单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 813 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal transcriptomic analysis during cold ischemic injury to the murine kidney reveals compartment-specific changes
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.25.654911
PMID:40501673
|
研究论文 | 利用空间转录组技术分析小鼠肾脏冷缺血损伤期间的时空转录组变化 | 首次在肾脏冷缺血损伤中应用空间转录组技术进行全转录组表征，并开发了计算工作流程识别区室特异性变化 | 研究基于小鼠模型，结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 | 揭示冷缺血损伤的分子机制及其对肾脏移植结局的影响 | 小鼠肾脏组织 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠肾脏样本（0-48小时冷缺血时间系列） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 182 | 2025-10-06 |
In Vivo CRISPR Interference Screen Reveals Long Noncoding RNA Portfolio Crucial for Cutaneous Squamous Cell Carcinoma Tumor Growth
2025-May-27, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.04.038
PMID:40441291
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研究论文 | 通过CRISPR干扰筛选揭示长链非编码RNA在皮肤鳞状细胞癌肿瘤生长中的关键作用 | 首次结合单细胞测序数据的伪批量分析和体内外CRISPR干扰筛选，系统鉴定调控cSCC生长的lncRNA组合 | 研究主要聚焦于角质形成细胞亚群中的lncRNA，可能未涵盖其他细胞类型的作用 | 探索长链非编码RNA在皮肤鳞状细胞癌发生发展中的功能机制 | 正常人皮肤组织和cSCC患者皮肤组织中的角质形成细胞亚群 | 功能基因组学 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞测序, CRISPR干扰筛选, 异种移植模型 | NA | 单细胞测序数据 | 正常和cSCC人皮肤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 183 | 2025-10-06 |
Bridging Large Language Models and Single-Cell Transcriptomics in Dissecting Selective Motor Neuron Vulnerability
2025-May-12, ArXiv
PMID:40463696
|
研究论文 | 提出一个利用大语言模型和单细胞转录组学分析选择性运动神经元易损性的新框架 | 首次将基因特异性文本注释与单细胞RNA测序数据结合，通过表达加权平均生成生物学背景化的细胞嵌入表示 | NA | 解析选择性运动神经元易损性，改进细胞类型识别和功能分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 自然语言处理,计算生物学 | 运动神经元疾病 | 单细胞RNA测序 | 大语言模型,BioBERT,SciBERT | 文本,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 184 | 2025-10-06 |
Oligodendroglia vulnerability in the human dorsal striatum in Parkinson's disease
2025-05-05, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-025-02884-5
PMID:40323467
|
研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学揭示帕金森病患者背侧纹状体中少突胶质细胞的脆弱性 | 首次在人类帕金森病背侧纹状体中系统鉴定出15种少突胶质细胞亚类，其中4种为疾病特异性群体，并发现其热休克蛋白过表达、髓鞘形成异常和细胞通讯受损等特征 | 研究样本量未明确说明，仅提及分析了约20万个少突胶质细胞核 | 阐明帕金森病中少突胶质细胞的多样性及其在疾病中的变化 | 人类尾状核和壳核（背侧纹状体）组织样本 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 约200,000个少突胶质细胞核（来自帕金森病患者和对照脑组织捐赠者） | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 185 | 2025-10-06 |
General and individualized changes in T cell immunity during aging
2025-May-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkae033
PMID:40073079
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综述 | 本文综述了T细胞免疫在衰老过程中的普遍性和个体化变化 | 系统区分了T细胞衰老的普遍性变化（影响所有个体）和特异性变化（个体独有），并整合了单细胞测序技术的新发现 | NA | 探讨衰老过程中T细胞亚群、转录组和TCR谱系的变化规律 | 人类T细胞免疫系统 | 免疫学 | 衰老相关疾病 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据、TCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 186 | 2025-10-06 |
Single-Cell Profiling of Mononuclear Cells Identifies Transcriptomics Signatures Differentiating Prostate Cancer From Benign Prostatic Hyperplasia
2025-May, Genes, chromosomes & cancer
DOI:10.1002/gcc.70051
PMID:40346907
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析前列腺癌和良性前列腺增生患者外周血单核细胞的转录组特征差异 | 首次在单细胞水平揭示前列腺癌与良性前列腺增生患者外周血免疫细胞的转录组差异和免疫微环境特征 | 样本量较小（4例前列腺癌和3例良性前列腺增生），需要更大规模研究验证 | 识别区分前列腺癌和良性前列腺增生的转录组生物标志物 | 前列腺癌和良性前列腺增生患者的外周血单核细胞 | 单细胞转录组学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 差异基因表达分析、通路分析、CellChat分析 | 单细胞转录组数据 | 7例患者（4例前列腺癌，3例良性前列腺增生） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 187 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals shared clonal signatures in nonmalignant B and tumor cells in T-prolymphocytic leukemia
2025-May, Blood neoplasia
DOI:10.1016/j.bneo.2025.100076
PMID:40453149
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示T细胞前淋巴细胞白血病中非恶性B细胞与肿瘤细胞共享的克隆特征 | 首次在单细胞水平证实T-PLL中非恶性B细胞与克隆性T细胞存在共享突变 | 样本量有限（16例患者），仅对9例患者获得复发样本 | 阐明T细胞前淋巴细胞白血病的克隆起源和进化动力学 | 16例T-PLL患者的非恶性细胞和肿瘤细胞 | 单细胞基因组学 | 白血病 | 靶向二代测序, 液滴数字PCR, 单细胞多组学分析 | NA | 基因组DNA, 细胞表面蛋白标记 | 16例T-PLL患者，其中9例有配对的诊断和复发样本 | Mission Bio | 单细胞多组学 | Tapestri Platform | Mission Bio Tapestri单细胞分析平台 |
| 188 | 2025-10-06 |
Multitissue single-cell analysis reveals differential cellular and molecular sensitivity between fructose and high-fat high-sucrose diets
2025-May-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115690
PMID:40349341
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研究论文 | 通过多组织单细胞分析比较果糖和高脂高糖饮食对代谢综合征的细胞和分子敏感性差异 | 首次在多组织水平系统比较不同饮食模式的细胞类型特异性反应，发现mt-Rnr2作为共同调节因子通过刺激产热缓解代谢综合征 | 研究仅基于小鼠模型，人类相关性需进一步验证 | 阐明不同饮食诱导代谢综合征的组织和细胞类型特异性作用机制 | 小鼠的下丘脑、肝脏、脂肪组织和小肠 | 单细胞组学 | 代谢综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个组织的小鼠样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 189 | 2025-10-06 |
NOTCH2 disrupts the synovial fibroblast identity and the inflammatory response of epiphyseal chondrocytes
2025-May-08, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.110206
PMID:40345585
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研究论文 | 本研究探讨NOTCH2信号如何通过改变转录组和细胞群来影响软骨细胞炎症反应和滑膜成纤维细胞特性 | 首次揭示NOTCH2通过破坏滑膜成纤维细胞特性和改变软骨细胞炎症反应在骨关节炎发病机制中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性需要进一步验证 | 研究NOTCH2信号在骨关节炎发病机制中的作用机制 | 小鼠软骨细胞和滑膜成纤维细胞 | 分子生物学 | 骨关节炎 | RNA-Seq, scRNA-Seq | NA | 转录组数据 | 两种功能获得性突变小鼠模型的原代骨骺细胞 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 190 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics from pancreas and local draining lymph node tissue reveals a lymphotoxin-β signature in human type 1 diabetes
2025-May-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.19.654940
PMID:40475580
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析1型糖尿病患者胰腺和引流淋巴结组织，揭示了淋巴毒素-β特征 | 首次在1型糖尿病自然史中整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据，揭示了胰腺和引流淋巴结中不同的炎症特征 | 样本量相对有限，未详细探讨所有观察到的转录变化的生物学机制 | 探索1型糖尿病发病机制中胰腺和引流淋巴结的炎症反应特征 | 1型糖尿病患者、非糖尿病患者和高易感性非糖尿病自身抗体阳性个体的胰腺和胰腺引流淋巴结组织 | 空间转录组学 | 1型糖尿病 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 包括非糖尿病患者和高易感性非糖尿病自身抗体阳性个体的胰腺和引流淋巴结样本 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 191 | 2025-10-06 |
Identification of core genes in acute kidney injury: evidence from multi-omics human transcriptomic data and in vivo models
2025-May-30, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2024-677
PMID:40529024
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研究论文 | 本研究通过整合多组学人类转录组数据和体内实验验证，识别了急性肾损伤的核心基因 | 首次将人类多组学数据与小鼠模型验证相结合，识别出SUGCT作为与肾小管线粒体代谢和免疫平衡相关的新型AKI核心基因 | 样本量相对有限（67例AKI患者和20例对照），需要在更大队列中进一步验证 | 识别急性肾损伤的核心基因并探索其机制 | 急性肾损伤患者和小鼠模型 | 生物信息学 | 急性肾损伤 | 转录组测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, RT-qPCR, Western blot, 免疫组织化学 | 列线图模型, WGCNA | 转录组数据, 基因表达数据 | 67例AKI患者和20例对照的人类样本，以及小鼠模型 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 192 | 2025-10-06 |
Development of a prognostic model for overall survival in neuroblastoma based on Schwann cell-specific genes, clinical predictors, and MYCN amplification
2025-May-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-2048
PMID:40530123
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研究论文 | 开发基于雪旺细胞特异性基因、临床预测因子和MYCN扩增的神经母细胞瘤总体生存预后模型 | 首次将肿瘤微环境中雪旺细胞特异性基因与临床因素和分子标志物整合构建神经母细胞瘤预后模型 | 样本量相对有限，训练集和测试集患者年龄分布存在差异 | 提高神经母细胞瘤总体生存预测准确性 | 神经母细胞瘤患者 | 生物信息学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,加权基因共表达网络分析,Cox回归分析 | 预后预测模型 | 基因表达数据,临床数据 | 训练集238例,测试集106例,单细胞数据16例患者(160,910个细胞) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 193 | 2025-10-06 |
Tolerance and heteroresistance to echinocandins in Candida auris: conceptual issues, clinical implications, and outstanding questions
2025-May-27, mSphere
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/msphere.00161-25
PMID:40237528
|
综述 | 探讨耳念珠菌对棘白菌素的耐受性和异质性耐药现象及其临床意义 | 首次系统阐述耳念珠菌对棘白菌素的耐受性与异质性耐药概念差异及其临床关联 | 临床意义尚不明确，缺乏与治疗失败相关的数据支持 | 阐明耳念珠菌对棘白菌素的适应性耐药机制及其临床影响 | 耳念珠菌及其对棘白菌素的耐药表型 | 微生物耐药性研究 | 真菌感染 | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 194 | 2025-10-06 |
3D organoids containing endothelial and neural cells generation by serial inductions of differentiation on human iPSC-derived embryoid bodies
2025-May-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.20.653559
PMID:40475416
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研究论文 | 通过在人iPSC衍生的胚状体上连续诱导分化，生成包含内皮细胞和神经细胞的3D类器官 | 开发了同时包含神经细胞和内皮细胞的3D脑类器官模型，模拟体内神经和内皮细胞发育过程 | 未明确说明类器官的长期稳定性和功能成熟度 | 研究大脑发育和神经感染性疾病中内皮细胞与神经细胞的相互作用 | 人诱导多能干细胞(iPSC)衍生的3D类器官 | 发育生物学 | 神经疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq), RNA测序(RNA-Seq), 免疫染色, siRNA抑制 | 3D类器官模型 | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 195 | 2025-10-06 |
Efficient profiling of total RNA in single cells with STORM-seq
2025-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2022.03.14.484332
PMID:40475517
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研究论文 | 开发了一种名为STORM-seq的单细胞总RNA测序技术，能够高效分析单细胞中的非编码转录本和全长RNA | 提出了首个使用随机六聚体引物和核糖体RNA去除的单细胞总RNA测序方案，无需专业液体处理设备即可构建迄今为止复杂度最高的单细胞RNA测序文库 | 未明确说明技术验证的样本规模和适用范围 | 开发更准确、易用的单细胞总RNA测序技术以解决现有方法的局限性 | 单细胞中的总RNA，包括非编码转录本、转座子元件和增强子RNA | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞总RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | STORM-seq | 基于随机六聚体引物的核糖体RNA去除单细胞总RNA测序方案 |
| 196 | 2025-10-06 |
Pseudoassembly of k-mers
2025-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.11.653354
PMID:40463286
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研究论文 | 提出一种基于着色de Bruijn图的基因组序列变异识别方法 | 开发了名为klue的伪组装方法，能够将k-mer组装成与变异感知伪比对扩展兼容的序列 | NA | 识别基因组序列中的变异 | 小鼠黑色素瘤模型的单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 着色de Bruijn图 | 基因组序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 197 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome atlas of spontaneous dry age-related macular degeneration in macaques
2025-May, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2023.02.028
PMID:40528953
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研究论文 | 构建了老年非人灵长类自发性干性年龄相关性黄斑变性的单细胞视网膜转录图谱 | 首次在非人灵长类模型中建立SD-AMD的单细胞转录图谱，揭示了铁死亡在疾病发病机制中的新作用 | 研究基于非人灵长类模型，结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 | 阐明自发性干性年龄相关性黄斑变性的发病机制 | 老年非人灵长类（猕猴）的视网膜组织 | 数字病理学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 老年猕猴视网膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 198 | 2025-10-06 |
Insulin-Degrading Enzyme Regulates mRNA Processing and May Interact with the CCR4-NOT Complex
2025-05-28, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14110792
PMID:40497968
|
研究论文 | 本研究探索胰岛素降解酶在mRNA处理和蛋白质稳态中的新功能 | 首次发现胰岛素降解酶与CCR4-NOT复合物相互作用，并提出其通过协调去腺苷酸化和蛋白酶功能调控蛋白质表达的新机制 | 提出的模型仍为推测性，需要进一步实验验证 | 阐明胰岛素降解酶在细胞生理和蛋白质稳态中的更广泛功能 | 人和小鼠胰岛细胞 | 分子生物学 | NA | 蛋白质组学,转录组学,单细胞转录组,邻近生物素化 | NA | 蛋白质组数据,转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 199 | 2025-10-06 |
Molecular Fingerprint of Endocannabinoid Signaling in the Developing Paraventricular Nucleus of the Hypothalamus as Revealed by Single-Cell RNA-Seq and In Situ Hybridization
2025-05-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14110788
PMID:40497964
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和原位杂交技术揭示了小鼠下丘脑室旁核发育过程中内源性大麻素信号传导的分子特征 | 首次在分子定义的神经元和星形胶质细胞中绘制了2-AG和AEA信号传导的时空图谱，发现了从Dagla到Daglb的发育转换 | 研究仅限于小鼠模型，且某些大麻素受体亚型的mRNA未能检测到 | 阐明下丘脑室旁核发育过程中内源性大麻素信号传导的纳米结构 | 小鼠胚胎期和出生后发育阶段的下丘脑室旁核神经元和星形胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 原位杂交, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 小鼠胚胎期和出生后发育阶段的脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 200 | 2025-10-06 |
The cGAS/STING Pathway: Friend or Foe in Regulating Cardiomyopathy
2025-05-25, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14110778
PMID:40497954
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综述 | 本文系统探讨cGAS/STING信号通路在心肌病炎症调控中的双重作用及治疗潜力 | 整合单细胞RNA测序数据与系统文献综述，揭示cGAS/STING通路在心肌病中的调控机制和潜在治疗靶点 | cGAS/STING通路在心肌病中的具体分子机制仍不明确且存在争议，需未来研究验证 | 阐明cGAS/STING信号通路在心肌病炎症反应中的调控作用及治疗干预策略 | 心肌病相关的炎症机制和cGAS/STING信号通路 | 自然语言处理 | 心肌病 | 单细胞RNA测序, 文献综述 | NA | 文本数据, 测序数据 | 公开可用的人类单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |