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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-06 |
Skin organoid transplantation promotes tissue repair with scarless in frostbite
2025-Apr-18, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwae055
PMID:39363875
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研究论文 | 本研究通过构建皮肤类器官移植系统,探索其在冻伤修复中促进无疤痕愈合的作用机制 | 首次将hiPSC来源的皮肤类器官与明胶水凝胶结合用于冻伤治疗,并发现其通过调控整合素α5β1-FAK通路减少成纤维细胞向肌成纤维细胞转化 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人体进行验证 | 开发促进冻伤无疤痕愈合的新型治疗方法 | 冻伤小鼠模型、人类诱导多能干细胞来源的皮肤类器官 | 组织工程 | 冻伤 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2025-10-06 |
RUNX2 promotes fibrosis via an alveolar-to-pathological fibroblast transition
2025-Apr, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08542-2
PMID:39910313
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了RUNX2在肺纤维化中通过肺泡成纤维细胞向病理性成纤维细胞转化促进纤维化的机制 | 首次发现LEPR成纤维细胞中的SCUBE2肺泡成纤维细胞是CTHRC1+POSTN+病理性成纤维细胞的主要来源,并证实RUNX2是调控纤维化基因表达的关键因子 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探索肺纤维化中病理性成纤维细胞的来源及其调控机制 | 小鼠肺组织中的成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | scRNA-seq, scATAC-seq, 基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 两种肺纤维化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 63 | 2025-10-06 |
The role of TIGIT-CD226-PVR axis in mediating T cell exhaustion and apoptosis in NSCLC
2025-04, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-02052-2
PMID:39725799
|
研究论文 | 本研究探讨TIGIT-CD226-PVR信号轴在非小细胞肺癌中调控T细胞耗竭和凋亡的作用机制 | 首次系统揭示TIGIT-CD226-PVR信号轴在CD27+/CD127+T细胞亚群中的调控作用及其与免疫治疗疗效的关联 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中得到验证 | 探索TIGIT-CD226-PVR信号轴在非小细胞肺癌T细胞耗竭和凋亡中的调控机制 | 非小细胞肺癌小鼠模型中的CD27+/CD127+T细胞 | 免疫肿瘤学 | 肺癌 | 单细胞测序技术、生物信息学分析、体外实验、体内研究 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 64 | 2025-10-06 |
Targeted editing of CCL5 with CRISPR-Cas9 nanoparticles enhances breast cancer immunotherapy
2025-04, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-02032-6
PMID:39870938
|
研究论文 | 本研究利用CRISPR-Cas9纳米颗粒靶向编辑CCL5基因以增强乳腺癌免疫治疗效果 | 首次将CRISPR-Cas9技术与FCPCV纳米颗粒结合用于乳腺癌免疫治疗,通过靶向编辑CCL5基因改善肿瘤免疫微环境 | 研究主要基于小鼠模型,尚未进行人体临床试验 | 开发新型乳腺癌免疫治疗策略 | 乳腺癌细胞和人源化小鼠模型 | 基因编辑与免疫治疗 | 乳腺癌 | CRISPR-Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 65 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell sequencing and machine learning to uncover the role of mitophagy in subtyping and prognosis of esophageal cancer
2025-04, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-02061-1
PMID:39948301
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和机器学习方法,探索线粒体自噬在食管癌亚型分型和预后中的作用 | 首次将线粒体自噬相关基因与食管癌分子分型相结合,并利用机器学习算法识别核心基因构建预后模型 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 阐明线粒体自噬在食管癌中的分子机制并开发预后预测模型 | 食管癌患者 | 机器学习 | 食管癌 | RNA测序,单细胞测序 | LASSO回归,随机森林,XGBoost,多元COX回归 | 基因表达数据 | TCGA数据库中的食管癌患者数据及两个外部验证队列 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 66 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals sex differences in the subcellular composition and associated gene-regulatory network activity of human carotid plaques
2025-Apr, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00628-y
PMID:40211055
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类颈动脉斑块在亚细胞组成和基因调控网络活性方面的性别差异 | 首次在单细胞水平系统揭示颈动脉斑块中性别特异的细胞表型和基因调控网络差异 | 样本量相对有限,仅分析了7,690个细胞 | 探究颈动脉斑块形成中的性别差异机制 | 人类颈动脉斑块细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7,690个颈动脉斑块细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2025-10-06 |
Excitatory synaptic transmission is differentially modulated by opioid receptors along the claustro-cingulate pathway
2025-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.31.646444
PMID:40236172
|
研究论文 | 本研究探讨阿片受体在CLA-ACC神经通路中对兴奋性突触传递的调控机制 | 首次揭示KOR、MOR和DOR阿片受体在扣带皮层-屏状核通路中对兴奋性突触传递的差异化调控作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在更高阶物种中验证 | 阐明阿片受体在扣带皮层-屏状核神经环路中对谷氨酸能信号传递的调控机制 | 小鼠扣带皮层第五层锥体神经元和屏状核神经元 | 神经科学 | 疼痛感知障碍 | 空间转录组学, 脑片电生理学, 光遗传学, 药理学方法 | NA | 电生理信号, 基因表达数据 | 小鼠脑组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 68 | 2025-10-06 |
AI-based phenotyping of hepatic fiber morphology to inform molecular alterations in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2025-Apr-22, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001360
PMID:40262132
|
研究论文 | 本研究利用人工智能技术对代谢功能障碍相关脂肪性肝病中的肝纤维形态进行表型分析,并探索其与分子改变的关系 | 开发了基于AI的FibroNest算法量化肝纤维形态表型,首次将纤维形态表型与空间单细胞转录组分析相结合揭示MASLD发病机制 | 样本量相对有限(94例活检样本),其中仅13%伴有HCC,需要更大样本验证 | 全面表征MASLD中肝纤维形态表型及其相关分子改变 | 94例MASLD患者的肝活检样本,其中12例并发肝细胞癌 | 数字病理学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 全基因组转录组学,空间单细胞转录组,体外实验 | AI算法(FibroNest) | 组织图像,转录组数据,空间转录组数据 | 94例MASLD肝活检样本 | Nanostring | 空间单细胞转录组 | CosMx | CosMx空间分子成像平台 |
| 69 | 2025-10-06 |
Identification and characterization of early human photoreceptor states and cell-state-specific retinoblastoma-related features
2025-Apr-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.02.28.530247
PMID:38915659
|
研究论文 | 通过全长单细胞RNA测序识别早期人类光感受器状态及视网膜母细胞瘤相关特征 | 首次揭示未解决的感光细胞前体状态,发现早期锥细胞前体内在基因表达在视网膜母细胞瘤起始中的作用 | NA | 理解人类锥感光细胞与杆细胞的发育差异及其在视网膜母细胞瘤发生中的作用 | 人类锥感光细胞和杆感光细胞的发育状态 | 单细胞基因组学 | 视网膜母细胞瘤 | 全长单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 70 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial genomic landscape of non-small cell lung cancer brain metastases
2025-Apr, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-03530-z
PMID:40016452
|
研究论文 | 通过多模态单细胞测序和空间转录组学揭示非小细胞肺癌脑转移的基因组景观 | 首次在初治NSCLC患者中整合单核RNA/T细胞受体测序、单细胞空间转录组和全基因组测序,发现染色体不稳定性是脑转移的显著特征 | 样本量相对有限,需要更大规模验证 | 探索非小细胞肺癌脑转移的生物学机制 | 非小细胞肺癌患者的脑转移灶和原发肿瘤 | 数字病理学 | 肺癌 | 单核RNA测序, T细胞受体测序, 单细胞空间转录组学, 全基因组测序, 多重免疫荧光 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | 初治NSCLC患者样本(具体数量未明确)+ 4,869名独立患者验证队列 + 12,275名NSCLC患者新队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 全基因组测序 | NA | NA |
| 71 | 2025-10-06 |
Activated polyreactive B cells are clonally expanded in autoantibody positive and patients with recent-onset type 1 diabetes
2025-Apr-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115425
PMID:40117290
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析揭示1型糖尿病患者中胰岛抗原反应性B细胞的基因表达和BCR谱系变化 | 首次在1型糖尿病中发现胰岛抗原反应性B细胞存在克隆扩增和多反应性特征 | 样本量有限,仅分析了外周血中的B细胞而未直接研究胰腺组织 | 探究1型糖尿病中自身反应性B细胞的表型和功能特征 | 非糖尿病自身抗体阴性一级亲属、自身抗体阳性者和新发1型糖尿病供者的外周血胰岛抗原反应性B细胞 | 单细胞基因组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序, BCR测序 | NA | 单细胞转录组数据, B细胞受体序列数据 | 来自三类供者群体的外周血B细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 72 | 2025-10-06 |
SIGMAR1 screened by a GPCR-related classifier regulates endoplasmic reticulum stress in bladder cancer
2025-Apr-10, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06393-7
PMID:40211230
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研究论文 | 本研究通过构建GPCR-TME分类器筛选出SIGMAR1,并验证其在膀胱癌中通过调节内质网应激影响肿瘤进展的机制 | 首次构建膀胱癌相关的GPCR-TME分类器,并发现SIGMAR1通过调节内质网应激影响膀胱癌进展的新机制 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多独立队列验证GPCR-TME分类器的临床应用价值 | 探究GPCR相关基因在膀胱癌中的作用机制,特别是SIGMAR1对内质网应激的调控功能 | 膀胱癌患者数据、膀胱癌细胞系、裸鼠移植瘤模型 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 免疫治疗反应分析, 蛋白质印迹, 基因集富集分析, CIBERSORT免疫细胞浸润分析 | GPCR-TME分类器 | 批量测序数据, 单细胞RNA测序数据, 临床病理数据 | 从公共数据库获取的多组膀胱癌数据集,包含细胞系和组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 73 | 2025-10-06 |
Mapping Small Extracellular Vesicle Secretion Potential in Healthy Human Gingiva Using Spatial Transcriptomics
2025-Apr-07, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47040256
PMID:40699655
|
研究论文 | 利用空间转录组学技术绘制健康人牙龈组织中小细胞外囊泡分泌潜力的空间分布图谱 | 首次在sEVs生物发生特定背景下对可用牙龈转录组数据进行荟萃分析,揭示了沟内上皮浅层和深层是sEVs相关基因表达最富集的区域 | 研究基于公开转录组数据,未进行实验验证;仅分析了43个已知sEVs生物发生相关基因中的12个 | 探索健康人牙龈组织中不同结构在小细胞外囊泡生物发生中的作用 | 健康人牙龈组织 | 空间转录组学 | 口腔组织再生 | 空间转录组学,基因本体分析 | NA | 转录组数据,空间基因表达数据 | 公开可用的牙龈转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 74 | 2025-10-06 |
A systematic review of single-cell RNA sequencing applications and innovations
2025-Apr, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
综述 | 本文系统综述了单细胞RNA测序技术的应用与创新,重点关注胰岛细胞研究 | 全面总结了scRNA-seq在理解细胞类型、基因活性和细胞相互作用方面的最新进展 | 作为综述文章,不包含原始实验数据,主要基于现有文献分析 | 系统评估单细胞RNA测序技术的应用、创新和挑战 | 胰岛细胞及复杂组织中的细胞多样性 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 75 | 2025-10-06 |
Adipose-derived leptin and complement factor D mediate osteoarthritis severity and pain
2025-Apr-25, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt5915
PMID:40279436
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研究论文 | 本研究揭示了脂肪源性瘦素和补体因子D在骨关节炎严重程度和疼痛中的关键作用 | 首次通过脂肪营养不良小鼠模型证实脂肪-关节信号交流的存在,并发现瘦素通过调控补体因子D影响骨关节炎表型 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究肥胖相关脂肪因子在骨关节炎发病机制中的具体作用 | 脂肪营养不良小鼠模型、脂肪组织植入物、关节组织 | 骨科学 | 骨关节炎 | 空间转录组学、全局无监督多组学分析 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 76 | 2025-10-06 |
Novel insights into kidney disease: the scRNA-seq and spatial transcriptomics approaches: a literature review
2025-Apr-08, BMC nephrology
IF:2.2Q2
DOI:10.1186/s12882-025-04103-5
PMID:40200175
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文献综述 | 本文综述了单细胞RNA测序与空间转录组学在肾脏疾病研究中的应用与发展 | 整合单细胞RNA测序与空间转录组学技术,以前所未有的分辨率解析肾脏微环境中细胞亚群的动态相互作用 | NA | 总结单细胞RNA测序与空间转录组学在肾脏疾病研究中的应用价值 | 肾脏疾病相关的细胞异质性和空间组织 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 77 | 2025-10-06 |
USP4 depletion-driven RAB7A ubiquitylation impairs autophagosome-lysosome fusion and aggravates periodontitis
2025-04, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2024.2429371
PMID:39663592
|
研究论文 | 本研究揭示了USP4缺失通过介导RAB7A泛素化破坏自噬体-溶酶体融合,从而加剧牙周炎发病机制 | 首次发现USP4通过调控RAB7A泛素化状态影响自噬体-溶酶体融合在牙周炎中的作用机制 | NA | 阐明自噬与牙周炎发病机制之间的分子调控网络 | 临床牙龈组织样本、实验性牙周炎小鼠模型、巨噬细胞 | 分子生物学 | 牙周炎 | 基因组学分析、组织学分析、蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、组织学数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2025-10-06 |
A simplified preparation method for single-nucleus RNA-sequencing using long-term frozen brain tumor tissues
2025-Apr-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-97053-9
PMID:40229354
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研究论文 | 开发了一种适用于长期冷冻脑肿瘤组织的简化单核RNA测序制备方法 | 优化了从长期冷冻儿科神经胶质瘤组织中分离完整细胞核的方法,并改进了3'测序文库以包含更短的RNA片段 | 主要针对冷冻脑肿瘤组织,对其他组织类型的适用性需进一步验证 | 开发适用于冷冻组织的单核RNA测序方法 | 儿科神经胶质瘤组织 | 单细胞测序 | 脑肿瘤 | 单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单核RNA测序 | NA | 适用于液滴基和板基单细胞测序平台 |
| 79 | 2025-10-06 |
Long-lasting B cell convergence to distinct broadly reactive epitopes following vaccination with chimeric influenza virus hemagglutinins
2025-Apr-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.02.025
PMID:40132593
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研究论文 | 通过单细胞测序分析嵌合血凝素疫苗诱导的B细胞应答特性 | 首次结合单细胞RNA测序和B细胞受体 repertoire 测序分析cHA疫苗诱导的B细胞特异性、功能和亚群 | 仅为一期临床试验结果,样本量有限 | 评估嵌合血凝素疫苗诱导的B细胞应答特性 | 疫苗接种后的人类B细胞 | 免疫学 | 流感 | 单细胞RNA测序, B细胞受体 repertoire 测序 | NA | 单细胞转录组数据, B细胞受体序列数据 | 一期临床试验参与者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 80 | 2025-10-06 |
Expansion of OSMR expression and signaling in the human dorsal root ganglion links OSM to neuropathic pain
2025-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.26.645611
PMID:40236060
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研究论文 | 本研究揭示了OSM-OSMR信号通路在人类背根神经节中的表达扩展及其与神经病理性疼痛的关联 | 发现人类背根神经节中OSMR表达的物种特异性扩展,证明OSM通过MAPK信号直接激活感觉神经元并诱导疼痛相关转录组特征 | 研究主要基于体外实验和转录组分析,需要进一步体内验证 | 探究OSM-OSMR信号通路在神经病理性疼痛中的作用机制 | 人类背根神经节组织和神经元 | 神经科学 | 神经病理性疼痛 | RNA测序,原位杂交,免疫组织化学,膜片钳电生理,CRISPR编辑 | NA | 转录组数据,电生理数据,图像数据 | 神经病理性疼痛患者的背根神经节样本 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |