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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-10-06 |
Din Oversees Mesenchymal Stem Cell Homeostasis in Mouse Incisors
2025-May-14, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6568233/v1
PMID:40470223
|
研究论文 | 本研究通过新开发的基因敲除小鼠模型揭示了Din基因在小鼠切牙间充质干细胞稳态调控中的关键作用 | 首次发现并验证了预测基因Din在牙髓间充质干细胞稳态维持中的核心功能,并阐明其通过Rho GTPases通路调控的分子机制 | 研究仅限于小鼠切牙模型,在人类牙齿中的功能尚需验证 | 探究Din基因在牙齿干细胞稳态调控中的作用机制 | 小鼠切牙中的间充质干细胞和上皮干细胞 | 干细胞生物学 | 牙齿发育异常 | 基因敲除模型,单细胞RNA测序,转录组学,蛋白质组学,GLISA分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,蛋白质数据 | 未明确样本数量的小鼠切牙组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 222 | 2025-10-06 |
scATD: a high-throughput and interpretable framework for single-cell cancer drug resistance prediction and biomarker identification
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf268
PMID:40501071
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研究论文 | 提出一种基于大语言模型的高通量单细胞癌症耐药性预测框架scATD | 采用双向风格迁移实现无需模型参数训练的新患者预测,并通过知识蒸馏提升性能 | NA | 开发高通量单细胞癌症耐药性预测和生物标志物识别方法 | 单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 大语言模型, 知识蒸馏, 迁移学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 223 | 2025-10-06 |
Showcasing the Comprehensive Understanding of Cellular Profiling and Human Neurophysiology
2025-May, Journal of pharmacy & bioallied sciences
DOI:10.4103/jpbs.jpbs_46_25
PMID:40511047
|
研究论文 | 本文系统整合细胞谱系分析与人类神经生理学,探索两者在理解神经过程、细胞反应和疾病机制中的相互作用 | 采用跨领域整合方法,结合单细胞RNA测序与电生理技术解析细胞异质性与神经生理表型的关联 | NA | 揭示细胞亚型在特定神经生理功能中的作用,为精准治疗提供理论基础 | 人类标本中的细胞异质性与神经生理表型 | 生物信息学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 电生理记录 | NA | 基因表达数据, 电生理信号 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 224 | 2025-10-06 |
Huangqi decoction ameliorated intestinal barrier dysfunction via regulating NF-κB signaling pathway in slow transit constipation model mice
2025-May-27, World journal of gastrointestinal surgery
IF:1.8Q2
DOI:10.4240/wjgs.v17.i5.106000
PMID:40502512
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研究论文 | 本研究探讨黄芪汤通过调控NF-κB信号通路改善慢传输型便秘小鼠肠道屏障功能障碍的机制 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组测序技术系统揭示黄芪汤通过抑制NF-κB通路修复肠道屏障功能的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究黄芪汤是否通过下调NF-κB信号通路恢复肠道屏障功能来缓解慢传输型便秘 | KM小鼠和LS174T细胞系 | 单细胞组学 | 慢传输型便秘 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 免疫组织化学, Western blot | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 蛋白质表达数据 | KM小鼠分组(对照组、模型组、黄芪汤治疗组) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | NA |
| 225 | 2025-10-06 |
Efficacy, safety and exploratory analysis of neoadjuvant tislelizumab (a PD-1 inhibitor) plus nab-paclitaxel followed by epirubicin/cyclophosphamide for triple-negative breast cancer: a phase 2 TREND trial
2025-May-26, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02254-3
PMID:40414961
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研究论文 | 评估替雷利珠单抗联合白蛋白紫杉醇及表柔比星/环磷酰胺作为三阴性乳腺癌新辅助治疗方案的疗效与安全性 | 首次采用PD-1抑制剂替雷利珠单抗联合特定化疗方案的新辅助治疗模式,并整合多组学技术探索生物标志物 | 单臂II期试验设计,样本量有限(53例),缺乏对照组 | 确定三阴性乳腺癌新辅助免疫治疗的最佳化疗方案和获益人群 | 三阴性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, TCR测序, 质谱流式细胞术, 全外显子组测序 | 预测模型 | 基因组数据, 转录组数据 | 53例患者(44例完成治疗) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, TCR测序, 质谱流式细胞术, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 226 | 2025-10-06 |
Dissecting PTPN7-driven aggressiveness in IDH-wildtype astrocytomas: multi-omics, clinical validation, and spatial transcriptomics for prognostic insights
2025-May-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02662-5
PMID:40413344
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨PTPN7在IDH野生型星形细胞瘤中的预后意义和免疫调节功能 | 首次系统研究PTPN7在胶质瘤中的空间分布特征及其与免疫微环境的相互作用 | 研究主要基于生物信息学分析,需要更多实验验证PTPN7的功能机制 | 评估PTPN7作为胶质瘤预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | IDH野生型星形细胞瘤患者样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组化, 基因集富集分析 | Cox生存分析, CIBERSORT | 基因表达数据, 空间转录组数据, 临床数据 | TCGA、CGGA数据库样本,70例免疫组化验证病例 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium | 10x Genomics Visium空间转录组平台 |
| 227 | 2025-10-06 |
Functional heterogeneity and clinical implications of CD4+ T cell subtypes in high-grade serous ovarian carcinoma
2025-May-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v16.i5.104138
PMID:40503412
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析高级别浆液性卵巢癌中CD4+ T细胞亚型的功能异质性及其临床意义 | 首次系统揭示了HGSOC中CD4+ T细胞亚型在附件组织和腹水中的空间分布差异,并鉴定出与不良预后相关的Treg3亚型 | 样本量相对有限(42例患者),且仅分析了附件组织和腹水两种组织类型 | 表征HGSOC中CD4+ T细胞亚型的功能异质性和组织特异性分布,并识别治疗生物标志物 | 42例高级别浆液性卵巢癌患者的附件组织和腹水样本 | 单细胞生物学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类,Cox比例风险模型 | 单细胞转录组数据 | 42例HGSOC患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 228 | 2025-10-06 |
Study on Liver Sinusoidal Endothelial Cell Fenestrations Based on Cellular Omics-Structure Integration Technology and Its Application in Metabolic Diseases
2025-May-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.16.653525
PMID:40475559
|
研究论文 | 开发了细胞组学-结构整合技术平台,实现单细胞水平基因表达谱与超分辨率细胞结构信息的同步获取 | 首创细胞组学-结构整合技术平台,突破传统技术无法同时获取单细胞基因表达和超分辨率结构的限制 | 未明确说明技术平台的具体应用范围和样本处理限制 | 研究肝窦内皮细胞窗孔形成机制及其在代谢疾病中的应用 | 原代肝窦内皮细胞、非酒精性脂肪性肝炎和糖尿病小鼠模型 | 数字病理 | 代谢疾病 | 单细胞转录组学、超分辨率荧光显微镜、电子显微镜、深度学习 | 深度学习 | 图像、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | COSI技术平台 | 包含单细胞转录组学与超分辨率荧光显微镜整合模块、电子显微镜与超分辨率荧光显微镜整合模块、综合分析模块 |
| 229 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals SLC31A1-mediated M2 polarization of macrophages promotes malignant progression in triple-negative breast cancer
2025-May-14, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-025-06191-0
PMID:40360897
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现SLC31A1介导的巨噬细胞M2极化促进三阴性乳腺癌恶性进展 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定SLC31A1在三阴性乳腺癌髓系细胞中的过表达及其在巨噬细胞M2极化中的关键作用 | NA | 研究三阴性乳腺癌免疫微环境中巨噬细胞极化的调控机制及其对肿瘤恶性进展的影响 | 三阴性乳腺癌样本中的巨噬细胞和癌细胞 | 单细胞测序分析 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序, qPCR, 流式细胞术, Transwell实验, 划痕实验, 铜离子检测, 过氧化氢检测 | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据, 细胞功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 230 | 2025-10-06 |
In situ profiling of plasma cell clonality with image-based single-cell transcriptomics
2025-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.09.653118
PMID:40463110
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研究论文 | 开发了一种基于图像的单细胞转录组学方法BCR-MERFISH,用于在原位分析浆细胞克隆性 | 首次结合V基因使用和转录组分析来区分浆细胞克隆,能够在组织原位同时分析细胞类型和免疫受体多样性 | 目前仅在细胞培养和小鼠模型中验证,尚未在人类样本中应用 | 开发能够分析适应性免疫系统中细胞克隆多样性的单细胞技术 | 浆细胞及其B细胞受体克隆多样性 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学,荧光原位杂交 | NA | 图像,转录组数据 | 细胞培养物和小鼠组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | BCR-MERFISH(B细胞受体多重误差鲁棒荧光原位杂交) |
| 231 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics of Glomerulo-centric antibody mediated rejection in renal transplants
2025-May, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2025.110460
PMID:39993695
|
案例研究 | 通过空间转录组技术分析肾移植患者抗体介导排斥反应中肾小球中心的分子特征变化 | 首次使用数字空间分析技术定位肾移植排斥反应中肾小球特异性转录本,揭示天然免疫细胞在肾小球中的空间分布 | 仅基于单个患者的4次活检样本,样本量有限 | 研究急性抗体介导排斥反应中肾小球中心的分子机制 | 肾移植患者的活检组织 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 数字空间分析 | NA | 空间转录组数据 | 来自单个患者的4次肾活检样本(治疗前、治疗中和治疗后) | NA | 空间转录组学 | NA | 数字空间分析技术 |
| 232 | 2025-10-06 |
GAEDGRN: reconstruction of gene regulatory networks based on gravity-inspired graph autoencoders
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf232
PMID:40415678
|
研究论文 | 提出基于重力启发图自编码器的新型基因调控网络重建框架GAEDGRN | 通过重力启发图自编码器捕捉基因调控网络中的有向拓扑结构,并设计基因重要性评分方法 | 未明确说明方法在更广泛细胞类型或复杂疾病中的适用性 | 从单细胞RNA测序数据重建高分辨率基因调控网络 | 基因调控网络和基因间的潜在因果关系 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图自编码器, 图神经网络 | 基因表达数据 | 三种GRN类型的七种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 233 | 2025-10-06 |
Proliferation of Early and Mature Osteoblasts Is Required for Bone Fracture Healing in Mice
2025-May-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.27.656371
PMID:40501538
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研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型探索成骨细胞增殖在小鼠骨折愈合过程中的作用机制 | 首次证实成熟成骨细胞在骨折后仍具有增殖能力,并系统阐明了不同分化阶段成骨细胞增殖对骨痂形成的贡献 | 研究仅限于小鼠模型,人类骨折愈合机制可能存在差异 | 探究成骨细胞增殖在骨折愈合过程中的具体作用机制 | 基因工程小鼠模型(Col1-TK、Osx-CreERT2、Ocn-Cre、Dmp1-CreERT2与ROSA-TK杂交品系) | 骨生物学 | 骨折 | 单细胞RNA测序,基因工程小鼠模型,放射学评估 | NA | 基因表达数据,影像学数据 | 多个基因工程小鼠品系,具体数量未明确说明 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 234 | 2025-10-06 |
Quantitative molecular cartography of emergency myelopoiesis reveals conserved modules of hematopoietic activation
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.28.656712
PMID:40501607
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序开发了造血细胞注释方法和分化模型,揭示了应急髓系生成的多层次调控机制 | 开发了通用的细胞注释方法HemaScribe和造血分化定量模型HemaScape,发现了跨不同炎症挑战的髓系祖细胞应急响应模块 | NA | 阐明不同应急髓系生成诱导剂调控造血干细胞和祖细胞的分子机制 | 造血干细胞和祖细胞(HSPC) | 单细胞基因组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 定量分化模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 235 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing + TCR Sequencing Reveal the Proportion and Characteristics of Dual TCR T Cells in Tertiary Lymphoid Structures in Pemphigus
2025-May-24, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.05.008
PMID:40419016
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和TCR测序分析,揭示天疱疮三级淋巴结构中双TCR T细胞的比例和特征 | 首次发现天疱疮三级淋巴结构中含有更高比例的双TCR T细胞,并鉴定出独特的克隆扩增双TCR CXCL13+CD4+ T细胞亚群 | 样本量有限,仅比较了天疱疮、慢性特发性红皮病和健康对照皮肤组织 | 探索天疱疮病理皮肤组织中三级淋巴结构内淋巴细胞的起源、特征及其在发病机制中的作用 | 天疱疮患者、慢性特发性红皮病患者和健康对照者的皮肤组织 | 单细胞组学 | 天疱疮 | 单细胞RNA测序, TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据 | 天疱疮、慢性特发性红皮病和健康对照皮肤组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 236 | 2025-10-06 |
Single-cell profiling demonstrates the combined effect of wheeze phenotype and infant viral infection on airway epithelial development
2025-May-23, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adr9995
PMID:40408478
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了喘息表型和婴儿期病毒感染对2-3岁儿童鼻气道上皮细胞发育的联合影响 | 首次在预先设计的嵌套出生队列中,通过单细胞RNA测序系统比较了四种不同临床表型儿童的气道上皮发育特征 | 样本量相对有限,仅针对2-3岁儿童,且为观察性研究 | 探究喘息表型和呼吸道合胞病毒感染对气道上皮发育的影响机制 | 2-3岁儿童的鼻气道上皮细胞 | 单细胞组学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序,体外病毒感染实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自四种临床表型儿童的鼻气道上皮细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 237 | 2025-10-06 |
SCIG: Machine learning uncovers cell identity genes in single cells by genetic sequence codes
2025-May-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf431
PMID:40433981
|
研究论文 | 开发了一种名为SCIG的机器学习方法,通过遗传序列特征识别单细胞中的细胞身份基因 | 首次发现细胞身份基因具有独特的遗传序列特征,并开发了不依赖细胞间比较的识别方法 | NA | 识别单细胞中的细胞身份基因,以理解细胞分化、发育和疾病相关的细胞身份失调 | 人类内皮细胞图谱中的单细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据、遗传序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 238 | 2025-10-06 |
CellTypeAgent: Trustworthy cell type annotation with Large Language Models
2025-May-13, ArXiv
PMID:40463689
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研究论文 | 开发了一种结合大语言模型与数据库验证的可信细胞类型注释工具CellTypeAgent | 首次将大语言模型与数据库验证相结合用于细胞类型注释,有效减轻幻觉问题 | NA | 提高单细胞RNA测序分析中细胞类型注释的准确性和可靠性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 大语言模型 | 文本 | 9个真实数据集,包含36个组织的303种细胞类型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 239 | 2025-10-06 |
Randomized phase 2 trial of pembrolizumab alone or in combination with low dose chemotherapy for patients with non-small cell lung cancer and poor performance status
2025-May, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.lungcan.2025.108513
PMID:40203764
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研究论文 | 比较帕博利珠单抗单药或联合低剂量化疗治疗体能状态差的非小细胞肺癌患者的随机二期临床试验 | 首次在PS2患者群体中直接比较免疫单药与免疫联合低剂量化疗的疗效 | 样本量较小(43例患者),为二期临床试验需要更大规模验证 | 探索体能状态差的晚期非小细胞肺癌患者的最佳免疫治疗方案 | 东部肿瘤协作组体能状态评分为2的晚期非小细胞肺癌患者 | 临床肿瘤学 | 肺癌 | 流式细胞术,单细胞测序 | NA | 临床数据,血液样本分析数据 | 43例患者入组,40例可评估疗效 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 240 | 2025-10-06 |
BPIFB1 is a prognostic biomarker and mediated collagen synthesis in idiopathic pulmonary fibrosis
2025-May-30, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000042671
PMID:40441200
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研究论文 | 本研究探讨BPIFB1在特发性肺纤维化中的表达特征及其与肺功能和胶原合成的关联 | 首次发现BPIFB1在IPF中高表达于分化纤毛细胞和MUC5B阳性细胞,并揭示其与肺功能负相关及参与胶原合成的分子机制 | 血液BPIFB1表达在对照组和IPF组间无显著差异,具体分子通路机制仍需进一步实验验证 | 阐明BPIFB1在特发性肺纤维化中的预后价值和分子功能 | 特发性肺纤维化患者样本和基因表达数据 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序,转录组分析,功能富集分析 | Cox回归,Kaplan-Meier分析 | 基因表达数据,临床样本数据 | 来自Gene Expression Omnibus数据库的IPF样本数据 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |