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当前共找到 716 篇文献，本页显示第 541 - 560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 541 | 2025-10-07 |
Circular RNA discovery with emerging sequencing and deep learning technologies
2025-Apr-17, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02157-7
PMID:40247051
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综述 | 本文总结了环状RNA发现、表征和功能分析算法的最新突破 | 整合长读长和单细胞RNA测序技术与深度学习算法，以前所未有的分辨率和规模研究环状RNA | 整合大规模环状RNA测序数据仍面临挑战 | 探索环状RNA在基因调控和疾病发病机制中的作用 | 环状RNA分子 | 自然语言处理 | NA | 长读长测序, 单细胞RNA测序 | 深度学习 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 542 | 2025-10-07 |
Bulk RNA-seq conjoined with ScRNA-seq analysis reveals the molecular characteristics of nucleus pulposus cell ferroptosis in rat aging intervertebral discs
2025-Apr-17, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-025-03550-7
PMID:40247370
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研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq分析，揭示了大鼠衰老椎间盘中髓核细胞铁死亡的分子特征 | 首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq技术系统鉴定髓核细胞铁死亡的关键驱动因子和细胞亚群特征 | 研究仅在大鼠模型中进行，需要进一步在人类样本中验证 | 明确椎间盘退变过程中髓核细胞铁死亡的关键驱动因子和细胞亚群特征 | 大鼠尾椎间盘的髓核组织和细胞 | 单细胞组学 | 椎间盘退变 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 普鲁士蓝染色, 荧光探针检测 | NA | 基因表达数据, 组织染色图像 | 10月龄和20月龄大鼠椎间盘组织 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 543 | 2025-10-07 |
Progranulin deficiency in the brain: the interplay between neuronal and non-neuronal cells
2025-Apr-16, Translational neurodegeneration
IF:10.8Q1
DOI:10.1186/s40035-025-00475-8
PMID:40234992
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综述 | 本文综述了颗粒蛋白前体缺乏在脑部疾病中的作用机制，重点关注神经元与非神经元细胞之间的相互作用 | 系统阐述了颗粒蛋白前体缺乏导致神经退行性病变的非细胞自主机制，特别关注脂滴积累小胶质细胞和髓鞘脂质含量改变等新发现 | NA | 探讨颗粒蛋白前体缺乏如何通过不同脑细胞群体及其异常相互作用导致额颞叶痴呆的神经退行性变和神经炎症 | 神经元、小胶质细胞、星形胶质细胞、少突胶质细胞、内皮细胞和周细胞等脑部细胞群体 | 神经科学 | 额颞叶痴呆 | 单细胞转录组学、诱导多能干细胞技术、基因工程器官样体 | NA | 患者脑组织、生物体液、体外模型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 544 | 2025-10-07 |
Senescence-induced p21high macrophages contributed to CD8+ T cells-related immune hyporesponsiveness in kidney transplantation via Zfp36/IL-27 axis
2025-Apr-15, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-025-00784-2
PMID:40234384
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研究论文 | 本研究揭示了衰老诱导的p21高表达巨噬细胞通过Zfp36/IL-27轴抑制CD8+ T细胞功能，从而减轻肾移植排斥反应的机制 | 首次发现衰老相关巨噬细胞通过Zfp36调控IL-27表达影响CD8+ T细胞功能的免疫抑制机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床验证仍需进一步开展 | 探究衰老免疫系统对肾移植排斥反应的影响机制 | 肾移植受者和小鼠移植模型 | 免疫学 | 肾移植排斥反应 | 单细胞转录组分析，基因敲除，siRNA沉默，中和抗体 | 小鼠肾移植模型，条件性基因敲除模型 | 临床数据，单细胞转录组数据，体外功能实验数据 | 来自中国和德国两个医疗中心的临床数据，小鼠移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 545 | 2025-10-07 |
Redefining the high variable genes by optimized LOESS regression with positive ratio
2025-Apr-15, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06112-5
PMID:40234751
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研究论文 | 开发了一种基于优化LOESS回归的单细胞RNA测序特征选择算法 | 利用优化的局部加权散点平滑回归精确捕捉基因平均表达水平与阳性比率的关系，同时最小化过拟合 | NA | 提高单细胞RNA测序数据的特征选择效果 | 单细胞RNA测序数据中的高变基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | LOESS回归 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 546 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic dynamics of scallop heart reveals the heterogeneous response to heat stress
2025-Apr-15, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02210-1
PMID:40234911
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了扇贝心脏在热应激下的异质性响应机制 | 首次在开放循环系统动物中揭示心室肌细胞和心房肌细胞对热应激的差异化响应模式，并鉴定出关键热响应基因PLRP2-like | 研究仅针对单一物种，未涉及其他开放循环系统动物的比较分析 | 探究开放循环系统动物心脏对高温应激的细胞异质性响应机制 | 软体动物模型Argopecten irradians（扇贝）的心脏组织 | 单细胞生物学 | 热应激反应 | 单细胞RNA测序，RNA干扰 | NA | 单细胞转录组数据，形态学数据，代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 547 | 2025-10-07 |
Patterns of hemolysis, erythropoiesis, and iron distribution define unique disease trajectories in three mouse models of genetic anemia
2025-Apr-15, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2025.104787
PMID:40245977
|
研究论文 | 本研究系统比较了三种遗传性贫血小鼠模型的溶血模式、红细胞生成和铁分布特征 | 首次通过综合比较三种常见遗传性贫血模型，揭示了它们在溶血模式、铁代谢和红细胞生成方面的独特疾病轨迹 | 研究仅限于小鼠模型，结果向人类疾病的转化需要进一步验证 | 阐明不同遗传性贫血模型的病理生理差异，为疾病研究和治疗开发提供模型选择依据 | 镰状细胞病、β-地中海贫血和遗传性球形红细胞增多症的小鼠模型 | 血液病研究 | 遗传性贫血 | 单细胞RNA测序, 铁同位素示踪 | NA | 基因表达数据, 代谢数据 | 三种遗传性贫血小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 548 | 2025-10-07 |
Unveiling hypoxia-related prognostic and immunotherapeutic biomarkers in lung adenocarcinoma through single-cell and bulk RNA sequencing: Including insights into PGF
2025-Apr-12, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143056
PMID:40228772
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研究论文 | 本研究通过单细胞和bulk RNA测序揭示肺腺癌中缺氧相关的预后和免疫治疗生物标志物 | 识别了与晚期肺腺癌相关的新细胞亚型，发现了高缺氧评分的细胞亚型模块，构建了基于缺氧相关分子簇的新型预后特征 | 样本量相对较小(15例患者)，机制研究仍需进一步验证 | 探索缺氧微环境与免疫抵抗相互作用的机制 | 肺腺癌患者肿瘤微环境中的细胞亚型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 空间转录组分析 | 预后特征模型 | RNA测序数据, 空间转录组数据 | 15例肺腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 549 | 2025-10-07 |
scAMZI: attention-based deep autoencoder with zero-inflated layer for clustering scRNA-seq data
2025-Apr-07, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11511-2
PMID:40197174
|
研究论文 | 提出一种基于注意力自编码器和零膨胀层的深度学习模型scAMZI，用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 结合SimAM注意力模块、自编码器、ZINB模型和零膨胀层，能够充分挖掘细胞特征并处理数据中的零值问题 | NA | 开发更有效的单细胞RNA测序数据聚类方法 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 注意力自编码器, 深度学习 | 基因表达数据 | 14个基准数据集，包含数百至数万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 550 | 2025-10-07 |
Decoding B Cells in Autoimmune Diseases Through ScRNA + BCR-Seq: Current Knowledge and Future Directions
2025-04-03, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14070539
PMID:40214492
|
综述 | 系统总结单细胞RNA测序与B细胞受体测序技术在自身免疫疾病B细胞研究中的应用与前景 | 首次整合分析B细胞亚群转录组与BCR克隆的动态关联，并聚焦双BCR B细胞和B/T双表型细胞在自身免疫中的特殊作用 | NA | 推动自身免疫疾病多组学研究和精准治疗范式的创新 | 自身免疫疾病中的B细胞及其受体 | 自然语言处理 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞B细胞受体测序 | NA | 单细胞转录组数据, BCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞BCR-seq | NA | NA |
| 551 | 2025-10-07 |
Integrative analysis of genetic variability and functional traits in lung adenocarcinoma epithelial cells via single-cell RNA sequencing, GWAS, bayesian deconvolution, and machine learning
2025-Apr, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-025-01621-2
PMID:39992528
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、全基因组关联研究、贝叶斯反卷积和机器学习技术，研究肺腺癌上皮细胞的遗传变异和功能特征 | 首次将单细胞RNA测序与全基因组关联研究通过贝叶斯反卷积和机器学习方法相结合，系统分析肺腺癌上皮细胞的遗传和功能复杂性 | NA | 揭示肺腺癌的遗传和功能复杂性，探索肿瘤进展机制和免疫-上皮细胞相互作用 | 肺腺癌上皮细胞 | 机器学习 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 贝叶斯反卷积, 机器学习 | 机器学习模型 | 基因表达数据, 遗传变异数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 552 | 2025-04-18 |
Identification of Novel Protein Biomarkers for Intrahepatic Cholangiocarcinoma by Integrating Human Plasma Proteome with Genome
2025-Apr-17, Journal of gastrointestinal cancer
IF:1.6Q4
DOI:10.1007/s12029-025-01226-8
PMID:40240670
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研究论文 | 本研究通过整合人类血浆蛋白质组与基因组数据，识别出与肝内胆管癌(ICC)潜在相关的蛋白质生物标志物 | 首次对ICC进行蛋白质组-MR分析，揭示了其复杂的遗传结构，并鉴定出5种与疾病有潜在因果关联的新型血液蛋白 | 研究主要基于欧洲人群数据，可能在其他人群中的普适性有待验证 | 发现ICC的潜在治疗和诊断靶点 | 肝内胆管癌(ICC)相关蛋白质生物标志物 | 生物信息学 | 肝内胆管癌 | 蛋白质组范围孟德尔随机化(MR)、ELISA、scRNA-seq | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据、蛋白质组数据、RNA-seq数据 | 来自deCODE血浆蛋白质组GWAS和欧洲meta分析的遗传数据，TCGA和GTEx数据库样本 | NA | NA | NA | NA |
| 553 | 2025-10-07 |
Virus-associated inflammation imprints an inflammatory profile on monocyte-derived macrophages in the human liver
2025-Apr-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI175241
PMID:40231469
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了慢性乙型肝炎患者肝脏中单核细胞来源的炎症性巨噬细胞的特征及其在炎症消退后的持续存在 | 首次在人类肝脏中鉴定出具有炎症转录特征的单核细胞来源巨噬细胞，并证明其在炎症消退后仍保留核心转录特征 | 研究样本仅限于慢性乙型肝炎患者，未涵盖其他病因的肝病 | 探究病毒相关炎症对肝脏巨噬细胞组成的重塑作用 | 慢性乙型肝炎患者的肝脏组织和血液单核细胞 | 单细胞生物学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 慢性乙型肝炎患者纵向样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 554 | 2025-10-07 |
How is single-cell RNA sequencing contributing to the advancement of cancer therapeutics?
2025-Apr-15, World journal of gastrointestinal oncology
IF:2.5Q3
DOI:10.4251/wjgo.v17.i4.103480
PMID:40235873
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析胃癌肿瘤微环境中细胞群体的分布和动态变化 | 利用scRNA-seq技术全面揭示胃癌不同阶段肿瘤微环境中的关键细胞相互作用 | NA | 探索单细胞RNA测序在癌症治疗进展中的贡献，特别关注胃癌治疗策略开发 | 胃癌患者的肿瘤微环境细胞群体 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 555 | 2025-10-07 |
Parallel comparison of T cell and B cell subpopulations of adenoid hypertrophy and tonsil hypertrophy of children
2025-Apr-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58094-w
PMID:40229254
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较儿童腺样体肥大和扁桃体肥大的T细胞和B细胞亚群差异 | 首次在单细胞水平上平行比较AH和TH的免疫微环境差异，发现AH具有更多幼稚B细胞和调节性CD4 T细胞，但浆细胞较少 | 样本量相对有限，仅包含12对配对样本 | 探究儿童腺样体肥大和扁桃体肥大的免疫微环境差异 | 1209名1-15岁被诊断为腺样体肥大的儿科患者，其中12对配对AH和TH样本 | 单细胞生物学 | 儿童耳鼻喉疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1209名患者，12对配对AH和TH样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 556 | 2025-10-07 |
Multi-omics analysis identifies diagnostic circulating biomarkers and potential therapeutic targets, revealing IQGAP1 as an oncogene in gastric cancer
2025-Apr-14, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00895-9
PMID:40229327
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研究论文 | 通过多组学整合分析识别胃癌循环生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次通过多组学整合方法识别出IQGAP1等8个胃癌生物标志物，并揭示IQGAP1在胃癌中的致癌作用 | NA | 识别胃癌诊断性循环生物标志物和潜在治疗靶点 | 胃癌患者 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 基因定量性状位点分析, 蛋白定量性状位点分析, 共定位分析, 孟德尔随机化 | NA | 血浆样本, 肿瘤组织样本, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 557 | 2025-10-07 |
IL1RAP is an immunotherapeutic target for normal karyotype triple-mutated acute myeloid leukemia
2025-Apr-14, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-025-00769-z
PMID:40229904
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析鉴定IL1RAP作为正常核型三重突变急性髓系白血病的免疫治疗靶点 | 首次通过多组学方法系统识别IL1RAP作为NKt-AML特异性表面抗原，并证明其可作为抗体-药物偶联物的潜在靶点 | 样本量有限（仅12例NKt-AML样本进行表面蛋白质组分析），需进一步验证 | 寻找NKt-AML特异性表面抗原以开发新型免疫疗法 | 原发性急性髓系白血病样本 | 生物医学 | 急性髓系白血病 | 表面蛋白质组富集、转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 100例原发性AML样本（表面蛋白质组），691例原发性AML样本（转录组），23例原发性AML样本（单细胞RNA测序） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 558 | 2025-10-07 |
Extracellular vesicle-derived miRNA-mediated cell-cell communication inference for single-cell transcriptomic data with miRTalk
2025-Apr-14, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03566-x
PMID:40229908
|
研究论文 | 开发了一种名为miRTalk的新方法，用于从单细胞转录组数据推断细胞外囊泡来源的miRNA介导的细胞间通讯 | 首次提出通过细胞外囊泡来源的miRNA-靶标相互作用推断细胞间通讯的创新方法 | NA | 开发从单细胞RNA测序数据推断细胞间通讯的计算方法 | 细胞外囊泡来源的miRNA及其靶标相互作用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | miRTalk（专门开发的推断算法） | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 559 | 2025-10-07 |
Comprehensive bioinformatics and immunohistochemical analyses identify phosphoinositide metabolism and PNPLA7 as potential biomarkers in urological cancers
2025-Apr-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-97118-9
PMID:40221501
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研究论文 | 通过生物信息学和免疫组化分析发现磷酸肌醇代谢和PNPLA7基因可作为泌尿系统癌症的潜在生物标志物 | 首次系统研究磷酸肌醇代谢在泌尿系统癌症中的作用，并发现PNPLA7作为新型生物标志物 | 基于公共数据库的分析，需要进一步实验验证 | 探讨磷酸肌醇代谢在泌尿系统癌症中的预后价值和治疗指导意义 | 透明细胞肾癌、膀胱癌和前列腺腺癌 | 生物信息学 | 泌尿系统癌症 | 生物信息学分析，单细胞RNA测序，免疫组化 | NA | 基因表达数据，临床样本 | 公共数据库中的泌尿系统癌症数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 560 | 2025-10-07 |
Exploring the tumor microenvironment of breast cancer to develop a prognostic model and predict immunotherapy responses
2025-Apr-12, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-97784-9
PMID:40221624
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研究论文 | 本研究通过分析乳腺癌肿瘤微环境开发预后模型并预测免疫治疗反应 | 识别了12个独立预后基因并构建预后模型，首次揭示内皮细胞比例与患者预后的显著关联 | 基于公共数据库的回顾性分析，缺乏前瞻性临床验证 | 开发乳腺癌预后模型并预测免疫治疗反应 | 乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组测序，单细胞RNA测序 | Cox回归，LASSO回归，共识聚类，WGCNA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 公共数据库中的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq，转录组测序 | NA | NA |