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当前共找到 715 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-08-12 |
Angiogenesis and targeted therapy in the tumour microenvironment: From basic to clinical practice
2025-04, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70313
PMID:40268524
|
综述 | 本文系统综述了肿瘤微环境中的血管生成及其靶向治疗的研究进展，包括内皮细胞病理生理学、内皮-间质转化、单细胞视角下的内皮细胞异质性，以及不同细胞类型在肿瘤血管生成中的作用和抗血管生成治疗的临床策略 | 从单细胞测序视角深入探讨肿瘤内皮细胞异质性及其与微环境细胞的相互作用，并总结了抗血管生成免疫治疗和纳米技术在临床中的应用进展 | 综述未提供具体的实验数据或定量分析，可能缺乏对某些新兴疗法疗效的深入评估 | 总结血管生成在肿瘤进展中的作用机制，探讨靶向血管生成的临床治疗策略，并为抗血管生成治疗的临床应用提供见解 | 肿瘤微环境中的内皮细胞、基质细胞、免疫细胞及其在血管生成中的相互作用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 42 | 2026-08-11 |
Deletion of hepcidin disrupts iron homeostasis and hematopoiesis in zebrafish embryogenesis
2025-04-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204307
PMID:40110772
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研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9技术创建了稳定敲除hepcidin（hamp）的斑马鱼模型，发现hamp缺失导致胚胎母体铁过载，下调血红蛋白基因并减少血红蛋白含量，通过单细胞RNA测序揭示了血液祖细胞中的异常表达模式和铁死亡现象。 | 首次利用CRISPR/Cas9系统构建稳定的斑马鱼hamp敲除模型，并结合单细胞RNA测序技术，揭示了hamp在胚胎造血中的关键作用，特别是发现特定血液祖细胞亚型中铁死亡和发育延迟的新机制。 | 研究仅基于斑马鱼模型，其结论在人类中的适用性需进一步验证；未详细探讨hamp调控铁代谢和造血的具体分子信号通路。 | 探究hepcidin在斑马鱼胚胎发育过程中对铁稳态和造血作用的影响。 | 斑马鱼胚胎及其血液祖细胞。 | 单细胞转录组学 | 血液疾病 | CRISPR/Cas9, 单细胞RNA测序 | 基因敲除模型 | 单细胞RNA测序数据 | 研究所用样本为斑马鱼胚胎，具体数量未在标题和摘要中说明。 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 43 | 2026-08-11 |
Insulin-like growth factor 2 as a driving force for exponential expansion and differentiation of the neonatal thymus
2025-04-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204347
PMID:40110795
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序研究小鼠胸腺基质，揭示成纤维细胞来源的胰岛素样生长因子2在新生胸腺快速扩张和分化中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示新生胸腺向稳态转变过程中主要转录组变化发生在内皮和间充质细胞，并鉴定出成纤维细胞来源的IGF2驱动胸腺皮质上皮细胞增殖和分化 | 研究主要基于小鼠模型，人体样本仅用于验证，可能限制了对人类胸腺生物学机制的全面理解 | 探究新生胸腺快速生长后停止的分子机制，特别是IGF2在胸腺扩张和分化中的作用 | 小鼠胸腺基质细胞及人类胸腺组织 | 单细胞转录组学 | 不适用 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 研究包括小鼠胸腺基质细胞（多个时间点）和人类胸腺样本（跨时期） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 44 | 2026-08-08 |
Elevated Serum and Urinary Secreted Protein Acidic and Rich in Cysteine Levels are Novel Biomarkers of Kidney Fibrosis Severity
2025-04, Archives of medical research
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.arcmed.2024.103125
PMID:39612526
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研究论文 | 本研究评估了血清和尿液中富含半胱氨酸的酸性分泌蛋白（SPARC）水平作为肾纤维化严重程度的非侵入性生物标志物的诊断价值。 | 首次提出血清和尿液SPARC水平可作为肾纤维化的非侵入性生物标志物，并联合eGFR提高预测准确性。 | 未明确提及研究的局限性。 | 探索血清和尿液中SPARC水平在肾纤维化诊断中的价值。 | 慢性肾脏病（CKD）患者及健康对照肾脏样本。 | 机器学习和数字病理学 | 慢性肾脏病 | 单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据和临床数据 | 674名接受肾活检的CKD患者（训练队列322名，验证队列352名） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 45 | 2026-08-08 |
X-scPAE: An explainable deep learning model for embryonic lineage allocation prediction based on single-cell transcriptomics revealing key genes in embryonic cell development
2025-04, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.109787
PMID:39946788
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研究论文 | 提出了一种基于可解释PCA和注意力自编码器的深度学习模型X-scPAE，用于预测人类和小鼠单细胞转录组数据中的胚胎谱系分配，并通过反事实梯度归因算法识别关键基因 | 结合PCA、自编码器、注意力机制和反事实梯度归因算法，实现对谱系预测的可解释性分析，优于现有方法并提取出关键基因 | 未提及具体局限性，可能依赖于单细胞转录组数据质量及模型泛化性 | 预测胚胎细胞谱系分配并识别谱系间基因表达差异，以理解细胞分化过程并减少早期流产 | 人类和小鼠单细胞转录组数据 | 机器学习、单细胞转录组学 | 早期流产 | 单细胞转录组测序 | 注意力自编码器、PCA、逻辑回归 | 单细胞转录组数据 | 未指定具体样本数量，涉及人类和小鼠单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 46 | 2026-08-04 |
SMAD4 and KRAS Status Shapes Cancer Cell-Stromal Cross-Talk and Therapeutic Response in Pancreatic Cancer
2025-04-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-2330
PMID:39841099
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析SMAD4缺失与KRAS突变状态对胰腺癌肿瘤微环境和治疗反应的影响 | 首次揭示了SMAD4缺失在KRASG12D和KRASG12V驱动的胰腺癌中对肿瘤微环境的不同调控机制，特别是JAK/STAT信号通路的依赖性差异 | 研究主要基于小鼠模型的临床前数据，尚需在人类胰腺癌样本中进一步验证 | 阐明SMAD4丢失和KRAS突变状态如何塑造胰腺癌细胞与基质细胞的相互作用及治疗反应 | 胰腺导管腺癌小鼠模型，包括KRASG12D或KRASG12V突变，Smad4野生型或缺失 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种小鼠模型的肿瘤样本，具体数量未在摘要中说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 47 | 2026-08-04 |
Single-Cell Analyses Reveal a Functionally Heterogeneous Exhausted CD8+ T-cell Subpopulation That Is Correlated with Response to Checkpoint Therapy in Melanoma
2025-04-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-3918
PMID:40042995
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析发现，晚期黑色素瘤患者中CD8+肿瘤浸润淋巴细胞中PD-1和CTLA4共表达（CPHi）比例≥20%与PD-1单药治疗的客观缓解率和生存期改善相关，并揭示该细胞群内部存在功能异质性的多个亚群 | 首次将CPHi CD8+ TIL亚群与黑色素瘤检查点治疗反应相关联，并利用单细胞和 bulk RNA测序揭示了该亚群内部的异质性，挑战了以往仅关注祖细胞样耗竭T细胞的共识 | 摘要未提及具体局限性，如样本量、验证队列或机制验证等 | 评估PD-1+CTLA4+ CD8+ TIL亚群（CPHi）在黑色素瘤中预测检查点抑制剂治疗反应的价值，并解析其细胞组成 | 晚期黑色素瘤患者的CD8+肿瘤浸润淋巴细胞（TIL） | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据（单细胞和bulk） | 晚期黑色素瘤患者样本（具体数量未给出） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 48 | 2026-08-04 |
Lineage Tracing and Single-Cell RNA Sequencing Reveal a Common Transcriptional State in Breast Cancer Tumor-Initiating Cells Characterized by IFN/STAT1 Activity
2025-04-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-4022
PMID:40230213
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研究论文 | 结合谱系追踪和单细胞RNA测序，揭示乳腺癌肿瘤起始细胞中由IFN/STAT1活性表征的共同转录状态 | 开发了一种STAT响应性谱系追踪系统，并结合单细胞RNA测序，首次在单细胞水平上识别出与肿瘤起始细胞相关的IFN/STAT1转录状态 | 该方法未能检测到所有基底样三阴性乳腺癌异种移植模型中的肿瘤起始细胞 | 了解肿瘤起始细胞的分子表型，并探索选择性靶向肿瘤起始细胞的策略 | 人类三阴性乳腺癌肿瘤起始细胞 | 单细胞转录组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个异种移植模型及临床样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2026-07-30 |
High-resolution reconstruction of cell-type specific transcriptional regulatory processes from bulk sequencing samples
2025-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.02.646189
PMID:40291712
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研究论文 | 提出一种名为DeepDETAILS的深度学习框架，利用scATAC-seq参考数据库从批量测序样本中高分辨率重建细胞类型特异性转录调控过程 | 核心创新在于能够使用scATAC-seq参考库对批量测序数据进行跨模态反卷积，实现碱基精度的细胞类型特异性基因组信号重建，且适用于多种组学数据集 | 未明确提及局限性，但整体依赖scATAC-seq参考数据的可用性和质量，可能受限于参考库的覆盖范围和准确性 | 开发一种从批量测序样本中高分辨率重建细胞类型特异性转录调控过程的计算方法 | 人类组织中的多种细胞类型，涵盖39种人体组织和86种细胞类型 | 机器学习 | 原发性硬化性胆管炎 | scATAC-seq, PRO-cap, PRO-seq, ChIP-seq | 深度学习（DeepDETAILS框架） | 测序数据（包括批量测序和单细胞测序数据） | 39种人体组织样本，86种细胞类型 | NA | 单细胞ATAC测序, 批量RNA测序, 批量ChIP测序 | NA | NA |
| 50 | 2026-07-30 |
Spatially Resolved Tumor Ecosystems and Cell States in Gastric Adenocarcinoma Progression and Evolution
2025-Apr-02, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-0605
PMID:39774838
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研究论文 | 通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据，揭示了胃癌进展和演化中空间解析的肿瘤生态系统和细胞状态 | 首次整合GeoMx数字空间剖析仪和单细胞RNA测序数据，识别出与独特免疫微环境相关的空间解析表达异质性，并发现两种与特定分子亚型、临床预后、基质邻域和遗传驱动因素相关的独立进化轨迹 | NA | 研究胃癌进展和演化中空间解析的肿瘤生态系统和细胞状态 | 多个胃癌样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 多个胃癌患者样本 | NanoString | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx Digital Spatial Profiler |
| 51 | 2026-07-30 |
Single-cell analysis of the epigenome and 3D chromatin architecture in the human retina
2025-Apr-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.28.630634
PMID:39764062
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研究论文 | 对人类视网膜进行单细胞多组学分析，构建转录组、表观基因组和三维染色质结构图谱 | 首次在单细胞水平上综合分析了人类视网膜的表观基因组和三维染色质结构，并利用深度学习解释非编码风险变异 | 未明确说明 | 填补视网膜细胞类型转录调控元件注释的空白，为眼科疾病风险变异机制研究提供资源 | 人类视网膜、黄斑、视网膜色素上皮/脉络膜组织 | 单细胞多组学 | 眼部疾病 | 单细胞多组学测序 | 序列预测模型 | 单细胞数据 | 未明确数量 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 52 | 2026-07-24 |
Tolerogenic dendritic cell-mediated regulatory T cell differentiation by Chinese herbal formulation attenuates colitis progression
2025-04, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.04.023
PMID:38677546
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研究论文 | 中药复方CDD-2103通过诱导耐受性树突状细胞分化调节性T细胞来缓解结肠炎进展 | 首次揭示中药复方CDD-2103通过上调氧化磷酸化相关基因促进耐受性树突状细胞积累和功能，进而增强调节性T细胞分化，并鉴定出活性成分巴马亭和黄连素 | 未在人体样本中验证CDD-2103的免疫调节机制，且活性成分的具体靶点及信号通路有待深入研究 | 探究中药复方CDD-2103及其活性成分在结肠炎小鼠模型中调节免疫耐受的机制 | 慢性TNBS诱导及T细胞转移诱导的Rag1-/-小鼠结肠炎模型 | 机器学习 | 结肠炎 | 单细胞转录组分析、液相色谱-质谱联用 | NA | 转录组数据 | 两种小鼠模型（慢性TNBS诱导和T细胞转移诱导的Rag1-/-小鼠） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 53 | 2026-07-23 |
Two duplicated GhMML3 genes coordinately control development of lint and fuzz fibers in cotton
2025-04-14, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101281
PMID:39943690
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research paper | 本文发现两个重复的GhMML3基因通过剂量依赖性方式协同调控棉花长绒和短绒纤维的发育 | 首次揭示两个重复的GhMML3基因通过剂量依赖机制协同调控棉花两种纤维发育，并阐明其与关键纤维起始基因GhHD-1和GhMYB25的调控关系 | 未详细说明基因编辑突变体的脱靶效应评估及大田环境下的表型验证 | 解析棉花长绒和短绒纤维发育的遗传与分子调控机制 | 棉花（包括野生型J668和隐性裸籽突变体nNSM） | machine learning | NA | CRISPR-Cas9基因编辑、基因过表达、转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 包括J668、nNSM突变体、基因编辑突变体#mml3s及杂交后代群体 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 54 | 2026-07-23 |
Multi-Omic Insight Into the Molecular Networks in the Pathogenesis of Coronary Artery Disease
2025-04, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.037203
PMID:40135555
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研究论文 | 通过整合基因甲基化、表达和蛋白质水平的多组学数据，利用孟德尔随机化和共定位分析，识别与冠状动脉疾病相关的基因，并探讨其分子机制 | 创新性地结合多组学数据和孟德尔随机化方法，发现TAGLN2、APOB、GIP等基因与冠状动脉疾病风险的新关联，展示了多组学整合在揭示因果关系方面的优势 | 研究主要基于公开数据集，样本量有限，且未进行功能验证实验，结果可能受到混杂因素的影响 | 探索冠状动脉疾病的分子网络和潜在因果基因 | 冠状动脉疾病患者和对照组的基因甲基化、表达和蛋白质数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | 孟德尔随机化，共定位分析，单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据（甲基化、基因表达、蛋白质水平） | 多项研究数据集，具体样本量未详述 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 55 | 2026-07-23 |
Predicting Prognosis and Immunotherapy Response in Glioblastoma (GBM) With a 5-Gene CAF-Risk Signature
2025-04, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.70158
PMID:40226936
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研究论文 | 开发并验证了一个5基因癌症相关成纤维细胞（CAF）风险特征，用于预测胶质母细胞瘤（GBM）患者的预后和免疫治疗反应 | 首次构建并验证了基于CAF的5基因风险特征（ITGA5、MMP14、FN1、COL5A1和COL6A1），并证明其与免疫浸润和免疫治疗反应显著相关 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 探究CAF在GBM中的作用，通过开发CAF风险特征并探索其与免疫浸润和免疫治疗反应的相关性 | 胶质母细胞瘤（GBM）患者 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq、单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归模型 | 基因表达数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 56 | 2026-07-10 |
Life-long microbiome rejuvenation improves intestinal barrier function and inflammaging in mice
2025-04-02, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-025-02089-8
PMID:40176137
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研究论文 | 通过长期肠道微生物组年轻化干预，评估其对小鼠肠道屏障功能和炎症老化的改善作用 | 首次在非反刍哺乳动物中证明终生反复粪菌移植（FMT）可延缓衰老相关过程，并利用单细胞RNA测序揭示肠道细胞表型变化机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，结果向人类转化的可行性尚未验证；未对特定细菌菌株或代谢产物进行因果验证 | 探索终生肠道微生物组年轻化策略是否能够延缓或预防哺乳动物的衰老进程 | 小鼠（年轻供体与同龄受体） | 机器学习, 数字病理学 | 老年疾病 | 粪菌移植（FMT）, 16S rRNA基因测序, 宏基因组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 微生物组数据 | 小鼠，具体数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序, 16S rRNA基因测序, 宏基因组学 | NA | NA |
| 57 | 2026-07-10 |
Faecalibacterium prausnitzii-derived outer membrane vesicles reprogram gut microbiota metabolism to alleviate Porcine Epidemic Diarrhea Virus infection
2025-04-02, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-025-02078-x
PMID:40176190
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研究论文 | 探讨粪杆菌外膜泡通过重编程肠道菌群代谢减轻猪流行性腹泻病毒感染的作用机制 | 首次发现粪杆菌外膜泡是缓解PEDV感染的主要功能成分，并揭示其通过增加磷脂酰胆碱水平、改变肠道细胞组成及抑制坏死性凋亡信号通路的新机制 | 研究仅基于猪仔模型，且未在人体中验证该益生菌及外膜泡的潜在应用 | 探究粪杆菌在减轻猪流行性腹泻病毒感染中的作用及其机制 | 粪杆菌及其外膜泡在PEDV感染猪仔模型中的作用 | 微生物组学 | 猪流行性腹泻 | 蛋白质组学、非靶向代谢组学、小RNA测序、宏基因组学、单细胞测序 | NA | 蛋白质、代谢物、RNA、DNA序列、单细胞数据 | 猪仔模型，具体数量未在摘要中提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞测序用于分析肠道细胞相对丰度 |
| 58 | 2026-07-05 |
LncRNA MIR181A1HG Deficiency Attenuates Vascular Inflammation and Atherosclerosis
2025-Apr-11, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.124.325196
PMID:40047069
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研究论文 | 本研究探讨长链非编码RNA MIR181A1HG在血管炎症和动脉粥样硬化中的调控作用 | 首次发现MIR181A1HG通过隔离Foxp1远离目标基因启动子，激活NLRP3炎症小体，驱动血管内皮炎症和动脉粥样硬化，独立于miR-181a1/b1簇功能 | 未进一步研究其他潜在分子机制或临床人群样本验证 | 研究MIR181A1HG在调控血管炎症和动脉粥样硬化中的作用和分子机制 | 人类和小鼠动脉粥样硬化病变中的内皮细胞及免疫细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、荧光素酶报告基因检测、染色质免疫沉淀 | NA | 基因表达数据 | 人类和小鼠主动脉样本，MIR181A1HG敲除和过表达小鼠模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 59 | 2026-07-01 |
Biological sex affects gene expression and functional variation across the human genome
2025-Apr-14, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.09.03.24313025
PMID:39281750
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研究论文 | 利用480个淋巴母细胞系单细胞RNA-seq数据，鉴定人类基因组中性别偏倚表达基因及其功能变异 | 首次系统揭示性别对基因表达影响的广泛性，发现1200个性别偏倚基因，并建立核心基因集（21个基因）在多种组织和数据集中一致表达；通过机器学习识别关键转录因子（FOSL1、ZNF730等），发现X染色体数目调控这些因子 | 独立数据集的验证证据较弱，且性别偏倚eQTL复制率有限 | 探究生物性别如何影响人类基因组中的基因表达和功能变异 | 人类淋巴母细胞系及GTEx多组织样本 | 基因组学 | 自身免疫性疾病（如多发性硬化） | 单细胞RNA-seq | 机器学习、线性建模 | 单细胞转录组数据 | 480个淋巴母细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2026-07-01 |
Unleashing the Power of Multiomics: Unraveling the Molecular Landscape of Peripheral Neuropathy
2025-04, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.70019
PMID:40126913
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综述 | 追踪基因组技术在外周神经病变研究中的演变，强调多组学整合在揭示分子景观中的作用 | 全面分析新兴多组学技术（如RNA测序和蛋白质组学）与传统基因组方法的整合，推动对外周神经病变病理生理学的整体理解 | 多组学技术临床标准化面临挑战，需要稳健指南以最大化临床效用 | 综述基因组技术在外周神经病变中的应用，探索多组学整合对诊断和治疗的意义 | 外周神经病变的分子机制和遗传变异 | 自然语言处理 | 外周神经病变 | NGS, ONT, 单细胞测序, RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |