单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 813 篇文献，本页显示第 201 - 220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 201 | 2025-10-06 |
Dynamic Expression and Functional Implications of the Cell Polarity Gene, Dchs1, During Cardiac Development
2025-05-24, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14110774
PMID:40497950
|
研究论文 | 本研究通过构建Dchs1-HA敲入小鼠模型，揭示了Dchs1在心脏发育过程中的动态表达模式和功能意义 | 首次系统阐明Dchs1在心脏发育中的时空表达模式及其在非心肌细胞间的极性延伸和细胞间通讯作用 | 研究主要基于小鼠模型，在人类心脏发育中的直接应用仍需进一步验证 | 探究Dchs1在心脏发育过程中的表达模式和功能机制 | Dchs1-HA敲入小鼠模型的心脏组织 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 免疫组织化学、Western blotting、单细胞转录组学 | NA | 图像数据、蛋白质印迹数据、单细胞转录组数据 | 不同发育阶段的小鼠心脏组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 202 | 2025-10-06 |
Tyrosinase in melanoma inhibits anti-tumor activity of PD-1 deficient T cells
2025-May-15, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02237-4
PMID:40375241
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9技术敲除黑色素瘤中的酪氨酸酶，发现其能抑制T细胞的抗肿瘤活性，并揭示了酪氨酸酶缺失可逆转免疫冷肿瘤表型 | 首次发现酪氨酸酶在黑色素瘤中抑制T细胞抗肿瘤活性，并证明其缺失可增强PD-1缺陷T细胞的抗肿瘤效果 | 研究基于小鼠B16黑色素瘤模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探索黑色素瘤抵抗免疫治疗的分子机制 | B16黑色素瘤细胞、T细胞、PD-1缺陷小鼠 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 小鼠黑色素瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 203 | 2025-10-06 |
Identification of an Immune-Related Gene Signature for Prognostic Prediction in Glioblastoma: Insights from Integrated Bulk and Single-Cell RNA Sequencing
2025-May-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17111799
PMID:40507280
|
研究论文 | 本研究通过整合分析bulk和单细胞RNA测序数据，识别了一个与胶质母细胞瘤预后相关的五基因免疫特征 | 首次结合bulk和单细胞RNA测序数据构建胶质母细胞瘤巨噬细胞相关预后特征，揭示了该特征在肿瘤相关巨噬细胞中的特异性表达模式 | 研究样本量有限，需要进一步实验验证基因特征的功能机制 | 识别与胶质母细胞瘤预后和免疫调控相关的基因特征 | 胶质母细胞瘤患者样本 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | 预后特征模型 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 204 | 2025-10-06 |
TLR7 responses in glomerular macrophages accelerate the progression of glomerulonephritis in NZBWF1 mice
2025-05-21, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxaf005
PMID:40401698
|
研究论文 | 本研究探讨了肾小球巨噬细胞中TLR7信号在加速NZBWF1小鼠肾小球肾炎进展中的作用机制 | 首次揭示肾小球巨噬细胞中TLR7信号通过诱导CD31表达、IL-1β产生和补体因子B表达等机制直接促进肾小球肾炎进展 | 研究仅限于NZBWF1小鼠模型，未在人类样本中验证 | 阐明巨噬细胞TLR7信号在肾小球肾炎发病机制中的具体作用 | NZBWF1小鼠模型的肾小球巨噬细胞 | 免疫学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序，基因敲除技术 | TLR7基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，蛋白质表达数据 | NZBWF1小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 205 | 2025-10-06 |
scValue: value-based subsampling of large-scale single-cell transcriptomic data for machine and deep learning tasks
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf279
PMID:40515392
|
研究论文 | 提出了一种基于数据价值的大规模单细胞转录组数据子采样方法scValue，用于优化机器学习和深度学习任务性能 | 使用随机森林模型的袋外估计对单个细胞进行'数据价值'排序，优先选择高价值细胞，并为数据价值变异度高的细胞类型分配更多代表性 | NA | 开发高效的大规模单细胞转录组数据子采样方法，以提升下游机器学习和深度学习任务性能 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机森林, 多种ML/DL模型 | 单细胞转录组数据 | 16个公共数据集，从数万到数百万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 206 | 2025-10-06 |
Longitudinal single-cell analysis reveals RUNX1T1 as an early driver in treatment-induced neuroendocrine transdifferentiation
2025-May-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.14.653660
PMID:40463134
|
研究论文 | 通过纵向单细胞转录组测序揭示RUNX1T1是治疗诱导神经内分泌转分化的早期驱动因子 | 首次发现t-NEPC发展过程中的早期中间过渡细胞状态，并鉴定RUNX1T1作为NEPC转分化的关键转录调节因子 | 研究基于单一PDX模型（LTL331/331R），需要更多模型验证 | 探究治疗诱导神经内分泌前列腺癌的时序动态和分子驱动机制 | 前列腺癌患者来源异种移植模型（PDX） | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7个时间点的纵向样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 207 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics highlights B cells as key contributors to a complete and durable response to chemo-immunotherapy in a patient with resectable NSCLC
2025-May-11, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011563
PMID:40350207
|
研究论文 | 通过空间转录组学等多组学技术分析一例可切除NSCLC患者对化疗免疫治疗的完全病理反应机制 | 首次通过整合空间转录组学、单细胞RNA测序和血清蛋白质组学揭示B淋巴细胞在介导肿瘤完全消退中的关键作用 | 单病例研究，样本量有限，需要更大规模研究验证 | 探索可切除非小细胞肺癌患者对化疗免疫治疗产生完全病理反应的免疫机制 | 一例ALK/EGFR野生型可切除NSCLC伴同步脑转移患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据 | 1例患者（治疗前脑转移灶和治疗后原发肺肿瘤组织） | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 208 | 2025-10-06 |
Hepatic stellate cell heterogeneity: Functional aspects and therapeutic implications
2025-May-08, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001386
PMID:40338161
|
综述 | 本文综述了肝星状细胞在健康和疾病状态下的异质性及其功能作用 | 整合单细胞测序和空间转录组学等多组学数据，系统阐述肝星状细胞亚群及其在肝脏稳态和疾病中的双向通讯机制 | NA | 探讨肝星状细胞异质性对肝脏稳态和疾病的贡献及其治疗靶向潜力 | 肝星状细胞及其与肝细胞、内皮细胞、巨噬细胞/单核细胞、T细胞和肿瘤细胞的相互作用 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 临床数据, 临床前数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 209 | 2025-10-06 |
Revolutionizing cancer treatment: Navigating the intricate landscape of cellular signaling networks
2025-May, Advances in clinical and experimental medicine : official organ Wroclaw Medical University
IF:2.1Q3
DOI:10.17219/acem/205024
PMID:40418208
|
征稿启事 | 探讨癌症治疗中细胞信号网络的可塑性及其对治疗抵抗的影响，并征集相关前沿研究 | 整合单细胞多组学、空间转录组学和人工智能网络建模等创新技术解析肿瘤适应性机制 | NA | 解析癌症信号网络的动态重编程机制并开发适应性疗法 | 肿瘤细胞、非编码基因组、肿瘤微环境 | 系统生物学 | 癌症 | 单细胞多组学、空间转录组学、AI网络建模 | 人工智能网络模型 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 210 | 2025-10-06 |
scDown: A Pipeline for Single-Cell RNA-Seq Downstream Analysis
2025-May-30, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26115297
PMID:40508102
|
研究论文 | 开发了一个名为scDown的单细胞RNA测序下游分析流程，用于自动化细胞分化和细胞通讯分析 | 整合了多种下游分析工具，能够同时处理Seurat和Scanpy注释的数据，并在罕见疾病研究中发现了新的神经元炎症信号特征 | 仅支持单细胞RNA测序数据，功能集中于细胞分化和通讯分析 | 开发自动化单细胞RNA测序下游分析流程 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 已发表数据集（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 211 | 2025-10-06 |
Modeling the Transitional Phase of Epithelial Cells Reveals Prognostic and Therapeutic Targets in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2025-May-29, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17111813
PMID:40507294
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别胰腺导管腺癌中处于过渡期的上皮细胞亚群，并构建基因风险评分模型用于预后预测 | 首次识别并表征了PDAC进展过程中经历过渡期的高度增殖上皮细胞亚群，揭示了基质-上皮细胞通过胶原信号传导的相互作用机制 | 研究样本量有限，需要更大规模队列验证模型的临床适用性 | 探索胰腺导管腺癌进展过程中的关键转折点，寻找预后标志物和治疗靶点 | 胰腺导管腺癌患者样本中的上皮细胞和肿瘤微环境细胞 | 单细胞基因组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, qPCR, Lasso Cox回归分析 | Lasso Cox回归模型 | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 212 | 2025-10-06 |
Single-Cell Sequencing: An Emerging Tool for Biomarker Development in Nuclear Emergencies and Radiation Oncology
2025-May-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17111801
PMID:40507282
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在核应急和放射肿瘤学中生物标志物开发的应用前景 | 强调单细胞测序技术相比传统批量测序在识别辐射敏感和剂量响应生物标志物方面的独特优势，能够提供细胞水平的高分辨率信息 | 单细胞RNA测序技术在辐射研究领域仍处于新兴阶段，技术应用尚未成熟 | 探讨辐射剂量测定方法和辐射暴露相关生物标志物的开发 | 辐射暴露相关的生物标志物和细胞特征 | 生物信息学 | 放射相关疾病 | 单细胞测序，下一代测序 | NA | 基因组数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 213 | 2025-10-06 |
Potential Role of SESN3 in Linking Heart Failure with Preserved Ejection Fraction and Chronic Obstructive Pulmonary Disease via Autophagy Dysregulation
2025-May-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26115174
PMID:40507985
|
研究论文 | 本研究探讨SESN3通过自噬失调在射血分数保留型心力衰竭和慢性阻塞性肺疾病之间的潜在联系机制 | 首次发现SESN3介导的自噬失调可能是HFpEF和COPD的共同发病机制，揭示了HFpEF可能是一种涉及多器官的系统性疾病 | 研究主要基于动物模型和生物信息学分析，需要在人类临床样本中进一步验证 | 识别HFpEF和COPD之间的共同致病机制并验证其系统性作用 | HFpEF心脏组织和COPD肺组织的转录组数据，以及HFpEF小鼠模型的心脏和肺组织 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 转录组分析，差异表达基因分析，加权基因共表达网络分析，LASSO回归，免疫细胞浸润分析，单细胞RNA测序，免疫荧光，定量PCR，Western blotting，透射电子显微镜 | LASSO回归模型 | 转录组数据，单细胞RNA测序数据，实验数据 | HFpEF和COPD转录组数据集，HFpEF小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 214 | 2025-10-06 |
Molecular Characterization of Atypical Fibroxanthoma and Pleomorphic Dermal Sarcoma
2025-May-27, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17111785
PMID:40507266
|
综述 | 本文综述非典型纤维黄色瘤和多形性真皮肉瘤的分子特征研究进展 | 首次整合单细胞RNA测序数据并鉴定新生物标志物 | 因肿瘤罕见性导致研究样本量有限 | 阐明AFX和PDS的分子驱动机制和预后生物标志物 | 非典型纤维黄色瘤和多形性真皮肉瘤肿瘤组织 | 数字病理学 | 皮肤肉瘤 | 外显子组测序, bulk RNA测序, 靶向DNA测序, DNA甲基化分析, 拷贝数分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 215 | 2025-10-06 |
Clinical efficacy and chemoresistance analysis of precision neoadjuvant chemotherapy for borderline resectable pancreatic cancer: a prospective, single-arm pilot study
2025-May-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002342
PMID:40146255
|
研究论文 | 本研究评估基于患者来源类器官（PDOs）的新辅助化疗在临界可切除胰腺癌中的临床疗效和安全性 | 首次将PDOs药物敏感性测试应用于BRPC患者的新辅助化疗方案调整，并通过单细胞RNA测序分析吉西他滨耐药机制 | 单臂试点研究，样本量较小（19例），缺乏对照组 | 评估基于PDOs的新辅助化疗在临界可切除胰腺癌中的疗效和安全性 | 临界可切除胰腺癌（BRPC）患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），患者来源类器官（PDOs）培养，药物敏感性测试 | NA | 基因表达数据，临床数据 | 25例筛查患者，19例符合条件，16例接受手术切除 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 216 | 2025-10-06 |
Novel PAP-targeted CAR-T therapy enhances antitumor efficacy through CoupledCAR approach
2025-May-31, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-011238
PMID:40449956
|
研究论文 | 本研究开发了靶向前列腺酸性磷酸酶(PAP)的CAR-T疗法，并通过CoupledCAR方法增强抗肿瘤效果 | 首次证明PAP是前列腺癌CAR-T治疗的可行靶点，开发了无需肿瘤抗原即可扩增CAR-T细胞的CoupledCAR平台技术 | 研究主要聚焦于前列腺癌，对其他实体瘤的适用性需要进一步验证 | 开发针对实体瘤的新型CAR-T治疗方法 | 前列腺癌细胞和CAR-T细胞 | 免疫治疗 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq), 免疫组织化学染色, 抗体筛选 | CAR-T细胞疗法 | 基因表达数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 217 | 2025-10-06 |
Chaperonin containing TCP1 subunit 5 as a novel pan-cancer prognostic biomarker for tumor stemness and immunotherapy response: insights from multi-omics data, integrated machine learning, and experimental validation
2025-May-27, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04071-7
PMID:40423850
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据和机器学习方法，揭示了CCT5作为泛癌预后生物标志物在肿瘤干细胞性和免疫治疗反应中的作用 | 首次系统性地分析了CCT5在33种癌症类型中的表达模式，并开发了基于CCT5共表达基因的机器学习模型来预测免疫检查点阻断治疗反应 | 研究结果需要进一步的实验验证，且样本量在某些癌症类型中可能有限 | 探索CCT5在泛癌进展中的生物学功能及其作为免疫治疗反应预测标志物的潜力 | 33种癌症类型的肿瘤组织和细胞 | 机器学习 | 泛癌分析 | 多组学分析、机器学习、单细胞RNA测序、空间转录组学 | 机器学习模型 | RNA-seq数据、单细胞RNA-seq数据、空间转录组数据 | 23个免疫检查点阻断队列，共1394个样本，涵盖8种癌症类型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 218 | 2025-10-06 |
Analyses of single-cell RNA sequencing uncover the role of intratumoral Helicobacter pylori in shaping tumor progression and immunity in gastric cancer
2025-May-24, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04048-6
PMID:40411560
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示胃内幽门螺杆菌在胃癌进展和免疫调节中的作用 | 开发SAHMI流程系统性地恢复和去噪人类临床组织中的微生物信号，首次在单细胞转录组水平研究肿瘤-微生物相互作用 | 研究仅限于胃癌样本，未验证其他癌症类型中类似机制的普适性 | 探究胃内微生物群特别是幽门螺杆菌在胃癌发生发展中的作用机制 | 胃癌组织样本中的细胞群体和幽门螺杆菌 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，荧光原位杂交，免疫组织化学 | SAHMI分析流程 | 单细胞转录组数据，组织图像数据 | 大型胃癌队列（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 219 | 2025-10-06 |
Low-Strength Type I Interferon Signaling Promotes CAR T-Cell Treatment Efficacy
2025-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.13.653878
PMID:40463198
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现低强度I型干扰素信号可增强CAR-T细胞疗效 | 首次揭示低强度IFN-I信号可增强CAR-T细胞杀伤活性和体内疗效，且与共刺激域无关 | 样本量较小（8例患者），需更大规模研究验证 | 探索提高CD19靶向CAR-T细胞治疗r/r DLBCL疗效的新策略 | 复发/难治性弥漫大B细胞淋巴瘤患者和CAR-T细胞 | 单细胞组学 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 8例r/r DLBCL患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 220 | 2025-10-06 |
ARHGDIB as a prognostic biomarker and modulator of the immunosuppressive microenvironment in glioma
2025-May-15, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04063-7
PMID:40372473
|
研究论文 | 本研究探讨ARHGDIB作为胶质瘤预后生物标志物及其在免疫抑制微环境调控中的作用 | 首次揭示ARHGDIB在胶质瘤免疫微环境中的调控机制，发现其与CD163相似的表达模式并能诱导M2巨噬细胞极化 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，需要更多临床样本验证 | 探究ARHGDIB在胶质瘤免疫微环境中的调控作用及其预后价值 | 胶质瘤组织和细胞 | 生物信息学与肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | qPCR, IHC, 单细胞测序, 免疫荧光, 生物信息学分析 | LASSO-Cox回归, Kaplan-Meier生存分析 | 基因表达数据, 临床数据, 免疫组化图像 | 公共数据库数据及自建队列样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |