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当前共找到 715 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2025-10-07 |
PcoCas12a: A novel CRISPR enzyme from Prevotella copri enhancing TCR-T-cell tumor suppression
2025-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.139740
PMID:39800033
|
研究论文 | 本研究鉴定了一种来自Prevotella copri的新型基因编辑酶PcoCas12a，并证明其在TCR-T细胞中通过敲除DGKα基因增强肿瘤抑制能力 | 发现了一种新型CRISPR酶PcoCas12a，具有更广的编辑位点范围和更高的编辑效率，特别是在T细胞编辑中表现优于AsCas12a | NA | 开发用于免疫细胞编辑的高效基因编辑工具 | TCR-T细胞和DGKα基因 | 基因编辑 | 肿瘤 | CRISPR基因编辑，单细胞测序 | NA | 基因编辑效率数据，单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 382 | 2025-10-07 |
Update on mast cell biology
2025-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.12.1092
PMID:39800266
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综述 | 本文回顾了2022-2024年间关于肥大细胞生物学研究的关键进展 | 整合了单细胞RNA测序等新技术对肥大细胞异质性和功能的新认识 | NA | 更新对肥大细胞生物学的理解 | 小鼠和人类肥大细胞 | NA | 过敏炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 383 | 2025-10-07 |
Characterization of NK Cells Using Single-Cell RNA Sequencing in Patients With Acute-On-Chronic Liver Failure
2025-Apr, Journal of gastroenterology and hepatology
IF:3.7Q2
DOI:10.1111/jgh.16870
PMID:39800654
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析慢加急性肝衰竭患者外周血中NK细胞亚群的特征及其在疾病进展中的作用 | 首次在ACLF患者中通过单细胞RNA测序系统鉴定NK细胞亚群，并发现炎症性NK细胞与疾病进展的相关性 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证结果 | 探究慢加急性肝衰竭患者外周血中NK细胞亚群的特征及其在炎症反应中的作用 | 慢加急性肝衰竭患者和健康对照者的外周血NK细胞 | 单细胞组学 | 肝衰竭 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 14,751个NK细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 384 | 2025-10-07 |
ODSEI Chip: An Open 3D Microfluidic Platform for Studying Tumor Spheroid-Endothelial Interactions
2025-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202410659
PMID:39805002
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研究论文 | 介绍一种新型开放式3D微流控平台ODSEI芯片，用于研究肿瘤球体与内皮细胞的相互作用 | 开发了能够阵列1000多个肿瘤球体的开放式3D微阵列平台，实现单球体水平的药物耐药性分析 | NA | 研究肿瘤球体与内皮细胞相互作用及其在药物耐药性中的作用 | 乳腺癌肿瘤球体和血管内皮细胞 | 生物医学工程 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，蛋白质阵列 | NA | 基因表达数据，蛋白质数据 | 超过1000个肿瘤球体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 开放式3D微流控平台ODSEI芯片 |
| 385 | 2025-10-07 |
Flow-Cytometric Quantification of Urine Kidney Epithelial Cells Specifically Reflects Tubular Damage in Acute Kidney Diseases
2025-Apr, Kidney international reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.ekir.2025.01.037
PMID:40303202
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研究论文 | 本研究开发了一种通过流式细胞术定量尿液中肾上皮细胞的方法，用于特异性反映急性肾疾病中的肾小管损伤 | 通过CITE-Seq技术将尿液单细胞转录组与TEC表面蛋白对齐，首次建立了流式细胞术定量尿液中近端和远端肾小管上皮细胞的标准化方案 | 样本量相对有限，需要在更广泛的患者群体中进一步验证 | 建立肾小管上皮细胞作为肾小管损伤的临床标志物 | 急性肾损伤患者、COVID-19感染者、ANCA相关性血管炎患者和健康对照者 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞测序, CITE-Seq, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 表面蛋白表达数据 | 243名患者（包括8个AKI和肾小球疾病患者的测序样本，以及4个队列共235名验证患者） | NA | 单细胞RNA-seq, 表位测序 | NA | NA |
| 386 | 2025-10-07 |
Investigation into the Spatial Heterogeneity of Lung Composite Large-Cell Neuroendocrine Carcinoma Spatial Transcriptomic Analysis of Combined Large-Cell Neuroendocrine Carcinoma
2025-Apr-30, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1089/cbr.2025.0043
PMID:40304569
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术分析肺复合性大细胞神经内分泌癌的空间异质性，并鉴定关键基因SMC1A的功能 | 首次应用空间转录组学技术研究CoLCNEC的空间异质性，发现SMC1A基因在肿瘤区域显著上调并促进癌细胞恶性行为 | 仅使用单个患者样本，样本量有限，需要更大规模研究验证 | 探索CoLCNEC的空间转录组表达模式并鉴定关键基因 | 肺复合性大细胞神经内分泌癌患者组织样本及NCI-H661、LTEP-a-2细胞系 | 空间转录组学 | 肺癌 | 空间转录组学，高通量测序，免疫组织化学，RT-qPCR，Western blot，流式细胞术 | 无监督聚类 | 空间基因表达数据，图像数据 | 1例CoLCNEC患者样本，包含LCNEC、腺癌和鳞状细胞癌三种成分 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium福尔马林固定石蜡包埋空间转录组试剂盒 |
| 387 | 2025-10-07 |
Systematic evaluation of the isolated effect of tissue environment on the transcriptome using a single-cell RNA-seq atlas dataset
2025-Apr-29, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11614-w
PMID:40301713
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为COSER的数据分析框架，用于评估组织环境对单细胞转录组的独立影响 | 提出了COSER框架，首次使用图论方法枚举适当子数据集来解决统计混杂问题，能够评估离散变量在单细胞中的独立效应 | 仅在小鼠单细胞转录组图谱数据上验证，尚未在其他物种或更大规模数据集中测试 | 评估组织环境对基因表达的独立影响，消除细胞类型效应的统计混杂 | 小鼠单细胞转录组数据 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图论算法 | 单细胞转录组数据 | Tabula Muris Senis单细胞转录组图谱数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 388 | 2025-10-07 |
SpaNorm: spatially-aware normalization for spatial transcriptomics data
2025-Apr-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03565-y
PMID:40301877
|
研究论文 | 开发了一种名为SpaNorm的空间转录组学数据标准化方法，能够同时建模文库大小效应和基础生物学信息 | 首个空间感知的标准化方法，能够分离文库大小效应和生物学信息，在去除文库大小效应的同时保留生物信息 | NA | 解决空间转录组学数据标准化中的空间关联问题 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 空间感知标准化模型 | 空间转录组数据 | 来自6个数据集的27个组织样本，涵盖4个技术平台 | NA | 空间转录组学 | NA | 支持多细胞和亚细胞空间转录组学数据，在不同分割方法下表现稳健 |
| 389 | 2025-10-07 |
Clinical Diagnosis and Treatment System for Neurological Psychological Gastrointestinal Diseases Based on Multimodal Artificial Intelligence and Immunology
2025-Apr-29, Current pharmaceutical biotechnology
IF:2.2Q3
|
研究论文 | 基于多模态人工智能和免疫学开发神经心理胃肠疾病临床诊疗系统，用于结直肠癌预测和治疗辅助 | 整合神经免疫基因调控与AI多模态技术，结合单细胞测序和分子模拟技术阐明特征选择的生物学机制 | NA | 设计和开发基于神经免疫基因调控的人工智能多模态胃肠疾病临床信息系统 | 结直肠癌患者 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞测序, 分子模拟技术 | AI多模态模型 | 基因表达数据, 免疫细胞状态数据, 生活习惯数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 390 | 2025-10-07 |
LAMA4+ CD90+ eCAFs provide immunosuppressive microenvironment for liver cancer through induction of CD8+ T cell senescence
2025-Apr-28, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02162-7
PMID:40289085
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组数据，揭示了LAMA4+ CD90+ eCAFs通过诱导CD8+ T细胞衰老为肝癌提供免疫抑制微环境的机制 | 首次鉴定出与不良预后相关的CD90+ eCAFs亚型，并阐明其通过LAMA4-ITGA6信号轴诱导CD8+ T细胞衰老的新机制 | 对CAFs亚型的功能理解仍有限，需要进一步研究其他CAFs亚型的作用 | 探究肝癌微环境中癌症相关成纤维细胞与免疫细胞的相互作用机制 | 肝癌患者样本和自发性小鼠肝癌模型 | 肿瘤免疫学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, siRNA转染, Western blot, 流式细胞术 | 自发性小鼠肝癌模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞功能数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | NA |
| 391 | 2025-10-07 |
Transcriptomic characterization of transitioning cell types in the skin of Atlantic salmon
2025-Apr-28, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02196-w
PMID:40289111
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学技术表征了大西洋鲑皮肤中推定间充质基质细胞在伤口愈合过程中的转录组特征 | 首次绘制了伤口愈合过程中推定分化间充质基质细胞亚群的转录组活性图谱，揭示了不同MSC亚群的空间生态位 | 研究仅针对大西洋鲑，结果可能不适用于其他鱼类物种 | 表征大西洋鲑皮肤中推定间充质基质细胞在健康和伤口愈合状态下的转录组特征 | 大西洋鲑皮肤中的推定间充质基质细胞（成纤维细胞样成体干细胞） | 空间转录组学 | 伤口愈合 | 单细胞核测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 392 | 2025-10-07 |
E3 ubiquitin ligase TRIM38 regulates macrophage polarization to reduce hepatic inflammation by interacting with HSPA5
2025-Apr-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114662
PMID:40300357
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研究论文 | 本研究探讨了E3泛素连接酶TRIM38通过调控巨噬细胞极化减轻肝脏炎症的分子机制 | 首次揭示TRIM38通过与HSPA5相互作用并介导其K63依赖性泛素化来稳定HSPA5，从而促进M2巨噬细胞极化 | TRIM38在肝脏其他细胞类型中的作用及其在MASLD不同阶段的具体调控机制仍需进一步研究 | 探究巨噬细胞TRIM38在代谢性肝病中的作用，寻找控制炎症的关键靶点 | 巨噬细胞极化、肝脏炎症、代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD) | 分子生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序、分子相互作用分析、泛素化检测 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | MASLD患者的肝脏巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 393 | 2025-10-07 |
InSituCor: exploring spatially correlated genes conditional on the cell type landscape
2025-Apr-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03554-1
PMID:40275395
|
研究论文 | 开发了InSituCor工具包，用于在考虑细胞类型分布的条件下探索空间转录组数据中的空间相关基因 | 能够发现无法用已知细胞类型分布解释的空间基因相关性，避免了传统方法中因细胞类型空间排列导致的伪相关 | NA | 开发空间转录组数据分析工具，识别真正有生物学意义的空间基因相关性 | 空间转录组数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 394 | 2025-10-07 |
Comprehensive immunogenomic landscape analysis unveils CD33 + myeloid cell-driven immunomodulatory signatures in melanoma development
2025-Apr-16, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.155981
PMID:40300524
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研究论文 | 通过整合孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序技术，系统揭示了CD33+髓系细胞在黑色素瘤发展中的免疫调节作用 | 首次结合孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序，系统阐明CD33+髓系细胞通过补体级联和趋化因子信号通路驱动黑色素瘤免疫微环境失调的机制 | 研究主要基于遗传关联分析和计算反卷积，需要进一步实验验证CD33+髓系细胞的具体功能机制 | 探索免疫细胞群体与癌症发展之间的因果关系，特别关注黑色素瘤中的免疫调节特征 | 612种免疫细胞特征和91种癌症类型的全基因组关联研究数据，黑色素瘤样本中的髓系细胞亚群 | 计算生物学 | 黑色素瘤 | 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序, 计算反卷积分析 | NA | 基因组关联数据, 单细胞RNA测序数据, 癌症基因组图谱数据 | 612种免疫细胞特征和91种癌症类型的GWAS数据，TCGA黑色素瘤队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 395 | 2025-10-07 |
Cross-Species Multi-Omics Analysis Reveals Myeloid-Driven Endothelial Oxidative Stress in Ischemic Stroke
2025-Apr-16, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL37429
PMID:40302336
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研究论文 | 通过跨物种多组学分析揭示了缺血性卒中中髓系细胞驱动的内皮氧化应激机制 | 首次整合人类和小鼠模型的多种组学数据，系统揭示了髓系细胞与内皮细胞代谢重编程在血脑屏障破坏中的协同作用 | 研究主要基于动物模型和体外实验，需要进一步的人类临床验证 | 探究缺血性卒中中外周与中枢免疫反应的相互作用机制 | 人类和小鼠缺血性卒中模型，包括外周血和脑组织样本 | 生物信息学 | 缺血性卒中 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 流式细胞术, scMetabolism分析 | 计算分析模型 | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 人类和小鼠缺血性卒中模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 396 | 2025-10-07 |
Multiomics Analysis Reveals Neuroblastoma Molecular Signature Predicting Risk Stratification and Tumor Microenvironment Differences
2025-Apr-04, Journal of proteome research
IF:3.8Q1
DOI:10.1021/acs.jproteome.4c00882
PMID:39762147
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研究论文 | 通过多组学分析构建神经母细胞瘤分子标志物模型，用于风险分层和肿瘤微环境差异评估 | 首次整合多组学数据识别关键枢纽基因，构建恶性亚群1相关特征(MSRS)，并发现PLK1作为关键治疗靶点 | 未明确说明样本规模和验证队列的具体细节 | 开发神经母细胞瘤精准风险分类器和探索肿瘤微环境差异 | 神经母细胞瘤患者样本和肿瘤微环境 | 生物信息学 | 神经母细胞瘤 | 多组学分析, 单细胞转录组测序 | 分子特征模型 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 397 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies endothelial-derived HBEGF as promoting pancreatic beta cell proliferation in mice via the EGFR-Kmt5a-H4K20me pathway
2025-Apr, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-024-06341-y
PMID:39694915
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现内皮细胞来源的HBEGF通过EGFR-Kmt5a-H4K20me通路促进小鼠胰腺β细胞增殖 | 首次揭示内皮细胞来源的HBEGF通过Kmt5a-H4K20me信号通路调控β细胞增殖的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探索调控生理性β细胞增殖的细胞内和细胞外信号通路 | 小鼠胰腺β细胞、内皮细胞、小鼠和大鼠β细胞系、原代小鼠胰岛 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 体外功能验证 | CellChat | 单细胞转录组数据 | 43,724个胰岛内分泌和非内分泌细胞，其中15,569个β细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 398 | 2025-10-07 |
Machine learning analysis of FOSL2 and RHoBTB1 as central immunological regulators in knee osteoarthritis synovium
2025-Apr, The Journal of international medical research
IF:1.4Q4
DOI:10.1177/03000605251333646
PMID:40287984
|
研究论文 | 通过机器学习分析膝骨关节炎滑膜中的关键免疫调节基因FOSL2和RHoBTB1 | 首次结合多种机器学习算法和单细胞RNA测序技术系统鉴定膝骨关节炎滑膜中的核心免疫调节基因 | 需要进一步的研究验证这些基因在膝骨关节炎中的确切作用和治疗潜力 | 探索膝骨关节炎滑膜的分子机制和免疫调节机制 | 膝骨关节炎滑膜组织、小鼠模型 | 机器学习 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序、机器学习算法、基因组关联分析 | LASSO、支持向量机 | 基因表达数据 | GSE55235和GSE51588数据集，膝骨关节炎小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 399 | 2025-10-07 |
scPEDSSC: proximity enhanced deep sparse subspace clustering method for scRNA-seq data
2025-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012924
PMID:40294099
|
研究论文 | 提出一种基于邻近性增强的深度稀疏子空间聚类方法scPEDSSC，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型识别 | 采用基于两部分广义伽马分布的深度自编码器学习自表达矩阵，并结合其二阶幂生成相似度矩阵 | NA | 解决单细胞RNA测序数据聚类分析中的高维度、噪声和稀疏性挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度自编码器, 稀疏子空间聚类 | 基因表达数据 | 12个真实生物数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 400 | 2025-10-07 |
Single-nucleus RNA sequencing and spatial transcriptomics reveal the mechanism by which Xiaozhiling injection treats internal hemorrhoids
2025-Apr-27, World journal of gastrointestinal surgery
IF:1.8Q2
DOI:10.4240/wjgs.v17.i4.103494
PMID:40291892
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学揭示了消痔灵注射液治疗内痔的作用机制 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术研究消痔灵注射液治疗内痔的分子机制，发现Sphk1-S1P通路在促进纤维化中的关键作用 | 研究仅基于大鼠模型，缺乏人类临床样本验证 | 探究消痔灵注射液治疗内痔的分子机制 | 内痔模型大鼠的成纤维细胞 | 空间转录组学 | 内痔 | 单核RNA测序,空间转录组学,电子显微镜,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据,图像数据 | 大鼠内痔模型（分为对照组和治疗组） | NA | 单核RNA测序,空间转录组学 | Stereo-seq | NA |