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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2025-10-07 |
Development of a breast cancer invasion score to predict tumor aggressiveness and prognosis via PI3K/AKT/mTOR pathway analysis
2025-Apr-09, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02422-y
PMID:40204712
|
研究论文 | 本研究通过分析乳腺癌单细胞RNA测序数据,开发了乳腺癌侵袭评分模型来预测肿瘤侵袭性和预后 | 首次基于单细胞RNA测序数据开发乳腺癌侵袭评分(BCIS),识别了9个关键区分基因,并验证其与PI3K/AKT/mTOR通路的相关性 | 研究样本量相对有限,仅分析了三个导管癌阶段的数据 | 开发预测乳腺癌侵袭性和预后的评分模型 | 乳腺癌细胞,特别是侵袭性和非侵袭性细胞群体 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,LASSO Cox回归,功能实验验证 | LASSO Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据,临床生存数据 | TCGA-BRCA、GSE20685和METABRIC数据集中的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 622 | 2025-10-07 |
CCL3 correlates with ferroptosis in intervertebral disc degeneration and its prognostic significance
2025-Apr-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-94989-w
PMID:40204911
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研究论文 | 本研究探讨CCL3与铁死亡在椎间盘退变中的相关性及其诊断和预后意义 | 首次揭示CCL3通过pAMPK/AMPK通路调控铁死亡影响椎间盘退变进程 | 需要进一步研究靶向CCL3的治疗策略 | 阐明铁死亡和CCL3在椎间盘退变中的机制及其诊断预后价值 | 椎间盘退变患者组织样本和单细胞测序数据 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 单细胞测序、qRT-PCR、Western blotting、共培养实验 | NA | 单细胞测序数据、人类组织样本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 623 | 2025-10-07 |
A single-cell atlas of bladder cancer unveils dynamic cellular composition and endothelial functional shifts during progression
2025-Apr-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02297-6
PMID:40205274
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析膀胱癌细胞组成,揭示内皮细胞在肿瘤进展中的功能转变 | 首次在膀胱癌中鉴定出阶段特异性内皮细胞亚群,特别是MIBC特异的ADAM10+内皮细胞亚群 | 基于公共数据集分析,样本量有限(47例患者),缺乏实验验证 | 阐明膀胱癌进展过程中内皮细胞的异质性和功能变化 | 47例膀胱癌患者的单细胞RNA测序数据 | 单细胞组学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | CellChat细胞通讯网络分析 | 单细胞转录组数据 | 47例膀胱癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 624 | 2025-10-07 |
Comprehensive analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq data via machine learning and bioinformatics reveals the role of lysine metabolism-related genes in gastric carcinogenesis
2025-Apr-09, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14051-w
PMID:40205350
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研究论文 | 通过机器学习和生物信息学方法综合分析单细胞和批量RNA测序数据,揭示赖氨酸代谢相关基因在胃癌发生中的作用 | 首次创新性地识别SLC7A7和VIM作为赖氨酸代谢相关基因参与胃癌发生,并建立了可靠的预后风险列线图 | NA | 研究赖氨酸代谢相关基因在胃癌发生中的作用机制 | 胃癌细胞、临床样本 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 细胞增殖实验, 细胞迁移实验, 细胞侵袭实验, 细胞周期分析 | 机器学习模型 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 625 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals prognosis-related stromal signatures that potentiate stratification of patients with extrahepatic cholangiocarcinoma
2025-Apr-09, BMC gastroenterology
IF:2.5Q2
DOI:10.1186/s12876-025-03829-8
PMID:40205358
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肝外胆管癌中与预后相关的基质特征,实现患者分层 | 首次在肝外胆管癌中通过单细胞RNA测序系统鉴定预后相关基质细胞亚群并建立患者分层系统 | 样本量有限(8例单细胞测序样本),需要更大规模验证 | 探索肝外胆管癌肿瘤微环境中基质细胞的组成及其与预后的关系 | 肝外胆管癌患者肿瘤组织和配对癌旁正常组织 | 数字病理 | 肝外胆管癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 基因集变异分析(GSVA) | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 | 8例活检样本(5例肿瘤组织+3例癌旁组织)用于单细胞测序,43例肿瘤组织用于批量RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 626 | 2025-10-07 |
Filtering cells with high mitochondrial content depletes viable metabolically altered malignant cell populations in cancer single-cell studies
2025-Apr-09, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03559-w
PMID:40205439
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研究论文 | 本研究挑战了单细胞RNA测序分析中基于线粒体含量过滤细胞的常规做法,揭示了高线粒体含量的恶性细胞具有独特的代谢特征和临床相关性 | 首次系统证明高线粒体含量的恶性细胞具有生物学功能意义,而非单纯的细胞死亡标志,挑战了现有质量控制标准 | 研究基于公共数据集,缺乏实验验证;样本来源和癌症类型有限 | 评估单细胞RNA测序中高线粒体含量恶性细胞的功能特征和生物学意义 | 来自134名患者的441,445个癌细胞和公共空间转录组数据 | 单细胞转录组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 转录组数据 | 441,445个细胞来自134名患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 627 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the intra-tumoral heterogeneity and immune microenvironment of small cell carcinoma of the ovary, hypercalcemic type
2025-Apr-09, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-025-01649-8
PMID:40205496
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示卵巢高钙血症型小细胞癌的瘤内异质性和免疫微环境特征 | 首次在SCCOHT中应用单细胞RNA测序技术,发现癌细胞可分为7种亚型,并鉴定出复发灶中具有高干性特征的癌细胞亚群 | 样本量较小(仅15个样本),单细胞测序仅针对1个原发灶和1个复发灶 | 探索SCCOHT的基因组突变谱、瘤内异质性和免疫微环境 | 卵巢高钙血症型小细胞癌(SCCOHT)患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 全外显子组测序, 基因panel检测, 多重免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 基因组数据, 图像数据 | 15个SCCOHT样本(包含1个原发灶及匹配正常组织,1个复发灶) | NA | 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 628 | 2025-10-07 |
Single-cell and spatial transcriptomic analyses revealing tumor microenvironment remodeling after neoadjuvant chemoimmunotherapy in non-small cell lung cancer
2025-Apr-09, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02287-w
PMID:40205583
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析揭示非小细胞肺癌新辅助 chemoimmunotherapy 后肿瘤微环境重塑 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组技术系统分析NSCLC患者新辅助 chemoimmunotherapy 后肿瘤微环境的动态变化,发现SELENOP-巨噬细胞与抗原呈递CAFs在肿瘤边界的共定位及其在治疗应答中的协同作用 | 样本量较小(12例患者16个组织样本),需要更大规模研究验证发现 | 研究 chemoimmunotherapy 对NSCLC患者肿瘤微环境的影响,识别与治疗敏感性相关的关键分子、细胞亚群、通讯模式和空间分布 | 非小细胞肺癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 12例NSCLC患者的16个肺癌组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 629 | 2025-10-07 |
Putative function and prognostic molecular marker of mast cells in colorectal cancer
2025-Apr-08, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-025-02117-4
PMID:40205370
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示肥大细胞在结直肠癌中的功能作用,并构建基于肥大细胞标志物的预后分类模型 | 首次系统解析肥大细胞与恶性细胞间的分子通讯机制,并建立基于6个肥大细胞标志物的预后分类模型 | 研究样本量有限,主要基于公共数据库数据,需要更多临床样本验证 | 探究肥大细胞在结直肠癌发展中的功能作用并构建预后分子标志物模型 | 结直肠癌患者单细胞转录组数据、P815和MC-9细胞系、MC38细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA-seq, qRT-PCR, 细胞共培养, 伤口愈合实验, Transwell实验 | LASSO回归, Cox回归 | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | GSE146771数据集中的10,186个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 630 | 2025-10-07 |
Methionine-driven YTHDF1 expression facilitates bladder cancer progression by attenuating RIG-I-modulated immune responses and enhancing the eIF5B-PD-L1 axis
2025-Apr, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01434-y
PMID:39672819
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研究论文 | 本研究揭示了甲硫氨酸通过增强YTHDF1表达抑制膀胱癌免疫治疗的两种机制 | 首次发现甲硫氨酸通过YTHDF1同时调控RIG-I介导的干扰素通路和eIF5B-PD-L1轴的双重免疫抑制机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床验证样本有限 | 探究甲硫氨酸对膀胱癌免疫治疗的影响机制 | 膀胱癌细胞、MB49小鼠肿瘤模型、膀胱癌免疫治疗患者样本 | 肿瘤免疫学 | 膀胱癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、免疫沉淀、质谱分析、多重免疫荧光 | 小鼠肿瘤模型 | RNA测序数据、单细胞数据、质谱数据、免疫荧光图像 | MB49小鼠模型及膀胱癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 631 | 2025-10-07 |
Age-Dependent Bi-Phasic Dynamics of Ly49+CD8+ Regulatory T Cell Population
2025-Apr, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14461
PMID:39696807
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研究论文 | 本研究首次揭示了Ly49+CD8+调节性T细胞在衰老过程中的双相动态变化规律 | 首次在衰老背景下研究Foxp3-CD8调节性T细胞,发现其具有与CD4 Foxp3+Treg不同的年龄依赖性双相动态变化模式 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅来自公共单细胞RNA-seq数据集,需要进一步实验验证 | 探究CD8调节性T细胞在衰老过程中的动态变化规律及其免疫调节功能 | 小鼠和人类外周血单核细胞中的CD8调节性T细胞 | 免疫学 | 衰老相关免疫疾病 | 流式细胞术,转录组分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 小鼠生命周期各阶段样本和人类PBMC单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 632 | 2025-10-07 |
Nuclear respiratory factor-1 (NRF1) induction as a powerful strategy to deter mitochondrial dysfunction and senescence in mesenchymal stem cells
2025-Apr, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14446
PMID:39720856
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研究论文 | 本研究探讨了核呼吸因子-1(NRF1)过表达对间充质干细胞线粒体功能和衰老的调控作用 | 首次证明NRF1诱导可通过增强线粒体功能有效延缓间充质干细胞衰老 | 研究主要基于体外实验模型,尚未在体内验证其治疗效果 | 探索NRF1过表达对间充质干细胞衰老的抑制作用及其机制 | 间充质干细胞(MSCs) | 细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),mRNA转染 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 633 | 2025-10-07 |
Therapeutic Black Phosphorus Nanosheets Elicit Neutrophil Response for Enhanced Tumor Suppression
2025-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202414779
PMID:39840467
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研究论文 | 本研究探讨聚乙二醇功能化黑磷纳米片通过调节肿瘤免疫微环境增强抗肿瘤免疫反应的机制 | 首次发现黑磷纳米片具有免疫调节功能,能通过募集和激活中性粒细胞增强抗肿瘤免疫反应 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证;具体分子机制仍需进一步阐明 | 探索黑磷纳米片在癌症治疗中的免疫调节作用 | 乳腺癌模型(4T1原位BALB/c小鼠和MMTV-PyMT转基因小鼠) | 纳米医学 | 乳腺癌 | 质谱流式细胞术,bulk RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 两种小鼠乳腺癌模型 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 634 | 2025-10-07 |
Human Pituitary Organoids: Transcriptional Landscape Deciphered by scRNA-Seq and Stereo-Seq, with Insights into SOX3's Role in Pituitary Development
2025-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202414230
PMID:39951008
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研究论文 | 通过优化培养条件并应用单细胞RNA测序和空间转录组技术,首次系统解析了人类垂体类器官的转录组特征和空间结构 | 首次在垂体类器官中同时应用scRNA-seq和Stereo-seq技术,揭示了细胞组成、细胞间相互作用和空间分布特征,并发现SOX3基因在垂体发育中的关键作用 | 该技术仍处于早期发展阶段,类器官的细胞组成和空间结构特征仍需进一步验证 | 建立优化的人类垂体类器官培养体系并解析其转录组特征 | 人类诱导多能干细胞分化的垂体类器官 | 单细胞生物学 | 垂体疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 635 | 2025-10-07 |
Differential expression of endothelial derived galectins in response to shear stress
2025-Apr-15, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2025.114521
PMID:40107440
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研究论文 | 本研究探讨剪切应力对内皮细胞半乳糖凝集素表达的调控作用 | 首次揭示不同类型剪切应力对内皮细胞半乳糖凝集素表达的差异调控 | 研究主要基于体外细胞模型,需要更多体内验证 | 研究剪切应力对内皮细胞半乳糖凝集素表达的调控机制 | 人脐静脉内皮细胞(HUVEC)和人动脉内皮细胞(HAEC) | 细胞生物学 | 心血管疾病 | qPCR, 免疫荧光成像, ELISA, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 636 | 2025-10-07 |
GOLM1 Promotes Atherogenesis by Activating Macrophage EGFR-ERK Signaling Cascade
2025-Apr-11, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325880
PMID:40026146
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研究论文 | 本研究揭示了GOLM1通过激活巨噬细胞EGFR-ERK信号通路促进动脉粥样硬化发生的新机制 | 首次发现GOLM1作为动脉粥样硬化的致病介质,通过结合EGFR激活ERK信号通路促进巨噬细胞摄取LDL | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步开展 | 探讨GOLM1在动脉粥样硬化发生发展中的作用机制 | 动脉粥样硬化患者样本和Apoe-/-基因修饰小鼠 | 分子病理学 | 心血管疾病 | 免疫染色, ELISA, 单细胞测序, 磷酸化蛋白质组学, 分子生物学技术 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞测序数据 | 患者和Apoe-/-小鼠的血清及病变组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 637 | 2025-10-07 |
March2 Alleviates Aortic Aneurysm/Dissection by Regulating PKM2 Polymerization
2025-Apr-11, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325049
PMID:40079144
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研究论文 | 本研究揭示了E3泛素连接酶March2通过调节PKM2聚合抑制血管平滑肌细胞凋亡,从而缓解主动脉瘤/夹层的新机制 | 首次发现March2通过促进PKM2的K33连接多聚泛素化调节其二聚体向四聚体转换,抑制组蛋白H3K18乳酸化修饰和p53驱动的细胞凋亡 | 研究主要基于动物模型,临床转化价值需进一步验证 | 探究March2在主动脉瘤/夹层发病机制中的作用及分子机制 | 人类AAD组织样本、March2基因敲除小鼠模型、血管平滑肌细胞 | 心血管疾病研究 | 主动脉瘤/夹层 | 单细胞RNA测序,CUT&Tag,CUT&Tag-qPCR,蛋白质免疫共沉淀 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据,表观遗传修饰数据 | 人类AAD组织样本和β-氨基丙腈单富马酸盐诱导的小鼠AAD模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 638 | 2025-10-07 |
Lost in translation: conserved amino acid usage despite extreme codon bias in foraminifera
2025-Apr-09, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03916-24
PMID:40042280
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和系统基因组学分析有孔虫的密码子使用模式,发现尽管核苷酸组成存在极端变异,但氨基酸使用高度保守 | 揭示了在极端密码子偏好性条件下氨基酸使用仍保持保守的悖论现象,挑战了传统关于氨基酸使用受GC压力驱动的认知 | 研究对象主要为不可培养的微生物真核生物,实验验证受限 | 探索有孔虫中密码子使用模式和分子进化规律 | 有孔虫(单细胞真核生物) | 基因组学 | NA | 单细胞转录组学, 系统基因组学 | NA | 转录组数据, 系统发育数据 | 49个个体代表28个属,包含1,044个基因家族 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 639 | 2025-10-07 |
Generation of induced alveolar assembloids with functional alveolar-like macrophages
2025-Apr-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58450-w
PMID:40199883
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研究论文 | 开发了一种结合人多能干细胞来源肺泡上皮类器官和诱导巨噬细胞的共培养系统,创建功能性诱导肺泡组装体 | 首次创建了包含功能性肺泡样巨噬细胞的诱导肺泡组装体,能够模拟人类肺部发育和免疫反应 | NA | 研究肺泡上皮细胞与巨噬细胞之间的相互作用及其在肺部发育和疾病中的作用 | 人类多能干细胞来源的肺泡上皮细胞和诱导巨噬细胞 | 干细胞生物学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序, 功能分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 功能分析数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 640 | 2025-10-07 |
Single-cell atlas of endothelial and mural cells across primary and metastatic brain tumors
2025-Apr-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.02.022
PMID:40107274
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研究论文 | 通过单细胞分析构建了原发性和转移性脑肿瘤中内皮细胞和周细胞的综合图谱 | 首次全面比较了不同类型脑肿瘤(包括低级别胶质瘤、高级别胶质母细胞瘤和脑转移瘤)中血脑屏障细胞的异质性 | 研究样本类型和数量可能有限,需要进一步验证 | 理解脑肿瘤特异性血管特征,为血管和免疫靶向治疗提供基础 | 非肿瘤脑组织、IDH突变低级别胶质瘤、IDH野生型高级别胶质母细胞瘤、多种原发性肿瘤的脑转移瘤 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间分析 | NA | RNA测序数据, 空间数据 | 多种脑组织样本(包括正常组织和不同类型肿瘤) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |