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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-10-06 |
Constructing a cross-tissue human knee single-cell atlas identified osteoarthritis reduces regenerative tissue stem cells while increasing inflammatory pain macrophages
2025-May-05, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6247502/v1
PMID:40386432
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研究论文 | 构建首个跨组织人类膝关节单细胞图谱,揭示骨关节炎减少再生性组织干细胞同时增加炎症疼痛巨噬细胞 | 首次构建包含关节软骨、半月板、滑膜和软骨下骨的膝关节骨关节炎综合单细胞图谱,发现组织间活跃通讯机制 | NA | 研究骨关节炎的跨组织分子机制和细胞组成变化 | 人类膝关节组织(关节软骨、半月板、滑膜、软骨下骨) | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 242 | 2025-10-06 |
miR-190 is a Key Regulator in Establishing Cell Polarity and Specification in the Drosophila Nervous System
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.28.656688
PMID:40501908
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研究论文 | 本研究鉴定miR-190作为果蝇神经母细胞极性和分化的关键调控因子 | 首次发现miR-190通过调控Cdc42激活和Par-6定位来建立神经母细胞极性 | 研究仅限于果蝇胚胎神经母细胞,尚未在哺乳动物系统中验证 | 探究miR-190在神经母细胞不对称分裂和命运决定中的分子机制 | 果蝇胚胎神经母细胞和中枢神经系统细胞群体 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,转录组分析,qPCR | NA | RNA测序数据,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 243 | 2025-10-06 |
Comprehensive single-cell profiling of T and B cell subsets in mice reveals impacts on memory immune responses in FMDV infection
2025-05, Virology
IF:2.8Q3
DOI:10.1016/j.virol.2025.110496
PMID:40090183
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析FMDV感染对小鼠T细胞和B细胞亚群记忆免疫反应的影响 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统揭示FMDV感染对记忆免疫细胞的影响机制,并发现Fos相关基因的关键作用 | 研究工具有限,仅针对小鼠脾脏细胞进行分析 | 研究FMDV感染对记忆免疫反应的影响机制 | 小鼠脾脏中的T细胞和B细胞亚群 | 免疫学 | 口蹄疫 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠脾脏细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 244 | 2025-10-06 |
Mechanism and Efficacy of Etanercept in Treating Autoimmune-like Manifestations of Coronavirus Disease 2019 in elderly individuals
2025-05, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2025.152898
PMID:40168796
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研究论文 | 评估依那西普治疗老年COVID-19患者自身免疫样表现的作用机制和疗效 | 首次通过单细胞测序揭示老年COVID-19患者的自身免疫样表现,并发现依那西普通过抑制PF4和TNF-α发挥治疗作用 | 基于同情使用病例的观察性分析,样本量有限(仅7名治疗患者) | 评估TNF抑制剂依那西普在老年COVID-19患者中的治疗效果 | 老年COVID-19患者(特别是有自身免疫样表现者) | 医学研究 | COVID-19 | 单细胞测序,转录组分析,分子对接 | 观察性分析 | 临床指标数据,单细胞测序数据 | 7名依那西普治疗患者+2名未感染个体,共40万个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 245 | 2025-10-06 |
Novel diagnostic biomarkers regulating macrophages autophagy in ischemic cardiomyopathy: An analysis integrating bulk RNA sequencing with single-cell RNA sequencing
2025-05, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2025.152907
PMID:40300424
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研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序分析,探索缺血性心肌病中巨噬细胞自噬相关的诊断生物标志物 | 首次整合bulk RNA测序和单细胞RNA测序技术,系统识别缺血性心肌病中巨噬细胞自噬相关的诊断生物标志物 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于大鼠模型,需要进一步临床验证 | 探索缺血性心肌病中巨噬细胞自噬相关的诊断生物标志物及其作用机制 | 缺血性心肌病患者组织样本和大鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, WGCNA分析 | PPI网络分析, WGCNA | 基因表达数据 | 使用GSE46224和GSE116250数据集,并在大鼠模型中验证 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 246 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA and TCR repertoire analysis identify markers of virus-specific T cells
2025-05, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2025.152904
PMID:40305898
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研究论文 | 通过单细胞RNA和TCR谱分析识别病毒特异性T细胞的标志物 | 发现7个上调基因可作为早期识别增殖性抗原特异性T细胞的标志物,准确率达93.52% | 样本仅来自健康供体,未在患者群体中验证 | 鉴定用于识别抗原特异性T细胞的生物标志物 | 健康供体的外周血单个核细胞和CD3/CD8 T细胞 | 单细胞分析 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序, TCR谱分析, CFSE染色 | NA | 单细胞RNA测序数据, TCR序列数据 | 健康供体外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 247 | 2025-10-06 |
Interpretable Machine Learning reveals the Role of PANoptosis in the Diagnosis and Subtyping of NAFLD
2025-05, Immunobiology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.imbio.2025.152909
PMID:40311345
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研究论文 | 本研究通过可解释机器学习揭示了PANoptosis在NAFLD诊断、分型及免疫微环境重塑中的关键作用 | 首次整合多组学数据和可解释机器学习方法,系统解析PANoptosis在NAFLD中的作用机制,并识别出9个枢纽基因和潜在治疗药物 | NA | 探究PANoptosis在非酒精性脂肪肝病诊断、分型和免疫微环境重塑中的作用 | 非酒精性脂肪肝病患者 | 机器学习 | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞测序,分子对接,pan-cancer分析 | 可解释机器学习,无监督共识聚类 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 248 | 2025-10-06 |
Prg4+ fibro-adipogenic progenitors in muscle are crucial for bone fracture repair
2025-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.14.654160
PMID:40462922
|
研究论文 | 本研究揭示了肌肉中Prg4+纤维脂肪祖细胞在骨骨折修复中的关键作用 | 首次发现Prg4标记的FAP亚群能从肌肉迁移至骨折部位并分化为软骨细胞和骨细胞 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究肌肉细胞在骨骨折修复中的贡献机制 | 小鼠肌肉组织和骨骨折模型 | 细胞生物学 | 骨损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 249 | 2025-10-06 |
MACanalyzeR scRNAseq analysis tool reveals PPARγHIGH/GDF15HIGH lipid-associated macrophages facilitate thermogenic expansion in BAT
2025-May-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60295-2
PMID:40450001
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研究论文 | 开发用于单细胞RNA测序分析的MACanalyzeR工具,揭示PPARγHIGH/GDF15HIGH脂质相关巨噬细胞在棕色脂肪组织产热扩张中的作用 | 开发了专门用于单核细胞/巨噬细胞代谢谱分析的scRNAseq工具MACanalyzeR,并首次发现Pparg脂质相关巨噬细胞通过分泌GDF15调节棕色脂肪组织稳态 | 研究仅使用雄性小鼠模型,未涉及雌性动物或人类样本 | 探究巨噬细胞在棕色脂肪组织功能和代谢调节中的作用机制 | 肥胖雄性小鼠模型(db/db和高脂饮食喂养小鼠)的棕色脂肪组织 | 单细胞转录组学 | 肥胖代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两种肥胖小鼠模型(db/db和高脂饮食喂养小鼠) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 250 | 2025-10-06 |
Reconstructing Dynamic Gene Regulatory Networks Using f-Divergence from Time-Series scRNA-Seq Data
2025-May-30, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47060408
PMID:40699807
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研究论文 | 提出一种基于f-散度的动态基因调控网络推断方法f-DyGRN,用于从时间序列单细胞RNA测序数据重建动态基因调控网络 | 首次将f-散度应用于量化单细胞基因表达的时间变异,结合Granger因果关系模型和移动窗口策略捕捉动态调控变化 | 方法性能依赖于合适的f-散度度量选择,且仅使用THP-1细胞数据进行验证 | 从时间序列单细胞RNA测序数据推断动态基因调控网络 | THP-1人髓系单核细胞白血病细胞的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | f-DyGRN(基于f-散度的动态基因调控网络模型),Granger因果关系模型 | 单细胞RNA测序数据,时间序列数据 | 模拟数据和真实THP-1细胞单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 251 | 2025-10-06 |
NPAS4 Depletion in POMC Neurons Protects From Obesity and Alters the Feeding-regulated Transcriptome in Male Mice
2025-May-19, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqaf083
PMID:40296822
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子NPAS4在POMC神经元中对摄食行为的调控作用 | 首次发现NPAS4在POMC神经元中被摄食刺激诱导,并证明其缺失通过改变抑制性GABA能信号传导来调控摄食行为 | 研究仅使用雄性小鼠,未评估性别差异;机制研究仍需进一步深入 | 探究NPAS4在POMC神经元中对摄食调控的作用机制 | 雄性小鼠的POMC神经元 | 神经科学 | 肥胖症 | 条件性基因敲除,单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 252 | 2025-10-06 |
A human and mouse subpopulation of senescent β-cells induces pathologic dysfunction through targetable paracrine signaling
2025-May-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.07.648438
PMID:40654723
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研究论文 | 本研究通过鉴定人和小鼠衰老β细胞亚群,揭示其通过可靶向的旁分泌信号诱导病理功能障碍的机制 | 首次在人和小鼠中鉴定出表达特定标志物的衰老β细胞亚群,并证明其分泌的SASP因子可诱导继发性衰老和β细胞功能障碍 | NA | 研究衰老β细胞亚群的异质性及其在糖尿病病理过程中的作用 | 人和小鼠的胰腺β细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,空间转录组学,空间蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,蛋白质组数据 | 高脂饮食喂养的小鼠和来自2型糖尿病供体的人类胰岛 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 253 | 2025-10-06 |
High-resolution comparative single-cell transcriptomics of doublesex-expressing neurons reveals evolutionary conservation and diversity of sexual circuits in Drosophila
2025-May-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.06.652433
PMID:40654601
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研究论文 | 通过单细胞转录组学比较分析果蝇属中表达doublesex基因的神经元,揭示性行为神经回路在进化中的保守性和多样性 | 首次在多个果蝇物种中系统比较性决定基因表达神经元的单细胞转录组,揭示细胞类型作为独立进化单元的特性 | 研究主要关注doublesex表达神经元,可能未涵盖所有参与性行为的神经元类型 | 探究神经回路在进化过程中的细胞和分子组成变化机制 | 果蝇属多个物种中表达doublesex基因的神经元细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 四个果蝇物种的雄性个体,包括一个物种的雌性数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 254 | 2025-10-06 |
Quantification of single cell-type-specific alternative transcript initiation
2025-May-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.29.651292
PMID:40654755
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研究论文 | 开发了一种名为TSRdetector的新型生物信息学方法,用于检测不同组织、细胞类型或疾病中基因转录起始区域使用的显著变化 | 首个专门设计用于在单细胞类型水平分析基因转录起始区域差异使用的生物信息学工具 | 方法验证仅限于肾脏疾病、B细胞分化和多能性转换等特定生物学场景 | 探索不同组织和细胞类型中基因转录起始区域的选择性激活机制 | 人类肾脏细胞、小鼠B细胞、人类胚胎干细胞 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | 生物信息学算法 | RNA测序数据 | 多个数据集(包括健康与糖尿病患者肾脏、小鼠B细胞分化、人类ESC多能性转换) | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | 10x Chromium | 10x单核RNA测序 |
| 255 | 2025-10-06 |
Integrating Single-Cell Sequencing and Transcriptome Analysis to Investigate the Role of Ferroptosis in Ischemic Stroke and the Molecular Mechanisms of Immune Checkpoints
2025-05, World neurosurgery
IF:1.9Q2
DOI:10.1016/j.wneu.2025.123908
PMID:40118372
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研究论文 | 通过整合单细胞测序和转录组分析,研究铁死亡在缺血性脑卒中中的作用及免疫检查点的分子机制 | 首次结合单细胞转录组数据和机器学习算法识别缺血性脑卒中中铁死亡相关关键基因,并探索其与免疫细胞浸润的关联 | 研究基于单一数据集GSE247474,需要更多独立队列验证 | 识别缺血性脑卒中中铁死亡相关关键基因,探索其分子机制和早期诊断价值 | 星形胶质细胞和T细胞亚群 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA-seq, 转录组分析 | Lasso回归, 支持向量机 | 单细胞转录组数据 | GSE247474数据集中的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 256 | 2025-10-06 |
Exploring the immune environment of glioblastoma through single-cell RNA sequencing in humanized mouse models
2025-May-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.17.654526
PMID:40475625
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研究论文 | 通过人源化小鼠模型中的单细胞RNA测序探索胶质母细胞瘤的免疫环境 | 建立了利用患者来源异种移植的人源化小鼠胶质母细胞瘤模型,该模型能更好地模拟复发性胶质母细胞瘤的免疫特征 | 模型基于免疫缺陷小鼠,可能无法完全模拟人类完整的免疫系统功能 | 研究胶质母细胞瘤的肿瘤免疫微环境并评估新疗法 | 人源化小鼠模型中的胶质母细胞瘤患者来源异种移植 | 单细胞测序分析 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 两个免疫缺陷小鼠模型,使用人脐带血来源的CD34+造血干细胞祖细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 257 | 2025-10-06 |
Sex differences in adenosine deaminase activity associate with disparities in SARS-CoV-2 innate immunity
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112418
PMID:40343269
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研究论文 | 本研究揭示腺苷脱氨酶活性性别差异与SARS-CoV-2先天免疫差异的关联机制 | 首次发现女性ADA活性较低与内源性逆转录病毒-干扰素刺激基因信号增强的关联,并阐明IL-18驱动性别特异性ADA2表达的机制 | 样本来源和数量未明确说明,机制研究仍需进一步验证 | 探究抗病毒免疫性别差异的分子机制 | 健康人群和COVID-19患者的血液、肺组织和呼吸道细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 258 | 2025-10-06 |
Spatial characterization of interface dermatitis in cutaneous lupus reveals novel chemokine ligand-receptor pairs that drive disease
2025-May-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.05.574422
PMID:38260617
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研究论文 | 本研究通过空间多组学技术揭示了皮肤红斑狼疮界面皮炎中角质细胞损伤驱动淋巴细胞募集的分子机制 | 首次系统描绘了皮肤红斑狼疮界面皮炎中角质细胞损伤到免疫细胞募集的完整信号通路,并鉴定出AIM2-Casp8-IL-18-CXCL6/CXCR1和CCL8/CCR2等新型趋化因子配体-受体对 | 样本量相对有限,研究主要聚焦于特定临床亚型 | 阐明皮肤红斑狼疮界面皮炎的免疫发病机制 | 皮肤红斑狼疮患者的水疱活检组织和穿刺活检组织 | 数字病理学 | 皮肤红斑狼疮 | 光谱流式细胞术, 96重免疫分析靶向蛋白质组学, 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 数字空间分析 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据, 流式细胞数据 | 皮肤红斑狼疮患者和健康供者的活检样本 | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 靶向蛋白质组学 | 数字空间分析技术 | 96重免疫分析靶向蛋白质组学检测皮肤间质液中184种蛋白质分析物 |
| 259 | 2025-10-06 |
Decoding sexual dimorphism of the sex-shared nervous system at single-neuron resolution
2025-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.27.630541
PMID:40654890
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析性别共享神经系统中神经元水平的分子二态性 | 首次在单神经元分辨率揭示性别共享神经系统的广泛分子二态性,发现神经肽和信号相关基因的强烈性别偏好表达 | 研究仅针对成年雄性和雌雄同体线虫,未涵盖其他发育阶段或物种 | 探究遗传性别如何在单神经元水平塑造神经系统的分子结构 | 成年雄性和雌雄同体线虫的性别共享神经元 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年雄性和雌雄同体线虫的神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 260 | 2025-10-06 |
CXCL12+ fibroblastic reticular cells in lymph nodes facilitate immune tolerance by regulating T cell-mediated alloimmunity
2025-May-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI182709
PMID:40309773
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现淋巴结中CXCL12高表达的成纤维网状细胞通过调节T细胞介导的同种免疫反应促进移植耐受 | 首次鉴定出淋巴结中特定的CXCL12hi FRCs亚群,并证明其在调节移植免疫耐受中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需进一步深入 | 探究特定FRC亚群在控制同种免疫反应中的作用机制 | 小鼠和人类淋巴结中的成纤维网状细胞及T细胞 | 免疫学 | 移植免疫 | 单细胞RNA测序, 遗传缺失技术, 纳米递送技术 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 心脏移植小鼠的初始和引流淋巴结, 人类淋巴结样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |