单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 716 篇文献,本页显示第 701 - 716 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
701 2025-10-07
The future of cardiology: Integrating single-cell transcriptomics with multi-omics for enhanced cardiac disease insights
2025-Apr, Current problems in cardiology IF:3.0Q2
综述 探讨单细胞转录组测序技术在心血管疾病研究中的应用及其与多组学整合的未来发展方向 强调将空间转录组学与其他组学技术整合以增强对心脏生物学的理解 当前单细胞转录组测序面临数据整合挑战,需要更全面的多组学方法 通过整合单细胞转录组学与多组学技术提升对心血管疾病的认知 哺乳动物心脏细胞及心血管疾病机制 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 多组学分析 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
702 2025-10-07
Shining a light on cell biology of the nucleus with single-cell sequencing
2025-Apr, Current opinion in cell biology IF:6.0Q1
综述 本文综述了单细胞测序技术在细胞核生物学研究中的最新进展和应用 系统总结单细胞测序技术如何揭示细胞核内过程的异质性和相互作用机制 NA 探讨单细胞测序技术在细胞核生物学研究中的应用前景 细胞核生物学过程和细胞状态 单细胞生物学 NA 单细胞测序 NA 基因组数据,转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序,单细胞基因组测序 NA NA
703 2025-10-07
Gbp2 driving macrophages dynamics in murine heart transplant
2025-Apr, Tissue & cell IF:2.7Q3
研究论文 本研究通过生物信息学分析鉴定出Gbp2是驱动心脏移植排斥过程中巨噬细胞动态变化的关键基因 首次发现Gbp2在心脏移植急性排斥过程中调控巨噬细胞极化的关键作用 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床样本中验证 鉴定心脏移植排斥过程中巨噬细胞动态变化的关键基因并评估其对巨噬细胞极化的影响 小鼠心脏移植模型中的巨噬细胞 生物信息学 器官移植排斥 单细胞测序, 伪时序分析, hdWGCNA NA 单细胞测序数据 小鼠心脏移植模型数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
704 2025-10-07
Impaired primitive erythropoiesis and defective vascular development in Trim71-KO embryos
2025-Apr, Life science alliance IF:3.3Q1
研究论文 本研究揭示RNA结合蛋白Trim71通过调控中胚层先驱转录因子Eomes的表达,在胚胎原肠胚形成阶段建立器官发生正常发育框架的重要机制 首次发现Trim71通过NHL结构域直接抑制Eomes mRNA,建立了这两种重要调控基因之间的功能联系 内皮细胞条件性敲除未诱导明显缺陷,表明Trim71在内皮细胞及其前体细胞中的表达对胚胎存活并非必需 探究Trim71在胚胎发育过程中对基因表达的调控机制 Trim71基因敲除小鼠胚胎 发育生物学 胚胎发育缺陷 单细胞RNA测序,条件性基因敲除 基因敲除小鼠模型 基因表达数据 E7.5阶段全局敲除胚胎 NA 单细胞RNA-seq NA NA
705 2025-10-07
A novel coarsened graph learning method for scalable single-cell data analysis
2025-Apr, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1
研究论文 提出一种基于特征感知图粗化的新型方法FACH,用于可扩展的单细胞数据分析 首次将局部敏感哈希技术整合到图粗化过程中,实现高效的单细胞数据分析 NA 解决单细胞数据大规模图表示的计算挑战 单细胞RNA测序和质谱流式细胞术数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 图神经网络 单细胞数据 NA NA 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 NA NA
706 2025-10-07
Enhanced single-cell RNA-seq embedding through gene expression and data-driven gene-gene interaction integration
2025-Apr, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1
研究论文 提出一种整合基因表达和基因间相互作用的新型单细胞RNA测序嵌入方法 通过构建细胞-叶图(CLG)和K近邻图(KNNG)的融合图结构,首次将数据驱动的基因间相互作用整合到单细胞嵌入中 未明确说明方法对特定细胞类型或组织的适用性限制 开发更全面的单细胞RNA测序数据分析方法 单细胞RNA测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 图神经网络, 随机森林 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
707 2025-10-07
X-scPAE: An explainable deep learning model for embryonic lineage allocation prediction based on single-cell transcriptomics revealing key genes in embryonic cell development
2025-Apr, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1
研究论文 提出一种基于单细胞转录组数据的可解释深度学习模型X-scPAE,用于预测胚胎细胞谱系分配并识别关键基因 结合PCA降维、自编码器特征提取、注意力机制和反事实梯度归因算法,构建可解释的深度学习模型 NA 准确预测细胞谱系分配并识别谱系间基因表达差异 人类和小鼠的单细胞转录组数据 生物信息学 胚胎发育疾病 单细胞RNA测序 自编码器, 注意力机制, 逻辑回归 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
708 2025-10-07
Ephrin-B2 acts as a positive regulator of osteogenesis-angiogenesis coupling
2025-Apr, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究探讨了Ephrin-B2信号在成骨-血管生成偶联中的正向调控作用及其机制 首次通过单细胞测序发现牙周炎中成骨细胞谱系Ephrin-B2信号缺陷,并构建过表达Ephrin-B2的成骨细胞与内皮细胞共移植系统证实其促进血管化骨再生的作用 研究主要基于体外共培养和动物实验,尚未进行临床验证 探索Ephrin-B2信号在成骨-血管生成偶联中的作用机制,为牙周组织工程提供指导 牙周组织、成骨细胞、人脐静脉内皮细胞(HUVECs) 单细胞转录组学 牙周炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 来自公共数据库GEO: GSE171213的牙周组织单细胞数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
709 2025-10-07
Single-cell transcriptional footprint for pseudogene SsCLEC9A is associated with antigen processing and presentation in Sus scrofa
2025-Apr, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究首次发现猪的CLEC9A基因因远古突变成为假基因,但其突变转录本仍影响树突状细胞的抗原呈递功能 首次揭示猪CLEC9A基因成为假基因的进化事件,并发现其突变转录本仍具有生物学功能 研究主要基于体外实验,需要进一步体内验证 探究假基因SsCLEC9A的转录适应及其在抗原呈递中的作用 猪树突状细胞和骨髓造血细胞 免疫学 NA 荧光激活细胞分选,单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
710 2025-10-07
High antigen-presenting CAF levels correlate with reduced glycosaminoglycan biosynthesis-heparan sulfate/heparin metabolism in immune cells and poor prognosis in esophageal squamous cell carcinoma: Insights from bulk and single-cell transcriptome profiling
2025-Apr, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序发现食管鳞状细胞癌中抗原呈递CAF亚群通过调控糖胺聚糖生物合成-硫酸乙酰肝素/肝素代谢途径影响免疫细胞功能并导致不良预后 首次在食管鳞癌中鉴定出抗原呈递CAF亚群,并揭示其通过调控糖胺聚糖代谢通路重塑肿瘤代谢微环境的新机制 研究主要基于转录组数据,需要进一步实验验证代谢通路的具体功能机制 探究癌症相关成纤维细胞在食管鳞癌肿瘤微环境代谢重编程中的作用 食管鳞状细胞癌患者肿瘤样本中的癌症相关成纤维细胞和免疫细胞 单细胞转录组学 食管鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
711 2025-10-07
Unveiling FKBP7 as an early endoplasmic reticulum sentinel in pancreatic stellate cell activation, collagen remodeling and tumor progression
2025-Apr-01, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究揭示了FKBP7作为胰腺星状细胞早期内质网标志物在细胞活化、胶原重塑和肿瘤进展中的作用机制 首次发现FKBP7作为胰腺星状细胞早期活化标志物,早于αSMA表达,并通过与BiP相互作用调控特定胶原亚型分泌 研究主要基于体外实验和动物模型,在人体内的具体作用机制仍需进一步验证 探究内质网驻留蛋白FKBP7在胰腺导管腺癌基质活化中的作用机制 胰腺星状细胞、癌症相关成纤维细胞、胰腺导管腺癌患者组织 分子生物学 胰腺癌 单细胞RNA测序、免疫组织化学、功能分析 NA 基因表达数据、组织图像 胰腺导管腺癌患者组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
712 2025-10-07
The development and potent antitumor efficacy of CD44/CD133 dual-targeting IL7Rα-armored CAR-T cells against glioblastoma
2025-Apr-01, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究开发了靶向CD44和CD133的双特异性IL7Rα装甲CAR-T细胞,用于治疗胶质母细胞瘤 首创串联靶向CD44和CD133的双特异性CAR结构,并在CD28共刺激受体和CD3ζ信号链之间插入截短型IL-7受体α胞内结构域(Δ7R) 临床前研究阶段,尚未进行人体临床试验 开发针对胶质母细胞瘤的新型免疫治疗方法 胶质瘤干细胞、胶质母细胞瘤患者样本、颅内异种移植模型、患者来源异种移植模型、胶质母细胞瘤类器官 免疫治疗 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术 CAR-T细胞疗法 测序数据、细胞表型数据 胶质母细胞瘤患者样本、患者来源模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
713 2025-10-07
Integration of single-cell and bulk RNA sequencing data using machine learning identifies oxidative stress-related genes LUM and PCOLCE2 as potential biomarkers for heart failure
2025-Apr, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据,利用机器学习识别出氧化应激相关基因LUM和PCOLCE2作为心力衰竭的潜在生物标志物 首次整合单细胞和bulk RNA测序数据,结合多种机器学习算法系统识别心力衰竭的氧化应激相关生物标志物 需要进一步研究验证其临床实用性 识别心力衰竭的氧化应激相关生物标志物 心力衰竭患者和横主动脉缩窄诱导的心力衰竭小鼠模型 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 LASSO,XGBoost,Boruta,随机森林,梯度提升机,决策树,SVM-RFE 基因表达数据 未明确样本数量 NA 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 NA NA
714 2025-10-07
Integrative analysis of bulk RNA and single-cell sequencing data reveals a liquid-liquid phase separation signature for clear cell renal cell carcinoma
2025-Apr-15, Gene IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过整合分析bulk RNA和单细胞测序数据,建立了一个基于液-液相分离相关基因的透明细胞肾细胞癌预后和免疫治疗反应预测标志 首次构建了基于液-液相分离相关基因的ccRCC预后特征,并验证了其与免疫浸润、免疫治疗反应的关系 NA 建立透明细胞肾细胞癌的预后和免疫治疗反应预测标志 透明细胞肾细胞癌患者和细胞 生物信息学 肾癌 bulk RNA测序, 单细胞测序 单变量Cox回归, LASSO算法 基因表达数据 TCGA数据库中的ccRCC样本 NA 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 NA NA
715 2024-12-09
Rapid and efficient immune response induced by a designed modular cholera toxin B subunit (CTB)-based self-assembling nanoparticle
2025-Apr, Biomaterials IF:12.8Q1
研究论文 本文设计了一种基于霍乱毒素B亚单位(CTB)的自组装纳米颗粒,并研究了其快速免疫激活机制 该纳米疫苗通过CTB五聚体和非天然三聚体域自组装,展示了S. Paratyphi A O-多糖抗原,并揭示了其在淋巴结中的动态变化和强大的体液免疫反应能力 免疫激活机制的深入理解仍有限,限制了此类纳米载体的进一步扩展 研究新型自组装纳米疫苗的快速免疫激活机制,并评估其在不同感染模型中的预防效果 基于CTB的自组装纳米颗粒及其在免疫激活中的作用 免疫学 感染性疾病 单细胞RNA测序 NA RNA NA NA NA NA NA
716 2024-12-09
A 3D-printed microdevice encapsulates vascularized islets composed of iPSC-derived β-like cells and microvascular fragments for type 1 diabetes treatment
2025-Apr, Biomaterials IF:12.8Q1
研究论文 本文介绍了一种3D打印的微型装置,用于封装血管化的胰岛,这些胰岛由诱导多能干细胞(iPSC)衍生的β样细胞和微血管片段组成,用于治疗1型糖尿病 创新点在于使用3D打印技术制造了一种可回收的微型装置,封装了血管化的胰岛,用于长期治疗1型糖尿病 研究仅在C57BL/6小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 开发一种新的治疗方法,通过移植血管化的胰岛来治疗1型糖尿病 诱导多能干细胞衍生的β样细胞和微血管片段 NA 1型糖尿病 3D打印技术 NA 单细胞RNA测序数据 C57BL/6小鼠 NA NA NA NA
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