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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2025-10-07 |
Tff2 marks gastric corpus progenitors that give rise to pyloric metaplasia/SPEM following injury
2025-Apr-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.09.647847
PMID:40291734
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研究论文 | 本研究通过Tff2-CreERT基因敲入小鼠模型,揭示了Tff2+胃体峡部细胞是短暂扩增祖细胞,并在损伤后成为幽门化生/SPEM的主要来源 | 挑战了传统认为化生逐步进展的观点,发现Tff2+祖细胞而非主细胞是SPEM的主要来源,且Kras突变可使这些祖细胞直接进展为异型增生 | 主要基于小鼠模型研究,人类组织验证相对有限 | 探究胃幽门化生/SPEM的细胞起源及其在胃癌发生中的作用 | Tff2+胃体峡部祖细胞、主细胞、幽门化生/SPEM病变 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学分析 | Tff2-CreERT基因敲入小鼠模型 | 基因表达数据,空间转录组数据 | 小鼠模型及人类组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 402 | 2025-10-07 |
Integration of Microarray and Single-Cell RNA-Seq Data and Machine Learning Allows the Identification of Key Histone Modification Gene Changes in Spermatogonial Stem Cells
2025-Apr-08, Biology
DOI:10.3390/biology14040387
PMID:40282252
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研究论文 | 整合微阵列和单细胞RNA测序数据,通过机器学习识别精子干细胞中关键组蛋白修饰基因的变化 | 首次整合微阵列和scRNA-seq数据识别与精子干细胞功能和衰老相关的组蛋白修饰基因变化 | NA | 研究精子干细胞中组蛋白修饰基因的变化及其与男性生育能力的关系 | 精子干细胞和成纤维细胞 | 机器学习 | 男性不育症 | 微阵列, 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 403 | 2025-10-07 |
Advances in Microfluidic Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics
2025-Apr-02, Micromachines
IF:3.0Q2
DOI:10.3390/mi16040426
PMID:40283301
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综述 | 本文综述了微流控技术在单细胞RNA测序和空间转录组学领域的最新进展与应用 | 系统评估微流控技术在单细胞和空间多组学中的优势与局限,并强调其在发育、神经科学和疾病机制研究中的贡献 | NA | 探讨微流控技术在单细胞和空间多组学领域的发展现状与未来前景 | 微流控芯片技术及其在单细胞分析和空间转录组学中的应用 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 微流控技术 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 404 | 2025-10-07 |
Elucidating the Role of Trem2 in Lipid Metabolism and Neuroinflammation
2025-Apr, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70338
PMID:40205810
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和代谢组学技术,揭示了Trem2在阿尔茨海默病中调控星形胶质细胞脂质代谢和神经炎症的关键作用 | 首次系统阐明Trem2通过调节脂质代谢途径影响星形胶质细胞炎症反应的具体机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证尚不充分 | 探究Trem2在阿尔茨海默病脂质代谢失调和神经炎症中的作用机制 | 阿尔茨海默病小鼠模型中的星形胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 转录组学, 高通量代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 405 | 2025-10-07 |
Microglia-Derived IL-6 Promotes Müller Glia Reprogramming and Proliferation in Zebrafish Retina Regeneration
2025-Apr-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.4.67
PMID:40266594
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研究论文 | 本研究揭示了斑马鱼视网膜再生中,小胶质细胞来源的IL-6通过调控Jak1-Stat3信号通路促进Müller胶质细胞重编程和增殖的机制 | 首次发现小胶质细胞来源的IL-6是激活Stat3信号的关键分子,并阐明其在视网膜再生中的双重调控作用 | 研究主要基于斑马鱼模型,在哺乳动物中的适用性仍需进一步验证 | 探索Stat3激活因子IL-6在斑马鱼视网膜再生中的表达和功能 | 成年斑马鱼视网膜 | 发育生物学 | 视网膜损伤 | 单细胞RNA测序, PCR, 谱系追踪, 免疫染色 | 斑马鱼损伤模型 | 基因表达数据, 图像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 406 | 2025-10-07 |
Emerging targets for advancing endometrial therapeutics
2025-Apr, Reproductive biomedicine online
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.rbmo.2024.104785
PMID:40287196
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综述 | 本文总结了子宫内膜研究的最新靶点及其在妇科疾病治疗中的进展 | 聚焦单细胞RNA测序、空间转录组学、微生物组等新兴技术,提出子宫内膜衰老等较少研究的领域 | NA | 推进子宫内膜治疗研究 | 子宫内膜及其相关妇科疾病 | NA | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 微生物组分析, 类器官模型, 月经血分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 407 | 2025-10-07 |
Single Cell Deletion of the Transcription Factors Trps1 and Sox9 in Astrocytes Reveals Novel Functions in the Adult Cerebral Cortex
2025-Apr, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24645
PMID:39610085
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研究论文 | 通过单细胞水平删除转录因子Trps1和Sox9研究其在成年大脑皮层星形胶质细胞中的新功能 | 首次在成年大脑皮层星形胶质细胞中同时研究Trps1和Sox9的功能,并发现它们对突触维持和免疫反应的调控作用 | 研究仅限于大脑皮层区域,未涉及其他脑区 | 探索转录因子在成年大脑星形胶质细胞功能调控中的作用 | 成年小鼠大脑皮层星形胶质细胞 | 神经科学 | NA | Cas9介导的基因删除,慢病毒递送,单细胞转录组测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 408 | 2025-10-07 |
Exploring immune gene expression and potential regulatory mechanisms in anaplastic thyroid carcinoma using a combination of single-cell and bulk RNA sequencing data
2025-Apr, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据探索未分化甲状腺癌中免疫基因表达及潜在调控机制 | 首次结合单细胞和bulk RNA测序数据系统分析ATC免疫特征,识别关键转录因子和潜在治疗靶点 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要实验验证 | 识别未分化甲状腺癌的新型诊断和治疗靶点 | 未分化甲状腺癌和乳头状甲状腺癌的免疫相关基因 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 生物信息学分析 | AUCell, PPI网络分析 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的ATC和PTC样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 409 | 2025-10-07 |
Development of a centrosome amplification-associated signature in kidney renal clear cell carcinoma based on multiple machine learning models
2025-Apr, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本研究基于多种机器学习模型开发了肾透明细胞癌中心体扩增相关特征,用于预测预后和免疫治疗反应 | 首次构建了肾透明细胞癌中心体扩增相关预后指数(CAAPI),并发现其与高死亡率、高突变率和免疫抑制微环境相关 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索中心体扩增相关特征对肾透明细胞癌预后预测和治疗反应的影响 | 肾透明细胞癌患者 | 机器学习 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | 随机生存森林分析, Cox回归分析 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA-KIRC数据集、ICGC数据集和GEO数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 410 | 2025-10-07 |
Double-target magnetic stimulation attenuates oligodendrocyte apoptosis and oxidative stress impairment after spinal cord injury via GAP43
2025-Apr, The spine journal : official journal of the North American Spine Society
DOI:10.1016/j.spinee.2024.12.025
PMID:39701305
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研究论文 | 本研究探讨双靶点磁刺激通过GAP43减轻脊髓损伤后少突胶质细胞凋亡和氧化应激损伤的机制 | 首次揭示双靶点磁刺激通过GAP43促进少突胶质细胞成熟和轴突再生的抗凋亡和抗氧化应激机制 | 动物模型研究,结果向临床转化需进一步验证 | 评估双靶点磁刺激对脊髓损伤后功能恢复和神经环路改善的作用 | 脊髓损伤模型大鼠和体外培养的胶质细胞 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 透射电子显微镜, 蛋白质印迹, 免疫荧光染色, TUNEL染色, 细胞凋亡检测, 脂质ROS检测 | 动物模型 | 基因表达数据, 图像数据, 蛋白质数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 411 | 2025-10-07 |
Transcriptomics, single-cell sequencing and spatial sequencing-based studies of cerebral ischemia
2025-Apr-24, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-02596-2
PMID:40275374
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综述 | 本文综述了基于转录组学、单细胞测序和空间测序的脑缺血研究进展 | 整合多水平转录组学数据揭示脑缺血的分子机制 | NA | 研究脑缺血的病理生理过程并寻找新的治疗策略 | 脑缺血 | 生物信息学 | 脑缺血 | 转录组学, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 412 | 2025-10-07 |
Cellular immunotherapy targeting CLL-1 for juvenile myelomonocytic leukemia
2025-Apr-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59040-6
PMID:40268927
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研究论文 | 本研究开发了靶向CLL-1的CAR-T细胞免疫疗法用于治疗幼年型粒单核细胞白血病 | 首次发现CLL-1在JMML细胞表面过表达,并开发了靶向CLL-1的CAR-T细胞疗法 | 目前仅进行了临床前研究,尚未在人体临床试验中验证 | 开发针对幼年型粒单核细胞白血病的新型免疫治疗方法 | 幼年型粒单核细胞白血病患者细胞及白血病干细胞 | 免疫治疗 | 幼年型粒单核细胞白血病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 质谱分析, 流式细胞术 | CAR-T细胞疗法 | RNA测序数据, 蛋白质质谱数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 413 | 2025-10-07 |
Gene regulatory networks analysis for the discovery of prognostic genes in gliomas
2025-Apr-23, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-98542-7
PMID:40269178
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研究论文 | 通过分析胶质瘤基因调控网络发现预后相关基因 | 首次系统重建胶质瘤基因调控网络并识别出与神经发育和突触过程相关的关键预后基因 | 研究主要基于转录组数据,缺乏功能验证实验 | 发现胶质瘤中的预后相关基因和关键基因调控网络 | 989例原发性胶质瘤患者和201,986个单细胞 | 生物信息学 | 胶质瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 弹性网络正则化, Cox回归 | 基因表达数据 | 989例胶质瘤样本和201,986个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 414 | 2025-10-07 |
In-depth single-cell transcriptomic exploration of the regenerative dynamics in stony coral
2025-Apr-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08089-6
PMID:40269231
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研究论文 | 通过单细胞转录组等技术深入研究石珊瑚再生动态的分子机制 | 首次结合单细胞RNA测序、bulk RNA测序和微计算机断层扫描技术系统揭示珊瑚快速再生关键阶段 | 珊瑚快速再生存在时间限制性 | 探究珊瑚再生过程中的分子机制以解决珊瑚移植生长缓慢问题 | 石珊瑚Acropora muricata | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 微计算机断层扫描 | NA | 转录组数据, 影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 415 | 2025-10-07 |
6-Gingerol, an active compound of ginger, attenuates NASH-HCC progression by reprogramming tumor-associated macrophage via the NOX2/Src/MAPK signaling pathway
2025-Apr-23, BMC complementary medicine and therapies
IF:3.3Q1
DOI:10.1186/s12906-025-04890-2
PMID:40269843
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研究论文 | 本研究探讨了生姜活性成分6-姜酚通过NOX2/Src/MAPK信号通路重编程肿瘤相关巨噬细胞,从而减缓NASH-HCC进展的机制 | 首次发现6-姜酚可通过NOX2/Src/MAPK信号通路重编程肿瘤相关巨噬细胞,诱导其向M1表型极化并增强促炎功能 | 研究主要基于体外实验,缺乏体内实验验证 | 探索生姜及其活性成分治疗NASH-HCC的疗效和分子机制 | 非酒精性脂肪性肝炎相关肝细胞癌(NASH-HCC) | 药理学研究 | 肝细胞癌 | 网络药理学, 生物信息学, 单细胞RNA测序, 分子对接, 体外实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 416 | 2025-10-07 |
Molecular characteristics of early- and late-onset ovarian cancer: insights from multidimensional evidence
2025-Apr-23, Journal of ovarian research
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s13048-025-01664-9
PMID:40269926
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研究论文 | 本研究通过多维度证据探讨早发和晚发卵巢癌的分子特征差异 | 首次结合孟德尔随机化、机器学习和单细胞测序方法系统分析卵巢癌年龄相关分子特征 | 研究样本量有限,需要进一步实验验证 | 阐明早发和晚发卵巢癌的分子机制差异 | 卵巢癌患者 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞测序, 机器学习, 孟德尔随机化, 生物信息学分析 | 机器学习模型 | 基因组数据, 临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 417 | 2025-10-07 |
Comprehensive single-cell RNA-sequencing study of Tollip deficiency effect in IL-13-stimulated human airway epithelial cells
2025-Apr-23, BMC research notes
IF:1.6Q2
DOI:10.1186/s13104-025-07255-7
PMID:40269942
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究Tollip缺陷对IL-13刺激的人气道上皮细胞的影响 | 首次进行Tollip敲低的单细胞分析,并首次探索其与IL-13的相互作用 | NA | 研究Tollip在人气道上皮细胞对IL-13反应中的功能 | 原代人气道上皮细胞 | 单细胞测序 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 418 | 2025-10-07 |
Serum C-C motif chemokine ligand 17 as a predictive biomarker for the progression of non-idiopathic pulmonary fibrosis interstitial lung disease
2025-Apr-23, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03237-2
PMID:40269953
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研究论文 | 本研究通过血清生物标志物筛选和验证,发现CCL17可作为预测非特发性肺纤维化间质性肺病进展的临床可测量生物标志物 | 首次确定血清CCL17作为预测非IPF-ILD进展的临床可测量生物标志物,并通过多队列验证和单细胞RNA测序阐明其细胞来源 | 研究样本量有限,需要在更大规模人群中进一步验证 | 识别能够预测间质性肺病进展程度的临床可测量生物标志物 | 间质性肺病患者(包括发现队列252例患者和验证队列154例非IPF-ILD患者)及小鼠模型 | 生物标志物研究 | 间质性肺病 | 化学发光酶免疫测定,免疫印迹,单细胞RNA测序 | NA | 血清样本,肺组织样本,单细胞RNA测序数据 | 发现队列252例患者,验证队列154例非IPF-ILD患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 419 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing reveals intracranial microvasculature-derived CXCL12 promotes CD8+ T-cell infiltration and blood-brain barrier dysfunction after subarachnoid hemorrhage in mice
2025-Apr-23, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03444-0
PMID:40270006
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了蛛网膜下腔出血后颅内微血管通过CXCL12-CXCR4轴促进CD8+ T细胞浸润并导致血脑屏障功能障碍的机制 | 首次发现颅内微血管来源的CXCL12通过CXCR4通路促进CD8+ T细胞浸润,阐明了蛛网膜下腔出血后血脑屏障功能障碍的新机制 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类样本中验证;实验时间点有限,未能覆盖所有病理过程 | 阐明蛛网膜下腔出血后颅内微血管介导的T细胞浸润对血脑屏障功能的影响及潜在机制 | 成年雄性C57BL/6J小鼠的白质区域 | 单细胞生物学 | 蛛网膜下腔出血 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 实验性蛛网膜下腔出血后1天和7天的小鼠样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 420 | 2025-10-07 |
Integrated multi-omics profiling characterizes the crucial role of human dental epithelium during tooth development
2025-Apr-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115437
PMID:40120109
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和分泌组学分析,构建了人类牙齿发育的多层次时空图谱 | 首次结合多种组学技术系统描绘人类牙齿发育过程,识别了未被表征的上皮亚群及其空间定位 | 研究聚焦于胎儿期牙齿发育,未涉及成年期牙齿再生过程 | 阐明人类牙齿早期发育的细胞和分子机制 | 人类胎儿牙齿原基 | 空间生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 分泌组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据, 蛋白质分泌数据 | 人类胎儿牙齿发育不同时间点的样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |