单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 923 篇文献，本页显示第 221 - 240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-06-05 |
Transcriptional signatures of endothelial cells shape immune responses in cardiopulmonary health and disease
2025-May-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.191059
PMID:40401523
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review | 本文综述了心肺血管系统中内皮细胞（ECs）在健康和疾病状态下对免疫反应的调控作用 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了心肺血管系统中内皮细胞的异质性及其免疫调节特性 | NA | 探讨内皮细胞在心肺健康和疾病中的免疫调节功能 | 心肺血管系统中的内皮细胞 | 生物医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 222 | 2025-06-05 |
Prg4+ fibro-adipogenic progenitors in muscle are crucial for bone fracture repair
2025-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.14.654160
PMID:40462922
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研究论文 | 本文研究了肌肉中Prg4+纤维脂肪祖细胞在骨折修复中的关键作用 | 揭示了Prg4+纤维脂肪祖细胞在骨折修复中的新机制，即这些细胞可以从肌肉迁移到骨折部位并分化为软骨细胞、成骨细胞和骨细胞 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证；在膜内骨损伤模型中，Prg4+ FAPs的贡献显著低于骨折模型 | 探究肌肉细胞在骨折修复中的作用机制 | 小鼠模型中的Prg4+纤维脂肪祖细胞 | 骨科学 | 骨折 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 小鼠骨折模型和膜内骨损伤模型 | 基因表达数据和细胞定位数据 | 未明确说明具体样本数量，但使用了小鼠模型进行研究 |
| 223 | 2025-06-05 |
Single-Cell RNA Sequencing and Inferred Protein Activity Analysis Reveal a Distinct Tumor Phenotype in Early-Onset Colorectal Cancer Patients
2025-May-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.15.653154
PMID:40462964
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research paper | 通过单细胞RNA测序和推断的蛋白质活性分析，揭示了早发性结直肠癌患者的独特肿瘤表型 | 整合公共数据和内部临床样本，结合scRNA-seq和mIF技术，首次定义了EO-CRC中一个以前未被识别的上皮亚群，该亚群以TLR4和CCR5的高表达为特征 | 研究样本量可能有限，且仅比较了EO-CRC和LO-CRC，未涉及其他类型的结直肠癌 | 探究早发性结直肠癌（EO-CRC）与晚发性结直肠癌（LO-CRC）在分子和微环境驱动因素上的差异 | 早发性结直肠癌（EO-CRC）和晚发性结直肠癌（LO-CRC）患者 | digital pathology | colorectal cancer | scRNA-seq, mIF, VIPER | NA | RNA sequencing data, immunofluorescence data | 公共数据和内部临床样本（具体数量未提及） |
| 224 | 2025-06-05 |
High-Resolution Spatial Profiling of Microglia Reveals Proximity Associated Immunometabolic Reprogramming in Alzheimer's Disease
2025-May-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.16.654329
PMID:40462993
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研究论文 | 利用高分辨率空间转录组学技术揭示阿尔茨海默病中小胶质细胞的免疫代谢重编程 | 首次提供了跨物种、解剖区域和AD病理负担的小胶质细胞免疫代谢状态的高分辨率图谱 | 研究依赖于小鼠模型和人类尸检组织，可能无法完全反映活体情况 | 探究阿尔茨海默病病理标志物附近小胶质细胞基因表达与代谢特征的关系 | PS19、APP/PS1和5xFAD小鼠模型及人类死后背外侧前额叶皮层组织 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 高分辨率空间转录组学(Xenium平台) | 机器学习 | 空间转录组数据 | 三种小鼠模型和人类尸检组织 |
| 225 | 2025-06-05 |
PML1-Mediated Feedforward Loop Through PI3K and MAPK Axes Drives Endocrine Resistance
2025-May-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.15.653365
PMID:40463196
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研究论文 | 该研究揭示了PML1通过PI3K和MAPK信号轴驱动的正反馈环路在雌激素受体阳性乳腺癌内分泌抵抗中的作用 | 首次发现PML1蛋白是克服内分泌抵抗的关键治疗靶点，并阐明了其通过PI3K/MAPK信号轴形成正反馈环路的分子机制 | 研究主要基于细胞实验和部分临床样本分析，尚未进行大规模临床试验验证 | 探索雌激素受体阳性乳腺癌内分泌抵抗的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 雌激素受体阳性乳腺癌细胞及内分泌治疗耐药机制 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | scRNA-seq分析、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质水平数据 | 多种内分泌治疗耐药细胞系（包括4-羟基他莫昔芬、氟维司群、elacestrant和CDK4/6抑制剂耐药细胞） |
| 226 | 2025-06-05 |
Sex-dependent effects of peptidylarginine deiminases on neutrophil function and long-term outcomes after spinal cord injury
2025-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.08.652924
PMID:40463031
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research paper | 研究肽基精氨酸脱亚胺酶（PADs）对脊髓损伤后中性粒细胞功能及长期恢复的性别依赖性影响 | 首次描述了脊髓损伤后PAD介导的中性粒细胞功能中的性别差异，并强调了在临床前研究中纳入两性的重要性 | 未观察到PAD4缺失对运动恢复的影响，仅观察到对组织保留的性别依赖性效应 | 探讨PADs在脊髓损伤恢复中的作用及其性别差异 | 小鼠模型中的中性粒细胞功能及脊髓损伤后的恢复情况 | 神经科学 | 脊髓损伤 | scRNA-seq | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量，但使用了小鼠模型和公开的scRNA-seq数据 |
| 227 | 2025-06-05 |
Klf9 promotes the repair of myocardial infarction by regulating macrophage recruitment and polarization
2025-May-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.187072
PMID:40198141
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研究论文 | 研究揭示了Klf9通过调节巨噬细胞招募和极化促进心肌梗死后修复的机制 | 首次揭示了Klf9通过调控IFN-γ/STAT1信号通路影响巨噬细胞表型和功能，从而促进心肌梗死后修复 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证 | 探究Klf9在心肌梗死后巨噬细胞表型和功能调控中的作用 | 心肌梗死小鼠模型和巨噬细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | 野生型和Klf9敲除小鼠 |
| 228 | 2025-06-05 |
The brain-body circuit mediates acute stress-induced antiinflammatory reflex in bacterial cystitis by suppressing ILC2 activation
2025-May-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.189362
PMID:40100274
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研究论文 | 本研究揭示了急性应激通过脑-体回路抑制ILC2细胞激活，从而在细菌性膀胱炎中产生抗炎反射的机制 | 首次发现急性应激通过PVN脑区激活抑制ILC2细胞的促炎因子表达，揭示了脑-体回路在UTI治疗中的新机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类临床验证 | 探究心理应激如何通过脑-体回路调节膀胱感染的免疫反应 | 小鼠UTI模型中的PVN神经元和ILC2细胞 | 神经免疫学 | 尿路感染/膀胱炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),逆行标记技术 | 动物模型(小鼠) | 基因表达数据 | 未明确说明数量的小鼠UTI模型 |
| 229 | 2025-06-05 |
Target Screening and Single Cell Analysis of Diabetic Retinopathy and Hepatocarcinoma
2025-May, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70521
PMID:40293350
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析筛选糖尿病视网膜病变（DR）和肝细胞癌（HCC）之间的共享基因和通路，以揭示潜在的治疗靶点 | 首次将铁蛋白吞噬相关基因（FRHG）与DR和HCC联系起来，并利用机器学习模型验证了这些关键枢纽基因的诊断效能 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 探索DR和HCC之间的共同病理调控通路和潜在治疗靶点 | 糖尿病视网膜病变（DR）和肝细胞癌（HCC） | 生物信息学 | 糖尿病视网膜病变和肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、qRT-PCR | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | GEO数据集GSM7494113（HCC）、GSE209872和GSE160306（大鼠视网膜） |
| 230 | 2025-06-05 |
A Robust Kernel-Based Workflow for Niche Trajectory Analysis
2025-05, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401199
PMID:40411819
|
研究论文 | 提出了一种基于核的稳健工作流程，用于生态位轨迹分析，以模拟组织微环境的空间连续变化 | 提出了一种新的基于核的策略，将生态位的结构组成建模为基因表达空间中的连续函数，无需细胞类型注释 | NA | 克服现有生态位轨迹分析方法的局限性，提高稳健性和准确性 | 组织微环境 | 空间转录组学 | NA | 核方法 | NA | 空间转录组数据 | NA |
| 231 | 2025-06-04 |
TRAF3 as a potential diagnostic biomarker for recurrent pregnancy loss: insights from single-cell transcriptomics and machine learning
2025-May-31, BMC pregnancy and childbirth
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s12884-025-07742-6
PMID:40450232
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和机器学习技术，探索了复发性流产（RPL）的潜在机制，重点关注蜕膜自然杀伤细胞（dNK）和TRAF3基因的作用 | 首次将TRAF3基因作为RPL的诊断标志物和治疗靶点，并开发了一个包含TRAF3及其他九个基因的高效诊断模型 | 研究样本量未明确说明，且需要进一步验证TRAF3作为治疗靶点的有效性 | 探索RPL的潜在机制，并寻找诊断标志物和治疗靶点 | 复发性流产（RPL）患者和正常妊娠（NP）的蜕膜组织 | 数字病理学 | 复发性流产 | 单细胞转录组分析、机器学习、WGCNA、RT-PCR、免疫组化、分子对接分析 | 机器学习模型 | 转录组数据 | NA |
| 232 | 2025-06-04 |
Temporally resolved single-cell RNA sequencing reveals protective and pathological responses during herpes simplex virus CNS infection
2025-May-31, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03471-x
PMID:40450318
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了单纯疱疹病毒中枢神经系统感染期间的保护性和病理性反应 | 识别了一类具有抗病毒和促炎特性的病毒激活小胶质细胞亚群，并揭示了单核细胞在病毒感染脑部病理过程中的关键驱动作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，人类样本的验证尚未进行 | 探究HSV-1感染中枢神经系统时的免疫反应机制 | HSV-1感染的小鼠脑干组织 | 单细胞转录组学 | 单纯疱疹病毒感染 | 单细胞RNA测序, GeoMx空间转录组学 | NA | 转录组数据 | HSV-1感染的小鼠脑干组织样本 |
| 233 | 2025-06-04 |
Human endothelial cells promote a human neural stem cell type B phenotype via Notch signaling
2025-May-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60194-6
PMID:40447618
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research paper | 研究发现人类内皮细胞通过Notch信号通路促进人类神经干细胞B型表型 | 首次揭示了人类内皮细胞通过Notch信号通路促进神经干细胞B型表型的机制，并鉴定了S100A6和LeX作为人类B型细胞的标记物 | 研究主要基于体外实验，需要进一步在体内验证这些发现 | 探究人类内皮细胞与神经干细胞之间的相互作用机制 | 人类内皮细胞(hECs)和神经干细胞(hNSPCs) | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 基因表达数据 | 人类神经干细胞和内皮细胞样本 |
| 234 | 2025-06-04 |
Immunogenicity and cellular response of a herpes zoster virus gEgI fusion protein adjuvanted with CpG-emulsion in mice
2025-May-30, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03423-w
PMID:40448056
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研究论文 | 研究评估了一种新型疱疹病毒gEgI融合蛋白疫苗在小鼠中的免疫原性和细胞反应 | 开发了gEgI融合蛋白疫苗，并使用新型复合佐剂XUA09C，显示出比现有疫苗Shingrix更强的T细胞反应和免疫激活 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证效果 | 开发更安全、更易获取的带状疱疹疫苗 | 成年小鼠、VZV预免疫小鼠和老年小鼠 | 疫苗开发 | 带状疱疹 | 单细胞RNA测序 | NA | 免疫反应数据 | 多组小鼠（具体数量未提及） |
| 235 | 2025-06-04 |
Multiplex imaging reveals novel patterns of MRTFA/B activation in the breast cancer microenvironment
2025-May-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06559-3
PMID:40448123
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research paper | 该研究通过多重成像技术揭示了MRTFA/B在乳腺癌微环境中的新激活模式 | 首次在人类肿瘤中发现MRTFA/B在癌细胞中同时激活，并在不同组织学亚型和肿瘤微环境细胞中表现出不同的表达模式，特别是在非裔美国患者的转移性肿瘤中MRTFA表达升高 | 研究主要基于组织微阵列和公共数据库分析，可能受到样本来源和数据质量的限制 | 评估MRTFA/B转录因子对乳腺癌及其肿瘤微环境细胞的致瘤和转移影响 | 乳腺癌组织微阵列中的肿瘤细胞和肿瘤微环境细胞（内皮细胞和抗原呈递细胞） | digital pathology | breast cancer | multiplexed immunofluorescence, bioinformatics analysis, single-cell RNA sequencing | NA | image, RNA-seq data | 两个乳腺癌组织微阵列（CHTN_BrCaProg3和TMA BCWG UIC-001-TMA），包含来自芝加哥西区和南区患者的原发肿瘤和淋巴结转移样本 |
| 236 | 2025-06-04 |
Ocular immune privilege in action: The living eye imposes unique regulatory and anergic gene signatures on uveitogenic T cells
2025-May-30, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115780
PMID:40450686
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research paper | 该研究探讨了眼部免疫特权如何通过独特的调节和无能基因签名影响葡萄膜炎原性T细胞 | 使用单细胞转录组学和功能验证揭示了Tregs和无能细胞的独特表型，以及它们从共同增殖前体平行而非顺序分化的轨迹 | 研究主要基于体内免疫特权模型，可能不完全反映人类眼部免疫反应的全部复杂性 | 揭示眼部免疫特权的分子机制，为自身免疫效应细胞的沉默或癌症、疫苗接种或慢性感染中T细胞无反应性的逆转提供策略 | 视网膜特异性T细胞，特别是Foxp3调节性T细胞（Tregs）和无能T细胞 | 免疫学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 237 | 2025-06-04 |
CCR5-mediated dynamic maintenance of resident memory T cells in the respiratory tract
2025-May-30, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2920-y
PMID:40459692
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研究论文 | 本研究探讨了CCR5介导的呼吸道组织中驻留记忆T细胞的动态维持机制 | 通过条形码谱系追踪和单细胞转录组分析，发现了一种独特的CD69CD103病毒特异性CD8 T细胞群体，并揭示了CCR5-CCL5轴在促进肺到引流淋巴结迁移中的作用 | 研究主要关注流感感染模型，可能不适用于其他病原体或组织 | 阐明呼吸道组织中驻留记忆T细胞的维持机制 | CD8 T细胞在呼吸道和引流淋巴结中的动态分布和功能 | 免疫学 | 流感 | 条形码谱系追踪, 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及小鼠模型中的T细胞分析 |
| 238 | 2025-06-04 |
Single-cell analyses identify monocyte gene expression profiles that influence HIV-1 reservoir size in acutely treated cohorts
2025-May-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59833-9
PMID:40442100
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，研究宿主基因表达对HIV-1病毒库大小的影响 | 首次发现CD14+单核细胞活性和IL1B表达与HIV-1病毒库大小的负相关关系，并揭示了IL1B通过激活NF-κB影响病毒库的机制 | 样本量较小（14名男性），且研究对象仅限于急性感染期开始ART治疗的男性 | 研究宿主基因表达对HIV-1病毒库大小的影响 | 急性感染期开始ART治疗的男性HIV-1感染者 | 生物医学 | HIV/AIDS | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），完整前病毒DNA检测（IPDA®） | NA | RNA测序数据 | 14名男性（初始队列）和38名男性（验证队列） |
| 239 | 2025-06-04 |
In vivo CRISPRi screen reveals lncRNA portfolio crucial for cutaneous squamous cell carcinoma tumor growth
2025-May-27, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.04.038
PMID:40441291
|
研究论文 | 本研究通过CRISPRi筛选揭示了在皮肤鳞状细胞癌（cSCC）肿瘤生长中起关键作用的长链非编码RNA（lncRNA）组合 | 首次通过伪批量分析单细胞测序数据确定了在角质形成细胞亚群中特异性表达的lncRNA组合，并通过CRISPR干扰筛选和异种移植模型验证了这些lncRNA对cSCC生长的影响 | 研究主要基于体外和异种移植模型，未涉及人体临床试验 | 揭示lncRNA在皮肤鳞状细胞癌肿瘤生长中的作用 | 皮肤鳞状细胞癌（cSCC） | 癌症研究 | 皮肤癌 | 单细胞测序、CRISPR干扰筛选 | 异种移植模型 | 测序数据 | 来自正常和cSCC人类皮肤组织的单细胞测序数据 |
| 240 | 2025-06-04 |
INBRX-106: a hexavalent OX40 agonist that drives superior antitumor responses via optimized receptor clustering
2025-May-21, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011524
PMID:40404202
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research paper | 本文介绍了一种新型六价OX40激动剂INBRX-106，通过优化受体聚集增强抗肿瘤T细胞反应 | 开发了六价OX40激动剂INBRX-106，相比传统二价激动剂能更有效地诱导受体聚集和多聚体结合，从而增强信号传导和T细胞激活 | 虽然在小鼠模型和临床I/II期试验中显示出良好效果，但还需要更大规模的临床试验验证其安全性和有效性 | 开发更有效的OX40靶向免疫疗法，克服传统二价激动剂的局限性 | OX40受体和T细胞 | 免疫疗法 | 癌症 | NF-kß报告基因检测、共聚焦显微镜、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 实验数据、临床样本数据 | 小鼠肿瘤模型、体外人类样本、临床I/II期试验(NCT04198766)的患者样本 |