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当前共找到 716 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2026-03-14 |
Identification and validation of immune-related biomarkers and polarization types of macrophages in keloid based on bulk RNA-seq and single-cell RNA-seq analysis
2025-04, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.burns.2025.107413
PMID:39923303
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研究论文 | 本研究基于bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq分析，识别并验证了瘢痕疙瘩中免疫相关生物标志物及巨噬细胞极化类型 | 结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，利用WGCNA和三种机器学习方法识别出BMP1和IL1R1作为新型生物标志物，并揭示了瘢痕疙瘩中M2巨噬细胞显著增加而M1减少的极化异常 | 研究依赖于公共数据库数据，样本量可能有限，且实验验证仅通过WB和IF进行，需要进一步功能研究确认机制 | 识别瘢痕疙瘩的免疫相关生物标志物和巨噬细胞极化类型，为治疗提供新见解 | 瘢痕疙瘩组织样本 | 生物信息学 | 瘢痕疙瘩 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, WGCNA, 机器学习(LASSO, SVM-RFE, RF), 蛋白质印迹, 免疫荧光 | LASSO, SVM-RFE, 随机森林 | RNA-seq数据 | 多个GEO数据集(GSE83286, GSE212954, GSE92566, GSE90051)，具体样本数未明确说明 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 82 | 2026-03-13 |
Stable isotope tracing in human plasma-like medium reveals metabolic and immune modulation of the glioblastoma microenvironment
2025-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.29.542774
PMID:37398280
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研究论文 | 本研究优化了一种结合人血浆样培养基的体外稳定同位素示踪方法，用于人胶质瘤外植体和胶质瘤干细胞系，以揭示胶质母细胞瘤微环境中的代谢和免疫调控特征 | 开发了一种在生理营养水平和完整肿瘤微环境下评估胶质瘤代谢的可行方法，结合人血浆样培养基和稳定同位素示踪技术，揭示了传统培养条件中被抑制的代谢和免疫程序 | 该方法仍为体外模型，可能无法完全模拟体内复杂的生理和免疫相互作用 | 研究胶质瘤在完整肿瘤微环境下的代谢特征及其与免疫微环境的相互作用 | 人胶质瘤外植体和胶质瘤干细胞系 | 代谢组学 | 胶质母细胞瘤 | 稳定同位素示踪技术、空间转录组学 | NA | 代谢数据、转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 83 | 2026-03-06 |
The dynamic immune behavior of primary and metastatic ovarian carcinoma
2025-Apr-25, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00818-8
PMID:40281242
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研究论文 | 本研究结合单细胞测序和空间转录组学，探索高级别浆液性卵巢癌中导致免疫抑制的分子机制 | 首次结合单细胞测序与空间转录组学技术，系统比较原发性与转移性卵巢癌的免疫微环境动态变化，并揭示上皮细胞与免疫细胞间的交互作用在免疫抑制中的关键角色 | 研究未明确说明样本量大小，且可能仅限于高级别浆液性卵巢癌亚型，未涵盖其他卵巢癌类型 | 揭示高级别浆液性卵巢癌免疫抑制的分子机制，为免疫调节药物临床试验设计提供依据 | 高级别浆液性卵巢癌患者的原发性肿瘤和网膜转移肿瘤 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 84 | 2026-03-06 |
SORBET: Automated cell-neighborhood analysis of spatial transcriptomics or proteomics for interpretable sample classification via GNN
2025-Apr-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.30.573739
PMID:38260586
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研究论文 | 本文介绍了SORBET，一种几何深度学习框架，用于分析空间转录组学或蛋白质组学数据，通过图卷积网络进行可解释的样本分类 | SORBET是首个在空间转录组学数据上进行表型预测的示例，利用新颖的数据增强技术和定制可解释性分析，无需将完整细胞谱压缩为有限注释 | NA | 开发一种自动化细胞邻域分析框架，以整合空间信息与多重分子数据，准确预测表型，如免疫治疗反应 | 转移性黑色素瘤、非小细胞肺癌和结直肠癌样本 | 机器学习 | 黑色素瘤, 非小细胞肺癌, 结直肠癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | 图卷积网络(GCN) | 空间转录组学数据, 空间蛋白质组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | CosMx, Imaging Mass Cytometry (IMC), Co-detection by indexing (CODEX) | CosMx空间转录组学数据集, Imaging Mass Cytometry (IMC)和CODEX空间蛋白质组学数据集 |
| 85 | 2026-03-06 |
Mapping dynamic regulation of gene expression using single-cell transcriptomics and application to complex disease genetics
2025-Apr-10, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2024.100397
PMID:39741416
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研究论文 | 本研究开发了一种基于单细胞转录组学的遗传模型，用于量化基因表达的动态遗传调控及其细胞类型特异性，并应用于精神分裂症等复杂疾病遗传学分析 | 开发了细胞类型特异性和细胞状态调整的基因表达遗传模型，能够量化基因表达的动态遗传调控并评估其细胞类型特异性，为复杂疾病机制提供新见解 | NA | 利用单细胞转录组学数据揭示遗传变异如何影响人类生理和疾病相关的生物过程，并应用于复杂疾病遗传学研究 | 诱导多能干细胞分化为中脑神经元的单细胞转录组数据，以及英国生物库中超过1,500种表型数据 | 自然语言处理 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 86 | 2026-03-06 |
An expandable synthetic library of human paired antibody sequences
2025-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012932
PMID:40258041
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研究论文 | 本文介绍了IgHuAb，一种用于高通量生成配对人类抗体序列的大型语言模型，并基于此创建了模拟自然抗体序列特征的合成抗体库SynAbLib | 开发了首个基于大型语言模型的高通量配对人类抗体序列生成方法，并构建了具有更高序列多样性的合成抗体库 | 未提及具体实验验证的抗体数量或功能活性数据 | 解决当前单细胞测序方法在配对抗体序列数据获取中的低通量和高成本问题，以更好地理解人类抗体序列的潜在多样性 | 人类抗体序列 | 自然语言处理 | NA | 单细胞测序 | 大型语言模型 | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 87 | 2026-03-02 |
STAT3 signaling enhances tissue expansion during postimplantation mouse development
2025-Apr-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115506
PMID:40188437
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研究论文 | 本研究探讨了STAT3信号在小鼠胚胎植入后发育过程中对组织扩张的增强作用 | 揭示了STAT3在胚胎植入后发育中的时间控制作用，特别是在需要快速细胞分裂的组织中，如植入后外胚层和造血谱系 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性仅通过突变与矮小症的关联间接提及 | 研究STAT3信号在小鼠胚胎植入后发育过程中的功能 | 小鼠胚胎、胚胎干细胞、植入后外胚层和造血谱系 | 发育生物学 | NA | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 小鼠胚胎和胚胎干细胞样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 88 | 2026-03-02 |
Single cell RNA sequencing after moderate traumatic brain injury: effects of therapeutic hypothermia
2025-Apr-18, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03430-6
PMID:40251570
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探究了中度创伤性脑损伤后治疗性低温对脑皮层细胞类型特异性转录反应的影响 | 首次在创伤性脑损伤模型中应用单细胞RNA测序技术，全面评估治疗性低温对不同细胞亚型的特异性调控作用，揭示了温度敏感的胶质细胞和血管细胞过程在神经保护中的重要性 | 研究仅关注了损伤后24小时的时间点，未评估长期效应；样本来源于小鼠模型，可能无法完全反映人类疾病情况 | 探究治疗性低温在创伤性脑损伤后的细胞类型特异性保护机制 | C57BL/6小鼠的脑皮层组织，包括损伤周围区域 | 单细胞转录组学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | C57BL/6小鼠的脑皮层组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2026-03-02 |
EcDNA-borne PVT1 fusion stabilizes oncogenic mRNAs
2025-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.01.646515
PMID:40236070
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研究论文 | 本研究揭示了染色体外DNA（ecDNA）扩增通过结构变异产生基因融合，特别是PVT1与致癌基因的融合，增强RNA稳定性并促进癌症进展 | 首次发现ecDNA上的PVT1融合通过SRSF1蛋白相互作用稳定致癌mRNA，并证明其在MYC成瘾癌症模型中的关键作用 | 未明确提及具体癌症类型或样本量限制，机制细节可能需进一步验证 | 探究ecDNA结构变异如何通过基因融合驱动癌症发展 | 人类癌症中的染色体外DNA（ecDNA）及其基因融合事件 | 基因组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组和转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 90 | 2026-03-02 |
Timing neural development and regeneration
2025-Apr, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2025.102976
PMID:40010202
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综述 | 本文综述了哺乳动物神经祖细胞时间身份调控机制的最新进展，及其在胶质细胞向神经元重编程策略中的潜在应用 | 整合时间身份调控与促神经因子过表达以增强重编程效率和扩展神经元亚型生成谱系 | NA | 探讨神经祖细胞时间身份的调控机制及其在神经发育与再生治疗中的应用 | 哺乳动物中枢神经系统中的神经祖细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2026-03-01 |
Mutual Regulation of Cardiovascular and Hematopoietic Development
2025-Apr-22, Current cardiology reports
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s11886-025-02236-5
PMID:40261519
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综述 | 本文探讨了心血管与造血系统在发育中的相互调控关系，特别聚焦于心内膜造血这一进化保守过程及其在心脏发育和巨噬细胞形成中的作用 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了心内膜细胞具有独立于已知造血器官的内在造血程序，并阐明了心内膜来源巨噬细胞在心脏形态发生中的独特贡献 | NA | 探讨心血管与造血系统发育的分子机制和调控相互作用 | 心内膜造血过程、心脏发育、巨噬细胞形成 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2026-02-19 |
Identifiability for Gaussian Processes with Holomorphic Kernels
2025-Apr, ... International Conference on Learning Representations
PMID:41695776
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研究论文 | 本文为在零附近全纯的高斯过程核开发了一个新的理论框架，以确定核参数的可识别性 | 针对在零附近全纯的核（如平方指数核、周期核和有理二次核及其组合），开发了一个新的理论框架来研究其参数可识别性，填补了现有研究主要关注Matérn型核的空白 | NA | 确定高斯过程核参数的可识别性，以支持参数在应用中的有意义的解释 | 高斯过程的核参数，特别是那些在零附近全纯的核 | 机器学习 | NA | NA | 高斯过程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 93 | 2026-02-15 |
Loss of ATG7 in microglia impairs UPR, triggers ferroptosis, and weakens amyloid pathology control
2025-Apr-07, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230173
PMID:39945772
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研究论文 | 本研究探讨了在阿尔茨海默病小鼠模型中，特异性敲除小胶质细胞的Atg7基因如何通过影响未折叠蛋白反应和氧化应激，导致铁死亡，从而削弱对淀粉样斑块的控制 | 揭示了Atg7缺失通过降低未折叠蛋白反应和增加氧化应激，在小胶质细胞中诱导铁死亡的新机制，特别是在淀粉样斑块存在的蛋白毒性压力下 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；且未详细探讨Atg7缺失在其他神经退行性疾病中的普遍性 | 探究Atg7在小胶质细胞中对淀粉样斑块控制的作用机制 | 阿尔茨海默病小鼠模型中的小胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、生化分析、免疫荧光分析 | NA | RNA测序数据、生化数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 94 | 2026-02-12 |
The transcription factor HHEX maintains glucocorticoid levels and protects adrenals from androgen-induced lipid depletion
2025-Apr-15, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6248794/v1
PMID:40321776
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序解析了肾上腺皮质类固醇生成谱系的转录组，并发现转录因子HHEX在维持糖皮质激素水平和保护肾上腺免受雄激素诱导的脂质耗竭中起关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别HHEX为糖皮质激素生成细胞中最富集的转录因子，并揭示其在肾上腺性别二态性和脂质代谢调控中的多功能作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类肾上腺中的具体机制尚未完全阐明 | 探究维持肾上腺皮质细胞差异响应能力的分子机制 | 肾上腺皮质糖皮质激素生成细胞（zona fasciculata） | 单细胞组学 | 肾上腺功能障碍 | scRNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 使用报告基因小鼠的肾上腺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 95 | 2026-02-07 |
Single cell RNA sequencing of haematopoietic cells in fresh and frozen human atheroma tissue
2025-Apr-29, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf014
PMID:39907372
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了新鲜和冷冻保存的人类动脉粥样硬化斑块组织中造血细胞的活性和转录组谱 | 首次评估了冷冻保存对脆弱和坏死动脉粥样硬化组织在单细胞RNA测序分析中的可行性，证明了冷冻保存可作为生物样本库的可行方法 | 颈动脉样本中缺失LYVE1+巨噬细胞，可能由于动脉内膜切除术中丢失外膜层；冷冻保存轻微影响细胞完整性，导致线粒体RNA相对丰度增加 | 确定冷冻保存是否影响动脉粥样硬化组织中造血细胞的活性和转录组谱，以支持大规模生物样本库的建立 | 人类动脉粥样硬化斑块组织中的造血细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5对新鲜和冷冻保存的动脉粥样硬化样本（3个来自冠状动脉，2个来自颈动脉） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Genomics scRNA-seq workflow | 10× Genomics单细胞RNA测序工作流程 |
| 96 | 2026-02-03 |
A replication study of novel fetal hemoglobin-associated genetic variants in sickle cell disease-only cohorts
2025-Apr-06, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf015
PMID:39886999
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研究论文 | 本研究验证了在镰状细胞病（SCD）患者中，胎儿血红蛋白（HbF）水平与五个新基因位点（ASB3、BACH2、PFAS、ZBTB7A和KLF1）的遗传变异之间的关联，并利用CRISPR抑制和单细胞转录组学技术探索了这些非编码变异在调控β-珠蛋白基因表达中的功能 | 首次在独立的SCD队列中复制了先前GWAS发现的20个HbF相关新变异中的五个，并利用CRISPR抑制和单细胞转录组学技术验证了BACH2和KLF1位点非编码变异的功能性作用 | 未能通过全外显子组测序在SCD患者中鉴定出对HbF水平有显著影响的罕见遗传变异 | 验证镰状细胞病（SCD）患者中胎儿血红蛋白（HbF）水平与新基因位点的遗传关联，并探索这些变异的功能机制 | 镰状细胞病（SCD）患者，具体包括3740名SCD患者用于遗传关联验证，以及1354名SCD患者用于全外显子组分析，同时使用红细胞系HUDEP-2细胞进行功能研究 | 遗传学 | 镰状细胞病 | 全基因组关联研究（GWAS）、CRISPR抑制、单细胞转录组学、全外显子组测序 | NA | 遗传变异数据、转录组数据、外显子组序列数据 | 3740名SCD患者用于遗传关联验证，1354名SCD患者用于全外显子组分析 | NA | 单细胞转录组学、全外显子组测序 | NA | NA |
| 97 | 2026-02-02 |
Periductal fibroblasts participate in liver homeostasis, fibrosis, and tumorigenesis
2025-Apr-07, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20232123
PMID:39888328
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了肝脏中Cd34+和Dpt+成纤维细胞在肝脏稳态、纤维化和肝内胆管癌中的不同作用 | 首次利用Cd34-CreER和Dpt-CreER正交组合，系统解析了肝脏中不同位置成纤维细胞的命运，明确了导管周围成纤维细胞在肝脏稳态和肿瘤进展中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类肝脏成纤维细胞的功能可能有所不同，且具体分子机制仍需进一步探索 | 探究肝脏成纤维细胞在生理和病理状态下的功能差异 | 小鼠肝脏中的Cd34+和Dpt+成纤维细胞 | 单细胞组学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，但涉及小鼠肝脏成纤维细胞的多组分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 98 | 2026-02-02 |
GLS as a Key Cuproptosis-Related Gene in Periodontitis: Insights from Single-Cell RNA Sequencing
2025-Apr, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2024.10.001
PMID:39428264
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和生物信息学分析，探讨了铜死亡相关基因在牙周炎中的作用，并发现GLS是关键的铜死亡相关基因 | 首次整合单细胞RNA测序和生物信息学分析来研究牙周炎中的铜死亡相关基因，并识别出GLS作为关键基因在免疫细胞中广泛表达且与牙周组织免疫细胞网络密切相关 | 研究基于公开数据集GSE10334进行分析，样本来源和数量可能有限，且主要依赖生物信息学预测，需要进一步的实验验证 | 阐明铜死亡与牙周炎之间的关联，并识别关键的铜死亡相关基因 | 牙周炎患者组织样本中的基因表达数据 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析，LASSO回归，逻辑回归分析 | LASSO回归，逻辑回归 | 基因表达数据 | 基于GSE10334数据集，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 99 | 2026-01-24 |
A Multi-omics approach to identify and validate shared genetic architecture in rheumatoid arthritis, multiple sclerosis, and type 1 diabetes: integrating GWAS, GEO, MSigDB, and scRNA-seq data
2025-Apr-21, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01598-x
PMID:40254686
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研究论文 | 本研究采用多组学方法，整合GWAS、GEO、MSigDB和scRNA-seq数据，识别并验证了类风湿关节炎、多发性硬化症和1型糖尿病之间的共享遗传结构，揭示了ROMO1作为关键共享遗传成分及其在单核细胞中的调控作用 | 首次通过整合多组学数据（包括GWAS、bulk RNA-seq、scRNA-seq和GEO数据）系统性地识别并验证了ROMO1作为RA、MS和T1D三种自身免疫疾病的共享遗传成分，并阐明了其通过ROS通路和单核细胞表位调控的潜在机制 | 研究主要基于生物信息学分析和公开数据库数据，缺乏实验验证；样本来源和数量可能存在异质性；ROS通路的具体调控机制仍需进一步探究 | 揭示类风湿关节炎、多发性硬化症和1型糖尿病三种自身免疫疾病之间的共享遗传结构及其分子机制 | 类风湿关节炎、多发性硬化症和1型糖尿病患者及健康对照的遗传和转录组数据 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | GWAS, bulk RNA-seq, scRNA-seq, 差异基因表达分析, LASSO回归, GSEA, ROC分析, 免疫浸润分析, 孟德尔随机化分析 | LASSO回归, GSEA, ROC分析, 孟德尔随机化 | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 100 | 2026-01-16 |
Prior chemotherapy deteriorates T-cell quality for CAR T-cell therapy in B-cell non-Hodgkin's lymphoma
2025-Apr-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010709
PMID:40210237
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研究论文 | 本研究评估了化疗对B细胞非霍奇金淋巴瘤患者T细胞功能的影响，发现化疗会降低T细胞质量，从而影响CAR T细胞疗法的效果 | 首次通过多参数流式细胞术、单细胞RNA测序和全基因组DNA甲基化阵列综合分析化疗对T细胞功能的影响，为优化CAR T细胞疗法提供了新见解 | 样本量相对较小，且仅针对B细胞非霍奇金淋巴瘤患者，结果可能不适用于其他癌症类型 | 评估化疗对T细胞功能的影响，以优化CAR T细胞疗法的效果 | B细胞非霍奇金淋巴瘤患者的T细胞 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 多参数流式细胞术, 单细胞RNA测序, 全基因组DNA甲基化阵列, 体外功能测试 | NA | 细胞, 基因表达数据, 甲基化数据 | 两个患者队列（治疗前和治疗后），具体样本数未明确 | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组DNA甲基化阵列 | NA | NA |