单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-04-02	Comprehensive single-cell profiling of T and B cell subsets in mice reveals impacts on memory immune responses in FMDV infection 2025-May, Virology IF:2.8Q3 DOI:10.1016/j.virol.2025.110496 PMID:40090183	research paper	该研究通过单细胞RNA测序技术，全面分析了小鼠T细胞和B细胞亚群在口蹄疫病毒(FMDV)感染中对记忆免疫反应的影响	首次利用单细胞RNA测鉴定了小鼠脾脏中大多数T和B细胞亚群的特定基因标记，揭示了FMDV感染对记忆细胞功能的独特影响机制	研究仅限于小鼠模型，尚未在更大动物模型或人体中进行验证	探究FMDV感染对记忆免疫反应的影响机制	小鼠脾脏中的T细胞和B细胞亚群	免疫学	口蹄疫	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	未明确说明具体样本数量的小鼠脾脏细胞
2	2025-04-02	Neuronal activity modulates the expression of secretagogin, a Ca2+ sensor protein, during mammalian forebrain development 2025-May, Acta physiologica (Oxford, England) DOI:10.1111/apha.70031 PMID:40165367	研究论文	本研究探讨了神经元活动中钙离子传感器蛋白secretagogin的表达调控及其在哺乳动物前脑发育中的作用	揭示了secretagogin表达受神经元活动调控的新机制，并发现其在唐氏综合征胎儿中的表达延迟	研究主要集中于前脑和皮层神经元，未全面覆盖其他脑区	阐明secretagogin作为神经元标志物的表达调控机制及其与神经元活动的关系	人类胎儿前脑、小鼠皮层神经元、SH-SY5Y神经母细胞瘤细胞	神经科学	唐氏综合征	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫组织化学、体外培养	Scgn-iCre::Ai9转基因小鼠	基因表达数据、免疫染色图像	人类胎儿样本、小鼠模型及体外培养细胞
3	2025-04-02	Single‑cell RNA‑Seq reveals PBMC profile alterations in a patient following a radiation accident 2025-May, Experimental and therapeutic medicine IF:2.4Q3 DOI:10.3892/etm.2025.12846 PMID:40165803	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了辐射事故后患者外周血单个核细胞的动态变化	首次应用单细胞RNA测序技术分析辐射暴露后PBMCs的转录组变化，并揭示了相关信号通路的失调	样本量较小，仅包括一名辐射患者和十名健康对照	研究辐射暴露对人体血液免疫反应的影响	辐射事故患者和健康对照者的外周血单个核细胞(PBMCs)	生物医学	辐射损伤	单细胞RNA测序(scRNA-Seq)	NA	RNA测序数据	1名辐射患者(两个时间点)和10名健康对照者的PBMCs细胞
4	2025-03-30	Schwann cells secrete IGFBP5 to facilitate the growth of keloids 2025-May-15, Life sciences IF:5.2Q1 DOI:10.1016/j.lfs.2025.123534 PMID:40049369	研究论文	本研究探讨了雪旺细胞及其分泌蛋白IGFBP5在瘢痕疙瘩生长中的作用	首次发现雪旺细胞在瘢痕疙瘩中的比例显著增加，并揭示了IGFBP5通过p53/p21/Cyclin D1通路促进瘢痕疙瘩生长的分子机制	研究主要基于体外实验和兔耳瘢痕模型，尚未在人体临床试验中验证	阐明瘢痕疙瘩生长的分子机制并探索潜在治疗靶点	瘢痕疙瘩组织和正常瘢痕组织中的雪旺细胞及成纤维细胞	分子病理学	皮肤纤维增生性疾病	单细胞测序	兔耳瘢痕模型	基因表达数据	未明确说明样本数量，但包含瘢痕疙瘩和正常瘢痕组织的对比
5	2025-03-30	Single-cell transcriptomics in a child with coenzyme Q10 nephropathy: potential of single-cell RNA sequencing in pediatric kidney disease 2025-May, Pediatric nephrology (Berlin, Germany) DOI:10.1007/s00467-024-06611-2 PMID:39805995	研究论文	本研究通过单细胞转录组学分析了一名辅酶Q10肾病患儿的肾脏活检样本，揭示了该疾病在细胞水平上的基因表达变化	首次在辅酶Q10肾病中应用单细胞RNA测序技术，揭示了跨细胞类型的线粒体基因表达普遍下调现象	研究仅基于单一病例，样本量有限	阐明辅酶Q10肾病在单个细胞水平的基因表达变异	5岁辅酶Q10肾病男童的肾脏活检样本	数字病理学	肾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	1例肾脏活检样本
6	2025-03-30	Integration of Single-Cell and Spatial Transcriptomic Data Reveals Spatial Architecture and Potential Biomarkers in Alzheimer's Disease 2025-May, Molecular neurobiology IF:4.6Q1 DOI:10.1007/s12035-024-04617-3 PMID:39543008	research paper	该研究通过整合单细胞和空间转录组数据，揭示了阿尔茨海默病(AD)前额叶皮层(PFC)的空间结构和潜在生物标志物	首次结合scRNA-seq和空间转录组学技术构建AD患者PFC区域的细胞图谱和空间结构，并发现少突胶质细胞亚型与AD病理的关联以及PLXDC2作为非侵入性生物标志物的潜力	研究样本量相对有限(8个scRNA-seq数据集)，且空间转录组分析仅聚焦于PFC区域	探索AD患者前额叶皮层的细胞组成和空间结构特征，寻找疾病相关生物标志物	阿尔茨海默病患者和正常对照的前额叶皮层组织	digital pathology	geriatric disease	scRNA-seq, 空间转录组学, 微阵列	CARD工具(空间重构), 无监督聚类	单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 微阵列数据	8个scRNA-seq数据集(包含AD患者和正常对照)
7	2025-03-25	Xin-Fu-Kang oral liquid mitigates chronic heart failure through NR4A1-Dependent regulation of endoplasmic reticulum-mitochondrial crosstalk in Cardiomyocytes 2025-May, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2025.156467 PMID:40036990	研究论文	研究探讨了心复康口服液通过调节NR4A1依赖的内质网-线粒体交互作用，改善慢性心力衰竭的机制	首次揭示了心复康口服液通过NR4A1介导的内质网-线粒体交互作用改善心肌细胞功能的分子机制	研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床转化需要进一步验证	探究心复康口服液治疗慢性心力衰竭的分子机制	心肌细胞	心血管疾病研究	慢性心力衰竭	单细胞测序(scRNA-seq)、UPLC-QE MS、分子对接	小鼠横向主动脉缩窄(TAC)模型、苯肾上腺素诱导的心脏压力超负荷模型	基因表达数据、质谱数据	小鼠模型和体外培养的H9C2细胞
8	2025-03-25	Targeting p53 for immune modulation: Exploring its functions in tumor immunity and inflammation 2025-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217614 PMID:40054656	综述	本文综述了p53在肿瘤免疫和炎症中的双重作用，探讨其对免疫动态的影响及其在癌症免疫治疗中的潜在应用	详细阐述了p53在免疫调节中的新功能，包括其在免疫原性细胞死亡(ICD)中的作用以及与NF-κB信号通路的相互作用	NA	探讨p53在免疫调节和肿瘤免疫逃逸中的作用，及其在癌症免疫治疗中的潜在应用	p53蛋白及其在免疫细胞(如巨噬细胞、树突状细胞、NK细胞、T细胞和B细胞)中的功能	肿瘤免疫学	癌症	单细胞RNA测序、CRISPR筛选	NA	NA	NA
9	2025-03-25	Huoxue Tongluo tablet enhances atherosclerosis efferocytosis by promoting the differentiation of Trem2+ macrophages via PPARγ signaling pathway 2025-May, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2025.156579 PMID:40068297	研究论文	本研究探讨了活血通络片通过PPARγ信号通路促进Trem2+巨噬细胞分化，从而增强动脉粥样硬化中巨噬细胞的胞葬作用	首次揭示了活血通络片对巨噬细胞亚群的调控作用及其促进胞葬活性的机制	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	评估活血通络片在单细胞水平上治疗动脉粥样硬化的效果和机制	ApoE⁻/⁻小鼠	心血管疾病	动脉粥样硬化	UPLC-MS/MS, 单细胞测序, qPCR, 免疫组化, 流式细胞术, 免疫荧光染色, Western blotting	动物模型	转录组数据, 蛋白质表达数据	ApoE⁻/⁻小鼠（具体数量未明确说明）
10	2025-03-25	Irreversible electroporation combined with PD-L1/IL-6 dual blockade promotes anti-tumor immunity via cDC2/CD4+T cell axis in MHC-I deficient pancreatic cancer 2025-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217620 PMID:40068706	research paper	研究探讨了不可逆电穿孔（IRE）联合PD-L1/IL-6双阻断如何通过cDC2/CD4+T细胞轴在MHC-I缺陷型胰腺癌中促进抗肿瘤免疫	揭示了IRE疗法后PD-L1阻断激活cDC2-CD4T细胞轴的补偿性抗肿瘤机制，并提出了PD-L1/IL-6双阻断联合消融治疗的新策略	研究主要基于临床样本和小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证	探索MHC-I缺陷型胰腺癌的免疫治疗新方法	胰腺导管腺癌（PDAC）患者和小鼠模型	肿瘤免疫学	胰腺癌	scRNA-seq, 流式细胞术	NA	基因表达数据, 细胞表型数据	临床样本和小鼠模型（具体数量未明确说明）
11	2025-03-25	UBE2C mediates follicular thyroid carcinoma invasion and metastasis via K29-Specific vimentin ubiquitination 2025-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217624 PMID:40074069	研究论文	本研究揭示了UBE2C通过K29特异性波形蛋白泛素化调控滤泡性甲状腺癌的侵袭和转移	首次发现UBE2C在滤泡性甲状腺癌中的双重功能，即促进细胞增殖同时抑制迁移和侵袭，并通过K29特异性泛素化降解波形蛋白	动物模型中UBE2C敲低导致原发肿瘤减小但促进转移的现象需要进一步机制研究	探究UBE2C在滤泡性甲状腺癌进展中的具体作用机制	滤泡性甲状腺癌(FTC)组织和细胞系	癌症生物学	甲状腺癌	单细胞RNA测序，动物模型	NA	基因表达数据，蛋白质相互作用数据	未明确说明样本数量，但包含临床标本和细胞系实验
12	2025-03-23	Spatial transcriptomics of Glomerulo-centric antibody mediated rejection in renal transplants 2025-May, Clinical immunology (Orlando, Fla.) DOI:10.1016/j.clim.2025.110460 PMID:39993695	研究论文	本研究利用数字空间分析技术，对一名患者在急性抗体介导排斥反应治疗前后的四次肾活检样本进行空间转录组学分析	首次在急性抗体介导排斥反应中，通过空间转录组学技术定位了肾小球中的分子特征，揭示了天然免疫细胞和HLA II类抗原在肾小球中的表达变化	研究仅基于一名患者的四次活检样本，样本量较小，可能影响结果的普遍性	探讨急性抗体介导排斥反应中肾小球的分子特征变化及其对足细胞的影响	肾移植患者的肾活检样本	数字病理学	肾脏疾病	数字空间分析（Digital Spatial Profiling）	NA	空间转录组数据	一名患者的四次肾活检样本
13	2025-03-23	Single-Cell Transcriptomics Identifies a Prominent Role for the MIF-CD74 Axis in Myasthenia Gravis Thymus 2025-May, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation DOI:10.1212/NXI.0000000000200384 PMID:40117520	研究论文	本文通过单细胞转录组学技术研究了重症肌无力（MG）患者胸腺中的淋巴细胞类型，揭示了MIF-CD74轴在MG胸腺中的重要作用	首次在MG胸腺中观察到B细胞向生发中心（GC）相关和抗体分泌细胞成熟的6个不同群体，并发现MIF-CD74轴在B细胞存活信号中的主导作用	研究样本量较小，仅包括11名未接受免疫治疗的早期发病AChR抗体阳性MG患者	探讨MG胸腺中淋巴细胞类型的转录组特征及其在疾病中的作用	重症肌无力（MG）患者的胸腺组织	单细胞转录组学	重症肌无力	单细胞转录组学、多重组织学、ELISA	NA	单细胞转录组数据	11名未接受免疫治疗的早期发病AChR抗体阳性MG患者的胸腺组织
14	2025-03-22	Ibudilast Protects Retinal Bipolar Cells From Excitotoxic Retinal Damage and Activates the mTOR Pathway 2025-May, Glia IF:5.4Q1 DOI:10.1002/glia.24657 PMID:39916387	研究论文	本文研究了Ibudilast在保护视网膜双极细胞免受兴奋性毒性视网膜损伤中的作用，并探讨了其激活mTOR通路的机制	首次在兴奋性毒性视网膜损伤模型中验证了Ibudilast的神经保护作用，并通过单细胞RNA测序揭示了其作用机制	研究仅基于鸡的视网膜损伤模型，未在人类或其他哺乳动物模型中进行验证	探讨Ibudilast在视网膜神经元保护中的作用及其机制	鸡的视网膜神经元，特别是双极细胞和Müller胶质细胞	神经科学	视网膜疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq），光谱域光学相干断层扫描（SD-OCT），电生理学	兴奋性毒性视网膜损伤模型	RNA测序数据，光学成像数据，电生理数据	未明确提及具体样本数量，但使用了鸡的视网膜损伤模型
15	2025-03-22	Hydrogen sulfide improves depression-like behaviors in CUMS-induced mice by regulating autophagy 2025-May, Psychoneuroendocrinology IF:3.4Q2 DOI:10.1016/j.psyneuen.2025.107418 PMID:40023886	研究论文	本研究探讨了硫化氢通过调节自噬改善慢性不可预测轻度应激（CUMS）诱导的小鼠抑郁样行为的机制	首次揭示了硫化氢通过激活PI3K/AKT/mTOR信号通路抑制自噬并改善突触可塑性损伤的抗抑郁机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探讨硫化氢在抑郁症中的抗抑郁机制及其治疗潜力	慢性不可预测轻度应激（CUMS）诱导的抑郁小鼠	神经科学	抑郁症	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	CUMS诱导的抑郁小鼠
16	2025-03-20	Single-Cell RNA Sequencing Uncovers Molecular Features Underlying the Disrupted Neurogenesis Following Traumatic Brain Injury 2025-May, Glia IF:5.4Q1 DOI:10.1002/glia.24671 PMID:39760225	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了创伤性脑损伤（TBI）后神经干细胞（NSCs）向胶质细胞分化的分子机制，并发现Tubb3基因表达的NSC-4亚群的减少是神经生成受阻的原因	首次通过单细胞RNA测序技术揭示了TBI后NSCs向胶质细胞分化的分子机制，并发现Dlx2转录因子的下调是神经生成受阻的关键因素	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	揭示TBI后神经干细胞分化异常的分子机制	小鼠脑室下区（SVZ）的神经干细胞及其衍生细胞	单细胞测序	创伤性脑损伤	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	小鼠脑室下区的神经干细胞及其衍生细胞
17	2025-03-19	Insight into perfluorooctanoic acid-induced impairment of mouse embryo implantation via single-cell RNA-seq 2025-May-05, Journal of hazardous materials IF:12.2Q1 DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.137375 PMID:39892134	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了全氟辛酸（PFOA）对小鼠胚胎植入的影响及其机制	首次利用单细胞RNA测序技术揭示了PFOA通过干扰ANGPTL信号通路影响子宫内膜上皮细胞功能和发育的具体机制	研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本	探讨PFOA对子宫内膜接受性和胚胎植入的影响及其分子机制	小鼠子宫内膜	生殖医学	不孕症	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	NA
18	2025-03-19	SPP1 + macrophages in colorectal cancer: Markers of malignancy and promising therapeutic targets 2025-May, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2024.101340 PMID:40092488	研究论文	本研究通过整合单细胞和空间转录组学以及批量测序技术，探讨了SPP1+巨噬细胞在结直肠癌（CRC）肿瘤微环境中的角色和机制	揭示了SPP1+巨噬细胞在CRC中的显著升高及其作为恶性肿瘤标志物的潜力，提出了这些巨噬细胞作为治疗靶点的可能性	研究中未明确提及样本量，且对于SPP1+巨噬细胞的具体作用机制仍需进一步探索	探讨SPP1+巨噬细胞在结直肠癌中的作用及其作为治疗靶点的潜力	结直肠癌（CRC）肿瘤微环境中的SPP1+巨噬细胞	数字病理学	结直肠癌	单细胞转录组学, 空间转录组学, 批量测序	NA	转录组数据	NA
19	2025-03-19	Comprehensive analysis of immune subtype characterization on identification of potential cells and drugs to predict response to immune checkpoint inhibitors for hepatocellular carcinoma 2025-May, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2024.101471 PMID:40092490	研究论文	本文通过免疫亚型分类，研究了肝细胞癌（HCC）患者对免疫检查点抑制剂（ICIs）反应的预测，并探讨了细胞异质性和候选药物的作用	本研究首次整合了细胞异质性和免疫表型分析，以预测HCC患者对ICIs的反应，并识别了与ICI反应相关的关键细胞和候选药物	研究样本量有限，且未进行大规模临床试验验证	预测肝细胞癌患者对免疫检查点抑制剂的反应，并探索相关细胞和药物	肝细胞癌（HCC）患者	数字病理学	肝癌	单细胞测序技术	NA	基因表达数据	151个免疫相关基因集
20	2025-03-19	The scRNA-sequencing landscape of pancreatic ductal adenocarcinoma revealed distinct cell populations associated with tumor initiation and progression 2025-May, Genes & diseases IF:6.9Q1 DOI:10.1016/j.gendis.2024.101323 PMID:40092486	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术揭示了胰腺导管腺癌（PDAC）中与肿瘤起始和进展相关的不同细胞群体	首次在PDAC患者中通过单细胞RNA测序技术识别了与肿瘤起始和淋巴结转移相关的关键细胞群体和基因	样本量较小，仅包括8名PDAC患者，且未涉及其他类型的胰腺癌	探索胰腺导管腺癌（PDAC）的转录组景观，以理解其发展机制并寻找新的治疗策略	8名不同淋巴结转移状态的PDAC患者	数字病理学	胰腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	8名PDAC患者