单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 722 篇文献，本页显示第 701 - 720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2025-10-07 |
Therapeutic potential of p-coumaric acid in alleviating renal fibrosis through inhibition of M2 macrophage infiltration and cellular communication
2025-Apr, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.156507
PMID:39978279
|
研究论文 | 本研究探讨对香豆酸通过抑制M2巨噬细胞浸润和细胞通讯缓解肾纤维化的治疗潜力 | 首次系统揭示对香豆酸通过特异性靶向M2巨噬细胞并破坏其与肾小管上皮细胞相互作用来缓解肾纤维化的新机制 | 研究主要基于动物模型，临床转化潜力仍需进一步验证 | 评估对香豆酸对肾纤维化的治疗作用并阐明其分子机制 | 单侧输尿管梗阻诱导的肾纤维化模型 | 病理学研究 | 肾脏疾病 | LC-MS, CyTOF, scRNA-seq, 流式细胞术, Western blot, qRT-PCR, 免疫组化, 免疫荧光 | NA | 代谢组数据, 单细胞转录组数据, 蛋白质数据, 细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 702 | 2025-10-07 |
Dihydromyricetin regulates the miR-155-5p/SIRT1/VDAC1 pathway to promote liver regeneration and improve alcohol-induced liver injury
2025-Apr, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.156522
PMID:39986231
|
研究论文 | 本研究探讨二氢杨梅素通过调控miR-155-5p/SIRT1/VDAC1通路促进肝脏再生并改善酒精性肝损伤的作用机制 | 首次揭示DMY通过调控miR-155-5p/SIRT1/VDAC1正反馈环路改善肝脏炎症和细胞衰老，促进肝脏再生 | NA | 探索DMY在酒精性肝病相关肝脏再生障碍中的治疗潜力及分子机制 | 酒精性肝病小鼠模型、临床ALD样本、体外细胞实验 | 分子生物学 | 酒精性肝病 | 血清非靶向代谢组学、肝脏转录组学、单细胞测序、Western blotting、双荧光素酶报告基因检测、免疫荧光 | NA | 代谢组数据、转录组数据、单细胞测序数据、蛋白质印迹数据 | NA | NA | 单细胞测序, 代谢组学, 转录组学 | NA | NA |
| 703 | 2025-10-07 |
Deciphering the Vulnerability of Pollen to Heat Stress for Securing Crop Yields in a Warming Climate
2025-Apr, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15315
PMID:39722468
|
综述 | 本文综述了高温胁迫对花粉发育的影响机制及提升作物耐热性的分子育种策略 | 系统整合单细胞RNA测序等基因组技术揭示花粉热应激的分子调控网络，并提出利用花粉筛选和基因编辑技术培育耐热作物的新思路 | NA | 解析花粉对高温胁迫的脆弱性机制，为保障气候变暖背景下的作物产量提供理论依据 | 多种作物的花粉发育过程 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序，CRISPR/Cas基因编辑，全基因组关联分析 | NA | 基因组数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 704 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveals the immune mechanisms by which tonsillectomy improves clinical outcomes of recurrent Immuoglobulin A nephropathy after kidney transplant
2025-Apr, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2025.02.010
PMID:39985963
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示扁桃体切除术改善肾移植后复发性IgA肾病临床结局的免疫机制 | 首次在IgANR患者中应用单细胞mRNA测序技术系统分析扁桃体切除术对B细胞表型和基因表达的影响，发现TCL1A在介导治疗效应中的关键作用 | 样本量有限（29例患者），仅分析了扁桃体组织和PBMC样本，缺乏长期随访数据 | 探究扁桃体切除术治疗IgANR的细胞和分子机制 | 29例IgANR患者的扁桃体组织和外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | IgA肾病 | 流式细胞术, 单细胞mRNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 29例IgANR患者，包括1个扁桃体组织样本和3个PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 705 | 2025-10-07 |
CD177+ neutrophils exacerbate septic lung injury via the NETs/AIM2 pathway: An experimental and bioinformatics study
2025-Apr-04, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114292
PMID:40007380
|
研究论文 | 本研究通过实验和生物信息学分析揭示了CD177+中性粒细胞通过NETs/AIM2通路加剧脓毒症肺损伤的机制 | 首次发现CD177+中性粒细胞是脓毒症肺组织中的主要中性粒细胞亚群，并阐明其通过NETs激活AIM2炎症小体加重肺损伤的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证；样本量相对有限 | 阐明脓毒症诱导急性肺损伤的免疫细胞异质性及其关键作用机制 | CLP模型小鼠的肺组织免疫细胞 | 生物信息学 | 脓毒症肺损伤 | 单细胞测序,分子生物学实验 | NA | 单细胞测序数据,基因表达数据 | CLP模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 706 | 2025-10-07 |
TREM2 as a Therapeutic Target in Atherosclerosis
2025-Apr, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.12279
PMID:39891588
|
综述 | 本文回顾了TREM2作为动脉粥样硬化治疗靶点的研究历程与临床转化潜力 | 首次系统梳理TREM2从基础研究到治疗干预的转化路径，提出其作为动脉粥样硬化新型治疗靶点的可行性 | NA | 探讨TREM2作为动脉粥样硬化治疗靶点的理论基础与临床应用前景 | 动脉粥样硬化斑块中的泡沫样巨噬细胞及TREM2阳性髓系细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 707 | 2025-10-07 |
The future of cardiology: Integrating single-cell transcriptomics with multi-omics for enhanced cardiac disease insights
2025-Apr, Current problems in cardiology
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.cpcardiol.2025.103005
PMID:39894239
|
综述 | 探讨单细胞转录组测序技术在心血管疾病研究中的应用及其与多组学整合的未来发展方向 | 强调将空间转录组学与其他组学技术整合以增强对心脏生物学的理解 | 当前单细胞转录组测序面临数据整合挑战，需要更全面的多组学方法 | 通过整合单细胞转录组学与多组学技术提升对心血管疾病的认知 | 哺乳动物心脏细胞及心血管疾病机制 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 多组学分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 708 | 2025-10-07 |
Shining a light on cell biology of the nucleus with single-cell sequencing
2025-Apr, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2025.102468
PMID:39903993
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在细胞核生物学研究中的最新进展和应用 | 系统总结单细胞测序技术如何揭示细胞核内过程的异质性和相互作用机制 | NA | 探讨单细胞测序技术在细胞核生物学研究中的应用前景 | 细胞核生物学过程和细胞状态 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞基因组测序 | NA | NA |
| 709 | 2025-10-07 |
Gbp2 driving macrophages dynamics in murine heart transplant
2025-Apr, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2024.102695
PMID:39709712
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析鉴定出Gbp2是驱动心脏移植排斥过程中巨噬细胞动态变化的关键基因 | 首次发现Gbp2在心脏移植急性排斥过程中调控巨噬细胞极化的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 鉴定心脏移植排斥过程中巨噬细胞动态变化的关键基因并评估其对巨噬细胞极化的影响 | 小鼠心脏移植模型中的巨噬细胞 | 生物信息学 | 器官移植排斥 | 单细胞测序, 伪时序分析, hdWGCNA | NA | 单细胞测序数据 | 小鼠心脏移植模型数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 710 | 2025-10-07 |
Impaired primitive erythropoiesis and defective vascular development in Trim71-KO embryos
2025-Apr, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202402956
PMID:39909558
|
研究论文 | 本研究揭示RNA结合蛋白Trim71通过调控中胚层先驱转录因子Eomes的表达，在胚胎原肠胚形成阶段建立器官发生正常发育框架的重要机制 | 首次发现Trim71通过NHL结构域直接抑制Eomes mRNA，建立了这两种重要调控基因之间的功能联系 | 内皮细胞条件性敲除未诱导明显缺陷，表明Trim71在内皮细胞及其前体细胞中的表达对胚胎存活并非必需 | 探究Trim71在胚胎发育过程中对基因表达的调控机制 | Trim71基因敲除小鼠胚胎 | 发育生物学 | 胚胎发育缺陷 | 单细胞RNA测序，条件性基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | E7.5阶段全局敲除胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 711 | 2025-10-07 |
A novel coarsened graph learning method for scalable single-cell data analysis
2025-Apr, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.109873
PMID:39999493
|
研究论文 | 提出一种基于特征感知图粗化的新型方法FACH，用于可扩展的单细胞数据分析 | 首次将局部敏感哈希技术整合到图粗化过程中，实现高效的单细胞数据分析 | NA | 解决单细胞数据大规模图表示的计算挑战 | 单细胞RNA测序和质谱流式细胞术数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | 图神经网络 | 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 712 | 2025-10-07 |
Enhanced single-cell RNA-seq embedding through gene expression and data-driven gene-gene interaction integration
2025-Apr, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.109880
PMID:39999494
|
研究论文 | 提出一种整合基因表达和基因间相互作用的新型单细胞RNA测序嵌入方法 | 通过构建细胞-叶图(CLG)和K近邻图(KNNG)的融合图结构，首次将数据驱动的基因间相互作用整合到单细胞嵌入中 | 未明确说明方法对特定细胞类型或组织的适用性限制 | 开发更全面的单细胞RNA测序数据分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络, 随机森林 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 713 | 2025-10-07 |
X-scPAE: An explainable deep learning model for embryonic lineage allocation prediction based on single-cell transcriptomics revealing key genes in embryonic cell development
2025-Apr, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.109787
PMID:39946788
|
研究论文 | 提出一种基于单细胞转录组数据的可解释深度学习模型X-scPAE，用于预测胚胎细胞谱系分配并识别关键基因 | 结合PCA降维、自编码器特征提取、注意力机制和反事实梯度归因算法，构建可解释的深度学习模型 | NA | 准确预测细胞谱系分配并识别谱系间基因表达差异 | 人类和小鼠的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 胚胎发育疾病 | 单细胞RNA测序 | 自编码器, 注意力机制, 逻辑回归 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 714 | 2025-10-07 |
Ephrin-B2 acts as a positive regulator of osteogenesis-angiogenesis coupling
2025-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140555
PMID:39894124
|
研究论文 | 本研究探讨了Ephrin-B2信号在成骨-血管生成偶联中的正向调控作用及其机制 | 首次通过单细胞测序发现牙周炎中成骨细胞谱系Ephrin-B2信号缺陷，并构建过表达Ephrin-B2的成骨细胞与内皮细胞共移植系统证实其促进血管化骨再生的作用 | 研究主要基于体外共培养和动物实验，尚未进行临床验证 | 探索Ephrin-B2信号在成骨-血管生成偶联中的作用机制，为牙周组织工程提供指导 | 牙周组织、成骨细胞、人脐静脉内皮细胞(HUVECs) | 单细胞转录组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 来自公共数据库GEO: GSE171213的牙周组织单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 715 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptional footprint for pseudogene SsCLEC9A is associated with antigen processing and presentation in Sus scrofa
2025-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140629
PMID:39904428
|
研究论文 | 本研究首次发现猪的CLEC9A基因因远古突变成为假基因，但其突变转录本仍影响树突状细胞的抗原呈递功能 | 首次揭示猪CLEC9A基因成为假基因的进化事件，并发现其突变转录本仍具有生物学功能 | 研究主要基于体外实验，需要进一步体内验证 | 探究假基因SsCLEC9A的转录适应及其在抗原呈递中的作用 | 猪树突状细胞和骨髓造血细胞 | 免疫学 | NA | 荧光激活细胞分选,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 716 | 2025-10-07 |
High antigen-presenting CAF levels correlate with reduced glycosaminoglycan biosynthesis-heparan sulfate/heparin metabolism in immune cells and poor prognosis in esophageal squamous cell carcinoma: Insights from bulk and single-cell transcriptome profiling
2025-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140418
PMID:39889995
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序发现食管鳞状细胞癌中抗原呈递CAF亚群通过调控糖胺聚糖生物合成-硫酸乙酰肝素/肝素代谢途径影响免疫细胞功能并导致不良预后 | 首次在食管鳞癌中鉴定出抗原呈递CAF亚群，并揭示其通过调控糖胺聚糖代谢通路重塑肿瘤代谢微环境的新机制 | 研究主要基于转录组数据，需要进一步实验验证代谢通路的具体功能机制 | 探究癌症相关成纤维细胞在食管鳞癌肿瘤微环境代谢重编程中的作用 | 食管鳞状细胞癌患者肿瘤样本中的癌症相关成纤维细胞和免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 717 | 2025-10-07 |
Unveiling FKBP7 as an early endoplasmic reticulum sentinel in pancreatic stellate cell activation, collagen remodeling and tumor progression
2025-Apr-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217538
PMID:39924075
|
研究论文 | 本研究揭示了FKBP7作为胰腺星状细胞早期内质网标志物在细胞活化、胶原重塑和肿瘤进展中的作用机制 | 首次发现FKBP7作为胰腺星状细胞早期活化标志物，早于αSMA表达，并通过与BiP相互作用调控特定胶原亚型分泌 | 研究主要基于体外实验和动物模型，在人体内的具体作用机制仍需进一步验证 | 探究内质网驻留蛋白FKBP7在胰腺导管腺癌基质活化中的作用机制 | 胰腺星状细胞、癌症相关成纤维细胞、胰腺导管腺癌患者组织 | 分子生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、功能分析 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 胰腺导管腺癌患者组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 718 | 2025-10-07 |
The development and potent antitumor efficacy of CD44/CD133 dual-targeting IL7Rα-armored CAR-T cells against glioblastoma
2025-Apr-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217541
PMID:39952598
|
研究论文 | 本研究开发了靶向CD44和CD133的双特异性IL7Rα装甲CAR-T细胞，用于治疗胶质母细胞瘤 | 首创串联靶向CD44和CD133的双特异性CAR结构，并在CD28共刺激受体和CD3ζ信号链之间插入截短型IL-7受体α胞内结构域(Δ7R) | 临床前研究阶段，尚未进行人体临床试验 | 开发针对胶质母细胞瘤的新型免疫治疗方法 | 胶质瘤干细胞、胶质母细胞瘤患者样本、颅内异种移植模型、患者来源异种移植模型、胶质母细胞瘤类器官 | 免疫治疗 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 | CAR-T细胞疗法 | 测序数据、细胞表型数据 | 胶质母细胞瘤患者样本、患者来源模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 719 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell and bulk RNA sequencing data using machine learning identifies oxidative stress-related genes LUM and PCOLCE2 as potential biomarkers for heart failure
2025-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140793
PMID:39929468
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，利用机器学习识别出氧化应激相关基因LUM和PCOLCE2作为心力衰竭的潜在生物标志物 | 首次整合单细胞和bulk RNA测序数据，结合多种机器学习算法系统识别心力衰竭的氧化应激相关生物标志物 | 需要进一步研究验证其临床实用性 | 识别心力衰竭的氧化应激相关生物标志物 | 心力衰竭患者和横主动脉缩窄诱导的心力衰竭小鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | LASSO,XGBoost,Boruta,随机森林,梯度提升机,决策树,SVM-RFE | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 720 | 2025-10-07 |
Integrative analysis of bulk RNA and single-cell sequencing data reveals a liquid-liquid phase separation signature for clear cell renal cell carcinoma
2025-Apr-15, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149313
PMID:39921047
|
研究论文 | 本研究通过整合分析bulk RNA和单细胞测序数据，建立了一个基于液-液相分离相关基因的透明细胞肾细胞癌预后和免疫治疗反应预测标志 | 首次构建了基于液-液相分离相关基因的ccRCC预后特征，并验证了其与免疫浸润、免疫治疗反应的关系 | NA | 建立透明细胞肾细胞癌的预后和免疫治疗反应预测标志 | 透明细胞肾细胞癌患者和细胞 | 生物信息学 | 肾癌 | bulk RNA测序, 单细胞测序 | 单变量Cox回归, LASSO算法 | 基因表达数据 | TCGA数据库中的ccRCC样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |