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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis and machine learning-based integration develop an immune-responsive signature of antigen-presenting cancer-associated fibroblasts in lung adenocarcinoma
2025-Apr-30, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-2024-2015
PMID:40400942
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析和机器学习整合开发了肺腺癌中抗原呈递癌症相关成纤维细胞的免疫反应特征 | 发现具有巨噬细胞样特征的新型抗原呈递CAF亚群,该亚群与免疫检查点抑制剂良好反应相关 | apCAF丰度在个体间存在差异,样本量可能有限 | 识别与肺腺癌免疫检查点抑制剂疗效相关的CAF亚群 | 肺腺癌样本中的癌症相关成纤维细胞 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | 机器学习 | RNA测序数据 | 多个数据集的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 162 | 2025-10-06 |
Unlocking plant regeneration: The role for glutathione
2025-04-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.03.012
PMID:40262524
|
研究论文 | 本研究揭示了谷胱甘肽在植物再生过程中的关键作用机制 | 首次发现组织损伤释放的谷胱甘肽通过加速细胞周期G1期进程促进植物器官再生 | NA | 探究谷胱甘肽在植物再生过程中的分子机制 | 植物再生过程 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,活体成像 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 163 | 2025-10-06 |
Lipoxin A4/FPR2 Signaling Mitigates Ferroptosis of Alveolar Epithelial Cells via NRF2-Dependent Pathway During Lung Ischemia-Reperfusion Injury
2025-Apr-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202401475R
PMID:40270323
|
研究论文 | 本研究探讨脂氧素A4通过FPR2受体激活NRF2通路抑制肺泡上皮细胞铁死亡,从而减轻肺缺血再灌注损伤的机制 | 首次揭示脂氧素A4/FPR2信号通路通过NRF2依赖性途径调控肺泡上皮细胞铁死亡在肺缺血再灌注损伤中的保护作用 | 研究主要基于小鼠模型,在人体中的直接验证尚需进一步研究 | 探究铁死亡在肺缺血再灌注损伤中的作用及脂氧素A4的保护机制 | 肺移植患者样本、C57BL/6野生型小鼠、Fpr2和Nrf2基因敲除小鼠、肺泡II型上皮细胞 | 生物医学研究 | 肺缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序、小鼠肺门结扎模型、小鼠原位肺移植模型、体外细胞实验 | 基因敲除动物模型、细胞模型 | 基因表达数据、生理指标数据、生化指标数据 | 未明确样本数量,包含患者组织样本、多种基因型小鼠和细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 164 | 2025-10-06 |
Vagal Sensory Gut-Brain Pathways That Control Eating-Satiety and Beyond
2025-Apr, Comprehensive Physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1002/cph4.70010
PMID:40229922
|
综述 | 本文挑战了迷走神经仅传递饱腹信号的传统观点,系统阐述了迷走神经作为整合餐食信息的复杂感觉系统 | 揭示了迷走神经传入神经元具有专门亚群和多样感觉模式,能够主动编码餐食相关信息的多个方面 | 作为综述文章,未进行原始实验研究,主要基于现有文献整合分析 | 探讨迷走神经感觉通路在肠脑通讯中的多重功能 | 迷走神经传入神经元及其下游脑回路 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学、神经回路映射、功能成像 | NA | 文献证据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 165 | 2025-10-06 |
Single-cell omics technologies - Fundamentals on how to create single-cell looking glasses for reproductive health
2025-Apr, American journal of obstetrics and gynecology
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.ajog.2024.08.041
PMID:40253074
|
综述 | 本文综述单细胞组学技术在生殖健康研究中的应用进展 | 系统整合单细胞测序、空间转录组学和高维蛋白质组成像等多种技术,为生殖医学提供多维视角 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于文献综述 | 探讨单细胞技术在生殖健康领域的临床应用前景 | 生殖道组织、胎儿发育、妊娠过程和妇科疾病 | 单细胞组学 | 妇科疾病、妊娠并发症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组成像 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 166 | 2025-10-06 |
Identification of druggable genetic targets for prostate cancer risk based on mendelian randomization and single-cell RNA sequencing
2025-Apr-30, International urology and nephrology
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s11255-025-04525-y
PMID:40304996
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、共定位分析和单细胞RNA测序技术,识别与前列腺癌风险相关的可成药遗传靶点 | 首次将孟德尔随机化、共定位分析和单细胞RNA测序技术相结合,系统性地识别前列腺癌的可成药遗传靶点 | 部分基因(如BAK1)可能伴随副作用,需要进一步验证 | 识别与前列腺癌风险相关的可成药遗传靶点,为靶向治疗提供新方向 | 前列腺癌相关遗传靶点和肿瘤细胞类型 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 孟德尔随机化分析, 共定位分析, 单细胞RNA测序, 全表型关联研究 | NA | 基因组数据, 单细胞表达数据 | 2608个可成药基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 167 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing for characterizing the immune communication and iron metabolism roles in CD31+ glioma cells
2025-Apr-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-377
PMID:40386270
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究CD31+胶质瘤细胞在免疫通讯和铁代谢中的作用 | 首次在胶质瘤微环境中系统分析CD31+免疫细胞的细胞通讯网络和铁代谢功能,发现铁蛋白在免疫调节中的潜在作用 | 研究局限于CD31+细胞亚群,未涵盖胶质瘤微环境中所有细胞类型 | 阐明CD31+免疫细胞在胶质瘤进展中的作用机制 | 胶质瘤微环境中的CD31+免疫细胞(巨噬细胞和T细胞) | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | CellChat, Monocle3 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 168 | 2025-10-06 |
scRNA-seq reveals chemotherapy-induced tumor microenvironment changes in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Apr-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-103
PMID:40386264
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析化疗诱导的胰腺导管腺癌肿瘤微环境变化 | 发现LYZ在化疗后肿瘤细胞中显著增加,揭示化疗改变抗原呈递机制和PVR信号通路从T细胞向髓系细胞转移 | 使用公开可用数据,缺乏实验验证 | 研究化疗诱导的肿瘤微环境变化并优化胰腺癌免疫治疗反应 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本(接受或未接受标准化疗) | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 169 | 2025-10-06 |
Single cell sequencing technology reveals the correlation between B lymphocytes and vascular inflammatory symptoms of Kawasaki disease
2025-Apr-30, Translational pediatrics
IF:1.5Q2
DOI:10.21037/tp-2025-19
PMID:40386362
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了川崎病血管炎症症状与B淋巴细胞的相关性 | 首次通过单细胞测序技术系统分析川崎病不同血管炎症阶段的免疫细胞变化,发现CD19+B细胞与疾病进程的关联 | 样本量相对有限,单细胞测序仅包含10例样本 | 探索川崎病早期血管炎症症状中的免疫细胞活化,寻找潜在诊断标志物并指导IVIG治疗时机 | 川崎病患儿和对照组儿童 | 单细胞组学 | 川崎病 | 单细胞测序,流式细胞术,定量PCR | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据,基因表达数据 | 单细胞测序10例(7例KD+3对照),验证队列277例(95例KD+12健康儿童+170例发热儿童) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞测序平台 |
| 170 | 2025-10-06 |
Identification and Exploration of Pyroptosis-Related Genes in Macrophage Cells Reveal Necrotizing Enterocolitis Heterogeneity Through Single-Cell and Bulk-Sequencing
2025-Apr-24, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26094036
PMID:40362275
|
研究论文 | 通过单细胞和批量测序技术鉴定和探索巨噬细胞中焦亡相关基因,揭示坏死性小肠结肠炎的异质性 | 首次在NEC中发现了一个新的巨噬细胞亚群,并证实TREM1在焦亡过程中的关键作用 | 焦亡相关基因在NEC发病机制中的具体分子机制仍需进一步研究 | 识别焦亡相关细胞群体和基因,探索NEC的潜在治疗靶点 | 坏死性小肠结肠炎(NEC)患者肠道组织和巨噬细胞 | 单细胞测序分析 | 坏死性小肠结肠炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫荧光染色, PCR, Western blot | WGCNA, GSEA, 细胞通讯分析 | RNA测序数据, 图像数据, 蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 171 | 2025-10-06 |
Histone HIST1 genes and tumor-infiltrating lymphocytes in a child with γδ T cell acute lymphoblastic leukemia by single-cell sequencing
2025-Apr-23, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiaf022
PMID:39973604
|
病例报告 | 通过单细胞测序技术研究儿童γδ T细胞急性淋巴细胞白血病中HIST1组蛋白基因与肿瘤浸润淋巴细胞的关系 | 首次在γδ T-ALL中发现HIST1组蛋白基因与疾病的相关性,并揭示γδ T细胞对抗该白血病的潜在效应功能 | 单一样本病例研究,结果需要更大样本量验证 | 探索γδ T-ALL的生物学特征和潜在治疗靶点 | 儿童γδ T细胞急性淋巴细胞白血病患者 | 单细胞测序 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例儿童患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 172 | 2025-10-06 |
Cell Type Resolved Expression of Duplicate Genes Retained From Whole Genome Duplication in Atlantic salmon
2025-Apr-30, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evaf076
PMID:40305003
|
研究论文 | 利用单细胞转录组技术研究大西洋鲑鱼肝脏组织中全基因组复制保留的重复基因在不同细胞类型中的表达模式 | 首次在单细胞水平上分析鲑鱼全基因组复制保留的重复基因在不同细胞类型中的表达差异和细菌感染响应 | 仅研究肝脏组织,未涉及其他组织类型;统计功效可能受限 | 探究全基因组复制事件后重复基因在不同细胞类型中的表达模式和功能演化 | 大西洋鲑鱼肝脏组织中的重复基因对 | 单细胞生物学 | 细菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 173 | 2025-10-06 |
Development and validation of tryptophan metabolism-related risk model and molecular subtypes for predicting postoperative biochemical recurrence in prostate cancer
2025-Apr-30, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-2025-39
PMID:40376539
|
研究论文 | 开发并验证了基于色氨酸代谢的风险模型和分子亚型,用于预测前列腺癌患者术后生化复发 | 首次将色氨酸代谢相关基因与前列腺癌术后生化复发预测相结合,建立了风险评分模型和分子亚型分类系统 | 研究主要基于TCGA数据库,需要更多独立队列验证模型普适性 | 预测前列腺癌患者根治性前列腺切除术后生化复发风险 | 前列腺癌患者 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 差异表达分析、单因素Cox回归、LASSO回归、多因素Cox回归、一致性聚类、免疫组化、单细胞测序 | Cox回归风险模型、聚类分析 | 基因表达数据、临床数据 | TCGA-PRAD数据集421例前列腺癌患者,高风险组211例,Cluster 1亚型261例 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 174 | 2025-10-06 |
Cold-Induced DHRS4 Promotes Thermogenesis via Enhanced Fatty Acid β-Oxidation in Porcine Subcutaneous Adipocytes
2025-Apr-22, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15091190
PMID:40362005
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析揭示了猪皮下脂肪细胞中冷诱导DHRS4通过增强脂肪酸β-氧化促进产热的新机制 | 首次在缺乏经典棕色脂肪组织的大型哺乳动物(猪)中发现DHRS4作为表观遗传-代谢开关调控冷适应机制 | 研究主要聚焦于猪模型,结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 | 探究大型哺乳动物脂肪组织在冷应激下的代谢重编程表观遗传机制 | 猪皮下脂肪组织 | 表观遗传学 | 代谢适应 | 单细胞RNA测序, 批量转录组分析, DNA甲基化分析 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 冷暴露猪模型的皮下脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 175 | 2025-05-17 |
Supplementation of Forskolin and Linoleic Acid During IVC Improved the Developmental and Vitrification Efficiency of Bovine Embryos
2025-Apr-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26094151
PMID:40362390
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研究论文 | 本研究评估了在体外培养(IVC)中添加福斯高林和亚油酸(FL)对牛胚胎冷冻存活、脂质含量和玻璃化过程中生存能力的影响 | 首次使用脂质代谢组学和单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术揭示了FL通过调节脂质代谢降低胚胎脂滴含量,从而提高冷冻存活率的机制 | 研究仅针对牛胚胎,结果可能不适用于其他物种 | 提高体外培养牛胚胎的发育能力和玻璃化效率 | 牛胚胎 | 生殖生物学 | NA | 脂质代谢组学, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 脂质组学数据, 基因表达数据 | 726种已鉴定脂质(26种差异表达),1079个差异表达基因(DEGs) | NA | NA | NA | NA |
| 176 | 2025-05-17 |
Deciphering Anticancer Mechanisms of Calycosin in Lung Adenocarcinoma Through Multi-Omics: Targeting SMAD3-Mediated NOTCH Signaling in the Tumor Microenvironment
2025-Apr-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17091455
PMID:40361382
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法探讨了毛蕊花素在肺腺癌中的抗癌机制,特别是通过靶向SMAD3介导的NOTCH信号通路在肿瘤微环境中的作用 | 首次揭示了毛蕊花素通过靶向SMAD3调控NOTCH信号通路在单核细胞/巨噬细胞中的作用,从而抑制肿瘤生长、侵袭和免疫逃逸 | 研究主要基于体外和计算分析,缺乏体内实验验证 | 探究毛蕊花素在肺腺癌中的抗癌机制 | 肺腺癌(LUAD)及其肿瘤微环境 | 肿瘤学 | 肺癌 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、网络药理学、分子对接 | NA | RNA测序数据 | 未明确说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 177 | 2025-05-17 |
New Insights and Implications of Cell-Cell Interactions in Developmental Biology
2025-Apr-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26093997
PMID:40362237
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综述 | 本文综述了2008年至2023年间与发育生物学相关的细胞间相互作用(CCIs)研究,系统收集和分类了93种分析工具和39个数据库,并通过案例研究展示了其实际应用 | 利用高通量技术如单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组学(ST)系统解析细胞间调控网络,并构建了全面的数据库和分析框架 | 当前分析框架在空间定位和单细胞分辨率下跨膜状态验证方面存在解释性限制 | 推动发育生物学中细胞间相互作用(CCIs)研究的应用和临床转化 | 细胞间相互作用(CCIs)及其在胚胎发育中的调控网络 | 发育生物学 | NA | scRNA-seq, 空间转录组学(ST) | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 178 | 2025-05-17 |
Exploring the Role of Circadian Rhythm-Related Genes in the Identification of Sepsis Subtypes and the Construction of Diagnostic Models Based on RNA-seq and scRNA-seq
2025-Apr-23, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26093993
PMID:40362233
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研究论文 | 探讨昼夜节律相关基因在脓毒症亚型识别及基于RNA-seq和scRNA-seq的诊断模型构建中的作用 | 首次基于昼夜节律相关基因识别脓毒症亚型,并利用多种机器学习算法构建诊断模型 | 研究依赖于公共数据库数据,未进行独立队列验证 | 识别脓毒症亚型并构建诊断模型 | 脓毒症患者和对照组的基因表达数据 | 生物信息学 | 脓毒症 | RNA-seq, scRNA-seq, RT-qPCR | 随机森林, 支持向量机, 广义线性模型, xgboost | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的脓毒症和对照组RNA-seq数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 179 | 2025-05-17 |
Dual Disruption of EGFR/PI3K Signaling: IGF2BP2 Targeting Reverses Anti-EGFR Resistance in CAFs-Infiltrated Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Apr-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26093941
PMID:40362183
|
研究论文 | 本研究探讨了RNA结合蛋白IGF2BP2在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的致癌作用及其作为治疗靶点的潜力 | 首次发现IGF2BP2通过m6A依赖机制稳定EGFR和PIK3R1 mRNA,同时靶向EGFR/PI3K信号通路克服抗EGFR耐药性 | 研究主要基于体外和小鼠模型,尚未进行临床验证 | 探索OSCC中RNA结合蛋白的调控机制并开发新的治疗策略 | 口腔鳞状细胞癌细胞和癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 癌症生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、RIP-seq、RIP/MeRIP-qPCR、双荧光素酶报告基因检测 | 小鼠异种移植模型和基因敲除小鼠模型 | RNA测序数据和蛋白质相互作用数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及组织微阵列、体外细胞实验和小鼠模型 | NA | NA | NA | NA |
| 180 | 2025-05-17 |
Spatial Omics in Clinical Research: A Comprehensive Review of Technologies and Guidelines for Applications
2025-Apr-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26093949
PMID:40362187
|
review | 本文全面综述了空间组学技术在临床研究中的应用及其相关指南 | 整合分子分析与空间组织背景,提供高分辨率的基因表达、蛋白质相互作用和表观遗传修饰分析 | 数据复杂性和整合方面存在挑战 | 探讨空间组学技术在疾病机制和治疗反应中的应用 | 癌症、神经学和免疫学领域 | digital pathology | NA | spatial transcriptomics, proteomics, epigenomics | NA | molecular data, spatial data | NA | NA | NA | NA | NA |