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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-10-06 |
Suppression of NOX2-Derived Reactive Oxygen Species (ROS) Reduces Epithelial-to-MesEnchymal Transition Through Blocking SiO2-Regulated JNK Activation
2025-Apr-30, Toxics
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxics13050365
PMID:40423444
|
研究论文 | 本研究揭示了二氧化硅暴露通过NOX2-ROS-JNK信号通路正反馈循环促进肺上皮细胞上皮-间质转化的分子机制 | 首次发现JNK与NOX2信号通路在二氧化硅诱导的肺纤维化中存在正反馈循环关系 | 研究主要基于细胞和动物模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探究二氧化硅诱导肺纤维化中NOX2与JNK信号通路的相互作用机制 | 人类上皮细胞和矽肺诱导小鼠 | 分子生物学 | 矽肺 | 单细胞测序,体内实验 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 142 | 2025-10-06 |
Integrating Dynamical Systems Modeling with Spatiotemporal scRNA-Seq Data Analysis
2025-Apr-22, Entropy (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/e27050453
PMID:40422408
|
综述 | 探讨如何整合动力系统建模与时空单细胞RNA测序数据分析来研究细胞动态行为 | 将马尔可夫链、随机微分方程和生成模型等计算框架与时空单细胞RNA测序技术相结合,从系统视角重建动态细胞轨迹和命运决定 | NA | 通过整合计算模型与时空单细胞技术来理解生物系统的动态特性 | 细胞行为、发育过程和疾病进展 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 时间序列空间转录组学 | 马尔可夫链, 随机微分方程, 最优传输, 薛定谔桥 | 基因表达数据, 时空数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 143 | 2025-10-06 |
SMAD4 and KRAS Status Shapes Cancer Cell-Stromal Cross-Talk and Therapeutic Response in Pancreatic Cancer
2025-Apr-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2330
PMID:39841099
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析SMAD4和KRAS基因状态对胰腺癌肿瘤微环境及治疗反应的影响 | 首次系统比较KrasG12D和KrasG12V突变背景下SMAD4缺失对胰腺癌基质组成和JAK/STAT信号通路的差异化影响 | 研究基于Trp53突变小鼠模型,结果在人类胰腺癌中的直接适用性需要进一步验证 | 阐明恶性细胞基因型如何通过细胞-基质相互作用影响胰腺癌治疗反应 | Trp53突变的胰腺导管腺癌小鼠模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 144 | 2025-10-06 |
Lineage Tracing and Single-Cell RNA Sequencing Reveal a Common Transcriptional State in Breast Cancer Tumor-Initiating Cells Characterized by IFN/STAT1 Activity
2025-Apr-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-4022
PMID:40230213
|
研究论文 | 本研究通过谱系追踪和单细胞RNA测序技术,揭示了乳腺癌肿瘤起始细胞中IFN/STAT1信号通路活化的共同转录状态 | 开发了STAT响应性谱系追踪系统,首次在单细胞水平发现TICs中普遍存在IFN/STAT1相关转录状态,并鉴定出骨髓基质细胞抗原-2作为该状态的表面标志物 | STAT信号检测方法仅适用于部分基底样三阴性乳腺癌异种移植模型,无法在所有模型中有效检测TICs | 探索乳腺癌肿瘤起始细胞的分子表型特征和选择性靶向策略 | 三阴性乳腺癌肿瘤起始细胞、异种移植模型和临床样本 | 单细胞转录组学 | 乳腺癌 | 谱系追踪、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个基底样三阴性乳腺癌异种移植模型和临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 145 | 2025-10-06 |
Induction of macrophage efferocytosis in pancreatic cancer via PI3Kγ inhibition and radiotherapy promotes tumour control
2025-Apr-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333492
PMID:39788719
|
研究论文 | 本研究探讨了PI3Kγ抑制剂与放疗联合治疗胰腺癌的免疫调节机制 | 首次发现PI3Kγ抑制与放疗联合可促进巨噬细胞胞葬作用,使其从免疫耐受转变为抗原呈递状态 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探索改善胰腺导管腺癌免疫治疗效果的联合策略 | 胰腺癌小鼠模型(LSL-KrasG12D/+;Trp53R172H/+;Pdx1-Cre) | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 流式细胞术,多重免疫组化,RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据,影像数据 | NA | NA | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 146 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics of the aging mouse brain reveals origins of inflammation in the white matter
2025-Apr-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58466-2
PMID:40185750
|
研究论文 | 通过空间转录组学分析年轻、中年和老年小鼠大脑,揭示白质纤维束是大脑衰老过程中炎症反应的核心区域 | 首次系统性地在自然衰老过程中对三个年龄段和两种性别的小鼠大脑进行空间转录组学分析,识别出白质纤维束是年龄相关炎症变化最显著的区域 | 研究仅限于小鼠模型,需要在人类样本中进一步验证 | 系统理解年龄诱导的大脑分子变化 | 年轻、中年和老年小鼠的大脑组织 | 空间转录组学 | 老年疾病 | 空间转录组学,免疫荧光,定量MRI,计算机模拟分析 | NA | 空间转录组数据,图像数据,MRI数据 | 三个年龄段(年轻、中年、老年)和两种性别的小鼠大脑样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 147 | 2025-10-06 |
An integrated machine learning model of transcriptomic genes in multi-center chronic obstructive pulmonary disease reveals the causal role of TIMP4 in airway epithelial cell
2025-Apr-23, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03238-1
PMID:40269868
|
研究论文 | 本研究通过整合多中心COPD转录组数据,开发了13基因模型并鉴定TIMP4为关键致病基因 | 首次通过多中心数据整合和机器学习方法识别出与COPD发病机制相关的核心基因集,并验证TIMP4在纤毛细胞中的致病作用 | 研究样本来源仅限于两个中心,功能验证仍处于初步阶段 | 识别COPD发病机制中独立于患者变异性的核心基因集 | COPD患者肺组织样本和原代人气道上皮细胞 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | 加权基因共表达网络分析,机器学习,孟德尔随机化,单细胞测序 | 基因表达模型 | 转录组测序数据 | 来自两个中心的COPD患者肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 148 | 2025-10-06 |
A spatiotemporal cell atlas of cardiopulmonary progenitor cell allocation during development
2025-Apr-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115513
PMID:40178979
|
研究论文 | 本研究通过构建心肺祖细胞发育的时空细胞图谱,揭示了心肺共同发育的细胞谱系分配机制 | 首次创建了心肺祖细胞来源的细胞图谱,发现了先前未被充分认识的心肺祖细胞衍生谱系 | 研究主要基于小鼠胚胎发育模型,人类发育过程的直接适用性需要进一步验证 | 阐明心肺祖细胞在发育过程中的分配机制和分子调控网络 | 小鼠胚胎期心肺祖细胞及其发育后代 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,谱系追踪,空间定位,计算细胞轨迹分析 | 计算分析模型 | 单细胞转录组数据,空间定位数据 | E8.5时期Wnt2心肺祖细胞及其发育过程中的后代细胞 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 149 | 2025-10-06 |
[Public Database-based Study to Explore the Expression and Role of DDB1
in Lung Adenocarcinoma]
2025-Apr-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
|
研究论文 | 本研究基于公共数据库探讨DDB1在肺腺癌中的表达及其作用 | 首次系统分析DDB1在肺腺癌中的表达特征、预后价值及其与免疫细胞浸润的关系 | 研究主要依赖公共数据库数据,需要进一步实验验证机制 | 探究DDB1在肺腺癌中的表达特征、临床意义及生物学功能 | 肺腺癌组织和细胞 | 生物信息学 | 肺癌 | 生物信息学分析,单细胞测序,组织芯片 | NA | 基因表达数据,临床病理数据,单细胞测序数据 | 公共数据库中的肺腺癌样本和组织芯片样本 | NA | 单细胞RNA-seq,组织芯片 | NA | NA |
| 150 | 2025-10-06 |
HMOX1-LDHB interaction promotes ferroptosis by inducing mitochondrial dysfunction in foamy macrophages during advanced atherosclerosis
2025-04-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.12.011
PMID:39731912
|
研究论文 | 本研究揭示了HMOX1-LDHB相互作用通过诱导线粒体功能障碍促进晚期动脉粥样硬化中泡沫巨噬细胞铁死亡的新机制 | 首次发现HMOX1-LDHB相互作用通过LONP1介导的TFAM降解导致线粒体功能障碍,从而促进泡沫巨噬细胞铁死亡 | NA | 阐明晚期动脉粥样硬化中泡沫巨噬细胞死亡的分子机制 | 动脉粥样硬化中的泡沫巨噬细胞,特别是TREM2低表达的泡沫巨噬细胞亚群 | 分子生物学 | 心血管疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 151 | 2025-10-06 |
An integrated analysis of scRNA-seq and RNA-seq data revealed metastasis-related regulators as prognostic indicators in lung adenocarcinoma
2025-Apr-30, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-2025-482
PMID:40400936
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,开发了肺腺癌预后预测模型 | 首次结合单细胞和批量RNA测序数据识别转移相关调控因子作为肺腺癌预后指标 | NA | 开发预测肺腺癌患者预后的列线图模型 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 加权基因共表达网络分析 | 预后模型, 列线图 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 152 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis and machine learning-based integration develop an immune-responsive signature of antigen-presenting cancer-associated fibroblasts in lung adenocarcinoma
2025-Apr-30, Journal of thoracic disease
IF:2.1Q3
DOI:10.21037/jtd-2024-2015
PMID:40400942
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析和机器学习整合开发了肺腺癌中抗原呈递癌症相关成纤维细胞的免疫反应特征 | 发现具有巨噬细胞样特征的新型抗原呈递CAF亚群,该亚群与免疫检查点抑制剂良好反应相关 | apCAF丰度在个体间存在差异,样本量可能有限 | 识别与肺腺癌免疫检查点抑制剂疗效相关的CAF亚群 | 肺腺癌样本中的癌症相关成纤维细胞 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | 机器学习 | RNA测序数据 | 多个数据集的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 153 | 2025-10-06 |
Unlocking plant regeneration: The role for glutathione
2025-04-21, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.03.012
PMID:40262524
|
研究论文 | 本研究揭示了谷胱甘肽在植物再生过程中的关键作用机制 | 首次发现组织损伤释放的谷胱甘肽通过加速细胞周期G1期进程促进植物器官再生 | NA | 探究谷胱甘肽在植物再生过程中的分子机制 | 植物再生过程 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,活体成像 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 154 | 2025-10-06 |
Lipoxin A4/FPR2 Signaling Mitigates Ferroptosis of Alveolar Epithelial Cells via NRF2-Dependent Pathway During Lung Ischemia-Reperfusion Injury
2025-Apr-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202401475R
PMID:40270323
|
研究论文 | 本研究探讨脂氧素A4通过FPR2受体激活NRF2通路抑制肺泡上皮细胞铁死亡,从而减轻肺缺血再灌注损伤的机制 | 首次揭示脂氧素A4/FPR2信号通路通过NRF2依赖性途径调控肺泡上皮细胞铁死亡在肺缺血再灌注损伤中的保护作用 | 研究主要基于小鼠模型,在人体中的直接验证尚需进一步研究 | 探究铁死亡在肺缺血再灌注损伤中的作用及脂氧素A4的保护机制 | 肺移植患者样本、C57BL/6野生型小鼠、Fpr2和Nrf2基因敲除小鼠、肺泡II型上皮细胞 | 生物医学研究 | 肺缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序、小鼠肺门结扎模型、小鼠原位肺移植模型、体外细胞实验 | 基因敲除动物模型、细胞模型 | 基因表达数据、生理指标数据、生化指标数据 | 未明确样本数量,包含患者组织样本、多种基因型小鼠和细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 155 | 2025-10-06 |
Vagal Sensory Gut-Brain Pathways That Control Eating-Satiety and Beyond
2025-Apr, Comprehensive Physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1002/cph4.70010
PMID:40229922
|
综述 | 本文挑战了迷走神经仅传递饱腹信号的传统观点,系统阐述了迷走神经作为整合餐食信息的复杂感觉系统 | 揭示了迷走神经传入神经元具有专门亚群和多样感觉模式,能够主动编码餐食相关信息的多个方面 | 作为综述文章,未进行原始实验研究,主要基于现有文献整合分析 | 探讨迷走神经感觉通路在肠脑通讯中的多重功能 | 迷走神经传入神经元及其下游脑回路 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学、神经回路映射、功能成像 | NA | 文献证据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 156 | 2025-10-06 |
Single-cell omics technologies - Fundamentals on how to create single-cell looking glasses for reproductive health
2025-Apr, American journal of obstetrics and gynecology
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.ajog.2024.08.041
PMID:40253074
|
综述 | 本文综述单细胞组学技术在生殖健康研究中的应用进展 | 系统整合单细胞测序、空间转录组学和高维蛋白质组成像等多种技术,为生殖医学提供多维视角 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于文献综述 | 探讨单细胞技术在生殖健康领域的临床应用前景 | 生殖道组织、胎儿发育、妊娠过程和妇科疾病 | 单细胞组学 | 妇科疾病、妊娠并发症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组成像 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 157 | 2025-10-06 |
Identification of druggable genetic targets for prostate cancer risk based on mendelian randomization and single-cell RNA sequencing
2025-Apr-30, International urology and nephrology
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s11255-025-04525-y
PMID:40304996
|
研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、共定位分析和单细胞RNA测序技术,识别与前列腺癌风险相关的可成药遗传靶点 | 首次将孟德尔随机化、共定位分析和单细胞RNA测序技术相结合,系统性地识别前列腺癌的可成药遗传靶点 | 部分基因(如BAK1)可能伴随副作用,需要进一步验证 | 识别与前列腺癌风险相关的可成药遗传靶点,为靶向治疗提供新方向 | 前列腺癌相关遗传靶点和肿瘤细胞类型 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 孟德尔随机化分析, 共定位分析, 单细胞RNA测序, 全表型关联研究 | NA | 基因组数据, 单细胞表达数据 | 2608个可成药基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 158 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing for characterizing the immune communication and iron metabolism roles in CD31+ glioma cells
2025-Apr-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-377
PMID:40386270
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究CD31+胶质瘤细胞在免疫通讯和铁代谢中的作用 | 首次在胶质瘤微环境中系统分析CD31+免疫细胞的细胞通讯网络和铁代谢功能,发现铁蛋白在免疫调节中的潜在作用 | 研究局限于CD31+细胞亚群,未涵盖胶质瘤微环境中所有细胞类型 | 阐明CD31+免疫细胞在胶质瘤进展中的作用机制 | 胶质瘤微环境中的CD31+免疫细胞(巨噬细胞和T细胞) | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | CellChat, Monocle3 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 159 | 2025-10-06 |
scRNA-seq reveals chemotherapy-induced tumor microenvironment changes in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Apr-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-2025-103
PMID:40386264
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析化疗诱导的胰腺导管腺癌肿瘤微环境变化 | 发现LYZ在化疗后肿瘤细胞中显著增加,揭示化疗改变抗原呈递机制和PVR信号通路从T细胞向髓系细胞转移 | 使用公开可用数据,缺乏实验验证 | 研究化疗诱导的肿瘤微环境变化并优化胰腺癌免疫治疗反应 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本(接受或未接受标准化疗) | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 160 | 2025-10-06 |
Single cell sequencing technology reveals the correlation between B lymphocytes and vascular inflammatory symptoms of Kawasaki disease
2025-Apr-30, Translational pediatrics
IF:1.5Q2
DOI:10.21037/tp-2025-19
PMID:40386362
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了川崎病血管炎症症状与B淋巴细胞的相关性 | 首次通过单细胞测序技术系统分析川崎病不同血管炎症阶段的免疫细胞变化,发现CD19+B细胞与疾病进程的关联 | 样本量相对有限,单细胞测序仅包含10例样本 | 探索川崎病早期血管炎症症状中的免疫细胞活化,寻找潜在诊断标志物并指导IVIG治疗时机 | 川崎病患儿和对照组儿童 | 单细胞组学 | 川崎病 | 单细胞测序,流式细胞术,定量PCR | NA | 单细胞RNA测序数据,流式细胞数据,基因表达数据 | 单细胞测序10例(7例KD+3对照),验证队列277例(95例KD+12健康儿童+170例发热儿童) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞测序平台 |