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当前共找到 733 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-10-06 |
SORBET: Automated cell-neighborhood analysis of spatial transcriptomics or proteomics for interpretable sample classification via GNN
2025-Apr-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.30.573739
PMID:38260586
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研究论文 | 提出一种名为SORBET的几何深度学习框架，用于分析空间转录组学和蛋白质组学数据以实现可解释的样本分类 | 首个在空间转录组学数据上进行表型预测的方法，采用图卷积网络直接分析完整空间剖面数据，无需将细胞特征压缩为有限注释 | NA | 通过整合空间信息和多重分子数据来准确预测表型，特别是在临床环境中 | 转移性黑色素瘤、非小细胞肺癌和结直肠癌样本 | 空间组学 | 黑色素瘤,非小细胞肺癌,结直肠癌 | 空间转录组学,空间蛋白质组学 | 图卷积网络(GCN) | 空间分子数据 | NA | Nanostring, Fluidigm, Akoya Biosciences | 空间转录组学,空间蛋白质组学 | CosMx, Imaging Mass Cytometry(IMC), CODEX | CosMx空间转录组学平台, Imaging Mass Cytometry技术, CODEX共检测索引技术 |
| 102 | 2025-10-06 |
Sp140L Is a Novel Herpesvirus Restriction Factor
2025-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.13.628399
PMID:39713285
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现Sp140L是一种新型疱疹病毒限制因子 | 首次鉴定Sp140L为疱疹病毒限制因子，揭示了其连接病毒DNA感知与转录抑制的新机制 | 研究主要聚焦于EB病毒，对其他DNA病毒的验证仍需进一步扩展 | 探索疱疹病毒如何逃避宿主防御机制并鉴定新的病毒限制因子 | EB病毒感染的B细胞和疱疹病毒松鼠猴ORF3蛋白 | 分子生物学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | EBNA-LP敲除感染的B细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 103 | 2025-10-06 |
Prior chemotherapy deteriorates T-cell quality for CAR T-cell therapy in B-cell non-Hodgkin's lymphoma
2025-Apr-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010709
PMID:40210237
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研究论文 | 本研究评估化疗对B细胞非霍奇金淋巴瘤患者T细胞功能的影响及其对CAR T细胞疗法的意义 | 首次通过多组学方法系统揭示化疗导致T细胞分化状态改变和耗竭标志物上调，直接影响CAR T细胞疗效 | 样本量有限，仅针对B细胞非霍奇金淋巴瘤患者，未涉及其他癌症类型 | 评估既往化疗对T细胞功能的影响及其对CAR T细胞疗法效果的潜在负面影响 | B细胞非霍奇金淋巴瘤患者的T细胞 | 免疫治疗 | B细胞非霍奇金淋巴瘤 | 多参数流式细胞术,单细胞RNA测序,全基因组DNA甲基化阵列,体外功能测试 | NA | 单细胞转录组数据,表观遗传数据,功能实验数据 | 两个B细胞非霍奇金淋巴瘤患者队列（治疗前vs化疗后） | NA | 单细胞RNA测序,DNA甲基化分析 | NA | NA |
| 104 | 2025-10-06 |
T-B cell cooperation in ectopic lymphoid follicles propagates CNS autoimmunity
2025-04-25, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adn2784
PMID:40279405
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研究论文 | 本研究揭示了脑膜异位淋巴滤泡中T细胞与B细胞的广泛合作如何促进中枢神经系统自身免疫 | 首次通过活体成像直接观察T17-B细胞在脑膜异位淋巴滤泡中的持久抗原特异性接触，并发现中枢神经系统T细胞依赖B细胞维持促炎细胞因子谱 | 研究采用实验性自身免疫性脑脊髓炎模型，可能不完全反映人类多发性硬化症的复杂病理过程 | 探究脑膜异位淋巴滤泡在中枢神经系统自身免疫中的作用机制 | T细胞、B细胞及其在中枢神经系统的相互作用 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序，活体成像 | T辅助17细胞过继转移实验性自身免疫性脑脊髓炎模型 | 基因表达数据，影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 105 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis Combined with Mendelian Randomization Identifies Genes Associated with Prostate Cancer Cells
2025-Apr-23, The world journal of men's health
DOI:10.5534/wjmh.240298
PMID:40583027
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研究论文 | 通过整合单细胞数据与孟德尔随机化分析，鉴定与前列腺癌细胞相关的预后基因 | 首次将单细胞测序与孟德尔随机化方法相结合，识别前列腺癌包膜侵袭相关的关键基因 | 样本量较小（仅6例前列腺癌病例），需要在更大队列中验证结果 | 研究前列腺癌包膜侵袭相关的预后基因 | 前列腺癌细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞测序, 孟德尔随机化, 免疫组织化学, 细胞功能实验 | hdWGCNA, Seurat, Cox回归 | 单细胞测序数据, 基因表达数据, 临床数据 | 6例前列腺癌病例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 106 | 2025-10-06 |
Identification of Recurrence-associated Gene Signatures and Machine Learning-based Prediction in IDH-Wildtype Histological Glioblastoma
2025-Apr-14, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-025-02345-4
PMID:40227386
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研究论文 | 本研究通过基因共表达网络分析和机器学习方法，识别IDH野生型胶质母细胞瘤复发相关基因并建立预测模型 | 首次在IDH野生型组织学胶质母细胞瘤中鉴定8个复发相关基因，并开发了基于随机森林的高精度预测模型 | 研究样本量相对有限，需要更多独立队列验证模型的泛化能力 | 探索胶质母细胞瘤复发的分子机制并建立复发预测模型 | IDH野生型组织学胶质母细胞瘤患者 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA), RT-qPCR, 单细胞RNA测序, 机器学习 | 随机森林(RF) | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | CGGA-693队列190例, CGGA-325队列111例, 另有两个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 107 | 2025-10-06 |
Psychological stress increases skin infection through the action of TGFβ to suppress immune-acting fibroblasts
2025-04-11, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.ads0519
PMID:40215323
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和脂质组学分析揭示了心理压力通过TGFβ抑制真皮成纤维细胞免疫功能从而增加皮肤感染的机制 | 首次发现心理压力通过脑-皮肤轴介导的TGFβ信号通路抑制成纤维细胞产生抗菌肽cathelicidin的免疫防御功能 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类中得到验证 | 探究心理压力增加皮肤感染易感性的分子机制 | 小鼠模型中的真皮成纤维细胞 | 免疫学 | 皮肤感染 | 单细胞转录组学, 脂质组学分析 | NA | 基因表达数据, 脂质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 108 | 2025-10-06 |
Eutopic macrophages facilitate endometriosis progression via ferroptosis-mediated release of S100A9
2025-Apr-03, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf027
PMID:40493892
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现子宫内膜异位症患者在位内膜中S100A9+巨噬细胞亚群通过铁死亡释放S100A9促进疾病进展 | 首次揭示在位内膜中S100A9+巨噬细胞亚群通过铁死亡机制促进子宫内膜异位症发展的新机制 | NA | 探究巨噬细胞在子宫内膜异位症发病机制中的具体作用 | 子宫内膜异位症患者组织样本和小鼠模型 | 单细胞生物学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, 体外实验, 小鼠模型 | NA | 基因表达数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 109 | 2025-10-06 |
Lysine methyltransferase SETD7 coordinates the emergence of mature and senescent subpopulations during the decidualization of endometrial stromal cells
2025-Apr-03, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf028
PMID:40570096
|
研究论文 | 本研究揭示了组蛋白甲基转移酶SETD7在子宫内膜基质细胞蜕膜化过程中调控细胞命运分化的新机制 | 首次发现SETD7通过稳定雌激素受体蛋白而非其组蛋白甲基化活性来调控蜕膜化，并鉴定其为细胞命运分化的关键调节因子 | 研究主要基于体外细胞模型和公共数据库分析，缺乏体内实验验证 | 探究SETD7在子宫内膜基质细胞蜕膜化过程中的调控作用 | 子宫内膜基质细胞(EnSC) | 表观遗传学 | 复发性流产 | 单细胞RNA测序, mRNA微阵列 | 基因敲除模型 | 基因表达数据 | 公共数据库中的单细胞RNA测序数据和子宫内膜组织mRNA微阵列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 110 | 2025-10-06 |
Spatial profiling of ANO7 in prostate tissue: links to AR-signalling-associated lipid metabolism and inflammation
2025-04, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6405
PMID:39978863
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析ANO7在前列腺组织中的表达模式及其与雄激素受体信号和脂质代谢的关联 | 首次发现ANO7在前列腺上皮中呈现异质性开关表达模式，并揭示其与雄激素受体信号通路和脂质代谢的关联 | 研究样本仅来自局限性前列腺癌患者，未涵盖更广泛的前列腺疾病谱系 | 探讨ANO7基因在良性前列腺上皮中的功能作用 | 前列腺切除术样本中的良性前列腺上皮区域 | 空间转录组学 | 前列腺癌 | 空间转录组学，RNA-seq | NA | 空间转录组数据，批量RNA-seq数据 | 来自局限性前列腺癌患者的前列腺切除术样本（具体样本数未明确说明） | NA | 空间转录组学，批量RNA测序 | NA | NA |
| 111 | 2025-10-06 |
An Improved, High-Yield Method for Isolating Nuclei from Individual Zebrafish Embryos for Single-Nucleus RNA Sequencing
2025-04, Zebrafish
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/zeb.2024.0175
PMID:40040474
|
研究论文 | 开发了一种改进的从斑马鱼胚胎中高效分离高质量细胞核的方法，用于单细胞RNA测序 | 采用珠磨均质化方法在96孔板格式中高效分离细胞核，相比酶消化法有显著改进 | NA | 建立高效的斑马鱼胚胎细胞核分离方法以支持单细胞测序研究 | 斑马鱼胚胎 | 单细胞测序 | NA | 单细胞组合索引RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 112 | 2025-10-06 |
Multi-omics approaches for identifying the PANoptosis signature and prognostic model via a multimachine-learning computational framework for intrahepatic cholangiocarcinoma
2025-Apr-15, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001352
PMID:40233411
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法和机器学习框架识别肝内胆管癌的PANoptosis特征并构建预后模型 | 整合Cox回归分析和5种机器学习算法识别关键基因，构建的PANoptosis风险评分在多中心队列中表现出优异性能 | 样本量相对有限，需要更多独立队列验证 | 表征肝内胆管癌患者的PANoptosis特征，构建临床诊疗指导模型并探索耐药机制 | 肝内胆管癌患者 | 机器学习 | 肝内胆管癌 | 转录组测序、蛋白质组测序、单细胞转录组分析 | Cox回归, 机器学习算法 | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 来自OEP001105公共队列和重庆医科大学附属第一医院的多中心队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 113 | 2025-10-06 |
CAF-derived exosomal LINC01711 promotes breast cancer progression by activating the miR-4510/NELFE axis and enhancing glycolysis
2025-Apr-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202402024RRR
PMID:40172996
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研究论文 | 本研究揭示了乳腺癌相关成纤维细胞通过外泌体传递LINC01711激活miR-4510/NELFE轴，从而增强乳腺癌细胞糖酵解和恶性进展的分子机制 | 首次发现CAF来源外泌体中的LINC01711通过miR-4510/NELFE轴调控TXN表达并促进糖酵解的新机制 | NA | 探索乳腺癌微环境中CAF通过外泌体lncRNA促进肿瘤进展的分子机制 | 乳腺癌细胞、癌症相关成纤维细胞(CAF)及其外泌体 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞测序、降维分析、聚类分析、细胞注释 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 114 | 2025-10-06 |
A tumor necrosis factor-α-responsive cryptic promoter drives overexpression of the human endogenous retrovirus ERVK-7
2025-Apr-30, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108568
PMID:40316021
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研究论文 | 本研究揭示了人内源性逆转录病毒ERVK-7在肺腺癌中通过肿瘤坏死因子-α响应性隐蔽启动子驱动的过表达机制 | 发现了ERVK-7的两个新型转录本及其细胞谱系特异性表达模式，阐明了炎症信号通路对ERVK-7表达的差异性调控机制 | 主要聚焦于肺腺癌，对其他癌症类型的适用性需要进一步验证 | 探究ERVK-7在肺腺癌中的表达调控机制及其作为生物标志物的潜力 | 人内源性逆转录病毒ERVK-7及其在肺腺癌中的表达调控 | 基因组学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,表观遗传图谱 | NA | 基因组数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 115 | 2025-10-06 |
The spatial transcriptome of the late-stage embryonic and postnatal mouse brain reveals spatiotemporal molecular markers
2025-Apr-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-95496-8
PMID:40210990
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研究论文 | 通过空间转录组分析研究小鼠胚胎晚期和出生后大脑发育过程中的时空分子标记 | 首次将空间转录组分析应用于发育中的胎儿大脑，发现了脉络丛、梨状皮层和丘脑的新分子标记，以及能够确定发育阶段背侧内嗅核的新型分子标记 | 研究主要基于小鼠模型，人类大脑发育可能存在差异；空间转录组数据的计算分析仍需进一步优化 | 研究小鼠大脑发育过程中基因表达的时空调控机制 | 胚胎晚期和出生后小鼠大脑组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序，单细胞转录组数据整合 | 数据分析模型 | 空间转录组数据，单细胞转录组数据 | 小鼠大脑发育多个时间点的组织样本 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 116 | 2025-10-06 |
