单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 733 篇文献，本页显示第 661 - 680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2025-10-07 |
NAALAD2 mutations disrupt the fate of photoreceptor cells and retinal pigment epithelial cells during early retinal development
2025-Apr-02, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107724
PMID:40185296
|
研究论文 | 本研究通过发现NAALAD2基因新突变并利用点突变敲入小鼠模型，揭示了该突变通过影响光感受器细胞和视网膜色素上皮细胞的命运导致病理性近视的机制 | 首次报道人类NAALAD2基因突变与病理性近视的关联，并通过单细胞RNA测序揭示了该突变对视网膜细胞组成和转录谱的影响 | 研究基于单个中国家族的突变发现，样本规模有限，需要更大样本验证 | 探究NAALAD2突变在病理性近视发病机制中的作用 | NAALAD2点突变敲入小鼠模型，特别是视锥细胞、视杆细胞和视网膜色素上皮细胞 | 单细胞组学 | 病理性近视 | 单细胞RNA测序 | 点突变敲入小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 一个中国家族和对应的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 662 | 2025-10-07 |
S100A8/A9 innate immune signaling as a distinct mechanism driving progression of smoking-related breast cancers
2025-Apr, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03276-5
PMID:39856330
|
研究论文 | 本研究揭示了吸烟通过S100A8/A9先天免疫信号通路促进乳腺癌进展的新机制 | 首次发现α7 nAChR-S100A8/A9-Syntaphilin免疫信号模块驱动尼古丁诱导的肿瘤进展，并识别出吸烟相关乳腺癌作为侵袭性乳腺癌的独特亚型 | NA | 探索吸烟促进乳腺癌进展的分子机制 | 乳腺癌细胞、吸烟相关的乳腺癌患者样本 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 663 | 2025-10-07 |
Macrophages protect against sensory axon loss in peripheral neuropathy
2025-Apr, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08535-1
PMID:39939762
|
研究论文 | 本研究揭示肥胖前期小鼠中巨噬细胞通过galectin 3延缓外周神经病变中感觉轴突变性的保护机制 | 首次发现肥胖诱导的外周神经病变中浸润性巨噬细胞具有神经保护作用，而非传统认知的促炎损伤作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类患者中验证；观察时间窗口为6个月，长期效应未知 | 探究炎症反应在外周神经病变发病机制中的作用 | 高脂高果糖饮食诱导的肥胖前期小鼠模型 | 神经科学 | 糖尿病外周神经病变 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 664 | 2025-10-07 |
MiR-146a engineered extracellular vesicles derived from mesenchymal stromal cells more potently attenuate ischaemia-reperfusion injury in lung transplantation
2025-Apr, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70298
PMID:40195092
|
研究论文 | 本研究探讨了通过雾化递送miR-146a工程化人脐带间充质干细胞胞外囊泡在大鼠肺移植模型中减轻缺血再灌注损伤的效果 | 首次将miR-146a工程化的hucMSC-EVs通过雾化方式递送至肺移植模型，并证明其通过IRAK1/TRAF6/NF-κB通路抑制NLRP3炎症小体激活的机制 | 研究仅使用大鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 开发减轻肺移植中缺血再灌注损伤的新治疗策略 | 大鼠肺移植模型和细胞冷保存再灌注模型 | 生物医学工程 | 肺移植相关疾病 | bulk-RNA测序, 单细胞测序分析, 免疫荧光, Western blot | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 665 | 2025-04-10 |
ROICellTrack: A deep learning framework for integrating cellular imaging modalities in subcellular spatial transcriptomic profiling of tumor tissues
2025-Apr-08, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf152
PMID:40199763
|
研究论文 | 开发了一个名为ROICellTrack的深度学习框架，用于更好地整合细胞成像与空间转录组分析 | 提出了一种新的深度学习框架，将细胞成像与空间转录组分析相结合，以分析肿瘤异质性 | 研究样本量较小，仅分析了56个ROI | 提高对肿瘤异质性的理解，以支持个性化和靶向治疗 | 膀胱尿路上皮癌（UCB）和上尿路尿路上皮癌（UTUC）的肿瘤组织 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 空间转录组技术（如GeoMx Digital Spatial Profiler） | 深度学习 | 图像和转录组数据 | 56个ROI | NA | NA | NA | NA |
| 666 | 2025-10-07 |
Fasting-mimicking diet-enriched Bifidobacterium pseudolongum suppresses colorectal cancer by inducing memory CD8+ T cells
2025-Apr-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-333020
PMID:39870395
|
研究论文 | 本研究揭示了模拟禁食饮食通过富集假长双歧杆菌及其代谢产物L-精氨酸促进CD8+组织驻留记忆T细胞分化，从而抑制结直肠癌的机制 | 首次发现假长双歧杆菌是模拟禁食饮食抗肿瘤作用的关键介质，并阐明其通过产生L-精氨酸诱导记忆性CD8+T细胞分化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证样本有限，机制研究尚未完全阐明所有信号通路 | 探究模拟禁食饮食通过肠道菌群调节抑制结直肠癌的免疫机制 | 结直肠癌小鼠模型和结直肠癌患者 | 免疫学与肿瘤学 | 结直肠癌 | 粪便宏基因组测序、单细胞RNA测序、多色流式细胞术、代谢组学分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据、流式细胞数据 | 结直肠癌小鼠模型和有限数量的结直肠癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 宏基因组测序, 代谢组学 | NA | NA |
| 667 | 2025-10-07 |
Exploring and validating the marmoset as a primate model for chromosomal instability in early development
2025-Apr-07, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf012
PMID:40193493
|
研究论文 | 本研究验证了狨猴作为研究灵长类早期发育中染色体不稳定性的合适模型 | 首次发现狨猴胚胎中存在异质性非整倍体，建立了naïve样狨猴多能干细胞系，揭示了非整倍体在囊胚发育中促进腔体形成的新作用 | 研究受限于动物模型系统，无法直接验证人类胚胎中的机制 | 探索灵长类早期发育中染色体不稳定性的调控机制 | 狨猴胚胎细胞和naïve样狨猴多能干细胞 | 发育生物学 | 胚胎发育异常 | 单细胞RNA测序，转录组分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 668 | 2025-10-07 |
Integrating microbial GWAS and single-cell transcriptomics reveals associations between host cell populations and the gut microbiome
2025-Apr-07, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-025-01978-w
PMID:40195537
|
研究论文 | 开发计算框架scBPS整合微生物GWAS和单细胞转录组数据，揭示宿主细胞群体与肠道微生物组的关联 | 首次将微生物全基因组关联研究(GWAS)与单细胞RNA测序数据整合，开发scBPS计算方法系统解析宿主-微生物相互作用 | 研究主要基于计算预测和有限实验验证，需要更多功能实验确认机制 | 探索宿主遗传、肠道微生物组与特定细胞环境之间的关联机制 | 人类24个器官的单细胞RNA测序数据和207种微生物分类群 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,微生物GWAS,转录组分析 | 计算框架(scBPS) | 基因组数据,转录组数据 | 24个人类器官,207种微生物分类群,254种宿主细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq,单核RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 669 | 2025-10-07 |
A replication study of novel fetal hemoglobin-associated genetic variants in sickle cell disease-only cohorts
2025-Apr-06, Human molecular genetics
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/hmg/ddaf015
PMID:39886999
|
研究论文 | 本研究验证了镰状细胞病中五个新的胎儿血红蛋白相关遗传位点，并通过功能实验探索其调控机制 | 首次在独立镰状细胞病队列中验证了五个新的HbF相关遗传位点，并结合CRISPR抑制和单细胞转录组学揭示其功能机制 | 未能在1354名SCD患者中发现对HbF水平有较大影响的罕见遗传变异 | 验证镰状细胞病中新的胎儿血红蛋白相关遗传变异并探索其功能机制 | 镰状细胞病患者和HUDEP-2红细胞系 | 遗传学 | 镰状细胞病 | GWAS, CRISPR抑制, 单细胞转录组学, 全外显子组测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 最多3740名SCD患者用于验证研究，1354名SCD患者用于外显子分析 | NA | 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 670 | 2025-10-07 |
Multi-omics analysis identifies DLX4 as a novel biomarker for diagnosis, prognosis, and immune infiltration: from pan-cancer to renal cancer
2025-Apr-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02258-z
PMID:40186710
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨DLX4基因在泛癌及肾癌中的诊断、预后和免疫浸润价值 | 首次系统揭示DLX4在泛癌中的表达模式及其与免疫浸润的关联，特别是在肾透明细胞癌中的空间定位特征 | 研究主要基于数据库分析，实验验证部分相对有限 | 探索DLX4在癌症中的分子机制及其作为生物标志物的潜力 | 多种癌症类型，特别关注肾透明细胞癌(KIRC) | 生物信息学 | 肾癌 | 多组学分析, 空间转录组学, 实时PCR, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 突变数据, 甲基化数据, 免疫数据 | 26种癌症类型，具体样本数量未明确说明 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 671 | 2025-10-07 |
Multi-omics insights into the roles of CCNB1, PLK1, and HPSE in breast cancer progression: implications for prognosis and immunotherapy
2025-Apr-05, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02282-z
PMID:40186712
|
研究论文 | 通过多组学方法研究CCNB1、PLK1和HPSE在乳腺癌进展中的作用及其预后和免疫治疗意义 | 首次整合转录组学、蛋白质组学、DNA甲基化分析、免疫浸润分析和单细胞RNA测序等多组学方法系统研究这三个基因在乳腺癌中的协同作用 | 未明确说明样本来源和具体样本量，功能验证实验仅限于细胞增殖分析 | 探究CCNB1、PLK1和HPSE在乳腺癌进展中的具体作用机制 | 乳腺癌肿瘤组织和细胞系 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组学, 蛋白质组学, DNA甲基化分析, 免疫浸润分析, 单细胞RNA测序, siRNA敲低 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 甲基化数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | NA |
| 672 | 2025-10-07 |
Revealing NAPSA's role in ccRCC: Insights from single-cell RNA sequencing
2025-Apr-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149478
PMID:40194687
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示NAPSA基因在透明细胞肾细胞癌中的表达特征和潜在作用机制 | 首次在单细胞水平系统分析NAPSA在ccRCC中的表达模式，并发现其与EMT过程及肿瘤微环境中细胞通讯的关联 | 样本量较小（7个肿瘤和2个正常样本），需要更大规模研究验证；机制研究尚不完善 | 探究NAPSA基因在透明细胞肾细胞癌中的表达特征和功能作用 | 透明细胞肾细胞癌组织样本和细胞系（OS-RC-2和Caki-1） | 单细胞测序分析 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序，免疫荧光染色，siRNA转染 | Seurat分析流程 | 单细胞RNA测序数据，基因表达数据 | 7个肿瘤样本和2个正常样本（来自GEO数据库GSE210042），外加两个ccRCC细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 673 | 2025-10-07 |
Esophageal epithelial Ikkβ deletion promotes eosinophilic esophagitis in experimental allergy mouse model
2025-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.12.1070
PMID:39724973
|
研究论文 | 本研究通过构建食管上皮细胞特异性Ikkβ敲除小鼠模型，揭示了上皮IKKβ/NF-κB信号通路在嗜酸细胞性食管炎发病机制中的关键保护作用 | 首次在实验性过敏小鼠模型中证明食管上皮细胞特异性Ikkβ缺失会加剧嗜酸细胞性食管炎病理特征 | 研究基于小鼠模型，与人类疾病存在物种差异；机制研究尚未完全阐明所有下游效应 | 探究上皮IKKβ/NF-κB信号通路在嗜酸细胞性食管炎发病机制中的作用 | 食管上皮细胞特异性Ikkβ敲除小鼠模型 | 病理学 | 嗜酸细胞性食管炎 | 单细胞RNA测序，组织学分析，转录组分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，组织图像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 674 | 2025-10-07 |
Origin and stepwise evolution of vertebrate lungs
2025-Apr, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-025-02642-6
PMID:39953253
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析脊椎动物肺器官的起源和逐步演化过程 | 首次在软骨鱼类中发现肺发育相关的遗传基础，识别哺乳动物特异性肺泡细胞类型和基因 | 研究主要基于基因表达数据，功能验证仅限于小鼠模型 | 探究脊椎动物肺器官的演化起源和分子机制 | 脊椎动物成年和发育期肺组织 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多种脊椎动物物种的肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 675 | 2025-10-07 |
Aspartame increases the risk of liver cancer through CASP1 protein: A comprehensive network analysis insights
2025-Apr-01, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118089
PMID:40139029
|
研究论文 | 通过综合网络毒理学、孟德尔随机化、分子动力学和单细胞RNA测序分析，系统探索阿斯巴甜通过CASP1蛋白增加肝癌风险的机制 | 首次整合网络毒理学、孟德尔随机化、分子动力学和单细胞技术系统研究阿斯巴甜的致癌机制，发现CASP1是阿斯巴甜诱导肝癌的关键靶点 | 需要后续实验验证阿斯巴甜的致癌机制，研究结果主要基于计算和预测方法 | 系统探索阿斯巴甜的致癌潜力及其对肝脏的作用机制 | 阿斯巴甜及其与肝癌相关的分子靶点 | 计算生物学 | 肝癌 | 网络毒理学、孟德尔随机化、分子动力学模拟、单细胞RNA测序 | 分子对接模型、分子动力学模型 | 计算预测数据、分子对接数据、单细胞表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 676 | 2025-10-07 |
H1-0 is a specific mediator of the repressive ETV6::RUNX1 transcriptional landscape in preleukemia and B cell acute lymphoblastic leukemia
2025-Apr, HemaSphere
IF:7.6Q1
DOI:10.1002/hem3.70116
PMID:40177616
|
研究论文 | 本研究通过hiPSC模型发现H1-0是ETV6::RUNX1融合基因诱导的转录抑制景观的关键调控因子 | 首次揭示连接组蛋白H1-0在ETV6::RUNX1阳性前白血病状态中的关键调控作用 | 研究主要基于hiPSC模型，需要进一步在体内验证 | 探索ETV6::RUNX1阳性前白血病细胞维持静息状态的分子机制 | ETV6::RUNX1阳性B细胞前体急性淋巴细胞白血病 | 分子生物学 | 急性淋巴细胞白血病 | CRISPR/Cas9基因编辑，单细胞测序，双荧光素酶报告基因检测 | hiPSC模型 | 转录组数据 | 1,727例白血病患者样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 677 | 2025-10-07 |
The role of lactate metabolism in retinoblastoma tumorigenesis and ferroptosis resistance
2025-Apr-01, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2025.102893
PMID:40188688
|
研究论文 | 本研究探讨乳酸代谢在视网膜母细胞瘤肿瘤发生和铁死亡抵抗中的关键作用 | 首次在单细胞水平揭示视网膜母细胞瘤中乳酸代谢特征，发现MCT1介导的乳酸转运促进肿瘤发生和铁死亡抵抗的新机制 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，需要进一步临床验证 | 阐明乳酸代谢在视网膜母细胞瘤肿瘤发生和铁死亡抵抗中的作用机制 | 视网膜母细胞瘤患者组织样本、视网膜母细胞瘤细胞系和小鼠异种移植模型 | 数字病理学 | 视网膜母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 患者视网膜母细胞瘤组织和正常视网膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 678 | 2025-10-07 |
Individualized patient tumor organoids faithfully preserve human brain tumor ecosystems and predict patient response to therapy
2025-Apr-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.01.002
PMID:39938519
|
研究论文 | 开发了一种快速高效的个体化患者肿瘤类器官(IPTO)培养系统，能够准确模拟人脑肿瘤的细胞和分子病理特征 | 利用iPSC来源的脑类器官培养患者来源的肿瘤外植体，首次实现了包括成人、儿童和转移性脑癌在内的多种中枢神经系统肿瘤的体外培养 | 未明确说明样本规模和研究队列的具体细节 | 建立能够预测患者特异性治疗反应的临床前肿瘤模型 | 人脑肿瘤组织样本，包括成人、儿童和转移性脑癌 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 基因组学, 表观基因组学, 组织病理学分析 | IPTO(个体化患者肿瘤类器官)模型 | 基因组数据, 转录组数据, 表观基因组数据, 图像数据 | 前瞻性患者队列(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 679 | 2025-10-07 |
Interferon-responsive intestinal BEST4/CA7+ cells are targets of bacterial diarrheal toxins
2025-Apr-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.02.003
PMID:40010349
|
研究论文 | 本研究通过人类肠道类器官模型揭示了BEST4/CA7+细胞在细菌感染引起的腹泻中的作用机制 | 首次建立人类肠道类器官中BEST4/CA7细胞的分化方法，发现其对细菌毒素的响应机制及去甲肾上腺素-ADRA2A轴的调控作用 | 缺乏小鼠模型验证，人类体外模型数量有限 | 探究肠道BEST4/CA7细胞在电解质平衡和免疫应答中的功能 | 人类肠道BEST4/CA7细胞 | 单细胞生物学 | 细菌性腹泻 | 单细胞RNA测序, 类器官培养 | 人类肠道类器官模型 | 基因表达数据, 功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 680 | 2025-10-07 |
Exploring Human Brain Metabolism via Genome-Scale Metabolic Modeling with Highlights on Multiple Sclerosis
2025-04-02, ACS chemical neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.1021/acschemneuro.5c00006
PMID:40091499
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA-seq数据和基因组规模代谢模型，构建了人脑细胞特异性代谢模型并应用于多发性硬化症研究 | 首次构建了包含神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞、少突胶质细胞和少突胶质前体细胞的脑细胞特异性GEMs，并创建了整合的iHumanBrain2690脑代谢网络模型 | 模型基于计算推断，需要实验验证；未考虑所有脑细胞类型和复杂的细胞间相互作用 | 探索人脑代谢机制，特别关注多发性硬化症中的代谢改变 | 人脑细胞（神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞、少突胶质细胞、少突胶质前体细胞） | 系统生物学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA-seq, 基因组规模代谢建模, tINIT算法 | 基因组规模代谢模型 | 基因表达数据, 代谢网络数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |