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当前共找到 802 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals distinct plasma cell populations in chronic thromboembolic pulmonary hypertension
2025-05, Journal of thrombosis and haemostasis : JTH
IF:5.5Q1
DOI:10.1016/j.jtha.2025.02.010
PMID:39965671
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示慢性血栓栓塞性肺动脉高压中浆细胞的独特亚群特征 | 首次发现AHNAK和IGLC3两个新型浆细胞亚群，并揭示其分化轨迹和功能特征 | 样本量有限（5例患者和6例正常肺动脉），需要更大规模验证 | 识别CTEPH中浆细胞的表型改变和分化模式 | 慢性血栓栓塞性肺动脉高压患者的肺动脉内膜切除组织和血浆样本 | 单细胞转录组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序，蛋白电泳 | GeneSwitches分析，轨迹分析 | 单细胞转录组数据，蛋白质数据 | 5例CTEPH患者，6例正常肺动脉，273例CTEPH患者，259例IPAH患者，251例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2025-05-09 |
BRAF mutation cancer, colorectal cancer, tumor associated lymph node structure and immune microenvironment study: MAPK protein kinase molecular action and SIRPG-CD47 protein signaling pathway
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142191
PMID:40101830
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研究论文 | 本研究探讨了BRAF基因突变对结直肠癌免疫微环境重塑的影响，特别是对肿瘤相关淋巴结构成熟和功能的影响 | 通过单细胞RNA测序、伪时间轨迹分析和空间转录组分析，揭示了BRAF突变对T细胞亚群和B细胞亚群的影响，以及其在肿瘤免疫微环境重塑中的作用 | 研究样本量未明确说明，可能影响结果的普遍性 | 系统评估BRAF基因突变对结直肠癌免疫微环境重塑的影响 | 结直肠癌患者的临床样本 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、伪时间轨迹分析、空间转录组分析、免疫组织化学、多重荧光染色技术 | NA | RNA测序数据、免疫组织化学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 3 | 2025-10-06 |
SOX4 as a Key Oncogene Driving Tumor Invasion in Retinoblastoma
2025-05-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.5.24
PMID:40402518
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研究论文 | 本研究探讨SOX4在视网膜母细胞瘤侵袭中的作用及其致癌通路机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示SOX4在MKI67+光感受器减少细胞中特异性高表达，并证实其通过Wnt/β-catenin和cyclin D1信号通路驱动肿瘤侵袭 | 研究样本量有限，机制研究主要基于细胞系和动物模型，需要更多临床样本验证 | 探索SOX4在视网膜母细胞瘤侵袭中的作用及分子机制 | 人视网膜组织、眼内和眼外视网膜母细胞瘤样本、RB细胞系(Y79, WERI-RB1)及异种移植模型 | 癌症生物学 | 视网膜母细胞瘤 | RNA-seq, scRNA-seq, siRNA敲除, CCK-8, EdU, 克隆形成, Transwell实验 | NA | 基因表达数据, 细胞功能数据 | 人视网膜组织、RB组织样本及两种RB细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 4 | 2026-07-23 |
ICOS+CD4+ T cells define a high susceptibility to anti-PD-1 therapy-induced lung pathogenesis
2025-05-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.186483
PMID:40198121
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研究论文 | 本研究探讨了抗PD-1治疗引发的肺部病理发生机制，发现ICOS+CD4+ T细胞在老年小鼠和患者中易导致免疫相关不良事件 | 首次揭示ICOS+CD4+ T细胞在抗PD-1治疗诱导的肺部毒性中的关键作用，并确认了年龄因素对免疫相关不良事件易感性的影响 | 主要基于小鼠模型，人类样本验证有限，且未完全阐明ICOS+CD4+ T细胞活化的上游信号通路 | 阐明抗PD-(L)1治疗中免疫相关不良事件的细胞机制，特别是年龄对肺部毒性的影响 | 荷瘤老年小鼠和癌症患者 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 老年小鼠和年轻小鼠，以及癌症患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-07-23 |
Shared roles of immune and stromal cells in the pathogenesis of human bronchiolitis obliterans syndrome
2025-05-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.176596
PMID:40232854
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类闭塞性细支气管炎综合征的免疫和基质细胞在发病机制中的共享作用 | 首次在两种形式的人类BOS（CLAD-BOS和cGVHD-BOS）中鉴定出CD8+组织驻留记忆T细胞的扩增群体，并发现其与其他慢性肺疾病不同，同时揭示了非免疫细胞群中与巨噬细胞趋化和增殖相关的基因和通路 | 样本量较小（CLAD-BOS患者4例、cGVHD-BOS患者3例、对照组3例），可能限制了结果的普遍性 | 阐明闭塞性细支气管炎综合征的发病机制，寻找共享的细胞和分子通路 | 人类闭塞性细支气管炎综合征的肺部组织样本 | 自然语言处理 | 慢性肺病，移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10例：4例CLAD-BOS患者、3例cGVHD-BOS患者、3例对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-07-23 |
Characterization of a pathogenic nonmigratory fibroblast population in systemic sclerosis skin
2025-05-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.185618
PMID:40232859
|
研究论文 | 研究系统性硬化症皮肤中一种致病性非迁移成纤维细胞群体的特征 | 首次从皮肤活检中分离出非迁移的“驻留”成纤维细胞群体，并与常规外植体培养的迁移细胞进行比较，揭示其在疾病不同阶段和自身抗体亚组中的致病差异 | 未提供明确的局限性说明 | 探索系统性硬化症中非迁移成纤维细胞群体的致病作用及其在纤维化中的潜在角色 | 系统性硬化症患者的成纤维细胞（迁移和驻留群体） | 机器学习和数字病理学 | 系统性硬化症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 多通道免疫荧光 | NA | 文本和图像 | 从系统性硬化症患者的皮肤活检组织中分离的成纤维细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-07-23 |
Transcriptional signatures of endothelial cells shape immune responses in cardiopulmonary health and disease
2025-05-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.191059
PMID:40401523
|
综述 | 本文综述了心肺脉管系统中内皮细胞的转录特征及其在免疫调控中的作用，重点关注单细胞RNA测序揭示的细胞异质性和疾病状态下的转录重编程 | 首次系统总结心肺系统中内皮细胞亚群的免疫调节特性，包括抗原呈递、细胞因子分泌、免疫细胞募集等功能的转录特征，并提出内皮细胞作为未来治疗靶点的潜力 | 未提供具体实验数据验证，依赖现有文献综述，可能缺乏对不同疾病模型中内皮细胞功能的定量比较 | 阐述心肺健康与疾病中内皮细胞的免疫调控功能，特别是适应性及非适应性免疫调节作用 | 心肺脉管系统中的内皮细胞亚群 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-07-23 |
Identification of maize genes that condition early systemic infection of sugarcane mosaic virus through single-cell transcriptomics
2025-05-12, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101297
PMID:40045576
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研究论文 | 通过单细胞转录组学鉴定甘蔗花叶病毒早期系统感染中起作用的玉米基因 | 首次利用单细胞RNA测序技术研究甘蔗花叶病毒早期系统感染期间病毒积累与细胞内基因表达变化的共变模式，识别了潜在抗病毒或促病毒因子 | 只关注了早期系统感染阶段，未覆盖后期症状表现或长期互作动态 | 探究玉米叶片早期系统感染甘蔗花叶病毒时病毒积累与基因表达变化的共变关系 | 甘蔗花叶病毒感染的玉米叶片 | 单细胞转录组学 | 植物病毒病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 甘蔗花叶病毒感染的玉米叶片样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-07-23 |
IFN-γ and donor leukocyte infusions for relapsed myeloblastic malignancies after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation
2025-05-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.190655
PMID:40131369
|
研究论文 | 一项I期临床试验评估了IFN-γ联合供体白细胞输注治疗异基因造血干细胞移植后复发的髓系恶性肿瘤的安全性和疗效 | 首次在人类临床试验中验证IFN-γ联合供体白细胞输注治疗移植后复发髓系肿瘤的安全性和初步疗效，并通过单细胞RNA测序证实IFN-γ在体内激活造血干细胞/髓系祖细胞中的IFN-γ反应通路 | 样本量较小（仅7例患者），需要更大规模研究正式验证该方法的疗效 | 评估IFN-γ联合供体白细胞输注治疗异基因造血干细胞移植后复发髓系恶性肿瘤的安全性和耐受性 | 异基因造血干细胞移植后复发的急性髓系白血病或骨髓增生异常综合征患者 | 数字病理学 | 急性髓系白血病, 骨髓增生异常综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 7例患者（其中6例接受供体白细胞输注） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10 | 2026-07-23 |
The brain-body circuit mediates acute stress-induced antiinflammatory reflex in bacterial cystitis by suppressing ILC2 activation
2025-05-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.189362
PMID:40100274
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研究论文 | 发现急性应激通过大脑-身体回路抑制膀胱ILC2细胞活化，从而减轻细菌性膀胱炎的炎症反应 | 首次揭示下丘脑室旁核（PVN）通过糖皮质激素信号直接调控ILC2细胞功能，形成脑-体抗炎反射通路 | 摘要未提及研究局限性 | 探究急性应激状态下大脑神经回路调控膀胱感染的分子机制 | 小鼠模型中的膀胱组织、室旁核神经元、2型先天淋巴细胞（ILC2） | 机器学习和单细胞转录组学 | 泌尿系统感染（膀胱炎） | 单细胞RNA测序、逆行神经示踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠膀胱免疫细胞（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 11 | 2026-07-23 |
Single-cell RNA-seq reveals the immune response of Co-infection with streptococcus pneumoniae after influenza A virus by a lung-on-chip: The molecular structure and mechanism of tight junction protein ZO-1
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.141815
PMID:40057081
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研究论文 | 利用肺芯片模型和单细胞RNA测序揭示甲型流感病毒与肺炎链球菌共感染对肺部免疫反应的影响，重点关注紧密连接蛋白ZO-1的分子结构和作用机制 | 首次结合人肺芯片模型和单细胞RNA测序技术，系统研究流感病毒与肺炎链球菌共感染对肺部免疫反应的影响，并揭示紧密连接蛋白ZO-1在维持肺屏障完整性中的关键作用及其下调与异常定位机制 | 未提及具体限制 | 探索甲型流感病毒与肺炎链球菌共感染对肺部免疫反应的影响，特别是紧密连接蛋白ZO-1的分子结构和作用机制 | 人肺芯片模型中甲型流感病毒与肺炎链球菌共感染的肺细胞 | 数字病理学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 12 | 2026-07-10 |
Systematic evaluation of single-cell RNA-seq analyses performance based on long-read sequencing platforms
2025-05, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.05.020
PMID:38782298
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研究论文 | 系统评估基于长读长测序平台的单细胞RNA测序分析性能 | 首次系统比较Oxford Nanopore Technologies (ONT)和Pacific Biosciences (PacBio)两种第三代测序技术在单细胞RNA测序分析中的性能，并使用NGS作对照评估其在细胞类型鉴定、新异构体识别和等位基因特异性表达方面的表现 | 未明确提及限制 | 系统性评估ONT和PacBio平台在单细胞RNA-seq分析中的性能，为单细胞转录组研究设计测序策略提供指导 | 来自相同单细胞cDNA文库的不同数量细胞 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA测序, 长读长测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 不同数量细胞的单细胞cDNA文库 | Oxford Nanopore Technologies, Pacific Biosciences | 单细胞RNA测序 | ONT, PacBio | ONT长读长测序平台, PacBio长读长测序平台 |
| 13 | 2026-07-06 |
Spatiotemporal analysis of lung immune dynamics in lethal Coccidioides posadasii infection
2025-05-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.02562-24
PMID:39611685
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research paper | 使用单细胞RNA测序和空间转录组学分析了致死性Coccidioides posadasii感染期间的肺部免疫动态 | 首次在高时间分辨率下结合单细胞RNA测序和空间转录组学揭示致死性球孢子菌感染中单核细胞源性巨噬细胞（表达Trem2）驱动组织重塑和纤维化的机制 | 主要基于小鼠模型，人类感染中的免疫反应差异尚未验证 | 阐明致死性球孢子菌感染期间肺部免疫反应的时空动态及其在组织损伤和纤维化中的作用 | 感染Coccidioides posadasii的小鼠肺部组织 | digital pathology | lung disease | single-cell RNA sequencing, spatial transcriptomics | NA | gene expression data, spatial transcriptomics data | 小鼠肺部样本 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium |
| 14 | 2026-07-04 |
Quantitative molecular cartography of emergency myelopoiesis reveals conserved modules of hematopoietic activation
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.28.656712
PMID:40501607
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序对紧急髓系造血进行定量分子图谱分析，揭示造血激活的保守模块 | 开发了通用化细胞注释方法HemaScribe和精炼的造血分化定量模型HemaScape，并揭示多种紧急髓系造血诱导策略及共享与独特的转录响应模块 | NA | 阐明不同紧急髓系造血诱导物如何通过共享或独特的分子机制调控造血干细胞和祖细胞 | 造血干细胞和祖细胞（HSPC） | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多项紧急髓系造血模式样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-07-04 |
Tumor-colonizing Pseudoalteromonas elyakovii metabolically reprograms the tumor microenvironment and promotes breast ductal carcinoma
2025-05-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03873-24
PMID:40192290
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研究论文 | 研究肿瘤定殖的Pseudoalteromonas elyakovii通过代谢重编程肿瘤微环境促进乳腺导管癌的机制 | 首次在物种水平上揭示乳腺导管癌内微生物动态变化，并结合双免疫荧光、SweAMI探针杂交和单细胞RNA测序深入分析瘤内微生物与肿瘤免疫的关系 | 研究样本量为102例，相对较小，且仅关注乳腺导管癌，可能限制结论的普适性 | 探究瘤内微生物群在乳腺癌发展和进展中的作用及其潜在的临床应用价值 | 乳腺导管癌患者的肿瘤组织及癌旁正常组织中的微生物组成和肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | qRT-PCR, 双免疫荧光染色, SweAMI探针杂交, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 微生物组数据, 免疫荧光图像 | 102份乳腺导管癌患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 16 | 2026-07-03 |
Dual oxic-anoxic co-culture enables direct study of anaerobe-host interactions at the airway epithelial interface
2025-05-14, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01338-24
PMID:40366160
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研究论文 | 描述了一种双有氧-无氧共培养方法，用于直接研究厌氧菌与气道上皮细胞在转录水平上的相互作用 | 提出双有氧-无氧共培养方法，能够同时维持厌氧菌和宿主细胞的活性，从而克服实验模型中厌氧菌和宿主细胞对氧气需求冲突的限制 | 共培养时间限于约48小时，且主要聚焦于单一厌氧菌模型，可能限制了长期相互作用和其他厌氧菌种类的普适性 | 研究厌氧菌与气道上皮细胞在疾病中的相互作用机制 | 厌氧菌（如具核梭杆菌）和气道气道上皮细胞 | 数字病理学 | 气道疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 17 | 2026-07-01 |
Longitudinal single cell RNA-sequencing reveals evolution of micro- and macro-states in chronic myeloid leukemia
2025-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.14.653262
PMID:40661452
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研究论文 | 通过纵向单细胞RNA测序揭示慢性髓系白血病微观与宏观状态的演变 | 建立理论框架解释离散疾病表型在单细胞尺度隐藏但在宏观水平清晰显现的机制，利用状态转移理论揭示细胞类型特异性贡献 | 未明确提及 | 阐明单细胞数据中离散疾病定义状态的形成机制 | 慢性髓系白血病（CML）进展模型 | 自然语言处理 | 白血病 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-06-30 |
Comprehensive Multi-Omics Analysis of Copper Metabolism Related Molecular Subtypes and Prognostic Risk Stratification in Colon Adenocarcinoma
2025-05, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70591
PMID:40391581
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研究论文 | 对结肠腺癌中铜代谢相关分子亚型进行综合多组学分析并构建预后风险分层模型 | 首次基于铜代谢相关基因全面分析结肠腺癌的分子亚型并构建预后风险模型，结合单细胞测序揭示铜代谢基因在肿瘤微环境中的空间和细胞分布，并通过体外实验验证COX19基因促进肿瘤细胞侵袭和增殖的功能 | 研究主要基于公共数据库数据，缺乏大规模独立临床样本的外部验证，体外实验未进行动物模型验证 | 探究铜代谢相关基因在结肠腺癌预后和肿瘤微环境中的作用机制 | 结肠腺癌细胞和组织样本 | 机器学习 | 结肠癌 | RNA-seq, 单细胞测序, western blot, PCR, siRNA, 集落形成实验, Transwell实验 | 风险模型 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | TCGA和GEO数据库中的结肠腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-06-29 |
Target Screening and Single Cell Analysis of Diabetic Retinopathy and Hepatocarcinoma
2025-05, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70521
PMID:40293350
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研究论文 | 旨在识别肝癌和糖尿病视网膜病变之间的共享基因和通路，以发现潜在治疗靶点 | 首次将铁蛋白吞噬相关基因表达与肝癌和糖尿病视网膜病变的细胞亚群及关键枢纽基因联系起来，揭示了两者共同的病理调控通路 | 基于公共数据集和体外模拟高糖微环境验证，缺乏体内实验和临床样本验证 | 探索肝癌与糖尿病视网膜病变之间的分子关联，发现潜在治疗靶点 | 肝癌和糖尿病视网膜病变的共享基因与通路 | 机器学习 | 肝癌, 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR | 机器学习模型 | 单细胞基因表达数据 | 使用GEO数据集包含大鼠视网膜和肝癌单细胞数据，具体样本量未说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-06-29 |
Characterising Shared and Specific Cell-Cell Communication in Cardiomyopathy Subtypes From Single-Cell Transcriptomics Data
2025-05, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70554
PMID:40344498
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研究论文 | 从单细胞转录组数据表征心肌病亚型中共享和特定的细胞间通讯 | 系统分析了四种心肌病亚型及健康供体中细胞间通讯的共性和差异，识别了共享的炎症、自身免疫等通用通路及亚型特异性通路 | NA | 理解心肌病亚型中细胞间相互作用的共同和独特特征，以推动靶向治疗 | 致心律失常性心肌病、扩张型心肌病、肥厚型心肌病、缺血性心肌病及健康供体心室区域的单细胞RNA测序数据 | 单细胞转录组学 | 心肌病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自致心律失常性心肌病、扩张型心肌病、肥厚型心肌病、缺血性心肌病患者及健康供体心室区域的多组样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |