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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2025-10-07 |
Parallel comparison of T cell and B cell subpopulations of adenoid hypertrophy and tonsil hypertrophy of children
2025-Apr-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58094-w
PMID:40229254
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较儿童腺样体肥大和扁桃体肥大的T细胞和B细胞亚群差异 | 首次在单细胞水平上平行比较AH和TH的免疫微环境差异,发现AH具有更多幼稚B细胞和调节性CD4 T细胞,但浆细胞较少 | 样本量相对有限,仅包含12对配对样本 | 探究儿童腺样体肥大和扁桃体肥大的免疫微环境差异 | 1209名1-15岁被诊断为腺样体肥大的儿科患者,其中12对配对AH和TH样本 | 单细胞生物学 | 儿童耳鼻喉疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1209名患者,12对配对AH和TH样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 562 | 2025-10-07 |
Multi-omics analysis identifies diagnostic circulating biomarkers and potential therapeutic targets, revealing IQGAP1 as an oncogene in gastric cancer
2025-Apr-14, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00895-9
PMID:40229327
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研究论文 | 通过多组学整合分析识别胃癌循环生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次通过多组学整合方法识别出IQGAP1等8个胃癌生物标志物,并揭示IQGAP1在胃癌中的致癌作用 | NA | 识别胃癌诊断性循环生物标志物和潜在治疗靶点 | 胃癌患者 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 基因定量性状位点分析, 蛋白定量性状位点分析, 共定位分析, 孟德尔随机化 | NA | 血浆样本, 肿瘤组织样本, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 563 | 2025-10-07 |
IL1RAP is an immunotherapeutic target for normal karyotype triple-mutated acute myeloid leukemia
2025-Apr-14, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00769-z
PMID:40229904
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研究论文 | 本研究通过多组学分析鉴定IL1RAP作为正常核型三重突变急性髓系白血病的免疫治疗靶点 | 首次通过多组学方法系统识别IL1RAP作为NKt-AML特异性表面抗原,并证明其可作为抗体-药物偶联物的潜在靶点 | 样本量有限(仅12例NKt-AML样本进行表面蛋白质组分析),需进一步验证 | 寻找NKt-AML特异性表面抗原以开发新型免疫疗法 | 原发性急性髓系白血病样本 | 生物医学 | 急性髓系白血病 | 表面蛋白质组富集、转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 100例原发性AML样本(表面蛋白质组),691例原发性AML样本(转录组),23例原发性AML样本(单细胞RNA测序) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 564 | 2025-10-07 |
Extracellular vesicle-derived miRNA-mediated cell-cell communication inference for single-cell transcriptomic data with miRTalk
2025-Apr-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03566-x
PMID:40229908
|
研究论文 | 开发了一种名为miRTalk的新方法,用于从单细胞转录组数据推断细胞外囊泡来源的miRNA介导的细胞间通讯 | 首次提出通过细胞外囊泡来源的miRNA-靶标相互作用推断细胞间通讯的创新方法 | NA | 开发从单细胞RNA测序数据推断细胞间通讯的计算方法 | 细胞外囊泡来源的miRNA及其靶标相互作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | miRTalk(专门开发的推断算法) | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 565 | 2025-10-07 |
Comprehensive bioinformatics and immunohistochemical analyses identify phosphoinositide metabolism and PNPLA7 as potential biomarkers in urological cancers
2025-Apr-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-97118-9
PMID:40221501
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研究论文 | 通过生物信息学和免疫组化分析发现磷酸肌醇代谢和PNPLA7基因可作为泌尿系统癌症的潜在生物标志物 | 首次系统研究磷酸肌醇代谢在泌尿系统癌症中的作用,并发现PNPLA7作为新型生物标志物 | 基于公共数据库的分析,需要进一步实验验证 | 探讨磷酸肌醇代谢在泌尿系统癌症中的预后价值和治疗指导意义 | 透明细胞肾癌、膀胱癌和前列腺腺癌 | 生物信息学 | 泌尿系统癌症 | 生物信息学分析,单细胞RNA测序,免疫组化 | NA | 基因表达数据,临床样本 | 公共数据库中的泌尿系统癌症数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 566 | 2025-10-07 |
Exploring the tumor microenvironment of breast cancer to develop a prognostic model and predict immunotherapy responses
2025-Apr-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-97784-9
PMID:40221624
|
研究论文 | 本研究通过分析乳腺癌肿瘤微环境开发预后模型并预测免疫治疗反应 | 识别了12个独立预后基因并构建预后模型,首次揭示内皮细胞比例与患者预后的显著关联 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏前瞻性临床验证 | 开发乳腺癌预后模型并预测免疫治疗反应 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组测序,单细胞RNA测序 | Cox回归,LASSO回归,共识聚类,WGCNA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 公共数据库中的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,转录组测序 | NA | NA |
| 567 | 2025-10-07 |
Overcoming immunotherapy resistance in hepatocellular carcinoma by targeting myeloid IL-8/CXCR2 signaling
2025-Apr-02, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.02.002
PMID:39916327
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研究论文 | 本研究通过靶向髓系IL-8/CXCR2信号通路克服肝细胞癌的免疫治疗耐药性 | 首次在单细胞水平揭示IL-8/CXCR2通路通过髓系抑制细胞介导免疫检查点抑制剂耐药机制,并验证CXCR2拮抗剂的联合治疗策略 | 研究样本量有限,主要基于临床前模型验证机制 | 阐明肝细胞癌免疫检查点抑制剂耐药机制并开发联合治疗策略 | 晚期肝细胞癌患者和小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 原位小鼠模型 | 基因表达数据 | 晚期肝细胞癌患者队列(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 568 | 2025-10-07 |
Dynamic changes of molecular pattern and cellular subpopulation in puncture-induced tendon injury model
2025-Apr-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112034
PMID:40230536
|
研究论文 | 本研究通过建立穿刺诱导的肌腱损伤模型,揭示了早期肌腱修复过程中的分子模式和细胞亚群动态变化 | 首次在多个时间点系统分析早期肌腱损伤的分子模式和细胞亚群,识别了7个特征基因集和15种参与修复的细胞类型 | 临床早期肌腱损伤样本获取困难,研究主要基于动物模型 | 探索早期肌腱修复的分子机制和细胞动态 | 穿刺诱导的肌腱损伤模型 | 单细胞组学 | 肌腱疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 569 | 2025-10-07 |
Senescent CD8+ T cells: a novel risk factor in atrial fibrillation
2025-Apr-15, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae222
PMID:39382426
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多色流式细胞术发现衰老CD8+ T细胞是心房颤动的关键免疫特征,并揭示了其通过干扰素-γ诱导钙处理异常促进房颤的机制 | 首次将衰老CD8+ T细胞鉴定为房颤的新型风险因素,并揭示了其通过干扰素-γ诱导心肌细胞钙处理异常致心律失常的机制 | NA | 全面表征房颤中的免疫细胞特征并探究其潜在机制 | 房颤患者和非房颤对照人群的免疫细胞及hiPSC来源的心房肌细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 多色流式细胞术, 心脏光学标测 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据, 电生理数据 | 房颤患者和非房颤对照人群的外周静脉和左心房样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 570 | 2025-10-07 |
Determinants of Response to Sequential Pembrolizumab with Trastuzumab plus Platinum/5-FU in HER2-Positive Gastric Cancer: A Phase II Chemoimmunotherapy Trial
2025-Apr-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-3528
PMID:40100100
|
研究论文 | 评估序贯使用帕博利珠单抗联合曲妥珠单抗加铂类/5-FU治疗HER2阳性胃癌的疗效和生物学机制 | 首次在HER2阳性胃癌中评估序贯免疫化疗方案,并通过多时间点活检揭示曲妥珠单抗诱导的NK细胞浸润和Fc受体介导的细胞毒性机制 | 样本量较小(16例患者),为单臂II期试验 | 评估序贯帕博利珠单抗联合曲妥珠单抗加铂类/5-FU在HER2阳性胃癌中的疗效和生物学决定因素 | 晚期HER2阳性胃食管腺癌患者 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 全外显子测序, 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 空间转录组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 临床数据 | 16例治疗初治的转移性HER2阳性胃食管癌患者 | NA | 全外显子测序, 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 571 | 2025-10-07 |
Plasma CCL3 predicts adverse heart failure outcomes in patients with arrhythmogenic cardiomyopathy
2025-Apr-14, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-04024-y
PMID:40223064
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研究论文 | 本研究探讨了致心律失常性心肌病(ACM)患者心肌纤维脂肪组织的特征及血浆趋化因子水平与心力衰竭负担的关系 | 首次发现ACM患者纤维脂肪组织中米色/棕色脂肪标志物表达升高,饱和甘油三酯水平增加,并通过单细胞RNA测序揭示了促炎巨噬细胞的明显积累 | 需要在更大规模和独立的队列中进行进一步验证 | 研究ACM患者纤维脂肪组织特征及血浆趋化因子水平与心力衰竭预后的关系 | 致心律失常性心肌病患者 | 心血管疾病研究 | 致心律失常性心肌病 | 实时定量PCR, 脂质组学分析(LC-MS), 单细胞RNA测序, 免疫染色, 酶联免疫吸附试验 | NA | 基因表达数据, 脂质组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 纤维脂肪组织样本: 正常对照10例, ACM患者24例; 单细胞RNA测序: 正常对照2例, ACM患者6例; 随访研究: ACM患者102例 | NA | 单细胞RNA测序, 脂质组学分析 | NA | NA |
| 572 | 2025-10-07 |
A spatial transcriptomics study of MES-like and mono/macro cells in gliomas
2025-Apr-13, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-95277-3
PMID:40222970
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析胶质瘤中MES样恶性细胞和单核/巨噬细胞亚群的空间分布特征及其在肿瘤微环境中的作用 | 首次利用空间转录组学揭示MES样恶性肿瘤细胞在四个不同区域的精确定位,并发现CD14-ITGB2、LGALS1-CD69和APOE-TREM2等关键细胞间相互作用 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 识别胶质瘤的潜在治疗靶点和预后标志物 | 胶质母细胞瘤(GBM)和低级别胶质瘤(LGG)患者 | 空间转录组学 | 胶质瘤 | 空间转录组学,生物信息学分析,药物敏感性分析 | TIDE框架 | 基因表达数据,临床信息,空间转录组数据 | 1327个测序数据样本 | NA | 空间转录组学,多组学分析 | NA | NA |
| 573 | 2025-10-07 |
Single cell transcriptome sequencing indicates the cellular heterogeneity of small intestine tissue in celiac disease
2025-Apr-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-90300-z
PMID:40216823
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示乳糜泻小肠组织的细胞异质性 | 首次构建乳糜泻小肠组织的单细胞表达谱,发现新的疾病相关生物标志物和T细胞亚群特征 | 样本量较小(仅3例患者和3例对照),仅在中国人群中进行验证 | 探索乳糜泻的发病机制,分析免疫微环境和细胞异质性 | 乳糜泻患者和健康对照者的小肠活检组织 | 单细胞组学 | 乳糜泻 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,定量聚合酶链反应 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例乳糜泻患者和3例健康对照的小肠活检组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 574 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics reveals the mechanisms of lung injury induced by galt gene editing in mouse
2025-Apr-11, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151780
PMID:40233430
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示GALT基因编辑诱导小鼠肺损伤的分子机制 | 首次利用CRISPR/Cas9技术构建Galt c.847 + 1G>T突变小鼠模型,并通过单细胞RNA测序系统分析肺组织细胞群体变化 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类样本中验证 | 探究GALT基因突变对肺组织的影响机制 | GALT基因编辑小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 半乳糖血症 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9, PCR, Western blotting, 组织病理学分析 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 基因编辑小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 575 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals important role of monocytes and macrophages during mucopolysaccharidosis treatment
2025-Apr-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-97330-7
PMID:40210734
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究黏多糖贮积症II型患者在接受酶替代治疗过程中免疫细胞的动态变化 | 首次在MPS-II患者中应用单细胞RNA测序技术分析治疗过程中免疫细胞的动态变化,发现单核细胞和巨噬细胞在疾病进程和治疗响应中的关键作用 | 仅纳入1名10岁患者样本,样本量较小 | 研究MPS-II疾病进程中免疫细胞的动态变化及其在酶替代治疗中的作用机制 | 黏多糖贮积症II型患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 黏多糖贮积症 | 单细胞RNA测序,基因组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 1名10岁MPS-II患者在不同疾病阶段的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 576 | 2025-10-07 |
Integrated bioinformatics and experimental verification to dissect the mechanisms and bioactive ingredients of Radix Rehmanniae in treating multiple sclerosis
2025-Apr-08, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151790
PMID:40233432
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研究论文 | 通过整合生物信息学和实验验证揭示生地黄治疗多发性硬化的作用机制及活性成分 | 首次采用网络药理学与实验验证相结合的策略系统阐明生地黄治疗多发性硬化的多成分-多靶点作用模式 | 机制研究主要集中于小胶质细胞,尚未在其他细胞类型中验证 | 探究生地黄治疗多发性硬化的作用机制和活性成分 | 生地黄及其活性成分松果菊苷和毛蕊花糖苷 | 生物信息学 | 多发性硬化 | 网络药理学,转录组学,单细胞RNA测序,分子对接,体外实验 | NA | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | 基于GSE数据集的转录组和单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序,转录组学 | NA | NA |
| 577 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA Sequencing Analysis of Sputum Cell Transcriptomes Reveals Pathways and Communication Networks That Contribute to the Pathogenesis of Asthma
2025-Apr-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.31.646405
PMID:40236103
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析哮喘患者痰液细胞转录组,揭示参与哮喘发病机制的细胞通路和通讯网络 | 首次在哮喘患者痰液样本中应用单细胞RNA测序技术,揭示了细胞表型和动态通讯模式的详细景观 | 样本量相对有限(16例哮喘患者和8例对照),仅基于痰液样本分析 | 研究哮喘发病机制中的细胞转录组特征和细胞间通讯网络 | 哮喘患者和非哮喘对照者的痰液细胞 | 单细胞转录组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 16例哮喘患者和8例非哮喘对照,共37,565个细胞转录组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 578 | 2025-10-07 |
Chromosomal Instability and Clonal Heterogeneity in Breast Cancer: From Mechanisms to Clinical Applications
2025-Apr-04, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17071222
PMID:40227811
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综述 | 本文全面综述了乳腺癌中染色体不稳定性和克隆异质性的机制及其临床意义 | 整合了单细胞测序等最新检测技术进展,系统阐述CIN和CH在肿瘤免疫微环境塑造和免疫治疗中的作用 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据和研究方法 | 探讨乳腺癌染色体不稳定性和克隆异质性的生物学机制及临床转化价值 | 乳腺癌肿瘤细胞 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | 单细胞测序, 高分辨率技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 579 | 2025-10-07 |
Mapping the spatial architecture of glioblastoma from core to edge delineates niche-specific tumor cell states and intercellular interactions
2025-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.04.647096
PMID:40235981
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研究论文 | 利用空间转录组学绘制胶质母细胞瘤从核心到边缘的空间结构,揭示肿瘤细胞状态和细胞间相互作用 | 首次通过空间转录组学系统描绘GBM生态系统的空间异质性,发现由基因表达和空间定位共同定义的肿瘤细胞状态 | NA | 解析胶质母细胞瘤的空间异质性和肿瘤微环境结构 | 胶质母细胞瘤组织样本 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 580 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics AI agent charts hPSC-pancreas maturation in vivo
2025-Apr-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.01.646731
PMID:40236029
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研究论文 | 开发了一种名为STAgent的空间转录组学AI代理,用于自动化分析人类干细胞来源胰腺细胞在体内的成熟过程 | 整合多模态大语言模型与专业计算工具,将数周的分析任务转化为分钟级的自动化处理,具备动态代码生成、视觉推理和实时文献检索等自主研究能力 | NA | 开发自动化空间转录组学分析工具,研究人类干细胞来源胰腺细胞的体内成熟过程 | 人类干细胞来源的胰腺细胞移植到免疫缺陷小鼠后的发育过程 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,单细胞空间转录组学 | 多模态大语言模型 | 空间转录组数据 | 多个发育时间点的单细胞空间转录组数据 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |