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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2025-10-07 |
Cross-Species Multi-Omics Analysis Reveals Myeloid-Driven Endothelial Oxidative Stress in Ischemic Stroke
2025-Apr-16, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL37429
PMID:40302336
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研究论文 | 通过跨物种多组学分析揭示了缺血性卒中中髓系细胞驱动的内皮氧化应激机制 | 首次整合人类和小鼠模型的多种组学数据,系统揭示了髓系细胞与内皮细胞代谢重编程在血脑屏障破坏中的协同作用 | 研究主要基于动物模型和体外实验,需要进一步的人类临床验证 | 探究缺血性卒中中外周与中枢免疫反应的相互作用机制 | 人类和小鼠缺血性卒中模型,包括外周血和脑组织样本 | 生物信息学 | 缺血性卒中 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 流式细胞术, scMetabolism分析 | 计算分析模型 | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | 人类和小鼠缺血性卒中模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 322 | 2025-10-07 |
Multiomics Analysis Reveals Neuroblastoma Molecular Signature Predicting Risk Stratification and Tumor Microenvironment Differences
2025-Apr-04, Journal of proteome research
IF:3.8Q1
DOI:10.1021/acs.jproteome.4c00882
PMID:39762147
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研究论文 | 通过多组学分析构建神经母细胞瘤分子标志物模型,用于风险分层和肿瘤微环境差异评估 | 首次整合多组学数据识别关键枢纽基因,构建恶性亚群1相关特征(MSRS),并发现PLK1作为关键治疗靶点 | 未明确说明样本规模和验证队列的具体细节 | 开发神经母细胞瘤精准风险分类器和探索肿瘤微环境差异 | 神经母细胞瘤患者样本和肿瘤微环境 | 生物信息学 | 神经母细胞瘤 | 多组学分析, 单细胞转录组测序 | 分子特征模型 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 323 | 2025-10-07 |
Impaired megakaryopoiesis due to aberrant macrophage polarization via BTK/Rap1/NF-κB pathway in sepsis-induced thrombocytopenia
2025-Apr-02, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.12.048
PMID:39741411
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研究论文 | 本研究揭示巨噬细胞通过BTK/Rap1/NF-κB通路调控脓毒症诱导血小板减少症的机制 | 首次发现BTK磷酸化通过Rap1/NF-κB信号通路调控巨噬细胞促炎极化在SIT中的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步开展 | 探讨脓毒症诱导血小板减少症的发病机制 | SIT患者、脓毒症小鼠模型、巨噬细胞和巨核细胞 | 分子生物学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序、共培养实验、信号通路抑制实验 | NA | 基因表达数据、细胞计数数据 | SIT患者和脓毒症小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 324 | 2025-10-07 |
Spatially Resolved Tumor Ecosystems and Cell States in Gastric Adenocarcinoma Progression and Evolution
2025-Apr-02, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-0605
PMID:39774838
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研究论文 | 通过整合胃癌的空间转录组和单细胞RNA测序数据,揭示肿瘤内空间异质性与不同免疫微环境的关联 | 发现两种独立的进化轨迹,并识别肿瘤-基质界面作为独特的肿瘤生态状态 | NA | 研究胃腺癌进展和演化中的空间分辨肿瘤生态系统和细胞状态 | 多个胃癌样本 | 空间转录组学 | 胃癌 | 空间转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | GeoMx Digital Spatial Profiler | NA |
| 325 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing identifies endothelial-derived HBEGF as promoting pancreatic beta cell proliferation in mice via the EGFR-Kmt5a-H4K20me pathway
2025-Apr, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-024-06341-y
PMID:39694915
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现内皮细胞来源的HBEGF通过EGFR-Kmt5a-H4K20me通路促进小鼠胰腺β细胞增殖 | 首次揭示内皮细胞来源的HBEGF通过Kmt5a-H4K20me信号通路调控β细胞增殖的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探索调控生理性β细胞增殖的细胞内和细胞外信号通路 | 小鼠胰腺β细胞、内皮细胞、小鼠和大鼠β细胞系、原代小鼠胰岛 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 体外功能验证 | CellChat | 单细胞转录组数据 | 43,724个胰岛内分泌和非内分泌细胞,其中15,569个β细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 326 | 2025-10-07 |
Restorative Effects of Short-Chain Fatty Acids on Corneal Homeostasis Disrupted by Antibiotic-Induced Gut Dysbiosis
2025-Apr, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.11.010
PMID:39732390
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研究论文 | 本研究探讨肠道微生物群对角膜稳态的影响及短链脂肪酸的修复作用 | 首次揭示抗生素诱导的肠道菌群失调会破坏角膜昼夜节律基因表达和屏障功能,并证明短链脂肪酸具有修复作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 | 研究肠道微生物群对角膜稳态的调控机制 | 小鼠角膜组织 | 微生物组学 | 角膜功能障碍 | RNA测序,单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠角膜组织样本 | NA | RNA-seq,单细胞测序 | NA | NA |
| 327 | 2025-10-07 |
Effect of tumor microenvironment in pancreatic cancer on the loss of β-cell mass: implications for type 3c diabetes
2025-Apr, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-024-02204-w
PMID:39760782
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析胰腺导管腺癌肿瘤微环境对β细胞质量损失的影响,揭示3c型糖尿病的发病机制 | 首次在单细胞水平系统分析PDAC肿瘤微环境中不同细胞类型与内分泌细胞的相互作用,并比较近端和远端肿瘤旁区域胰岛特征的差异 | 样本量相对有限,主要关注胰腺导管腺癌,未涵盖其他胰腺肿瘤类型 | 探索胰腺癌肿瘤微环境与β细胞质量损失之间的复杂相互作用,阐明3c型糖尿病发病机制 | 胰腺导管腺癌患者肿瘤组织、正常胰腺供体组织、INS-1E细胞系、PANC-1细胞系 | 单细胞生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, TUNEL染色, RT-qPCR, CCK8检测 | NA | 单细胞转录组数据, 组织病理学数据, 细胞实验数据 | 正常胰腺供体、非糖尿病患者和3c型糖尿病患者的肿瘤旁组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 328 | 2025-10-07 |
MicroRNA-mediated Ets1 repression in retinal endothelial cells: A novel anti-angiogenic mechanism in nonproliferative diabetic retinopathy
2025-Apr, Diabetes, obesity & metabolism
DOI:10.1111/dom.16182
PMID:39777974
|
研究论文 | 本研究通过microRNA测序和单细胞测序分析,揭示了非增殖性糖尿病视网膜病变中一种新型microRNA通过抑制Ets1介导的抗血管生成机制 | 发现了一种靶向Ets1的新型microRNA在NPDR患者血浆中上调,并揭示了其在视网膜内皮细胞中的抗血管生成作用机制 | 研究样本量有限,主要基于病例对照设计,需要更大规模研究验证 | 探索非增殖性糖尿病视网膜病变中血管生成的调控机制 | 2型糖尿病患者(伴有和不伴有NPDR)的血浆和视网膜样本,以及小鼠和大鼠模型的视网膜细胞 | 分子生物学 | 糖尿病视网膜病变 | microRNA测序, 单细胞测序 | NA | 测序数据 | 2型糖尿病患者病例对照样本 | NA | 单细胞测序, microRNA测序 | NA | NA |
| 329 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq reveals that granulosa cells are a target of phthalate toxicity in the ovary
2025-Apr-01, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/toxsci/kfaf001
PMID:39752319
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究邻苯二甲酸盐对卵巢颗粒细胞的毒性作用 | 首次在单细胞水平揭示邻苯二甲酸盐对卵巢颗粒细胞的特异性毒性作用,发现其对不同细胞亚型的影响差异 | 研究仅使用小鼠模型,未在人类样本中验证;仅测试单一浓度(10µg/ml)的邻苯二甲酸盐代谢物混合物 | 探究邻苯二甲酸盐在卵巢中的分子毒性机制 | 小鼠窦卵泡中的颗粒细胞、卵泡膜细胞和基质细胞 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠窦卵泡(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 330 | 2025-10-07 |
Machine learning analysis of FOSL2 and RHoBTB1 as central immunological regulators in knee osteoarthritis synovium
2025-Apr, The Journal of international medical research
IF:1.4Q4
DOI:10.1177/03000605251333646
PMID:40287984
|
研究论文 | 通过机器学习分析膝骨关节炎滑膜中的关键免疫调节基因FOSL2和RHoBTB1 | 首次结合多种机器学习算法和单细胞RNA测序技术系统鉴定膝骨关节炎滑膜中的核心免疫调节基因 | 需要进一步的研究验证这些基因在膝骨关节炎中的确切作用和治疗潜力 | 探索膝骨关节炎滑膜的分子机制和免疫调节机制 | 膝骨关节炎滑膜组织、小鼠模型 | 机器学习 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序、机器学习算法、基因组关联分析 | LASSO、支持向量机 | 基因表达数据 | GSE55235和GSE51588数据集,膝骨关节炎小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 331 | 2025-10-07 |
scPEDSSC: proximity enhanced deep sparse subspace clustering method for scRNA-seq data
2025-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012924
PMID:40294099
|
研究论文 | 提出一种基于邻近性增强的深度稀疏子空间聚类方法scPEDSSC,用于单细胞RNA测序数据的细胞类型识别 | 采用基于两部分广义伽马分布的深度自编码器学习自表达矩阵,并结合其二阶幂生成相似度矩阵 | NA | 解决单细胞RNA测序数据聚类分析中的高维度、噪声和稀疏性挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度自编码器, 稀疏子空间聚类 | 基因表达数据 | 12个真实生物数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 332 | 2025-10-07 |
The Application of scRNA-Seq in Heart Development and Regeneration
2025-Apr, Genesis (New York, N.Y. : 2000)
DOI:10.1002/dvg.70013
PMID:40300044
|
综述 | 本文总结了单细胞RNA测序技术在心脏发育与再生研究中的应用 | 系统梳理了scRNA-seq技术在揭示心脏损伤修复分子机制方面的最新进展 | NA | 探索单细胞RNA测序在心脏发育和再生研究中的应用价值 | 哺乳动物心脏、斑马鱼心脏、心肌细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 333 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptome Reveals the Cellular Response to PEG-Induced Stress in Wheat Leaves
2025-Apr-27, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c12749
PMID:40287963
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了小麦叶片在PEG诱导胁迫下的细胞响应机制 | 首次构建小麦叶片单细胞图谱,揭示不同细胞类型在干旱胁迫下的响应异质性和调控网络 | 研究仅基于PEG模拟的干旱胁迫,未涉及真实田间干旱条件 | 探究小麦在细胞水平对干旱胁迫的响应机制 | 抗旱和感旱小麦幼苗叶片 | 单细胞组学 | 植物胁迫响应 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 334 | 2025-10-07 |
Single-nucleus RNA sequencing and spatial transcriptomics reveal the mechanism by which Xiaozhiling injection treats internal hemorrhoids
2025-Apr-27, World journal of gastrointestinal surgery
IF:1.8Q2
DOI:10.4240/wjgs.v17.i4.103494
PMID:40291892
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学揭示了消痔灵注射液治疗内痔的作用机制 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术研究消痔灵注射液治疗内痔的分子机制,发现Sphk1-S1P通路在促进纤维化中的关键作用 | 研究仅基于大鼠模型,缺乏人类临床样本验证 | 探究消痔灵注射液治疗内痔的分子机制 | 内痔模型大鼠的成纤维细胞 | 空间转录组学 | 内痔 | 单核RNA测序,空间转录组学,电子显微镜,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据,图像数据 | 大鼠内痔模型(分为对照组和治疗组) | NA | 单核RNA测序,空间转录组学 | Stereo-seq | NA |
| 335 | 2025-10-07 |
Integrated Analysis of Single-Cell and Transcriptome Data Reveals the Role and Regulatory Mechanisms of Neuroinflammation in Parkinson's Disease
2025-Apr-26, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02306-4
PMID:40285838
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研究论文 | 通过整合单细胞和转录组数据分析,揭示神经炎症在帕金森病中的作用及STAT3转录因子的调控机制 | 首次通过整合单细胞RNA测序和微阵列数据,系统揭示STAT3作为小胶质细胞促炎活化的核心调控因子在帕金森病中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库数据,样本来源有限;动物和细胞模型可能无法完全模拟人类疾病复杂性 | 探究帕金森病中不同细胞类型的炎症特征及其调控机制 | 人类PD中脑黑质致密部组织、MPTP诱导的PD小鼠模型、MPP+诱导的BV2细胞和SH-SY5Y细胞 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序, 微阵列分析, GSVA, GSEA, KEGG, GO分析, 轨迹分析, SCENIC分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据 | 来自GEO数据库的人类PD中脑组织数据,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 336 | 2025-10-07 |
Blockade of TIGAR prevents CD8+ T cell dysfunction and elicits anti-AML immunity
2025-Apr-26, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04042-y
PMID:40285889
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研究论文 | 本研究通过阻断TIGAR基因表达,揭示了其能够防止CD8+ T细胞功能失调并诱导抗急性髓系白血病免疫反应的机制 | 首次证明TIGAR沉默不仅能直接抑制AML细胞,还能增强T细胞功能,通过调节糖代谢途径逆转T细胞耗竭状态 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探究TIGAR沉默是否能够消除AML细胞并恢复功能失调的T细胞功能 | C57BL/6J背景的TIGAR基因敲除小鼠和C1498细胞建立的AML小鼠模型 | 免疫学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,细胞因子检测 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,细胞表型数据,生存数据 | 未明确说明具体样本数量,使用基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 337 | 2025-10-07 |
In silico-based analysis and in vitro experiments identify SIGMAR1 as a potential marker of putative lung cancer stem cells
2025-Apr-26, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02394-6
PMID:40285994
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结合体外实验,鉴定SIGMAR1作为肺癌干细胞潜在标志物 | 首次通过单细胞RNA测序数据识别SIGMAR1在肺癌干细胞中的特异性表达,并验证其在调控干细胞自我更新能力中的功能 | 研究主要基于体外实验和已有数据集,未来需要进一步探索SIGMAR1调控干细胞特性的具体机制 | 识别肺癌干细胞的新型标志物并验证其功能 | A549细胞系来源的肿瘤球体及人类肺癌组织单细胞测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,轨迹分析,siRNA敲低 | NA | 单细胞RNA测序数据,体外实验数据 | 两个公共单细胞RNA测序数据集及A549细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 338 | 2025-10-07 |
Perturbing local steroidogenesis to improve breast cancer immunity
2025-Apr-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59356-3
PMID:40287432
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研究论文 | 通过抑制局部类固醇生成来增强三阴性乳腺癌的抗肿瘤免疫反应 | 首次揭示免疫细胞局部类固醇生成在乳腺癌免疫抑制中的作用机制,并发现泊沙康唑可作为类固醇生成抑制剂 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 探索通过调控局部类固醇生成改善乳腺癌免疫治疗效果的策略 | 三阴性乳腺癌患者肿瘤样本和人源化TNBC小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 靶向代谢组学,免疫组织化学,单细胞转录组学,代谢建模 | NA | 代谢组数据,转录组数据,组织切片图像 | TNBC患者肿瘤样本和实验小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,靶向代谢组分析 | NA | NA |
| 339 | 2025-10-07 |
Comprehensive single-cell transcriptome analysis of autologous platelet-rich plasma therapy on human thin endometrium
2025-Apr-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-99468-w
PMID:40287476
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究自体富血小板血浆治疗对人类薄型子宫内膜的影响 | 首次通过单细胞转录组分析研究PRP治疗机制,发现PRP治疗能增强细胞干性、促进间质-上皮转化并增强巨噬细胞功能 | 样本量较小(仅10名患者),需要更大规模研究验证 | 探究自体富血小板血浆治疗薄型子宫内膜的分子机制 | 薄型子宫内膜患者的子宫内膜组织 | 单细胞转录组学 | 薄型子宫内膜 | 单细胞RNA测序,苏木精-伊红染色,免疫组织化学 | CytoTRACE细胞轨迹重建分析,基因集变异分析 | 单细胞转录组数据,组织学图像数据 | 10名薄型子宫内膜患者的配对样本(治疗前后) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 340 | 2025-10-07 |
Dynamics of tertiary lymphoid structures and immune cross talk in early versus advanced colorectal cancer: potential implications for immunotherapy
2025-Apr-26, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04027-x
PMID:40287532
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了早期与晚期结直肠癌中三级淋巴结构动态变化及其对免疫治疗的影响 | 发现CD8+Tex细胞表达CXCL13以及CD4+Tfh与BGC细胞间的CD40-CD40L相互作用是三级淋巴结构功能的关键调节因子 | 研究主要基于三个内部队列,需要更大规模的外部验证 | 探究早期与晚期结直肠癌肿瘤微环境和三级淋巴结构的差异及其对免疫治疗的潜在影响 | 结直肠癌患者肿瘤组织 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA转录分析, 病理组织分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA转录数据, 病理组织数据 | 三个内部队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |