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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-05 |
Niche Macrophages Recycle Iron to Tumor Cells and Foster Erythroblast Mimicry to Promote Bone Metastasis and Anemia
2025-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.23.650120
PMID:41031013
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研究论文 | 本研究揭示了骨髓转移微环境中巨噬细胞通过铁循环促进肿瘤生长和贫血的新机制 | 发现VCAM1+CD163+CCR3+巨噬细胞在骨转移微环境中被肿瘤细胞劫持用于铁获取,并首次报道肿瘤细胞通过模仿红系细胞产生血红蛋白的适应性机制 | 人类样本验证仍需进一步扩展,具体分子调控通路需要更深入研究 | 探究骨转移与贫血之间的机制联系及肿瘤微环境中细胞互作 | 骨髓转移微环境中的巨噬细胞、肿瘤细胞和红系细胞 | 单细胞生物学 | 乳腺癌骨转移 | 单细胞RNA测序, 微环境标记 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 62 | 2025-10-05 |
Tumor-derived arachidonic acid reprograms neutrophils to promote immune suppression and therapy resistance in triple-negative breast cancer
2025-Apr-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.03.002
PMID:40157359
|
研究论文 | 本研究揭示了三阴性乳腺癌细胞通过释放含花生四烯酸的细胞外囊泡重编程中性粒细胞,导致免疫抑制和治疗抵抗的机制 | 首次发现肿瘤细胞脂质积累通过细胞外囊泡介导的中性粒细胞重编程促进免疫抑制和治疗抵抗 | 人类患者数据仅为相关性分析,需要进一步验证机制 | 探究三阴性乳腺癌获得性免疫治疗抵抗的机制 | 三阴性乳腺癌细胞和中性粒细胞 | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 63 | 2025-10-05 |
Annexin A1 regulates inflammatory-immune response and reduces pancreatic and extra- pancreatic injury during severe acute pancreatitis
2025-Apr, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00321-x
PMID:40025269
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研究论文 | 本研究探讨了Annexin A1在重症急性胰腺炎中调节炎症免疫反应及减轻胰腺和胰腺外损伤的作用 | 首次系统揭示Anxa1在髓系细胞中的动态表达调控及其在重症急性胰腺炎中的保护机制,并证明其衍生肽Ac2-26的治疗潜力 | 研究主要基于动物模型,尚未在人体临床试验中验证 | 阐明Annexin A1在急性胰腺炎炎症免疫反应中的调控作用 | 髓系细胞、胰腺组织及肺肝肾等胰腺外器官 | 病理生理学 | 急性胰腺炎 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、基因表达分析 | 动物模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | 多种动物模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 64 | 2025-10-05 |
p63 co-opts the skin Krt8-to-Krt5 transition for enamel organ development
2025-Apr-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.11.637463
PMID:39990386
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了p63在釉质器官发育中调控Krt8向Krt5过渡的机制 | 首次发现p63在釉质器官发育中借用皮肤发育的Krt8-to-Krt5过渡机制 | 研究仅基于小鼠切牙模型,早期p63敲除小鼠的发育停滞限制了更全面功能研究 | 探究p63在釉质器官细胞分化中的具体作用机制 | 小鼠切牙釉质器官上皮细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 轨迹重建, 比较转录组分析, 染色质可及性分析 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 小鼠切牙样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 65 | 2025-10-05 |
3D spatial transcriptomics reveals the molecular structure of input and output pathways in the mouse olfactory bulb
2025-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.19.639192
PMID:40060607
|
研究论文 | 利用3D空间转录组学技术重建小鼠嗅球的解剖和分子组织,揭示嗅觉通路的分子结构 | 首次使用3D空间转录组学技术绘制了嗅球的全面分子图谱,揭示了嗅球对称性组织的新原理 | 研究仅限于小鼠模型,未在其他物种中验证 | 研究脊椎动物大脑对称性组织的分子基础 | 小鼠嗅球组织 | 空间转录组学 | NA | 3D空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 近一千个分子特征不同的肾小球 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 66 | 2025-10-05 |
Machine learning integration of single-cell and bulk transcriptomics identifies fibroblast-driven prognostic markers in colorectal cancer
2025-Apr-22, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2025.12038
PMID:40266079
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组数据,识别结直肠癌中成纤维细胞驱动的预后标志物 | 首次通过机器学习整合单细胞和批量转录组数据,构建了七基因成纤维细胞相关预后特征 | 研究样本量相对有限,需要在更多独立队列中验证 | 开发结直肠癌的预后生物标志物和个性化治疗策略 | 结直肠癌肿瘤微环境中的成纤维细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 机器学习整合方法 | 基因表达数据 | 306个CRC样本(448,255个细胞),TCGA-COAD队列351例,GSE17536数据集177例 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 67 | 2025-10-05 |
Rare Subset of T Cells Form Heterotypic Clusters with Circulating Tumor Cells to Foster Cancer Metastasis
2025-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.01.646421
PMID:40236049
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研究论文 | 本研究揭示了一种罕见的CD4和CD8双阳性T细胞通过与循环肿瘤细胞形成异质性簇促进癌症转移的新机制 | 首次发现罕见的CD4/CD8双阳性T细胞在CTC-WBC簇中显著富集,并鉴定VLA4-VCAM1相互作用是簇形成的关键介质 | 研究主要基于晚期乳腺癌患者样本,需要验证是否适用于其他癌症类型和早期患者 | 探索外周血免疫细胞与循环肿瘤细胞的相互作用机制及其在癌症转移中的作用 | 晚期乳腺癌患者的血液样本和临床前小鼠模型 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 流式细胞术, ImageStream分析, 单细胞RNA测序, 基因扰动研究 | NA | 血液样本, 测序数据, 图像数据 | 1,529例乳腺癌患者血液标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 68 | 2025-10-05 |
High-resolution reconstruction of cell-type specific transcriptional regulatory processes from bulk sequencing samples
2025-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.02.646189
PMID:40291712
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研究论文 | 提出一种名为DeepDETAILS的新型深度学习框架,能够从批量测序样本中高分辨率重建细胞类型特异性转录调控过程 | 开发了基于深度学习的跨模态反卷积方法,可利用scATAC-seq参考库对其他批量组学数据集进行细胞类型特异性信号重建,达到碱基对精度 | 依赖于scATAC-seq参考数据的可用性和质量,未明确说明模型对数据稀缺情况的处理能力 | 实现从批量测序数据中高分辨率重建细胞类型特异性基因组信号 | 人类组织和细胞类型,包括39种不同人体组织和86种不同细胞类型 | 机器学习 | 原发性硬化性胆管炎 | 深度学习,单细胞ATAC测序,染色质免疫沉淀测序,新生转录测序 | 深度学习框架 | 基因组测序数据 | 39种人体组织和86种细胞类型 | NA | 单细胞ATAC-seq, ChIP-seq, PRO-cap, PRO-seq | NA | NA |
| 69 | 2025-10-05 |
Inhibition of bone morphogenetic protein 4 alleviates angiotensin II-induced abdominal aortic aneurysm by reducing inflammation and endothelial-mesenchymal transition
2025-04, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示BMP4在血管紧张素II诱导的腹主动脉瘤中通过调节内皮-间质转化和炎症促进疾病进展的机制 | 首次发现BMP4在腹主动脉瘤进展中的关键作用,并阐明其通过BGN结合和PI3K/AKT/mTOR通路诱导内皮细胞表型转换的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究腹主动脉瘤的发病机制及BMP4在其中的作用 | 血管紧张素II诱导的腹主动脉瘤小鼠模型和鼠主动脉内皮细胞 | 单细胞测序分析 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序, 伪时间轨迹分析, 蛋白质-蛋白质相互作用分析, 共免疫沉淀 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞测序分析 |
| 70 | 2025-10-05 |
Stem Cell Markers LGR5, LGR4 and Their Immediate Signalling Partners are Dysregulated in Preeclampsia
2025-Apr, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-024-10831-2
PMID:39688759
|
研究论文 | 本研究首次描述了LGR5和LGR4及其信号伴侣在人类胎盘中的表达特征,并发现它们在子痫前期胎盘中的失调现象 | 首次在人类胎盘中表征LGR5/LGR4及其配体/靶点,发现这些干细胞标志物在子痫前期和胎儿生长受限胎盘中的表达失调 | 缺氧/促炎细胞因子处理未能显著改变LGR5/LGR4表达,暗示可能存在其他调控机制 | 研究LGR5/LGR4及其信号伴侣在人类胎盘中的表达特征及其在子痫前期和胎儿生长受限中的失调机制 | 人类胎盘组织、滋养层干细胞、不同妊娠期胎盘样本 | 生殖医学 | 子痫前期、胎儿生长受限 | 原位杂交、单细胞转录组测序、单核RNA测序、转录组分析 | NA | RNA测序数据、基因表达数据 | 早孕期胎盘11例、早产胎盘9例、足月胎盘11例、早发性子痫前期81例、晚发性子痫前期20例、胎儿生长受限34例及相应对照组 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA |
| 71 | 2025-10-05 |
Plasma exosomes from individuals with type 2 diabetes drive breast cancer aggression in patient-derived organoids
2025-Apr-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.13.612950
PMID:39345362
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研究论文 | 本研究通过患者来源类器官模型揭示2型糖尿病血浆外泌体通过改变肿瘤微环境促进乳腺癌侵袭性的新机制 | 首次开发了保留天然肿瘤浸润淋巴细胞的乳腺癌患者来源类器官模型,并发现2型糖尿病外泌体通过扩增免疫抑制性T细胞和增强肿瘤异质性驱动癌症进展 | 研究样本量有限,外泌体作用的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究2型糖尿病血浆外泌体对乳腺癌肿瘤微环境免疫细胞功能的影响 | 乳腺癌患者来源类器官和血浆外泌体 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 患者来源类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 72 | 2025-10-05 |
Polymorphic tandem repeats influence cell type-specific gene expression across the human immune landscape
2025-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.02.621562
PMID:40291654
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研究论文 | 本研究通过全基因组和单细胞RNA测序分析串联重复序列对免疫细胞类型特异性基因表达的影响 | 首次在单细胞水平系统分析串联重复序列对免疫细胞类型特异性基因表达的调控作用,发现超过62,000个单细胞表达数量性状串联重复位点 | 研究主要基于血液来源细胞,可能不适用于其他组织类型;串联重复序列的准确识别仍存在技术挑战 | 探索串联重复序列变异对免疫细胞类型特异性基因表达的调控机制 | 1,925名个体的血液来源细胞,涵盖28种不同的免疫细胞类型 | 基因组学 | 免疫介导性疾病,血液系统疾病 | 全基因组测序,单细胞RNA测序 | 数量性状位点分析,精细定位 | 基因组序列数据,单细胞基因表达数据 | 超过540万个血液来源细胞,来自1,925名个体 | NA | 单细胞RNA-seq,全基因组测序 | NA | NA |
| 73 | 2025-10-06 |
Prunella vulgaris: A potential molecule for the treatment of hepatocellular carcinoma
2025-Apr-25, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000042267
PMID:40295240
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研究论文 | 本研究系统评估了夏枯草治疗肝细胞癌的潜力并探索其分子机制 | 首次通过系统药理学方法识别夏枯草治疗肝细胞癌的关键靶点,并揭示其通过p53信号通路和免疫细胞调节的分子机制 | 研究主要基于计算预测和体外实验,缺乏体内实验验证和临床数据支持 | 探索夏枯草治疗肝细胞癌的分子机制和潜在生物标志物 | 夏枯草活性成分及其在肝细胞癌中的分子靶点 | 系统药理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,分子对接,体外实验 | NA | 基因表达数据,化合物靶点数据 | 185个药物靶点和635个HCC相关靶点 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 74 | 2025-10-06 |
Skin organoid transplantation promotes tissue repair with scarless in frostbite
2025-Apr-18, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwae055
PMID:39363875
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研究论文 | 本研究通过构建皮肤类器官移植系统,探索其在冻伤修复中促进无疤痕愈合的作用机制 | 首次将hiPSC来源的皮肤类器官与明胶水凝胶结合用于冻伤治疗,并发现其通过调控整合素α5β1-FAK通路减少成纤维细胞向肌成纤维细胞转化 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人体进行验证 | 开发促进冻伤无疤痕愈合的新型治疗方法 | 冻伤小鼠模型、人类诱导多能干细胞来源的皮肤类器官 | 组织工程 | 冻伤 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2025-10-06 |
RUNX2 promotes fibrosis via an alveolar-to-pathological fibroblast transition
2025-Apr, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08542-2
PMID:39910313
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了RUNX2在肺纤维化中通过肺泡成纤维细胞向病理性成纤维细胞转化促进纤维化的机制 | 首次发现LEPR成纤维细胞中的SCUBE2肺泡成纤维细胞是CTHRC1+POSTN+病理性成纤维细胞的主要来源,并证实RUNX2是调控纤维化基因表达的关键因子 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探索肺纤维化中病理性成纤维细胞的来源及其调控机制 | 小鼠肺组织中的成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | scRNA-seq, scATAC-seq, 基因敲除 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 两种肺纤维化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 76 | 2025-10-06 |
The role of TIGIT-CD226-PVR axis in mediating T cell exhaustion and apoptosis in NSCLC
2025-04, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-02052-2
PMID:39725799
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研究论文 | 本研究探讨TIGIT-CD226-PVR信号轴在非小细胞肺癌中调控T细胞耗竭和凋亡的作用机制 | 首次系统揭示TIGIT-CD226-PVR信号轴在CD27+/CD127+T细胞亚群中的调控作用及其与免疫治疗疗效的关联 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中得到验证 | 探索TIGIT-CD226-PVR信号轴在非小细胞肺癌T细胞耗竭和凋亡中的调控机制 | 非小细胞肺癌小鼠模型中的CD27+/CD127+T细胞 | 免疫肿瘤学 | 肺癌 | 单细胞测序技术、生物信息学分析、体外实验、体内研究 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 77 | 2025-10-06 |
Targeted editing of CCL5 with CRISPR-Cas9 nanoparticles enhances breast cancer immunotherapy
2025-04, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-02032-6
PMID:39870938
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研究论文 | 本研究利用CRISPR-Cas9纳米颗粒靶向编辑CCL5基因以增强乳腺癌免疫治疗效果 | 首次将CRISPR-Cas9技术与FCPCV纳米颗粒结合用于乳腺癌免疫治疗,通过靶向编辑CCL5基因改善肿瘤免疫微环境 | 研究主要基于小鼠模型,尚未进行人体临床试验 | 开发新型乳腺癌免疫治疗策略 | 乳腺癌细胞和人源化小鼠模型 | 基因编辑与免疫治疗 | 乳腺癌 | CRISPR-Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 78 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell sequencing and machine learning to uncover the role of mitophagy in subtyping and prognosis of esophageal cancer
2025-04, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-02061-1
PMID:39948301
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和机器学习方法,探索线粒体自噬在食管癌亚型分型和预后中的作用 | 首次将线粒体自噬相关基因与食管癌分子分型相结合,并利用机器学习算法识别核心基因构建预后模型 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 阐明线粒体自噬在食管癌中的分子机制并开发预后预测模型 | 食管癌患者 | 机器学习 | 食管癌 | RNA测序,单细胞测序 | LASSO回归,随机森林,XGBoost,多元COX回归 | 基因表达数据 | TCGA数据库中的食管癌患者数据及两个外部验证队列 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 79 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals sex differences in the subcellular composition and associated gene-regulatory network activity of human carotid plaques
2025-Apr, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00628-y
PMID:40211055
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类颈动脉斑块在亚细胞组成和基因调控网络活性方面的性别差异 | 首次在单细胞水平系统揭示颈动脉斑块中性别特异的细胞表型和基因调控网络差异 | 样本量相对有限,仅分析了7,690个细胞 | 探究颈动脉斑块形成中的性别差异机制 | 人类颈动脉斑块细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7,690个颈动脉斑块细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2025-10-06 |
Excitatory synaptic transmission is differentially modulated by opioid receptors along the claustro-cingulate pathway
2025-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.31.646444
PMID:40236172
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研究论文 | 本研究探讨阿片受体在CLA-ACC神经通路中对兴奋性突触传递的调控机制 | 首次揭示KOR、MOR和DOR阿片受体在扣带皮层-屏状核通路中对兴奋性突触传递的差异化调控作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在更高阶物种中验证 | 阐明阿片受体在扣带皮层-屏状核神经环路中对谷氨酸能信号传递的调控机制 | 小鼠扣带皮层第五层锥体神经元和屏状核神经元 | 神经科学 | 疼痛感知障碍 | 空间转录组学, 脑片电生理学, 光遗传学, 药理学方法 | NA | 电生理信号, 基因表达数据 | 小鼠脑组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |