单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
721	2025-03-05	High expression of SERPINE1 and CTSL in keratinocytes in pressure injury caused by ischemia-reperfusion injury 2025-Apr, Tissue & cell IF:2.7Q3 DOI:10.1016/j.tice.2025.102746 PMID:39864211	研究论文	本研究通过转录组测序、单细胞测序数据库和GeneCards数据库分析筛选与缺血再灌注损伤相关的压力性损伤（PI）候选基因，并利用机器学习算法识别关键基因SERPINE1和CTSL，验证其在PI中的预后价值	首次通过整合转录组测序、单细胞测序和机器学习算法，识别出SERPINE1和CTSL作为PI的潜在生物标志物	研究主要基于大鼠模型，尚未在人类样本中进行验证	探索压力性损伤（PI）的生理机制及相关分子生物标志物，以开发有效的预防和治疗策略	压力性损伤（PI）大鼠模型	生物信息学	压力性损伤	转录组测序、单细胞测序、机器学习算法	机器学习算法（未具体说明）	基因表达数据	大鼠模型样本
722	2025-03-03	Multi-omics analysis to explore the molecular mechanisms related to keloid 2025-Apr, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries IF:3.2Q1 DOI:10.1016/j.burns.2025.107396 PMID:39874886	研究论文	本研究通过多组学分析探索了瘢痕疙瘩的分子机制，识别了关键基因和免疫细胞的作用，并提出了潜在的治疗靶点	结合bulk RNA测序、孟德尔随机化、免疫浸润分析和单细胞RNA测序，揭示了DUSP1和HOXA5在瘢痕疙瘩中的关键作用，并提出了IL17信号通路作为潜在治疗靶点	研究主要基于基因表达和免疫细胞分析，缺乏体内实验验证，且样本量未明确说明	识别瘢痕疙瘩的致病机制、关键基因和免疫细胞的作用，为靶向治疗提供新见解	瘢痕疙瘩组织	生物信息学	皮肤疾病	bulk RNA测序、单细胞RNA测序、孟德尔随机化、免疫浸润分析	NA	基因表达数据	NA
723	2025-02-26	Exploring immune gene expression and potential regulatory mechanisms in anaplastic thyroid carcinoma using a combination of single-cell and bulk RNA sequencing data 2025-Apr, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.compbiolchem.2024.108311 PMID:39674047	研究论文	本研究通过结合单细胞和批量RNA测序数据，探索了未分化甲状腺癌（ATC）中的免疫基因表达及其潜在调控机制	结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，识别了ATC中的差异表达免疫基因，并发现了潜在的调控转录因子和药物靶点	研究依赖于公开数据库的数据，可能受到数据质量和样本量的限制	识别ATC中的新型治疗靶点，以改善ATC的诊断和治疗	未分化甲状腺癌（ATC）和乳头状甲状腺癌（PTC）	生物信息学	甲状腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq）	NA	RNA测序数据	来自GEO数据库的ATC和PTC样本
724	2025-02-26	Development of a centrosome amplification-associated signature in kidney renal clear cell carcinoma based on multiple machine learning models 2025-Apr, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.compbiolchem.2024.108317 PMID:39675190	研究论文	本研究通过多种机器学习模型开发了与肾透明细胞癌（KIRC）中心体扩增相关的特征，并评估了其对预后和治疗反应的预测能力	首次构建了与KIRC中心体扩增相关的预后指数（CAAPI），并揭示了其在肿瘤微环境调节和免疫治疗反应中的重要作用	研究主要依赖于TCGA-KIRC数据集，外部验证数据集较少，可能影响结果的普适性	探索中心体扩增相关特征在KIRC预后和治疗反应预测中的作用	肾透明细胞癌（KIRC）患者	机器学习	肾癌	随机生存森林分析、Cox回归分析、单细胞RNA测序	随机生存森林、Cox回归模型	基因表达数据、单细胞RNA测序数据	TCGA-KIRC数据集、ICGC和GEO数据集用于验证，单细胞RNA测序数据来自GSE159115
725	2025-02-26	High antigen-presenting CAF levels correlate with reduced glycosaminoglycan biosynthesis-heparan sulfate/heparin metabolism in immune cells and poor prognosis in esophageal squamous cell carcinoma: Insights from bulk and single-cell transcriptome profiling 2025-Apr, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140418 PMID:39889995	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了食管鳞状细胞癌中抗原呈递的癌症相关成纤维细胞（apCAF）对肿瘤代谢环境的重塑作用及其与患者不良预后的关联	首次在食管鳞状细胞癌中识别出抗原呈递的癌症相关成纤维细胞（apCAF）亚群，并揭示了其对肿瘤代谢环境的重塑机制	研究中未详细探讨apCAF如何具体影响免疫逃逸的分子机制	探讨癌症相关成纤维细胞在食管鳞状细胞癌肿瘤微环境中的代谢重编程作用及其对患者预后的影响	食管鳞状细胞癌肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞	数字病理学	食管鳞状细胞癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
726	2025-02-25	Single Cell Deletion of the Transcription Factors Trps1 and Sox9 in Astrocytes Reveals Novel Functions in the Adult Cerebral Cortex 2025-Apr, Glia IF:5.4Q1 DOI:10.1002/glia.24645 PMID:39610085	研究论文	本研究通过CRISPR-Cas9技术删除成年大脑皮层中的转录因子Trps1和Sox9，揭示了它们在星形胶质细胞中的新功能	首次在成年大脑皮层中通过单细胞和空间转录组学技术揭示了Trps1和Sox9在星形胶质细胞中的特异性功能及其对周围细胞的非细胞自主效应	研究仅限于成年大脑皮层的星形胶质细胞，未涉及其他脑区或发育阶段	探索转录因子Trps1和Sox9在成年大脑皮层星形胶质细胞中的功能及其异质性	成年大脑皮层的星形胶质细胞	神经科学	NA	CRISPR-Cas9, 单细胞转录组学, 空间转录组学	NA	转录组数据	NA
727	2025-02-22	Identification of novel hub gene and biological pathways associated with ferroptosis in In-Stent restenosis 2025-Apr-15, Gene IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.gene.2025.149287 PMID:39880339	研究论文	本研究通过整合GEO数据库和单细胞测序数据，揭示了与铁死亡相关的分子靶点，并构建了lncRNA-miRNA-SP1调控网络，以探索支架内再狭窄（ISR）的治疗新策略	首次将铁死亡与血管平滑肌细胞在支架内再狭窄中的作用联系起来，并识别出SP1作为关键调控因子	研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证来确认SP1的功能和调控机制	揭示支架内再狭窄中与铁死亡相关的分子靶点，探索新的治疗策略	血管平滑肌细胞（VSMCs）	生物信息学	心血管疾病	单细胞测序（scRNA-Seq）	NA	基因表达数据	NA
728	2025-02-03	Periductal fibroblasts participate in liver homeostasis, fibrosis, and tumorigenesis 2025-Apr-07, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1 DOI:10.1084/jem.20232123 PMID:39888328	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，研究了肝脏中不同成纤维细胞群体的生理功能及其在肝纤维化和肿瘤发生中的作用	首次通过单细胞RNA测序技术鉴定了Cd34和Dpt作为肝成纤维细胞特异性基因，并揭示了它们在肝纤维化和肝内胆管癌中的作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	研究肝脏中不同成纤维细胞群体的生理功能及其在肝纤维化和肿瘤发生中的作用	小鼠肝脏中的成纤维细胞	生物医学	肝纤维化, 肝内胆管癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	小鼠肝脏组织样本
729	2024-12-09	Rapid and efficient immune response induced by a designed modular cholera toxin B subunit (CTB)-based self-assembling nanoparticle 2025-Apr, Biomaterials IF:12.8Q1 DOI:10.1016/j.biomaterials.2024.122946 PMID:39515192	研究论文	本文设计了一种基于霍乱毒素B亚单位（CTB）的自组装纳米颗粒，并研究了其快速免疫激活机制	该纳米疫苗通过CTB五聚体和非天然三聚体域自组装，展示了S. Paratyphi A O-多糖抗原，并揭示了其在淋巴结中的动态变化和强大的体液免疫反应能力	免疫激活机制的深入理解仍有限，限制了此类纳米载体的进一步扩展	研究新型自组装纳米疫苗的快速免疫激活机制，并评估其在不同感染模型中的预防效果	基于CTB的自组装纳米颗粒及其在免疫激活中的作用	免疫学	感染性疾病	单细胞RNA测序	NA	RNA	NA
730	2024-12-09	A 3D-printed microdevice encapsulates vascularized islets composed of iPSC-derived β-like cells and microvascular fragments for type 1 diabetes treatment 2025-Apr, Biomaterials IF:12.8Q1 DOI:10.1016/j.biomaterials.2024.122947 PMID:39547136	研究论文	本文介绍了一种3D打印的微型装置，用于封装血管化的胰岛，这些胰岛由诱导多能干细胞（iPSC）衍生的β样细胞和微血管片段组成，用于治疗1型糖尿病	创新点在于使用3D打印技术制造了一种可回收的微型装置，封装了血管化的胰岛，用于长期治疗1型糖尿病	研究仅在C57BL/6小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	开发一种新的治疗方法，通过移植血管化的胰岛来治疗1型糖尿病	诱导多能干细胞衍生的β样细胞和微血管片段	NA	1型糖尿病	3D打印技术	NA	单细胞RNA测序数据	C57BL/6小鼠