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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-04-09 |
Unleashing the Power of Multiomics: Unraveling the Molecular Landscape of Peripheral Neuropathy
2025-Apr, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.70019
PMID:40126913
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综述 | 本文回顾了基因组技术在周围神经病变研究中的演变,并分析了整合多组学技术以揭示其分子机制、发现新生物标志物和治疗靶点的潜力 | 系统性地追溯了从传统遗传分析到NGS、长读长/单细胞测序等新兴多组学技术在周围神经病变研究中的应用演变,并强调了多组学整合对推动该领域发展的革命性作用 | 本文为综述文章,未报告原始研究数据,且指出了将多组学技术标准化用于临床所面临的挑战和问题 | 回顾基因组技术在周围神经病变研究中的发展历程,并探讨整合多组学方法以提升诊断、预后评估和个性化治疗策略的潜力 | 周围神经病变及其相关的分子机制 | 自然语言处理 | 周围神经病变 | 下一代测序、长读长测序、单细胞测序、RNA测序、蛋白质组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 42 | 2026-04-07 |
RUNX2 promotes fibrosis via an alveolar-to-pathological fibroblast transition
2025-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08542-2
PMID:39910313
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了肺纤维化中LEPR成纤维细胞通过肺泡成纤维细胞向病理成纤维细胞转化的机制,并发现RUNX2是调控该过程的关键因子 | 首次发现SCUBE2肺泡成纤维细胞是LEPR成纤维细胞的主要成分,并证明RUNX2是调控纤维化基因表达的关键转录因子 | 研究基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证;未探讨其他潜在细胞来源对病理成纤维细胞的贡献 | 探究肺纤维化中病理成纤维细胞的来源及其调控机制 | 小鼠肺组织中的LEPR成纤维细胞、SCUBE2肺泡成纤维细胞和CTHRC1POSTN病理成纤维细胞 | 单细胞组学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | 两个小鼠肺纤维化模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 43 | 2026-04-06 |
Macrophages protect against sensory axon loss in peripheral neuropathy
2025-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08535-1
PMID:39939762
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研究论文 | 本研究探讨了巨噬细胞在肥胖前驱糖尿病小鼠模型中对周围神经病变中感觉轴突丢失的保护作用 | 首次揭示了CCR2巨噬细胞在肥胖前驱糖尿病诱导的周围神经病变早期浸润神经并发挥神经保护作用,通过galectin 3延缓轴突退化 | 研究基于小鼠模型,结果在人类患者中的适用性尚需验证,且未详细探讨巨噬细胞保护作用的具体分子机制 | 研究肥胖前驱糖尿病条件下周围神经病变的发病机制及免疫细胞的作用 | 高脂高果糖饮食诱导的肥胖前驱糖尿病小鼠模型 | NA | 周围神经病变 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 44 | 2026-04-03 |
Effect of tumor microenvironment in pancreatic cancer on the loss of β-cell mass: implications for type 3c diabetes
2025-04, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-024-02204-w
PMID:39760782
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和病理分析,探讨了胰腺导管腺癌肿瘤微环境对β细胞质量减少的影响及其在3c型糖尿病发病机制中的作用 | 首次在单细胞水平上系统揭示了胰腺导管腺癌肿瘤微环境与邻近胰岛β细胞之间的相互作用,并明确了肿瘤微环境通过诱导β细胞凋亡导致β细胞质量减少,从而触发3c型糖尿病的具体机制 | 研究主要基于体外细胞实验和临床样本分析,缺乏体内动物模型的直接验证;样本量相对有限,可能影响统计效力;未深入探讨肿瘤微环境中具体信号分子介导β细胞凋亡的详细通路 | 阐明胰腺导管腺癌肿瘤微环境如何导致β细胞质量减少并引发3c型糖尿病的机制 | 胰腺导管腺癌患者的肿瘤组织、邻近胰腺组织(近端和远端)、正常供体胰腺组织、INS-1E细胞系和PANC-1细胞系 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, TUNEL染色, RT-qPCR, CCK8检测 | NA | 单细胞RNA测序数据, 病理图像, 基因表达数据 | 来自供体的正常胰腺组织、非糖尿病和3c型糖尿病患者的癌旁组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 45 | 2026-04-03 |
Vagal Sensory Gut-Brain Pathways That Control Eating-Satiety and Beyond
2025-Apr, Comprehensive Physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1002/cph4.70010
PMID:40229922
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综述 | 本文挑战了迷走神经作为简单饱腹感信号被动传递器的传统观点,强调其作为主动编码多种餐食相关信息的复杂系统,并整合单细胞转录组学、神经环路映射和功能成像等最新进展 | 提出迷走神经传入神经元(VANs)不仅是饱腹感传感器,还具有特化亚群、多样感觉模态和下游脑环路,能主动编码机械拉伸、营养成分、代谢状态和微生物代谢物等多方面信息 | NA | 更新对迷走神经感觉通路在控制进食-饱腹感及更广泛功能(如食物奖赏和记忆形成)中作用的理解 | 迷走神经传入神经元(VANs)及其下游脑环路 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学、神经环路映射、功能成像 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 46 | 2026-03-30 |
Multimodal learning for mapping genotype-phenotype dynamics
2025-04, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-024-00765-7
PMID:39875699
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研究论文 | 本研究提出了一个计算集成遗传学框架,用于同时分析和解释基因型及其相关表型的高维景观,并开发了一个多模态基础模型来探索人类转录组学在细胞水平上的基因型-表型关系流形 | 整合单细胞RNA测序等高通量基因分型方法与语言模型等先进学习方法,构建了一个用于分析基因型-表型动态关系的多模态基础模型,能够以更高分辨率解析细胞异质性 | NA | 解析复杂基因表达模式如何产生复杂表型这一生物学基本问题,探索基因表达与表型表现之间的动态相互作用 | 人类转录组学数据,特别是内皮细胞中的von Willebrand因子(VWF)基因 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 语言模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 47 | 2026-03-24 |
Human long noncoding RNA VILMIR is induced by major respiratory viral infections and modulates the host interferon response
2025-04-15, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00141-25
PMID:40130878
|
研究论文 | 本研究通过大规模转录组数据分析,发现了一种新型长链非编码RNA VILMIR,它在多种主要呼吸道病毒感染后被上调,并调控宿主干扰素反应 | 首次鉴定并表征了长链非编码RNA VILMIR作为干扰素刺激基因,在流感、SARS-CoV-2和RSV感染中上调,并证明其调控宿主干扰素反应 | 研究主要基于细胞系和体外实验,体内功能和具体分子机制尚需进一步探究 | 识别在人类主要呼吸道病毒感染中起关键作用的新型长链非编码RNA靶点 | 人类上皮细胞系(如A549)、免疫细胞系(SUP-T1、THP-1)以及COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本 | 自然语言处理 | 呼吸道病毒感染 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 多个细胞系及COVID-19患者样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 48 | 2026-03-20 |
Transcriptional profiles of mouse oligodendrocyte precursor cells across the lifespan
2025-Apr, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-00840-2
PMID:40164771
|
研究论文 | 本研究通过构建转基因小鼠品系并进行单细胞RNA测序,揭示了少突胶质前体细胞在整个生命周期中从静息到增殖和分化关键转变的转录变化 | 构建了Matn4-mEGFP转基因小鼠品系,首次在单细胞分辨率下解析了OPCs在整个生命周期中不同状态下的转录组变化,并发现衰老通过激活HIF-1α和WNT通路影响OPCs功能 | 研究主要基于小鼠模型,人体OPCs的衰老机制可能有所不同;体外药理学实验的结果需要在体内模型中进一步验证 | 探究衰老如何影响少突胶质前体细胞的增殖和分化能力,及其对髓鞘稳态和修复的影响 | 小鼠少突胶质前体细胞 | 单细胞组学 | 神经系统衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 跨多个年龄段的皮质OPCs单细胞测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 49 | 2026-03-19 |
Mucosal tissue NK cells tune their function between optimal anti-pathogen activity and tissue protection
2025-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.04.647286
PMID:40291684
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研究论文 | 本研究揭示了阴道黏膜组织中NK细胞在稳态下具有独特的效应减弱和组织驻留表型,但在感染时能迅速响应并平衡抗病原体活性与组织修复功能 | 首次系统表征人类阴道组织NK细胞的独特功能表型,并发现其在HSV-2感染中兼具抗病毒应答和组织损伤限制的双重功能 | 研究主要聚焦于阴道组织,其他黏膜部位的NK细胞功能可能有所不同;小鼠模型与人类系统的完全等效性仍需进一步验证 | 探究黏膜组织NK细胞在感染过程中如何平衡抗病原体功能与组织保护作用 | 人类阴道组织NK细胞和小鼠阴道组织NK细胞 | 免疫学 | 疱疹病毒感染 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),高参数流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞术数据 | 人类阴道组织样本和小鼠感染模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 50 | 2026-03-15 |
Integrative analysis of single-cell transcriptomics and genetic associations identify cell states associated with vascular disease
2025-04, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
|
研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序数据和遗传关联分析,识别了与血管疾病相关的细胞状态 | 开发了新的计算方法整合GWAS数据与单核表达谱,揭示了VSMC和成纤维细胞在疾病中的表型连续体 | 样本量相对较小(正常n=7,动脉瘤n=9,动脉粥样硬化n=2),且仅针对人类升主动脉组织 | 识别血管疾病早期功能障碍相关的特定血管亚群和中间细胞状态 | 人类升主动脉组织(正常、动脉瘤性和动脉粥样硬化) | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 18个样本(7个正常,9个动脉瘤,2个动脉粥样硬化) | NA | 单核RNA-seq | NA | NA |
| 51 | 2026-03-14 |
Multi-omics analysis to explore the molecular mechanisms related to keloid
2025-04, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.burns.2025.107396
PMID:39874886
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探索瘢痕疙瘩的分子机制,识别了关键基因和免疫细胞参与 | 结合bulk RNA测序、孟德尔随机化、免疫浸润分析和单细胞RNA测序,首次系统识别DUSP1和HOXA5作为瘢痕疙瘩的关键枢纽基因,并揭示IL17信号通路和免疫细胞(如肥大细胞和巨噬细胞)的关键作用 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源和数量可能限制结果的普适性;多组学数据的整合分析可能存在技术偏差 | 识别瘢痕疙瘩的潜在致病机制、枢纽基因和免疫细胞参与,为靶向治疗提供新见解 | 瘢痕疙瘩组织 | 生物信息学 | 皮肤肿瘤(瘢痕疙瘩) | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 免疫浸润分析, GSEA, GSVA, 网络分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 52 | 2026-03-14 |
Identification and validation of immune-related biomarkers and polarization types of macrophages in keloid based on bulk RNA-seq and single-cell RNA-seq analysis
2025-04, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.burns.2025.107413
PMID:39923303
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研究论文 | 本研究基于bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq分析,识别并验证了瘢痕疙瘩中免疫相关生物标志物及巨噬细胞极化类型 | 结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,利用WGCNA和三种机器学习方法识别出BMP1和IL1R1作为新型生物标志物,并揭示了瘢痕疙瘩中M2巨噬细胞显著增加而M1减少的极化异常 | 研究依赖于公共数据库数据,样本量可能有限,且实验验证仅通过WB和IF进行,需要进一步功能研究确认机制 | 识别瘢痕疙瘩的免疫相关生物标志物和巨噬细胞极化类型,为治疗提供新见解 | 瘢痕疙瘩组织样本 | 生物信息学 | 瘢痕疙瘩 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, WGCNA, 机器学习(LASSO, SVM-RFE, RF), 蛋白质印迹, 免疫荧光 | LASSO, SVM-RFE, 随机森林 | RNA-seq数据 | 多个GEO数据集(GSE83286, GSE212954, GSE92566, GSE90051),具体样本数未明确说明 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 53 | 2026-03-13 |
Stable isotope tracing in human plasma-like medium reveals metabolic and immune modulation of the glioblastoma microenvironment
2025-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.29.542774
PMID:37398280
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研究论文 | 本研究优化了一种结合人血浆样培养基的体外稳定同位素示踪方法,用于人胶质瘤外植体和胶质瘤干细胞系,以揭示胶质母细胞瘤微环境中的代谢和免疫调控特征 | 开发了一种在生理营养水平和完整肿瘤微环境下评估胶质瘤代谢的可行方法,结合人血浆样培养基和稳定同位素示踪技术,揭示了传统培养条件中被抑制的代谢和免疫程序 | 该方法仍为体外模型,可能无法完全模拟体内复杂的生理和免疫相互作用 | 研究胶质瘤在完整肿瘤微环境下的代谢特征及其与免疫微环境的相互作用 | 人胶质瘤外植体和胶质瘤干细胞系 | 代谢组学 | 胶质母细胞瘤 | 稳定同位素示踪技术、空间转录组学 | NA | 代谢数据、转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 54 | 2026-03-06 |
The dynamic immune behavior of primary and metastatic ovarian carcinoma
2025-Apr-25, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00818-8
PMID:40281242
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研究论文 | 本研究结合单细胞测序和空间转录组学,探索高级别浆液性卵巢癌中导致免疫抑制的分子机制 | 首次结合单细胞测序与空间转录组学技术,系统比较原发性与转移性卵巢癌的免疫微环境动态变化,并揭示上皮细胞与免疫细胞间的交互作用在免疫抑制中的关键角色 | 研究未明确说明样本量大小,且可能仅限于高级别浆液性卵巢癌亚型,未涵盖其他卵巢癌类型 | 揭示高级别浆液性卵巢癌免疫抑制的分子机制,为免疫调节药物临床试验设计提供依据 | 高级别浆液性卵巢癌患者的原发性肿瘤和网膜转移肿瘤 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 55 | 2026-03-06 |
SORBET: Automated cell-neighborhood analysis of spatial transcriptomics or proteomics for interpretable sample classification via GNN
2025-Apr-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.30.573739
PMID:38260586
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研究论文 | 本文介绍了SORBET,一种几何深度学习框架,用于分析空间转录组学或蛋白质组学数据,通过图卷积网络进行可解释的样本分类 | SORBET是首个在空间转录组学数据上进行表型预测的示例,利用新颖的数据增强技术和定制可解释性分析,无需将完整细胞谱压缩为有限注释 | NA | 开发一种自动化细胞邻域分析框架,以整合空间信息与多重分子数据,准确预测表型,如免疫治疗反应 | 转移性黑色素瘤、非小细胞肺癌和结直肠癌样本 | 机器学习 | 黑色素瘤, 非小细胞肺癌, 结直肠癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | 图卷积网络(GCN) | 空间转录组学数据, 空间蛋白质组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | CosMx, Imaging Mass Cytometry (IMC), Co-detection by indexing (CODEX) | CosMx空间转录组学数据集, Imaging Mass Cytometry (IMC)和CODEX空间蛋白质组学数据集 |
| 56 | 2026-03-06 |
Mapping dynamic regulation of gene expression using single-cell transcriptomics and application to complex disease genetics
2025-Apr-10, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2024.100397
PMID:39741416
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研究论文 | 本研究开发了一种基于单细胞转录组学的遗传模型,用于量化基因表达的动态遗传调控及其细胞类型特异性,并应用于精神分裂症等复杂疾病遗传学分析 | 开发了细胞类型特异性和细胞状态调整的基因表达遗传模型,能够量化基因表达的动态遗传调控并评估其细胞类型特异性,为复杂疾病机制提供新见解 | NA | 利用单细胞转录组学数据揭示遗传变异如何影响人类生理和疾病相关的生物过程,并应用于复杂疾病遗传学研究 | 诱导多能干细胞分化为中脑神经元的单细胞转录组数据,以及英国生物库中超过1,500种表型数据 | 自然语言处理 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 57 | 2026-03-06 |
An expandable synthetic library of human paired antibody sequences
2025-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012932
PMID:40258041
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研究论文 | 本文介绍了IgHuAb,一种用于高通量生成配对人类抗体序列的大型语言模型,并基于此创建了模拟自然抗体序列特征的合成抗体库SynAbLib | 开发了首个基于大型语言模型的高通量配对人类抗体序列生成方法,并构建了具有更高序列多样性的合成抗体库 | 未提及具体实验验证的抗体数量或功能活性数据 | 解决当前单细胞测序方法在配对抗体序列数据获取中的低通量和高成本问题,以更好地理解人类抗体序列的潜在多样性 | 人类抗体序列 | 自然语言处理 | NA | 单细胞测序 | 大型语言模型 | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 58 | 2026-03-04 |
Loss of Kmt2c / d promotes gastric cancer initiation and confers vulnerability to mTORC1 inhibition and anti-PD1 immunotherapy
2025-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.27.645747
PMID:40236091
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研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型揭示了Kmt2c/d功能缺失在胃癌发生中的作用,并发现其对mTORC1抑制剂和抗PD1免疫疗法敏感 | 首次证明Kmt2c/d缺失与Pten缺失协同驱动侵袭性胃癌快速发生,并发现Kmt2c/d缺失通过调控核糖体蛋白转录和MHC-I表达,创造了mTORC1抑制剂与免疫疗法的联合治疗机会 | 研究基于小鼠模型,其结论在人类胃癌中的直接适用性需要进一步验证 | 探究Kmt2c/d基因在胃癌发生中的功能及其对治疗策略的影响 | 基因工程小鼠模型中的胃上皮细胞及由此产生的胃腺癌 | 癌症生物学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,组织学染色,基因敲除 | 基因工程小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据,组织学图像 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 59 | 2026-03-02 |
STAT3 signaling enhances tissue expansion during postimplantation mouse development
2025-Apr-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115506
PMID:40188437
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研究论文 | 本研究探讨了STAT3信号在小鼠胚胎植入后发育过程中对组织扩张的增强作用 | 揭示了STAT3在胚胎植入后发育中的时间控制作用,特别是在需要快速细胞分裂的组织中,如植入后外胚层和造血谱系 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性仅通过突变与矮小症的关联间接提及 | 研究STAT3信号在小鼠胚胎植入后发育过程中的功能 | 小鼠胚胎、胚胎干细胞、植入后外胚层和造血谱系 | 发育生物学 | NA | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 小鼠胚胎和胚胎干细胞样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 60 | 2026-03-02 |
Single cell RNA sequencing after moderate traumatic brain injury: effects of therapeutic hypothermia
2025-Apr-18, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03430-6
PMID:40251570
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,探究了中度创伤性脑损伤后治疗性低温对脑皮层细胞类型特异性转录反应的影响 | 首次在创伤性脑损伤模型中应用单细胞RNA测序技术,全面评估治疗性低温对不同细胞亚型的特异性调控作用,揭示了温度敏感的胶质细胞和血管细胞过程在神经保护中的重要性 | 研究仅关注了损伤后24小时的时间点,未评估长期效应;样本来源于小鼠模型,可能无法完全反映人类疾病情况 | 探究治疗性低温在创伤性脑损伤后的细胞类型特异性保护机制 | C57BL/6小鼠的脑皮层组织,包括损伤周围区域 | 单细胞转录组学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | C57BL/6小鼠的脑皮层组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |