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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-10-22 |
Astragalus polysaccharide reduces the severity of acute pancreatitis under a high-fat diet through enriching L. reuteri and propionate
2025-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140021
PMID:39837455
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研究论文 | 本研究探讨黄芪多糖通过富集罗伊氏乳杆菌和丙酸盐减轻高脂饮食下急性胰腺炎严重程度的机制 | 首次揭示黄芪多糖通过调节肠道菌群-胰腺轴缓解急性胰腺炎的具体机制,发现罗伊氏乳杆菌和丙酸盐的协同保护作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 研究黄芪多糖对高脂饮食诱导的急性胰腺炎的保护作用及其机制 | 高脂饮食诱导的急性胰腺炎小鼠模型 | 生物医学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 122 | 2025-10-19 |
Semaphorin 6A phase separation sustains a histone lactylation-dependent lactate buildup in pathological angiogenesis
2025-Apr-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2423677122
PMID:40244673
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研究论文 | 本研究揭示了SEMA6A通过相分离机制维持组蛋白乳酸化修饰,促进病理性血管生成的新机制 | 首次发现SEMA6A的C端无序区域通过液-液相分离形成凝聚体,招募RHOA和P300促进组蛋白乳酸化循环 | 研究主要聚焦于视网膜病变模型,在其他血管疾病中的普适性需要进一步验证 | 探索病理性血管生成中组蛋白乳酸化修饰的调控机制 | 视网膜内皮细胞和氧诱导视网膜病变模型 | 表观遗传学 | 视网膜缺血性疾病 | CUT&Tag, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组学数据,表观遗传学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 123 | 2025-10-19 |
St3gal5-mediated sialylation of glyco-CD177 on neutrophils restricts neuroinflammation following CNS injury
2025-Apr-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2426187122
PMID:40244680
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研究论文 | 本研究揭示了St3gal5介导的中性粒细胞CD177糖基化在限制中枢神经系统损伤后神经炎症中的关键作用 | 首次发现CD177中性粒细胞作为抗炎亚群通过St3gal5介导的唾液酸化调控神经炎症,并提出FDA批准的丙戊酸可作为靶向中性粒细胞糖生物学的治疗策略 | CD177糖生物学在神经炎症中的具体分子机制仍需进一步阐明 | 探究中性粒细胞CD177糖基化在中枢神经系统损伤后神经炎症中的调控作用 | 人类和小鼠的中性粒细胞 | 免疫学 | 中枢神经系统损伤 | 单细胞RNA测序,糖蛋白组学,遗传学方法 | NA | 基因表达数据,蛋白质组学数据 | 人类和小鼠的中性粒细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 124 | 2025-10-17 |
Single-Cell Analyses Reveal a Functionally Heterogeneous Exhausted CD8+ T-cell Subpopulation That Is Correlated with Response to Checkpoint Therapy in Melanoma
2025-Apr-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3918
PMID:40042995
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研究论文 | 通过单细胞分析发现与黑色素瘤检查点治疗反应相关的功能异质性耗竭CD8+ T细胞亚群 | 识别出PD-1和CTLA4共表达(CPHi)的CD8+ TIL亚群与治疗反应相关,并揭示该亚群的功能异质性 | 研究主要关注晚期黑色素瘤患者,结果在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 寻找能够预测免疫检查点抑制剂治疗反应的生物标志物 | 晚期黑色素瘤患者的CD8+肿瘤浸润淋巴细胞(TIL) | 免疫肿瘤学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 125 | 2025-10-16 |
Single-cell and spatial detection of senescent cells using DeepScence
2025-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.21.568150
PMID:38045252
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研究论文 | 开发基于深度神经网络的DeepScence方法,用于在单细胞和空间转录组数据中检测衰老细胞 | 提出了CoreScence衰老相关基因集,并开发了DeepScence深度学习方法,在多种数据平台上均能准确识别衰老细胞 | NA | 开发准确识别衰老细胞的方法,研究其空间和分子特征 | 衰老细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 深度神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 126 | 2025-10-05 |
Comparison of Lean, Obese, and Weight-Loss Models Reveals TREM2 Deficiency Attenuates Breast Cancer Growth Uniquely in Lean Mice and Alters Clonal T-cell Populations
2025-Apr-03, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-3511
PMID:39841585
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研究论文 | 本研究通过比较瘦型、肥胖型和减重后小鼠模型,揭示TREM2缺失在瘦型小鼠中独特抑制乳腺癌生长并改变克隆性T细胞群体 | 首次证明体重历史条件影响TREM2抑制在乳腺癌中的疗效,并发现瘦型TREM2缺陷小鼠中CD8+ T细胞从耗竭状态向效应记忆状态的转变 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类临床环境中验证 | 探讨肥胖与乳腺癌关联的机制及减重潜在益处,评估TREM2缺失对不同体重状态下绝经后乳腺癌的影响 | 绝经后乳腺癌小鼠模型(瘦型、肥胖型、减重后) | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 可变-多样-连接区测序(VDJ测序) | 小鼠模型 | 基因表达数据, T细胞受体序列数据 | 多种体重状态的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 127 | 2025-10-05 |
Endogenous CD4+ T Cells That Recognize ALK and the NPM1::ALK Fusion Protein Can Be Expanded from Human Peripheral Blood
2025-Apr-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0445
PMID:39774774
|
研究论文 | 本研究从人类外周血中成功扩增出识别ALK和NPM1::ALK融合蛋白的内源性CD4+ T细胞 | 首次在人类外周血中发现ALK特异性CD4+ T细胞,并鉴定出NPM1::ALK融合新表位特异性T细胞受体 | 样本量较小(10名患者和6名健康供者),仅针对ALK阳性间变性大细胞淋巴瘤 | 探索ALK特异性CD4+ T细胞在癌症免疫治疗中的潜力 | ALK阳性间变性大细胞淋巴瘤患者和健康供者的外周血样本 | 免疫学 | 淋巴瘤 | TCRαβ单细胞测序,树突状细胞刺激,肽池筛选 | TCR报告细胞系(58α-β-) | 细胞免疫应答数据,TCR序列数据 | 10名ALK阳性淋巴瘤患者和6名健康供者 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 128 | 2025-10-05 |
Histology-Based Virtual RNA Inference Identifies Pathways Associated with Metastasis Risk in Colorectal Cancer
2025-Apr-23, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.04.22.25326170
PMID:40313260
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研究论文 | 本研究开发了一种基于组织学图像的虚拟RNA推断方法,用于识别结直肠癌转移风险相关的通路 | 首次实现了直接从H&E染色组织图像推断空间转录组水平的分子信息,无需实际进行空间转录组测序 | 某些肿瘤相关通路仅靠组织学无法完全捕获 | 开发从组织学图像推断RNA表达的方法,识别结直肠癌转移风险相关通路 | 结直肠癌患者组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 虚拟RNA推断,空间转录组学 | UNI, ResNet-50, ViT, VMamba | 组织图像,基因表达数据 | 45名患者,超过300,000个Visium点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 129 | 2025-10-05 |
Niche Macrophages Recycle Iron to Tumor Cells and Foster Erythroblast Mimicry to Promote Bone Metastasis and Anemia
2025-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.23.650120
PMID:41031013
|
研究论文 | 本研究揭示了骨髓转移微环境中巨噬细胞通过铁循环促进肿瘤生长和贫血的新机制 | 发现VCAM1+CD163+CCR3+巨噬细胞在骨转移微环境中被肿瘤细胞劫持用于铁获取,并首次报道肿瘤细胞通过模仿红系细胞产生血红蛋白的适应性机制 | 人类样本验证仍需进一步扩展,具体分子调控通路需要更深入研究 | 探究骨转移与贫血之间的机制联系及肿瘤微环境中细胞互作 | 骨髓转移微环境中的巨噬细胞、肿瘤细胞和红系细胞 | 单细胞生物学 | 乳腺癌骨转移 | 单细胞RNA测序, 微环境标记 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 130 | 2025-10-05 |
p63 co-opts the skin Krt8-to-Krt5 transition for enamel organ development
2025-Apr-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.11.637463
PMID:39990386
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了p63在釉质器官发育中调控Krt8向Krt5过渡的机制 | 首次发现p63在釉质器官发育中借用皮肤发育的Krt8-to-Krt5过渡机制 | 研究仅基于小鼠切牙模型,早期p63敲除小鼠的发育停滞限制了更全面功能研究 | 探究p63在釉质器官细胞分化中的具体作用机制 | 小鼠切牙釉质器官上皮细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 轨迹重建, 比较转录组分析, 染色质可及性分析 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 小鼠切牙样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 131 | 2025-10-05 |
3D spatial transcriptomics reveals the molecular structure of input and output pathways in the mouse olfactory bulb
2025-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.19.639192
PMID:40060607
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研究论文 | 利用3D空间转录组学技术重建小鼠嗅球的解剖和分子组织,揭示嗅觉通路的分子结构 | 首次使用3D空间转录组学技术绘制了嗅球的全面分子图谱,揭示了嗅球对称性组织的新原理 | 研究仅限于小鼠模型,未在其他物种中验证 | 研究脊椎动物大脑对称性组织的分子基础 | 小鼠嗅球组织 | 空间转录组学 | NA | 3D空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 近一千个分子特征不同的肾小球 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 132 | 2025-10-05 |
Machine learning integration of single-cell and bulk transcriptomics identifies fibroblast-driven prognostic markers in colorectal cancer
2025-Apr-22, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2025.12038
PMID:40266079
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组数据,识别结直肠癌中成纤维细胞驱动的预后标志物 | 首次通过机器学习整合单细胞和批量转录组数据,构建了七基因成纤维细胞相关预后特征 | 研究样本量相对有限,需要在更多独立队列中验证 | 开发结直肠癌的预后生物标志物和个性化治疗策略 | 结直肠癌肿瘤微环境中的成纤维细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 机器学习整合方法 | 基因表达数据 | 306个CRC样本(448,255个细胞),TCGA-COAD队列351例,GSE17536数据集177例 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 133 | 2025-10-05 |
Rare Subset of T Cells Form Heterotypic Clusters with Circulating Tumor Cells to Foster Cancer Metastasis
2025-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.01.646421
PMID:40236049
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研究论文 | 本研究揭示了一种罕见的CD4和CD8双阳性T细胞通过与循环肿瘤细胞形成异质性簇促进癌症转移的新机制 | 首次发现罕见的CD4/CD8双阳性T细胞在CTC-WBC簇中显著富集,并鉴定VLA4-VCAM1相互作用是簇形成的关键介质 | 研究主要基于晚期乳腺癌患者样本,需要验证是否适用于其他癌症类型和早期患者 | 探索外周血免疫细胞与循环肿瘤细胞的相互作用机制及其在癌症转移中的作用 | 晚期乳腺癌患者的血液样本和临床前小鼠模型 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 流式细胞术, ImageStream分析, 单细胞RNA测序, 基因扰动研究 | NA | 血液样本, 测序数据, 图像数据 | 1,529例乳腺癌患者血液标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 134 | 2025-10-05 |
High-resolution reconstruction of cell-type specific transcriptional regulatory processes from bulk sequencing samples
2025-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.02.646189
PMID:40291712
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研究论文 | 提出一种名为DeepDETAILS的新型深度学习框架,能够从批量测序样本中高分辨率重建细胞类型特异性转录调控过程 | 开发了基于深度学习的跨模态反卷积方法,可利用scATAC-seq参考库对其他批量组学数据集进行细胞类型特异性信号重建,达到碱基对精度 | 依赖于scATAC-seq参考数据的可用性和质量,未明确说明模型对数据稀缺情况的处理能力 | 实现从批量测序数据中高分辨率重建细胞类型特异性基因组信号 | 人类组织和细胞类型,包括39种不同人体组织和86种不同细胞类型 | 机器学习 | 原发性硬化性胆管炎 | 深度学习,单细胞ATAC测序,染色质免疫沉淀测序,新生转录测序 | 深度学习框架 | 基因组测序数据 | 39种人体组织和86种细胞类型 | NA | 单细胞ATAC-seq, ChIP-seq, PRO-cap, PRO-seq | NA | NA |
| 135 | 2025-10-05 |
Inhibition of bone morphogenetic protein 4 alleviates angiotensin II-induced abdominal aortic aneurysm by reducing inflammation and endothelial-mesenchymal transition
2025-04, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示BMP4在血管紧张素II诱导的腹主动脉瘤中通过调节内皮-间质转化和炎症促进疾病进展的机制 | 首次发现BMP4在腹主动脉瘤进展中的关键作用,并阐明其通过BGN结合和PI3K/AKT/mTOR通路诱导内皮细胞表型转换的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究腹主动脉瘤的发病机制及BMP4在其中的作用 | 血管紧张素II诱导的腹主动脉瘤小鼠模型和鼠主动脉内皮细胞 | 单细胞测序分析 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序, 伪时间轨迹分析, 蛋白质-蛋白质相互作用分析, 共免疫沉淀 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞测序分析 |
| 136 | 2025-10-05 |
Stem Cell Markers LGR5, LGR4 and Their Immediate Signalling Partners are Dysregulated in Preeclampsia
2025-Apr, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-024-10831-2
PMID:39688759
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研究论文 | 本研究首次描述了LGR5和LGR4及其信号伴侣在人类胎盘中的表达特征,并发现它们在子痫前期胎盘中的失调现象 | 首次在人类胎盘中表征LGR5/LGR4及其配体/靶点,发现这些干细胞标志物在子痫前期和胎儿生长受限胎盘中的表达失调 | 缺氧/促炎细胞因子处理未能显著改变LGR5/LGR4表达,暗示可能存在其他调控机制 | 研究LGR5/LGR4及其信号伴侣在人类胎盘中的表达特征及其在子痫前期和胎儿生长受限中的失调机制 | 人类胎盘组织、滋养层干细胞、不同妊娠期胎盘样本 | 生殖医学 | 子痫前期、胎儿生长受限 | 原位杂交、单细胞转录组测序、单核RNA测序、转录组分析 | NA | RNA测序数据、基因表达数据 | 早孕期胎盘11例、早产胎盘9例、足月胎盘11例、早发性子痫前期81例、晚发性子痫前期20例、胎儿生长受限34例及相应对照组 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA |
| 137 | 2025-10-05 |
Plasma exosomes from individuals with type 2 diabetes drive breast cancer aggression in patient-derived organoids
2025-Apr-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.13.612950
PMID:39345362
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研究论文 | 本研究通过患者来源类器官模型揭示2型糖尿病血浆外泌体通过改变肿瘤微环境促进乳腺癌侵袭性的新机制 | 首次开发了保留天然肿瘤浸润淋巴细胞的乳腺癌患者来源类器官模型,并发现2型糖尿病外泌体通过扩增免疫抑制性T细胞和增强肿瘤异质性驱动癌症进展 | 研究样本量有限,外泌体作用的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究2型糖尿病血浆外泌体对乳腺癌肿瘤微环境免疫细胞功能的影响 | 乳腺癌患者来源类器官和血浆外泌体 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 患者来源类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 138 | 2025-10-05 |
Polymorphic tandem repeats influence cell type-specific gene expression across the human immune landscape
2025-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.02.621562
PMID:40291654
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研究论文 | 本研究通过全基因组和单细胞RNA测序分析串联重复序列对免疫细胞类型特异性基因表达的影响 | 首次在单细胞水平系统分析串联重复序列对免疫细胞类型特异性基因表达的调控作用,发现超过62,000个单细胞表达数量性状串联重复位点 | 研究主要基于血液来源细胞,可能不适用于其他组织类型;串联重复序列的准确识别仍存在技术挑战 | 探索串联重复序列变异对免疫细胞类型特异性基因表达的调控机制 | 1,925名个体的血液来源细胞,涵盖28种不同的免疫细胞类型 | 基因组学 | 免疫介导性疾病,血液系统疾病 | 全基因组测序,单细胞RNA测序 | 数量性状位点分析,精细定位 | 基因组序列数据,单细胞基因表达数据 | 超过540万个血液来源细胞,来自1,925名个体 | NA | 单细胞RNA-seq,全基因组测序 | NA | NA |
| 139 | 2025-10-06 |
Prunella vulgaris: A potential molecule for the treatment of hepatocellular carcinoma
2025-Apr-25, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000042267
PMID:40295240
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研究论文 | 本研究系统评估了夏枯草治疗肝细胞癌的潜力并探索其分子机制 | 首次通过系统药理学方法识别夏枯草治疗肝细胞癌的关键靶点,并揭示其通过p53信号通路和免疫细胞调节的分子机制 | 研究主要基于计算预测和体外实验,缺乏体内实验验证和临床数据支持 | 探索夏枯草治疗肝细胞癌的分子机制和潜在生物标志物 | 夏枯草活性成分及其在肝细胞癌中的分子靶点 | 系统药理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,分子对接,体外实验 | NA | 基因表达数据,化合物靶点数据 | 185个药物靶点和635个HCC相关靶点 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 140 | 2025-10-06 |
Skin organoid transplantation promotes tissue repair with scarless in frostbite
2025-Apr-18, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwae055
PMID:39363875
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研究论文 | 本研究通过构建皮肤类器官移植系统,探索其在冻伤修复中促进无疤痕愈合的作用机制 | 首次将hiPSC来源的皮肤类器官与明胶水凝胶结合用于冻伤治疗,并发现其通过调控整合素α5β1-FAK通路减少成纤维细胞向肌成纤维细胞转化 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人体进行验证 | 开发促进冻伤无疤痕愈合的新型治疗方法 | 冻伤小鼠模型、人类诱导多能干细胞来源的皮肤类器官 | 组织工程 | 冻伤 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |