单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 798 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-21 |
CTHRC1 expresses in cancer-associated fibroblasts and is associated with resistance to anti-androgen therapy in prostate cancer
2025-05, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01624-z
PMID:40009323
|
研究论文 | 本研究通过批量及单细胞RNA测序分析，探讨了CTHRC1在前列腺癌中的表达、预后价值及其与抗雄激素治疗耐药性的关系 | 首次揭示CTHRC1主要由肌成纤维细胞样癌相关成纤维细胞（myCAFs）表达，并通过CCN2/CAV1/AR通路调控雄激素受体信号，与抗雄激素治疗耐药相关 | 所有数据均来自公共数据库，缺乏体内外功能实验验证CTHRC1的具体分子机制 | 探索CTHRC1在前列腺癌中的表达及其基因功能，研究其预后价值和在治疗中的潜在作用 | 前列腺癌患者样本及正常对照组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 批量RNA测序，单细胞RNA测序，免疫组化染色 | CIBERSORT算法 | 图像，文本 | 1999例前列腺癌病例和531例正常对照，单细胞RNA测序数据包含来自7个前列腺原发肿瘤的62,995个细胞 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 2 | 2026-09-21 |
Decoding functional hematopoietic progenitor cells in the adult human lung
2025-May-01, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027884
PMID:40014797
|
研究论文 | 该研究揭示了成人肺脏中存在功能性造血祖细胞，并解析了其基因特征、空间定位及在干细胞移植中的潜在应用 | 首次在成人肺脏中证实功能性造血前体细胞存在于血管外空间，频率与骨髓相似，且具有增殖和植入小鼠的能力；发现肺源性CD34+造血祖细胞具有独特的基因表达特征，并可通过空间转录组学定位至肺泡间质微环境 | 研究主要基于小鼠移植实验和体外分析，肺脏造血祖细胞在人体内长期造血功能及临床意义尚需进一步验证 | 探究成人肺脏中是否存在功能性造血祖细胞及其特征，并评估其在造血干细胞移植中的潜在价值 | 成人肺脏组织、骨髓、外周血样本及小鼠模型 | 单细胞与空间组学 | 血液系统疾病 | 空间转录组学、单细胞基因表达分析、造血干细胞移植 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3 | 2026-09-20 |
Apoptosis inhibition reprograms alveolar myofibroblasts toward ductal myofibroblasts
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.26.654588
PMID:40492191
|
研究论文 | 通过抑制肺泡肌成纤维细胞凋亡，发现其可重编程为导管肌成纤维细胞，并揭示其命运可塑性和病理生理汇聚 | 首次通过诱导性BCL2过表达小鼠等位基因抑制AMF凋亡，证明AMF经凋亡清除，并发现其可成熟为DMF | 研究基于小鼠模型，结论是否适用于人类肺部发育和疾病尚需验证 | 探究肺泡肌成纤维细胞的凋亡清除及其命运可塑性 | 小鼠肺泡肌成纤维细胞、导管肌成纤维细胞及气道平滑肌细胞 | 单细胞转录组学、发育生物学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 4 | 2026-09-20 |
Time-Varying Gene Regulatory Networks Inference Using KL Divergence from Single Cell Data
2025-May, Proceedings of the ... International Conference on Bioinformatics and Biomedical Technology
DOI:10.1109/icbbt65815.2025.11276344
PMID:41488127
|
研究论文 | 提出一个结合KL散度时间变异度量、自回归模型和正则化方法从时间序列单细胞RNA测序数据推断时变基因调控网络的框架，并通过仿真和THP-1数据验证 | 将KL散度用于时间变异度量，与自回归模型及不同正则化方法结合，并利用偏相关分析细化相互作用符号，以推断时变调控网络 | 仅在10基因合成数据集和THP-1单核细胞分化数据集上验证，尚未在更大规模或更多真实生物学数据集上评估 | 从时间序列单细胞RNA测序数据中准确重建动态基因调控网络，以理解生物过程 | 时间序列scRNA-seq数据、基因调控网络、THP-1单核细胞分化过程 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自回归模型 | 基因表达数据 | 10基因合成数据集和THP-1单核细胞分化数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5 | 2026-09-18 |
Single-cell profiling reveals monocyte heterogeneity and association with liver fibrosis in patients with chronic HBV
2025-05-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000672
PMID:40227083
|
研究论文 | 通过对慢性乙型肝炎（CHB）患者和健康对照者的外周血单核细胞进行单细胞RNA测序，揭示了单核细胞异质性及其与肝纤维化的关联，发现LMO2高表达与单核细胞扩增相关，以及单核细胞-血小板聚集体（MPA）在肝纤维化早期阶段的重要作用 | 首次在慢性HBV感染合并肝纤维化患者中通过单细胞RNA测序揭示循环单核细胞的异质性，发现LMO2高表达可能与单核细胞扩增相关，并鉴定出一个高表达血小板相关基因（如ITGA2B）的经典单核细胞亚群即单核细胞-血小板聚集体（MPA），证明MPA通过CCL5信号促进肝星状细胞炎症因子表达 | 研究样本量相对有限，仅对循环单核细胞进行了单细胞RNA测序而缺乏肝脏组织内的验证，MPA参与肝纤维化的具体分子机制尚需进一步深入探究 | 探究慢性乙型肝炎患者循环单核细胞的异质性特征及其在肝纤维化进展中的作用机制 | 慢性乙型肝炎合并肝纤维化患者（CHB组）和健康对照者（HC组）的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 慢性乙型肝炎合并肝纤维化患者和健康对照者的外周血单核细胞样本（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6 | 2026-09-18 |
Single-cell RNA sequencing reveals a reprogramming of hepatic immune cells and a protective role for B cells in MASH-driven HCC
2025-05-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000668
PMID:40257356
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了MASH驱动肝细胞癌中肝脏免疫细胞的重编程，并发现B细胞通过增强T细胞反应发挥抗肿瘤保护作用 | 首次在MASH驱动的HCC小鼠模型中系统描绘了肝内免疫细胞（包括B细胞、T细胞和巨噬细胞）的转录重编程图谱，发现了一群扩增的活化B细胞亚群具有抗肿瘤基因表达特征并与肝癌患者生存率提高相关，并通过μMT小鼠B细胞清除实验证明了B细胞通过增强CD8+ T细胞活化来抑制肝癌进展的保护作用 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人类肝癌样本中进一步验证；单细胞RNA测序可能遗漏低表达基因和稀有细胞亚群；B细胞增强T细胞抗肿瘤免疫的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究MASH驱动肝细胞癌中肝内免疫细胞的异质性和基因表达谱，并阐明B细胞在抗肿瘤免疫中的作用 | 高脂高碳水化合物饮食喂养的MUP-uPA小鼠模型中的肝内免疫细胞，以及μMT B细胞缺陷小鼠 | 单细胞组学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7 | 2026-09-16 |
Comprehensive single-cell transcriptomic reveals different destinies of melanocytes and dynamic changes of immune microenvironment in a psychological stress-induced leukoderma and leukotrichia mouse model
2025-05-14, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01236-z
PMID:40361040
|
研究论文 | 该研究通过建立慢性不可预测轻度刺激（CUMS）小鼠模型，利用单细胞RNA测序全面揭示了心理应激诱导的白癜风/白发过程中黑素细胞的不同命运以及免疫微环境的动态变化 | 首次在CUMS诱导的白癜风小鼠模型中通过单细胞转录组鉴定出两个具有不同命运的黑素细胞亚群（Mel2为黑素细胞干细胞，易发生焦亡和坏死性凋亡；Mel3为成熟黑素细胞，易受氧化应激、线粒体功能障碍和铁死亡影响），并发现CXCL16-CXCR6轴在树突状细胞和γδT细胞/NKT细胞中的激活，提出了不同于CD8+细胞毒性T淋巴细胞介导模型的新型应激性白癜风发病机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 建立慢性心理应激诱导的白癜风与白发小鼠模型，通过单细胞转录组揭示黑素细胞命运分化及免疫微环境变化，探索应激性白癜风的发病机制 | C57BL/6J小鼠（CUMS模型组与对照组）的皮肤组织和脾脏组织 | 数字病理学 | 白癜风 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8 | 2026-09-16 |
The MYC/TXNIP axis mediates NCL-Suppressed CD8+T cell immune response in lung adenocarcinoma
2025-05-09, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01224-3
PMID:40346484
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和体内外实验，揭示NCL通过MYC/TXNIP轴抑制CD8+T细胞葡萄糖代谢和抗肿瘤免疫功能，促进肺腺癌进展 | 首次揭示NCL通过MYC/TXNIP轴调控CD8+T细胞葡萄糖代谢和免疫逃逸的机制 | 未明确说明 | 探讨NCL在肺腺癌细胞T细胞葡萄糖代谢和免疫逃逸中的作用 | 肺腺癌、CD8+T细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本、图像 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9 | 2026-09-16 |
Transcriptome-wide analysis reveals potential roles of CFD and ANGPTL4 in fibroblasts regulating B cell lineage for extracellular matrix-driven clustering and novel avenues for immunotherapy in breast cancer
2025-05-08, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01237-y
PMID:40340806
|
研究论文 | 该研究通过转录组范围的分析，识别了乳腺癌中基于细胞外基质（ECM）的分子分型，并构建了预后模型，揭示了CFD和ANGPTL4在成纤维细胞调节B细胞谱系中的作用及其对免疫治疗的潜在影响 | 首次基于ECM成分和调节因子的特征，利用非负矩阵分解（NMF）将乳腺癌患者分为三个ECM相关集群（C1神经型、C2 ECM型、C3免疫型），并构建了ECM相关指数（ECI）预后模型；发现了ANGPTL4+和CFD+成纤维细胞分别与C2表型和其他ECM集群相关，并通过不同信号通路调节B细胞谱系；揭示了CFD和ANGPTL4对免疫治疗反应的相反影响 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 研究乳腺癌中ECM的组成模式及其生物学功能，探索ECM相关集群与肿瘤微环境（TME）的关系，并构建预后模型以指导免疫治疗 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 转录组测序、单细胞转录组测序 | 非负矩阵分解（NMF）、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、机器学习 | 转录组数据、基因组数据、单细胞转录组数据 | TCGA数据库中的乳腺癌患者样本（数量未明确），以及10个独立公共队列：Metabric、SCAN_B、GSE12276、GSE16446、GSE19615、GSE20685、GSE21653、GSE58644、GSE58812、GSE88770；训练队列n=5,392，测试队列n=1,344；单细胞数据来自GSE161529 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-09-16 |
Surgery/anesthesia may cause monocytes to promote tumor development
2025-05-07, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01213-6
PMID:40335909
|
研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术深入分析了围手术期手术/麻醉对外周血单个核细胞的影响 | 首次在围手术期深入分析手术/麻醉对外周血单个核细胞的影响，发现非经典单核细胞在术后受到影响且在48小时内无恢复趋势 | 样本量较小，仅纳入4例患者 | 探讨手术/麻醉对围手术期外周血单个核细胞的影响 | 4例接受手术的患者的外周血样本 | 单细胞测序 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, RT-PCR | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 4例患者的手术前、手术后0、24和48小时的外周血样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-09-16 |
Exploring ribosome biogenesis in lung adenocarcinoma to advance prognostic methods and immunotherapy strategies
2025-05-02, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06489-0
PMID:40316986
|
研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序技术构建肺腺癌单细胞图谱，基于核糖体生物发生相关基因建立预后模型RBS，并验证其在预后预测和免疫治疗反应评估中的价值 | 首次基于331个核糖体生物发生相关基因构建肺腺癌预后模型RBS，发现CD4+初始样T细胞高表达核糖体生物发生相关基因且随CD4+ T细胞发育逐渐降低，RBS模型在预后预测上优于140个已发表的肺腺癌预后模型 | 研究主要基于公共数据库和体外实验验证，缺乏大规模前瞻性临床试验验证RBS模型的临床实用性，KIF23的功能验证仅限于体外实验 | 探索核糖体生物发生在肺腺癌中的作用，构建预后模型并评估免疫治疗策略 | 肺腺癌患者样本及肺腺癌细胞系 | 数字病理学, 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | 机器学习 | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 12 | 2026-09-16 |
Decoding per- and polyfluoroalkyl substances (PFAS) in hepatocellular carcinoma: a multi-omics and computational toxicology approach
2025-05-02, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06517-z
PMID:40317014
|
研究论文 | 该研究采用多组学和计算毒理学方法，揭示PFAS暴露驱动肝细胞癌（HCC）的分子机制，并构建了PFAS相关HCC预后风险模型（PFASRHSig） | 首次将网络毒理学、集成机器学习、单细胞RNA测序、空间转录组学、实验验证和分子对接模拟相结合，系统解析PFAS在HCC中的核心靶点和机制，并构建了PFASRHSig预后模型 | 研究主要基于公共转录组数据和计算预测，实验验证仅限于RT-qPCR和IHC，缺乏体内动物模型和前瞻性临床队列验证 | 揭示PFAS暴露驱动肝细胞癌发生的分子机制，识别核心靶点，并构建预后风险模型 | 肝细胞癌（HCC）患者队列的转录组数据及PFAS暴露相关基因 | 机器学习 | 肝癌 | 网络毒理学、集成机器学习、单细胞RNA测序、空间转录组学、RT-qPCR、免疫组化染色、分子对接模拟 | 集成机器学习、PPI网络、生存风险模型 | 转录组数据、图像 | 多个公共HCC队列的转录组数据，具体样本量未在摘要中明确 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 13 | 2026-09-16 |
PD-1 regulates the anti-tumor immune function of macrophages through JAK2-STAT3 signaling pathway in colorectal cancer tumor microenvironment
2025-05-02, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06469-4
PMID:40317043
|
研究论文 | 该研究结合bulk RNA测序和单细胞RNA测序数据，揭示了结直肠癌肿瘤微环境中PD-1通过JAK2-STAT3信号通路调控巨噬细胞抗肿瘤免疫功能的作用机制 | 首次系统揭示了TAM上PD-1表达通过JAK2-STAT3信号通路调控巨噬细胞M2型极化、抑制吞噬活性及IFN-γ信号分子合成的分子机制，并阐明其在促进免疫抑制微环境形成和肿瘤进展中的关键作用 | 研究主要基于CT26小鼠结直肠癌细胞系和BMDMs体外模型，缺乏临床患者样本的直接验证，且未深入探讨PD-1在TAM上表达的上游调控机制 | 探究结直肠癌肿瘤微环境中TAM上PD-1的表达与患者预后的关联，以及PD-1调控巨噬细胞功能的分子机制 | 结直肠癌肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）、CT26小鼠结直肠癌细胞系、骨髓来源巨噬细胞（BMDMs）、荷瘤小鼠模型 | digital pathology, machine learning | 结直肠癌 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | 文本, 图像 | 未明确说明，涉及bulk RNA测序和scRNA-seq数据、CT26荷瘤小鼠模型及BMDMs体外实验 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-09-16 |
Randomized phase 2 trial of pembrolizumab alone or in combination with low dose chemotherapy for patients with non-small cell lung cancer and poor performance status
2025-05, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.lungcan.2025.108513
PMID:40203764
|
研究论文 | 一项随机二期临床试验，比较帕博利珠单抗单药与联合低剂量化疗在体能状态较差的非小细胞肺癌患者中的疗效。 | 针对体能状态差（PS=2）的非小细胞肺癌患者，探索帕博利珠单抗联合极低剂量化疗的疗效，并利用单细胞测序分析免疫细胞基因表达谱。 | 样本量较小，联合治疗组与单药组之间的疗效差异未达到统计学显著性，部分分析为探索性。 | 评估帕博利珠单抗单药或联合低剂量化疗在体能状态较差的晚期非小细胞肺癌患者中的疗效和安全性。 | 晚期非小细胞肺癌且ECOG体能状态评分为2的患者 | 临床肿瘤学 | 肺癌 | 流式细胞术, 单细胞测序 | NA | 临床数据, 血液样本 | 43例患者入组，20例提供血液样本进行生物标志物分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-09-16 |
Habitat radiomics predicts occult lymph node metastasis and uncovers immune microenvironment of head and neck cancer
2025-05-01, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06474-7
PMID:40312725
|
研究论文 | 本研究旨在建立基于肿瘤内、瘤周和栖息区域的影像组学模型，用于预测头颈部鳞状细胞癌的隐匿性淋巴结转移，并揭示其与免疫微环境的关联 | 首次提出栖息区域影像组学模型（RF-habitat radiomics model）用于预测头颈部鳞状细胞癌的隐匿性淋巴结转移，并通过影像基因组学分析揭示了该模型与耗竭相关CD8+ T细胞丰度的生物学关联 | 样本量相对有限，单细胞RNA测序分析仅涉及6例样本，需要更大规模的多中心前瞻性研究进一步验证模型的泛化能力和临床实用性 | 建立并验证基于肿瘤内、瘤周和栖息区域的影像组学模型，用于无创预测头颈部鳞状细胞癌的隐匿性淋巴结转移，并探索其潜在的免疫微环境机制 | 经病理确诊的头颈部鳞状细胞癌患者，来自三个医疗中心及TCGA数据库 | 数字病理学 | 头颈部癌 | 影像组学、bulk RNA-seq、单细胞RNA测序 | 随机森林（RF）、逻辑回归（LR）、支持向量机（SVM） | 图像（CT影像）、文本（基因组数据）、单细胞转录组数据 | 训练集330例，内部测试集154例，外部测试集183例，TCGA基因组集50例，单细胞RNA测序集6例 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 16 | 2026-09-14 |
Defining pathogenic IL-17 and CSF-1 gene expression signatures in chronic graft-versus-host disease
2025-May-08, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024025337
PMID:39977705
|
研究论文 | 该文章利用单细胞测序技术在小鼠慢性移植物抗宿主病模型中逆向工程出IL-17和CSF-1的时序性基因表达特征，并验证这些特征可在部分患者中检测到 | 首次通过单细胞测序在小鼠模型中逆向工程出可转化至人类的IL-17和CSF-1基因表达特征，并发现这些特征可在cGVHD诊断时及移植后第100天预测疾病发生 | 特征仅在70%的cGVHD诊断患者和一半后续发病患者中检测到，尚未在前瞻性临床研究中验证其预测治疗反应的能力 | 定义慢性移植物抗宿主病中致病性IL-17和CSF-1的基因表达特征，以辅助治疗选择和高风险患者识别 | 小鼠cGVHD模型中的血液单核细胞及接受异基因造血细胞移植的患者样本 | 单细胞测序 | 慢性移植物抗宿主病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确具体样本量，涉及小鼠模型和患者血液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-09-13 |
Maternal COVID-19 infection associated with offspring neurodevelopmental disorders
2025-May, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-024-02822-z
PMID:39521839
|
研究论文 | 该研究揭示了母体COVID-19感染通过扰乱母胎免疫平衡，影响子代星形胶质细胞、内皮细胞和兴奋性神经元，从而增加子代神经发育障碍风险的机制 | 首次利用孕期母体单细胞转录组建立包含47个独特基因的风险评分，发现CD4增殖T细胞水平可作为子代神经发育障碍风险的指标，并通过孟德尔随机化和全表型组关联研究验证了转录变化与子代神经发育障碍风险之间的因果关系，同时筛选出10种潜在治疗药物 | 摘要中未明确说明研究的具体局限性 | 探究母体COVID-19感染增加子代神经发育障碍发病率的潜在机制 | 孕期感染COVID-19的母体及其子代 | 数字病理学 | 神经发育障碍 | 单细胞转录组测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 18 | 2026-09-10 |
RNAcare: integrating clinical data with transcriptomic evidence using rheumatoid arthritis as a case study
2025-05-21, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-025-02162-z
PMID:40399884
|
研究论文 | 介绍了一个名为RNAcare的计算平台，该平台整合临床数据与转录组数据，以类风湿关节炎为案例进行研究。 | RNAcare平台提供了交互式且可复制的方法，能够直接整合基因表达数据与临床特征，并支持自定义目标标签，从而分析基因表达与临床症状（如疼痛和疲劳）之间的关系，这是现有工具所缺乏的。 | 摘要中未明确提及局限性。 | 开发一个整合临床数据与转录组数据的计算平台，以帮助临床医生和研究人员更好地理解基因表达与临床症状之间的关系。 | 类风湿关节炎患者样本的转录组数据及临床特征。 | 机器学习 | 类风湿关节炎 | RNA-seq | NA | 转录组数据和临床数据 | 未明确说明，但涉及患者样本。 | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2026-09-10 |
scSDNE: A semi-supervised method for inferring cell-cell interactions based on graph embedding
2025-05, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013027
PMID:40333631
|
研究论文 | 提出一种基于图嵌入的半监督方法scSDNE，用于推断细胞间通过配体-受体相互作用介导的通信 | 利用深度学习将交互细胞的基因映射到共享潜在空间，并整合基因调控信息以提升推断准确性和生物学可解释性 | 未在摘要中提及 | 开发一种半监督方法以更可靠地推断细胞-细胞相互作用，提供对复杂细胞间通信的新视角 | 细胞间的配体-受体相互作用及单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 图嵌入模型（基于深度学习） | 单细胞基因表达数据 | 未在摘要中说明 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 20 | 2026-09-10 |
M-band wavelet-based multi-view clustering of cells
2025-05, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013060
PMID:40408513
|
研究论文 | 提出了一种基于M波段小波分析的单细胞RNA测序数据多视图聚类方法WMC，结合均匀流形逼近与投影技术实现细胞类型的精细识别与发现 | 首次将M波段小波分析应用于scRNA-seq数据，通过将数据矩阵分解为近似和细节分量，实现了缺失细胞类型的可视化与新细胞类型的发现 | 摘要中未提及明显局限性 | 开发一种基于小波分析的单细胞测序数据聚类方法，用于精细识别细胞类型、身份和功能状态 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 小波分析 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |