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当前共找到 799 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-07 |
DNA methylation changes during acute COVID-19 are associated with long-term transcriptional dysregulation in patients' airway epithelial cells
2025-May, EMBO molecular medicine
IF:9.0Q1
DOI:10.1038/s44321-025-00215-5
PMID:40119174
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研究论文 | 本研究通过分析COVID-19患者急性期鼻细胞的DNA甲基化组和单细胞RNA测序数据，揭示了与长期转录失调相关的表观遗传变化 | 首次将急性COVID-19期间的DNA甲基化变化与患者气道上皮细胞长达12个月的长期转录失调联系起来，并发现纤毛功能基因的持续抑制与症状相关 | 样本量相对较小（急性期n=19，随访样本更少），且为观察性研究，无法确定甲基化变化与长期症状之间的因果关系 | 探究SARS-CoV-2感染后持续健康影响的分子机制，特别是表观遗传调控在长期转录失调中的作用 | COVID-19患者和对照组的鼻细胞（气道上皮细胞） | 表观遗传学 | COVID-19 | 酶促DNA甲基化组测序，单细胞RNA测序 | NA | DNA甲基化数据，单细胞转录组数据 | 急性期：COVID-19患者19人（其中14人进行scRNA-seq），对照组14人（其中10人进行scRNA-seq）；随访：感染后3个月7人，12个月5人；独立验证队列：感染后6个月15人 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-02-05 |
An engineered viral protein activates STAT5 to prevent T cell suppression
2025-05-23, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adn9633
PMID:40408430
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研究论文 | 本研究通过工程化改造疱疹病毒蛋白TIP，使其能够招募LCK激酶直接激活T细胞中的STAT5蛋白，从而在无细胞因子的情况下维持CD8+ T细胞的存活和功能，并增强其在实体瘤中的抗肿瘤效果 | 首次利用工程化的病毒蛋白TIP作为平台，强制招募LCK激酶至STAT蛋白，实现了细胞因子非依赖性的靶向STAT激活，并重编程了T细胞内的信号通路 | 研究主要基于体外和动物模型，其临床转化效果和长期安全性尚未在人体中得到验证 | 旨在克服T细胞疗法中因JAK-STAT信号失调导致的功能受损问题，增强T细胞在实体瘤中的持久性和功能性 | 工程化病毒蛋白TIP、LCK激酶、STAT5蛋白、CD8+ T细胞、实体瘤模型 | 免疫工程、合成生物学 | 实体瘤 | 单细胞转录组学、蛋白质工程、体内肿瘤模型 | NA | 基因表达数据、功能实验数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-01-21 |
Altered Hepatic Metabolism in Down Syndrome
2025-May-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.27.656393
PMID:40502193
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了唐氏综合征患者中肝脏代谢的改变，特别是胆汁酸水平升高和肝功能异常蛋白标志物 | 首次在唐氏综合征中系统报道了广泛的代谢变化，并利用小鼠模型和单细胞转录组学验证了胆汁酸代谢紊乱与肝脏病理的关联 | 研究样本量相对有限，且主要基于血浆分析，未深入探讨其他组织或长期临床影响 | 探究唐氏综合征中肝脏代谢的改变及其潜在机制 | 唐氏综合征患者和小鼠模型 | 代谢组学 | 唐氏综合征 | 多组学分析、bulk RNA-seq、单细胞转录组学 | Dp16小鼠模型 | 血浆、RNA序列数据 | 超过400人 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 4 | 2026-01-21 |
Interpretable Trajectory Inference with Single Cell Linear Adaptive Negative-binomial Expression (scLANE) Testing
2025-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.19.572477
PMID:38187622
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研究论文 | 本文提出了一种名为scLANE的可解释轨迹推断方法，用于单细胞RNA-seq数据中的基因表达动态分析 | scLANE测试基于可解释的广义线性模型，通过经验选择的基样条处理非线性，并扩展至估计方程和混合模型，以支持复杂实验设计下的可靠轨迹测试 | NA | 开发一种可解释的轨迹推断方法，以识别与生物轨迹进展显著相关的基因表达变化 | 单细胞RNA-seq数据中的基因表达动态 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | 广义线性模型（GLM）、基样条、估计方程、混合模型 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-01-18 |
Myeloid Fatty Acid Metabolism Activates Neighboring Hematopoietic Stem Cells to Promote Heart Failure With Preserved Ejection Fraction
2025-May-20, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本文通过比较患者样本和动物模型，揭示了骨髓脂肪酸代谢如何激活邻近造血干细胞，从而促进射血分数保留的心力衰竭（HFpEF）的机制 | 首次发现骨髓脂肪酸代谢通过重塑Vcam1启动子激活造血干细胞，促进HFpEF的系统性炎症和心脏舒张功能障碍 | 研究主要基于动物模型和体外实验，人类样本验证有限，且HFpEF的复杂病理机制可能涉及其他未被探索的因素 | 探究HFpEF中骨髓脂肪酸代谢对造血干细胞激活的因果机制 | HFpEF患者样本、小鼠模型、骨髓细胞和造血干细胞 | 心血管疾病 | 心力衰竭 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、质谱分析、碳标记 | NA | 基因表达数据、代谢数据、细胞表型数据 | 患者样本和小鼠模型，具体数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-01-14 |
Evaluating the practical aspects and performance of commercial single-cell RNA sequencing technologies
2025-May-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.19.654974
PMID:40475448
|
研究论文 | 本文通过标准化PBMCs样本，全面比较了多种商业单细胞RNA测序技术的性能，包括细胞回收率、测序效率、灵敏度、细胞注释和差异基因表达等指标 | 首次对七种全转录组mRNA测序试剂盒和两种包含TCR分析的试剂盒进行标准化比较，强调实验约束对细胞亚型分辨能力的影响 | 研究仅使用PBMCs样本，可能无法完全代表其他组织或细胞类型的性能差异 | 评估商业单细胞RNA测序技术的实际应用性能和选择标准 | 来自不同供者的标准化外周血单个核细胞（PBMCs） | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个供者的PBMCs样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-01-14 |
Transcriptomic Signature-Guided Depletion of Intermediate Alveolar Epithelial Cells Ameliorates Pulmonary Fibrosis in Mice
2025-May-21, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6623390/v1
PMID:40470235
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，识别了肺纤维化中关键的中间肺泡上皮细胞状态，并开发了一种基于RNA感知的蛋白质翻译技术，选择性靶向并消除这些细胞，从而在小鼠模型中减轻肺纤维化 | 引入了一种新型的RNA感知依赖性蛋白质翻译技术，用于选择性靶向和功能研究中间肺泡上皮细胞，并首次利用Sprr1a作为特异性标记物来区分这些细胞 | 研究主要基于小鼠模型，人类应用仍需进一步验证；技术特异性可能受限于标记物表达水平 | 探究中间肺泡上皮细胞在肺纤维化发生中的具体作用，并开发靶向治疗策略 | 小鼠模型中的Krt8+ ADI细胞和人类KRT5-/KRT17+异常基底样细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），RNA感知依赖性蛋白质翻译技术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8 | 2026-01-14 |
DRUG AND SINGLE-CELL GENE EXPRESSION INTEGRATION IDENTIFIES SENSITIVE AND RESISTANT GLIOBLASTOMA CELL POPULATIONS
2025-May-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.15.654044
PMID:40462892
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研究论文 | 本研究开发了一个名为ISOSCELES的新框架，通过整合单细胞基因表达数据和药物反应签名，量化胶质母细胞瘤细胞对药物的敏感性和耐药性景观 | ISOSCELES框架首次整合单细胞RNA测序数据和L1000表达签名，以预测不同细胞状态对药物的差异反应，并识别出OLIG2抑制剂与Depatux-M的新型组合疗法 | 研究未明确说明样本量大小或验证实验的详细范围，可能限制结果的普适性 | 开发一个预测胶质母细胞瘤不同细胞状态对药物敏感性和耐药性的平台，以促进治疗开发 | 新诊断和复发性胶质母细胞瘤肿瘤的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | ISOSCELES框架 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9 | 2026-01-14 |
A computational framework for mapping isoform landscape and regulatory mechanisms from spatial transcriptomics data
2025-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.02.651907
PMID:40654841
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为SPLISOSM的计算框架，用于从空间转录组学数据中检测异构体分辨率的模式 | SPLISOSM利用多元测试来考虑位点和异构体水平的依赖性，在稀疏数据上表现出稳健且理论依据充分的性能 | NA | 研究转录多样性（包括剪接和替代3'端使用）的空间协调机制 | 小鼠大脑和人类胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | 神经精神疾病，胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | 多元统计模型 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 10 | 2026-01-12 |
Defining pathogenic IL-17 and CSF-1 gene expression signatures in chronic graft-versus-host disease
2025-May-08, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024025337
PMID:39977705
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序方法，在慢性移植物抗宿主病（cGVHD）小鼠模型中定义了IL-17和CSF-1的基因表达特征，并验证了这些特征在患者中的可检测性 | 利用单细胞测序技术在小鼠血液单核细胞中定义了非直观的IL-17和CSF-1基因表达特征，并首次在cGVHD患者中验证了这些特征的临床相关性 | 研究基于小鼠模型推导特征，在患者中的验证样本量有限，且特征仅在70%诊断时和50%后续发病患者中检测到，可能存在假阴性 | 开发用于识别cGVHD患者中可药物靶向的免疫失调的生物标志物，以指导个体化治疗选择 | 慢性移植物抗宿主病（cGVHD）的小鼠模型和患者样本 | 单细胞测序 | 慢性移植物抗宿主病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量，但涉及小鼠模型和患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-01-11 |
Overexpression of Meis factors in late-stage retinal progenitors yields complex effects on temporal patterning and neurogenesis
2025-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.01.651492
PMID:40654906
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研究论文 | 本研究通过在小鼠晚期视网膜祖细胞中过表达Meis1和Meis2转录因子，探究其对细胞时间身份和神经发生的影响 | 首次在晚期视网膜祖细胞中系统研究Meis1和Meis2过表达对时间模式调控和神经发生能力的影响，揭示了二者在晚期发育阶段具有非重叠的调控功能 | 过表达Meis因子未能完全重编程晚期祖细胞的时间身份，且研究仅在小鼠模型中进行，未涉及人类细胞或体内长期功能验证 | 探究转录因子Meis1和Meis2在晚期视网膜祖细胞中对时间身份决定和神经发生的调控作用 | 出生后小鼠的视网膜祖细胞 | 发育生物学 | NA | 电穿孔转染、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，使用小鼠视网膜祖细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-01-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals distinct senotypes and a quiescence-senescence continuum at the transcriptome level following chemotherapy
2025-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.13.653730
PMID:40463227
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研究论文 | 本研究结合延时成像与单细胞RNA测序，揭示了化疗后细胞在转录组水平上存在不同的衰老类型以及静息-衰老连续体 | 首次通过单细胞RNA测序结合延时成像，将异质性细胞周期表型与转录组景观联系起来，并识别出多种衰老类型及两种不同的细胞周期阻滞途径 | 研究仅使用依托泊苷处理，未涵盖其他化疗药物；样本来源和数量未明确说明 | 区分化疗后细胞的静息与衰老状态，并探究其转录组特征 | 化疗处理后的细胞 | 单细胞组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，延时成像 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-01-09 |
ABCC3 Is a Differential Marker of CYP11B2-Negative Zona Glomerulosa Cells in Human Adrenal Cortex
2025-May-07, Endocrine pathology
IF:11.3Q1
DOI:10.1007/s12022-025-09862-3
PMID:40332623
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研究论文 | 本研究揭示了ABCC3作为人类肾上腺皮质中CYP11B2阴性球状带细胞的新型标志物，可用于区分正常肾上腺分区与醛固酮增多症相关的病变 | 首次发现ABCC3与醛固酮合酶CYP11B2在肾上腺球状带细胞中呈反向表达模式，并证明ABCC3可作为特异性区分CYP11B2阴性球状带细胞的标志物 | 研究主要基于组织样本和体外细胞实验，尚未在更大规模的临床队列中验证ABCC3标志物的诊断效能 | 探究ABCC3在人类肾上腺皮质中的表达模式及其在原发性醛固酮增多症中的病理学意义 | 人类肾上腺皮质组织、醛固酮生成腺瘤、皮质醇生成腺瘤、无功能腺瘤、醛固酮生成微结节及培养的人肾上腺皮质细胞 | 病理学 | 原发性醛固酮增多症 | 空间转录组学、免疫荧光共定位、细胞培养、基因表达分析 | NA | 组织样本、细胞样本、基因表达数据 | 多种肾上腺腺瘤样本及相邻肾上腺皮质组织 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 14 | 2026-01-08 |
Time-Varying Gene Regulatory Networks Inference Using KL Divergence from Single Cell Data
2025-May, Proceedings of the ... International Conference on Bioinformatics and Biomedical Technology
DOI:10.1109/icbbt65815.2025.11276344
PMID:41488127
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研究论文 | 本文提出了一种基于KL散度的新框架，用于从时间序列单细胞RNA测序数据中推断时变基因调控网络 | 整合KL散度的时间变异测量、自回归模型和正则化方法，以应对高维、稀疏和时序异质性的挑战 | NA | 从时间序列单细胞RNA测序数据中准确重建动态基因调控网络 | 10基因合成数据集和THP-1单核细胞分化数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自回归模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-01-06 |
Mapping satellite glial cell heterogeneity reveals distinct spatial organization and signifies functional diversity in the dorsal root ganglion
2025-May-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.19.654813
PMID:40475507
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研究论文 | 本研究首次全面表征了小鼠背根神经节中卫星胶质细胞的异质性，并通过整合单细胞RNA测序与免疫组化等技术，识别、验证并空间定位了四个不同的SGC亚群 | 首次在小鼠背根神经节中对卫星胶质细胞异质性进行综合表征，识别并空间定位了四个功能不同的SGC亚群，并在人类DRG中发现了内外双层SGC结构 | NA | 探究背根神经节中卫星胶质细胞的异质性、空间分布及其潜在功能意义 | 小鼠和人类背根神经节中的卫星胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 原位杂交, 先进成像技术 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-01-06 |
High-Sensitivity PD-L1 Staining Using Clone 73-10 Antibody and Spatial Transcriptomics for Precise Expression Analysis in Non-Tumorous, Intraepithelial Neoplasia, and Squamous Cell Carcinoma of Head and Neck
2025-May-20, Head and neck pathology
DOI:10.1007/s12105-025-01798-8
PMID:40392349
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研究论文 | 本研究利用高灵敏度克隆73-10抗体和空间转录组学技术，评估头颈部鳞状细胞癌中PD-L1的表达，旨在扩大免疫检查点抑制剂治疗的适用患者范围 | 首次结合高灵敏度克隆73-10抗体和空间转录组学分析，系统评估PD-L1在头颈部鳞状细胞癌、上皮内瘤变及正常组织中的表达，并揭示其与免疫微环境及预后的关联 | 样本量相对有限（94例临床样本，其中6例进行空间转录组学分析），且为单中心研究，可能影响结果的普遍性 | 评估PD-L1在头颈部鳞状细胞癌中的表达，探索其作为免疫治疗生物标志物的潜力，以优化患者筛选策略 | 头颈部鳞状细胞癌患者组织样本，包括癌组织、配对的上皮内瘤变及正常口腔黏膜 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 免疫组织化学染色，空间转录组学 | NA | 组织图像，转录组数据 | 94例头颈部鳞状细胞癌临床样本，包括配对的鳞状上皮内瘤变和正常口腔黏膜样本，其中6例进行了空间转录组学分析 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 17 | 2026-01-04 |
Pseudoassembly of k-mers
2025-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.11.653354
PMID:40463286
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研究论文 | 本文介绍了一种通过彩色de Bruijn图识别基因组序列变异的方法，并实现了名为klue的程序 | 提出了一种基于k-mer伪组装的方法，用于识别单细胞RNA-seq数据中的细胞类型特异性变异 | NA | 开发一种识别基因组序列变异的新方法 | 小鼠黑色素瘤模型中的单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA-seq | 彩色de Bruijn图 | 基因组序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-01-02 |
Resident CD24 +LCN2 + LPCs aggravate fibrosis and inflammatory progression via the recruitment of TPPP3 +COL10A1 + macrophages in NASH
2025-May-16, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2025081
PMID:40380802
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研究论文 | 本研究揭示了在非酒精性脂肪性肝炎（NASH）中，驻留的CD24+LCN2+肝脏祖细胞（LPCs）通过招募TPPP3+COL10A1+巨噬细胞亚型，加剧纤维化和炎症进展 | 首次在人类NASH中鉴定出驻留的CD24+LCN2+ LPCs，并阐明其通过促进促炎性巨噬细胞亚型（MP-2，标记为COL10A1和TPPP3）的激活来驱动纤维化的分子机制 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和计算分析，虽然在小鼠模型和人类样本中进行了验证，但具体的功能机制和靶向干预策略仍需进一步实验验证 | 探究人类NASH中肝脏祖细胞（LPCs）的分子表型及其调控机制，特别是在纤维化和炎症进展中的作用 | 人类NASH患者的肝脏样本、NASH小鼠模型（CDAHFD和HFD）以及相关的RNA测序数据集 | 单细胞组学 | 非酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNA测序、细胞通讯分析（CellChat和NicheNet） | NA | 单细胞RNA测序数据、RNA测序数据 | 临床NASH样本、NASH小鼠模型及人类NASH肝脏样本（具体数量未在摘要中明确） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-01-02 |
Randomized phase 2 trial of pembrolizumab alone or in combination with low dose chemotherapy for patients with non-small cell lung cancer and poor performance status
2025-May, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.lungcan.2025.108513
PMID:40203764
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研究论文 | 本研究是一项针对体能状态不佳的晚期非小细胞肺癌患者的随机II期临床试验，比较了帕博利珠单抗单药与联合低剂量化疗的疗效 | 首次在体能状态不佳（ECOG PS 2）的晚期NSCLC患者中，直接比较帕博利珠单抗单药与联合极低剂量化疗的疗效，并探索了相关的血液生物标志物 | 样本量较小（共43例患者），为II期研究，需要更大规模的III期试验验证结果 | 确定对于体能状态不佳的晚期非小细胞肺癌患者，帕博利珠单抗联合低剂量化疗是否比单药帕博利珠单抗更有效 | 晚期非小细胞肺癌且ECOG体能状态评分为2的患者 | NA | 肺癌 | 流式细胞术, 单细胞测序 | NA | 临床数据, 血液样本 | 43名患者（每组20名可评估疗效），其中20名提供了可选血液样本用于生物标志物分析 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 20 | 2025-12-31 |
Decoding muscle-resident Schwann cell dynamics during neuromuscular junction remodeling
2025-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.06.561193
PMID:38370853
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了肌肉驻留施万细胞在神经肌肉接头重塑中的作用，特别是在去神经和再神经过程中的动态变化 | 发现了一种新型的末端施万细胞亚型，该亚型在去神经-再神经循环中起关键作用，并识别了SPP1信号作为神经肌肉接头动态的关键调节因子 | NA | 探究肌肉驻留施万细胞在神经肌肉接头重塑中的贡献 | 肌肉驻留施万细胞，包括末端施万细胞和髓鞘施万细胞亚型 | 数字病理学 | 神经肌肉疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |