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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA Sequencing Contributes to the Treatment of Acute Myeloid Leukaemia With Hematopoietic Stem Cell Transplantation, Chemotherapy, and Immunotherapy
2025-Apr, Journal of biochemical and molecular toxicology
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jbt.70218
PMID:40233268
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综述 | 本文探讨单细胞RNA测序在急性髓系白血病治疗中的应用,特别是对造血干细胞移植、化疗和免疫治疗的贡献 | 利用单细胞RNA测序技术识别细胞亚克隆和肿瘤特征,为AML治疗开辟新的诊断和治疗靶点 | NA | 研究单细胞RNA测序如何改善急性髓系白血病的治疗策略 | 急性髓系白血病患者和造血干细胞 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 582 | 2025-10-07 |
Tracing Early Migratory Neurons in the Developing Nose Using Contactin-2 (Cntn2)CreERT2
2025-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.27.645843
PMID:40236046
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研究论文 | 本研究开发了Cntn2CreERT2诱导性小鼠品系,用于追踪发育过程中鼻部早期迁移神经元 | 首次创建Cntn2CreERT2诱导性小鼠品系,实现对特定神经元群体的时间可控性操作 | NA | 研究发育过程中鼻部神经元的迁移机制 | 啮齿类动物发育过程中的早期迁移神经元 | 发育神经生物学 | NA | 单细胞RNA测序,基因工程小鼠模型 | NA | 基因表达数据,组织学图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 583 | 2025-10-07 |
Loss of Kmt2c / d promotes gastric cancer initiation and confers vulnerability to mTORC1 inhibition and anti-PD1 immunotherapy
2025-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.27.645747
PMID:40236091
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研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型揭示了Kmt2c/d缺失在胃癌发生中的作用及其对mTORC1抑制剂和抗PD1免疫疗法的敏感性 | 首次发现Kmt2c/d缺失通过调控蛋白质合成和MHC-I表达促进胃癌发生,并揭示其对mTORC1抑制剂和免疫疗法的特殊敏感性 | 研究基于小鼠模型,在人类胃癌中的直接适用性需要进一步验证 | 探究Kmt2c/d基因缺失在胃癌发生中的作用及潜在治疗策略 | 基因工程小鼠模型的胃上皮细胞 | 癌症生物学 | 胃癌 | 基因敲除、单细胞RNA测序、组织学染色 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据、组织图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 584 | 2025-10-07 |
mcDETECT: Decoding 3D Spatial Synaptic Transcriptomes with Subcellular-Resolution Spatial Transcriptomics
2025-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.27.645744
PMID:40236251
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研究论文 | 开发mcDETECT框架,通过亚细胞分辨率空间转录组学解码3D空间突触转录组 | 首次整合机器学习算法与靶向基因panel的空间转录组学,实现在三维空间中基于突触mRNA聚集识别单个突触并构建单突触空间转录组谱 | NA | 研究神经退行性疾病中突触的分子机制 | 大脑神经网络中的突触结构 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学,靶向基因panel,机器学习 | 机器学习算法 | 空间转录组数据,电子显微镜数据,遗传标记数据 | NA | 10x Genomics, Vizgen, NanoString | 空间转录组学 | Xenium, Xenium 5K, MERSCOPE, CosMx | 多种空间转录组学平台数据 |
| 585 | 2025-10-07 |
Gut microbiota-derived tryptophan metabolites improve total parenteral nutrition-associated infections by regulating Group 3 innate lymphoid cells
2025-Apr, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.70007
PMID:40236767
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研究论文 | 本研究揭示了肠道微生物来源的色氨酸代谢物通过调节第3组先天淋巴细胞改善全肠外营养相关感染的机制 | 首次发现色氨酸代谢物通过激活核受体Rorγt促进ILC3分泌IL-22的分子机制 | 机制研究仍需进一步深入,临床转化需要更多验证 | 探究全肠外营养相关感染的发病机制及治疗策略 | 慢性肠衰竭患者和小鼠模型 | 免疫学 | 肠道感染 | RNA测序,单细胞RNA测序,16S rRNA基因测序,宏基因组测序 | NA | 基因表达数据,微生物组数据 | 慢性肠衰竭患者和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,16S rRNA测序,宏基因组测序 | NA | NA |
| 586 | 2025-10-07 |
HLF and PPARα axis regulates metabolic-associated fatty liver disease through extracellular vesicles derived from the intestinal microbiota
2025-Apr, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.70022
PMID:40236774
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研究论文 | 本研究揭示肠道HLF/PPARα轴通过调控肠道微生物来源的细胞外囊泡改善代谢相关脂肪肝疾病的机制 | 首次发现肠道HLF通过抑制PPARα表达调节肠道屏障功能,并阐明微生物囊泡中牛磺鹅去氧胆酸在抑制肝细胞铁死亡中的关键作用 | 研究主要基于动物模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究肠道在代谢相关脂肪肝疾病发展中的分子机制 | 食蟹猴肠道组织、基因敲除小鼠、肠道微生物来源的细胞外囊泡 | 分子生物学 | 代谢相关脂肪肝病 | 单细胞转录组测序、脂质组学分析 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据、代谢物数据 | 食蟹猴肠道组织样本和基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 587 | 2025-10-07 |
Reading of Human Acute Immune Dynamics in Omicron SARS-CoV-2 Breakthrough Infection
2025-Apr-15, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2025.2494705
PMID:40231451
|
研究论文 | 本研究通过纵向追踪奥密克戎突破感染患者的免疫动态,揭示了其与初感染不同的免疫应答特征 | 首次系统描绘奥密克戎突破感染期间的人类急性免疫动态,发现单核细胞来源的S100A8/A9在轻症早期显著升高并持续存在 | 样本量较小(13名参与者),仅观察至症状出现后7天 | 解析SARS-CoV-2突破感染的免疫应答动态 | 奥密克戎突破感染患者 | 免疫学 | COVID-19 | 转录组测序,单细胞测序,TCR测序,BCR测序,Olink蛋白质组学,抗原-抗体结合实验 | NA | 血液样本,转录组数据,蛋白质组数据,免疫受体序列数据 | 13名参与者 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞多组学 | NA | NA |
| 588 | 2024-12-21 |
Correction to: The pathogenesis of endometriosis and adenomyosis: insights from single-cell RNA sequencing
2025-Apr-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioae184
PMID:39701072
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 589 | 2025-10-07 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveals the key role of MCAM+ tip-like endothelial cells in osteosarcoma metastasis
2025-Apr-13, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00896-8
PMID:40221534
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示了MCAM+尖端样内皮细胞在骨肉瘤转移中的关键作用 | 首次系统构建骨肉瘤内皮细胞单细胞图谱,发现尖端样内皮细胞在转移灶中富集并鉴定MCAM为其关键功能基因 | 未明确MCAM促进血管生成和转移的具体分子机制 | 探究尖端样内皮细胞在骨肉瘤转移中的作用机制 | 骨肉瘤患者的内皮细胞,特别是尖端样内皮细胞 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, qRT-PCR, 管形成实验, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 实验验证数据 | 未明确具体样本数量,包括原发肿瘤、转移灶和正常淋巴结样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 590 | 2025-10-07 |
ITGB2 and ICAM3 predict increased survival of sepsis with decreased intercellular communication in cytotoxic CD8+ T cells
2025-Apr-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-93685-z
PMID:40221459
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别与脓毒症免疫相关的关键基因,发现ITGB2和ICAM3可预测脓毒症生存率增加 | 首次揭示细胞毒性CD8+T细胞中ITGB2、SELL和ICAM3低表达通过减少细胞间通讯不利于脓毒症生存 | 研究样本量有限,仅使用两个GEO数据集和小鼠模型验证 | 识别与脓毒症免疫相关的关键基因 | 脓毒症患者的CD8+T细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, KEGG分析 | NA | 基因表达数据 | GSE167363和GSE54514数据集,加小鼠CLP模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 591 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing characterization of Holstein cattle blood and milk immune cells during a chronic Staphylococcus aureus mastitis infection
2025-Apr-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-96657-5
PMID:40221598
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析荷斯坦奶牛在慢性金黄色葡萄球菌乳腺炎感染期间血液和乳汁免疫细胞的特征 | 首次使用单细胞RNA测序技术同时分析乳腺炎感染期间血液和乳汁中的免疫细胞,揭示了乳腺局部特异性粒细胞簇及其基因特征 | 研究仅涉及三头中期泌乳荷斯坦奶牛,样本量较小 | 研究慢性金黄色葡萄球菌乳腺炎感染期间免疫反应的细胞和分子特征 | 荷斯坦奶牛的血液和乳汁免疫细胞 | 单细胞组学 | 乳腺炎 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 3头中期泌乳荷斯坦奶牛 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 592 | 2025-10-07 |
Single Molecule Fluorescence In Situ Hybridization Using RNAscope to Study Hematopoietic and Vascular Interactions in the Zebrafish Embryo and Larva
2025-Apr-05, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5269
PMID:40224667
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研究论文 | 本文介绍了一种使用RNAscope技术优化单分子荧光原位杂交方案,用于研究斑马鱼胚胎和幼体阶段造血干细胞前体与血管的相互作用 | 优化了RNAscope技术在斑马鱼模型中的应用,提高了mRNA检测的灵敏度和空间分辨率,能够可视化深埋在内部器官中的造血生态位 | 主要局限在于技术方法专注于斑马鱼模型,可能在其他物种中的适用性需要进一步验证 | 研究造血干细胞前体如何从血管中出现并在发育生态位中定植的过程 | 斑马鱼胚胎和幼体阶段的造血干细胞前体及其血管生态位 | 空间转录组学 | NA | 单分子荧光原位杂交,RNAscope技术,荧光共聚焦显微镜 | NA | mRNA表达数据,荧光图像 | 斑马鱼胚胎和幼体 | Advanced Cell Diagnostics | 单分子荧光原位杂交,空间转录组学 | RNAscope | RNAscope技术结合高灵敏度mRNA检测和高分辨率荧光共聚焦成像 |
| 593 | 2025-10-07 |
TET3 is expressed in prostate cancer tumor-associated macrophages and is associated with anti-androgen resistance
2025-Apr, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-024-03708-w
PMID:39240303
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研究论文 | 本研究探讨TET3在前列腺癌肿瘤相关巨噬细胞中的表达及其对抗雄激素治疗疗效的影响 | 首次发现TET3在前列腺癌肿瘤相关巨噬细胞中特异性表达,并揭示其与抗雄激素治疗敏感性的关联 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证机制 | 研究TET3在前列腺癌中的表达特征及其对抗雄激素治疗疗效的影响 | 前列腺癌组织和肿瘤相关巨噬细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, CIBERSORT算法, 伪时间分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 1965例前列腺癌病例, 493例正常前列腺组织, 21292个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 594 | 2025-10-07 |
ApoE ε4-dependent Alteration of CXCR3 + CD127+ CD4+ T cells associates with elevated plasma neurofilament light chain in Alzheimer's disease
2025-Apr, Journal of Alzheimer's disease : JAD
DOI:10.1177/13872877251320123
PMID:40112322
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研究论文 | 本研究通过单细胞质谱流式技术揭示了阿尔茨海默病患者外周血中CXCR3+CD127+ Th1细胞与神经丝轻链蛋白的负相关性 | 首次发现CXCR3+CD127+ Th1细胞与神经丝轻链的关联具有ApoE ε4依赖性,并揭示了该细胞群在脑脊液与外周血中的差异分布 | 样本量有限,机制研究不够深入,需要进一步验证 | 表征阿尔茨海默病患者外周血适应性免疫细胞组成 | 阿尔茨海默病患者和健康对照的外周血单个核细胞及血浆样本 | 免疫学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞质谱流式技术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 蛋白质浓度数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞质谱流式, 单细胞RNA测序 | CyTOF | 质谱流式细胞技术分析外周血单个核细胞 |
| 595 | 2025-10-07 |
Large Peritoneal Macrophages Play No Role in the Pathogenesis of Postoperative Ileus Induced by Intestinal Manipulation
2025-Apr, Neurogastroenterology and motility
IF:3.5Q2
DOI:10.1111/nmo.14997
PMID:39777769
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和细胞迁移实验证明大腹膜巨噬细胞在术后肠梗阻发病机制中不起作用 | 首次通过单细胞测序和细胞特异性清除技术明确排除了大腹膜巨噬细胞在术后肠梗阻中的作用 | 研究仅关注早期POI阶段,未探讨长期效应或其他潜在机制 | 探究大腹膜巨噬细胞在术后肠梗阻发病机制中的作用 | 小鼠肠道操作模型中的免疫细胞 | 免疫学 | 术后肠梗阻 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, qPCR, 免疫荧光, 细胞过继转移 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据, 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 596 | 2025-10-07 |
Discovering genetically-supported drug targets for multisite chronic pain through multi-omics Mendelian randomization and single-cell RNA-sequencing
2025-Apr-19, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 通过多组学孟德尔随机化和单细胞RNA测序发现多部位慢性疼痛的遗传支持药物靶点 | 首次结合多组学孟德尔随机化与单细胞RNA测序识别多部位慢性疼痛的药物靶点 | 研究主要基于UK Biobank的汇总数据,缺乏实验验证 | 识别多部位慢性疼痛的潜在治疗靶点 | 多部位慢性疼痛患者 | 生物信息学 | 慢性疼痛 | 多组学孟德尔随机化,单细胞RNA测序,贝叶斯共定位,蛋白互作分析 | 孟德尔随机化,贝叶斯模型 | 基因表达数据,蛋白质丰度数据,单细胞测序数据 | UK Biobank数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序,转录组关联研究 | NA | NA |
| 597 | 2025-10-07 |
Identification of a Novel Mitochondrial-Related Gene Signature for BMSCs in Osteoporosis Combining Single-Cell and Bulk Transcriptome Data
2025-Apr-13, Biochemical genetics
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s10528-025-11099-y
PMID:40221950
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组数据,鉴定骨质疏松中骨髓间充质干细胞的新型线粒体相关基因特征 | 首次结合单细胞RNA测序和批量转录组数据识别骨质疏松中BMSCs的线粒体相关基因特征,并发现DUT基因的关键调控作用 | 研究样本量有限,需要更大规模的验证研究 | 鉴定骨质疏松患者BMSCs中线粒体相关基因特征并探索其功能 | 骨质疏松患者和健康个体的骨髓间充质干细胞(BMSCs) | 单细胞转录组学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RT-qPCR, Western blot, 免疫荧光, 电镜扫描 | LASSO逻辑回归, 随机森林 | 转录组数据 | 使用GSE147287(单细胞)和GSE35956(批量)数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 598 | 2025-10-07 |
Identification of the disulfidptosis-related key gene CD2AP as a potential biomarker and new therapeutic target for LUAD patients by comprehensive multi-omics analysis
2025-Apr-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02308-6
PMID:40214854
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研究论文 | 通过多组学分析鉴定双硫死亡相关关键基因CD2AP作为肺腺癌患者的潜在生物标志物和治疗靶点 | 首次将双硫死亡机制与CD2AP基因在肺腺癌中的功能联系起来,并系统评估其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 探索CD2AP在肺腺癌中的功能及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 转录组学、甲基化分析、免疫浸润分析、空间转录组学 | Kaplan-Meier生存分析、富集分析 | 基因组数据、转录组数据、临床数据 | TCGA、GEO等公共数据库中的肺腺癌样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 599 | 2025-10-07 |
Integrated single cell and bulk RNA sequencing analyses reveal the impact of tryptophan metabolism on prognosis and immunotherapy in colon cancer
2025-Apr-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85893-4
PMID:40216815
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序分析,揭示了色氨酸代谢对结肠癌预后和免疫治疗的影响 | 首次结合单细胞和批量RNA测序系统分析色氨酸代谢在结肠癌中的作用,并构建了色氨酸代谢风险评分模型 | 研究依赖于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 分析结肠癌中色氨酸代谢特征并预测免疫治疗反应 | 结肠癌患者 | 生物信息学 | 结肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 随机森林算法 | 基因表达数据 | 训练队列473个肿瘤和41个正常组织,验证队列902名癌症患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 600 | 2025-10-07 |
Spatiotemporal transcriptomics reveals key gene regulation for grain yield and quality in wheat
2025-Apr-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03569-8
PMID:40217326
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析小麦籽粒早期发育过程,鉴定了关键调控基因 | 首次构建小麦籽粒发育的空间转录组图谱,识别了10种细胞类型和192个标记基因,发现TaABI3-B1等关键调控因子 | 仅关注早期发育阶段(授粉后4-12天),未覆盖完整籽粒发育周期 | 解析小麦籽粒发育的时空基因调控网络,为提升产量和品质提供遗传资源 | 小麦籽粒发育过程 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,WGCNA分析,基序分析 | NA | 空间转录组数据 | 授粉后4-12天的小麦籽粒发育阶段 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |