单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 575 篇文献，本页显示第 461 - 480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2025-04-05 |
Landscape of T Cells in Tuberculous Pleural Effusion
2025-Apr, The clinical respiratory journal
DOI:10.1111/crj.70066
PMID:40170555
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序分析结核性胸腔积液（TPE）患者中T淋巴细胞亚群的分布、功能及调控机制 | 首次在单细胞水平上揭示了TPE患者胸腔积液和外周血中T淋巴细胞亚群的分布模式和动态变化 | 样本量较小（仅4例TPE患者），可能影响结果的普遍性 | 探究结核性胸腔积液患者T淋巴细胞亚群的表达模式、调控机制和功能 | 结核性胸腔积液患者的胸腔积液和外周血中的T淋巴细胞 | 免疫学 | 结核病 | scRNA-seq, T-SNE, GSVA, 伪时间分析, ELISA | NA | 单细胞RNA测序数据, 细胞因子数据 | 4例TPE患者的胸腔积液和外周血样本 |
| 462 | 2025-04-05 |
Differentiation stage predicts radiosensitivity in mesenchymal-like pancreatic cancer
2025-Apr-01, International journal of radiation oncology, biology, physics
DOI:10.1016/j.ijrobp.2025.03.034
PMID:40180058
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研究论文 | 通过基因组分类器预测胰腺癌细胞系和患者的放射敏感性，以实现基因组引导的放射治疗 | 利用单细胞RNA测序数据区分上皮和间充质细胞，预测胰腺癌细胞系的分化阶段，并发现分化阶段与放射敏感性相关 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，临床患者数据的验证仍需进一步研究 | 预测胰腺癌的放射敏感性，优化放射治疗方案 | 胰腺癌细胞系和患者 | 基因组学 | 胰腺癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | 基因组分类器 | RNA测序数据 | 45个胰腺癌细胞系和来自The Cancer Genome Atlas的胰腺癌患者数据 |
| 463 | 2025-04-04 |
CAF-derived exosomal LINC01711 promotes breast cancer progression by activating the miR-4510/NELFE axis and enhancing glycolysis
2025-Apr-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202402024RRR
PMID:40172996
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研究论文 | 本研究揭示了CAF来源的外泌体通过传递lncRNA LINC01711激活miR-4510/NELFE轴，从而增强乳腺癌细胞的糖酵解作用 | 发现CAF来源的外泌体中高表达的LINC01711通过miR-4510/NELFE轴调控TXN，促进乳腺癌细胞的糖酵解和恶性行为 | 未提及具体样本量或实验验证的局限性 | 探索乳腺癌进展的分子机制及潜在治疗靶点 | 乳腺癌细胞和癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 肿瘤微环境研究 | 乳腺癌 | 单细胞测序、降维聚类和细胞注释技术 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 464 | 2025-04-04 |
Integration of Flow Cytometry and Single-Cell RNA Sequencing Analysis to Explore the Fibroblast Subpopulations in Keloid that Correlate with Recurrence
2025-Apr-03, Advances in wound care
IF:5.8Q1
DOI:10.1089/wound.2024.0262
PMID:40177712
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研究论文 | 本研究通过整合流式细胞术和单细胞RNA测序分析，探索了与瘢痕疙瘩复发相关的成纤维细胞亚群 | 首次鉴定了影响瘢痕疙瘩复发的关键致病性成纤维细胞亚群FB1，并发现CD26+/CD117+/CD34+表型可作为复发预测标志物 | 研究样本来源为公共数据库，缺乏独立验证队列 | 鉴定参与瘢痕疙瘩复发的关键致病性细胞亚群 | 瘢痕疙瘩组织中的成纤维细胞亚群 | 单细胞组学 | 皮肤纤维化疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术(FCM) | 逻辑回归分析 | 单细胞转录组数据、流式细胞数据 | 公共数据库中的瘢痕疙瘩组织样本（具体数量未说明） |
| 465 | 2025-04-04 |
Morphogenic, molecular, and cellular adaptations for unidirectional airflow in the chicken lung
2025-Apr-03, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204346
PMID:40177910
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研究论文 | 本研究通过多尺度3D成像和单细胞转录组学技术，揭示了鸡肺中单向气流的形态发生、分子和细胞适应机制 | 发现了鸡肺中特有的KRT14表达肺泡细胞类型（命名为腔细胞），并揭示了腔细胞、肺泡2型细胞和肺泡1型细胞在辐射状分布中的顺序排列 | 研究仅聚焦于鸡肺发育过程，未与其他鸟类物种进行比较 | 探索鸟类肺脏单向气流的发育适应机制及其与哺乳动物双向气流的差异 | 鸡肺发育过程中的形态发生、分子特征和细胞类型 | 发育生物学 | NA | 多尺度3D成像、单细胞转录组学、Stereo-seq空间转录组学 | NA | 3D成像数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 鸡肺发育关键阶段样本 |
| 466 | 2025-04-04 |
PKCδ Germline Variants and Genetic Deletion in Mice Augment Antitumor Immunity through Regulation of Myeloid Cells
2025-Apr-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0999
PMID:39808445
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研究论文 | 该研究通过分析种系遗传变异与肿瘤免疫基因特征的关联，发现蛋白激酶C delta（PKCδ）作为候选靶点，并通过小鼠实验验证其在增强抗肿瘤免疫中的作用 | 首次将PKCδ种系变异与抗肿瘤免疫联系起来，并揭示了PKCδ通过调节髓系细胞状态影响肿瘤免疫微环境的机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本验证仍需扩大样本量 | 探索新的癌症免疫治疗靶点 | PKCδ基因及其在小鼠和人类中的功能 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 小鼠模型和临床样本（具体数量未明确说明） |
| 467 | 2025-04-04 |
Anti-Peptidylarginine-4 Autoantibodies Derived from Patients with Rheumatoid Arthritis Exert Pathogenic Effects by Activating Monocytes and Exacerbating Inflammatory Arthritis
2025-Apr-02, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43168
PMID:40176290
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research paper | 该研究探讨了类风湿性关节炎(RA)患者中抗PAD4自身抗体通过激活单核细胞和加剧炎症性关节炎的致病机制 | 揭示了抗PAD4抗体通过与单核细胞结合触发炎症级联反应的新机制，促进免疫细胞向关节募集和T细胞激活，最终导致更严重的关节炎 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体内完全验证这些机制 | 阐明抗PAD4抗体在类风湿性关节炎发病机制中的作用 | 类风湿性关节炎患者和小鼠模型 | 免疫学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序、体外细胞培养 | 胶原诱导性关节炎(CIA)小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞培养数据 | 使用RA患者来源的单克隆抗体和小鼠模型进行研究 |
| 468 | 2025-04-04 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals the Effect of MIF on Myeloid-Derived Suppressor Cells in Multiple Myeloma
2025-Apr-02, International journal of laboratory hematology
IF:2.2Q3
DOI:10.1111/ijlh.14473
PMID:40176414
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research paper | 该研究通过单细胞转录组分析探讨了MIF在多发性骨髓瘤中对髓系来源抑制细胞（MDSCs）的影响 | 首次揭示了MIF在MDSCs中的表达差异及其与多发性骨髓瘤的关联 | 研究样本量有限，且仅基于GSE124310数据集进行分析 | 探索骨髓微环境中MIF与MDSCs之间的关系 | 多发性骨髓瘤患者和正常对照的骨髓样本 | digital pathology | multiple myeloma | scRNA-seq, flow cytometry | NA | RNA-seq数据 | GSE124310数据集中的MM和正常样本 |
| 469 | 2025-04-04 |
Different inflammatory, fibrotic, and immunological signatures between pre-fibrotic and overt primary myelofibrosis
2025-Apr-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2024.285598
PMID:39385733
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析了前纤维化和明显原发性骨髓纤维化（PMF）的炎症、纤维化和免疫学特征差异 | 首次在前纤维化和明显PMF之间识别出14种细胞类型及其亚群的差异，特别是造血干细胞和祖细胞（HSPC）与巨核细胞的炎症/纤维化特征变化 | 未发现PMF进展过程中的决定性亚群 | 探究PMF进展过程中不同造血细胞的功能变化及其在疾病发展中的作用 | 前纤维化PMF、明显PMF及其他骨髓增殖性肿瘤（MPN）患者的骨髓抽吸物 | 数字病理学 | 骨髓纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 前纤维化PMF、明显PMF及其他MPN患者的骨髓样本 |
| 470 | 2024-12-30 |
Correction to: Unveiling the dynamics of B lymphocytes in systemic lupus erythematosus patients treated with belimumab through longitudinal single-cell RNA sequencing
2025-Apr-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keae694
PMID:39731783
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 471 | 2025-01-20 |
Unlocking the potential of spatial transcriptomics with custom microfluidic chips
2025-Apr, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2771-9
PMID:39826037
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 472 | 2025-04-04 |
Multi-Omic Insight Into the Molecular Networks in the Pathogenesis of Coronary Artery Disease
2025-Apr, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.037203
PMID:40135555
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研究论文 | 通过整合多组学数据，研究冠状动脉疾病（CAD）的分子网络及其发病机制 | 采用基于摘要数据的孟德尔随机化和共定位分析整合基因甲基化、表达和蛋白质水平的多组学数据，揭示了TAGLN2、APOB、GIP等基因与CAD风险的关联 | 研究中未提及样本的具体数量，且可能未完全覆盖所有潜在的因果基因 | 探索冠状动脉疾病（CAD）的分子机制及潜在因果基因 | 冠状动脉疾病（CAD）患者及其相关基因 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 多组学数据分析、孟德尔随机化、共定位分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因甲基化、表达和蛋白质水平数据 | NA |
| 473 | 2025-04-04 |
Machine Learning Unveils Sphingolipid Metabolism's Role in Tumour Microenvironment and Immunotherapy in Lung Cancer
2025-Apr, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70435
PMID:40159631
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法揭示了鞘脂代谢在肺癌肿瘤微环境（TME）和免疫治疗中的作用 | 首次结合机器学习算法（Lasso回归和生存SVM）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，系统分析了鞘脂代谢相关基因在肺癌TME中的表达及其与免疫细胞浸润的关系 | 研究主要基于TCGA和GTEx数据库的临床样本，缺乏外部验证队列 | 探究鞘脂代谢在肺癌肿瘤微环境形成和免疫治疗响应中的作用机制 | 肺癌（LUAD和LUSC）患者的肿瘤微环境 | 机器学习 | 肺癌 | 转录组分析、scRNA-seq、Lasso回归、生存SVM | Lasso回归、SVM | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA和GTEx数据库中的临床样本 |
| 474 | 2025-04-04 |
Transitional CXCL14+ cancer-associated fibroblasts enhance tumour metastasis and confer resistance to EGFR-TKIs, revealing therapeutic vulnerability to filgotinib in lung adenocarcinoma
2025-Apr, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70281
PMID:40162549
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，识别出一种独特的CXCL14+肌纤维母细胞样癌症相关成纤维细胞（myCAFs）亚群，该亚群在肺腺癌（LUAD）中促进肿瘤转移并导致对EGFR-TKIs的耐药性，同时发现Filgotinib可逆转这种耐药性 | 首次识别出CXCL14+ myCAFs亚群在LUAD中的关键作用，并发现Filgotinib作为逆转EGFR-TKIs耐药性的潜在治疗药物 | 研究主要基于单细胞和空间转录组学数据，临床样本验证仍需进一步扩大 | 探究癌症相关成纤维细胞（CAFs）异质性在肺腺癌（LUAD）肿瘤进展和治疗耐药性中的作用 | 肺腺癌（LUAD）患者和肿瘤微环境中的CXCL14+ myCAFs亚群 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq, 空间转录组学, ELISA, 免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 临床样本数据 | 多个独立LUAD队列的临床组织样本和患者血浆样本 |
| 475 | 2025-04-04 |
Dynamic Alterations in DNA Methylation of CD4+ T Cells and Macrophages in a Murine Model of Tuberculous Pleural Infection Induced by BCG Vaccination
2025-Apr, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70166
PMID:40170749
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研究论文 | 本研究分析了BCG诱导的小鼠结核性胸膜炎模型中CD4+ T细胞和巨噬细胞的DNA甲基化和转录组数据，揭示了免疫细胞在结核性胸膜感染过程中的动态变化和调控特性 | 首次揭示了结核性胸膜感染过程中免疫细胞DNA甲基化的动态变化及其对Th1、Th17和Th22细胞分化的调控作用，并发现C1q在感染过程中的表达增加及其调控机制 | 研究仅基于小鼠模型，结果是否适用于人类结核性胸膜感染尚需进一步验证 | 探究结核性胸膜感染过程中免疫细胞的DNA甲基化动态变化及其调控机制 | BCG诱导的结核性胸膜炎小鼠模型中的CD4+ T细胞和巨噬细胞 | 免疫学 | 结核病 | DNA甲基化分析、转录组测序、单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | DNA甲基化数据、转录组数据 | BCG诱导的结核性胸膜炎小鼠模型在特定时间点（第0、1、7和14天）的胸膜灌洗液样本 |
| 476 | 2025-04-03 |
Glycolysis-Derived Lactate Induces ACSL4 Expression and Lactylation to Activate Ferroptosis during Intervertebral Disc Degeneration
2025-Apr-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202416149
PMID:40171826
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研究论文 | 本研究揭示了糖酵解衍生的乳酸通过促进ACSL4表达和乳酰化激活铁死亡在椎间盘退变中的作用机制 | 首次阐明乳酸通过组蛋白H3K18乳酰化促进ACSL4转录，并通过K412位点乳酰化激活铁死亡的新机制 | 研究主要基于细胞和动物实验，临床转化应用仍需进一步验证 | 探究椎间盘退变过程中髓核细胞的代谢变化及乳酸的作用机制 | 髓核细胞(NPCs) | 细胞生物学 | 椎间盘退变(IVDD) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，腺相关病毒9(AAV9)基因沉默 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 477 | 2025-04-03 |
Calpain-2-Mediated Endothelial Focal Adhesion Disruption in Thoracic Aortic Dissection
2025-Apr-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202501112
PMID:40171827
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研究论文 | 本文探讨了钙蛋白酶-2在内皮细胞粘附破坏中的作用及其与胸主动脉夹层（TAD）的关系 | 首次揭示了钙蛋白酶-2通过调节内皮粘附蛋白在TAD早期病理过程中的关键作用，并提出了潜在的治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需进一步研究 | 阐明胸主动脉夹层早期发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 胸主动脉夹层患者样本和小鼠模型 | 心血管疾病研究 | 胸主动脉夹层 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 患者单细胞RNA测序数据及小鼠模型 |
| 478 | 2025-04-03 |
Comprehensive Multi-omics and Mendelian Randomization Reveal the Key Role of Monocytes in Aging and Osteoarthritis
2025-Apr-02, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01416-6
PMID:40172742
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研究论文 | 本研究通过多组学和孟德尔随机化方法，探讨了骨关节炎（OA）与衰老之间的潜在联系和分子机制 | 整合单细胞RNA测序、批量RNA测序数据、孟德尔随机化、共定位分析和细胞功能分析，揭示了单核细胞在OA和衰老中的关键作用，并鉴定了与OA有因果关系的四个关键标记基因 | 研究结果需要在更大规模的独立队列中进行验证 | 探索OA与衰老之间的潜在联系和分子机制 | OA患者、衰老患者和对照组的单核细胞 | 生物信息学 | 骨关节炎 | scRNA-seq, bulk RNA-seq, 孟德尔随机化, 共定位分析 | NA | RNA测序数据 | OA、衰老和对照组的scRNA-seq数据 |
| 479 | 2025-04-03 |
Stem Cell Markers LGR5, LGR4 and Their Immediate Signalling Partners are Dysregulated in Preeclampsia
2025-Apr, Stem cell reviews and reports
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s12015-024-10831-2
PMID:39688759
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研究论文 | 本研究首次描述了LGR5/LGR4及其信号伴侣在人类胎盘中的表达，并探讨了它们在先兆子痫和胎儿生长受限中的失调 | 首次在人类胎盘中表征LGR5/LGR4及其配体/靶点，并揭示其与先兆子痫和胎儿生长受限的关联 | 缺氧/促炎细胞因子处理未显著改变LGR5/LGR4表达，可能限制了对其在胎盘功能不全发病机制中作用的深入理解 | 探究LGR5/LGR4及其信号伴侣在胎盘中的表达及其在先兆子痫和胎儿生长受限中的作用 | 人类胎盘组织、滋养层干细胞(hTSCs)及单细胞转录组数据 | 分子生物学 | 先兆子痫、胎儿生长受限(FGR) | 原位杂交、单细胞转录组测序、RNA测序 | NA | mRNA表达数据、单细胞转录组数据 | 胎盘样本：早期先兆子痫(n=81)、晚期先兆子痫(n=20)、FGR(n=34)及对照组(n=19-33) |
| 480 | 2025-04-03 |
Genome-Scale Metabolic Modeling of Human Pancreas with Focus on Type 2 Diabetes
2025-Apr, Omics : a journal of integrative biology
IF:2.2Q3
DOI:10.1089/omi.2024.0211
PMID:40068171
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和通用Human1模型，生成了非糖尿病和2型糖尿病状态下胰腺α、β、δ和PP细胞的基因组尺度代谢模型，并在单细胞分辨率下进行了代谢活动分析 | 首次在单细胞分辨率下构建了胰腺细胞的基因组尺度代谢模型，并研究了2型糖尿病状态下的代谢变化 | 研究主要基于计算模型，需要进一步的实验验证 | 深入理解2型糖尿病的病理生理学并发现新的分子靶点 | 人类胰腺α、β、δ和PP细胞 | 计算生物学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序、基因组尺度代谢建模、通量平衡分析 | Human1模型 | RNA测序数据 | NA |