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当前共找到 727 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-06 |
Investigative needle core biopsies support multimodal deep-data generation in glioblastoma
2025-Apr-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58452-8
PMID:40295505
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研究论文 | 本研究展示了通过常规立体定向穿刺活检获取的胶质母细胞瘤组织可进行多组学深度数据分析 | 首次系统验证立体定向穿刺活检在生成多组学数据和监测治疗反应方面的可行性 | 样本量有限，需要更大规模研究验证 | 探索立体定向穿刺活检在胶质母细胞瘤多组学分析和治疗监测中的应用价值 | 胶质母细胞瘤患者术中获取的穿刺活检组织 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,代谢组学,蛋白质组学,磷酸化蛋白质组学,T细胞克隆型分析,MHC I类免疫肽组学 | NA | 多组学数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,代谢组学,蛋白质组学,磷酸化蛋白质组学,免疫肽组学 | NA | NA |
| 82 | 2025-10-06 |
Single cell RNA sequencing after moderate traumatic brain injury: effects of therapeutic hypothermia
2025-Apr-18, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03430-6
PMID:40251570
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析中度创伤性脑损伤后治疗性低温对多种细胞类型特异性转录反应的影响 | 首次在单细胞水平上揭示治疗性低温对创伤性脑损伤后胶质细胞和血管细胞特异性转录调控的机制 | 研究仅观察损伤后24小时的时间点，样本量相对有限 | 探究治疗性低温对创伤性脑损伤后细胞类型特异性分子机制的影响 | C57BL/6小鼠的脑皮质组织 | 单细胞测序分析 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | C57BL/6小鼠创伤性脑损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 83 | 2025-10-06 |
An atlas of single-cell eQTLs dissects autoimmune disease genes and identifies novel drug classes for treatment
2025-Apr-09, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100820
PMID:40154479
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研究论文 | 通过单细胞eQTL图谱解析自身免疫疾病基因并识别新型治疗药物类别 | 提出JOBS联合模型将bulk eQTL建模为单细胞eQTL的加权和，显著提高eQTL检测能力 | 单细胞eQTL数据集规模相对较小 | 解析自身免疫疾病遗传机制并识别潜在治疗药物 | 14种免疫介导疾病 | 基因组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序，全基因组关联分析 | JOBS联合模型 | 基因表达数据，基因组变异数据 | OneK1K和eQTLGen数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2025-10-06 |
EcDNA-borne PVT1 fusion stabilizes oncogenic mRNAs
2025-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.01.646515
PMID:40236070
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研究论文 | 本研究揭示染色体外DNA(ecDNA)通过结构变异产生基因融合，其中PVT1外显子1作为5'端伴侣可增强癌基因mRNA稳定性 | 首次发现ecDNA通过结构变异产生lncRNA与mRNA的嵌合融合，并阐明PVT1外显子1通过SRSF1蛋白相互作用增强癌基因mRNA稳定性的新机制 | 未明确说明研究样本的具体数量和类型 | 探究ecDNA结构变异产生的基因融合对癌基因表达的调控机制 | 染色体外DNA(ecDNA)、PVT1 lncRNA、癌基因融合转录本 | 癌症基因组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2025-10-06 |
Evidence of off-target probe binding in the 10x Genomics Xenium v1 Human Breast Gene Expression Panel compromises accuracy of spatial transcriptomic profiling
2025-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.31.646342
PMID:40236200
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研究论文 | 本研究通过开发OPT软件工具，揭示了10x Genomics Xenium v1人类乳腺癌基因表达面板中存在的脱靶探针结合问题 | 开发了首个专门检测空间转录组技术中脱靶探针结合的工具OPT，并系统评估了Xenium平台的探针特异性问题 | 研究仅针对特定版本的Xenium人类乳腺癌基因面板，结果可能不适用于其他基因面板或平台版本 | 评估10x Genomics Xenium平台探针结合的特异性，提高空间转录组数据的生物学可解释性 | 10x Genomics Xenium v1人类乳腺癌基因表达面板中的280个基因 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 探针序列比对，空间转录组分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，探针序列数据 | 来自同一肿瘤组织的多个数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | 10x Xenium, 10x Visium CytAssist, 10x Chromium | 10x Genomics Xenium v1 Human Breast Gene Expression Panel, Visium CytAssist, 3' single-cell RNA-seq |
| 86 | 2025-10-06 |
Crosstalk Signaling Between the Epithelial and Non-Epithelial Compartments of the Mouse Inner Ear
2025-Apr, Journal of the Association for Research in Otolaryngology : JARO
DOI:10.1007/s10162-025-00980-7
PMID:40080263
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索小鼠内耳前庭器官中上皮细胞与非上皮间充质细胞之间的信号串扰 | 首次在新生小鼠椭圆囊中系统揭示上皮与非上皮细胞区室间的动态信号交流，特别是间充质细胞在出生后发育中的主导信号发送作用 | 研究仅关注出生后第4天和第6天两个时间点，未能覆盖更完整的发育时间序列 | 探索内耳前庭器官发育过程中上皮与非上皮细胞区室间的相互作用机制 | 新生小鼠内耳椭圆囊细胞 | 单细胞生物学 | 前庭功能障碍 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，定量多重原位杂交 | 多种计算方法 | 单细胞转录组数据，图像数据 | 955个细胞，来自12个注释细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq | Smart-seq2 | 全长Smart-seq2单细胞RNA测序 |
| 87 | 2025-10-06 |
The dynamic and diverse nature of parenchyma cells in the Arabidopsis root during secondary growth
2025-04, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-01938-6
PMID:40140531
|
研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和谱系追踪技术，揭示了拟南芥根次生生长过程中薄壁细胞的多样性和功能动态 | 首次通过单细胞RNA测序与谱系追踪相结合的方法，重建了拟南芥根次生生长过程中的细胞发育轨迹，发现了20种先前未描述的细胞类型或状态 | 研究仅限于拟南芥根部，结果在其他植物或组织中的普适性需要进一步验证 | 探究拟南芥根次生生长过程中薄壁细胞的多样性和功能特性 | 拟南芥根部在次生生长过程中的薄壁细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 93个报告基因系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2025-10-06 |
Transcriptional profiles of mouse oligodendrocyte precursor cells across the lifespan
2025-Apr, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-00840-2
PMID:40164771
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析小鼠少突胶质前体细胞在整个生命周期中的转录变化 | 构建了Matn4-mEGFP转基因小鼠品系，首次在单细胞水平解析了OPCs从静息到增殖和分化关键转变过程中的转录变化 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究衰老如何影响少突胶质前体细胞的转录特征和功能 | 小鼠少突胶质前体细胞 | 单细胞组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 跨多个年龄段的皮质OPCs | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 89 | 2025-10-06 |
MYB74 transcription factor guides de novo specification of epidermal cells in the abscission zone of Arabidopsis
2025-04, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-01976-0
PMID:40181105
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了拟南芥脱落区非表皮残留细胞通过转分化形成表皮细胞的发育程序 | 首次发现MYB74转录因子指导脱落区表皮细胞的从头特化，揭示了植物通过转分化途径同时实现保护和促进生长的机制 | NA | 探究植物脱落区表皮细胞从头特化的分子机制和生物学意义 | 拟南芥脱落区的非表皮残留细胞 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 90 | 2025-10-06 |
The dynamic immune behavior of primary and metastatic ovarian carcinoma
2025-Apr-25, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00818-8
PMID:40281242
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学技术揭示了高级别浆液性卵巢癌原发灶和转移灶的免疫微环境动态特征 | 首次结合单细胞测序和空间转录组学技术系统比较卵巢癌原发灶与转移灶的免疫微环境差异，并发现上皮细胞与免疫细胞间的交叉通讯在免疫抑制中的关键作用 | 样本来源仅限于卵巢癌患者，未涉及其他癌症类型；研究结果需要更大样本量验证 | 探究高级别浆液性卵巢癌免疫抑制的分子机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者的原发肿瘤和网膜转移肿瘤 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 未明确指定样本数量，但包含原发肿瘤和转移肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 91 | 2025-10-06 |
Dissection of tumoral niches using spatial transcriptomics and deep learning
2025-Apr-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112214
PMID:40230519
|
研究论文 | 本研究开发了TG-ME计算框架，通过整合空间转录组学数据和形态学图像来解析肿瘤微环境中的生态位 | 提出结合Transformer和图变分自编码器(GraphVAE)的创新计算框架，能够同时利用空间转录组数据和形态学图像进行肿瘤生态位分析 | NA | 开发计算工具解析肿瘤微环境的空间组织结构 | 肿瘤生态位和肿瘤微环境 | 空间转录组学，深度学习 | 非小细胞肺癌 | 空间转录组学，深度学习 | Transformer，GraphVAE | 空间转录组数据，形态学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 92 | 2025-10-06 |
Progesterone signaling in oviductal epithelial cells modulates the immune response to support preimplantation embryonic development
2025-Apr-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt6113
PMID:40249812
|
研究论文 | 本研究探讨孕酮信号通过调控输卵管上皮细胞免疫反应支持胚胎着床前发育的机制 | 首次揭示输卵管上皮细胞中孕酮受体通过抑制IL-22等促炎基因表达来保障胚胎正常发育的新机制 | 研究仅使用小鼠模型，人类临床适用性需进一步验证 | 阐明孕酮信号在胚胎着床前发育过程中的免疫调节作用 | 条件性敲除孕酮受体的小鼠模型及其胚胎 | 生殖生物学 | 妊娠丢失 | 单细胞RNA测序，药理学抑制，共培养实验 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，胚胎发育表型数据 | 未明确样本数量的小鼠模型和胚胎 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 93 | 2025-10-06 |
Morphogenic, molecular and cellular adaptations for unidirectional airflow in the chicken lung
2025-Apr-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204346
PMID:40177910
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研究论文 | 本研究通过多尺度成像和单细胞转录组学揭示了鸡肺中单向气流的形态发生、分子和细胞适应机制 | 发现了鸡特有的表达KRT14的肺泡细胞类型（命名为腔细胞），并揭示了肺分支融合形成副支气管和径向肺泡生成的新机制 | 研究主要集中于鸡肺发育过程，与哺乳动物肺的比较分析相对有限 | 阐明鸟类肺中单向气流的发育适应机制及其与哺乳动物双向气流的差异 | 鸡肺发育过程中的关键阶段 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 多尺度3D成像 | NA | 基因表达数据, 成像数据 | 鸡肺发育关键阶段的多个样本 | 华大基因 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | Stereo-seq | Stereo-seq空间转录组技术 |
| 94 | 2025-10-06 |
ATM-dependent DNA damage response constrains cell growth and drives clonal hematopoiesis in telomere biology disorders
2025-Apr-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI181659
PMID:40179146
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了端粒功能障碍通过激活ATM依赖性DNA损伤反应通路导致细胞衰老和凋亡，从而驱动克隆造血的机制 | 首次系统性地在端粒生物学疾病患者中发现ATM依赖性DNA损伤反应的过度激活是疾病发病的关键机制，并提出ATM抑制可能成为潜在治疗策略 | 研究样本量相对有限（166例患者），且主要基于观察性数据，需要进一步的功能验证和临床试验 | 探究端粒生物学疾病中造血系统异常和克隆造血的分子机制 | 166例儿童和成人端粒生物学疾病患者的造血细胞 | 分子生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞测序, ATM激活检测, 端粒功能障碍诱导灶分析, 细胞生长实验 | NA | 基因组数据, 单细胞测序数据, 细胞功能数据 | 166例端粒生物学疾病患者（儿童和成人） | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 95 | 2025-10-06 |
The essential role of connective-tissue cells during axolotl limb regeneration
2025-Apr-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.30.645595
PMID:40236065
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示结缔组织细胞在蝾螈肢体再生过程中构成高达75%的芽基细胞并证明其必要性 | 首次通过空间转录组学量化结缔组织细胞在再生芽基中的比例，并利用基因消融实验证实其功能必要性 | 未详细探讨其他类型细胞在再生过程中的具体作用机制 | 阐明结缔组织细胞在蝾螈肢体再生过程中的细胞组成和功能必要性 | 墨西哥钝口螈（Ambystoma mexicanum）的肢体再生过程 | 发育生物学 | 组织再生 | 空间转录组学、基因消融 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 选择性探针阵列 |
| 96 | 2025-10-06 |
Genetics- and age-driven neuroimmune and disc changes underscore herniation susceptibility and pain-associated behaviors in SM/J mice
2025-Apr-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ado6847
PMID:40267183
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研究论文 | 本研究通过SM/J小鼠模型揭示了遗传背景和衰老对自发性椎间盘突出易感性及疼痛相关行为的神经免疫机制 | 首次在野生型环境中建立自发性椎间盘突出的小鼠模型，并系统揭示了神经免疫调节和细胞外基质改变在病理过程中的作用 | 研究仅限于SM/J小鼠品系，结果在其他遗传背景中的普适性需要进一步验证 | 探究遗传和年龄因素对椎间盘突出易感性及疼痛行为的神经免疫机制 | SM/J近交系小鼠的腰椎间盘、背根神经节、脊髓和外周血单核细胞 | 神经免疫学 | 椎间盘突出 | 单细胞RNA测序, 飞行时间细胞计数, 转录组分析 | NA | 基因表达数据, 细胞计数数据 | SM/J近交系小鼠群体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 97 | 2025-10-06 |
Accessing genetically defined cell types in the superior colliculus with transgenic mouse lines
2025-Apr-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112194
PMID:40212591
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研究论文 | 本研究利用转基因小鼠品系表征上丘中特定神经元类型，验证分子图谱与形态学分类之间的相关性 | 首次基于单细胞转录组图谱系统评估转基因小鼠品系在上丘特定神经元类型靶向中的适用性 | 仅评估了10个转基因小鼠品系，可能未覆盖所有上丘神经元类型 | 研究上丘神经元亚型的功能特性 | 转基因小鼠的上丘神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学，转基因技术 | NA | 基因表达数据，荧光成像数据 | 10个转基因小鼠品系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 98 | 2025-10-06 |
Altered baseline immunological state and impaired immune response to SARS-CoV-2 mRNA vaccination in lung transplant recipients
2025-Apr-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102050
PMID:40187358
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了肺移植受者基线免疫状态异常及其对SARS-CoV-2 mRNA疫苗免疫应答受损的机制 | 首次通过多组学整合分析揭示肺移植受者基线免疫状态与COVID-19重症相似的免疫特征，并直接关联到疫苗应答受损 | 样本量有限，未探讨不同免疫抑制方案对疫苗应答的影响 | 探究肺移植受者对SARS-CoV-2 mRNA疫苗免疫应答减弱的免疫学机制 | 肺移植受者与健康对照者 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序，多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据，细胞因子数据，抗体数据 | 肺移植受者与健康对照者（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 99 | 2025-10-06 |
A cohort of highly activated CD99- CD72+ B cells promoting autoimmune progression in juvenile systemic lupus erythematosus
2025-Apr-16, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114466
PMID:40090085
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研究论文 | 本研究在青少年系统性红斑狼疮中发现了一类高度活化的CD99-CD72+B细胞亚群，该细胞群通过表达高水平TLR7促进自身免疫进程 | 首次在青少年系统性红斑狼疮中鉴定出CD72+B细胞这一关键过渡细胞群体，揭示了其在自身免疫反应中的新作用机制 | 研究主要基于测序数据分析，需要进一步实验验证该细胞群体的具体功能机制 | 探究青少年系统性红斑狼疮中B细胞亚群的免疫病理机制 | 青少年系统性红斑狼疮患者的B细胞 | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 多组学整合分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 100 | 2025-10-06 |
A Spatial Multi-Omic Framework Identifies Gliomas Permissive to TIL Expansion
2025-Apr-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.26.645566
PMID:40236001
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研究论文 | 本研究通过多模态分析识别胶质瘤中肿瘤浸润淋巴细胞扩增的空间和分子决定因素 | 首次整合光谱流式细胞术、TCR测序、单细胞RNA-seq、Xenium原位转录组学和CODEX空间蛋白质组学，建立空间多组学框架分析胶质瘤TIL扩增能力 | 研究聚焦于高级别胶质瘤，结果在其他免疫排斥肿瘤中的普适性需进一步验证 | 识别胶质瘤中肿瘤浸润淋巴细胞扩增的基因组和空间决定因素 | 高级别胶质瘤样本 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 光谱流式细胞术, TCR测序, 单细胞RNA测序, 原位转录组学, 空间蛋白质组学 | 多组学整合分析 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 蛋白质组数据, T细胞受体数据 | 未明确样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Xenium | Xenium原位转录组学平台 |