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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2025-10-07 |
Uncovering gene and cellular signatures of immune checkpoint response via machine learning and single-cell RNA-seq
2025-Apr-02, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00883-z
PMID:40169777
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和机器学习方法预测免疫检查点抑制剂治疗反应 | 开发了可解释的机器学习模型,在保持单细胞分辨率的同时预测治疗反应,并识别出跨癌种通用的11基因标志物 | 研究主要基于黑色素瘤数据,在其他癌种中的验证仍需进一步研究 | 预测免疫检查点抑制剂治疗反应并识别关键生物标志物 | 黑色素瘤浸润免疫细胞 | 机器学习 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | XGBoost, 强化学习 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 682 | 2025-10-07 |
Characterization of shell field populations in gastropods and their autonomous specification mechanism independent of inter-quartet interactions
2025-Apr-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204538
PMID:40105679
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研究论文 | 本研究重新探讨了帽贝壳场特化的诱导假说,发现壳场细胞群具有自主特化机制 | 首次在帽贝中证明壳场细胞群(源自第二四分体)的特化不依赖于与其他四分体细胞的相互作用 | 研究仅针对帽贝一种物种,结论在其他软体动物中的普适性有待验证 | 探究软体动物胚胎壳场特化的细胞自主性机制 | 帽贝胚胎和分离的第二四分体(2q)细胞 | 发育生物学 | NA | 双色原位杂交,单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据,转录组数据 | 16细胞期胚胎及分离的2q细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 683 | 2025-10-07 |
Deletion of hepcidin disrupts iron homeostasis and hematopoiesis in zebrafish embryogenesis
2025-Apr-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204307
PMID:40110772
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研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9技术构建铁调素敲除斑马鱼模型,揭示其在胚胎期铁稳态和造血过程中的关键作用 | 首次在斑马鱼模型中证实铁调素缺失导致胚胎铁过载和造血异常,并发现特定血液祖细胞亚型出现铁死亡现象 | 研究局限于斑马鱼模型,需进一步验证在哺乳动物系统中的适用性 | 探究铁调素在斑马鱼胚胎造血过程中的调控机制 | 斑马鱼胚胎和血液祖细胞 | 发育生物学 | 血液疾病 | CRISPR/Cas9基因编辑,单细胞RNA测序 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 斑马鱼胚胎模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 684 | 2025-10-07 |
Differentiation stage predicts radiosensitivity in mesenchymal-like pancreatic cancer
2025-Apr-01, International journal of radiation oncology, biology, physics
DOI:10.1016/j.ijrobp.2025.03.034
PMID:40180058
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据开发分化阶段分类器,用于预测间充质样胰腺癌的放射敏感性 | 首次发现胰腺癌细胞分化阶段与放射敏感性相关,并证明染色质压缩状态与分化阶段存在关联 | 研究主要基于细胞系数据,需要进一步临床验证 | 开发基因组分类器预测胰腺癌放射敏感性,实现基因组指导的放射治疗 | 胰腺癌细胞系和胰腺癌患者 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | 基因组分类器 | 基因表达数据 | 45个胰腺癌细胞系,TCGA胰腺癌患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 685 | 2025-04-04 |
Integration of Flow Cytometry and Single-Cell RNA Sequencing Analysis to Explore the Fibroblast Subpopulations in Keloid that Correlate with Recurrence
2025-Apr-03, Advances in wound care
IF:5.8Q1
DOI:10.1089/wound.2024.0262
PMID:40177712
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研究论文 | 本研究通过整合流式细胞术和单细胞RNA测序分析,探索了与瘢痕疙瘩复发相关的成纤维细胞亚群 | 首次鉴定了影响瘢痕疙瘩复发的关键致病性成纤维细胞亚群FB1,并发现CD26+/CD117+/CD34+表型可作为复发预测标志物 | 研究样本来源为公共数据库,缺乏独立验证队列 | 鉴定参与瘢痕疙瘩复发的关键致病性细胞亚群 | 瘢痕疙瘩组织中的成纤维细胞亚群 | 单细胞组学 | 皮肤纤维化疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术(FCM) | 逻辑回归分析 | 单细胞转录组数据、流式细胞数据 | 公共数据库中的瘢痕疙瘩组织样本(具体数量未说明) | NA | NA | NA | NA |
| 686 | 2025-10-07 |
PKCδ Germline Variants and Genetic Deletion in Mice Augment Antitumor Immunity through Regulation of Myeloid Cells
2025-Apr-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0999
PMID:39808445
|
研究论文 | 本研究通过分析种系变异发现PKCδ是癌症免疫治疗的潜在靶点,并证实其缺失可通过调节髓系细胞增强抗肿瘤免疫 | 首次将PKCδ种系变异与肿瘤免疫特征关联,并证明其通过调控巨噬细胞M1/M2表型转换增强抗PD-1/PD-L1疗效 | 主要基于小鼠模型,临床样本验证仍需扩展 | 探索新型癌症免疫治疗靶点 | PKCδ基因变异、髓系细胞、肿瘤微环境 | 癌症免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序、基因敲除、条件性基因删除 | NA | 基因表达数据、临床样本数据 | 小鼠模型和临床样本(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 687 | 2024-12-30 |
Correction to: Unveiling the dynamics of B lymphocytes in systemic lupus erythematosus patients treated with belimumab through longitudinal single-cell RNA sequencing
2025-Apr-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keae694
PMID:39731783
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 688 | 2025-10-07 |
Machine Learning Unveils Sphingolipid Metabolism's Role in Tumour Microenvironment and Immunotherapy in Lung Cancer
2025-Apr, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70435
PMID:40159631
|
研究论文 | 本研究通过机器学习方法揭示鞘脂代谢在肺癌肿瘤微环境形成和免疫治疗中的作用机制 | 首次整合机器学习算法和单细胞测序技术系统分析鞘脂代谢基因在肺癌肿瘤微环境中的调控作用 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探究鞘脂代谢在肺癌肿瘤微环境免疫调控中的作用及其对免疫治疗的影响 | 肺腺癌(LUAD)和肺鳞癌(LUSC)患者样本 | 机器学习 | 肺癌 | 转录组分析,单细胞RNA测序 | Lasso回归,生存SVM | 基因表达数据,临床数据 | TCGA和GTEx数据库中的肺癌临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq,转录组测序 | NA | NA |
| 689 | 2025-10-07 |
Comprehensive Multi-omics and Mendelian Randomization Reveal the Key Role of Monocytes in Aging and Osteoarthritis
2025-Apr-02, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01416-6
PMID:40172742
|
研究论文 | 通过多组学和孟德尔随机化方法揭示单核细胞在衰老和骨关节炎中的关键作用 | 首次整合单细胞RNA测序、批量RNA-seq数据和孟德尔随机化分析,发现单核细胞亚群在骨关节炎和衰老中的异质性,并鉴定出四个与骨关节炎有因果关系的关键标志基因 | 需要独立验证队列进一步确认研究结果,机制研究仍需深入 | 探索骨关节炎与衰老之间的潜在联系和分子机制 | 骨关节炎患者、衰老个体和对照组的单核细胞亚群 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 孟德尔随机化, 共定位分析, 细胞功能分析 | 孟德尔随机化模型 | 基因表达数据 | 包含骨关节炎、衰老和对照组的多组学数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 690 | 2025-10-07 |
Dynamic Alterations in DNA Methylation of CD4+ T Cells and Macrophages in a Murine Model of Tuberculous Pleural Infection Induced by BCG Vaccination
2025-Apr, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70166
PMID:40170749
|
研究论文 | 本研究通过分析BCG诱导的小鼠结核性胸膜炎模型中CD4+ T细胞和巨噬细胞的DNA甲基化动态变化 | 首次揭示了结核性胸膜炎进展过程中免疫细胞DNA甲基化的动态变化特征及其对T细胞分化的调控作用 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证 | 探究结核性胸膜炎中免疫细胞的表观遗传调控机制 | BCG诱导的结核性胸膜炎小鼠模型中的CD4+ T细胞和巨噬细胞 | 表观遗传学 | 结核病 | DNA甲基化测序,转录组测序,单细胞RNA测序 | NA | 表观遗传数据,转录组数据 | BCG诱导的小鼠胸膜炎模型在0、1、7、14天时间点的胸膜灌洗液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 691 | 2025-10-07 |
Transitional CXCL14+ cancer-associated fibroblasts enhance tumour metastasis and confer resistance to EGFR-TKIs, revealing therapeutic vulnerability to filgotinib in lung adenocarcinoma
2025-Apr, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70281
PMID:40162549
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析识别了肺腺癌中过渡性CXCL14+肌成纤维样癌症相关成纤维细胞,揭示了其促进肿瘤转移和EGFR-TKI耐药的作用机制 | 首次发现过渡性CXCL14+肌成纤维样CAF亚群在肺腺癌进展和EGFR-TKI耐药中的关键作用,并筛选出Filgotinib作为逆转该耐药的有效药物 | 研究主要聚焦于肺腺癌,在其他癌症类型中的适用性需要进一步验证 | 探究癌症相关成纤维细胞异质性在肺腺癌进展和治疗耐药中的作用机制 | 肺腺癌患者组织样本、血浆样本及相应的实验模型 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫组织化学,ELISA | NA | 单细胞测序数据,空间转录组数据,临床样本数据 | 多个独立肺腺癌队列的临床样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 692 | 2025-10-07 |
Integrated multi-omics analyses provide new insights into genomic variation landscape and regulatory network candidate genes associated with walnut endocarp
2025-Apr, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70113
PMID:40162720
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学分析揭示了核桃内果皮发育的基因组变异格局和调控网络候选基因 | 构建了首个核桃图形结构泛基因组,通过多组学整合分析鉴定了与木质素积累相关的关键候选基因 | 研究主要基于核桃品种,可能无法完全代表所有核桃种质的遗传多样性 | 系统解析核桃内果皮发育的基因组基础和调控网络 | 波斯核桃(Juglans regia)及其8个近缘种,共285个种质材料 | 植物基因组学 | NA | 基因组测序, GWAS, 转录组学, 代谢组学, DNA甲基化, 空间转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 代谢组数据, 表观遗传数据 | 285个核桃种质材料,涵盖11个发育阶段 | NA | 全基因组重测序, 多组学整合分析 | NA | NA |
| 693 | 2025-10-07 |
Spatial Transcriptomics and Proteomics Profiling After Ischemic Stroke Reperfusion: Insights Into Vascular Alterations
2025-Apr, Stroke
IF:7.8Q1
DOI:10.1161/STROKEAHA.124.048085
PMID:40052263
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和蛋白质组学分析缺血性卒中再灌注后的脑血管变化 | 首次结合空间转录组学和蛋白质组学技术,在空间维度上揭示缺血性卒中再灌注后微血管表达谱的变化 | 研究仅使用雄性小鼠模型,样本量较小(n=5),且仅观察了早期(24小时)变化 | 研究缺血性卒中再灌注后脑血管变化的分子机制 | 13-14周龄C57BL/6JRj雄性小鼠的脑实质内皮细胞和周细胞 | 空间转录组学 | 缺血性卒中 | 空间转录组学, 蛋白质组学, 免疫组织化学, Nissl染色 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 组织图像 | 5只雄性小鼠 | NA | 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 694 | 2025-10-07 |
Programmed Cell Death 10 (PDCD10) Is a Candidate Tumor-associated Gene in Esophageal Squamous Cell Carcinoma
2025-Apr, Anticancer research
IF:1.6Q4
DOI:10.21873/anticanres.17527
PMID:40155014
|
研究论文 | 本研究通过分析染色体扩增区域鉴定PDCD10作为食管鳞状细胞癌的新型候选肿瘤相关基因 | 首次发现PDCD10在ESCC中显著扩增和过表达,并确认其与不良预后的关联,同时筛选出阿泽拉酸和瑞巴派特作为潜在靶向治疗药物 | 研究主要基于生物信息学分析和细胞系实验,缺乏体内实验验证 | 鉴定食管鳞状细胞癌中新的肿瘤相关基因 | 食管鳞状细胞癌组织和细胞系 | 癌症基因组学 | 食管癌 | DNA拷贝数变异分析,RNA测序,单细胞RNA测序,免疫组织化学 | Cox回归分析,Kaplan-Meier生存分析 | 基因组数据,转录组数据,临床病理数据 | TCGA和CCLE数据库中的ESCC样本,GEO数据库中的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | 使用Scanpy分析单细胞RNA测序数据 |
| 695 | 2025-10-07 |
Single-cell insights into HNSCC tumor heterogeneity and programmed cell death pathways
2025-Apr, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102341
PMID:40068384
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示头颈部鳞状细胞癌肿瘤异质性,识别C2 MALAT1+肿瘤亚群的独特特征并开发新型预后模型 | 首次利用单细胞测序系统分析HNSCC肿瘤亚群,发现C2 MALAT1+肿瘤亚群具有最低的CytoTRACE评分和独特的程序性死亡通路表达特征,并建立了基于MALAT1肿瘤风险评分的新型预后模型 | 未明确说明样本规模和具体实验验证细节 | 解析HNSCC肿瘤异质性,识别治疗靶点并优化预后模型 | 头颈部鳞状细胞癌肿瘤细胞亚群,特别是C2 MALAT1+肿瘤亚群 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,伪时间轨迹分析,干性分析,LASSO回归 | LASSO回归模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 696 | 2025-10-07 |
Pathogenesis of systemic sclerosis: an integrative review of recent advances
2025-Apr-01, Journal of rheumatic diseases
IF:2.2Q3
DOI:10.4078/jrd.2024.0129
PMID:40134549
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综述 | 系统性硬化症的发病机制整合性综述,涵盖最新研究进展 | 强调从基础研究向精准治疗方法的转变,整合多组学数据探索致病细胞亚型 | NA | 探讨系统性硬化症的发病机制和精准治疗方向 | 系统性硬化症的病理机制和治疗方法 | NA | 系统性硬化症 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组, 基因组, 蛋白质组, 表观基因组 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 697 | 2025-10-07 |
Knowledge of the genetics of human pain gained over the last decade from next-generation sequencing
2025-Apr, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107667
PMID:39988004
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综述 | 本文总结了近十年来利用二代测序技术在人类疼痛遗传学领域取得的研究进展 | 揭示了疼痛相关基因的新型突变谱、发现了关键的可变剪接事件、开发了基于NGS的疼痛预测模型,并构建了神经病理性疼痛体感系统图谱 | 面临复杂数据分析的挑战和罕见遗传变异生物学功能解读的困难 | 探索人类疼痛的遗传学基础并推动个性化疼痛管理 | 疼痛相关基因和遗传变异 | 基因组学 | 疼痛相关疾病 | 二代测序,单细胞转录组学 | 分类器 | 基因组数据,转录组数据 | NA | NA | 二代测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 698 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals ECM remodeling-tumor stiffness-FAK as a key driver of vestibular schwannoma progression
2025-Apr, Progress in neurobiology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.pneurobio.2025.102730
PMID:39988022
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示细胞外基质重塑-肿瘤硬度-FAK信号通路是前庭神经鞘瘤进展的关键驱动因素 | 首次在单细胞水平揭示前庭神经鞘瘤进展与机械刺激反应和神经营养因子信号通路的关联,并明确ECM重塑-肿瘤硬度-FAK信号轴的作用机制 | 研究主要基于体外实验,需要进一步的体内验证和临床前研究 | 探究肿瘤硬度-FAK信号通路在前庭神经鞘瘤进展中的作用机制 | 前庭神经鞘瘤细胞 | 单细胞测序分析 | 前庭神经鞘瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据,组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 699 | 2025-10-07 |
SPRY1 regulates macrophage M1 polarization in skin aging and melanoma prognosis
2025-Apr, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102331
PMID:40023001
|
研究论文 | 本研究探讨SPRY1在皮肤衰老中的作用,特别是其对巨噬细胞M1极化的调控及其在黑色素瘤预后中的潜在价值 | 首次揭示SPRY1通过调控巨噬细胞M1极化促进皮肤衰老的机制,并发现其在黑色素瘤预后中的临床意义 | 缺乏体内实验验证,需要进一步研究其调控网络 | 研究SPRY1在皮肤衰老中的功能及其作为治疗靶点的潜力 | RAW264.7小鼠单核/巨噬细胞白血病细胞和NIH/3T3小鼠皮肤成纤维细胞 | 生物信息学 | 皮肤衰老和黑色素瘤 | 单细胞测序,WGCNA,qRT-PCR,CCK-8检测,ROS和SOD活性测量 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 来自GTEx和GEO数据库的数据集,以及细胞系实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 700 | 2025-10-07 |
Radiation from frequent whole-body CT scans induces systemic immunosuppression and immune activation of tumor tissue
2025-Apr, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102326
PMID:40014978
|
研究论文 | 本研究探讨重复全身CT扫描对系统性免疫和肿瘤免疫微环境的影响 | 首次揭示重复CT扫描辐射同时引起系统性免疫抑制和肿瘤组织免疫激活的双向效应 | 研究基于小鼠Lewis肺癌模型,结果需在人类临床研究中进一步验证 | 阐明重复全身CT扫描对系统性免疫、肿瘤免疫微环境和肿瘤控制的影响 | Lewis肺癌小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | ELISA, 流式细胞术, 免疫组织化学, RNA测序, 单细胞测序 | NA | 生物分子数据, 细胞计数数据, 基因表达数据 | 两组Lewis肺癌小鼠模型(对照组和多次CT扫描辐射组) | NA | 单细胞测序, RNA测序 | NA | NA |