 基因表达数据, 临床样本 | 来自GEO、TCGA和ICGC数据库的多个数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 297 | 2025-10-06 |
GSTM1 suppresses cardiac fibrosis post-myocardial infarction through inhibiting lipid peroxidation and ferroptosis
2025-May-31, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-025-00610-6
PMID:40448227
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研究论文 | 本研究探讨了GSTM1通过抑制脂质过氧化和铁死亡来减轻心肌梗死后心脏纤维化的作用机制 | 首次发现GSTM1在心肌梗死后心脏成纤维细胞中表达下调,并通过调节脂质代谢和铁死亡通路抑制纤维化进程 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,在人类患者中的验证仍需进一步研究 | 探究GSTM1在心肌梗死后心脏纤维化中的作用及其分子机制 | 小鼠心脏成纤维细胞、人类扩张型心肌病患者心脏组织 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 蛋白质组学、单细胞RNA测序、Western blotting、免疫荧光、实时定量PCR、转录组学、脂质过氧化检测 | NA | 蛋白质数据、基因表达数据、细胞表型数据 | 小鼠冠状动脉结扎模型、人类扩张型心肌病患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq、蛋白质组学 | NA | NA |
| 298 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial transcriptome analyses reveal tumor heterogeneity and immune remodeling involved in pituitary neuroendocrine tumor progression
2025-May-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60028-5
PMID:40442104
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析揭示垂体神经内分泌肿瘤的异质性和免疫重塑机制 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学分析垂体神经内分泌肿瘤,识别了与肿瘤进展相关的侵袭性肿瘤亚群和SPP1+肿瘤相关巨噬细胞的作用机制 | 样本量相对有限(57个组织样本),机制研究需要进一步实验验证 | 探索垂体神经内分泌肿瘤进展和侵袭的分子机制 | 垂体神经内分泌肿瘤(PitNETs)组织和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 57个组织样本,超过177,000个细胞和35,000个spots | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 299 | 2025-10-06 |
Identification of predictors for bacterial meningitis diagnosis based on transcriptomics and genetic analysis
2025-May-30, AMB Express
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s13568-025-01893-7
PMID:40445403
|
研究论文 | 本研究通过转录组学和遗传分析识别细菌性脑膜炎的诊断预测因子 | 首次通过整合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和伪时间分析等方法,系统识别了RNF144B和FYN作为细菌性脑膜炎的潜在生物标志物 | 研究样本量有限,需要在更大队列中验证生物标志物的临床适用性 | 改善细菌性脑膜炎的诊断和治疗策略 | 细菌性脑膜炎患者的免疫相关基因和免疫细胞 | 生物信息学 | 细菌性脑膜炎 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 差异基因表达分析, 共表达网络分析, 基因集富集分析, 伪时间分析 | NA | 转录组数据, 遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 300 | 2025-10-06 |
Development of an immune scoring system based on exosome-related gene expression for prognosis and treatment response prediction in breast cancer
2025-May-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02702-0
PMID:40445462
|
研究论文 | 基于外泌体相关基因表达开发免疫评分系统,用于乳腺癌预后和治疗反应预测 | 首次将外泌体相关基因与免疫评分系统结合,建立了新的乳腺癌预后预测模型 | 研究基于回顾性数据,需要前瞻性研究进一步验证 | 开发基于外泌体相关基因的免疫评分系统,预测乳腺癌预后和治疗反应 | 乳腺癌患者及其基因表达数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, qPCR, 免疫印迹 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 多个数据集的乳腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |