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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-05-17
Engineering sonogenetic EchoBack-CAR T cells
2025-May-15, Cell IF:45.5Q1
研究论文 利用超声遗传学技术构建EchoBack-CAR T细胞,通过聚焦超声刺激实现CAR的持续表达,用于实体肿瘤治疗 首次设计超声响应型EchoBack-CAR T细胞,利用超灵敏热休克启动子和CAR信号正反馈回路实现长效表达,并通过聚焦超声刺激精准调控 未提及 开发一种通用、高效且安全的实体肿瘤治疗策略 EchoBack-CAR T细胞及其靶向GD2或PSMA的变体 机器学习 胶质母细胞瘤,前列腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
2 2026-05-17
Rorγt-positive dendritic cells are required for the induction of peripheral regulatory T cells in response to oral antigens
2025-May-15, Cell IF:45.5Q1
研究论文 本文通过开发一种特异性删除Rorc基因顺式调控元件的小鼠,发现RORγt阳性树突状细胞对于口服抗原诱导外周调节性T细胞是必需的,而ILC3则无此作用 首次通过基因编辑手段特异性缺失RORγt阳性树突状细胞,明确区分了其在pTreg诱导中的独特作用,并发现RORγt DC与ILC3共享淋巴样起源 未明确指出局限性 阐明RORγt抗原呈递细胞在外周调节性T细胞诱导及口服耐受维持中的作用 RORγt阳性树突状细胞和3型固有淋巴样细胞 机器学习和数字病理不适用,应归类为免疫学或细胞生物学 食物过敏、炎症性肠病 单细胞RNA测序、流式细胞术、谱系追踪 不适用 单细胞转录组数据 基因修饰小鼠模型,具体数目未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞RNA测序平台,具体配置未详述
3 2026-05-17
Enhanced Production of Lipid Mediators in Plasma and Activation of DNA Damage Pathways in PBMCs Are Correlated With the Severity of Ancestral SARS-CoV-2 Infection
2025-May-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 通过血浆脂质代谢物分析和PBMCs转录组测序,揭示脂质介质与DNA损伤通路在SARS-CoV-2感染严重程度中的相关性 首次系统揭示花生四烯酸(AA)和二十碳五烯酸(EPA)等促炎脂质介质与WHO疾病严重程度评分的正相关关系,并发现EPA水平与高评分患者细胞周期和DNA损伤通路的激活相关 样本量较小(10例感染和10例未感染患者),需要更大样本验证;鼻拭子scRNA-seq数据集为已有公开数据,可能未完全匹配本研究的患者群体 探究遗传因素和脂质代谢物与重型SARS-CoV-2感染之间的关联机制 COVID-19患者和健康对照者的血浆、PBMCs和鼻拭子样本 自然语言处理 呼吸道病毒感染 bulk RNA-seq、总脂肪酸面板分析、Mann-Whitney U检验、Ontology/KEGG/Reactome通路分析 NA 基因表达数据、脂质代谢物数据 10例感染和10例未感染患者用于RNA-seq和脂质分析;58例健康与COVID-19参与者用于鼻拭子基因表达研究 NA bulk RNA-seq、scRNA-seq NA NA
4 2026-05-17
Regulation of RNA polymerase II transcription through re-initiation and bursting
2025-May-15, Molecular cell IF:14.5Q1
综述 综述了RNA聚合酶II通过再起始和爆发式转录调控的最新研究进展 整合活细胞成像和单细胞转录组学数据,提出RNAPII再起始和爆发式转录作为基因调控的普遍现象,并聚焦于分子机制和未解问题 未提供具体实验数据,主要基于现有文献总结,可能忽略某些研究细节 探讨RNAPII爆发式转录的调控策略及其在健康和疾病中的意义 真核细胞中RNA聚合酶II的转录调控过程 自然语言处理 NA 活细胞成像、单细胞转录组学 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
5 2026-05-17
Angiotensin-Converting Enzyme-Dependent Intrarenal Angiotensin II Contributes to CTP: Phosphoethanolamine Cytidylyltransferase Downregulation, Mitochondrial Membranous Disruption, and Reactive Oxygen Species Overgeneration in Diabetic Tubulopathy
2025-05, Antioxidants & redox signaling IF:5.9Q1
研究论文 该研究探讨了血管紧张素转换酶依赖性肾内血管紧张素II在糖尿病肾小管病变中导致线粒体膜破坏、活性氧过度生成和CTP:磷酸乙醇胺胞苷酰转移酶下调的作用 首次揭示了ACE依赖性肾内AngII通过破坏线粒体膜稳态和下调PCYT2导致糖尿病肾小管损伤的新机制,为ACEI联合治疗提供新靶点 研究主要基于小鼠模型,未在人类样本中验证;仅部分改善效果,未完全逆转损伤 探究ACE依赖性肾内AngII在糖尿病肾小管病变中对线粒体膜稳态和ROS生成的影响 高脂饮食/链脲佐菌素诱导的2型糖尿病小鼠模型 生物信息学 糖尿病肾病, 肾小管病变 单细胞RNA测序 NA 图像, 基因表达数据 小鼠模型,具体数量未在标题和摘要中说明 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 用于肾小管单细胞RNA测序分析PCYT2富集
6 2026-05-16
Exploring genetic and immune cell dynamics in systemic lupus erythematosus patients with Epstein-Barr virus infection via machine learning
2025-05-01, Rheumatology (Oxford, England)
研究论文 通过机器学习探索系统性红斑狼疮合并EB病毒感染患者的遗传和免疫细胞动态变化 首次利用机器学习识别出IFI27作为SLE合并EBV感染的关键基因,并结合单细胞RNA测序揭示其在CD4 CTL和B细胞亚群中的表达模式 未提供具体局限性信息 识别SLE合并EBV感染患者中的关键基因和免疫细胞 系统性红斑狼疮合并EB病毒感染患者 机器学习 系统性红斑狼疮 RNA测序 机器学习算法 基因表达数据 来源于GEO数据库的多个数据集(GSE50772、GSE81622、GSE85599、GSE45918) NA NA NA NA
7 2026-05-16
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA sequencing identifies APOC1 as a biomarker and therapeutic target for G0/G1 cell cycle arrest in cholangiocarcinoma
2025-05, Genomics IF:3.4Q2
research paper 通过整合单细胞和批量RNA测序,确定了APOC1作为胆管癌G0/G1细胞周期阻滞的生物标志物和治疗靶点 首次识别APOC1为胆管癌G0/G1期阻滞的特征基因,并利用单细胞RNA测序验证其表达峰与细胞周期的关联 NA 探索胆管癌中诱导G0/G1期阻滞的分子机制以及鉴定G0/G1期特征生物标志物 胆管癌细胞 machine learning 胆管癌 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
8 2026-05-15
Direct microglia replacement reveals pathologic and therapeutic contributions of brain macrophages to a monogenic neurological disease
2025-May-13, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 通过直接替换小胶质细胞,揭示脑巨噬细胞在单基因神经系统疾病中的病理和治疗作用 首次通过单细胞测序揭示Krabbe病中干扰素反应特征和小胶质细胞失调,并利用直接CNS单核细胞注射实现高效小胶质细胞替换,证明该疗法可显著改善疾病 主要在动物模型中进行,临床转化需进一步验证安全性和有效性 阐明巨噬细胞在Krabbe病病理和治疗中的具体角色,探索直接小胶质细胞替换的潜在治疗价值 Krabbe病(球细胞脑白质营养不良)模型小鼠(twitcher小鼠)及人类脑标本 机器学习 神经系统疾病 单细胞测序 NA 单细胞转录组数据 动物模型(twitcher小鼠)及人类脑组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
9 2026-05-15
Spatiotemporal profiling reveals the impact of caloric restriction on mammalian brain aging
2025-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过时空剖析揭示卡路里限制对哺乳动物大脑衰老的影响 利用高可扩展单核基因组学和空间转录组学平台,首次在区域和细胞类型特异性分辨率下解析卡路里限制抗衰老的分子和细胞机制 未明确提及,但可能包括仅在小鼠模型中验证,且卡路里限制对人类大脑衰老的转化应用需进一步研究 阐明卡路里限制对衰老大脑的分子和细胞保护机制,特别是区域特异性效应 小鼠大脑(来自36只小鼠,3个年龄组,超过50万个细胞),以及来自卡路里限制和对照条件下老年小鼠的12个脑切片进行空间转录组分析 数字病理学 神经退行性疾病 单核基因组学、空间转录组学 NA 基因表达数据 36只小鼠大脑、12个脑切片、超过50万个细胞 10x Genomics 单核RNA测序、空间转录组学 10x Chromium、10x Visium 10x Chromium单核3'测序、10x Visium空间转录组学
10 2026-05-12
Comparative spatial transcriptomics reveals root dryland adaptation mechanism in rice and HMGB1 as a key regulator
2025-05-05, Molecular plant IF:17.1Q1
研究论文 通过比较空间转录组学揭示旱稻根部干旱适应机制及HMGB1作为关键调控因子 首次构建了旱稻与水稻节间和根尖的空间转录组图谱,并鉴定了HMGB1作为促进旱稻根系伸长和增厚从而增强抗旱能力的关键转录调控因子 NA 揭示旱稻根部适应干旱的分子和发育机制,为培育抗旱水稻提供遗传资源 旱稻和水稻的根部 自然语言处理 NA 空间转录组学 NA 空间转录组数据 节间和根尖样本 NA 空间转录组学 NA NA
11 2026-05-10
High KYNU Expression Is Associated with Poor Prognosis, KEAP1/STK11 Mutations, and Immunosuppressive Metabolism in Patient-Derived but Not Murine Lung Adenocarcinomas
2025-May-16, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究发现了肺腺癌中KYNU基因的双峰表达与患者预后不良相关,并揭示了其与KEAP1/STK11突变及免疫抑制代谢的关系 首次揭示KYNU在肺腺癌患者来源肿瘤中与KEAP1/STK11共突变相关且具有免疫抑制代谢表型,而在小鼠模型中表达模式与人类不一致,凸显了物种差异 小鼠肺腺癌模型无法忠实再现人类KYNU的表达模式,给临床前模型研究带来挑战 发现肺腺癌中与预后相关的双峰表达基因,揭示其潜在致癌基因型及新的治疗见解 肺腺癌患者肿瘤样本及其对应的免疫微环境、代谢状态和小鼠模型 机器学习 肺腺癌, 胰腺癌, 肾癌, 黑色素瘤 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 代谢组学 聚类模型 转录组数据, 单细胞转录组数据, 代谢组数据 多个肺腺癌数据集,具体样本量未提及 NA 单细胞RNA-seq, 代谢组学 NA NA
12 2026-05-10
Defining pathogenic IL-17 and CSF-1 gene expression signatures in chronic graft-versus-host disease
2025-May-08, Blood IF:21.0Q1
研究论文 通过单细胞测序技术在慢性移植物抗宿主病中定义致病性IL-17和CSF-1基因表达特征 利用信息丰富的临床前慢性移植物抗宿主病模型,通过单细胞测序“逆向工程”定义小鼠血液中可随时间变化的IL-17和CSF-1特征,用于评估患者 靶向治疗仅对部分患者有效,且费用高昂、美国以外地区难以获取,目前依赖试错法使用 定义致病性IL-17和CSF-1基因表达特征,以促进选择合适治疗和识别高危个体进行预防性治疗 慢性移植物抗宿主病(cGVHD)患者和临床前模型小鼠 机器学习 慢性移植物抗宿主病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 70%的cGVHD诊断患者和一半移植后100天发展为cGVHD的患者 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序系统
13 2026-05-10
Single-cell transcriptomic analysis reveals efferocytosis signature predicting immunotherapy response in hepatocellular carcinoma
2025-05, Digestive and liver disease : official journal of the Italian Society of Gastroenterology and the Italian Association for the Study of the Liver IF:4.0Q1
研究论文 通过单细胞转录组分析开发了与胞葬作用相关的基因签名(ER.Sig),用于预测肝细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 首次结合单细胞和bulk转录组数据,利用十种机器学习算法构建胞葬作用相关基因签名,并多组学验证其在预测免疫治疗反应中的价值 数据来源于公共数据库,缺乏独立的外部验证队列;研究仅基于转录组水平,未进行功能实验验证 开发胞葬作用相关基因签名以预测肝细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 肝细胞癌患者 机器学习和数字病理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序和bulk RNA测序 随机生存森林模型(与其他九种算法比较后选择) 转录组数据(单细胞和bulk层面) 多个公共数据集,包括肝细胞癌患者样本和IMvigor210免疫治疗队列 NA 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 NA NA
14 2026-05-08
Meningeal-derived retinoic acid regulates neurogenesis via suppression of Notch and Sox2
2025-May-27, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学和RARα DNA结合谱分析,揭示了脑膜来源的视黄酸通过抑制Notch和Sox2信号促进神经发生的分子机制 首次阐明了脑膜来源的RA通过结合Sox2ot启动子、抑制Notch信号通路和Sox2表达来协调新皮质发育的此前未知机制 未提及明显局限性 探究脑膜来源的视黄酸在端脑神经祖细胞中促进神经发生的分子机制 Foxc1突变胚胎小鼠的端脑神经祖细胞 机器学习 神经发育障碍 空间转录组学、RARα DNA结合谱分析、宫内电穿孔 NA 转录组数据 Foxc1突变胚胎小鼠样本 NA 空间转录组学 NA 用于空间转录组学的平台未具体说明
15 2026-05-06
Selective GSK3α Inhibition Promotes Self-Renewal Across Different Stem Cell States
2025-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 选择性抑制GSK3α可促进不同干细胞状态的自我更新,并建立一种基于BRD0705/IWR1的通用培养系统 发现选择性抑制GSK3α(而非泛抑制GSK3α/β)能独立于β-catenin信号促进多种干细胞(ESC、EpiSC、NSC)的长期自我更新;联合IWR1构建的BRD0705/IWR1培养体系可维持多种多能干细胞状态并支持共培养 未提及具体限制 研究选择性GSK3α抑制对干细胞自我更新的调控作用,并开发一种能维持不同干细胞状态的培养系统 小鼠胚胎干细胞(ESC)、上胚层干细胞(EpiSC)、神经干细胞(NSC)及形成性多能干细胞 机器学习 NA 单细胞转录组测序、表观基因组分析、功能分析 NA 转录组数据、表观基因组数据 多种小鼠干细胞系(具体数量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
16 2026-05-05
Divergent Plastid Genomes in the Deepest-Branching Apicomplexan Parasites
2025-05-30, Genome biology and evolution IF:3.2Q2
研究论文 利用单细胞测序技术解析了最深分支顶复门寄生虫中质体基因组的多样性与进化 首次获取了所有四个已知古簇虫谱系中未培养代表的质体基因组数据,填补了顶复门质体基因组进化中的关键空白 未提及光合作用相关基因,且样本来自未培养的物种,可能限制基因组完整性的评估 研究顶复门寄生虫中质体(apicoplast)基因组的起源与进化 古簇虫谱系(archigregarines)中未培养代表的质体基因组 生物信息学 疟疾等相关寄生虫疾病 单细胞测序 NA 基因组序列 所有4个已知古簇虫谱系中未培养的代表性样本 NA NA NA NA
17 2026-05-03
A STT3A-dependent PD-L1 glycosylation modification mediated by GMPS drives tumor immune evasion in hepatocellular carcinoma
2025-May, Cell death and differentiation IF:13.7Q1
研究论文 通过蛋白质组学和单细胞RNA测序分析,发现GMPS介导的STT3A依赖性PD-L1糖基化修饰驱动肝细胞癌的免疫逃逸 首次揭示GMPS作为补充模块连接Sec61通道复合物和STT3A,增强PD-L1糖基化修饰,从而促进HCC免疫逃逸的新机制 主要基于体外细胞实验和小鼠模型,尚需更多临床样本验证;仅关注GMPS对PD-L1的作用,可能忽略其他免疫逃逸相关分子 探索肝细胞癌快速进展和免疫逃逸的分子机制 肝细胞癌组织及CD8+ T细胞 计算机视觉 肝细胞癌 蛋白质组学、单细胞RNA测序 NA 蛋白质组数据、单细胞转录组数据 晚期HCC组织样本(具体数量未在摘要中说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
18 2026-05-03
Impact of mechanotransduction on gene expression changes in periodontal ligament during orthodontic tooth movement
2025-May, Journal of bone and mineral metabolism IF:2.4Q3
研究论文 利用单细胞RNA测序技术揭示机械力传导对大鼠牙周膜在正畸牙移动过程中基因表达变化的影响,并探讨Mkx转录因子的作用 首次通过单细胞RNA测序描绘了正畸牙移动过程中大鼠牙周膜的细胞图谱,明确了Mkx和Scx在不同细胞群中的表达模式,揭示了Mkx在机械刺激下的保护性作用 文章未明确提及研究局限性,例如样本量较小、仅使用了动物模型而未验证人体组织等 阐明机械力传导对牙周膜在正畸牙移动过程中基因表达变化的影响,以及Mkx转录因子在该过程中的功能 大鼠牙周膜细胞和人类牙周膜细胞 单细胞组学 口腔疾病(正畸相关) 单细胞RNA测序(scRNA-seq),RT-qPCR NA 测序数据,基因表达数据 大鼠牙周膜样本(0天、1周、2周时间点) NA 单细胞RNA测序 NA NA
19 2026-05-03
Spatial transcriptomics of Glomerulo-centric antibody mediated rejection in renal transplants
2025-May, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
研究论文 通过数字空间分析技术研究肾移植中急性抗体介导排斥反应的肾小球中心空间转录组 首次在单患者系列活检中利用数字空间分析技术以空间分辨率定位肾小球内与抗体介导排斥反应相关的先天免疫细胞分子特征,并揭示足细胞损伤与持续肾小球炎的关系 基于单一患者的系列活检样本,样本量小,可能限制结果的普适性 揭示肾移植中急性抗体介导排斥反应期间肾小球的空间转录组变化 一名肾移植患者的连续四次活检组织(排斥反应前后及治疗期间) 数字病理学 肾移植排斥反应 数字空间分析(DSP) NA 转录组数据 4份活检样本来自一名患者 NA 空间转录组学 Digital Spatial Profiling 数字空间分析(DSP)技术用于定位肾小球内转录本
20 2026-05-03
Murine Aortic Valve Cell Heterogeneity at Birth
2025-May, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 通过单细胞转录组学分析新生小鼠主动脉瓣的细胞异质性,揭示新的内皮细胞亚群和间质细胞亚群及其在出生后成熟过程中的时空轨迹 首次在出生后第1天小鼠主动脉瓣中鉴定出一个新的瓣膜内皮细胞亚群和三个先前未描述的瓣膜间质细胞亚群(原始型、重塑型和生物活性型) 机制方面对瓣膜结构-功能关系建立的理解仍不充分,结论主要基于小鼠模型 阐明瓣膜出生后成熟过程中细胞异质性与结构功能关系建立的机制 新生小鼠主动脉瓣结构 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据 出生后第1天小鼠主动脉瓣样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3‘端测序平台
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