Cancer-associated fibroblasts in breast cancer in the single-cell era: Opportunities and challenges
2025-04, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189291
PMID:40024607
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综述 | 本文探讨了单细胞时代乳腺癌中癌症相关成纤维细胞的异质性、生物标志物分类及其在肿瘤进展中的作用 | 利用单细胞RNA测序技术系统分析乳腺癌中癌症相关成纤维细胞的异质性和功能亚群 | NA | 探索乳腺癌中癌症相关成纤维细胞的亚群分类及其在肿瘤微环境中的功能作用 | 乳腺癌中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 117 | 2025-10-06 |
The Lung Is Not a Primary Site of Platelet Biogenesis
2025-Apr-30, Physiological research
IF:1.9Q3
PMID:40432441
|
研究论文 | 本研究通过多物种实验验证肺脏是否为血小板生成的主要场所 | 首次通过跨物种比较（人类、小鼠、大鼠、兔子）系统评估肺脏血小板生成能力，结合血液参数分析、免疫组化和单细胞RNA测序技术 | 样本量有限，物种间差异可能影响结论的普适性 | 探究肺脏在血小板生物发生中的主要作用 | 人类、小鼠、大鼠、兔子的血小板和巨核细胞 | 生物医学研究 | 血液系统疾病 | 自动血液分析仪检测、免疫组织化学染色、单细胞RNA测序 | NA | 血液参数数据、组织染色图像、基因表达数据 | 人类124例、大鼠39例、兔子38例、小鼠未明确数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 118 | 2025-10-06 |
Nintedanib improves bleomycin-induced pulmonary fibrosis by inhibiting the Clec7a/SPP1 pathway in interstitial macrophages
2025-Apr, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111635
PMID:39892726
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和RNA-seq数据分析，揭示了尼达尼布通过抑制间质巨噬细胞中Clec7a/SPP1通路改善肺纤维化的新机制 | 首次发现尼达尼布通过抑制间质巨噬细胞中Clec7a来阻断NFκB/SPP1促纤维化通路的新作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证该机制 | 探索尼达尼布治疗特发性肺纤维化的精确作用机制 | 博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | 单细胞测序,RNA-seq | Monocle2,Cellchat,Scenic | 基因表达数据 | 纤维化和尼达尼布治疗的纤维化小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 119 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing systematically analyzed the mechanism of Emdogain on the restoration of delayed replantation periodontal membrane
2025-04-17, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-024-00345-5
PMID:40246878
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序系统分析Emdogain在延迟再植牙周膜修复中的作用机制 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示EMD通过调控Vtn+成纤维细胞、促进骨生成和血管生成通路的作用机制 | 研究仅基于大鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探究Emdogain促进延迟再植牙周膜修复的细胞和分子机制 | 大鼠延迟牙齿再植模型 | 单细胞测序 | 牙周病 | 单细胞RNA测序，micro-CT，HE染色，TRAP染色，免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据，影像数据，组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 120 | 2025-10-06 |
Pan-cancer Analysis Identified Ectopic RUNX1T1 Associated with Lineage Plasticity
2025-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.18.649575
PMID:40488132
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研究论文 | 通过泛癌分析发现异位RUNX1T1表达与肿瘤谱系可塑性相关 | 首次利用HOX代码量化肿瘤谱系可塑性，并鉴定RUNX1T1作为泛癌谱系可塑性标志物 | 研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证 | 鉴定与肿瘤谱系可塑性相关的泛癌生物标志物 | 114种癌症类型中的肿瘤细胞 | 生物信息学 | 多癌种（前列腺癌、肺癌、急性髓系白血病） | RNA测序、生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | 超过80,000个RNA测序样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |