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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
41 2025-10-05
Integrative analysis of single-cell transcriptomics and genetic associations identify cell states associated with vascular disease
2025-04, Atherosclerosis IF:4.9Q1
研究论文 通过整合单细胞转录组学和遗传关联分析,识别与血管疾病相关的细胞状态 开发新的计算方法整合GWAS数据与单核RNA测序数据,识别血管疾病相关的特定细胞亚群和中间状态 样本量相对较小(正常n=7,动脉瘤n=9,动脉粥样硬化n=2),仅使用人类升主动脉组织 识别导致早期血管功能障碍的特定血管亚群和中间细胞状态 人类升主动脉组织(正常、动脉瘤和动脉粥样硬化) 单细胞生物学 血管疾病 单核RNA测序(snRNA-seq),GWAS整合分析 RNA轨迹分析,细胞类型特异性富集分析 单细胞转录组数据,遗传关联数据 18个样本(7正常,9动脉瘤,2动脉粥样硬化) NA 单核RNA测序 NA NA
42 2025-10-05
Stem Cell Markers LGR5, LGR4 and Their Immediate Signalling Partners are Dysregulated in Preeclampsia
2025-Apr, Stem cell reviews and reports IF:4.5Q2
研究论文 本研究首次描述了LGR5和LGR4及其信号伴侣在人类胎盘中的表达特征,并发现它们在子痫前期胎盘中的失调现象 首次在人类胎盘中表征LGR5/LGR4及其配体/靶点,发现这些干细胞标志物在子痫前期和胎儿生长受限胎盘中的表达失调 缺氧/促炎细胞因子处理未能显著改变LGR5/LGR4表达,暗示可能存在其他调控机制 研究LGR5/LGR4及其信号伴侣在人类胎盘中的表达特征及其在子痫前期和胎儿生长受限中的失调机制 人类胎盘组织、滋养层干细胞、不同妊娠期胎盘样本 生殖医学 子痫前期、胎儿生长受限 原位杂交、单细胞转录组测序、单核RNA测序、转录组分析 NA RNA测序数据、基因表达数据 早孕期胎盘11例、早产胎盘9例、足月胎盘11例、早发性子痫前期81例、晚发性子痫前期20例、胎儿生长受限34例及相应对照组 NA 单细胞RNA测序,单核RNA测序 NA NA
43 2025-10-05
Plasma exosomes from individuals with type 2 diabetes drive breast cancer aggression in patient-derived organoids
2025-Apr-30, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过患者来源类器官模型揭示2型糖尿病血浆外泌体通过改变肿瘤微环境促进乳腺癌侵袭性的新机制 首次开发了保留天然肿瘤浸润淋巴细胞的乳腺癌患者来源类器官模型,并发现2型糖尿病外泌体通过扩增免疫抑制性T细胞和增强肿瘤异质性驱动癌症进展 研究样本量有限,外泌体作用的具体分子机制尚未完全阐明 探究2型糖尿病血浆外泌体对乳腺癌肿瘤微环境免疫细胞功能的影响 乳腺癌患者来源类器官和血浆外泌体 肿瘤免疫学 乳腺癌 单细胞RNA测序 患者来源类器官模型 单细胞转录组数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA-seq NA NA
44 2025-10-05
Polymorphic tandem repeats influence cell type-specific gene expression across the human immune landscape
2025-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过全基因组和单细胞RNA测序分析串联重复序列对免疫细胞类型特异性基因表达的影响 首次在单细胞水平系统分析串联重复序列对免疫细胞类型特异性基因表达的调控作用,发现超过62,000个单细胞表达数量性状串联重复位点 研究主要基于血液来源细胞,可能不适用于其他组织类型;串联重复序列的准确识别仍存在技术挑战 探索串联重复序列变异对免疫细胞类型特异性基因表达的调控机制 1,925名个体的血液来源细胞,涵盖28种不同的免疫细胞类型 基因组学 免疫介导性疾病,血液系统疾病 全基因组测序,单细胞RNA测序 数量性状位点分析,精细定位 基因组序列数据,单细胞基因表达数据 超过540万个血液来源细胞,来自1,925名个体 NA 单细胞RNA-seq,全基因组测序 NA NA
45 2025-10-05
Large-scale single-cell profiling of stem cells uncovers redundant regulators of shoot development and yield trait variation
2025-Apr-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过大规模单细胞分析揭示植物茎尖干细胞调控因子及其与产量性状的关联 首次在玉米和拟南芥中实现茎尖干细胞的大规模单细胞转录组分析,发现保守的干细胞调控因子 植物茎尖干细胞获取困难,需精细解剖技术 揭示植物茎尖干细胞调控机制并挖掘与产量性状相关的基因 玉米和拟南芥的茎尖干细胞 植物生物学 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 单细胞转录组数据、空间转录组数据 数千个干细胞表达细胞 NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
46 2025-10-06
Adhesion-Related Pathways and Functional Polarization of Astrocytes in Traumatic Brain Injury: Insights from Single-cell RNA Sequencing
2025-04-27, Neuromolecular medicine IF:3.3Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序分析创伤性脑损伤中星形胶质细胞的功能异质性和粘附相关通路的作用 首次系统揭示星形胶质细胞在创伤性脑损伤中的功能极化现象及粘附相关通路的关键调控作用 研究仅基于小鼠模型,需要人类样本验证;单细胞测序技术本身存在技术限制 探究创伤性脑损伤中星形胶质细胞功能异质性的调控机制 创伤性脑损伤小鼠模型的大脑皮层和海马体星形胶质细胞 单细胞测序分析 创伤性脑损伤 单细胞RNA测序 伪时间轨迹分析 单细胞RNA测序数据 创伤性脑损伤小鼠模型的大脑组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
47 2025-10-06
Prunella vulgaris: A potential molecule for the treatment of hepatocellular carcinoma
2025-Apr-25, Medicine IF:1.3Q2
研究论文 本研究系统评估了夏枯草治疗肝细胞癌的潜力并探索其分子机制 首次通过系统药理学方法识别夏枯草治疗肝细胞癌的关键靶点,并揭示其通过p53信号通路和免疫细胞调节的分子机制 研究主要基于计算预测和体外实验,缺乏体内实验验证和临床数据支持 探索夏枯草治疗肝细胞癌的分子机制和潜在生物标志物 夏枯草活性成分及其在肝细胞癌中的分子靶点 系统药理学 肝细胞癌 单细胞RNA测序,分子对接,体外实验 NA 基因表达数据,化合物靶点数据 185个药物靶点和635个HCC相关靶点 NA 单细胞RNA测序 NA NA
48 2025-10-06
Skin organoid transplantation promotes tissue repair with scarless in frostbite
2025-Apr-18, Protein & cell IF:13.6Q1
研究论文 本研究通过构建皮肤类器官移植系统,探索其在冻伤修复中促进无疤痕愈合的作用机制 首次将hiPSC来源的皮肤类器官与明胶水凝胶结合用于冻伤治疗,并发现其通过调控整合素α5β1-FAK通路减少成纤维细胞向肌成纤维细胞转化 研究仅使用小鼠模型,尚未在人体进行验证 开发促进冻伤无疤痕愈合的新型治疗方法 冻伤小鼠模型、人类诱导多能干细胞来源的皮肤类器官 组织工程 冻伤 单细胞转录组测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
49 2025-10-06
RUNX2 promotes fibrosis via an alveolar-to-pathological fibroblast transition
2025-Apr, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过小鼠模型揭示了RUNX2在肺纤维化中通过肺泡成纤维细胞向病理性成纤维细胞转化促进纤维化的机制 首次发现LEPR成纤维细胞中的SCUBE2肺泡成纤维细胞是CTHRC1+POSTN+病理性成纤维细胞的主要来源,并证实RUNX2是调控纤维化基因表达的关键因子 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类样本中验证 探索肺纤维化中病理性成纤维细胞的来源及其调控机制 小鼠肺组织中的成纤维细胞 单细胞生物学 肺纤维化 scRNA-seq, scATAC-seq, 基因敲除 NA 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 两种肺纤维化小鼠模型 NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA NA
50 2025-10-06
The role of TIGIT-CD226-PVR axis in mediating T cell exhaustion and apoptosis in NSCLC
2025-04, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究探讨TIGIT-CD226-PVR信号轴在非小细胞肺癌中调控T细胞耗竭和凋亡的作用机制 首次系统揭示TIGIT-CD226-PVR信号轴在CD27+/CD127+T细胞亚群中的调控作用及其与免疫治疗疗效的关联 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中得到验证 探索TIGIT-CD226-PVR信号轴在非小细胞肺癌T细胞耗竭和凋亡中的调控机制 非小细胞肺癌小鼠模型中的CD27+/CD127+T细胞 免疫肿瘤学 肺癌 单细胞测序技术、生物信息学分析、体外实验、体内研究 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
51 2025-10-06
Targeted editing of CCL5 with CRISPR-Cas9 nanoparticles enhances breast cancer immunotherapy
2025-04, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究利用CRISPR-Cas9纳米颗粒靶向编辑CCL5基因以增强乳腺癌免疫治疗效果 首次将CRISPR-Cas9技术与FCPCV纳米颗粒结合用于乳腺癌免疫治疗,通过靶向编辑CCL5基因改善肿瘤免疫微环境 研究主要基于小鼠模型,尚未进行人体临床试验 开发新型乳腺癌免疫治疗策略 乳腺癌细胞和人源化小鼠模型 基因编辑与免疫治疗 乳腺癌 CRISPR-Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据, 单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
52 2025-10-06
Integrating single-cell sequencing and machine learning to uncover the role of mitophagy in subtyping and prognosis of esophageal cancer
2025-04, Apoptosis : an international journal on programmed cell death IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞测序和机器学习方法,探索线粒体自噬在食管癌亚型分型和预后中的作用 首次将线粒体自噬相关基因与食管癌分子分型相结合,并利用机器学习算法识别核心基因构建预后模型 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 阐明线粒体自噬在食管癌中的分子机制并开发预后预测模型 食管癌患者 机器学习 食管癌 RNA测序,单细胞测序 LASSO回归,随机森林,XGBoost,多元COX回归 基因表达数据 TCGA数据库中的食管癌患者数据及两个外部验证队列 NA 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 NA NA
53 2025-10-06
Single-cell RNA sequencing reveals sex differences in the subcellular composition and associated gene-regulatory network activity of human carotid plaques
2025-Apr, Nature cardiovascular research IF:9.4Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示人类颈动脉斑块在亚细胞组成和基因调控网络活性方面的性别差异 首次在单细胞水平系统揭示颈动脉斑块中性别特异的细胞表型和基因调控网络差异 样本量相对有限,仅分析了7,690个细胞 探究颈动脉斑块形成中的性别差异机制 人类颈动脉斑块细胞 单细胞生物学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 7,690个颈动脉斑块细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
54 2025-10-06
Excitatory synaptic transmission is differentially modulated by opioid receptors along the claustro-cingulate pathway
2025-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨阿片受体在CLA-ACC神经通路中对兴奋性突触传递的调控机制 首次揭示KOR、MOR和DOR阿片受体在扣带皮层-屏状核通路中对兴奋性突触传递的差异化调控作用 研究仅限于小鼠模型,尚未在更高阶物种中验证 阐明阿片受体在扣带皮层-屏状核神经环路中对谷氨酸能信号传递的调控机制 小鼠扣带皮层第五层锥体神经元和屏状核神经元 神经科学 疼痛感知障碍 空间转录组学, 脑片电生理学, 光遗传学, 药理学方法 NA 电生理信号, 基因表达数据 小鼠脑组织样本 NA 空间转录组学 NA NA
55 2025-10-06
AI-based phenotyping of hepatic fiber morphology to inform molecular alterations in metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease
2025-Apr-22, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究利用人工智能技术对代谢功能障碍相关脂肪性肝病中的肝纤维形态进行表型分析,并探索其与分子改变的关系 开发了基于AI的FibroNest算法量化肝纤维形态表型,首次将纤维形态表型与空间单细胞转录组分析相结合揭示MASLD发病机制 样本量相对有限(94例活检样本),其中仅13%伴有HCC,需要更大样本验证 全面表征MASLD中肝纤维形态表型及其相关分子改变 94例MASLD患者的肝活检样本,其中12例并发肝细胞癌 数字病理学 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 全基因组转录组学,空间单细胞转录组,体外实验 AI算法(FibroNest) 组织图像,转录组数据,空间转录组数据 94例MASLD肝活检样本 Nanostring 空间单细胞转录组 CosMx CosMx空间分子成像平台
56 2025-10-06
Identification and characterization of early human photoreceptor states and cell-state-specific retinoblastoma-related features
2025-Apr-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过全长单细胞RNA测序识别早期人类光感受器状态及视网膜母细胞瘤相关特征 首次揭示未解决的感光细胞前体状态,发现早期锥细胞前体内在基因表达在视网膜母细胞瘤起始中的作用 NA 理解人类锥感光细胞与杆细胞的发育差异及其在视网膜母细胞瘤发生中的作用 人类锥感光细胞和杆感光细胞的发育状态 单细胞基因组学 视网膜母细胞瘤 全长单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
57 2025-10-06
Single-cell and spatial genomic landscape of non-small cell lung cancer brain metastases
2025-Apr, Nature medicine IF:58.7Q1
研究论文 通过多模态单细胞测序和空间转录组学揭示非小细胞肺癌脑转移的基因组景观 首次在初治NSCLC患者中整合单核RNA/T细胞受体测序、单细胞空间转录组和全基因组测序,发现染色体不稳定性是脑转移的显著特征 样本量相对有限,需要更大规模验证 探索非小细胞肺癌脑转移的生物学机制 非小细胞肺癌患者的脑转移灶和原发肿瘤 数字病理学 肺癌 单核RNA测序, T细胞受体测序, 单细胞空间转录组学, 全基因组测序, 多重免疫荧光 NA 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据 初治NSCLC患者样本(具体数量未明确)+ 4,869名独立患者验证队列 + 12,275名NSCLC患者新队列 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 全基因组测序 NA NA
58 2025-10-06
Activated polyreactive B cells are clonally expanded in autoantibody positive and patients with recent-onset type 1 diabetes
2025-Apr-22, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序分析揭示1型糖尿病患者中胰岛抗原反应性B细胞的基因表达和BCR谱系变化 首次在1型糖尿病中发现胰岛抗原反应性B细胞存在克隆扩增和多反应性特征 样本量有限,仅分析了外周血中的B细胞而未直接研究胰腺组织 探究1型糖尿病中自身反应性B细胞的表型和功能特征 非糖尿病自身抗体阴性一级亲属、自身抗体阳性者和新发1型糖尿病供者的外周血胰岛抗原反应性B细胞 单细胞基因组学 1型糖尿病 单细胞RNA测序, BCR测序 NA 单细胞转录组数据, B细胞受体序列数据 来自三类供者群体的外周血B细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
59 2025-10-06
SIGMAR1 screened by a GPCR-related classifier regulates endoplasmic reticulum stress in bladder cancer
2025-Apr-10, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过构建GPCR-TME分类器筛选出SIGMAR1,并验证其在膀胱癌中通过调节内质网应激影响肿瘤进展的机制 首次构建膀胱癌相关的GPCR-TME分类器,并发现SIGMAR1通过调节内质网应激影响膀胱癌进展的新机制 研究主要基于公共数据库数据,需要更多独立队列验证GPCR-TME分类器的临床应用价值 探究GPCR相关基因在膀胱癌中的作用机制,特别是SIGMAR1对内质网应激的调控功能 膀胱癌患者数据、膀胱癌细胞系、裸鼠移植瘤模型 生物信息学 膀胱癌 单细胞RNA测序, 免疫治疗反应分析, 蛋白质印迹, 基因集富集分析, CIBERSORT免疫细胞浸润分析 GPCR-TME分类器 批量测序数据, 单细胞RNA测序数据, 临床病理数据 从公共数据库获取的多组膀胱癌数据集,包含细胞系和组织样本 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
60 2025-10-06
Mapping Small Extracellular Vesicle Secretion Potential in Healthy Human Gingiva Using Spatial Transcriptomics
2025-Apr-07, Current issues in molecular biology IF:2.8Q3
研究论文 利用空间转录组学技术绘制健康人牙龈组织中小细胞外囊泡分泌潜力的空间分布图谱 首次在sEVs生物发生特定背景下对可用牙龈转录组数据进行荟萃分析,揭示了沟内上皮浅层和深层是sEVs相关基因表达最富集的区域 研究基于公开转录组数据,未进行实验验证;仅分析了43个已知sEVs生物发生相关基因中的12个 探索健康人牙龈组织中不同结构在小细胞外囊泡生物发生中的作用 健康人牙龈组织 空间转录组学 口腔组织再生 空间转录组学,基因本体分析 NA 转录组数据,空间基因表达数据 公开可用的牙龈转录组数据集 NA 空间转录组学 NA NA
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