单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 722 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-06 |
Identification and characterization of early human photoreceptor states and cell-state-specific retinoblastoma-related features
2025-Apr-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.28.530247
PMID:38915659
|
研究论文 | 通过全长单细胞RNA测序识别早期人类光感受器状态及视网膜母细胞瘤相关特征 | 首次揭示未解决的感光细胞前体状态，发现早期锥细胞前体内在基因表达在视网膜母细胞瘤起始中的作用 | NA | 理解人类锥感光细胞与杆细胞的发育差异及其在视网膜母细胞瘤发生中的作用 | 人类锥感光细胞和杆感光细胞的发育状态 | 单细胞基因组学 | 视网膜母细胞瘤 | 全长单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 82 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial genomic landscape of non-small cell lung cancer brain metastases
2025-Apr, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-03530-z
PMID:40016452
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研究论文 | 通过多模态单细胞测序和空间转录组学揭示非小细胞肺癌脑转移的基因组景观 | 首次在初治NSCLC患者中整合单核RNA/T细胞受体测序、单细胞空间转录组和全基因组测序，发现染色体不稳定性是脑转移的显著特征 | 样本量相对有限，需要更大规模验证 | 探索非小细胞肺癌脑转移的生物学机制 | 非小细胞肺癌患者的脑转移灶和原发肿瘤 | 数字病理学 | 肺癌 | 单核RNA测序, T细胞受体测序, 单细胞空间转录组学, 全基因组测序, 多重免疫荧光 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | 初治NSCLC患者样本（具体数量未明确）+ 4,869名独立患者验证队列 + 12,275名NSCLC患者新队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 全基因组测序 | NA | NA |
| 83 | 2025-10-06 |
Activated polyreactive B cells are clonally expanded in autoantibody positive and patients with recent-onset type 1 diabetes
2025-Apr-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115425
PMID:40117290
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析揭示1型糖尿病患者中胰岛抗原反应性B细胞的基因表达和BCR谱系变化 | 首次在1型糖尿病中发现胰岛抗原反应性B细胞存在克隆扩增和多反应性特征 | 样本量有限，仅分析了外周血中的B细胞而未直接研究胰腺组织 | 探究1型糖尿病中自身反应性B细胞的表型和功能特征 | 非糖尿病自身抗体阴性一级亲属、自身抗体阳性者和新发1型糖尿病供者的外周血胰岛抗原反应性B细胞 | 单细胞基因组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序, BCR测序 | NA | 单细胞转录组数据, B细胞受体序列数据 | 来自三类供者群体的外周血B细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2025-10-06 |
SIGMAR1 screened by a GPCR-related classifier regulates endoplasmic reticulum stress in bladder cancer
2025-Apr-10, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06393-7
PMID:40211230
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研究论文 | 本研究通过构建GPCR-TME分类器筛选出SIGMAR1，并验证其在膀胱癌中通过调节内质网应激影响肿瘤进展的机制 | 首次构建膀胱癌相关的GPCR-TME分类器，并发现SIGMAR1通过调节内质网应激影响膀胱癌进展的新机制 | 研究主要基于公共数据库数据，需要更多独立队列验证GPCR-TME分类器的临床应用价值 | 探究GPCR相关基因在膀胱癌中的作用机制，特别是SIGMAR1对内质网应激的调控功能 | 膀胱癌患者数据、膀胱癌细胞系、裸鼠移植瘤模型 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 免疫治疗反应分析, 蛋白质印迹, 基因集富集分析, CIBERSORT免疫细胞浸润分析 | GPCR-TME分类器 | 批量测序数据, 单细胞RNA测序数据, 临床病理数据 | 从公共数据库获取的多组膀胱癌数据集，包含细胞系和组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 85 | 2025-10-06 |
Mapping Small Extracellular Vesicle Secretion Potential in Healthy Human Gingiva Using Spatial Transcriptomics
2025-Apr-07, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47040256
PMID:40699655
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研究论文 | 利用空间转录组学技术绘制健康人牙龈组织中小细胞外囊泡分泌潜力的空间分布图谱 | 首次在sEVs生物发生特定背景下对可用牙龈转录组数据进行荟萃分析，揭示了沟内上皮浅层和深层是sEVs相关基因表达最富集的区域 | 研究基于公开转录组数据，未进行实验验证；仅分析了43个已知sEVs生物发生相关基因中的12个 | 探索健康人牙龈组织中不同结构在小细胞外囊泡生物发生中的作用 | 健康人牙龈组织 | 空间转录组学 | 口腔组织再生 | 空间转录组学，基因本体分析 | NA | 转录组数据，空间基因表达数据 | 公开可用的牙龈转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 86 | 2025-10-06 |
A systematic review of single-cell RNA sequencing applications and innovations
2025-Apr, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
综述 | 本文系统综述了单细胞RNA测序技术的应用与创新，重点关注胰岛细胞研究 | 全面总结了scRNA-seq在理解细胞类型、基因活性和细胞相互作用方面的最新进展 | 作为综述文章，不包含原始实验数据，主要基于现有文献分析 | 系统评估单细胞RNA测序技术的应用、创新和挑战 | 胰岛细胞及复杂组织中的细胞多样性 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 87 | 2025-10-06 |
Adipose-derived leptin and complement factor D mediate osteoarthritis severity and pain
2025-Apr-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt5915
PMID:40279436
|
研究论文 | 本研究揭示了脂肪源性瘦素和补体因子D在骨关节炎严重程度和疼痛中的关键作用 | 首次通过脂肪营养不良小鼠模型证实脂肪-关节信号交流的存在，并发现瘦素通过调控补体因子D影响骨关节炎表型 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究肥胖相关脂肪因子在骨关节炎发病机制中的具体作用 | 脂肪营养不良小鼠模型、脂肪组织植入物、关节组织 | 骨科学 | 骨关节炎 | 空间转录组学、全局无监督多组学分析 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 88 | 2025-10-06 |
Novel insights into kidney disease: the scRNA-seq and spatial transcriptomics approaches: a literature review
2025-Apr-08, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-025-04103-5
PMID:40200175
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文献综述 | 本文综述了单细胞RNA测序与空间转录组学在肾脏疾病研究中的应用与发展 | 整合单细胞RNA测序与空间转录组学技术，以前所未有的分辨率解析肾脏微环境中细胞亚群的动态相互作用 | NA | 总结单细胞RNA测序与空间转录组学在肾脏疾病研究中的应用价值 | 肾脏疾病相关的细胞异质性和空间组织 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 89 | 2025-10-06 |
USP4 depletion-driven RAB7A ubiquitylation impairs autophagosome-lysosome fusion and aggravates periodontitis
2025-04, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2024.2429371
PMID:39663592
|
研究论文 | 本研究揭示了USP4缺失通过介导RAB7A泛素化破坏自噬体-溶酶体融合，从而加剧牙周炎发病机制 | 首次发现USP4通过调控RAB7A泛素化状态影响自噬体-溶酶体融合在牙周炎中的作用机制 | NA | 阐明自噬与牙周炎发病机制之间的分子调控网络 | 临床牙龈组织样本、实验性牙周炎小鼠模型、巨噬细胞 | 分子生物学 | 牙周炎 | 基因组学分析、组织学分析、蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、组织学数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 90 | 2025-10-06 |
A simplified preparation method for single-nucleus RNA-sequencing using long-term frozen brain tumor tissues
2025-Apr-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-97053-9
PMID:40229354
|
研究论文 | 开发了一种适用于长期冷冻脑肿瘤组织的简化单核RNA测序制备方法 | 优化了从长期冷冻儿科神经胶质瘤组织中分离完整细胞核的方法，并改进了3'测序文库以包含更短的RNA片段 | 主要针对冷冻脑肿瘤组织，对其他组织类型的适用性需进一步验证 | 开发适用于冷冻组织的单核RNA测序方法 | 儿科神经胶质瘤组织 | 单细胞测序 | 脑肿瘤 | 单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单核RNA测序 | NA | 适用于液滴基和板基单细胞测序平台 |
| 91 | 2025-10-06 |
Long-lasting B cell convergence to distinct broadly reactive epitopes following vaccination with chimeric influenza virus hemagglutinins
2025-Apr-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.02.025
PMID:40132593
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研究论文 | 通过单细胞测序分析嵌合血凝素疫苗诱导的B细胞应答特性 | 首次结合单细胞RNA测序和B细胞受体 repertoire 测序分析cHA疫苗诱导的B细胞特异性、功能和亚群 | 仅为一期临床试验结果，样本量有限 | 评估嵌合血凝素疫苗诱导的B细胞应答特性 | 疫苗接种后的人类B细胞 | 免疫学 | 流感 | 单细胞RNA测序, B细胞受体 repertoire 测序 | NA | 单细胞转录组数据, B细胞受体序列数据 | 一期临床试验参与者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 92 | 2025-10-06 |
Expansion of OSMR expression and signaling in the human dorsal root ganglion links OSM to neuropathic pain
2025-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.26.645611
PMID:40236060
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研究论文 | 本研究揭示了OSM-OSMR信号通路在人类背根神经节中的表达扩展及其与神经病理性疼痛的关联 | 发现人类背根神经节中OSMR表达的物种特异性扩展，证明OSM通过MAPK信号直接激活感觉神经元并诱导疼痛相关转录组特征 | 研究主要基于体外实验和转录组分析，需要进一步体内验证 | 探究OSM-OSMR信号通路在神经病理性疼痛中的作用机制 | 人类背根神经节组织和神经元 | 神经科学 | 神经病理性疼痛 | RNA测序,原位杂交,免疫组织化学,膜片钳电生理,CRISPR编辑 | NA | 转录组数据,电生理数据,图像数据 | 神经病理性疼痛患者的背根神经节样本 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 93 | 2025-10-06 |
Investigative needle core biopsies support multimodal deep-data generation in glioblastoma
2025-Apr-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58452-8
PMID:40295505
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研究论文 | 本研究展示了通过常规立体定向穿刺活检获取的胶质母细胞瘤组织可进行多组学深度数据分析 | 首次系统验证立体定向穿刺活检在生成多组学数据和监测治疗反应方面的可行性 | 样本量有限，需要更大规模研究验证 | 探索立体定向穿刺活检在胶质母细胞瘤多组学分析和治疗监测中的应用价值 | 胶质母细胞瘤患者术中获取的穿刺活检组织 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,代谢组学,蛋白质组学,磷酸化蛋白质组学,T细胞克隆型分析,MHC I类免疫肽组学 | NA | 多组学数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,代谢组学,蛋白质组学,磷酸化蛋白质组学,免疫肽组学 | NA | NA |
| 94 | 2025-10-06 |
An atlas of single-cell eQTLs dissects autoimmune disease genes and identifies novel drug classes for treatment
2025-Apr-09, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100820
PMID:40154479
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研究论文 | 通过单细胞eQTL图谱解析自身免疫疾病基因并识别新型治疗药物类别 | 提出JOBS联合模型将bulk eQTL建模为单细胞eQTL的加权和，显著提高eQTL检测能力 | 单细胞eQTL数据集规模相对较小 | 解析自身免疫疾病遗传机制并识别潜在治疗药物 | 14种免疫介导疾病 | 基因组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序，全基因组关联分析 | JOBS联合模型 | 基因表达数据，基因组变异数据 | OneK1K和eQTLGen数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 95 | 2025-10-06 |
Evidence of off-target probe binding in the 10x Genomics Xenium v1 Human Breast Gene Expression Panel compromises accuracy of spatial transcriptomic profiling
2025-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.31.646342
PMID:40236200
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研究论文 | 本研究通过开发OPT软件工具，揭示了10x Genomics Xenium v1人类乳腺癌基因表达面板中存在的脱靶探针结合问题 | 开发了首个专门检测空间转录组技术中脱靶探针结合的工具OPT，并系统评估了Xenium平台的探针特异性问题 | 研究仅针对特定版本的Xenium人类乳腺癌基因面板，结果可能不适用于其他基因面板或平台版本 | 评估10x Genomics Xenium平台探针结合的特异性，提高空间转录组数据的生物学可解释性 | 10x Genomics Xenium v1人类乳腺癌基因表达面板中的280个基因 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 探针序列比对，空间转录组分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，探针序列数据 | 来自同一肿瘤组织的多个数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | 10x Xenium, 10x Visium CytAssist, 10x Chromium | 10x Genomics Xenium v1 Human Breast Gene Expression Panel, Visium CytAssist, 3' single-cell RNA-seq |
| 96 | 2025-10-06 |
Crosstalk Signaling Between the Epithelial and Non-Epithelial Compartments of the Mouse Inner Ear
2025-Apr, Journal of the Association for Research in Otolaryngology : JARO
DOI:10.1007/s10162-025-00980-7
PMID:40080263
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索小鼠内耳前庭器官中上皮细胞与非上皮间充质细胞之间的信号串扰 | 首次在新生小鼠椭圆囊中系统揭示上皮与非上皮细胞区室间的动态信号交流，特别是间充质细胞在出生后发育中的主导信号发送作用 | 研究仅关注出生后第4天和第6天两个时间点，未能覆盖更完整的发育时间序列 | 探索内耳前庭器官发育过程中上皮与非上皮细胞区室间的相互作用机制 | 新生小鼠内耳椭圆囊细胞 | 单细胞生物学 | 前庭功能障碍 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，定量多重原位杂交 | 多种计算方法 | 单细胞转录组数据，图像数据 | 955个细胞，来自12个注释细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq | Smart-seq2 | 全长Smart-seq2单细胞RNA测序 |
| 97 | 2025-10-06 |
The dynamic and diverse nature of parenchyma cells in the Arabidopsis root during secondary growth
2025-04, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-01938-6
PMID:40140531
|
研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和谱系追踪技术，揭示了拟南芥根次生生长过程中薄壁细胞的多样性和功能动态 | 首次通过单细胞RNA测序与谱系追踪相结合的方法，重建了拟南芥根次生生长过程中的细胞发育轨迹，发现了20种先前未描述的细胞类型或状态 | 研究仅限于拟南芥根部，结果在其他植物或组织中的普适性需要进一步验证 | 探究拟南芥根次生生长过程中薄壁细胞的多样性和功能特性 | 拟南芥根部在次生生长过程中的薄壁细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 93个报告基因系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 98 | 2025-10-06 |
MYB74 transcription factor guides de novo specification of epidermal cells in the abscission zone of Arabidopsis
2025-04, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-01976-0
PMID:40181105
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了拟南芥脱落区非表皮残留细胞通过转分化形成表皮细胞的发育程序 | 首次发现MYB74转录因子指导脱落区表皮细胞的从头特化，揭示了植物通过转分化途径同时实现保护和促进生长的机制 | NA | 探究植物脱落区表皮细胞从头特化的分子机制和生物学意义 | 拟南芥脱落区的非表皮残留细胞 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 99 | 2025-10-06 |
Dissection of tumoral niches using spatial transcriptomics and deep learning
2025-Apr-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112214
PMID:40230519
|
研究论文 | 本研究开发了TG-ME计算框架，通过整合空间转录组学数据和形态学图像来解析肿瘤微环境中的生态位 | 提出结合Transformer和图变分自编码器(GraphVAE)的创新计算框架，能够同时利用空间转录组数据和形态学图像进行肿瘤生态位分析 | NA | 开发计算工具解析肿瘤微环境的空间组织结构 | 肿瘤生态位和肿瘤微环境 | 空间转录组学，深度学习 | 非小细胞肺癌 | 空间转录组学，深度学习 | Transformer，GraphVAE | 空间转录组数据，形态学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 100 | 2025-10-06 |
Progesterone signaling in oviductal epithelial cells modulates the immune response to support preimplantation embryonic development
2025-Apr-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt6113
PMID:40249812
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研究论文 | 本研究探讨孕酮信号通过调控输卵管上皮细胞免疫反应支持胚胎着床前发育的机制 | 首次揭示输卵管上皮细胞中孕酮受体通过抑制IL-22等促炎基因表达来保障胚胎正常发育的新机制 | 研究仅使用小鼠模型，人类临床适用性需进一步验证 | 阐明孕酮信号在胚胎着床前发育过程中的免疫调节作用 | 条件性敲除孕酮受体的小鼠模型及其胚胎 | 生殖生物学 | 妊娠丢失 | 单细胞RNA测序，药理学抑制，共培养实验 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，胚胎发育表型数据 | 未明确样本数量的小鼠模型和胚胎 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |