单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 760 篇文献，本页显示第 161 - 180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-05-15 |
Deletion of hepcidin disrupts iron homeostasis and hematopoiesis in zebrafish embryogenesis
2025-Apr-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204307
PMID:40110772
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research paper | 研究通过CRISPR/Cas9系统创建稳定的hamp敲除斑马鱼模型，揭示了hamp在铁调节和造血中的关键作用 | 首次在斑马鱼模型中揭示了hamp缺失导致母体铁过载，并影响血红蛋白基因表达和血液祖细胞发育 | 研究仅局限于斑马鱼模型，尚未在哺乳动物或人类中进行验证 | 探索hamp在斑马鱼造血过程中的作用及其对铁稳态的影响 | 斑马鱼胚胎及其血液祖细胞 | developmental biology | blood disorders | CRISPR/Cas9系统, 单细胞RNA测序 | CRISPR knockout model | genetic and RNA sequencing data | 斑马鱼胚胎及其血液祖细胞样本 |
| 162 | 2025-05-15 |
Microvascular aberrations found in human polycystic kidneys are an early feature in a Pkd1 mutant mouse model
2025-Apr-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.052024
PMID:40114603
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学、三维成像及多模态磁共振成像技术，探讨了人类多囊肾中微血管异常的特征及其在小鼠模型中的早期表现 | 首次在人类ADPKD肾脏中鉴定出一种分子特征独特的微血管亚群，并在Pkd1突变小鼠模型中发现了类似的早期血管异常 | 研究主要关注ADPKD的血管异常，未涉及其他类型肾脏疾病的比较 | 探究ADPKD肾脏血管异常的起始时间和特征，为靶向血管治疗提供依据 | 人类ADPKD肾脏及Pkd1突变小鼠模型 | 数字病理学 | 多囊肾病 | 单细胞转录组学、三维成像、多模态磁共振成像 | Pkd1突变小鼠模型 | 图像、转录组数据 | 人类ADPKD肾脏样本及Pkd1突变小鼠肾脏样本 |
| 163 | 2025-05-14 |
Comprehensive pan-cancer single-cell analysis reveals glycolysis-related signatures as predictive biomarkers for immunotherapy response and their role in bladder cancer
2025-Apr-16, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114381
PMID:40058104
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研究论文 | 本研究通过全面的泛癌单细胞分析，揭示了糖酵解相关特征作为免疫治疗反应的预测生物标志物及其在膀胱癌中的作用 | 发现了一个与免疫治疗反应强烈相关的Glycolysis.Sig，并在预后和免疫反应中表现出优异的预测性能 | 研究结果主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证 | 探究糖酵解在泛癌中的作用，特别是在膀胱癌中的角色 | 34个单细胞RNA测序队列、8个接受ICI治疗的批量RNA测序队列和TCGA批量泛癌RNA测序队列 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 34个scRNA-seq队列、8个ICI治疗的bulk RNA-seq队列和TCGA泛癌RNA-seq队列 |
| 164 | 2025-05-14 |
Multi-transcriptomics reveals niche-specific expression programs and endothelial cells in glioblastoma
2025-Apr-15, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06185-z
PMID:40234880
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研究论文 | 该研究通过多转录组学方法揭示了胶质母细胞瘤中特定微环境的表达程序及内皮细胞的特征 | 发现了胶质母细胞瘤中坏死周围假栅栏细胞（PAN）和微血管增生（MVP）区域的特定分子表达和细胞组织差异，并识别了两种不同的内皮细胞表型 | 研究未完全阐明这些特定组织病理学特征的分子和细胞组分的空间组织 | 探究胶质母细胞瘤中坏死周围假栅栏细胞和微血管增生区域的分子表达和细胞组织差异 | 胶质母细胞瘤患者 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | bulk RNA测序、空间转录组学、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 胶质母细胞瘤患者的样本 |
| 165 | 2025-05-14 |
Central FGF19 signaling enhances energy homeostasis and adipose tissue thermogenesis through sympathetic activation in obese mice
2025-Apr-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00488.2024
PMID:40059865
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research paper | 该研究探讨了中枢FGF19信号通过激活交感神经促进肥胖小鼠能量稳态和脂肪组织产热的作用机制 | 揭示了FGF19不仅通过减少摄食，还通过激活交感神经促进白色和棕色脂肪组织产热的新机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体验证 | 阐明中枢FGF19信号改善肥胖小鼠能量代谢的作用机制 | 饮食诱导肥胖(DIO)小鼠 | 代谢研究 | 肥胖症 | 单细胞RNA测序 | 小鼠肥胖模型 | RNA测序数据、生理指标数据 | 未明确说明数量的饮食诱导肥胖小鼠 |
| 166 | 2025-05-14 |
Genome-Scale Metabolic Modeling of Human Pancreas with Focus on Type 2 Diabetes
2025-Apr, Omics : a journal of integrative biology
IF:2.2Q3
DOI:10.1089/omi.2024.0211
PMID:40068171
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和通用Human1模型，生成了非糖尿病和2型糖尿病状态下α、β、δ和PP细胞的基因组尺度代谢模型，并通过通量平衡分析研究了代谢活动的变化 | 首次在单细胞分辨率下生成胰腺细胞的基因组尺度代谢模型，并揭示了2型糖尿病中不同胰岛细胞代谢活动的变化 | 研究主要基于计算模型，需要进一步实验验证 | 深入理解2型糖尿病的病理生理学并发现新的分子靶点 | 人类胰腺中的α、β、δ和PP细胞 | 计算生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 通量平衡分析 | 基因组尺度代谢模型 | RNA测序数据 | NA |
| 167 | 2025-05-14 |
Expression of co-signaling molecules TIM-3/Galectin-9 at the maternal-fetal interface
2025-Apr, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2025.03.002
PMID:40068377
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研究论文 | 研究母胎界面共刺激分子TIM-3/Galectin-9的表达及其在维持免疫耐受微环境中的作用 | 首次系统研究了Galectin-9和TIM-3在母胎界面的分布和功能，揭示了它们与妊娠维持的潜在关联 | 研究主要基于体外实验和转录组学数据，缺乏体内功能验证 | 探究母胎界面免疫耐受微环境的分子机制 | 母体蜕膜组织和胎盘来源细胞 | 生殖免疫学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学、多重免疫组化 | NA | 转录组数据、免疫组化数据 | 未明确说明样本数量 |
| 168 | 2025-05-13 |
A Germline Heterozygous Dominant Negative IKZF2 Variant Causing Syndromic Primary Immune Regulatory Disorder and ICHAD
2025-Apr-28, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-025-01882-2
PMID:40295428
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research paper | 本文详细描述了一例携带IKZF2基因变异的儿科患者的免疫学评估，揭示了该变异导致的免疫失调综合征ICHAD的免疫表型 | 首次报道了种系显性负性HELIOS缺陷的免疫表型，并在单细胞水平上扩展了对自身免疫性溶血性贫血发病机制的理解 | 研究仅基于单个病例，样本量有限 | 研究IKZF2基因变异导致的免疫失调综合征的免疫学特征 | 携带IKZF2基因变异的儿科患者 | 免疫学 | 原发性免疫调节障碍 | 多参数流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 临床样本数据、单细胞转录组数据 | 1例儿科患者 |
| 169 | 2025-05-13 |
MultiOmics analysis of metabolic dysregulation and immune features in breast cancer
2025-Apr-16, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114376
PMID:40054322
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研究论文 | 通过多组学分析乳腺癌中的代谢失调和免疫特征，构建代谢风险模型以预测患者预后 | 首次全面整合代谢和免疫因素，构建基于代谢相关特征基因的乳腺癌预后预测模型 | 样本量相对较小（247例），且仅基于TCGA和GEO数据库的回顾性数据 | 评估代谢和免疫因素在乳腺癌预后预测中的作用 | 乳腺癌患者 | 多组学分析 | 乳腺癌 | GSVA、单细胞测序分析、机器学习算法 | 代谢风险模型 | 基因表达数据、临床病理数据 | 247例乳腺癌样本（来自TCGA和GEO数据库） |
| 170 | 2025-05-13 |
How fish intestinal cells responded to dietary methylmercury exposure? A single-cell transcriptomic analysis
2025-Apr-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2025.125967
PMID:40043872
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research paper | 通过单细胞转录组分析研究鱼类肠道细胞对膳食甲基汞暴露的响应 | 首次在单细胞水平上揭示了不同肠道细胞群体对甲基汞的异质性响应 | 研究仅针对gilthead seabream，结果可能不适用于其他鱼类 | 探究鱼类肠道细胞对甲基汞暴露的特定响应机制 | gilthead seabream的肠道细胞 | 单细胞转录组学 | 重金属中毒 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 171 | 2025-05-13 |
TransST: Transfer Learning Embedded Spatial Factor Modeling of Spatial Transcriptomics Data
2025-Apr-15, ArXiv
PMID:40321945
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research paper | 提出了一种名为TransST的新型迁移学习框架，用于从空间转录组学数据中推断细胞水平的异质性 | TransST通过自适应地利用外部来源的细胞标记信息，提高了从空间转录组学数据中提取真实生物信号的可靠性 | 技术限制包括相对较低的分辨率和测序深度不足 | 提高空间转录组学数据分析的准确性和可靠性 | 空间转录组学数据 | 生物医学研究 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 迁移学习框架TransST | 空间转录组学数据 | 多个真实研究和模拟设置 |
| 172 | 2025-05-13 |
Paradoxical Effect of Myosteatosis on the Immune Checkpoint Inhibitor Response in Metastatic Renal Cell Carcinoma
2025-Apr, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.13758
PMID:40052383
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research paper | 该研究探讨了在转移性肾细胞癌（mRCC）患者中，治疗前低骨骼肌质量（LSMM）和肌脂肪变性对一线免疫检查点抑制剂（ICI）治疗预后的影响 | 首次揭示了肌脂肪变性在PD-1抑制剂联合CTLA-4抑制剂治疗组和PD-1抑制剂联合TKI治疗组中对预后的相反影响，并结合单细胞RNA测序分析了免疫微环境差异 | 样本量较小（90例患者），且为回顾性研究 | 评估LSMM和肌脂肪变性对mRCC患者ICI治疗预后的影响 | 90例接受一线ICI治疗的转移性肾细胞癌患者 | 肿瘤免疫治疗 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据和单细胞RNA测序数据 | 90例mRCC患者（26.7%女性，中位年龄60.5岁） |
| 173 | 2025-05-13 |
A key role of PIEZO2 mechanosensitive ion channel in adipose sensory innervation
2025-Apr-01, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2025.02.004
PMID:40054462
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research paper | 该研究揭示了PIEZO2机械敏感离子通道在脂肪感觉神经支配中的关键作用 | 首次发现PIEZO2在脂肪神经支配的背根神经节神经元中作为主要机械感受器，并揭示了其在脂肪组织感觉调控中的重要作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类组织中验证 | 探索脂肪组织中感觉传入神经的分子机制 | 脂肪组织的感觉神经支配 | 神经生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 174 | 2025-05-13 |
Single-Cell Proteomic Characterization of Drug-Resistant Prostate Cancer Cells Reveals Molecular Signatures Associated with Morphological Changes
2025-Apr, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2025.100949
PMID:40090465
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研究论文 | 本研究通过单细胞蛋白质组学技术揭示了耐药前列腺癌细胞的蛋白质组特征及其与形态变化的关联 | 采用优化的高通量数据非依赖采集（DIA）方法进行单细胞蛋白质组分析，平均每个细胞鉴定超过1300种蛋白质，并发现了与细胞大小变化相关的蛋白质亚群 | NA | 探索前列腺癌耐药细胞的蛋白质组特征及其在治疗抵抗和癌症进展中的作用 | 耐药前列腺癌细胞（DRCs）和亲本PC3细胞 | 蛋白质组学 | 前列腺癌 | 单细胞蛋白质组学（SCP）、数据非依赖采集（DIA）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 蛋白质组数据、RNA测序数据 | NA |
| 175 | 2025-05-13 |
Deciphering the role of pyroptosis-related genes and natural killer T cells in sepsis pathogenesis: a comprehensive bioinformatics and Mendelian randomization analysis
2025-Apr, Journal of physiology and pharmacology : an official journal of the Polish Physiological Society
IF:2.0Q3
DOI:10.26402/jpp.2025.2.10
PMID:40350654
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research paper | 该研究通过生物信息学和孟德尔随机化分析，探讨了焦亡相关基因和自然杀伤T细胞在脓毒症发病机制中的作用 | 首次综合分析了焦亡相关基因和自然杀伤T细胞在脓毒症中的角色，并发现了多个潜在的诊断生物标志物 | 研究主要基于公开数据库数据，缺乏实验验证 | 阐明焦亡相关基因和自然杀伤T细胞在脓毒症发病机制中的作用 | 脓毒症患者样本和健康对照样本 | 生物信息学 | 脓毒症 | WGCNA, ssGSEA, scRNA-seq, 孟德尔随机化分析 | 机器学习方法 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集（GSE57065, GSE95233, GSE65682, GSE167363） |
| 176 | 2025-05-12 |
Mycoplasma ovipnuemoniae impairs the immune response of sheep and suppresses neutrophil function by inhibiting S100A9
2025-Apr, Veterinary microbiology
IF:2.4Q1
DOI:10.1016/j.vetmic.2025.110446
PMID:40022823
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研究论文 | 研究羊支原体肺炎如何通过抑制S100A9损害绵羊的免疫反应和中性粒细胞功能 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统分析了羊肺组织中11种细胞类型的转录组变化，并构建了细胞间通讯模型和关键调控基因的差异表达图谱 | 研究主要基于体外实验，体内验证不足 | 探究羊支原体肺炎对宿主肺部的损害机制 | 绵羊及其肺组织细胞 | 免疫学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA-seq数据 | 感染28天的绵羊肺组织样本 |
| 177 | 2025-05-11 |
Novel biomarkers related to mitochondrial permeability transition driven-necrosis in hypertrophic cardiomyopathy
2025-Apr-28, Journal of cardiology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.jjcc.2025.04.008
PMID:40306461
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研究论文 | 本研究结合转录组学和孟德尔随机化分析，探索线粒体通透性转换驱动的坏死相关基因（MPTDN-RGs）与肥厚型心肌病（HCM）的关联 | 首次通过结合转录组学和孟德尔随机化分析，识别出与HCM中MPTDN相关的新基因ITGB2和STAT3 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能受限于样本量和数据质量 | 探索MPTDN-RGs在HCM中的作用及其潜在治疗靶点 | 肥厚型心肌病（HCM）患者及相关基因 | 生物信息学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, mRNA-seq, 孟德尔随机化分析 | NA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个数据集（GSE36961、GSE141910、GSE174691） |
| 178 | 2025-05-11 |
A humanized mouse model system mimics prenatal Zika infection and reveals premature differentiation of neural stem cells
2025-Apr-16, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6033583/v1
PMID:40321761
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研究论文 | 开发了一种人源化小鼠模型系统，模拟产前寨卡病毒感染并揭示神经干细胞的过早分化 | 首次开发了一种人源化、免疫活性小鼠模型系统，能够模拟从轻度到重度的产前寨卡病毒感染引起的脑损伤 | 模型系统虽然模拟了人类表型谱，但仍需进一步验证其临床转化潜力 | 建立一个可靠且具有临床转化潜力的实验系统，模拟人类产前寨卡病毒感染 | 人源化小鼠模型和寨卡病毒感染后的脑损伤 | 传染病模型 | 寨卡病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 人源化小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 179 | 2025-05-11 |
CD177+ neutrophils exacerbate septic lung injury via the NETs/AIM2 pathway: An experimental and bioinformatics study
2025-Apr-04, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114292
PMID:40007380
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研究论文 | 本研究通过实验和生物信息学方法，探讨了CD177+中性粒细胞通过NETs/AIM2途径加剧脓毒症肺损伤的机制 | 首次揭示了CD177+中性粒细胞在脓毒症肺损伤中的主导作用及其通过NETs/AIM2途径的机制，并发现褪黑激素的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用的转化需要进一步验证 | 阐明脓毒症诱导的急性肺损伤的免疫细胞异质性和关键机制 | 脓毒症诱导的急性肺损伤小鼠模型 | 免疫学与分子生物学 | 脓毒症与急性肺损伤 | 单细胞测序与分子生物学实验方法 | Cecal Ligation and Puncture (CLP)小鼠模型 | 基因表达数据与实验数据 | 未明确提及样本数量，但使用了CLP小鼠模型 |
| 180 | 2025-05-11 |
Interferon-responsive intestinal BEST4/CA7+ cells are targets of bacterial diarrheal toxins
2025-Apr-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.02.003
PMID:40010349
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研究论文 | 该研究通过建立人类肠道类器官中BEST4/CA7细胞的培养协议，揭示了这些细胞在电解质平衡和免疫反应中的作用，特别是在细菌感染引起的腹泻中的关键功能 | 首次在人类肠道类器官中培养出BEST4/CA7细胞，并揭示了其在细菌毒素引起的腹泻中的CFTR介导的液体分泌机制 | 由于BEST4/CA7细胞在小鼠中不存在，且缺乏人类体外模型，研究受到一定限制 | 探索BEST4/CA7细胞在电解质平衡和免疫反应中的功能 | 人类肠道中的BEST4/CA7细胞 | 细胞生物学 | 腹泻 | 单细胞RNA测序 | 人类肠道类器官 | NA | NA |