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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 261 | 2025-10-07 |
Accurate fusion transcript identification from long- and short-read isoform sequencing at bulk or single-cell resolution
2025-Apr-14, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279200.124
PMID:40086881
|
研究论文 | 开发了新的计算工具CTAT-LR-Fusion,用于从长读长和短读长RNA测序数据中准确识别融合转录本 | 首个能够同时处理长读长和短读长RNA测序数据、适用于批量和单细胞水平的融合转录本检测工具 | 仅在有限数量的肿瘤细胞系和患者样本中进行了验证 | 开发高精度的融合转录本检测方法 | 肿瘤细胞系和肿瘤单细胞样本 | 生物信息学 | 癌症 | 长读长RNA测序,短读长RNA测序 | 计算工具CTAT-LR-Fusion | RNA测序数据 | 9个肿瘤细胞系、1个黑色素瘤样本和3个转移性高级别浆液性卵巢癌样本的单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 262 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis revealing mechanotransduction via the Hippo/YAP pathway in promoting fibroblast-to-myofibroblast transition and idiopathic pulmonary fibrosis development
2025-Apr-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149271
PMID:39855369
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了机械转导通过Hippo/YAP通路促进成纤维细胞向肌成纤维细胞转化及特发性肺纤维化发展的机制 | 首次结合单细胞测序和体外机械应力模型,系统阐明了机械转导通过Hippo/YAP通路在肺纤维化中的作用机制 | 研究主要基于体外细胞模型,需进一步在动物模型中验证;样本量有限 | 探索促进特发性肺纤维化发展的潜在分子机制 | IPF患者肺组织样本、健康人肺组织样本、MRC-5肺成纤维细胞系 | 单细胞生物学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 转录组测序, 基因本体富集分析, KEGG通路分析, 免疫荧光, 细胞增殖检测 | NA | 单细胞测序数据, 转录组数据, 图像数据 | IPF患者和健康人的肺组织样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 263 | 2025-10-07 |
Hypoxia Promotes Malignant Progression of Colorectal Cancer by Inducing POSTN+ Cancer-Associated Fibroblast Formation
2025-Apr, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.23882
PMID:39835715
|
研究论文 | 本研究揭示了缺氧通过诱导POSTN+癌症相关成纤维细胞形成促进结直肠癌恶性进展的机制 | 首次发现POSTN+成纤维细胞是缺氧密切相关的CAF亚型,并构建了POSTNFib缺氧相关风险预测模型 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,需要更多体内实验验证 | 探索缺氧调控结直肠癌免疫微环境的机制 | 结直肠癌患者和癌细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | 机器学习模型 | 基因表达数据, 临床病理信息 | 来自TCGA和GEO数据库的结直肠癌患者数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 264 | 2025-10-07 |
Spatial transcriptomics and single-cell RNA-sequencing revealed dendritic cell-mediated inflammation in keratoconus
2025-Apr, The ocular surface
DOI:10.1016/j.jtos.2025.01.008
PMID:39837422
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序揭示了树突状细胞介导的炎症在圆锥角膜发病机制中的作用 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术,系统揭示了圆锥角膜中炎症反应的空间异质性及树突状细胞通过IL-1β通路促进基质降解的新机制 | NA | 探究圆锥角膜的分子和细胞变异机制,特别是炎症反应在疾病发展中的作用 | 圆锥角膜组织样本 | 数字病理学 | 圆锥角膜 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 265 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals the role of immune-related autophagy in aseptic loosening of biomaterials bone-implant
2025-Apr, Biomaterials advances
IF:5.5Q2
DOI:10.1016/j.bioadv.2025.214190
PMID:39842168
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了免疫相关自噬在生物材料骨植入物无菌性松动中的作用机制 | 首次在单细胞水平揭示自噬相关基因Ctsb在无菌性松动中的下调及其对巨噬细胞凋亡和成骨细胞分化的影响 | NA | 探究免疫相关自噬在生物材料骨植入物无菌性松动机制中的作用 | 无菌性松动组织中的免疫细胞亚群(巨噬细胞和中性粒细胞) | 单细胞组学 | 骨科植入物并发症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 266 | 2025-10-07 |
M2 macrophages regulate nucleus pulposus cell extracellular matrix synthesis through the OPN-CD44 axis in intervertebral disc degeneration
2025-Apr, Osteoarthritis and cartilage
IF:7.2Q1
DOI:10.1016/j.joca.2024.12.007
PMID:39842659
|
研究论文 | 本研究揭示了M2巨噬细胞通过OPN-CD44轴调控髓核细胞胞外基质合成的机制 | 首次发现巨噬细胞通过OPN-CD44-pSMAD2/3信号通路调控椎间盘退变中髓核细胞的胞外基质合成 | 研究主要基于动物模型和体外实验,人类样本验证有限 | 探究巨噬细胞在椎间盘退变中的作用机制 | 髓核细胞、巨噬细胞、椎间盘组织 | 细胞生物学 | 椎间盘退变 | 单细胞转录组测序、细胞共培养、基因敲低 | 动物模型、细胞模型 | 基因表达数据、组织标本 | 人类髓核标本、腰椎不稳小鼠、纤维环穿刺小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 267 | 2025-10-07 |
Deciphering chondrocyte diversity in diabetic osteoarthritis through single-cell transcriptomics
2025-Apr, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学解析糖尿病骨关节炎中软骨细胞的多样性 | 在糖尿病骨关节炎中发现新型'热休克'软骨细胞亚群,并揭示其特有的分子标记和信号通路激活特征 | NA | 阐明骨关节炎与糖尿病骨关节炎在细胞和分子机制上的病理生理学差异 | 软骨细胞 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 268 | 2025-10-07 |
Insulin-like growth factor 2 as a driving force for exponential expansion and differentiation of the neonatal thymus
2025-Apr-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204347
PMID:40110795
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了胰岛素样生长因子2在新生儿胸腺扩张和分化中的关键驱动作用 | 首次发现成纤维细胞来源的IGF2是驱动新生儿胸腺皮质上皮细胞增殖和分化的关键因子,并证明这一机制在进化上具有保守性 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究胸腺从快速发育向稳态过渡的分子机制 | 小鼠和人类胸腺组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 269 | 2025-10-07 |
Chronic Rejection After Kidney Transplantation
2025-04-01, Transplantation
IF:5.3Q1
DOI:10.1097/TP.0000000000005187
PMID:39192468
|
综述 | 探讨肾脏移植后慢性排斥反应的免疫机制及新兴治疗策略 | 提出CD38单抗felzartamab通过靶向NK细胞效应功能治疗抗体介导排斥反应的新策略 | 现有临床试验结果多为阴性,felzartamab尚处于探索性二期试验阶段 | 解析肾脏移植慢性排斥的免疫机制并评估新型治疗方案的潜力 | 肾脏移植受者的慢性排斥反应过程 | 移植免疫学 | 肾脏移植排斥 | 免疫组织化学、转录组学、功能遗传学 | NA | 分子表达数据、形态学数据 | NA | NA | 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 270 | 2025-10-07 |
A Visible-Light Photocatalysis/Hydrolysis Hydrogen-Generating Nanoplatform for Dynamic Inflammation Management via Immune Metabolism Orchestration during Wound Repair
2025-Apr-30, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c00667
PMID:40117501
|
研究论文 | 本研究开发了一种可见光催化/水解产氢纳米平台,通过免疫代谢调控实现伤口修复过程中的动态炎症管理 | 首次整合可见光光催化和水解反应实现可控氢释放,并揭示了氢疗法通过线粒体应激和HIF-1α诱导糖酵解调控免疫代谢的新机制 | 未明确说明动物模型样本量及临床转化潜力 | 开发可控氢释放纳米平台并研究其在伤口修复中的免疫代谢调控机制 | 炎症微环境中的先天免疫细胞和成纤维细胞 | 纳米医学 | 慢性伤口 | 可见光光催化、水解反应、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 271 | 2025-05-02 |
Spatial transcriptomics: advances and challenges in peripheral nerve sheath tumor
2025-Apr-30, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf116
PMID:40305521
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 272 | 2025-10-07 |
Innate immune training in the neonatal response to sepsis
2025-Apr-30, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01179-5
PMID:40307728
|
研究论文 | 本研究揭示了新生儿接种卡介苗通过重编程骨髓生成增强对脓毒症免疫反应的机制 | 首次证明BCG疫苗接种通过同时重编程骨髓生成的多个方面来改善新生儿对脓毒症的生存率 | 训练免疫影响宿主保护性反应的具体机制仍未完全明确 | 探究先天免疫训练在新生儿脓毒症反应中的作用机制 | 新生儿(特别是早产儿)的免疫系统 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 273 | 2025-10-07 |
Microglia aging in the hippocampus advances through intermediate states that drive activation and cognitive decline
2025-Apr-29, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.97671
PMID:40298588
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了海马区小胶质细胞在衰老过程中经历中间状态并驱动神经炎症激活和认知衰退的机制 | 首次识别了小胶质细胞衰老的中间状态,并证明这些状态通过异时共生实验和遗传模型驱动炎症激活和认知功能下降 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明小胶质细胞在衰老过程中从稳态到功能障碍的进展机制 | 小鼠海马区小胶质细胞 | 神经科学 | 老年性疾病 | 单细胞RNA测序,假时间分析,条件性基因敲除 | 遗传小鼠模型 | 基因表达数据 | 成年小鼠生命周期和异时共生实验模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 274 | 2025-10-07 |
Autophagy disruption and mitochondrial stress precede photoreceptor necroptosis in multiple mouse models of inherited retinal disorders
2025-Apr-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59165-8
PMID:40301324
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了遗传性视网膜疾病中光感受器细胞死亡的共同分子通路 | 首次在多种遗传性视网膜疾病模型中发现自噬破坏和线粒体应激是触发光感受器坏死性凋亡的共同早期事件 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类患者中验证 | 探索遗传性视网膜疾病中光感受器细胞死亡的共同分子机制 | 人源化小鼠模型中的光感受器细胞 | 单细胞转录组学 | 遗传性视网膜疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 多种遗传性视网膜疾病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 275 | 2025-10-07 |
UHRF1-mediated epigenetic reprogramming regulates glycolysis to promote progression of B-cell acute lymphoblastic leukemia
2025-Apr-29, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07532-0
PMID:40301374
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研究论文 | 本研究揭示了UHRF1通过表观遗传调控糖代谢促进B细胞急性淋巴细胞白血病进展的分子机制 | 首次发现UHRF1-SFRP5-WNT5A-P38 MAPK-HK2信号轴在白血病糖代谢重编程中的关键作用,并鉴定出UHRF1靶向抑制剂UM164 | NA | 探索B细胞急性淋巴细胞白血病进展的分子机制,寻找改善临床预后的潜在治疗策略 | B细胞急性淋巴细胞白血病细胞 | 单细胞转录组学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 276 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome profiling of the human endometrium of patients with intrauterine adhesions
2025-Apr-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-97433-1
PMID:40301474
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序比较宫腔粘连患者与健康对照者的子宫内膜细胞 | 首次在单细胞分辨率下对宫腔粘连患者子宫内膜进行转录组分析,发现成纤维细胞亚群3的特定富集和功能特征 | 样本量较小(仅5例子宫内膜组织),需要更大规模研究验证 | 探究宫腔粘连的病理生理机制和子宫内膜微环境紊乱 | 人类子宫内膜组织 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5例子宫内膜组织(包含患者和健康对照),55,308个原代人类子宫内膜细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 277 | 2025-10-07 |
Integration of multi-omics data to unveil the molecular landscape and role of piRNAs in early-onset colorectal cancer
2025-Apr-29, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-04074-2
PMID:40301858
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研究论文 | 通过整合多组学数据揭示早发性结直肠癌的分子特征及piRNAs的作用机制 | 首次系统鉴定PIWIL1/piRNA作为EOCRC的标志物,并发现FR019089等piRNAs具有抑制肿瘤转移的功能 | 样本量相对有限(69例EOCRC),功能验证实验需进一步扩展 | 阐明早发性结直肠癌的分子机制及其侵袭性表型的驱动因素 | 515例结直肠癌患者(69例早发性,446例晚发性)的肿瘤样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 多组学分析(基因组、表观基因组、转录组)、RNA-seq、scRNA-seq、功能实验 | NA | 基因组数据、表观遗传数据、转录组数据 | 515例结直肠癌样本(69例早发性,446例晚发性) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 278 | 2025-10-07 |
Inhibition of adenosine/A2A receptor signaling suppresses dermal fibrosis by enhancing fatty acid oxidation
2025-Apr-29, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02210-2
PMID:40301970
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研究论文 | 本研究揭示了腺苷/A2A受体信号通过抑制脂肪酸氧化促进皮肤纤维化的新机制 | 首次发现腺苷/A2A受体信号轴通过抑制CREB磷酸化下调CPT1A表达,从而抑制脂肪酸氧化促进皮肤纤维化 | 样本量相对有限(35例SSc患者),机制研究主要基于动物模型和体外实验 | 探索腺苷代谢在系统性硬化症相关皮肤纤维化中的作用机制 | 系统性硬化症患者、小鼠皮肤纤维化模型、人真皮成纤维细胞 | 代谢组学 | 系统性硬化症 | 代谢组学分析、单细胞RNA测序、RNA测序、Seahorse能量代谢分析 | 基因敲除小鼠模型 | 代谢组数据、转录组数据、单细胞测序数据 | 35例SSc患者血浆样本,多种小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序、RNA测序、代谢组学 | NA | NA |
| 279 | 2025-10-07 |
Single-cell multi-dimensional data analysis decodes RNF19A-mediated drug resistance in rheumatoid arthritis fibroblast-like synoviocytes: mechanisms and biological insights
2025-Apr-28, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05707-8
PMID:40293542
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研究论文 | 本研究通过单细胞多维度数据分析揭示了RNF19A介导类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞药物耐药性的机制 | 首次发现RNF19A在耐药FLS中显著过表达,并阐明其通过泛素化降解MKP-1激活MAPK信号通路,形成正反馈循环的分子机制 | 基于公共数据库分析,需要进一步实验验证;机制研究主要在细胞水平进行 | 探索类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞药物耐药性的分子机制 | 骨关节炎和类风湿关节炎滑膜组织中的成纤维样滑膜细胞(FLS) | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 公共数据库中的骨关节炎和类风湿关节炎滑膜组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 280 | 2025-10-07 |
FOXM1 could serve as a bridge mediating prognosis and immunity for clear cell renal cell carcinoma via single-cell and bulk RNA-sequencing
2025-Apr-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02438-x
PMID:40293585
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析FOXM1在透明细胞肾细胞癌中的预后价值和免疫调节作用 | 首次通过单细胞和批量RNA测序相结合的方法,系统揭示FOXM1在ccRCC免疫微环境中的关键作用及其与免疫治疗耐药性的关联 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证FOXM1的具体作用机制 | 探讨FOXM1在透明细胞肾细胞癌预后和免疫调节中的作用 | 透明细胞肾细胞癌组织和癌旁组织 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组化, 实时定量PCR | Cox回归分析 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA数据库中的ccRCC样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |