单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 867 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2025-06-16 |
Single-Cell Sequencing: An Emerging Tool for Biomarker Development in Nuclear Emergencies and Radiation Oncology
2025-May-28, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17111801
PMID:40507282
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综述 | 本文探讨了单细胞测序技术在核紧急情况和放射肿瘤学中作为生物标志物开发新兴工具的应用 | 强调了单细胞测序技术在提供高分辨率细胞多样性和异质性视图方面的创新性，特别是在识别辐射暴露相关生物标志物方面的潜力 | 单细胞RNA测序技术在辐射研究领域仍处于新兴阶段 | 探讨辐射剂量测定的当前方法及与辐射暴露相关的生物标志物，并关注NGS技术在放射治疗和紧急事件中的发展 | 辐射暴露后的细胞和生物标志物 | 生物信息学 | 放射肿瘤学 | NGS, 单细胞测序, scRNA-seq | NA | 基因序列数据 | NA |
| 182 | 2025-06-16 |
Potential Role of SESN3 in Linking Heart Failure with Preserved Ejection Fraction and Chronic Obstructive Pulmonary Disease via Autophagy Dysregulation
2025-May-28, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26115174
PMID:40507985
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研究论文 | 本研究探讨了SESN3通过自噬失调在心力衰竭伴保留射血分数（HFpEF）和慢性阻塞性肺疾病（COPD）之间的潜在联系 | 首次提出SESN3介导的自噬可能是HFpEF和COPD的共同机制，并验证了其在心脏和肺组织中的系统性作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证不足 | 识别HFpEF和COPD的共同致病机制并验证其系统性作用 | HFpEF心脏组织和COPD肺组织 | 分子病理学 | 心血管疾病 | 转录组分析、WGCNA、LASSO回归、scRNA-seq、qPCR、Western blotting | HFpEF小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量 |
| 183 | 2025-06-16 |
Molecular Characterization of Atypical Fibroxanthoma and Pleomorphic Dermal Sarcoma
2025-May-27, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17111785
PMID:40507266
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综述 | 本文综述了非典型纤维黄色瘤（AFX）和多形性真皮肉瘤（PDS）的分子特征，包括它们的分子组成、基因表达和预后生物标志物 | 首次整合了包括单细胞RNA测序在内的多种分子数据集，讨论了这些肿瘤的分子驱动因素和预后生物标志物 | 由于这些肿瘤的罕见性，相关研究较少，分子特征的全面理解仍有待深入 | 探讨AFX和PDS的分子特征及其预后生物标志物 | 非典型纤维黄色瘤（AFX）和多形性真皮肉瘤（PDS） | 分子病理学 | 皮肤肉瘤 | 外显子测序、批量RNA测序、靶向DNA测序、DNA甲基化分析、拷贝数分析、scRNA-seq | NA | 分子数据 | NA |
| 184 | 2025-06-16 |
PRRX1 is a key regulator in the phenotypic transition between human normal dermal and keloid fibroblasts
2025-May-16, Journal of dermatological science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.jdermsci.2025.05.002
PMID:40517126
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research paper | 该研究探讨了人类胎儿皮肤、产后皮肤和瘢痕疙瘩组织之间的差异，以找出影响伤口愈合结果的关键因素 | 发现了PRRX1在调节正常和瘢痕疙瘩成纤维细胞表型转变中的关键作用，并利用三维人类瘢痕疙瘩模型在组织水平上进一步验证了这一作用 | 研究主要聚焦于PRRX1的作用，可能忽略了其他潜在的关键因素 | 理解人类胎儿皮肤、产后皮肤和瘢痕疙瘩组织之间的差异，以促进无疤痕伤口愈合的临床治疗 | 人类胎儿皮肤、产后皮肤和瘢痕疙瘩组织 | digital pathology | scarring | spatial transcriptomics (ST), histological imaging | three-dimensional human keloid model | transcriptomics data, histological images | 人类胎儿皮肤、产后皮肤和瘢痕疙瘩组织样本 |
| 185 | 2025-06-16 |
Clinical efficacy and chemoresistance analysis of precision neoadjuvant chemotherapy for borderline resectable pancreatic cancer: a prospective, single-arm pilot study
2025-May-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002342
PMID:40146255
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研究论文 | 本研究评估了基于患者来源类器官（PDOs）的新辅助化疗（NAC）在临界可切除胰腺癌（BRPC）中的临床疗效和安全性 | 利用PDOs进行药物敏感性测试，调整NAC方案，并探索了吉西他滨耐药的潜在机制 | 单臂试点研究，样本量较小（19例患者） | 评估PDOs指导的NAC在BRPC中的临床疗效和安全性，并探索吉西他滨耐药的分子机制 | 临界可切除胰腺癌（BRPC）患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | scRNA-seq分析 | NA | 临床数据和单细胞转录组数据 | 19例BRPC患者 |
| 186 | 2025-06-15 |
Novel PAP-targeted CAR-T therapy enhances antitumor efficacy through CoupledCAR approach
2025-May-31, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-011238
PMID:40449956
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research paper | 该研究提出了一种新型的PAP靶向CAR-T疗法，通过CoupledCAR方法增强抗肿瘤效果 | 首次证明PAP是前列腺癌CAR-T疗法的特异性靶点，并开发了CoupledCAR平台技术，无需肿瘤抗原即可扩增肿瘤靶向CAR-T细胞 | 研究主要基于体外和体内实验，尚未进行临床试验验证 | 开发针对前列腺癌的新型CAR-T疗法，解决现有疗法靶点缺乏和CAR-T细胞扩增受限的问题 | 前列腺癌细胞和CAR-T细胞 | 肿瘤免疫治疗 | 前列腺癌 | scRNA-Seq, 免疫组化染色 | CAR-T | 基因表达数据, 免疫组化数据 | NA |
| 187 | 2025-06-15 |
Chaperonin containing TCP1 subunit 5 as a novel pan-cancer prognostic biomarker for tumor stemness and immunotherapy response: insights from multi-omics data, integrated machine learning, and experimental validation
2025-May-27, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04071-7
PMID:40423850
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研究论文 | 本研究通过多组学数据和机器学习方法，揭示了CCT5在泛癌中的预后价值和免疫治疗响应预测作用 | 首次全面评估CCT5在33种癌症类型中的表达模式，并开发了基于CCT5的免疫治疗响应预测模型CCT5.Sig | 研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证 | 探究CCT5在泛癌进展中的作用及其作为免疫治疗响应预测标志物的潜力 | 33种癌症类型的肿瘤组织 | 生物信息学 | 泛癌 | 多组学分析（包括bulk RNA-seq、scRNA-seq和空间转录组学） | 机器学习模型 | 多组学数据 | 23个免疫检查点阻断队列（n=1394），涵盖8种癌症类型 |
| 188 | 2025-06-15 |
Analyses of single-cell RNA sequencing uncover the role of intratumoral Helicobacter pylori in shaping tumor progression and immunity in gastric cancer
2025-May-24, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04048-6
PMID:40411560
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了肿瘤内幽门螺杆菌在胃癌中塑造肿瘤进展和免疫的作用 | 使用SAHMI流程系统地恢复和去噪人类临床组织中的微生物信号，并在单细胞转录组水平上检查肿瘤-微生物相互作用 | 研究仅针对胃癌，未涉及其他类型的肿瘤 | 探究肿瘤内微生物群与胃癌发生和发展的关系 | 胃癌组织中的幽门螺杆菌及其与宿主细胞的相互作用 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、荧光原位杂交、免疫组织化学 | NA | RNA测序数据、图像数据 | 大型胃癌队列 |
| 189 | 2025-06-15 |
Low-Strength Type I Interferon Signaling Promotes CAR T-Cell Treatment Efficacy
2025-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.13.653878
PMID:40463198
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析，揭示了I型干扰素（IFN-I）信号在CD19导向的CAR T细胞治疗中的关键作用，并提出了一种通过低强度IFN-I信号增强CAR T细胞疗效的新策略 | 首次发现低强度IFN-I信号可以增强CAR T细胞的细胞毒性和体内疗效，而高强度IFN-I信号则会产生负面影响，这一发现为改进CAR T细胞治疗提供了新思路 | 研究样本量较小（仅8名患者），需要在更大规模的临床试验中验证 | 探索提高CD19导向CAR T细胞治疗复发/难治性弥漫大B细胞淋巴瘤（r/r DLBCL）疗效的方法 | 复发/难治性弥漫大B细胞淋巴瘤患者和CAR T细胞 | 免疫治疗 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 8名r/r DLBCL患者 |
| 190 | 2025-06-15 |
ARHGDIB as a prognostic biomarker and modulator of the immunosuppressive microenvironment in glioma
2025-May-15, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04063-7
PMID:40372473
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研究论文 | 本研究探讨了ARHGDIB作为胶质瘤预后生物标志物及其在免疫抑制微环境中的调节作用 | 首次揭示了ARHGDIB在胶质瘤免疫抑制微环境中的关键作用，并证实其作为肿瘤相关巨噬细胞的新型标志物 | 研究主要基于公共数据库和体外实验，需要更多临床样本验证 | 探究ARHGDIB在胶质瘤免疫微环境中的调控机制及其预后价值 | 胶质瘤患者样本和细胞系 | 肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | qPCR, IHC, 单细胞测序, 免疫荧光 | LASSO-Cox回归 | mRNA表达数据, 蛋白质表达数据 | 公共数据库数据+自建队列样本 |
| 191 | 2025-06-15 |
Din Oversees Mesenchymal Stem Cell Homeostasis in Mouse Incisors
2025-May-14, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6568233/v1
PMID:40470223
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research paper | 该研究揭示了预测基因Din在小鼠门牙间充质干细胞（MSCs）稳态中的关键作用 | 通过新开发的敲除小鼠模型，首次发现Din基因对MSCs稳态的调控作用及其在干细胞特性、运动性、衰老和分化潜能中的多重影响 | 研究仅限于小鼠门牙模型，尚未验证在其他组织或人类中的普适性 | 探究维持小鼠门牙间充质干细胞稳态的分子机制 | 小鼠门牙中的间充质干细胞（MSCs） | 干细胞生物学 | NA | 基因敲除模型、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、转录组学、蛋白质组学、GLISA检测 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质数据 | 未明确说明样本数量，使用基因敲除小鼠模型进行研究 |
| 192 | 2025-06-15 |
scATD: a high-throughput and interpretable framework for single-cell cancer drug resistance prediction and biomarker identification
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf268
PMID:40501071
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research paper | 提出了一种名为scATD的高通量、可解释的单细胞癌症耐药性预测和生物标志物识别框架 | scATD框架利用大型语言模型进行高通量药物敏感性预测，无需针对不同患者单细胞数据集进行模型微调，提高了预测速度和临床适用性 | 未明确提及具体局限性 | 开发一个能够快速预测单细胞水平癌症药物敏感性的高通量框架 | 单细胞RNA测序数据 | digital pathology | cancer | single-cell RNA sequencing | scATD-sf, scATD-gf, scATD-sf-dist (基于scFoundation和Geneformer大型语言模型) | 单细胞基因表达数据 | 未明确提及具体样本量 |
| 193 | 2025-06-15 |
Showcasing the Comprehensive Understanding of Cellular Profiling and Human Neurophysiology
2025-May, Journal of pharmacy & bioallied sciences
DOI:10.4103/jpbs.jpbs_46_25
PMID:40511047
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research paper | 本文系统性地探讨了细胞分析与人神经生理学的交叉领域，旨在揭示它们在理解神经过程、细胞反应及疾病中的相互作用 | 采用单细胞RNA测序和电生理学方法，探索人类样本中的细胞异质性和神经生理学表型，为设计高特异性治疗方案提供基础 | NA | 理解细胞分析与人神经生理学在神经过程和疾病中的相互作用 | 人类样本中的细胞异质性和神经生理学表型 | 分子生物学与神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 电生理学方法 | NA | 分子数据, 电生理数据 | NA |
| 194 | 2025-06-14 |
Huangqi decoction ameliorated intestinal barrier dysfunction via regulating NF-κB signaling pathway in slow transit constipation model mice
2025-May-27, World journal of gastrointestinal surgery
IF:1.8Q2
DOI:10.4240/wjgs.v17.i5.106000
PMID:40502512
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研究论文 | 研究黄芪汤通过调节NF-κB信号通路改善慢传输型便秘模型小鼠的肠道屏障功能障碍 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组测序技术，揭示了黄芪汤通过抑制NF-κB信号通路恢复肠道屏障功能的分子机制 | 研究仅在小鼠模型和LS174T细胞系中进行，尚未在人体临床试验中验证 | 探究黄芪汤是否通过下调NF-κB信号通路和恢复肠道屏障功能来缓解慢传输型便秘 | KM小鼠和LS174T细胞系 | 消化系统疾病研究 | 慢传输型便秘 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, 免疫组织化学, Western blot | 动物模型 | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | KM小鼠分组（对照组、模型组和黄芪汤治疗组）和LS174T细胞系 |
| 195 | 2025-06-14 |
Efficacy, safety and exploratory analysis of neoadjuvant tislelizumab (a PD-1 inhibitor) plus nab-paclitaxel followed by epirubicin/cyclophosphamide for triple-negative breast cancer: a phase 2 TREND trial
2025-May-26, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02254-3
PMID:40414961
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研究论文 | 评估tislelizumab联合nab-paclitaxel和表柔比星/环磷酰胺作为三阴性乳腺癌新辅助治疗的有效性和安全性 | 首次在II期TREND试验中评估tislelizumab联合化疗作为三阴性乳腺癌新辅助治疗的疗效，并进行了单细胞RNA测序等多种组学分析 | 单臂研究设计，缺乏对照组，样本量较小（53例患者） | 确定三阴性乳腺癌患者从新辅助免疫治疗中获益的最佳化疗方案和特定人群 | 三阴性乳腺癌患者 | 肿瘤学 | 三阴性乳腺癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, TCR-seq, cyTOF, WES | NA | 临床数据，组学数据 | 53例三阴性乳腺癌患者（44例完成治疗） |
| 196 | 2025-06-14 |
Dissecting PTPN7-driven aggressiveness in IDH-wildtype astrocytomas: multi-omics, clinical validation, and spatial transcriptomics for prognostic insights
2025-May-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02662-5
PMID:40413344
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研究论文 | 本研究探讨了PTPN7在IDH野生型星形细胞瘤中的预后意义、空间分布及免疫相关功能，旨在阐明其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 首次全面评估PTPN7在胶质瘤中的预后价值和免疫调节作用，并利用空间转录组学揭示其分布特征 | 研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证PTPN7的具体作用机制 | 探索PTPN7作为胶质瘤预后生物标志物和免疫治疗靶点的潜力 | IDH野生型星形细胞瘤 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、免疫组化 | Cox生存分析、CIBERSORT免疫去卷积 | mRNA表达数据、蛋白质表达数据 | TCGA和CGGA数据库样本、70例免疫组化验证病例 |
| 197 | 2025-06-14 |
Functional heterogeneity and clinical implications of CD4+ T cell subtypes in high-grade serous ovarian carcinoma
2025-May-24, World journal of clinical oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.5306/wjco.v16.i5.104138
PMID:40503412
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序分析了高级别浆液性卵巢癌中CD4+ T细胞亚型的功能异质性及其临床意义 | 首次在高级别浆液性卵巢癌中系统描述了CD4+ T细胞亚型的空间分布特征，并鉴定出与不良预后相关的Treg3亚型 | 样本量相对有限（42例患者），且仅分析了附件组织和腹水样本 | 阐明CD4+ T细胞亚型在高级别浆液性卵巢癌中的功能异质性和组织特异性分布，寻找治疗靶点 | 42例高级别浆液性卵巢癌患者的附件组织和腹水样本 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 42例高级别浆液性卵巢癌患者 |
| 198 | 2025-06-14 |
Study on Liver Sinusoidal Endothelial Cell Fenestrations Based on Cellular Omics-Structure Integration Technology and Its Application in Metabolic Diseases
2025-May-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.16.653525
PMID:40475559
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研究论文 | 本研究开发了一种新的细胞组学-结构整合技术平台（COSI），用于在单细胞水平同时获取基因表达谱和超分辨率细胞结构信息 | 开发了能够同时获取单细胞基因表达谱和超分辨率荧光图像的整合技术平台，填补了现有空间组学和细胞生物学研究的空白 | 未明确说明技术平台在临床应用中的具体限制条件 | 研究肝窦内皮细胞窗孔形成的分子机制及其在代谢疾病中的应用 | 原代肝窦内皮细胞 | 细胞生物学 | 代谢疾病 | 单细胞转录组学、超分辨率荧光显微镜、电子显微镜、深度学习分辨率增强 | 深度学习 | 基因表达数据、超分辨率图像数据 | 未明确说明具体样本数量，但包括原代肝窦内皮细胞以及NASH和糖尿病小鼠模型 |
| 199 | 2025-06-14 |
Single-cell RNA sequencing reveals SLC31A1-mediated M2 polarization of macrophages promotes malignant progression in triple-negative breast cancer
2025-May-14, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-025-06191-0
PMID:40360897
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示SLC31A1介导的巨噬细胞M2极化促进三阴性乳腺癌恶性进展的机制 | 首次发现SLC31A1在三阴性乳腺癌髓系细胞（特别是巨噬细胞亚群）中的过表达，并阐明其通过诱导巨噬细胞M2极化促进肿瘤恶性表型的新机制 | 研究主要基于体外实验，需要进一步体内实验验证；临床样本量有限 | 探究三阴性乳腺癌免疫微环境中的关键调控因子及其作用机制 | 三阴性乳腺癌组织样本和细胞系 | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | scRNA-seq, qPCR, 流式细胞术, Transwell实验, 划痕实验, 铜离子和H2O2检测 | NA | 单细胞转录组数据, 分子生物学实验数据 | 未明确说明样本数量（三阴性乳腺癌组织） |
| 200 | 2025-06-14 |
In situ profiling of plasma cell clonality with image-based single-cell transcriptomics
2025-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.09.653118
PMID:40463110
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研究论文 | 本文介绍了一种名为BCR-MERFISH的图像单细胞转录组学方法，用于在组织中分析浆细胞的克隆性 | 开发了BCR-MERFISH技术，结合V基因使用和转录组分析，首次在组织原位区分浆细胞克隆 | 目前仅在细胞培养和小鼠模型中验证，尚未应用于人类样本 | 研究浆细胞在组织中的克隆多样性和分布模式 | 小鼠肠道中的浆细胞 | 数字病理学 | NA | BCR-MERFISH（B细胞受体多重误差鲁棒荧光原位杂交） | NA | 图像和转录组数据 | 细胞培养和小鼠肠道组织样本 |