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当前共找到 727 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-05 |
Artificial variables help to avoid over-clustering in single-cell RNA sequencing
2025-Apr-03, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.02.014
PMID:40081375
|
研究论文 | 提出一种名为'recall'的方法，通过引入人工变量来防止单细胞RNA测序中的过度聚类问题 | 通过控制'双重使用'数据的影响，提供了一种可应用于多种聚类算法的过度聚类保护方法 | NA | 解决单细胞RNA测序分析中过度聚类导致的误导性结果问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类算法 | 基因表达数据 | 真实数据和模拟数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 42 | 2025-10-05 |
Endogenous CD4+ T Cells That Recognize ALK and the NPM1::ALK Fusion Protein Can Be Expanded from Human Peripheral Blood
2025-Apr-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0445
PMID:39774774
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研究论文 | 本研究从人类外周血中成功扩增出识别ALK和NPM1::ALK融合蛋白的内源性CD4+ T细胞 | 首次在人类外周血中发现ALK特异性CD4+ T细胞，并鉴定出NPM1::ALK融合新表位特异性T细胞受体 | 样本量较小（10名患者和6名健康供者），仅针对ALK阳性间变性大细胞淋巴瘤 | 探索ALK特异性CD4+ T细胞在癌症免疫治疗中的潜力 | ALK阳性间变性大细胞淋巴瘤患者和健康供者的外周血样本 | 免疫学 | 淋巴瘤 | TCRαβ单细胞测序，树突状细胞刺激，肽池筛选 | TCR报告细胞系（58α-β-） | 细胞免疫应答数据，TCR序列数据 | 10名ALK阳性淋巴瘤患者和6名健康供者 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 43 | 2025-10-05 |
Histology-Based Virtual RNA Inference Identifies Pathways Associated with Metastasis Risk in Colorectal Cancer
2025-Apr-23, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.04.22.25326170
PMID:40313260
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研究论文 | 本研究开发了一种基于组织学图像的虚拟RNA推断方法，用于识别结直肠癌转移风险相关的通路 | 首次实现了直接从H&E染色组织图像推断空间转录组水平的分子信息，无需实际进行空间转录组测序 | 某些肿瘤相关通路仅靠组织学无法完全捕获 | 开发从组织学图像推断RNA表达的方法，识别结直肠癌转移风险相关通路 | 结直肠癌患者组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 虚拟RNA推断，空间转录组学 | UNI, ResNet-50, ViT, VMamba | 组织图像，基因表达数据 | 45名患者，超过300,000个Visium点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 44 | 2025-10-05 |
Long-read single-cell RNA sequencing enables the study of cancer subclone-specific genotypes and phenotypes in chronic lymphocytic leukemia
2025-Apr-14, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279049.124
PMID:39965935
|
研究论文 | 本研究利用长读长单细胞RNA测序技术研究慢性淋巴细胞白血病中癌症亚克隆的基因型和表型特征 | 结合scBayes分析方法和MAS-seq长读长单细胞RNA测序技术，显著提高转录本覆盖度并扩展可检测的突变信息 | 研究样本量较小，仅包含6名患者 | 研究携带BTK C481S突变的癌症亚克隆，识别共存的CLL驱动突变，并分析突变亚克隆的转录组特征 | 慢性淋巴细胞白血病患者的癌细胞亚克隆 | 单细胞测序分析 | 慢性淋巴细胞白血病 | 长读长单细胞RNA测序，bulk DNA测序 | scBayes | 单细胞RNA测序数据，DNA测序数据 | 6名慢性淋巴细胞白血病患者 | NA | 单细胞RNA测序 | MAS-seq | 长读长单细胞RNA测序技术 |
| 45 | 2025-10-05 |
Integrating short-read and long-read single-cell RNA sequencing for comprehensive transcriptome profiling in mouse retina
2025-Apr-14, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279167.124
PMID:40050124
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研究论文 | 本研究通过整合短读长和长读长单细胞RNA测序技术，对小鼠视网膜进行了全面的转录组分析 | 首次系统比较单细胞长读长与传统短读长RNA测序技术，发现了44,325个转录本异构体，其中38%为先前未表征，17%在特定细胞亚类中特异性表达 | 研究仅限于小鼠视网膜组织，未验证其他组织或物种的适用性 | 建立有效的转录本异构体表征方法，研究选择性剪接在视网膜生物学中的作用 | 约30,000个小鼠视网膜细胞 | 单细胞测序 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 约30,000个细胞 | Illumina, Oxford Nanopore Technologies | 单细胞RNA测序 | Illumina测序平台, Oxford Nanopore测序平台 | 短读长测序产生15.4亿条reads，长读长测序产生14.0亿条reads |
| 46 | 2025-10-05 |
Timing neural development and regeneration
2025-Apr, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2025.102976
PMID:40010202
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综述 | 探讨哺乳动物神经祖细胞时间身份调控机制及其在胶质细胞重编程中的潜在应用 | 整合时间身份调控与神经发生因子过表达以增强重编程效率并扩展神经元亚型多样性 | NA | 解析神经祖细胞时间身份调控机制及其在神经再生治疗中的应用潜力 | 哺乳动物中枢神经系统神经祖细胞和胶质细胞 | 神经发育生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 47 | 2025-10-05 |
Niche Macrophages Recycle Iron to Tumor Cells and Foster Erythroblast Mimicry to Promote Bone Metastasis and Anemia
2025-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.23.650120
PMID:41031013
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研究论文 | 本研究揭示了骨髓转移微环境中巨噬细胞通过铁循环促进肿瘤生长和贫血的新机制 | 发现VCAM1+CD163+CCR3+巨噬细胞在骨转移微环境中被肿瘤细胞劫持用于铁获取，并首次报道肿瘤细胞通过模仿红系细胞产生血红蛋白的适应性机制 | 人类样本验证仍需进一步扩展，具体分子调控通路需要更深入研究 | 探究骨转移与贫血之间的机制联系及肿瘤微环境中细胞互作 | 骨髓转移微环境中的巨噬细胞、肿瘤细胞和红系细胞 | 单细胞生物学 | 乳腺癌骨转移 | 单细胞RNA测序, 微环境标记 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 48 | 2025-10-05 |
Tumor-derived arachidonic acid reprograms neutrophils to promote immune suppression and therapy resistance in triple-negative breast cancer
2025-Apr-08, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.03.002
PMID:40157359
|
研究论文 | 本研究揭示了三阴性乳腺癌细胞通过释放含花生四烯酸的细胞外囊泡重编程中性粒细胞，导致免疫抑制和治疗抵抗的机制 | 首次发现肿瘤细胞脂质积累通过细胞外囊泡介导的中性粒细胞重编程促进免疫抑制和治疗抵抗 | 人类患者数据仅为相关性分析，需要进一步验证机制 | 探究三阴性乳腺癌获得性免疫治疗抵抗的机制 | 三阴性乳腺癌细胞和中性粒细胞 | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 49 | 2025-10-05 |
Annexin A1 regulates inflammatory-immune response and reduces pancreatic and extra- pancreatic injury during severe acute pancreatitis
2025-Apr, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00321-x
PMID:40025269
|
研究论文 | 本研究探讨了Annexin A1在重症急性胰腺炎中调节炎症免疫反应及减轻胰腺和胰腺外损伤的作用 | 首次系统揭示Anxa1在髓系细胞中的动态表达调控及其在重症急性胰腺炎中的保护机制，并证明其衍生肽Ac2-26的治疗潜力 | 研究主要基于动物模型，尚未在人体临床试验中验证 | 阐明Annexin A1在急性胰腺炎炎症免疫反应中的调控作用 | 髓系细胞、胰腺组织及肺肝肾等胰腺外器官 | 病理生理学 | 急性胰腺炎 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、基因表达分析 | 动物模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | 多种动物模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 50 | 2025-10-05 |
p63 co-opts the skin Krt8-to-Krt5 transition for enamel organ development
2025-Apr-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.11.637463
PMID:39990386
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了p63在釉质器官发育中调控Krt8向Krt5过渡的机制 | 首次发现p63在釉质器官发育中借用皮肤发育的Krt8-to-Krt5过渡机制 | 研究仅基于小鼠切牙模型，早期p63敲除小鼠的发育停滞限制了更全面功能研究 | 探究p63在釉质器官细胞分化中的具体作用机制 | 小鼠切牙釉质器官上皮细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 轨迹重建, 比较转录组分析, 染色质可及性分析 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 小鼠切牙样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 51 | 2025-10-05 |
3D spatial transcriptomics reveals the molecular structure of input and output pathways in the mouse olfactory bulb
2025-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.19.639192
PMID:40060607
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研究论文 | 利用3D空间转录组学技术重建小鼠嗅球的解剖和分子组织，揭示嗅觉通路的分子结构 | 首次使用3D空间转录组学技术绘制了嗅球的全面分子图谱，揭示了嗅球对称性组织的新原理 | 研究仅限于小鼠模型，未在其他物种中验证 | 研究脊椎动物大脑对称性组织的分子基础 | 小鼠嗅球组织 | 空间转录组学 | NA | 3D空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 近一千个分子特征不同的肾小球 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 52 | 2025-10-05 |
Machine learning integration of single-cell and bulk transcriptomics identifies fibroblast-driven prognostic markers in colorectal cancer
2025-Apr-22, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2025.12038
PMID:40266079
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组数据，识别结直肠癌中成纤维细胞驱动的预后标志物 | 首次通过机器学习整合单细胞和批量转录组数据，构建了七基因成纤维细胞相关预后特征 | 研究样本量相对有限，需要在更多独立队列中验证 | 开发结直肠癌的预后生物标志物和个性化治疗策略 | 结直肠癌肿瘤微环境中的成纤维细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 机器学习整合方法 | 基因表达数据 | 306个CRC样本（448,255个细胞），TCGA-COAD队列351例，GSE17536数据集177例 | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 53 | 2025-10-05 |
Rare Subset of T Cells Form Heterotypic Clusters with Circulating Tumor Cells to Foster Cancer Metastasis
2025-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.01.646421
PMID:40236049
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研究论文 | 本研究揭示了一种罕见的CD4和CD8双阳性T细胞通过与循环肿瘤细胞形成异质性簇促进癌症转移的新机制 | 首次发现罕见的CD4/CD8双阳性T细胞在CTC-WBC簇中显著富集，并鉴定VLA4-VCAM1相互作用是簇形成的关键介质 | 研究主要基于晚期乳腺癌患者样本，需要验证是否适用于其他癌症类型和早期患者 | 探索外周血免疫细胞与循环肿瘤细胞的相互作用机制及其在癌症转移中的作用 | 晚期乳腺癌患者的血液样本和临床前小鼠模型 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 流式细胞术, ImageStream分析, 单细胞RNA测序, 基因扰动研究 | NA | 血液样本, 测序数据, 图像数据 | 1,529例乳腺癌患者血液标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 54 | 2025-10-05 |
High-resolution reconstruction of cell-type specific transcriptional regulatory processes from bulk sequencing samples
2025-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.02.646189
PMID:40291712
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研究论文 | 提出一种名为DeepDETAILS的新型深度学习框架，能够从批量测序样本中高分辨率重建细胞类型特异性转录调控过程 | 开发了基于深度学习的跨模态反卷积方法，可利用scATAC-seq参考库对其他批量组学数据集进行细胞类型特异性信号重建，达到碱基对精度 | 依赖于scATAC-seq参考数据的可用性和质量，未明确说明模型对数据稀缺情况的处理能力 | 实现从批量测序数据中高分辨率重建细胞类型特异性基因组信号 | 人类组织和细胞类型，包括39种不同人体组织和86种不同细胞类型 | 机器学习 | 原发性硬化性胆管炎 | 深度学习，单细胞ATAC测序，染色质免疫沉淀测序，新生转录测序 | 深度学习框架 | 基因组测序数据 | 39种人体组织和86种细胞类型 | NA | 单细胞ATAC-seq, ChIP-seq, PRO-cap, PRO-seq | NA | NA |
| 55 | 2025-10-05 |
Inhibition of bone morphogenetic protein 4 alleviates angiotensin II-induced abdominal aortic aneurysm by reducing inflammation and endothelial-mesenchymal transition
2025-04, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示BMP4在血管紧张素II诱导的腹主动脉瘤中通过调节内皮-间质转化和炎症促进疾病进展的机制 | 首次发现BMP4在腹主动脉瘤进展中的关键作用，并阐明其通过BGN结合和PI3K/AKT/mTOR通路诱导内皮细胞表型转换的机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究腹主动脉瘤的发病机制及BMP4在其中的作用 | 血管紧张素II诱导的腹主动脉瘤小鼠模型和鼠主动脉内皮细胞 | 单细胞测序分析 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序, 伪时间轨迹分析, 蛋白质-蛋白质相互作用分析, 共免疫沉淀 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞测序分析 |
| 56 | 2025-10-05 |
Integrative analysis of single-cell transcriptomics and genetic associations identify cell states associated with vascular disease
2025-04, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
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研究论文 | 通过整合单细胞转录组学和遗传关联分析，识别与血管疾病相关的细胞状态 | 开发新的计算方法整合GWAS数据与单核RNA测序数据，识别血管疾病相关的特定细胞亚群和中间状态 | 样本量相对较小（正常n=7，动脉瘤n=9，动脉粥样硬化n=2），仅使用人类升主动脉组织 | 识别导致早期血管功能障碍的特定血管亚群和中间细胞状态 | 人类升主动脉组织（正常、动脉瘤和动脉粥样硬化） | 单细胞生物学 | 血管疾病 | 单核RNA测序（snRNA-seq），GWAS整合分析 | RNA轨迹分析，细胞类型特异性富集分析 | 单细胞转录组数据，遗传关联数据 | 18个样本（7正常，9动脉瘤，2动脉粥样硬化） | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 57 | 2025-10-05 |
Stem Cell Markers LGR5, LGR4 and Their Immediate Signalling Partners are Dysregulated in Preeclampsia
2025-Apr, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-024-10831-2
PMID:39688759
|
研究论文 | 本研究首次描述了LGR5和LGR4及其信号伴侣在人类胎盘中的表达特征，并发现它们在子痫前期胎盘中的失调现象 | 首次在人类胎盘中表征LGR5/LGR4及其配体/靶点，发现这些干细胞标志物在子痫前期和胎儿生长受限胎盘中的表达失调 | 缺氧/促炎细胞因子处理未能显著改变LGR5/LGR4表达，暗示可能存在其他调控机制 | 研究LGR5/LGR4及其信号伴侣在人类胎盘中的表达特征及其在子痫前期和胎儿生长受限中的失调机制 | 人类胎盘组织、滋养层干细胞、不同妊娠期胎盘样本 | 生殖医学 | 子痫前期、胎儿生长受限 | 原位杂交、单细胞转录组测序、单核RNA测序、转录组分析 | NA | RNA测序数据、基因表达数据 | 早孕期胎盘11例、早产胎盘9例、足月胎盘11例、早发性子痫前期81例、晚发性子痫前期20例、胎儿生长受限34例及相应对照组 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA |
| 58 | 2025-10-05 |
Plasma exosomes from individuals with type 2 diabetes drive breast cancer aggression in patient-derived organoids
2025-Apr-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.13.612950
PMID:39345362
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研究论文 | 本研究通过患者来源类器官模型揭示2型糖尿病血浆外泌体通过改变肿瘤微环境促进乳腺癌侵袭性的新机制 | 首次开发了保留天然肿瘤浸润淋巴细胞的乳腺癌患者来源类器官模型，并发现2型糖尿病外泌体通过扩增免疫抑制性T细胞和增强肿瘤异质性驱动癌症进展 | 研究样本量有限，外泌体作用的具体分子机制尚未完全阐明 | 探究2型糖尿病血浆外泌体对乳腺癌肿瘤微环境免疫细胞功能的影响 | 乳腺癌患者来源类器官和血浆外泌体 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 患者来源类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 59 | 2025-10-05 |
Polymorphic tandem repeats influence cell type-specific gene expression across the human immune landscape
2025-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.02.621562
PMID:40291654
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研究论文 | 本研究通过全基因组和单细胞RNA测序分析串联重复序列对免疫细胞类型特异性基因表达的影响 | 首次在单细胞水平系统分析串联重复序列对免疫细胞类型特异性基因表达的调控作用，发现超过62,000个单细胞表达数量性状串联重复位点 | 研究主要基于血液来源细胞，可能不适用于其他组织类型；串联重复序列的准确识别仍存在技术挑战 | 探索串联重复序列变异对免疫细胞类型特异性基因表达的调控机制 | 1,925名个体的血液来源细胞，涵盖28种不同的免疫细胞类型 | 基因组学 | 免疫介导性疾病，血液系统疾病 | 全基因组测序，单细胞RNA测序 | 数量性状位点分析，精细定位 | 基因组序列数据，单细胞基因表达数据 | 超过540万个血液来源细胞，来自1,925名个体 | NA | 单细胞RNA-seq，全基因组测序 | NA | NA |
| 60 | 2025-10-06 |
Prunella vulgaris: A potential molecule for the treatment of hepatocellular carcinoma
2025-Apr-25, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000042267
PMID:40295240
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研究论文 | 本研究系统评估了夏枯草治疗肝细胞癌的潜力并探索其分子机制 | 首次通过系统药理学方法识别夏枯草治疗肝细胞癌的关键靶点，并揭示其通过p53信号通路和免疫细胞调节的分子机制 | 研究主要基于计算预测和体外实验，缺乏体内实验验证和临床数据支持 | 探索夏枯草治疗肝细胞癌的分子机制和潜在生物标志物 | 夏枯草活性成分及其在肝细胞癌中的分子靶点 | 系统药理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,分子对接,体外实验 | NA | 基因表达数据,化合物靶点数据 | 185个药物靶点和635个HCC相关靶点 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |