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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-03-28
Longitudinal single cell RNA-sequencing reveals evolution of micro- and macro-states in chronic myeloid leukemia
2025-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过纵向单细胞RNA测序研究慢性髓系白血病的进展,揭示了微观和宏观转录状态的演变 利用状态转移理论,揭示了细胞类型特异性贡献如何调控稳健的疾病表型状态转移,建立了从单细胞尺度到宏观状态水平的理论框架 NA 探索单细胞与批量转录组学中癌症特异性信息内容,解析离散疾病定义状态如何从噪声单细胞数据中涌现 慢性髓系白血病 数字病理学 白血病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2 2026-03-28
Claudin18.2-positive gastric cancer-specific changes in neoadjuvant chemotherapy-driven immunosuppressive tumor microenvironment
2025-May, British journal of cancer IF:6.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和多重免疫荧光分析,揭示了CLDN18.2阳性胃癌在新辅助化疗驱动下肿瘤微环境的特异性免疫抑制变化 首次在单细胞水平上揭示了CLDN18.2阳性胃癌化疗后独特的免疫抑制微环境变化,包括NK细胞ADCC相关基因下调、Tregs和TAMs中TGFB1表达上调,以及特定的细胞间相互作用信号通路 样本量较小(37例GC样本,其中仅11例CLDN18.2阳性),且为观察性研究,需要更大样本和功能验证实验 探究CLDN18.2阳性胃癌在新辅助化疗作用下肿瘤微环境的特异性变化,以解释化疗联合抗CLDN18.2抗体疗效有限的原因 胃癌组织样本,特别是CLDN18.2阳性和阴性的胃癌患者样本 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序,多重免疫荧光 NA 单细胞转录组数据,免疫荧光图像数据 37例胃癌样本(包括11例CLDN18.2阳性和26例CLDN18.2阴性样本) NA 单细胞RNA-seq NA NA
3 2026-03-25
Tissue signatures of human macrophages during homeostasis and activation
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用多模态单细胞测序技术,定义了来自不同组织(肺、小肠、脾脏、骨髓和淋巴结)的人类巨噬细胞在稳态和激活状态下的组织特异性特征 首次系统性地描绘了人类黏膜和淋巴器官中巨噬细胞在稳态和激活状态下的组织特异性转录和蛋白特征,并揭示了这些特征在极化刺激下仍能保持 研究样本来源于器官捐献者,可能无法完全代表所有生理或病理状态;未涵盖所有人体组织 阐明人类巨噬细胞在不同组织(特别是黏膜和淋巴器官)中的身份如何与其定居部位耦合,并在激活和极化过程中维持 从个体器官捐献者分离的肺、小肠、脾脏、骨髓和淋巴结组织中的巨噬细胞和单核细胞 单细胞组学 NA 多模态单细胞测序,刺激实验 NA 单细胞转录组数据,蛋白数据 来自个体器官捐献者的多个组织样本(肺、小肠、脾脏、骨髓、淋巴结) NA 单细胞多组学 NA NA
4 2026-03-24
Synergistic effects of PA (S184N) and PB2 (E627K) mutations on the increased pathogenicity of H3N2 canine influenza virus infections in mice and dogs
2025-05-20, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究揭示了PA(S184N)和PB2(E627K)突变对H3N2犬流感病毒在小鼠和犬中致病性增强的协同作用及其分子机制 首次通过小鼠体内连续传代建立了致死性H3N2犬流感病毒感染模型,并揭示了PA(S184N)和PB2(E627K)突变协同增强病毒致病性的新机制,同时利用单细胞RNA测序在单细胞水平阐明了病毒逃逸宿主抗病毒反应的机制 研究主要基于小鼠和犬的感染模型,对人类感染的直接风险评估仍需进一步研究;单细胞测序分析仅针对小鼠肺组织,犬类组织的免疫反应机制可能有所不同 阐明H3N2犬流感病毒适应哺乳动物的分子机制,评估其跨物种传播风险 H3N2犬流感病毒(CIV)及其突变株,感染的小鼠和犬 病毒学与传染病学 流感病毒感染 病毒连续传代、突变鉴定、单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因序列数据、单细胞转录组数据、病毒滴度数据 小鼠和犬的感染模型(具体数量未在摘要中明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
5 2026-03-20
Glucagon-like peptide-1 receptor signaling activation in alveolar type II cells enhances lung development in neonatal rats exposed to hyperoxia
2025-05, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 本研究探讨了胰高血糖素样肽-1受体(GLP-1R)在新生大鼠高氧暴露模型中通过调节肺泡II型细胞的线粒体分裂和糖代谢促进肺发育的作用机制 首次揭示了GLP-1R在肺泡II型细胞中通过m6A甲基化修饰调控线粒体分裂和糖代谢,从而影响肺发育的新机制 研究主要基于动物模型和细胞实验,尚未在临床样本中验证,且机制研究集中在METTL14介导的m6A修饰,可能存在其他调控途径 探索GLP-1R在调节肺发育中的作用及其潜在机制,特别是在支气管肺发育不良(BPD)模型中的应用 新生Sprague-Dawley大鼠的肺组织、原代肺泡II型细胞和RLE-6TN细胞系 NA 支气管肺发育不良 单细胞RNA测序、Western blotting、免疫荧光染色、Seahorse XF96代谢分析、RT-qPCR、MeRIP-qPCR NA 基因表达数据、蛋白质表达数据、代谢数据 新生大鼠分组(高氧组与对照组),在出生后3、7、10、14天提取肺组织,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6 2026-03-20
Extracellular vesicle-packaged GBP2 from macrophages aggravates sepsis-induced acute lung injury by promoting ferroptosis in pulmonary vascular endothelial cells
2025-05, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 本研究揭示了巨噬细胞来源的细胞外囊泡通过递送GBP2蛋白,与OTUD5结合并促进GPX4泛素化,从而诱导肺血管内皮细胞铁死亡,加剧脓毒症诱导的急性肺损伤的机制 首次发现巨噬细胞来源的EVs通过GBP2-OTUD5-GPX4轴驱动内皮细胞铁死亡,并筛选出靶向GBP2的小分子化合物Plantainoside D,为si-ALI提供了新的治疗靶点 研究主要在细胞和小鼠模型中进行,临床转化潜力需进一步验证;GBP2在其他细胞类型中的作用未明确 阐明巨噬细胞来源的细胞外囊泡在脓毒症诱导的急性肺损伤中的作用机制,并探索潜在治疗策略 巨噬细胞(THP-1、RAW264.7)、肺血管内皮细胞、脓毒症患者外周血样本、CLP小鼠模型 分子病理学 脓毒症诱导的急性肺损伤 蛋白质组测序、转录组测序、单细胞测序、RNA干扰、腺相关病毒转染、分子对接、分子动力学模拟、细胞热位移分析 NA 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞数据 脓毒症患者外周血样本、细胞系(THP-1、RAW264.7)、CLP小鼠模型 NA 单细胞测序 NA NA
7 2026-03-18
PINK1 link mitochondria-ER contacts controls deposition of intramuscular fat in pigs
2025-05-20, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究探讨了PINK1蛋白通过调控线粒体-内质网相互作用来调节猪肌肉内脂肪沉积的分子机制 首次揭示了PINK1在猪肌肉内脂肪沉积中的关键作用,并发现其通过调控线粒体-内质网接触来影响脂肪沉积过程 研究主要基于猪模型,结果在人类或其他物种中的适用性尚需验证 探究PINK1如何调控猪肌肉内脂肪沉积的分子机制 猪的肌肉组织、纤维-脂肪祖细胞和脂肪细胞 分子生物学 NA 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 多个猪品种的肌肉组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
8 2026-03-18
Murine Aortic Valve Cell Heterogeneity at Birth
2025-May, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析新生小鼠主动脉瓣细胞异质性,揭示了出生时瓣膜内皮细胞和间质细胞的新亚群 首次在出生后第1天小鼠主动脉瓣中发现新的瓣膜内皮细胞亚群和三个先前未被认识的瓣膜间质细胞亚群(原始型、重塑型和生物活性型),并通过谱系追踪揭示了原始型间质细胞在出生后成熟过程中的时空轨迹 研究仅针对出生后第1天的小鼠主动脉瓣,未涵盖更广泛的发育阶段或人类样本,可能限制了结果的普遍性 探究主动脉瓣在出生后成熟过程中建立结构-功能关系的细胞机制 新生小鼠(出生后第1天)的主动脉瓣结构 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
9 2026-03-18
Dissecting the Single-Cell Diversity and Heterogeneity Underlying Cervical Precancerous Lesions and Cancer Tissues
2025-05, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
研究论文 本文通过整合单细胞数据集,研究了从宫颈癌前病变到宫颈鳞状细胞癌的细胞多样性和异质性 利用单细胞组成数据分析(scCODA)揭示细胞类型组成变化,并通过ATAC-seq分析将表观遗传改变与基因表达谱关联,识别了关键转录因子(如YY1) 研究依赖于现有数据集整合,可能受样本来源和技术差异影响,且新队列数据(HRA001742)的相似性评估仅基于逻辑回归模型 探究宫颈癌前病变到宫颈鳞状细胞癌的细胞多样性和异质性,为靶向治疗提供基础 正常组织、癌旁组织、癌前病变和宫颈肿瘤的单细胞数据 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, RT-qPCR, 免疫组化(IHC) 逻辑回归模型 单细胞测序数据, 表观遗传数据, 基因表达数据 四个单细胞数据集,包括正常组织、癌旁组织、癌前病变和宫颈肿瘤样本 NA 单细胞RNA-seq, ATAC-seq NA NA
10 2026-03-17
Single-cell profiling demonstrates the combined effect of wheeze phenotype and infant viral infection on airway epithelial development
2025-May-23, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了2至3岁儿童鼻气道上皮细胞的发育表型,探讨了喘息表型和婴儿期呼吸道合胞病毒感染对气道上皮发育的联合影响 首次在预先设计的嵌套出生队列中,结合喘息表型和RSV感染状态,使用单细胞RNA测序技术系统表征了儿童气道上皮的发育异常和免疫反应变化 研究样本局限于特定年龄段的儿童,且为观察性研究,难以确定因果关系 阐明哮喘儿童气道上皮的发育机制,特别是喘息表型和早期RSV感染对其的影响 2至3岁儿童的鼻气道上皮细胞 数字病理学 哮喘 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 来自四个互斥组的儿童(喘息/非喘息与RSV感染/未感染组合) NA 单细胞RNA-seq NA NA
11 2026-03-17
Single-cell transcriptomics reveals targeted modulation of inflammatory repertoire by SOCE blockers
2025-May-01, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过单细胞转录组学研究了SOCE阻断剂BTP2和CM4620对人类外周血单个核细胞中免疫细胞炎症反应的靶向调节作用 首次利用多重单细胞RNA测序揭示SOCE阻断剂对CD8效应T细胞、NK细胞和CD4调节性T细胞炎症基因表达的差异性调控,显示其比传统免疫抑制剂更具选择性 研究仅基于体外多克隆刺激的正常人PBMCs,未涉及体内模型或疾病状态,且SOCE阻断剂的作用机制仍需进一步探索 探究SOCE阻断剂对免疫细胞功能的调控机制及其治疗潜力 正常人外周血单个核细胞(PBMCs) 单细胞转录组学 免疫介导性疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确样本数量,使用正常人PBMCs NA 单细胞RNA-seq NA NA
12 2026-03-14
Spatiotemporal transcriptome atlas of developing mouse lung
2025-05-30, Science bulletin IF:18.8Q1
研究论文 本研究通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据,构建了小鼠肺发育从E12.5到P0期的时空转录组图谱 首次报道了发育中肺的全面时空转录组图谱,结合空间和单细胞数据识别了10个关键空间域和谱系轨迹 研究仅基于小鼠模型,未直接验证人类肺发育,且未进行功能实验验证关键基因如Angpt2和Epha3的具体作用 旨在理解哺乳动物肺功能发育的复杂过程,包括分支形态发生和肺泡生成 小鼠肺组织,涵盖胚胎期E12.5到出生后P0的发育阶段 空间转录组学 NA 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 小鼠肺组织样本,覆盖E12.5至P0多个时间点 NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
13 2026-03-14
An automatic annotation tool and reference database for T cell subtypes and states at single-cell resolution
2025-05-30, Science bulletin IF:18.8Q1
研究论文 本研究构建了最大的人类T细胞参考数据库,并开发了名为STCAT的自动注释工具,用于单细胞RNA测序数据中T细胞亚型和状态的精准注释 构建了包含134.8万个T细胞、涵盖35种条件和16种组织的最大人类T细胞参考数据库;开发了基于分层模型和标记物校正的新型自动注释工具STCAT,其准确率比现有工具提高28%;首次系统揭示了CD4 Treg细胞在肿瘤样本中的富集现象以及CD8 naive相关细胞在健康个体中的丰度特征 参考数据库主要基于现有公开数据集构建,可能无法涵盖所有疾病状态和组织类型;工具验证仅在六个独立数据集上进行,需要更广泛的临床验证 开发T细胞亚型和状态的自动注释工具及参考数据库,以促进T细胞免疫和肿瘤免疫学研究 人类T细胞(包括CD4和CD8 T细胞) 单细胞组学 肺癌、COVID-19、卵巢癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 分层模型 单细胞转录组数据 1,348,268个T细胞,来自35种条件和16种组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
14 2026-03-14
Cell type-specific network analysis in Diversity Outbred mice identifies genes potentially responsible for human bone mineral density GWAS associations
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用多样性远交小鼠的单细胞转录组数据,构建细胞类型特异性网络,以解析人类骨密度GWAS关联基因的潜在因果作用 首次结合单细胞转录组轨迹分析与网络驱动基因识别,从细胞状态动态变化角度揭示骨密度调控新机制 研究基于小鼠模型数据,在人类中的直接验证尚需进一步实验 解析骨密度GWAS关联基因的细胞类型特异性功能与因果机制 骨髓来源基质细胞在成骨条件下的分化过程 单细胞转录组学 骨质疏松症 单细胞RNA测序 网络分析 单细胞转录组数据 多样性远交小鼠的骨髓基质细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
15 2026-03-14
The impact of breast radiotherapy on the tumor genome and immune ecosystem
2025-May-27, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究探讨了放疗对雌激素受体阳性乳腺癌患者肿瘤基因组和免疫微环境的影响 首次结合单细胞DNA测序和单细胞RNA测序技术,在放疗前后时间点分析乳腺癌肿瘤的克隆选择和免疫细胞动态变化 样本量较小(20名患者),仅针对雌激素受体阳性乳腺癌,且随访时间较短(放疗后7天) 阐明放疗如何调节乳腺癌肿瘤微环境,特别是对肿瘤基因组和免疫生态系统的影响 20名接受新辅助放疗的雌激素受体阳性乳腺癌患者 数字病理学 乳腺癌 单细胞DNA测序, 单细胞RNA测序 NA 单细胞测序数据 20名患者,其中8名进行scDNA-seq,11名进行scRNA-seq,在放疗前和放疗后7天采集肿瘤活检样本 NA 单细胞DNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
16 2026-03-14
EZH2 coordinates memory B-cell programming and recall responses
2025-May-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本研究揭示了组蛋白甲基转移酶EZH2在调控记忆B细胞(MBC)编程和回忆应答中的关键作用 首次在流感感染模型中系统阐明了EZH2如何调控MBC的形成、表型维持和功能潜能,并发现EZH2缺失导致MBC库向非生发中心型IgM+亚群偏移 EZH2敲除不完全,可能存在残留活性影响表型解读;研究主要聚焦流感感染模型,在其他病原体感染中的普适性需进一步验证 探究表观遗传酶EZH2在记忆B细胞分化与功能调控中的作用机制 小鼠(Mus musculus)记忆B细胞及其亚群 免疫学 传染病(流感) 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据 未明确样本数量(使用抗原特异性MBC进行scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序 NA NA
17 2026-03-13
Kindlin-2-Mediated Hematopoiesis Remodeling Regulates Triple-Negative Breast Cancer Immune Evasion
2025-May-02, Molecular cancer research : MCR IF:4.1Q2
研究论文 本研究揭示了接头蛋白Kindlin-2通过重塑造血过程和调节PD-L1表达,在三阴性乳腺癌免疫逃逸中的关键作用 首次阐明Kindlin-2通过系统性调节造血过程(促进髓系细胞扩增)和肿瘤PD-L1表达,驱动三阴性乳腺癌免疫逃逸的新机制 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证;未详细探讨Kindlin-2调控造血和PD-L1表达的具体下游信号通路 探究Kindlin-2在三阴性乳腺癌免疫逃逸中的作用机制,并评估其作为免疫治疗联合靶点的潜力 三阴性乳腺癌肿瘤模型、荷瘤小鼠的造血系统及肿瘤微环境 肿瘤免疫学 三阴性乳腺癌 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、免疫组化、基因敲除 基因敲除小鼠模型 RNA测序数据、免疫组化图像 未明确说明具体样本数量,但涉及荷瘤小鼠模型及多种测序分析 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
18 2026-03-06
Avian photoreceptor homologies and the origin of double cones
2025-May-19, Current biology : CB IF:8.1Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术,研究了鸟类视网膜中光感受器的进化关系,特别是双锥细胞的起源 首次系统性地探索了鸟类光感受器与其他脊椎动物类群的细胞类型同源性,并揭示了双锥细胞的两个组成部分(DC-P和DC-A)分别起源于祖先的红锥和蓝锥 研究主要基于新孵化的鸡视网膜,可能未涵盖所有鸟类或发育阶段,且进化推断依赖于转录因子表达模式,需进一步功能验证 追踪鸟类光感受器与其他脊椎动物物种的细胞类型同源性,并阐明双锥细胞的进化起源 鸟类(鸡)和绿安乐蜥(Anolis carolinensis)的视网膜光感受器细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq),CRISPR介导的基因敲除,顺式调控分析 NA 单细胞转录组数据 新孵化的鸡视网膜细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
19 2026-03-06
Defining pathogenic IL-17 and CSF-1 gene expression signatures in chronic graft-versus-host disease
2025-May-08, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序方法,在小鼠慢性移植物抗宿主病模型中定义了IL-17和CSF-1的基因表达特征,并验证其在患者中的适用性 利用单细胞测序技术在小鼠血液中逆向工程出IL-17和CSF-1的时序表达特征,并首次在cGVHD患者的相关单核细胞群体中识别这些特征 研究基于小鼠模型推导特征,在患者中的验证样本有限(70%诊断患者和50%后续发病患者),且未涉及治疗响应预测的临床前瞻性验证 开发用于识别cGVHD患者中可药物靶向的免疫失调的生物标志物,以指导个体化治疗选择 慢性移植物抗宿主病小鼠模型及患者样本 NA 慢性移植物抗宿主病 单细胞测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
20 2026-03-06
Single-cell RNA sequencing reveals a reprogramming of hepatic immune cells and a protective role for B cells in MASH-driven HCC
2025-May-01, Hepatology communications IF:5.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了代谢功能障碍相关脂肪性肝炎驱动的肝细胞癌中肝内免疫细胞的重编程,并强调了B细胞在肝癌中的保护作用 首次在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎驱动的肝细胞癌模型中,利用单细胞RNA测序全面解析肝内免疫细胞的异质性和转录重编程,并发现B细胞通过增强T细胞反应发挥抗肿瘤免疫作用 研究基于小鼠模型,结果在人类中的直接适用性需进一步验证;单细胞测序样本量有限,可能未完全捕获所有免疫细胞亚群 探究代谢功能障碍相关脂肪性肝炎驱动的肝细胞癌中免疫细胞的重编程机制及B细胞的抗肿瘤作用 高脂高碳水化合物饮食喂养的MUP-uPA小鼠模型中的肝内免疫细胞 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,但使用小鼠模型进行单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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