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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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261 | 2025-05-03 |
Autophagy disruption and mitochondrial stress precede photoreceptor necroptosis in multiple mouse models of inherited retinal disorders
2025-Apr-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59165-8
PMID:40301324
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了遗传性视网膜疾病(IRDs)中光感受器细胞死亡的共同分子通路 | 发现了不同遗传性视网膜疾病模型中光感受器细胞死亡的共同早期缺陷,即自噬和线粒体损伤,并指出这些缺陷会引发后期疾病阶段的坏死性凋亡 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类患者中验证 | 寻找适用于多种遗传性视网膜疾病的广谱治疗方法 | 遗传性视网膜疾病(IRDs)中的光感受器细胞 | 遗传学与分子生物学 | 遗传性视网膜疾病 | 单细胞转录组学 | 小鼠模型 | 转录组数据 | 多种遗传性和功能性不同的IRD小鼠模型 |
262 | 2025-05-03 |
UHRF1-mediated epigenetic reprogramming regulates glycolysis to promote progression of B-cell acute lymphoblastic leukemia
2025-Apr-29, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07532-0
PMID:40301374
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术揭示了UHRF1在B细胞急性淋巴细胞白血病进展中的作用及其分子机制 | 发现UHRF1通过甲基化修饰抑制SFRP5表达,激活WNT5A-P38 MAPK-HK2信号轴,促进有氧糖酵解,揭示了表观遗传和代谢重编程的分子机制 | 研究主要基于体外和动物模型,临床转化效果需进一步验证 | 探索B细胞急性淋巴细胞白血病进展的分子机制,寻找潜在治疗靶点 | B细胞急性淋巴细胞白血病细胞 | 肿瘤生物学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
263 | 2025-05-03 |
Single-cell transcriptome profiling of the human endometrium of patients with intrauterine adhesions
2025-Apr-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-97433-1
PMID:40301474
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较分析宫腔粘连患者和健康对照者的子宫内膜组织,揭示宫腔粘连的分子机制 | 首次在单细胞水平上对宫腔粘连患者的子宫内膜进行转录组分析,发现成纤维细胞亚群3和增殖内皮细胞的异常变化 | 样本量较小(5例子宫内膜组织),需要更大规模的研究验证结果 | 探究宫腔粘连的分子病理机制,为改善治疗提供理论基础 | 宫腔粘连患者和健康对照者的子宫内膜组织 | 数字病理学 | 妇科疾病 | scRNA-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | 5例子宫内膜组织(包含患者和对照),55,308个原代子宫内膜细胞 |
264 | 2025-05-03 |
Systematic evaluation of the isolated effect of tissue environment on the transcriptome using a single-cell RNA-seq atlas dataset
2025-Apr-29, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11614-w
PMID:40301713
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研究论文 | 本研究开发了一个名为COSER的新数据分析框架,用于评估组织环境对转录组的独立影响 | 提出了COSER框架,利用图论列举适当的子数据集以减少统计混杂,首次系统评估了组织环境对基因表达的独立影响 | 研究仅基于Tabula Muris Senis单细胞转录组图谱数据,未验证其他物种或数据集 | 评估组织环境对基因表达的独立影响 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 图论模型 | 单细胞转录组数据 | Tabula Muris Senis图谱数据集 |
265 | 2025-05-03 |
Integration of multi-omics data to unveil the molecular landscape and role of piRNAs in early-onset colorectal cancer
2025-Apr-29, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-04074-2
PMID:40301858
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研究论文 | 通过多组学数据整合揭示早发性结直肠癌的分子特征及piRNAs的作用 | 首次通过多组学分析揭示了PIWIL1/piRNA作为早发性结直肠癌的标志物,并发现特定piRNAs(FR019019、FR019089和FR132045)的下调与肿瘤侵袭性相关 | 研究样本量相对有限(69例EOCRC),且功能验证主要在体外进行 | 阐明早发性结直肠癌(EOCRC)的分子机制及其侵袭性表型的驱动因素 | 早发性结直肠癌(EOCRC)患者肿瘤组织 | 癌症基因组学 | 结直肠癌 | 多组学分析(基因组、表观基因组、转录组)、RNA-seq、scRNA-seq、功能实验 | NA | 基因组数据、表观遗传数据、转录组数据 | 515例(69例EOCRC和446例LOCRC) |
266 | 2025-05-03 |
SpaNorm: spatially-aware normalization for spatial transcriptomics data
2025-Apr-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03565-y
PMID:40301877
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research paper | 开发了一种名为SpaNorm的空间感知归一化方法,用于处理空间转录组数据 | 首个同时建模文库大小效应和潜在生物学效应,并分离这些效应的空间感知归一化方法 | 未提及具体局限性 | 解决空间转录组数据归一化中的挑战 | 空间转录组数据 | digital pathology | NA | spatial transcriptomics | SpaNorm | spatial transcriptomics data | 27个组织样本,来自6个数据集,涵盖4种技术平台 |
267 | 2025-05-03 |
Inhibition of adenosine/A2A receptor signaling suppresses dermal fibrosis by enhancing fatty acid oxidation
2025-Apr-29, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02210-2
PMID:40301970
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research paper | 研究探讨了腺苷/A2A受体信号通过增强脂肪酸氧化抑制皮肤纤维化的机制 | 揭示了腺苷代谢-A2A受体轴与脂肪酸氧化在系统性硬化症相关皮肤纤维化中的关键相互作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本数量有限 | 探索腺苷/A2A受体信号在皮肤纤维化中的作用机制 | 系统性硬化症患者的血浆样本、小鼠皮肤纤维化模型和人真皮成纤维细胞 | 医学研究 | 系统性硬化症 | 代谢组学分析、单细胞RNA测序、Seahorse能量代谢分析 | 基因敲除小鼠模型 | 血浆代谢物数据、RNA测序数据 | 35名系统性硬化症患者的血浆样本 |
268 | 2025-05-03 |
Molecular mechanisms and clinical significance of perineural invasion in malignancies: the pivotal role of tumor-associated Schwann cells in cancer progression and metastasis
2025-Apr-22, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-02729-x
PMID:40259163
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综述 | 本文综述了恶性肿瘤中神经周围侵袭(PNI)的分子机制及其临床意义,特别强调了肿瘤相关雪旺细胞(SCs)在癌症进展和转移中的关键作用 | 揭示了肿瘤相关雪旺细胞通过促进上皮-间质转化(EMT)、细胞外基质(ECM)重塑和免疫调节等机制在PNI中的关键作用,并探讨了针对神经生长因子介导的信号传导和SC-肿瘤相互作用的新兴治疗策略 | 目前对雪旺细胞的异质性及其在不同恶性肿瘤PNI中的分子亚型理解仍存在显著研究空白 | 阐明PNI的分子机制及其临床意义,探索潜在治疗靶点 | 恶性肿瘤中的神经周围侵袭(PNI)现象和肿瘤相关雪旺细胞(SCs) | 肿瘤学 | 恶性肿瘤 | 单细胞转录组学、分子分析 | NA | 分子数据、临床数据 | NA |
269 | 2025-05-03 |
Integrated genetic analysis and single cell-RNA sequencing for brain image-derived phenotypes and Parkinson's disease
2025-Apr-02, Progress in neuro-psychopharmacology & biological psychiatry
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.pnpbp.2025.111317
PMID:40081564
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研究论文 | 通过整合遗传分析和单细胞RNA测序技术,研究脑影像衍生表型与帕金森病之间的遗传和生物学联系 | 首次全面分析了624个脑影像衍生表型与帕金森病之间的遗传关联和因果关系,并利用单细胞RNA测序技术揭示了潜在的共享基因和生物学机制 | 研究结果主要基于统计关联分析,需要进一步的实验验证 | 揭示脑影像衍生表型与帕金森病之间的遗传和生物学联系 | 帕金森病患者和脑影像衍生表型 | 生物信息学 | 帕金森病 | GWAS, scRNA-seq, LDSC, 双向孟德尔随机化, MAGMA, PLACO, FUMA, Metascape | NA | 基因组数据, 单细胞RNA测序数据 | 624个脑影像衍生表型 |
270 | 2025-05-03 |
Chronic Rejection After Kidney Transplantation
2025-04-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000005187
PMID:39192468
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research paper | 该文章探讨了肾移植后慢性排斥反应的机制及潜在治疗方法 | 研究发现NK细胞在抗体介导的排斥反应中的关键作用,并探索了靶向CD38的单克隆抗体felzartamab的治疗潜力 | 目前许多临床试验结果仍为阴性,有效治疗方法尚未得到批准 | 研究肾移植后慢性排斥反应的机制及开发有效治疗方法 | 肾移植患者及相关的免疫机制 | NA | 肾移植排斥反应 | 免疫组织化学、批量转录组学、空间转录组学、功能遗传学 | NA | 分子和形态学数据 | NA |
271 | 2025-05-03 |
IL-25 Enhances B Cell Responses in Type 2 Inflammation Through IL-17RB Receptor
2025-Apr, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16472
PMID:39829150
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研究论文 | 研究IL-25通过IL-17RB受体增强B细胞在2型炎症中的反应 | 揭示了IL-25通过IL-17RB受体对B细胞的作用机制,并发现IL-17RB+ B细胞在2型炎症中具有独特的转录特征和增强的抗体产生能力 | 研究主要基于体外实验和有限的组织样本,需要进一步在体内模型中验证 | 探究IL-25受体(IL-17RB)在B细胞中的诱导和表达,以及IL-17RB表达B细胞对IL-25的反应 | 外周血来源的B细胞和鼻息肉组织中的B细胞 | 免疫学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉(CRSwNP)和其他2型炎症性疾病 | 流式细胞术、RT-PCR、单细胞RNA测序 | NA | 细胞和分子数据 | 外周血来源的B细胞和鼻息肉组织样本 |
272 | 2025-05-02 |
A Visible-Light Photocatalysis/Hydrolysis Hydrogen-Generating Nanoplatform for Dynamic Inflammation Management via Immune Metabolism Orchestration during Wound Repair
2025-Apr-30, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c00667
PMID:40117501
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研究论文 | 本研究介绍了一种通过可见光光催化/水解反应产生氢气的纳米平台,用于动态炎症管理,促进伤口修复 | 开发了一种新型的氢气生成纳米平台,实现了可控的氢气释放,并揭示了氢气在免疫代谢调控中的具体机制 | 未提及具体的临床前或临床试验结果,可能缺乏实际应用验证 | 探索氢气在动态炎症管理和伤口修复中的免疫代谢调控机制 | 炎症管理、伤口修复 | 纳米医学 | 慢性伤口 | 可见光光催化、水解反应、bulk-RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量 |
273 | 2025-05-02 |
Spatial transcriptomics: advances and challenges in peripheral nerve sheath tumor
2025-Apr-30, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf116
PMID:40305521
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
274 | 2025-05-02 |
Single-Cell Transcriptome Reveals Aquaporin-Mediated Carbon Nanosol-Induced Growth Promotion of Plants
2025-Apr-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504459
PMID:40305768
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研究论文 | 研究揭示了碳纳米溶胶通过水通道蛋白介导促进植物生长的单细胞转录组机制 | 首次在单细胞水平上解析了碳纳米溶胶促进植物生长的分子机制,并发现水通道蛋白在此过程中的关键作用 | 研究仅针对烟草根部细胞,未涉及其他植物组织或物种 | 探究碳纳米溶胶促进植物生长的分子机制 | 烟草根部细胞 | 植物分子生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 7,897个细胞(代表13种不同细胞类型) |
275 | 2025-05-02 |
Single cell RNA sequencing of haematopoietic cells in fresh and frozen human atheroma tissue
2025-Apr-29, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf014
PMID:39907372
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,比较了新鲜和冷冻保存的人类动脉粥样硬化组织中造血细胞的活性和转录组学特征 | 首次评估了冷冻保存对动脉粥样硬化组织中造血细胞单细胞RNA测序结果的影响,证实冷冻保存样本可用于大规模生物样本库建设 | 研究中颈动脉样本缺少LYVE1+巨噬细胞,可能由于手术过程中外膜层丢失所致 | 评估冷冻保存对动脉粥样硬化组织单细胞RNA测序结果的影响,探索生物样本库建设的可行性 | 人类动脉粥样硬化组织中的造血细胞 | 单细胞测序 | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | RNA测序数据 | 5对新鲜和冷冻保存的动脉粥样硬化样本(3例冠状动脉和2例颈动脉) |
276 | 2025-05-02 |
Microglia aging in the hippocampus advances through intermediate states that drive activation and cognitive decline
2025-Apr-29, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97671
PMID:40298588
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序和假时间分析,揭示了小鼠海马区小胶质细胞在衰老过程中的转录异质性,并确定了小胶质细胞衰老的中间状态 | 发现了小胶质细胞衰老的中间状态,并证明这些中间状态推动炎症激活和认知功能下降 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需验证 | 探究小胶质细胞在衰老过程中从稳态到功能障碍的进展机制 | 小鼠海马区小胶质细胞 | 神经科学 | 老年疾病 | 单细胞RNA-Seq, 假时间分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | RNA测序数据 | 成年小鼠海马区小胶质细胞 |
277 | 2025-05-02 |
Single-cell multi-dimensional data analysis decodes RNF19A-mediated drug resistance in rheumatoid arthritis fibroblast-like synoviocytes: mechanisms and biological insights
2025-Apr-28, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05707-8
PMID:40293542
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research paper | 该研究通过单细胞多维数据分析,揭示了RNF19A在类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞中介导药物耐药的机制及其生物学意义 | 首次发现RNF19A在耐药性成纤维样滑膜细胞中显著过表达,并通过泛素化降解MKP-1激活MAPK信号通路,形成正反馈循环促进药物耐药 | 研究主要基于公共单细胞转录组数据,实验验证部分可能受样本量限制 | 探索类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞药物耐药的分子机制 | 骨关节炎和类风湿关节炎滑膜组织的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 公共数据库中的骨关节炎和类风湿关节炎滑膜组织样本 |
278 | 2025-05-02 |
FOXM1 could serve as a bridge mediating prognosis and immunity for clear cell renal cell carcinoma via single-cell and bulk RNA-sequencing
2025-Apr-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02438-x
PMID:40293585
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研究论文 | 本研究探讨了FOXM1在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)中的预后和免疫调节作用 | 首次通过单细胞和批量RNA测序验证了FOXM1在ccRCC中作为预后和免疫调节桥梁的作用 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多实验验证 | 探究FOXM1在ccRCC预后和免疫治疗中的作用机制 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)组织和患者 | 癌症基因组学 | 肾细胞癌 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 免疫组化, qRT-PCR | Cox回归分析 | RNA测序数据, 临床数据 | TCGA数据库中的ccRCC样本 |
279 | 2025-05-02 |
Mapping immune cell dynamics and macrophage plasticity in breast cancer tumor microenvironment through single-cell analysis
2025-Apr-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02419-0
PMID:40293603
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研究论文 | 通过单细胞分析研究乳腺癌肿瘤微环境中免疫细胞动态和巨噬细胞可塑性 | 使用单细胞RNA测序技术和多种计算工具,全面分析乳腺癌中的免疫细胞亚群和巨噬细胞亚型,揭示了巨噬细胞亚型与乳腺癌细胞之间的潜在相互作用机制 | NA | 理解乳腺癌肿瘤微环境中免疫细胞与癌细胞之间的相互作用机制 | 乳腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞和巨噬细胞亚型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | Sc-Type, infercnv, CellChat, CytoTRACE, Monocle | 单细胞RNA测序数据 | NA |
280 | 2025-05-02 |
Epigenetic silencing of DNA sensing pathway by FOXM1 blocks stress ligand-dependent antitumor immunity and immune memory
2025-Apr-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59186-3
PMID:40295473
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研究论文 | 研究揭示了转录因子FOXM1通过表观遗传沉默DNA感知通路,抑制应激配体依赖的抗肿瘤免疫和免疫记忆的机制 | 首次发现FOXM1通过DNMT1-UHRF1复合物表观遗传沉默STING蛋白,从而抑制ULBP1表达,影响肿瘤免疫微环境 | 未涉及FOXM1在不同癌症类型中的普遍性验证 | 探究FOXM1在肿瘤免疫微环境中的作用机制 | 肿瘤细胞及其微环境 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |