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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-10-05 |
Single-cell analyses identify monocyte gene expression profiles that influence HIV-1 reservoir size in acutely treated cohorts
2025-May-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59833-9
PMID:40442100
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现单核细胞IL1B基因表达与HIV-1病毒库大小呈负相关 | 首次通过单细胞RNA测序揭示单核细胞IL1B表达与HIV-1病毒库大小的负相关性及其潜在机制 | 样本量较小且仅包含男性患者,研究结果需在更广泛人群中验证 | 研究宿主基因表达对HIV-1病毒库大小的影响 | 急性感染期开始ART治疗的HIV-1感染者外周血细胞 | 单细胞基因组学 | HIV/AIDS | 单细胞RNA测序,完整前病毒DNA检测 | 差异表达分析,相互作用建模 | 单细胞RNA测序数据 | 两个队列:14名男性(发现队列)和38名男性(验证队列) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 222 | 2025-10-05 |
WFDC3 identified as a prognostic and immune biomarker in pancreatic cancer
2025-May-08, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2025.12444
PMID:40350979
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证,发现WFDC3在胰腺癌中高表达并促进肿瘤转移和免疫逃逸 | 首次系统揭示WFDC3在胰腺癌中的促癌功能及其通过诱导上皮间质转化和抑制T细胞毒性介导免疫逃逸的机制 | WFDCs在肿瘤进展中的具体作用机制仍需进一步深入研究 | 探究WFDC家族成员在胰腺癌发生发展中的作用及其临床意义 | 胰腺癌组织和细胞 | 生物信息学 | 胰腺癌 | RNA测序, 功能富集分析, CCK-8增殖实验, EdU检测, transwell实验, 免疫荧光染色, 流式细胞术, LDH释放实验, Western blotting, qRT-PCR | LASSO回归模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | TCGA和GEO数据库中的胰腺癌数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 223 | 2025-10-05 |
INLAomics for Scalable and Interpretable Spatial Multiomic Data Integration
2025-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.02.651831
PMID:40654897
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研究论文 | 开发INLAomics框架用于空间多组学数据的可扩展和可解释集成分析 | 提出基于多元分层贝叶斯框架的空间多组学集成方法,克服现有方法忽略空间背景和可解释性差的局限 | 未提及具体的数据规模限制或计算资源需求 | 开发可扩展且可解释的空间多组学数据集成方法 | 空间转录组数据和基于抗体的蛋白质组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,抗体蛋白质组学 | 多元分层贝叶斯框架 | 空间多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞多组学 | NA | NA |
| 224 | 2025-10-05 |
Spatially resolved transcriptomic profiling for glomerular and tubulointerstitial gene expression in C3 glomerulopathy
2025-May, Clinical kidney journal
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/ckj/sfaf139
PMID:40416397
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研究论文 | 本研究利用空间转录组技术分析C3肾小球病的肾小球和肾小管间质基因表达特征 | 首次应用空间转录组技术对C3肾小球病进行亚结构特异性基因表达谱分析 | 样本量较小(仅3例C3G病例),需要更大规模研究验证 | 探究C3肾小球病的转录组特征和病理机制 | 人类肾脏活检标本(C3G患者、供体肾脏和其他肾小球肾炎患者) | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 3例C3G病例、7例供体对照、41例其他肾小球肾炎疾病对照 | NA | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx Digital Spatial Profiler与福尔马林固定石蜡包埋肾脏活检标本 |
| 225 | 2025-10-05 |
Heterogeneity of mature oligodendrocytes in the central nervous system
2025-May-01, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00055
PMID:38934385
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综述 | 本文系统总结了成熟少突胶质细胞在中枢神经系统中的异质性特征 | 整合了从20世纪早期研究到现代单细胞技术的证据,首次全面梳理成熟少突胶质细胞的功能和分子多样性 | 细胞亚型分类存在简化风险,且现有研究受限于时间分辨率和技术手段 | 探讨成熟少突胶质细胞在中枢神经系统中的异质性特征 | 成熟少突胶质细胞 | 神经科学 | 多发性硬化症,阿尔茨海默病,精神疾病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学,单细胞蛋白质组学 | NA | 转录组数据,形态学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 226 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptome of retinal myeloid cells in response to transplantation of human neurons reveals reversibility of microglial activation
2025-May-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.16.654622
PMID:40475635
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了视网膜移植后人源神经元引发的髓系细胞激活机制及其可逆性 | 首次在视网膜移植模型中揭示微胶质细胞激活的双向可逆轨迹 | 仅观察移植后3天的早期反应,缺乏长期动态监测数据 | 探究视网膜移植后宿主髓系细胞的激活机制和异质性 | 小鼠视网膜中的髓系细胞(微胶质细胞/巨噬细胞) | 单细胞转录组学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序,RNA Velocity分析,流式细胞分选,免疫荧光染色 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据,图像数据 | 多个视网膜样本,每个样本最多10,000个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 227 | 2025-10-05 |
Single-cell dynamics of breakthrough toxicities after anakinra prophylaxis for axicabtagene ciloleucel in lymphoma
2025-May-13, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024015161
PMID:39928957
|
研究论文 | 本研究评估阿那白滞素预防性用药对淋巴瘤患者接受CAR-T细胞治疗后突破性毒性的效果,并通过单细胞RNA测序分析毒性发生的分子机制 | 首次结合阿那白滞素预防性用药与单细胞RNA测序技术,揭示CAR-T治疗相关突破性毒性的分子机制,特别是IFN-γ通路的关键作用 | 每日一次预防性阿那白滞素对大多数患者不足以预防需要住院治疗的毒性反应 | 评估阿那白滞素预防CAR-T细胞治疗相关毒性的效果,并探索突破性毒性的分子机制 | 接受axicabtagene ciloleucel治疗的大细胞淋巴瘤患者 | 单细胞测序分析 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,细胞因子数据 | 临床试验患者群体(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 228 | 2025-10-05 |
Characterization of hyperoxia-induced senescent lung macrophages in neonatal mice
2025-May-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.09.652066
PMID:40654880
|
研究论文 | 本研究通过重新分析单细胞RNA测序数据,表征了新生小鼠高氧诱导的衰老肺巨噬细胞特征 | 首次系统性地表征了高氧诱导的衰老肺巨噬细胞的异质性、组织分布和代谢失调特征 | 研究基于小鼠模型,结果向人类早产儿支气管肺发育不良的转化需要进一步验证 | 研究高氧暴露对新生小鼠肺巨噬细胞衰老的影响及其特征 | 新生小鼠的肺组织细胞 | 单细胞转录组学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | GSE207866数据集中的小鼠肺组织细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 229 | 2025-10-05 |
A novel frameshift mutation in Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 1 (PIK3R1) causes immunodeficiency and Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS)
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.655625
PMID:40568112
|
研究论文 | 本研究通过鉴定PIK3R1基因的新型移码突变,揭示了其在免疫缺陷和肌萎缩侧索硬化症发病机制中的作用 | 首次报道PIK3R1基因c.1710dup移码突变导致单倍体不足,并通过iPSC模型证明其对神经元功能和存活的影响 | 研究基于单例患者样本,需要更大样本量验证 | 探究PIK3R1基因突变在免疫缺陷和神经系统疾病中的致病机制 | 携带PIK3R1 c.1710dup突变的常见变异型免疫缺陷患者及其iPSC衍生细胞模型 | 遗传学与神经科学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞RNA测序,iPSC技术,脑类器官培养 | iPSC衍生运动神经元和脑类器官模型 | 基因测序数据,单细胞转录组数据,细胞功能数据 | 1例患者及其iPSC衍生细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 230 | 2025-10-05 |
Trajectories of macrophage ontogeny and reprogramming in cancer
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112498
PMID:40475851
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了肿瘤相关巨噬细胞的发育轨迹及其在癌症免疫治疗中的重编程机制 | 首次通过伪时间分析揭示了巨噬细胞从免疫刺激状态向免疫抑制状态的发育轨迹,并发现特定基因失活可阻断这一过程 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探索肿瘤相关巨噬细胞的发育轨迹及其在免疫治疗中的作用机制 | 肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 小鼠癌症模型和癌症患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 231 | 2025-10-06 |
A Multimodal Spatial and Epigenomic Atlas of Human Adult Lung Topography
2025-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.655666
PMID:40475598
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研究论文 | 构建了人类成人肺部的多模态空间和表观基因组图谱 | 整合了snRNA-seq和SNARE-seq2技术,首次在相同细胞核内同时分析染色质可及性和基因表达,并通过MERFISH空间转录组学定位了25种细胞群体 | 仅使用11名健康成年人的样本,样本规模相对有限 | 开发高分辨率肺部疾病易感空间生态位参考图谱 | 人类成人肺部组织 | 空间转录组学 | 肺部疾病 | snRNA-seq, SNARE-seq2, MERFISH, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞核RNA测序, 染色质可及性, 空间转录组, 蛋白质标记 | 49个肺组织块,746,047个细胞核,来自11名健康成年人 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | SNARE-seq2(同时检测染色质可及性和基因表达), MERFISH(空间转录组学) |
| 232 | 2025-10-06 |
Microglia-driven inflammation induces progressive tauopathies and synucleinopathies
2025-May, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01450-z
PMID:40307569
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现小胶质细胞驱动的炎症能够独立引发并传播tau蛋白病和突触核蛋白病 | 首次证明小胶质细胞驱动的炎症足以独立引发神经退行性疾病的全套病理特征,并揭示其跨脑区传播机制 | 研究基于小鼠模型,人类疾病中的直接相关性仍需验证 | 探究小胶质细胞驱动的炎症在神经退行性疾病发病机制中的作用 | 小鼠模型和体外培养的小胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病,帕金森病 | 单细胞RNA测序,细胞移植 | NA | 基因表达数据,行为数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 233 | 2025-10-06 |
Interleukin-11 expressed in the polyp-enriched fibroblast subset is a potential therapeutic target in Peutz-Jeghers syndrome
2025-05, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6408
PMID:40070038
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定Peutz-Jeghers综合征息肉中富集的成纤维细胞亚群,并发现IL-11是该疾病潜在治疗靶点 | 首次识别PJS息肉富集的隐窝顶部成纤维细胞(pCTF)亚群,并证实IL-11在成纤维细胞重编程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究Peutz-Jeghers综合征息肉形成的细胞机制和潜在治疗靶点 | PJS小鼠模型息肉和患者息肉样本 | 单细胞生物学 | Peutz-Jeghers综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | PJS小鼠模型和患者息肉样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 234 | 2025-10-06 |
Cancer-associated fibroblast heterogeneity in chordoma†
2025-05, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6420
PMID:40088426
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评论 | 本文综述了脊索瘤中癌症相关成纤维细胞(CAF)异质性的最新研究进展 | 定义了脊索瘤中的炎症性CAF亚型(iCAF),该亚型与不良预后和肿瘤侵袭相关 | 区分CAF调控肿瘤表型中的相关性和因果关系仍面临重大挑战 | 研究脊索瘤中癌症相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤进展中的作用 | 脊索瘤肿瘤微环境中的细胞组成,特别是癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 脊索瘤 | 单细胞转录组学,空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 235 | 2025-10-06 |
Immune signatures of megakaryocytes in persistent inflammation-immunosuppression and catabolism syndrome
2025-May-30, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025087
PMID:40443348
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析持续性炎症-免疫抑制和分解代谢综合征患者中巨核细胞的免疫特征 | 首次在PICS中鉴定出五个巨核细胞亚群并揭示其通过CCL5表达和细胞间相互作用调节免疫稳态的新机制 | 样本量较小(11例患者),需要更大规模研究验证 | 探究巨核细胞在PICS中的免疫学作用和分子特征 | 巨核细胞 | 单细胞生物学 | 脓毒症相关免疫功能障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 11例患者(6例PICS, 5例脓毒症)和5例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 236 | 2025-10-06 |
Convergent musk biosynthesis across host and microbiota in musk deer and muskrat
2025-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法揭示了麝香鹿和麝鼠在麝香生物合成中的多层次趋同进化机制 | 首次发现不同哺乳动物物种间在麝香生物合成中从分子通路到微生物群落的多层次趋同进化现象 | 研究仅聚焦于两个物种,可能无法完全代表所有麝香生产动物的多样性 | 探究哺乳动物气味腺中介导趋同麝香生产的机制基础 | 森林麝香鹿和麝鼠的麝香分泌腺体 | 多组学整合分析 | NA | 单细胞RNA测序,宏基因组学,代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据,宏基因组数据,代谢物数据 | 两个物种的麝香腺体组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,宏基因组测序 | NA | NA |
| 237 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals alterations in the ovarian immune microenvironment regulated by 17β-estradiol in neonatal mice
2025-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了17β-雌二醇对新生小鼠卵巢免疫微环境的调控作用 | 首次全面表征新生小鼠卵巢免疫微环境对雌激素的敏感性,发现E2治疗可诱导巨噬细胞从M1向M2表型转换 | 研究仅使用C57BL/6J品系新生小鼠,结果可能不适用于其他发育阶段或品系 | 探究雌激素在卵巢中的免疫调节功能 | 新生小鼠卵巢组织 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | C57BL/6J新生小鼠卵巢样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 238 | 2025-10-06 |
Differential memory enrichment of cytotoxic CD4 T cells in Parkinson's disease patients reactive to α-synuclein
2025-May-14, NPJ Parkinson's disease
DOI:10.1038/s41531-025-00981-6
PMID:40368950
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研究论文 | 本研究探讨帕金森病患者中对α-突触核蛋白有反应的细胞毒性CD4 T细胞的记忆富集差异 | 首次发现CELSR2在PD患者CD4效应记忆T细胞中高表达,并揭示Granulysin CD4细胞毒性T细胞在PD_R患者中减少 | 样本量有限,未涵盖所有PD患者亚型,机制研究尚不完善 | 深入理解对α-突触核蛋白有反应的帕金森病患者T细胞亚群的病理变化 | 帕金森病患者和健康对照者的外周血T细胞 | 免疫学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 帕金森病患者和健康对照者(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 239 | 2025-10-06 |
Sex-dependent effects of peptidylarginine deiminases on neutrophil function and long-term outcomes after spinal cord injury
2025-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.08.652924
PMID:40463031
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研究论文 | 本研究探讨肽酰精氨酸脱亚氨酶对脊髓损伤后中性粒细胞功能和长期预后的性别依赖性影响 | 首次描述脊髓损伤后PAD介导的中性粒细胞功能存在性别差异,强调临床前研究需纳入两性样本的重要性 | 未观察到PAD4缺失对运动功能恢复的影响,组织保护效应存在性别差异但机制尚不明确 | 探究PADs在脊髓损伤恢复中的作用及性别差异 | 小鼠脊髓损伤模型中的中性粒细胞功能 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序,基因敲除模型,pan-PAD抑制剂处理 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,组织学数据,行为学数据 | 未明确样本数量的小鼠实验模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 240 | 2025-10-06 |
BDNF-GABA signaling in astrocytes: enhancing neural repair after SCI through MSC therapies
2025-05, Spinal cord
IF:2.1Q1
DOI:10.1038/s41393-025-01077-x
PMID:40229538
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研究论文 | 通过生物信息学分析探索星形胶质细胞在脊髓损伤修复中的作用机制及间充质干细胞治疗的潜在价值 | 首次整合单细胞转录组、空间转录组和bulk RNA-seq数据,系统揭示BDNF调控的GABA信号通路在星形胶质细胞介导的神经修复中的关键作用 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 探索脊髓损伤后星形胶质细胞的变化及其在间充质干细胞治疗中的作用机制 | 星形胶质细胞、间充质干细胞、诱导多能干细胞 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | scRNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq, GSEA | NA | 转录组数据 | 来自GEO数据库的公共数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |