单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
61	2025-03-23	Knowledge of the genetics of human pain gained over the last decade from next-generation sequencing 2025-Apr, Pharmacological research IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.phrs.2025.107667 PMID:39988004	综述	本文综述了过去十年中利用下一代测序（NGS）技术在人类疼痛遗传学领域取得的进展	NGS技术揭示了疼痛相关基因的突变谱、关键剪接事件和单细胞转录组学，开发了基于NGS的疼痛分类器，并发现了与骨关节炎和类风湿性关节炎疼痛相关的新基因	NGS在疼痛研究中面临复杂数据分析和罕见遗传变异功能未知的挑战	探讨NGS技术在疼痛遗传学研究中的应用及其对个性化疼痛管理的潜力	人类疼痛相关基因和遗传变异	基因组学	疼痛相关疾病	下一代测序（NGS）	NA	基因组数据	NA
62	2025-03-22	Endothelial RUNX3 controls LSEC dysfunction and angiocrine LRG1 signaling to prevent liver fibrosis 2025-Apr-01, Hepatology (Baltimore, Md.) DOI:10.1097/HEP.0000000000001018 PMID:39042837	研究论文	本研究探讨了内皮RUNX3在肝窦内皮细胞（LSEC）功能障碍和肝纤维化中的作用，揭示了RUNX3通过调控LRG1信号通路在肝纤维化中的关键作用	首次揭示了RUNX3在LSEC中的功能及其通过调控LRG1信号通路在肝纤维化中的作用，提出了LRG1作为抗纤维化治疗的新靶点	研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体中进行验证	研究RUNX3在肝窦内皮细胞中的功能及其在肝纤维化中的作用	小鼠模型、人永生化LSEC、小鼠原代LSEC	生物医学	肝纤维化	单细胞RNA测序、定量RT-PCR	NA	基因表达数据	小鼠模型和体外培养的LSEC
63	2025-03-22	Mesenchymal stem cells alleviate mouse liver fibrosis by inhibiting pathogenic function of intrahepatic B cells 2025-Apr-01, Hepatology (Baltimore, Md.) DOI:10.1097/HEP.0000000000000831 PMID:38546278	研究论文	本文研究了间充质干细胞（MSCs）通过抑制肝内B细胞的致病功能来缓解小鼠肝纤维化的机制	揭示了MSCs通过外泌体调控肝内B细胞的增殖和细胞因子产生，从而抑制肝纤维化的新机制	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探讨MSCs在肝纤维化治疗中的作用及其机制	小鼠肝纤维化模型	生物医学	肝纤维化	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	小鼠模型
64	2025-03-22	The Effect of Cuproptosis-Related Proteins on Macrophage Polarization in Mesothelioma is Revealed by scRNA-seq 2025-Apr, Biological trace element research IF:3.4Q2 DOI:10.1007/s12011-024-04333-y PMID:39177724	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术揭示了铜死亡相关蛋白对间皮瘤中巨噬细胞极化的影响	首次揭示了铜死亡相关基因在间皮瘤中的表达差异及其对巨噬细胞极化的影响，并构建了一个3基因特征用于预测患者生存时间	研究主要基于TCGA和GEO数据集，样本来源有限，且需要进一步实验验证	探讨铜死亡相关基因在间皮瘤中的作用及其对肿瘤免疫的影响	间皮瘤患者及其相关基因表达数据	数字病理学	间皮瘤	scRNA-seq	LASSO回归	单细胞RNA测序数据	TCGA和GEO数据集中的间皮瘤患者数据
65	2025-03-22	Integrative single-cell and spatial transcriptomic analyses identify a pathogenic cholangiocyte niche and TNFRSF12A as therapeutic target for biliary atresia 2025-Apr-01, Hepatology (Baltimore, Md.) DOI:10.1097/HEP.0000000000001064 PMID:39178365	研究论文	本文通过整合单细胞RNA测序和空间转录组数据，揭示了胆道闭锁（BA）中胆管细胞的致病作用，并提出了TNFRSF12A作为潜在治疗靶点	首次通过单细胞和空间转录组分析，识别出BA中胆管细胞富集的致病微环境，并发现TNFRSF12A作为关键信号分子	样本量较小，仅包含12个肝脏组织和4个肝脏切片，且主要基于小鼠模型和人类胆道类器官的研究	研究胆道闭锁（BA）中胆管细胞的致病机制，并探索潜在的治疗靶点	胆道闭锁（BA）患者和小鼠模型的肝脏组织及胆道类器官	数字病理	胆道闭锁	单细胞RNA测序，空间转录组分析	NA	RNA测序数据，空间转录组数据	12个肝脏组织（9个BA，3个对照），4个肝脏切片（2个BA，2个对照）
66	2025-03-22	Impact of lymph node metastasis on immune microenvironment and prognosis in colorectal cancer liver metastasis: insights from multiomics profiling 2025-Apr, British journal of cancer IF:6.4Q1 DOI:10.1038/s41416-024-02921-2 PMID:39753715	研究论文	本研究旨在探讨淋巴结转移（LNM）对结直肠癌肝转移（CRLM）患者预后的影响，并通过多组学分析揭示潜在的免疫机制	通过整合bulk RNA测序、单细胞RNA测序和蛋白质组学数据，首次全面比较了有无LNM患者的肿瘤引流淋巴结（TDLNs）、原发肿瘤和肝转移的免疫特征	研究依赖于回顾性队列数据，可能存在选择偏倚；多组学数据的整合分析复杂，可能引入技术误差	探讨LNM对CRLM患者预后的影响及其免疫机制	结直肠癌肝转移患者	数字病理学	结直肠癌	bulk RNA测序、单细胞RNA测序、蛋白质组学	NA	RNA测序数据、蛋白质组学数据	来自美国SEER队列和中国多中心队列的CRLM患者
67	2025-03-22	Single-cell RNA sequencing reveals ECM remodeling-tumor stiffness-FAK as a key driver of vestibular schwannoma progression 2025-Apr, Progress in neurobiology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.pneurobio.2025.102730 PMID:39988022	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序揭示了前庭神经鞘瘤（VS）进展中ECM重塑-肿瘤硬度-FAK信号的关键作用	首次将单细胞RNA测序应用于前庭神经鞘瘤，揭示了ECM重塑-肿瘤硬度-FAK信号在肿瘤进展中的关键作用	研究主要基于体外实验，缺乏体内实验验证	探讨肿瘤硬度-FAK信号在前庭神经鞘瘤进展中的作用	前庭神经鞘瘤细胞	数字病理学	前庭神经鞘瘤	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
68	2025-03-22	Cancer-associated fibroblasts in breast cancer in the single-cell era: Opportunities and challenges 2025-Apr, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189291 PMID:40024607	综述	本文探讨了乳腺癌中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的异质性及其在肿瘤微环境中的作用，并强调了单细胞RNA测序技术在分析CAF亚群中的应用	利用单细胞RNA测序技术对CAFs进行高分辨率分析，揭示了CAFs的异质性及其在乳腺癌进展中的具体作用	主要集中于乳腺癌中的CAFs，未涉及其他类型癌症或更广泛的肿瘤微环境研究	探讨CAFs在乳腺癌中的异质性及其在肿瘤微环境中的作用，为靶向治疗提供潜在方向	乳腺癌中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）	数字病理学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞RNA测序数据	NA
69	2025-03-21	Double-target magnetic stimulation attenuates oligodendrocyte apoptosis and oxidative stress impairment after spinal cord injury via GAP43 2025-Apr, The spine journal : official journal of the North American Spine Society DOI:10.1016/j.spinee.2024.12.025 PMID:39701305	研究论文	本研究评估了双靶点（大脑和脊髓）磁刺激（DTMS）治疗对脊髓损伤（SCI）大鼠的功能恢复和神经回路改善的影响，并探讨了DTMS对胶质细胞调节的作用	揭示了DTMS通过调节GAP43在少突胶质细胞中的抗凋亡和抗氧化应激作用，促进少突胶质细胞的分支和成熟以及轴突再生，从而改善SCI后的神经回路功能	研究主要基于动物模型，尚未在人类中进行验证	评估DTMS对脊髓损伤后功能恢复和神经回路改善的影响，并探讨其作用机制	脊髓损伤模型大鼠	神经科学	脊髓损伤	单细胞RNA测序、透射电子显微镜、Western blotting、免疫荧光染色、TUNEL染色、Annexin V-FITC凋亡试剂盒、脂质ROS试剂盒	NA	行为评估数据、组织染色数据、单细胞RNA测序数据	脊髓损伤模型大鼠
70	2025-03-21	Effect of tumor microenvironment in pancreatic cancer on the loss of β-cell mass: implications for type 3c diabetes 2025-Apr, Journal of gastroenterology IF:6.9Q1 DOI:10.1007/s00535-024-02204-w PMID:39760782	研究论文	本研究探讨了胰腺导管腺癌（PDAC）肿瘤微环境（TME）与β细胞质量减少之间的复杂相互作用，进一步阐明了3c型糖尿病（T3cDM）发病机制	通过单细胞RNA测序分析PDAC TME，揭示了肿瘤细胞、免疫细胞和成纤维细胞与内分泌细胞的相互作用，以及内分泌细胞中凋亡途径的激活	研究主要基于PDAC患者的样本，可能不适用于其他类型的胰腺癌或糖尿病	探讨PDAC TME对β细胞质量减少的影响及其在T3cDM发病中的作用	胰腺导管腺癌（PDAC）患者的肿瘤微环境（TME）和β细胞	肿瘤生物学	胰腺癌	单细胞RNA测序、TUNEL染色、RT-qPCR、CCK8检测	NA	RNA测序数据、病理学数据	来自供体的正常胰腺组织、非糖尿病（NDM）和T3cDM患者的副肿瘤组织
71	2025-03-21	Trends in Research of Odontogenic Keratocyst and Ameloblastoma 2025-Apr, Journal of dental research IF:5.7Q1 DOI:10.1177/00220345241282256 PMID:39876078	综述	本文综述了牙源性角化囊肿（OKC）和成釉细胞瘤（AM）研究的最新进展和趋势	利用单细胞和空间组学技术深入理解OKC和AM的肿瘤微环境和细胞异质性，以及3D培养技术在AM亚型分析中的应用	尽管AM已有可靠的临床前模型，但OKC的可靠体外和体内模型仍然稀缺	探讨OKC和AM的生物学行为机制及其潜在治疗靶点	牙源性角化囊肿（OKC）和成釉细胞瘤（AM）	数字病理学	口腔颌面部疾病	单细胞组学、空间转录组学、3D培养技术、人工智能（机器学习和深度学习）	NA	NA	NA
72	2025-03-21	SPRY1 regulates macrophage M1 polarization in skin aging and melanoma prognosis 2025-Apr, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102331 PMID:40023001	研究论文	本研究探讨了SPRY1在皮肤老化中的作用，特别是其对巨噬细胞M1极化的影响，并探索其作为缓解皮肤老化和黑色素瘤治疗靶点的潜力	首次揭示了SPRY1在皮肤老化中的关键作用，特别是通过促进巨噬细胞M1极化加速皮肤老化，并发现其在黑色素瘤中的表达与患者生存率相关	研究主要基于体外实验，缺乏体内验证，未来需要进一步探索其调控网络	研究SPRY1在皮肤老化中的功能及其作为治疗靶点的潜力	RAW264.7小鼠单核/巨噬细胞白血病细胞和NIH/3T3小鼠皮肤成纤维细胞	生物信息学	黑色素瘤	加权基因共表达网络分析（WGCNA）、单细胞测序、基因转染、CCK-8实验、qRT-PCR、ROS和SOD活性测量	NA	基因表达数据、细胞实验数据	GTEx和GEO数据库中的数据集，以及RAW264.7和NIH/3T3细胞系
73	2025-03-19	Radiation from frequent whole-body CT scans induces systemic immunosuppression and immune activation of tumor tissue 2025-Apr, Translational oncology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.tranon.2025.102326 PMID:40014978	研究论文	本研究探讨了重复全身CT扫描对系统性免疫、肿瘤免疫微环境及肿瘤控制的影响	首次揭示了重复全身CT扫描辐射诱导系统性免疫抑制和肿瘤组织免疫激活的现象	研究仅基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	阐明重复全身CT扫描对免疫系统及肿瘤控制的影响	Lewis肺癌小鼠模型	医学影像学	肺癌	ELISA、流式细胞术、免疫组化、RNA测序、单细胞测序	NA	生物样本数据	两组小鼠（对照组和多次全身CT扫描辐射组）
74	2025-03-18	FABP5+ lipid-loaded macrophages process tumour-derived unsaturated fatty acid signal to suppress T-cell antitumour immunity 2025-Apr, Journal of hepatology IF:26.8Q1 DOI:10.1016/j.jhep.2024.09.029 PMID:39357545	研究论文	本研究揭示了FABP5+脂质负载的肿瘤相关巨噬细胞通过FABP5-PPARγ信号通路增强肿瘤免疫抑制微环境的机制	首次揭示了FABP5介导的不饱和脂肪酸代谢在肿瘤相关巨噬细胞中的免疫调节作用，并提出了靶向FABP5作为肝癌治疗的新策略	研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人类临床试验中验证	探讨脂质代谢如何增强肿瘤相关巨噬细胞的促肿瘤作用	小鼠和人类肝细胞癌（HCC）肿瘤样本	肿瘤免疫学	肝癌	单细胞RNA测序	小鼠模型	RNA测序数据	小鼠和人类HCC肿瘤样本
75	2025-03-17	Lactate drives senescence-resistant lineages in hepatocellular carcinoma via histone H2B lactylation of NDRG1 2025-Apr-28, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217567 PMID:39978571	研究论文	本文通过单细胞RNA测序轨迹分析重建了肝细胞癌（HCC）的克隆进化，揭示了LDHA-NDRG1轴在癌症进展中的关键作用，并提出了针对乳酸化介导的表观遗传调控的精准医学策略	揭示了LDHA-NDRG1轴通过乳酸化组蛋白H2B在K58位点的表观遗传机制，连接代谢重编程与衰老逃逸，为HCC异质性提供了新的分子机制	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证	探索肝细胞癌的克隆进化及其与肿瘤异质性和衰老抵抗的关系	肝细胞癌（HCC）	癌症研究	肝细胞癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
76	2025-03-17	Spatial transcriptomics and single-cell RNA-sequencing revealed dendritic cell-mediated inflammation in keratoconus 2025-Apr, The ocular surface DOI:10.1016/j.jtos.2025.01.008 PMID:39837422	研究论文	本研究利用空间转录组学和单细胞RNA测序技术揭示了树突状细胞介导的炎症在圆锥角膜中的作用	首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，全面揭示了圆锥角膜的炎症特征及其空间分布	研究中未详细探讨其他可能的炎症通路及其在圆锥角膜中的作用	研究圆锥角膜的分子和细胞变化，特别是炎症反应的作用	圆锥角膜患者的角膜组织	数字病理学	圆锥角膜	空间转录组学, 单细胞RNA测序 (scRNA-seq)	NA	RNA测序数据	未明确说明样本数量
77	2025-03-17	Network-based analysis of Alzheimer's Disease genes using multi-omics network integration with graph diffusion 2025-Apr, Journal of biomedical informatics IF:4.0Q2 DOI:10.1016/j.jbi.2025.104797 PMID:39993589	研究论文	本文通过整合多组学网络，利用图扩散方法构建高质量网络，分析阿尔茨海默病（AD）基因的网络特性	挑战了AD基因主要是网络中枢纽基因的传统观点，揭示了AD基因在网络中的分布特性及其调控机制	需要进一步验证多组学网络整合方法的普适性及其在不同疾病中的应用	研究阿尔茨海默病基因在网络中的特性及其调控机制	阿尔茨海默病基因	生物信息学	阿尔茨海默病	微阵列、单细胞RNA测序、单核RNA测序、蛋白质相互作用、基因本体信息	图扩散	基因表达数据	NA
78	2025-03-16	Divergent PTEN-p53 interaction upon DNA damage in a human thyroid organoid model with germline PTEN mutations 2025-Apr-01, Endocrine-related cancer IF:4.1Q2 DOI:10.1530/ERC-24-0216 PMID:39970536	研究论文	本文研究了在携带不同PTEN基因变异的甲状腺类器官模型中，电离辐射如何影响DNA损伤反应，特别是PTEN与p53的相互作用	首次揭示了不同PTEN基因变异在辐射诱导的DNA损伤反应中的差异，特别是PTEN M134R变异与甲状腺癌易感性的关联	研究仅基于体外类器官模型，未涉及体内环境或临床样本验证	探讨PTEN基因变异在甲状腺癌发生中的作用机制	携带不同PTEN基因变异的人类诱导多能干细胞（hiPSC）衍生的甲状腺类器官	肿瘤生物学	甲状腺癌	CRISPR-Cas9基因编辑技术、RNA测序（RNA-seq）	甲状腺类器官模型	RNA测序数据	来自健康供体的hiPSC细胞系，携带PTEN WT/G132D和PTEN WT/M134R变异的类器官
79	2025-03-16	Mycoplasma ovipnuemoniae impairs the immune response of sheep and suppresses neutrophil function by inhibiting S100A9 2025-Apr, Veterinary microbiology IF:2.4Q1 DOI:10.1016/j.vetmic.2025.110446 PMID:40022823	研究论文	本文研究了绵羊感染绵羊肺炎支原体（MO）后，肺部免疫反应和中性粒细胞功能的变化	首次系统分析了MO感染后绵羊肺组织中11种细胞类型的转录组变化，并构建了细胞间通讯模型和关键调控基因的差异表达图谱	研究主要基于体外实验，体内实验的验证可能不足	探讨MO感染对绵羊肺部免疫反应和中性粒细胞功能的影响	绵羊肺组织中的11种细胞类型	生物信息学	肺炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	细胞间通讯模型	RNA测序数据	感染MO 28天后的绵羊肺组织
80	2025-03-15	How fish intestinal cells responded to dietary methylmercury exposure? A single-cell transcriptomic analysis 2025-Apr-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987) DOI:10.1016/j.envpol.2025.125967 PMID:40043872	研究论文	本研究通过单细胞转录组分析探讨了鱼类肠道细胞对膳食甲基汞暴露的响应	首次在单细胞水平上揭示了不同肠道细胞群体对甲基汞暴露的异质性响应	研究仅限于一种鱼类（金头鲷），未涉及其他物种或更广泛的生态影响	探讨鱼类肠道细胞对膳食甲基汞暴露的响应机制	金头鲷的肠道细胞	单细胞转录组学	NA	scRNA-seq	NA	基因表达数据	NA