单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 800 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-10-06 |
A retinoic acid:YAP1 signaling axis controls atrial lineage commitment
2025-May-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115687
PMID:40343798
|
研究论文 | 本研究揭示了视黄酸与YAP1信号轴协同调控心脏祖细胞向心房谱系分化的机制 | 首次发现Hippo效应因子YAP1与视黄酸信号协同整合于心房转录因子增强子网络，调控心房谱系特化 | 研究主要基于体外hESC模型和小鼠胚胎，人类体内验证尚需进一步研究 | 探究视黄酸信号调控心房谱系特化的下游效应机制 | 人类胚胎干细胞来源的心脏祖细胞、小鼠胚胎、模式化心脏类器官 | 发育生物学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, snATAC-seq, 功能基因组学 | NA | 单细胞转录组数据、单细胞染色质可及性数据 | 未处理与RA处理的人类胚胎干细胞来源CPCs | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 182 | 2025-10-06 |
Integrative Spatial Proteomics and Single-Cell RNA Sequencing Unveil Molecular Complexity in Rheumatoid Arthritis for Novel Therapeutic Targeting
2025-May-22, Proteomes
IF:4.0Q2
DOI:10.3390/proteomes13020017
PMID:40559990
|
研究论文 | 通过整合空间蛋白质组学和单细胞RNA测序技术揭示类风湿关节炎滑膜分子复杂性 | 首次结合激光捕获显微切割蛋白质组学和单细胞RNA测序分析类风湿关节炎滑膜组织空间异质性 | 未明确说明样本规模和验证方法 | 解析类风湿关节炎滑膜组织分子机制并发现治疗靶点 | 类风湿关节炎患者滑膜组织及其健康对照 | 空间多组学 | 类风湿关节炎 | 激光捕获显微切割, 质谱蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间蛋白质组学, 单细胞RNA测序 | NA | 激光捕获显微切割结合质谱蛋白质组学 |
| 183 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics reveal PI3K-AKT and metabolic alterations in aggressive, treatment-resistant lactotroph pituitary neuroendocrine tumors
2025-05-19, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02025-9
PMID:40390063
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示侵袭性、治疗抵抗性催乳素垂体神经内分泌肿瘤中PI3K-AKT通路和代谢改变 | 首次在DA抵抗性催乳素PitNET中应用空间转录组学技术揭示肿瘤内异质性，发现PI3K/AKT通路和脂质代谢改变 | 样本量较小（13例患者），未观察到从部分响应到完全无响应肿瘤的明确分化模式 | 解析催乳素垂体神经内分泌肿瘤的分子异质性，识别侵袭性和药物治疗抵抗的生物标志物 | 多巴胺激动剂抵抗性催乳素垂体神经内分泌肿瘤患者 | 空间转录组学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 空间转录组学, 全转录组测序, 全外显子组测序 | NA | 空间转录组数据, 测序数据 | 13例DA抵抗性催乳素PitNET患者 | 10x Genomics | 空间转录组学, bulk RNA-seq, WES | Visium | Visium Spatial Transcriptomics |
| 184 | 2025-10-06 |
Microglial mechanisms drive amyloid-β clearance in immunized patients with Alzheimer's disease
2025-May, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-03574-1
PMID:40050704
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学探索阿尔茨海默病患者中Aβ免疫治疗后的清除机制 | 首次通过空间转录组学结合单细胞RNA测序揭示不同免疫方法下小胶质细胞的区域特异性反应和TREM2/APOE上调机制 | 样本量有限，机制研究主要基于转录组数据，需要进一步功能验证 | 探究阿尔茨海默病Aβ免疫治疗中Aβ清除的分子机制 | 接受主动和被动Aβ免疫的阿尔茨海默病患者、未免疫患者及神经健康对照 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 免疫与非免疫AD患者及健康对照 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 185 | 2025-10-06 |
Multi-Omics and Experimental Validation Identify GPX7 and Glutathione-Associated Oxidative Stress as Potential Biomarkers in Ischemic Stroke
2025-May-30, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox14060665
PMID:40563300
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证，鉴定GPX7和谷胱甘肽相关氧化应激作为缺血性脑卒中的潜在生物标志物 | 首次系统整合GEO数据库和Genecards数据库，结合机器学习算法和单细胞RNA测序技术，通过体内实验验证GPX7在缺血性脑卒中中的关键作用 | 研究主要基于动物模型，临床转化价值需进一步验证 | 系统分析氧化应激相关基因在缺血性脑卒中中的功能和意义 | 缺血性脑卒中相关基因表达数据、Wistar大鼠大脑中动脉闭塞模型 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA测序、分子对接分析、多组学分析 | 机器学习算法、无监督一致性聚类 | 基因表达数据 | GEO数据库数据集、Wistar大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 186 | 2025-10-06 |
Advances in Genitourinary Tumor Genomics and Immunotherapy
2025-May-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16060667
PMID:40565559
|
综述 | 本文全面概述了泌尿生殖系统肿瘤免疫监测与免疫调节技术的最新进展 | 整合免疫监测技术、免疫调节方法和人工智能，提出跨学科融合推动癌症免疫治疗发展的新范式 | 作为综述文章，未提供原始实验数据验证所述技术的实际效果 | 探讨免疫监测与免疫调节技术在癌症免疫治疗中的应用与发展前景 | 泌尿生殖系统肿瘤的免疫治疗方法与技术平台 | 生物医学工程 | 泌尿生殖系统肿瘤 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、多重细胞因子分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 187 | 2025-10-06 |
Beyond Transposons: TIGD1 as a Pan-Cancer Biomarker and Immune Modulator
2025-May-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16060674
PMID:40565566
|
研究论文 | 本研究对TIGD1基因进行了泛癌分析，评估其作为癌症生物标志物和免疫调节因子的潜力 | 首次对TIGD1进行系统性泛癌分析，揭示其与肿瘤免疫微环境和治疗耐药性的关联 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要实验验证 | 评估TIGD1在多种癌症中的表达模式、诊断价值、预后意义及与免疫治疗反应的关系 | TCGA和GTEx数据库中的转录组和临床数据 | 生物信息学 | 多种癌症 | 转录组分析，单细胞测序，基因集富集分析 | 生物信息学分析 | 转录组数据，临床数据 | TCGA和GTEx数据库样本 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 188 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomics Unveils the Mechanistic Role of FOSL1 in Cutaneous Wound Healing
2025-May-29, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13061330
PMID:40564048
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了转录因子FOSL1在皮肤伤口愈合中的调控机制 | 首次系统揭示FOSL1通过调控MAPK和EGFR信号通路在皮肤伤口愈合中的关键作用 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限 | 探究FOSL1在皮肤伤口愈合中的作用机制及其治疗潜力 | 皮肤组织样本和动物模型 | 生物信息学 | 皮肤创伤 | 单细胞转录组测序, Western blot, 机器学习算法 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 189 | 2025-10-06 |
Correction: Desterke et al. Single-Cell RNA-Seq Analysis Links DNMT3B and PFKFB4 Transcriptional Profiles with Metastatic Traits in Hepatoblastoma. Biomolecules 2024, 14, 1394
2025-May-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15060769
PMID:40563546
|
更正 | 对已发表论文中错误的修正说明 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 190 | 2025-10-06 |
Multi-Transcriptomic Analysis Reveals GSC-Driven MES-Like Differentiation via EMT in GBM Cell-Cell Communication
2025-May-26, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13061304
PMID:40564022
|
研究论文 | 通过多转录组分析揭示胶质母细胞瘤中胶质瘤干细胞通过EMT驱动间充质样分化的细胞间通讯模式 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组数据系统分析GSC通过EMT介导的细胞通讯机制 | 研究主要基于生物信息学分析，需要实验验证EMT通路在GSC分化中的具体作用机制 | 探索胶质母细胞瘤中胶质瘤干细胞的细胞间通讯模式及其对肿瘤进展的影响 | 胶质母细胞瘤中的胶质瘤干细胞及其他肿瘤细胞 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组,基因集富集分析 | CellChat, ssGSEA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组 | NA | NA |
| 191 | 2025-10-06 |
Evaluation of the Effects of the Quaternary Ammonium Silane K21 on Zebrafish Viability, Toxicity, Growth, and Development
2025-May-22, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13061267
PMID:40563986
|
研究论文 | 评估季铵硅烷K21对斑马鱼存活率、毒性、生长和发育的影响 | 首次系统评估K21在斑马鱼多代发育中的生物学效应，并发现其可能激活新的生长加速通路 | 研究主要基于斑马鱼模型，在人类应用中的效果仍需进一步验证 | 探索K21分子在人类健康保护和疾病防治中的潜在应用 | 野生型、Casper透明皮肤突变型和转基因斑马鱼品系，以及卤虫 | 毒理学与发育生物学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序，连续稀释法，急性和慢性暴露研究 | NA | 基因表达数据，发育表型数据 | 多个发育阶段（胚胎、幼虫、幼鱼、成鱼）的斑马鱼和卤虫样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 192 | 2025-10-06 |
Mapping Inherited Genetic Variation with Opposite Effects on Autoimmune Disease and Four Cancer Types Identifies Candidate Drug Targets Associated with the Anti-Tumor Immune Response
2025-May-14, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16050575
PMID:40428397
|
研究论文 | 通过基因组关联研究识别对自身免疫疾病和癌症具有相反效应的遗传变异，发现潜在的癌症免疫治疗靶点 | 首次系统性地识别对自身免疫疾病和四种癌症类型具有相反效应的遗传变异，并验证其作为免疫治疗靶点的潜力 | 研究局限于四种特定癌症类型和七种自身免疫疾病，需要进一步实验验证 | 识别具有相反效应于自身免疫疾病和癌症的遗传变异，发现新的癌症免疫治疗靶点 | 乳腺癌、前列腺癌、卵巢癌和子宫内膜癌患者(240,540例)及自身免疫疾病患者(112,631例)的基因组数据 | 基因组学 | 多种癌症和自身免疫疾病 | GWAS, 元分析, RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, eQTL分析 | 固定效应元分析, 连锁不平衡聚类 | 基因组关联数据, 转录组数据 | 240,540例癌症患者/317,000例对照, 112,631例自身免疫疾病患者/895,386例对照 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 193 | 2025-10-06 |
Integrative single-cell RNA sequencing and mendelian randomization analysis reveal the potential role of synaptic vesicle cycling-related genes in Alzheimer's disease
2025-May, The journal of prevention of Alzheimer's disease
DOI:10.1016/j.tjpad.2025.100097
PMID:40021385
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，揭示了突触小泡循环相关基因在阿尔茨海默病中的潜在作用 | 首次结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析识别出四个突触小泡循环相关基因作为AD的保护因子 | 研究数据完全来源于公共数据库，缺乏实验验证 | 探索突触小泡循环相关基因在阿尔茨海默病中的潜在作用机制 | 阿尔茨海默病患者和健康个体的基因表达数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 差异表达分析 | 列线图 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 194 | 2025-10-06 |
Calbindin 2 as a Novel Biomarker and Therapeutic Target for Abdominal Aortic Aneurysm: Integrative Analysis of Human Proteomes and Genetics
2025-May-06, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.039195
PMID:40314374
|
研究论文 | 本研究通过整合人类蛋白质组学和遗传学分析，发现CALB2作为腹主动脉瘤的新型生物标志物和治疗靶点 | 首次将CALB2鉴定为腹主动脉瘤的因果风险因子，并通过多组学分析揭示其在脂肪组织间皮细胞中的特异性表达 | 研究主要基于遗传学证据和小鼠模型，需要在人类临床试验中进一步验证 | 识别腹主动脉瘤的新型生物标志物和治疗靶点 | 人类遗传数据、小鼠腹主动脉瘤模型 | 生物医学 | 腹主动脉瘤 | 蛋白质组范围孟德尔随机化、遗传相关性分析、共定位分析、多组学数据分析、bulk RNA测序、单细胞/单核RNA测序、空间转录组学 | NA | 遗传数据、蛋白质组数据、RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 195 | 2025-10-06 |
Candidate Biomarkers for Hard-to-Heal Wounds Revealed by Single-Cell RNA Sequencing of Wound Fluid in Murine Wound Models
2025 May-Jun, Wound repair and regeneration : official publication of the Wound Healing Society [and] the European Tissue Repair Society
IF:3.8Q1
DOI:10.1111/wrr.70038
PMID:40444294
|
研究论文 | 通过小鼠伤口模型中伤口液的单细胞RNA测序揭示难愈合伤口的候选生物标志物 | 首次使用伤口液细胞进行单细胞RNA测序分析，识别不同延迟愈合伤口模型中的共同生物标志物 | 样本收集困难，研究仅限于小鼠模型，尚未在临床环境中验证 | 探索不依赖单一病理学的因素，填补当前伤口管理空白 | 小鼠伤口模型中的伤口液细胞 | 单细胞组学 | 伤口愈合障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三种代表性延迟伤口模型（老年、糖尿病和脂多糖诱导炎症模型）与正常年轻小鼠的比较 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 196 | 2025-10-06 |
Targeting BATF2-RGS2 axis reduces T-cell exhaustion and restores anti-tumor immunity
2025-May-30, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02351-5
PMID:40442751
|
研究论文 | 本研究揭示BATF2-RGS2轴在调控T细胞耗竭和肿瘤免疫逃逸中的关键作用 | 首次发现BATF2通过转录调控RGS2驱动T细胞耗竭，并证明靶向该轴可增强抗肿瘤免疫 | 样本量较小（6例患者），主要基于小鼠模型，临床转化需进一步验证 | 探究RGS2在肺癌免疫调控中的作用及BATF2-RGS2轴的调控机制 | 肺癌患者样本、小鼠模型、CD8+ T细胞、3LL癌细胞 | 免疫学 | 肺癌 | 单细胞转录组分析、荧光素酶报告基因检测、体外共培养 | 基因敲除小鼠模型、肿瘤类器官模型 | 转录组数据、细胞实验数据 | 6例肺癌患者，多种基因型小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 197 | 2025-10-06 |
Identification of Synovial Lymphatics in the TMJ and their Roles in Arthritis and Pain
2025-May-30, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6683299/v1
PMID:40502768
|
研究论文 | 本研究首次发现颞下颌关节中存在滑膜淋巴管，并揭示其在关节炎和疼痛中的作用机制 | 首次在颞下颌关节中鉴定出滑膜淋巴系统，并证明淋巴功能障碍会驱动关节炎和疼痛的发生 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究颞下颌关节滑膜淋巴系统的存在及其在关节炎和疼痛中的作用 | 基因报告小鼠、人类组织样本 | 生物医学研究 | 颞下颌关节关节炎 | 基因报告技术、组织透明化、3D体积成像、功能遗传学、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 小鼠模型和人类组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 198 | 2025-10-06 |
MIC-Drop-seq: Scalable single-cell phenotyping of mutant vertebrate embryos
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.27.656468
PMID:40502104
|
研究论文 | 开发了一种结合高通量基因编辑和单细胞RNA测序的技术平台，用于斑马鱼胚胎的大规模遗传筛选 | 将多重混合CRISPR液滴技术与多重单细胞RNA测序相结合，实现了在脊椎动物胚胎中进行大规模基因功能筛选 | 技术主要应用于斑马鱼胚胎模型，在其他脊椎动物中的应用仍需验证 | 建立可扩展的基因功能映射平台，研究脊椎动物发育过程中的基因功能 | 斑马鱼胚胎 | 单细胞测序技术 | 发育生物学 | 单细胞RNA测序, CRISPR基因编辑 | NA | 单细胞基因表达数据 | 1000个斑马鱼胚胎，靶向50个转录调控因子 | NA | 单细胞RNA测序 | MIC-Drop-seq | 多重混合CRISPR液滴与多重单细胞RNA测序结合平台 |
| 199 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal transcriptomic analysis during cold ischemic injury to the murine kidney reveals compartment-specific changes
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.25.654911
PMID:40501673
|
研究论文 | 利用空间转录组技术分析小鼠肾脏冷缺血损伤期间的时空转录组变化 | 首次在肾脏冷缺血损伤中应用空间转录组技术进行全转录组表征，并开发了计算工作流程识别区室特异性变化 | 研究基于小鼠模型，结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 | 揭示冷缺血损伤的分子机制及其对肾脏移植结局的影响 | 小鼠肾脏组织 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠肾脏样本（0-48小时冷缺血时间系列） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 200 | 2025-10-06 |
Bridging Large Language Models and Single-Cell Transcriptomics in Dissecting Selective Motor Neuron Vulnerability
2025-May-12, ArXiv
PMID:40463696
|
研究论文 | 提出一个利用大语言模型和单细胞转录组学分析选择性运动神经元易损性的新框架 | 首次将基因特异性文本注释与单细胞RNA测序数据结合，通过表达加权平均生成生物学背景化的细胞嵌入表示 | NA | 解析选择性运动神经元易损性，改进细胞类型识别和功能分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 自然语言处理,计算生物学 | 运动神经元疾病 | 单细胞RNA测序 | 大语言模型,BioBERT,SciBERT | 文本,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |