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当前共找到 733 篇文献，本页显示第 301 - 320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 301 | 2025-10-07 |
Integrative bioinformatics analysis reveals mitochondrial-Immune crosstalk in depression and stroke: a multi-omics mechanistic exploration
2025-Apr-02, Progress in neuro-psychopharmacology & biological psychiatry
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.pnpbp.2025.111308
PMID:40058518
|
研究论文 | 通过整合生物信息学方法探索线粒体-免疫相互作用在抑郁症和脑卒中中的分子机制 | 首次系统揭示线粒体相关差异表达基因与免疫微环境的复杂互作网络，并识别出10个关键hub-MitoDEGs和10种潜在靶向药物 | 基于生物信息学分析的预测性结果需要实验验证，样本来源和规模可能存在限制 | 阐明线粒体代谢与免疫微环境在抑郁症和脑卒中发病机制中的相互作用 | 抑郁症和脑卒中患者的基因表达数据及线粒体基因数据 | 生物信息学 | 抑郁症,脑卒中 | 基因表达谱分析,单细胞RNA测序,蛋白质相互作用网络分析 | 生物信息学分析流程 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,多组学分析 | NA | NA |
| 302 | 2025-10-07 |
Integrated genetic analysis and single cell-RNA sequencing for brain image-derived phenotypes and Parkinson's disease
2025-Apr-02, Progress in neuro-psychopharmacology & biological psychiatry
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.pnpbp.2025.111317
PMID:40081564
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研究论文 | 通过整合遗传分析和单细胞RNA测序技术，研究脑影像表型与帕金森病之间的遗传关联和生物学机制 | 首次系统性地整合GWAS汇总统计数据和scRNA-seq数据，识别脑影像表型与帕金森病之间的共享遗传结构和细胞类型特异性表达谱 | 基于汇总统计数据而非原始个体数据，无法进行更深入的个体层面分析 | 揭示脑影像表型与帕金森病之间的遗传和生物学联系 | 624个脑影像表型和帕金森病 | 生物信息学 | 帕金森病 | GWAS, scRNA-seq, LDSC, Mendelian randomization, MAGMA, PLACO, FUMA, Metascape | MR, meta-analysis | 遗传汇总统计数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 303 | 2025-10-07 |
Application of bioinformatic tools in cell type classification for single-cell RNA-seq data
2025-Apr, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 比较评估支持向量机四种不同核函数在单细胞RNA测序数据细胞类型分类中的性能 | 首次系统比较SVM四种核函数在单细胞RNA-seq数据分类中的表现，发现线性和sigmoid核能达到约99%的准确率 | 仅使用了三个标准数据集，未在更大规模或更复杂的数据集上验证 | 开发更有效的单细胞RNA测序数据细胞类型分类方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | SVM | 基因表达数据 | 三个标准scRNA-seq数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 304 | 2025-10-07 |
PcoCas12a: A novel CRISPR enzyme from Prevotella copri enhancing TCR-T-cell tumor suppression
2025-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.139740
PMID:39800033
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研究论文 | 本研究鉴定了一种来自Prevotella copri的新型基因编辑酶PcoCas12a，并证明其在TCR-T细胞中通过敲除DGKα基因增强肿瘤抑制能力 | 发现了一种新型CRISPR酶PcoCas12a，具有更广的编辑位点范围和更高的编辑效率，特别是在T细胞编辑中表现优于AsCas12a | NA | 开发用于免疫细胞编辑的高效基因编辑工具 | TCR-T细胞和DGKα基因 | 基因编辑 | 肿瘤 | CRISPR基因编辑，单细胞测序 | NA | 基因编辑效率数据，单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 305 | 2025-10-07 |
Update on mast cell biology
2025-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.12.1092
PMID:39800266
|
综述 | 本文回顾了2022-2024年间关于肥大细胞生物学研究的关键进展 | 整合了单细胞RNA测序等新技术对肥大细胞异质性和功能的新认识 | NA | 更新对肥大细胞生物学的理解 | 小鼠和人类肥大细胞 | NA | 过敏炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 306 | 2025-10-07 |
Characterization of NK Cells Using Single-Cell RNA Sequencing in Patients With Acute-On-Chronic Liver Failure
2025-Apr, Journal of gastroenterology and hepatology
IF:3.7Q2
DOI:10.1111/jgh.16870
PMID:39800654
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析慢加急性肝衰竭患者外周血中NK细胞亚群的特征及其在疾病进展中的作用 | 首次在ACLF患者中通过单细胞RNA测序系统鉴定NK细胞亚群，并发现炎症性NK细胞与疾病进展的相关性 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证结果 | 探究慢加急性肝衰竭患者外周血中NK细胞亚群的特征及其在炎症反应中的作用 | 慢加急性肝衰竭患者和健康对照者的外周血NK细胞 | 单细胞组学 | 肝衰竭 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 14,751个NK细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 307 | 2025-10-07 |
ODSEI Chip: An Open 3D Microfluidic Platform for Studying Tumor Spheroid-Endothelial Interactions
2025-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202410659
PMID:39805002
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研究论文 | 介绍一种新型开放式3D微流控平台ODSEI芯片，用于研究肿瘤球体与内皮细胞的相互作用 | 开发了能够阵列1000多个肿瘤球体的开放式3D微阵列平台，实现单球体水平的药物耐药性分析 | NA | 研究肿瘤球体与内皮细胞相互作用及其在药物耐药性中的作用 | 乳腺癌肿瘤球体和血管内皮细胞 | 生物医学工程 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，蛋白质阵列 | NA | 基因表达数据，蛋白质数据 | 超过1000个肿瘤球体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 开放式3D微流控平台ODSEI芯片 |
| 308 | 2025-10-07 |
Unleashing the Power of Multiomics: Unraveling the Molecular Landscape of Peripheral Neuropathy
2025-Apr, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.70019
PMID:40126913
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综述 | 本文回顾了基因组技术在周围神经病变研究中的演变，重点分析了多组学技术在揭示疾病分子机制方面的潜力 | 系统整合了传统基因组技术与新兴多组学技术（包括RNA测序和蛋白质组学），为周围神经病变提供全面病理生理学见解 | 标准化这些技术用于临床仍面临挑战，需要建立更完善的指导方针 | 探索周围神经病变的分子机制，提升诊断准确性和治疗策略 | 周围神经病变患者及其分子特征 | 基因组学与多组学分析 | 周围神经病变 | NGS, 长读长测序, 单细胞测序, RNA测序, 蛋白质组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | 全基因组关联研究, 靶向基因panel测序, 全外显子/基因组测序, 单细胞测序 | NA | NA |
| 309 | 2025-10-07 |
Flow-Cytometric Quantification of Urine Kidney Epithelial Cells Specifically Reflects Tubular Damage in Acute Kidney Diseases
2025-Apr, Kidney international reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.ekir.2025.01.037
PMID:40303202
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研究论文 | 本研究开发了一种通过流式细胞术定量尿液中肾上皮细胞的方法，用于特异性反映急性肾疾病中的肾小管损伤 | 通过CITE-Seq技术将尿液单细胞转录组与TEC表面蛋白对齐，首次建立了流式细胞术定量尿液中近端和远端肾小管上皮细胞的标准化方案 | 样本量相对有限，需要在更广泛的患者群体中进一步验证 | 建立肾小管上皮细胞作为肾小管损伤的临床标志物 | 急性肾损伤患者、COVID-19感染者、ANCA相关性血管炎患者和健康对照者 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞测序, CITE-Seq, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 表面蛋白表达数据 | 243名患者（包括8个AKI和肾小球疾病患者的测序样本，以及4个队列共235名验证患者） | NA | 单细胞RNA-seq, 表位测序 | NA | NA |
| 310 | 2025-10-07 |
Investigation into the Spatial Heterogeneity of Lung Composite Large-Cell Neuroendocrine Carcinoma Spatial Transcriptomic Analysis of Combined Large-Cell Neuroendocrine Carcinoma
2025-Apr-30, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1089/cbr.2025.0043
PMID:40304569
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术分析肺复合性大细胞神经内分泌癌的空间异质性，并鉴定关键基因SMC1A的功能 | 首次应用空间转录组学技术研究CoLCNEC的空间异质性，发现SMC1A基因在肿瘤区域显著上调并促进癌细胞恶性行为 | 仅使用单个患者样本，样本量有限，需要更大规模研究验证 | 探索CoLCNEC的空间转录组表达模式并鉴定关键基因 | 肺复合性大细胞神经内分泌癌患者组织样本及NCI-H661、LTEP-a-2细胞系 | 空间转录组学 | 肺癌 | 空间转录组学，高通量测序，免疫组织化学，RT-qPCR，Western blot，流式细胞术 | 无监督聚类 | 空间基因表达数据，图像数据 | 1例CoLCNEC患者样本，包含LCNEC、腺癌和鳞状细胞癌三种成分 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium福尔马林固定石蜡包埋空间转录组试剂盒 |
| 311 | 2025-10-07 |
Systematic evaluation of the isolated effect of tissue environment on the transcriptome using a single-cell RNA-seq atlas dataset
2025-Apr-29, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11614-w
PMID:40301713
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研究论文 | 本研究开发了一种名为COSER的数据分析框架，用于评估组织环境对单细胞转录组的独立影响 | 提出了COSER框架，首次使用图论方法枚举适当子数据集来解决统计混杂问题，能够评估离散变量在单细胞中的独立效应 | 仅在小鼠单细胞转录组图谱数据上验证，尚未在其他物种或更大规模数据集中测试 | 评估组织环境对基因表达的独立影响，消除细胞类型效应的统计混杂 | 小鼠单细胞转录组数据 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图论算法 | 单细胞转录组数据 | Tabula Muris Senis单细胞转录组图谱数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 312 | 2025-10-07 |
SpaNorm: spatially-aware normalization for spatial transcriptomics data
2025-Apr-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03565-y
PMID:40301877
|
研究论文 | 开发了一种名为SpaNorm的空间转录组学数据标准化方法，能够同时建模文库大小效应和基础生物学信息 | 首个空间感知的标准化方法，能够分离文库大小效应和生物学信息，在去除文库大小效应的同时保留生物信息 | NA | 解决空间转录组学数据标准化中的空间关联问题 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 空间感知标准化模型 | 空间转录组数据 | 来自6个数据集的27个组织样本，涵盖4个技术平台 | NA | 空间转录组学 | NA | 支持多细胞和亚细胞空间转录组学数据，在不同分割方法下表现稳健 |
| 313 | 2025-10-07 |
Clinical Diagnosis and Treatment System for Neurological Psychological Gastrointestinal Diseases Based on Multimodal Artificial Intelligence and Immunology
2025-Apr-29, Current pharmaceutical biotechnology
IF:2.2Q3
|
研究论文 | 基于多模态人工智能和免疫学开发神经心理胃肠疾病临床诊疗系统，用于结直肠癌预测和治疗辅助 | 整合神经免疫基因调控与AI多模态技术，结合单细胞测序和分子模拟技术阐明特征选择的生物学机制 | NA | 设计和开发基于神经免疫基因调控的人工智能多模态胃肠疾病临床信息系统 | 结直肠癌患者 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞测序, 分子模拟技术 | AI多模态模型 | 基因表达数据, 免疫细胞状态数据, 生活习惯数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 314 | 2025-10-07 |
Autosomal dominant SLURP1 variants cause palmoplantar keratoderma and progressive symmetric erythrokeratoderma
2025-Apr-28, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf049
PMID:39913669
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研究论文 | 本研究通过全外显子测序发现常染色体显性SLURP1基因变异是导致掌跖角化症和进行性对称性红斑角化症的原因 | 首次发现常染色体显性遗传的SLURP1基因变异通过改变信号肽切割机制导致新型皮肤疾病表型 | 研究样本量有限，仅包含三个无亲缘关系的家系 | 鉴定导致掌跖角化症和进行性对称性红斑角化症的新型遗传变异 | 患有表皮分化障碍（包括PPK和PSEK表型）的患者队列 | 遗传学 | 皮肤疾病 | 全外显子测序, 空间转录组学, 质谱分析, 细胞因子定量分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质数据 | 三个无亲缘关系的家系 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 315 | 2025-10-07 |
LAMA4+ CD90+ eCAFs provide immunosuppressive microenvironment for liver cancer through induction of CD8+ T cell senescence
2025-Apr-28, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02162-7
PMID:40289085
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组数据，揭示了LAMA4+ CD90+ eCAFs通过诱导CD8+ T细胞衰老为肝癌提供免疫抑制微环境的机制 | 首次鉴定出与不良预后相关的CD90+ eCAFs亚型，并阐明其通过LAMA4-ITGA6信号轴诱导CD8+ T细胞衰老的新机制 | 对CAFs亚型的功能理解仍有限，需要进一步研究其他CAFs亚型的作用 | 探究肝癌微环境中癌症相关成纤维细胞与免疫细胞的相互作用机制 | 肝癌患者样本和自发性小鼠肝癌模型 | 肿瘤免疫学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, siRNA转染, Western blot, 流式细胞术 | 自发性小鼠肝癌模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞功能数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | NA |
| 316 | 2025-10-07 |
Transcriptomic characterization of transitioning cell types in the skin of Atlantic salmon
2025-Apr-28, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02196-w
PMID:40289111
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学技术表征了大西洋鲑皮肤中推定间充质基质细胞在伤口愈合过程中的转录组特征 | 首次绘制了伤口愈合过程中推定分化间充质基质细胞亚群的转录组活性图谱，揭示了不同MSC亚群的空间生态位 | 研究仅针对大西洋鲑，结果可能不适用于其他鱼类物种 | 表征大西洋鲑皮肤中推定间充质基质细胞在健康和伤口愈合状态下的转录组特征 | 大西洋鲑皮肤中的推定间充质基质细胞（成纤维细胞样成体干细胞） | 空间转录组学 | 伤口愈合 | 单细胞核测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 317 | 2025-10-07 |
E3 ubiquitin ligase TRIM38 regulates macrophage polarization to reduce hepatic inflammation by interacting with HSPA5
2025-Apr-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114662
PMID:40300357
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研究论文 | 本研究探讨了E3泛素连接酶TRIM38通过调控巨噬细胞极化减轻肝脏炎症的分子机制 | 首次揭示TRIM38通过与HSPA5相互作用并介导其K63依赖性泛素化来稳定HSPA5，从而促进M2巨噬细胞极化 | TRIM38在肝脏其他细胞类型中的作用及其在MASLD不同阶段的具体调控机制仍需进一步研究 | 探究巨噬细胞TRIM38在代谢性肝病中的作用，寻找控制炎症的关键靶点 | 巨噬细胞极化、肝脏炎症、代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD) | 分子生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序、分子相互作用分析、泛素化检测 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | MASLD患者的肝脏巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 318 | 2025-10-07 |
InSituCor: exploring spatially correlated genes conditional on the cell type landscape
2025-Apr-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03554-1
PMID:40275395
|
研究论文 | 开发了InSituCor工具包，用于在考虑细胞类型分布的条件下探索空间转录组数据中的空间相关基因 | 能够发现无法用已知细胞类型分布解释的空间基因相关性，避免了传统方法中因细胞类型空间排列导致的伪相关 | NA | 开发空间转录组数据分析工具，识别真正有生物学意义的空间基因相关性 | 空间转录组数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 319 | 2025-10-07 |
Intratumoral microbiota predicts the response to neoadjuvant chemoimmunotherapy in triple-negative breast cancer
2025-Apr-24, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010365
PMID:40280564
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研究论文 | 本研究探讨肿瘤内微生物群在预测三阴性乳腺癌患者对新辅助化疗免疫治疗反应中的作用 | 首次发现肿瘤内微生物群多样性和负荷与治疗反应相关，并开发了基于微生物群的预测模型 | 样本量相对有限(89例)，且仅针对三阴性乳腺癌患者 | 探索肿瘤内微生物群作为三阴性乳腺癌新辅助化疗免疫治疗反应预测标志物的价值 | 早期三阴性乳腺癌女性患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 16S rDNA测序,单细胞转录组测序,机器学习 | 机器学习模型 | 微生物组数据,单细胞转录组数据,临床数据 | 89例早期三阴性乳腺癌患者 | NA | 16S rDNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 320 | 2025-10-07 |
Comprehensive immunogenomic landscape analysis unveils CD33 + myeloid cell-driven immunomodulatory signatures in melanoma development
2025-Apr-16, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.155981
PMID:40300524
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研究论文 | 通过整合孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序技术，系统揭示了CD33+髓系细胞在黑色素瘤发展中的免疫调节作用 | 首次结合孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序，系统阐明CD33+髓系细胞通过补体级联和趋化因子信号通路驱动黑色素瘤免疫微环境失调的机制 | 研究主要基于遗传关联分析和计算反卷积，需要进一步实验验证CD33+髓系细胞的具体功能机制 | 探索免疫细胞群体与癌症发展之间的因果关系，特别关注黑色素瘤中的免疫调节特征 | 612种免疫细胞特征和91种癌症类型的全基因组关联研究数据，黑色素瘤样本中的髓系细胞亚群 | 计算生物学 | 黑色素瘤 | 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序, 计算反卷积分析 | NA | 基因组关联数据, 单细胞RNA测序数据, 癌症基因组图谱数据 | 612种免疫细胞特征和91种癌症类型的GWAS数据，TCGA黑色素瘤队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |