单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 558 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2025-04-05 |
BRD4 as the key lactylation related gene in heart failure identified through bioinformatics analysis
2025-Apr-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-91506-x
PMID:40169651
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研究论文 | 通过生物信息学分析识别出BRD4作为心力衰竭中与乳酸化修饰相关的关键基因 | 首次利用多种生物信息学分析方法确定BRD4是心力衰竭中关键的乳酸化相关基因，为研究心力衰竭中酰化相关机制奠定了基础 | 研究机制尚未完全阐明，需要进一步的实验验证 | 识别与心力衰竭进展相关的乳酸化修饰基因并探究其生物学意义 | 心力衰竭数据集(GSE5406)和单细胞测序数据集(GSE161470) | 生物信息学 | 心血管疾病 | 生物信息学分析、LASSO、WGCNA、ROC曲线分析、基因集富集分析、免疫细胞浸润分析、单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 442 | 2025-04-05 |
Integrating single-cell RNA sequencing, WGCNA, and machine learning to identify key biomarkers in hepatocellular carcinoma
2025-Apr-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-95493-x
PMID:40169794
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、WGCNA和机器学习技术，识别肝细胞癌的关键生物标志物 | 结合单细胞RNA测序、WGCNA和多种机器学习算法，识别出肝细胞癌的潜在生物标志物，并利用分子对接技术验证药物与核心蛋白的结合能力 | 研究依赖于公共数据库的数据，未进行实验验证 | 识别肝细胞癌的诊断和治疗生物标志物 | 肝细胞癌（HCC）患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、WGCNA、分子对接 | 机器学习算法（未具体说明）、逻辑回归 | 基因表达数据 | 从GEO数据库下载的微阵列和单细胞RNA测序数据集 |
| 443 | 2025-04-05 |
STopover captures spatial colocalization and interaction in the tumor microenvironment using topological analysis in spatial transcriptomics data
2025-Apr-01, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01457-1
PMID:40170080
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research paper | 介绍了一种名为STopover的新方法，利用空间分辨转录组学数据和拓扑分析来研究肿瘤微环境的空间配置 | 通过逐步降低特征阈值提取连通组件，利用Jaccard指数量化空间重叠，并通过转录组谱置换评估统计显著性 | NA | 阐明肿瘤微环境的空间配置以揭示肿瘤-免疫相互作用 | 肺和乳腺癌的空间分辨转录组学数据 | digital pathology | lung cancer, breast cancer | spatially resolved transcriptomics (SRT), topological analysis | NA | spatial transcriptomics data | NA |
| 444 | 2025-04-05 |
Landscape of T Cells in Tuberculous Pleural Effusion
2025-Apr, The clinical respiratory journal
DOI:10.1111/crj.70066
PMID:40170555
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research paper | 本研究通过单细胞RNA测序分析结核性胸腔积液（TPE）患者中T淋巴细胞亚群的分布、功能及调控机制 | 首次在单细胞水平上揭示了TPE患者胸腔积液和外周血中T淋巴细胞亚群的分布模式和动态变化 | 样本量较小（仅4例TPE患者），可能影响结果的普遍性 | 探究结核性胸腔积液患者T淋巴细胞亚群的表达模式、调控机制和功能 | 结核性胸腔积液患者的胸腔积液和外周血中的T淋巴细胞 | 免疫学 | 结核病 | scRNA-seq, T-SNE, GSVA, 伪时间分析, ELISA | NA | 单细胞RNA测序数据, 细胞因子数据 | 4例TPE患者的胸腔积液和外周血样本 |
| 445 | 2025-04-05 |
Differentiation stage predicts radiosensitivity in mesenchymal-like pancreatic cancer
2025-Apr-01, International journal of radiation oncology, biology, physics
DOI:10.1016/j.ijrobp.2025.03.034
PMID:40180058
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研究论文 | 通过基因组分类器预测胰腺癌细胞系和患者的放射敏感性，以实现基因组引导的放射治疗 | 利用单细胞RNA测序数据区分上皮和间充质细胞，预测胰腺癌细胞系的分化阶段，并发现分化阶段与放射敏感性相关 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，临床患者数据的验证仍需进一步研究 | 预测胰腺癌的放射敏感性，优化放射治疗方案 | 胰腺癌细胞系和患者 | 基因组学 | 胰腺癌 | scRNA-seq, bulk RNA-seq | 基因组分类器 | RNA测序数据 | 45个胰腺癌细胞系和来自The Cancer Genome Atlas的胰腺癌患者数据 |
| 446 | 2025-04-04 |
CAF-derived exosomal LINC01711 promotes breast cancer progression by activating the miR-4510/NELFE axis and enhancing glycolysis
2025-Apr-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202402024RRR
PMID:40172996
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研究论文 | 本研究揭示了CAF来源的外泌体通过传递lncRNA LINC01711激活miR-4510/NELFE轴，从而增强乳腺癌细胞的糖酵解作用 | 发现CAF来源的外泌体中高表达的LINC01711通过miR-4510/NELFE轴调控TXN，促进乳腺癌细胞的糖酵解和恶性行为 | 未提及具体样本量或实验验证的局限性 | 探索乳腺癌进展的分子机制及潜在治疗靶点 | 乳腺癌细胞和癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 肿瘤微环境研究 | 乳腺癌 | 单细胞测序、降维聚类和细胞注释技术 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 447 | 2025-04-04 |
Integration of Flow Cytometry and Single-Cell RNA Sequencing Analysis to Explore the Fibroblast Subpopulations in Keloid that Correlate with Recurrence
2025-Apr-03, Advances in wound care
IF:5.8Q1
DOI:10.1089/wound.2024.0262
PMID:40177712
|
研究论文 | 本研究通过整合流式细胞术和单细胞RNA测序分析，探索了与瘢痕疙瘩复发相关的成纤维细胞亚群 | 首次鉴定了影响瘢痕疙瘩复发的关键致病性成纤维细胞亚群FB1，并发现CD26+/CD117+/CD34+表型可作为复发预测标志物 | 研究样本来源为公共数据库，缺乏独立验证队列 | 鉴定参与瘢痕疙瘩复发的关键致病性细胞亚群 | 瘢痕疙瘩组织中的成纤维细胞亚群 | 单细胞组学 | 皮肤纤维化疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术(FCM) | 逻辑回归分析 | 单细胞转录组数据、流式细胞数据 | 公共数据库中的瘢痕疙瘩组织样本（具体数量未说明） |
| 448 | 2025-04-04 |
Morphogenic, molecular, and cellular adaptations for unidirectional airflow in the chicken lung
2025-Apr-03, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204346
PMID:40177910
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研究论文 | 本研究通过多尺度3D成像和单细胞转录组学技术，揭示了鸡肺中单向气流的形态发生、分子和细胞适应机制 | 发现了鸡肺中特有的KRT14表达肺泡细胞类型（命名为腔细胞），并揭示了腔细胞、肺泡2型细胞和肺泡1型细胞在辐射状分布中的顺序排列 | 研究仅聚焦于鸡肺发育过程，未与其他鸟类物种进行比较 | 探索鸟类肺脏单向气流的发育适应机制及其与哺乳动物双向气流的差异 | 鸡肺发育过程中的形态发生、分子特征和细胞类型 | 发育生物学 | NA | 多尺度3D成像、单细胞转录组学、Stereo-seq空间转录组学 | NA | 3D成像数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 鸡肺发育关键阶段样本 |
| 449 | 2025-04-04 |
PKCδ Germline Variants and Genetic Deletion in Mice Augment Antitumor Immunity through Regulation of Myeloid Cells
2025-Apr-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-23-0999
PMID:39808445
|
研究论文 | 该研究通过分析种系遗传变异与肿瘤免疫基因特征的关联，发现蛋白激酶C delta（PKCδ）作为候选靶点，并通过小鼠实验验证其在增强抗肿瘤免疫中的作用 | 首次将PKCδ种系变异与抗肿瘤免疫联系起来，并揭示了PKCδ通过调节髓系细胞状态影响肿瘤免疫微环境的机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床样本验证仍需扩大样本量 | 探索新的癌症免疫治疗靶点 | PKCδ基因及其在小鼠和人类中的功能 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 小鼠模型和临床样本（具体数量未明确说明） |
| 450 | 2025-04-04 |
Anti-Peptidylarginine-4 Autoantibodies Derived from Patients with Rheumatoid Arthritis Exert Pathogenic Effects by Activating Monocytes and Exacerbating Inflammatory Arthritis
2025-Apr-02, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43168
PMID:40176290
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research paper | 该研究探讨了类风湿性关节炎(RA)患者中抗PAD4自身抗体通过激活单核细胞和加剧炎症性关节炎的致病机制 | 揭示了抗PAD4抗体通过与单核细胞结合触发炎症级联反应的新机制，促进免疫细胞向关节募集和T细胞激活，最终导致更严重的关节炎 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体内完全验证这些机制 | 阐明抗PAD4抗体在类风湿性关节炎发病机制中的作用 | 类风湿性关节炎患者和小鼠模型 | 免疫学 | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序、体外细胞培养 | 胶原诱导性关节炎(CIA)小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞培养数据 | 使用RA患者来源的单克隆抗体和小鼠模型进行研究 |
| 451 | 2025-04-04 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals the Effect of MIF on Myeloid-Derived Suppressor Cells in Multiple Myeloma
2025-Apr-02, International journal of laboratory hematology
IF:2.2Q3
DOI:10.1111/ijlh.14473
PMID:40176414
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research paper | 该研究通过单细胞转录组分析探讨了MIF在多发性骨髓瘤中对髓系来源抑制细胞（MDSCs）的影响 | 首次揭示了MIF在MDSCs中的表达差异及其与多发性骨髓瘤的关联 | 研究样本量有限，且仅基于GSE124310数据集进行分析 | 探索骨髓微环境中MIF与MDSCs之间的关系 | 多发性骨髓瘤患者和正常对照的骨髓样本 | digital pathology | multiple myeloma | scRNA-seq, flow cytometry | NA | RNA-seq数据 | GSE124310数据集中的MM和正常样本 |
| 452 | 2025-04-04 |
Different inflammatory, fibrotic, and immunological signatures between pre-fibrotic and overt primary myelofibrosis
2025-Apr-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2024.285598
PMID:39385733
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析了前纤维化和明显原发性骨髓纤维化（PMF）的炎症、纤维化和免疫学特征差异 | 首次在前纤维化和明显PMF之间识别出14种细胞类型及其亚群的差异，特别是造血干细胞和祖细胞（HSPC）与巨核细胞的炎症/纤维化特征变化 | 未发现PMF进展过程中的决定性亚群 | 探究PMF进展过程中不同造血细胞的功能变化及其在疾病发展中的作用 | 前纤维化PMF、明显PMF及其他骨髓增殖性肿瘤（MPN）患者的骨髓抽吸物 | 数字病理学 | 骨髓纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 前纤维化PMF、明显PMF及其他MPN患者的骨髓样本 |
| 453 | 2024-12-30 |
Correction to: Unveiling the dynamics of B lymphocytes in systemic lupus erythematosus patients treated with belimumab through longitudinal single-cell RNA sequencing
2025-Apr-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keae694
PMID:39731783
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 454 | 2025-01-20 |
Unlocking the potential of spatial transcriptomics with custom microfluidic chips
2025-Apr, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2771-9
PMID:39826037
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 455 | 2025-04-04 |
Multi-Omic Insight Into the Molecular Networks in the Pathogenesis of Coronary Artery Disease
2025-Apr, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.037203
PMID:40135555
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研究论文 | 通过整合多组学数据，研究冠状动脉疾病（CAD）的分子网络及其发病机制 | 采用基于摘要数据的孟德尔随机化和共定位分析整合基因甲基化、表达和蛋白质水平的多组学数据，揭示了TAGLN2、APOB、GIP等基因与CAD风险的关联 | 研究中未提及样本的具体数量，且可能未完全覆盖所有潜在的因果基因 | 探索冠状动脉疾病（CAD）的分子机制及潜在因果基因 | 冠状动脉疾病（CAD）患者及其相关基因 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 多组学数据分析、孟德尔随机化、共定位分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因甲基化、表达和蛋白质水平数据 | NA |
| 456 | 2025-04-04 |
Machine Learning Unveils Sphingolipid Metabolism's Role in Tumour Microenvironment and Immunotherapy in Lung Cancer
2025-Apr, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70435
PMID:40159631
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研究论文 | 本研究通过机器学习方法揭示了鞘脂代谢在肺癌肿瘤微环境（TME）和免疫治疗中的作用 | 首次结合机器学习算法（Lasso回归和生存SVM）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，系统分析了鞘脂代谢相关基因在肺癌TME中的表达及其与免疫细胞浸润的关系 | 研究主要基于TCGA和GTEx数据库的临床样本，缺乏外部验证队列 | 探究鞘脂代谢在肺癌肿瘤微环境形成和免疫治疗响应中的作用机制 | 肺癌（LUAD和LUSC）患者的肿瘤微环境 | 机器学习 | 肺癌 | 转录组分析、scRNA-seq、Lasso回归、生存SVM | Lasso回归、SVM | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA和GTEx数据库中的临床样本 |
| 457 | 2025-04-04 |
Transitional CXCL14+ cancer-associated fibroblasts enhance tumour metastasis and confer resistance to EGFR-TKIs, revealing therapeutic vulnerability to filgotinib in lung adenocarcinoma
2025-Apr, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70281
PMID:40162549
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，识别出一种独特的CXCL14+肌纤维母细胞样癌症相关成纤维细胞（myCAFs）亚群，该亚群在肺腺癌（LUAD）中促进肿瘤转移并导致对EGFR-TKIs的耐药性，同时发现Filgotinib可逆转这种耐药性 | 首次识别出CXCL14+ myCAFs亚群在LUAD中的关键作用，并发现Filgotinib作为逆转EGFR-TKIs耐药性的潜在治疗药物 | 研究主要基于单细胞和空间转录组学数据，临床样本验证仍需进一步扩大 | 探究癌症相关成纤维细胞（CAFs）异质性在肺腺癌（LUAD）肿瘤进展和治疗耐药性中的作用 | 肺腺癌（LUAD）患者和肿瘤微环境中的CXCL14+ myCAFs亚群 | 数字病理学 | 肺癌 | scRNA-seq, 空间转录组学, ELISA, 免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 临床样本数据 | 多个独立LUAD队列的临床组织样本和患者血浆样本 |
| 458 | 2025-04-04 |
Dynamic Alterations in DNA Methylation of CD4+ T Cells and Macrophages in a Murine Model of Tuberculous Pleural Infection Induced by BCG Vaccination
2025-Apr, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70166
PMID:40170749
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研究论文 | 本研究分析了BCG诱导的小鼠结核性胸膜炎模型中CD4+ T细胞和巨噬细胞的DNA甲基化和转录组数据，揭示了免疫细胞在结核性胸膜感染过程中的动态变化和调控特性 | 首次揭示了结核性胸膜感染过程中免疫细胞DNA甲基化的动态变化及其对Th1、Th17和Th22细胞分化的调控作用，并发现C1q在感染过程中的表达增加及其调控机制 | 研究仅基于小鼠模型，结果是否适用于人类结核性胸膜感染尚需进一步验证 | 探究结核性胸膜感染过程中免疫细胞的DNA甲基化动态变化及其调控机制 | BCG诱导的结核性胸膜炎小鼠模型中的CD4+ T细胞和巨噬细胞 | 免疫学 | 结核病 | DNA甲基化分析、转录组测序、单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | DNA甲基化数据、转录组数据 | BCG诱导的结核性胸膜炎小鼠模型在特定时间点（第0、1、7和14天）的胸膜灌洗液样本 |
| 459 | 2025-04-03 |
Glycolysis-Derived Lactate Induces ACSL4 Expression and Lactylation to Activate Ferroptosis during Intervertebral Disc Degeneration
2025-Apr-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202416149
PMID:40171826
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研究论文 | 本研究揭示了糖酵解衍生的乳酸通过促进ACSL4表达和乳酰化激活铁死亡在椎间盘退变中的作用机制 | 首次阐明乳酸通过组蛋白H3K18乳酰化促进ACSL4转录，并通过K412位点乳酰化激活铁死亡的新机制 | 研究主要基于细胞和动物实验，临床转化应用仍需进一步验证 | 探究椎间盘退变过程中髓核细胞的代谢变化及乳酸的作用机制 | 髓核细胞(NPCs) | 细胞生物学 | 椎间盘退变(IVDD) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，腺相关病毒9(AAV9)基因沉默 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 460 | 2025-04-03 |
Calpain-2-Mediated Endothelial Focal Adhesion Disruption in Thoracic Aortic Dissection
2025-Apr-02, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202501112
PMID:40171827
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研究论文 | 本文探讨了钙蛋白酶-2在内皮细胞粘附破坏中的作用及其与胸主动脉夹层（TAD）的关系 | 首次揭示了钙蛋白酶-2通过调节内皮粘附蛋白在TAD早期病理过程中的关键作用，并提出了潜在的治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需进一步研究 | 阐明胸主动脉夹层早期发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 胸主动脉夹层患者样本和小鼠模型 | 心血管疾病研究 | 胸主动脉夹层 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 患者单细胞RNA测序数据及小鼠模型 |