单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 716 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2025-10-07 |
Identifying PSIP1 as a critical R-loop regulator in osteosarcoma via machine-learning and multi-omics analysis
2025-Apr-22, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03775-1
PMID:40264164
|
研究论文 | 本研究通过机器学习和多组学分析识别PSIP1作为骨肉瘤中关键的R-loop调控因子 | 首次构建R-loop基因预后评分模型(RGPSM)，并通过单细胞RNA测序结合实验验证PSIP1在骨肉瘤进展中的关键作用 | NA | 探索R-loop在骨肉瘤发生发展中的作用机制 | 骨肉瘤患者样本和细胞系 | 机器学习 | 骨肉瘤 | RNA测序,单细胞RNA测序,机器学习 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 多个骨肉瘤队列数据集 | NA | RNA-seq,scRNA-seq | NA | NA |
| 442 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals the mechanism of Realgar improvement on erythropoiesis in mice with myelodysplastic syndrome
2025-Apr-08, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03768-0
PMID:40200265
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示雄黄改善骨髓增生异常综合征小鼠红细胞生成的机制 | 首次在单细胞水平研究雄黄及其活性成分AsS对小鼠成红细胞的影响，揭示其调控红细胞分化的转录组机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探究雄黄改善骨髓增生异常综合征贫血症状的作用机制 | 小鼠成红细胞和骨髓细胞 | 单细胞测序 | 骨髓增生异常综合征 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 443 | 2025-10-07 |
Amino Acid Metabolism Subtypes in Neuroblastoma Identifying Distinct Prognosis and Therapeutic Vulnerabilities
2025-Apr-04, Journal of proteome research
IF:3.8Q1
DOI:10.1021/acs.jproteome.4c00554
PMID:39442086
|
研究论文 | 基于氨基酸代谢相关基因鉴定神经母细胞瘤的三种预后和治疗敏感性不同的亚型 | 首次在神经母细胞瘤中基于氨基酸代谢相关基因建立预后分型系统，并发现不同亚型对免疫治疗和化疗的敏感性差异 | NA | 探究氨基酸代谢与神经母细胞瘤预后的关联并建立分型系统 | 神经母细胞瘤患者 | 生物信息学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，基因表达分析 | NA | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 444 | 2025-10-07 |
FABP5+ lipid-loaded macrophages process tumour-derived unsaturated fatty acid signal to suppress T-cell antitumour immunity
2025-Apr, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.09.029
PMID:39357545
|
研究论文 | 本研究揭示了FABP5+脂质负载巨噬细胞通过处理肿瘤来源的不饱和脂肪酸信号抑制T细胞抗肿瘤免疫的机制 | 首次发现肿瘤细胞释放的长链不饱和脂肪酸通过FABP5-PPARγ信号通路激活巨噬细胞的免疫抑制功能 | 研究主要聚焦于肝细胞癌，该机制在其他肿瘤类型中的普适性需要进一步验证 | 探究脂质代谢如何增强肿瘤相关巨噬细胞的促肿瘤作用 | 小鼠和人类肝细胞癌肿瘤样本中的肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠和人类HCC肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 445 | 2025-10-07 |
Different inflammatory, fibrotic, and immunological signatures between pre-fibrotic and overt primary myelofibrosis
2025-Apr-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2024.285598
PMID:39385733
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析原发性骨髓纤维化不同阶段的骨髓细胞特征 | 首次在单细胞水平揭示前纤维化期和显性期原发性骨髓纤维化的炎症、纤维化和免疫特征差异 | 未发现PMF进展过程中的决定性细胞亚群 | 探究原发性骨髓纤维化进展过程中的细胞分子机制 | 骨髓穿刺样本中的造血细胞 | 单细胞组学 | 骨髓增殖性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 前纤维化PMF、显性PMF及其他MPN患者的骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 446 | 2025-10-07 |
Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveals the Regional Division of the Spatial Structure of MASH Fibrosis
2025-Apr, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.16125
PMID:39400982
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术揭示了MASH纤维化在肝脏中的区域分布特征及其分子机制 | 首次在MASH纤维化中表征了谱系特异性基因表达变化、亚群组成和伪时序分析，并识别了6个与纤维化相关的关键基因 | 样本量相对有限，需要更大规模的研究验证发现 | 阐明MASH纤维化在肝脏中的区域分布并识别潜在治疗靶点 | 健康对照、单纯性脂肪变性患者和MASH患者的肝脏组织 | 数字病理学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 伪时序分析 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 未明确具体样本数量，包含健康对照、单纯性脂肪变性和MASH患者肝脏切片 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 447 | 2025-10-07 |
Schwann Cell-Mediated M2-Like Macrophage Polarization in Rhabdomyosarcoma
2025-Apr, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.15214
PMID:39639424
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析头颈部横纹肌肉瘤微环境的细胞组成和免疫特征 | 首次发现施万细胞通过MIF-CD74和PTN-SDC3受体-配体对促进M2样巨噬细胞极化，并揭示其在轴突导向通路中的富集 | 样本量有限，主要聚焦头颈部横纹肌肉瘤，需要更多验证实验确认机制 | 研究横纹肌肉瘤微环境的细胞组成和免疫特征 | 头颈部横纹肌肉瘤样本 | 单细胞转录组学 | 横纹肌肉瘤 | 单细胞转录组测序，流式细胞术，免疫组织化学，bulk RNA测序 | CellChat，CIBERSORT，单样本基因集富集分析 | 单细胞转录组数据，基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 448 | 2025-10-07 |
Ozone-induced lung injury and inflammation: Pathways and therapeutic targets for pulmonary diseases caused by air pollutants
2025-Apr, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2025.109391
PMID:40121788
|
综述 | 探讨臭氧诱导肺损伤和炎症的分子通路及其作为空气污染物相关肺部疾病治疗靶点的潜力 | 通过单细胞转录组数据定位臭氧损伤感应与信号通路基因，识别臭氧反应热点区域 | NA | 阐明臭氧诱导肺损伤的病理机制并探索潜在治疗靶点 | 臭氧暴露导致的呼吸道上皮细胞损伤和炎症反应 | 数字病理学 | 肺损伤/肺部疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 449 | 2025-10-07 |
Identifying reproducible transcription regulator coexpression patterns with single cell transcriptomics
2025-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012962
PMID:40257984
|
研究论文 | 利用大规模单细胞转录组数据识别跨细胞类型可重复的转录调控因子共表达模式 | 整合了120个人类和103个小鼠单细胞RNA-seq数据集，构建跨物种可重复的转录调控因子共表达网络 | 未深入探讨特定生物学背景下的信号保存 | 识别跨生物背景可重复的转录调控因子共表达模式 | 人类和小鼠的转录调控因子及其共表达基因伙伴 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 共表达网络分析 | 单细胞转录组数据 | 超过2800万个细胞，来自223个数据集（120个人类，103个小鼠） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 450 | 2025-04-25 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis of Maize Embryo Development: a Sample Preparation Protocol
2025-Apr-23, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot108645
PMID:40268304
|
研究论文 | 本文描述了一种用于玉米胚胎发育研究的单细胞和空间转录组分析的样本制备协议 | 首次将单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组分析技术应用于玉米胚胎发育研究 | 仅提供了样本制备协议，未展示实际应用结果 | 研究玉米胚胎发育的细胞水平机制 | 玉米胚胎 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, 空间转录组分析 | NA | 转录组数据 | 未明确说明样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 451 | 2025-04-25 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis of Maize Embryo Development
2025-Apr-23, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.top108468
PMID:40268305
|
review | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学在玉米胚胎发育研究中的联合应用及其协同效果 | 结合单细胞RNA测序和空间转录组学两种技术研究玉米胚胎发育，提供了高分辨率的基因表达模式和调控网络分析 | 单细胞技术难以识别特定细胞簇，而空间转录组学通常无法达到单细胞分辨率且检测到的转录本较少 | 研究玉米胚胎发育的基因表达模式和调控网络，以促进植物发育机制的理解和农业改良 | 玉米胚胎发育过程中的细胞和组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 (RNA-seq), 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 452 | 2025-10-07 |
scIDPMs: Single-Cell RNA-Seq Imputation Using Diffusion Probabilistic Models
2025-Apr, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2024.3430554
PMID:39093668
|
研究论文 | 提出一种基于条件扩散概率模型的新型单细胞RNA测序数据插补方法scIDPMs | 首次将条件扩散概率模型应用于单细胞RNA测序数据插补，通过注意力机制的深度神经网络有效捕捉全局基因表达特征 | 未明确说明方法在超大规模数据集上的计算效率及对特定细胞类型的适用性限制 | 解决单细胞RNA测序数据中dropout事件导致的假零值问题，提高下游分析准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 条件扩散概率模型, 深度神经网络, 注意力机制 | 基因表达数据 | 模拟和真实单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 453 | 2025-10-07 |
The Effect of Cuproptosis-Related Proteins on Macrophage Polarization in Mesothelioma is Revealed by scRNA-seq
2025-Apr, Biological trace element research
IF:3.4Q2
DOI:10.1007/s12011-024-04333-y
PMID:39177724
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示铜死亡相关蛋白对间皮瘤中巨噬细胞极化的影响 | 首次发现铜死亡相关基因在间皮瘤中的作用机制，特别是SLC31A1基因对M2巨噬细胞极化的正向调控作用 | 研究样本量有限，需要进一步临床验证 | 探索铜死亡相关基因在间皮瘤发生发展中的作用及其对肿瘤免疫的影响 | 间皮瘤患者样本和单细胞数据 | 单细胞转录组学 | 间皮瘤 | 单细胞RNA测序, 体外验证 | LASSO回归, Cox回归 | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的间皮瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 454 | 2025-10-07 |
Integrative single-cell and spatial transcriptomic analyses identify a pathogenic cholangiocyte niche and TNFRSF12A as therapeutic target for biliary atresia
2025-Apr-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001064
PMID:39178365
|
研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组分析揭示胆道闭锁中致病性胆管细胞生态位及TNFRSF12A作为治疗靶点 | 首次通过整合单细胞RNA测序和空间转录组技术构建BA空间肝脏细胞图谱，发现胆管细胞富集的致病生态位并鉴定TNFRSF12A为潜在治疗靶点 | 样本量有限（12例单细胞测序+4例空间转录组），需进一步验证 | 阐明胆管细胞在胆道闭锁中的致病机制并寻找治疗靶点 | 胆道闭锁患者肝组织、小鼠疾病模型、人类胆管类器官 | 空间转录组学 | 胆道闭锁 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 生物信息学分析, 类器官培养 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 16例肝组织（12例单细胞测序：9例BA+3例对照；4例空间转录组：2例BA+2例对照） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | NA |
| 455 | 2025-10-07 |
CXCR4-targeted sensitive magnetic particle imaging for abdominal aortic aneurysm early detection and prognosis evaluation by recognizing total inflammatory cells
2025-Apr-22, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae255
PMID:39658102
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序识别CXCR4作为腹主动脉瘤炎症标志物，开发靶向探针实现早期检测和预后评估 | 首次将CXCR4确定为标记所有AAA相关免疫细胞和炎症血管细胞的趋化因子受体，并开发了CXCR4靶向多模态成像探针 | 研究基于小鼠模型，尚未在人体验证；早期检测能力需进一步临床确认 | 开发腹主动脉瘤早期检测和预后评估的新型成像方法 | 腹主动脉瘤小鼠模型、人类主动脉瘤单细胞测序数据 | 医学影像 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、磁粒子成像、荧光成像 | NA | 单细胞测序数据、影像数据 | 人类主动脉瘤数据集GSE155468和GSE166676、AAA小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 456 | 2025-10-07 |
Unraveling the Therapeutic Potential of Scutellarin for Clear Cell Renal Cell Carcinoma: A Comprehensive Molecular Analysis
2025-Apr-22, Current pharmaceutical design
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 通过综合分子分析探讨野黄芩素对透明细胞肾细胞癌的治疗潜力 | 首次通过多数据库整合、单细胞RNA测序和分子动力学模拟系统揭示野黄芩素在ccRCC中的作用靶点和机制 | 需要进一步的临床前和临床研究验证野黄芩素的精确分子机制和治疗优势 | 探索野黄芩素对透明细胞肾细胞癌的治疗作用机制 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)及相关分子靶点 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟,蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | WGCNA,分子对接模型,分子动力学模型 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | TCGA-KIRC和GSE53757数据集,GSE222703单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 457 | 2025-10-07 |
NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S8 expression and functional significance in non-small cell lung cancer
2025-Apr-21, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07638-5
PMID:40258810
|
研究论文 | 本研究探讨了NDUFS8在非小细胞肺癌中的表达及其通过调控线粒体功能促进肿瘤生长的作用机制 | 首次系统揭示NDUFS8通过调控线粒体复合物I活性影响非小细胞肺癌能量代谢和放射抵抗性的新机制 | 研究主要基于细胞系和动物模型，临床样本验证仍需扩展 | 阐明NDUFS8在非小细胞肺癌发生发展中的生物学功能和分子机制 | 非小细胞肺癌细胞系、原代肿瘤细胞和小鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、shRNA沉默、CRISPR/Cas9基因敲除、腺相关病毒递送 | 基因敲除/过表达模型 | 基因表达数据、功能实验数据 | 多种非小细胞肺癌细胞系和裸鼠移植瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 458 | 2025-10-07 |
Deconvolution of cell types and states in spatial multiomics utilizing TACIT
2025-Apr-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58874-4
PMID:40258827
|
研究论文 | 开发了一种名为TACIT的无监督算法，用于空间多组学数据中的细胞类型和状态解卷积 | 提出无需训练数据的无监督细胞注释算法，采用无偏阈值方法区分阳性细胞与背景，专注于相关标记物识别多组学检测中的模糊细胞 | NA | 解决空间生物学中细胞类型和状态识别的挑战 | 细胞类型和状态在空间多组学数据中的识别 | 空间生物学 | 炎症性腺体疾病 | 空间转录组学，空间蛋白质组学，多组学分析 | 无监督算法 | 空间多组学数据 | 5个数据集，5,000,000个细胞，51种细胞类型 | NA | 空间转录组学，空间蛋白质组学，单细胞多组学 | NA | NA |
| 459 | 2025-10-07 |
Stereopy: modeling comparative and spatiotemporal cellular heterogeneity via multi-sample spatial transcriptomics
2025-Apr-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58079-9
PMID:40258830
|
研究论文 | 开发了一个名为Stereopy的灵活框架，用于建模和分析多样本空间转录组数据中的比较和时空模式 | 提出了专门针对多样本多模态数据设计的通用容器、范围控制器和集成转换器，能够统一整合多样本数据探索细胞异质性 | NA | 通过多样本空间转录组数据建模比较和时空细胞异质性 | 多样本空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 460 | 2025-10-07 |
CFTR acts as a potential therapeutic target for attention deficit-hyperactivity disorder
2025-Apr-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-98900-5
PMID:40258939
|
研究论文 | 本研究通过遗传分析、斑马鱼模型和分子实验揭示了CFTR基因在注意力缺陷多动障碍发病机制中的潜在作用 | 首次发现CFTR基因突变与ADHD的共分离现象，并证实CFTR调节剂可改善ADHD样行为 | 研究样本量有限（两个近亲家庭），主要依赖斑马鱼模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 探讨CFTR基因在注意力缺陷多动障碍发病机制中的作用 | CFTR基因突变携带者、斑马鱼模型 | 神经科学 | 注意力缺陷多动障碍 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 蛋白质组学分析 | 斑马鱼基因敲除模型 | 基因序列数据, 行为数据, 表达谱数据 | 两个近亲家庭的六名成员及斑马鱼模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |