单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 800 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-10-06 |
Data standards for single-cell RNA-sequencing of paediatric cancer
2025-May, Clinical & translational immunology
IF:4.6Q2
DOI:10.1002/cti2.70033
PMID:40416408
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研究论文 | 系统评估儿科癌症单细胞RNA测序数据存储现状并提出标准化建议框架 | 首次系统分析儿科癌症scRNA-seq数据存储的不一致性问题，并提出改善数据存储实践的具体建议框架 | 仅分析已公开的scRNA-seq数据集，未涉及其他单细胞测序技术 | 改善儿科癌症单细胞RNA测序数据的存储标准和使用效率 | 公开可用的儿科癌症单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | 儿科癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 488个临床样本，超过130万个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 182 | 2025-10-06 |
Insights into human melanocyte development and characteristics through pluripotent stem cells combined with single-cell sequencing
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112373
PMID:40641554
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研究论文 | 通过多能干细胞结合单细胞测序技术研究人类黑色素细胞的发育过程和特征 | 首次结合人类多能干细胞和单细胞测序技术系统研究黑色素细胞发育的细胞异质性、分化轨迹和信号通路相互作用 | 研究主要基于体外诱导模型，与体内真实发育环境存在差异 | 探索人类黑色素细胞的发育机制和生物学特性 | 人类多能干细胞诱导的黑色素细胞和正常人类黑色素细胞 | 发育生物学 | 色素相关疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 183 | 2025-10-06 |
Humanized mouse model reveals T cell ANXA2 as a potential therapeutic target in ischemic stroke
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112302
PMID:40641552
|
研究论文 | 本研究通过建立人源化小鼠脑卒中模型，鉴定出ANXA2作为T细胞亚群的生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次建立人源化T细胞缺血性脑卒中模型，发现ANXA2作为新型治疗靶点，并使用小分子抑制剂验证其神经保护作用 | 人源化小鼠模型仍与人类疾病存在差异，需要进一步临床验证 | 探索缺血性脑卒中后T细胞的分子机制并鉴定治疗靶点 | 人源化小鼠模型和人类缺血性脑组织及外周血样本 | 单细胞测序分析 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 人源化小鼠模型和人类样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 184 | 2025-10-06 |
Integrative single-cell transcriptomics of sheep ovarian development reveals dynamic transcriptional programs relevant to reproductive traits
2025-May-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112422
PMID:40641558
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组学分析绵羊卵巢发育过程，揭示与繁殖性状相关的动态转录程序 | 首次在绵羊卵巢发育关键阶段构建单细胞转录组图谱，并通过跨物种比较发现与人类生殖性状的关联 | 样本数量有限，仅涵盖四个发育阶段 | 解析绵羊卵巢发育的转录动态及其与人类生殖生物学的相关性 | 绵羊卵巢组织 | 单细胞组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 61,649个单细胞，覆盖胚胎期90天(E90)、青春期前3月(M3)、青春期后6月(M6)和成年期(Y2,Y4) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 185 | 2025-10-06 |
Single-cell RNAseq of Angiotensin II-induced abdominal aortic tissue identifies aneurysm-associated cell clusters in C57BL/6J mice
2025-05-28, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20241235
PMID:40440080
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术分析血管紧张素II诱导的小鼠腹主动脉瘤组织，识别与动脉瘤相关的关键细胞群 | 首次在腹主动脉瘤中发现由内皮细胞转化的特殊细胞群（恶性ECs），并揭示Cxcl12-Cxcr4/Ackr3炎症轴在动脉瘤形成中的作用 | 研究仅使用C57BL/6J小鼠模型，样本量有限（不同年龄组样本数为21和7） | 探究腹主动脉瘤形成过程中起关键作用的特定细胞群 | C57BL/6J小鼠的腹主动脉组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 28只C57BL/6J小鼠（14周龄21只，32周龄7只） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 186 | 2025-10-06 |
Peripheral blood cell-type and sex-specific signatures of alcohol misuse revealed by single-cell transcriptomics
2025-May-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.21.655347
PMID:40501697
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示酒精滥用在外周血细胞类型和性别特异性中的分子特征 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统分析酒精使用障碍患者外周血单核细胞的免疫细胞比例和基因表达差异，并发现性别和剂量依赖的免疫细胞功能特征 | 研究样本量有限，仅关注外周血单核细胞，未涉及其他组织或细胞类型 | 表征酒精使用障碍中的免疫失调机制 | 酒精使用障碍患者和健康对照者的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 酒精使用障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 酒精使用障碍患者和健康对照者（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 187 | 2025-10-06 |
Targeting caseinolytic mitochondrial matrix peptidase, a novel contributor to the pathobiology of high-risk multiple myeloma
2025-May-29, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024024781
PMID:39912779
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学发现线粒体酪蛋白水解蛋白酶CLPP在多发性骨髓瘤中的过度表达及其作为治疗靶点的重要性 | 首次发现CLPP在多发性骨髓瘤进展中的关键作用，并证明其抑制剂可克服常规和新型药物耐药性 | NA | 探索多发性骨髓瘤进展的分子机制并寻找新的治疗靶点 | CD138+肿瘤性浆细胞与正常浆细胞的比较 | 单细胞转录组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 188 | 2025-10-06 |
Deconer: An Evaluation Toolkit for Reference-based Deconvolution Methods Using Gene Expression Data
2025-May-10, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf009
PMID:39963994
|
研究论文 | 开发了一个用于评估基于参考的去卷积方法的综合工具包Deconer | 首次提供了针对基于参考的去卷积方法的全面评估工具包，包含多种模拟和真实基因表达数据集 | NA | 评估和比较基于参考的细胞类型去卷积方法 | 16种基于参考的去卷积方法 | 生物信息学 | NA | 基因表达数据分析 | NA | 基因表达数据，包括bulk测序数据和单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 189 | 2025-10-06 |
Aboral cell types of Clytia and coral larvae have shared features and link taurine to the regulation of settlement
2025-May-16, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv1159
PMID:40378222
|
研究论文 | 本研究通过比较三种刺胞动物幼虫的转录组和单细胞RNA测序数据，揭示了幼虫前端（反口端）的细胞类型特征及牛磺酸在调控幼虫附着过程中的作用 | 首次整合多种刺胞动物幼虫的单细胞RNA测序数据，发现反口端特化细胞类型中牛磺酸摄取和分解代谢基因的表达模式，并证实外源性牛磺酸抑制幼虫附着 | 研究仅涉及三种刺胞动物物种，可能无法完全代表整个刺胞动物门的多样性 | 阐明刺胞动物幼虫附着的细胞和分子调控机制 | 水母Clytia和两种珊瑚的浮浪幼虫 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,转录组数据 | 三种刺胞动物物种的浮浪幼虫 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 190 | 2025-10-06 |
Safety and feasibility of 4-1BB co-stimulated CD19-specific CAR-NK cell therapy in refractory/relapsed large B cell lymphoma: a phase 1 trial
2025-May, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-025-00940-3
PMID:40251398
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研究论文 | 本研究评估了4-1BB共刺激的CD19特异性CAR-NK细胞疗法在难治/复发性大B细胞淋巴瘤患者中的安全性和可行性 | 首次使用狒狒包膜假型慢病毒载体转导脐带血来源的NK细胞生成CD19-BBz CAR-NK细胞，并进行临床阶段试验 | 样本量较小（仅8名患者），为早期阶段临床试验 | 评估CAR-NK细胞疗法在B细胞淋巴瘤患者中的安全性和治疗效果 | 难治/复发性大B细胞淋巴瘤患者 | 癌症免疫治疗 | 大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序，慢病毒转导 | 临床实验 | 临床数据，基因表达数据 | 8名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 191 | 2025-10-06 |
Cardiac Fibroblasts regulate myocardium and coronary vasculature development via the collagen signaling pathway
2025-May-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.11.612512
PMID:39314489
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基因标记技术揭示了心脏成纤维细胞通过胶原信号通路调控心肌和冠状血管发育的机制 | 首次系统阐明了心脏成纤维细胞在发育过程中通过胶原信号通路调控心肌细胞和血管内皮细胞发育的分子机制 | 研究主要聚焦于发育阶段，对成年心脏中成纤维细胞功能的验证相对有限 | 探究心脏成纤维细胞在心脏发育过程中对心肌和血管系统的调控作用 | 小鼠心脏成纤维细胞、心肌细胞和血管内皮细胞 | 发育生物学 | 心脏发育缺陷 | 单细胞mRNA测序(scRNA-seq), RNA染色, Pdgfra-CreER控制的DTA消融系统 | NA | 单细胞转录组数据, 组织染色图像 | 不同发育阶段的小鼠心脏组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 192 | 2025-10-06 |
Pathological α-synuclein dysregulates epitranscriptomic writer METTL3 to drive neuroinflammation in microglia
2025-May-27, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115618
PMID:40279247
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研究论文 | 本研究揭示了病理α-突触核蛋白通过失调m6A甲基转移酶METTL3驱动小胶质细胞神经炎症的机制 | 首次发现METTL3在α-突触核蛋白和锰诱导的神经炎症中表达上调并发挥关键调控作用 | 未明确METTL3调控神经炎症的具体下游分子机制 | 探究m6A RNA修饰在神经退行性疾病中的作用机制 | 人源小胶质细胞、星形胶质细胞、阿尔茨海默病、帕金森病和路易体痴呆患者尸检组织 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序, 亚细胞定位研究, 功能分析 | NA | RNA测序数据, 蛋白质定位数据 | 人源细胞模型和神经退行性疾病患者尸检组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 193 | 2025-10-06 |
MALADAPTIVE IMMUNE-FIBROTIC AXIS DRIVES IMPAIRED LONG BONE REGENERATION UNDER MECHANICAL INSTABILITY
2025-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.26.564177
PMID:37961650
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研究论文 | 本研究通过工程化小鼠延迟愈合模型，揭示了机械不稳定性通过免疫-纤维化轴驱动长骨再生障碍的机制 | 开发了可调节髓内钉模型模拟人类肥大性骨不连，首次建立机械不稳定性与免疫-基质细胞互作的直接联系 | 动物模型仍需进一步验证与人类临床情况的一致性 | 探究机械不稳定性对骨再生障碍的免疫学机制 | 小鼠长骨骨折模型 | 骨再生生物学 | 骨不连/骨折愈合障碍 | 空间转录组学，系统性免疫分析，生物力学测试 | 多变量建模 | 基因表达数据，免疫细胞表型数据，生物力学数据 | 未明确具体样本数量的小鼠实验 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 194 | 2025-10-06 |
scTsI: an effective two-stage imputation method for single-cell RNA-seq data
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf298
PMID:40579791
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研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA-seq数据的两阶段插补方法scTsI，有效处理丢失事件并提升下游分析性能 | 开发两阶段插补算法，第一阶段利用邻近细胞和基因信息插补零值，第二阶段通过脊回归和批量RNA-seq数据约束调整插补值，保持高表达值不变且避免引入新噪声 | 未明确说明方法在极稀疏数据或特定细胞类型中的性能限制 | 解决单细胞RNA-seq数据中丢失事件对下游分析的影响 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 脊回归 | 基因表达矩阵 | 多种模拟和真实数据集 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 195 | 2025-10-06 |
DeepExDC interprets genomic compartmentalization changes in single-cell Hi-C data
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf301
PMID:40581982
|
研究论文 | 提出DeepExDC方法用于单细胞Hi-C数据中A/B区室差异分析 | 开发首个可解释的一维卷积神经网络，用于单细胞水平全基因组范围的染色质区室变化分析，无需分布假设和差异模式限制 | 单细胞水平区室化变化计算分析领域尚处于起步阶段 | 分析不同条件下单细胞基因组区室化变化 | 单细胞Hi-C数据中的A/B染色质区室 | 计算生物学 | NA | 单细胞Hi-C，scRNA-seq，scATAC-seq | 1D CNN | Hi-C接触矩阵 | NA | NA | 单细胞Hi-C，单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 196 | 2025-10-06 |
Computational modeling of single-cell dynamics data
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf305
PMID:40586321
|
综述 | 本文综述了单细胞动态数据的计算建模方法，重点讨论了数据分析挑战和算法进展 | 系统梳理了单细胞动态数据分析的四大关键任务，并展望了生物技术与人工智能算法融合的前景 | 作为综述文章，未涉及具体实验验证和原始数据分析 | 探讨单细胞动态数据的计算分析方法及其在生命机制研究中的应用 | 单细胞动态测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞动态测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 197 | 2025-10-06 |
An order-preserving batch-effect correction method based on a monotonic deep learning framework
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf247
PMID:40586320
|
研究论文 | 提出了一种基于单调深度学习框架的保序批次效应校正方法 | 在批次效应校正方法中首次引入保序特性，通过单调深度学习网络保持基因表达数据的原始顺序关系 | 未提及方法的具体计算复杂度或在大规模数据集上的性能表现 | 开发具有保序特性的单细胞RNA测序数据批次效应校正方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 单调深度学习网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 198 | 2025-10-06 |
iGTP: learning interpretable cellular embedding for inferring biological mechanisms underlying single-cell transcriptomics
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf296
PMID:40551620
|
研究论文 | 提出了一种可解释的生成式转录程序框架iGTP，用于单细胞转录组数据的细胞嵌入表示和生物学机制推断 | 设计了结合转录程序空间和蛋白质-蛋白质相互作用的可解释生成模型框架，能够同时从TP和PPI层面提供生物学见解 | NA | 开发可解释的深度学习框架用于单细胞转录组数据的生物学机制分析 | 单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 变分自编码器, 图神经网络, 潜在扩散模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 199 | 2025-10-06 |
Fusion of spatiotemporal and network models to prioritize multiscale effects in single-cell perturbations
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf277
PMID:40545244
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研究论文 | 提出Perturb-STNet框架，通过融合时空和网络模型来识别单细胞扰动中的多尺度效应 | 开发了首个基于网络的时空模型框架，能够对单细胞扰动数据中的空间和时间差异表达调控因子进行排序 | 方法在复杂多细胞/多组织系统中的验证仍需进一步扩展 | 识别驱动发育和疾病过程的时空差异表达调控因子 | 单细胞扰动数据中的调控因子、细胞和邻域相互作用 | 计算生物学 | 肺癌、黑色素瘤、结肠炎 | 单细胞成像、空间转录组学 | 网络时空模型 | 单细胞时空数据 | 合成数据、肺癌数据、小鼠黑色素瘤模型、结肠炎数据 | NA | CODEX单细胞成像、MERFISH空间转录组学 | NA | CODEX单细胞成像时间序列数据、MERFISH空间转录组学时间序列数据 |
| 200 | 2025-07-02 |
Correction to: ScInfeR: an efficient method for annotating cell types and sub-types in single-cell RNA-seq, ATAC-seq, and spatial omics
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf337
PMID:40580031
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |