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当前共找到 733 篇文献，本页显示第 241 - 260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-10-07 |
Construction of a Prognostic Model for Lysosome-dependent Cell Death in Gastric Cancer Based on Single-cell RNA-seq and Bulk RNA-seq Data
2025-Apr-20, Biomedical and environmental sciences : BES
IF:3.0Q2
DOI:10.3967/bes2024.159
PMID:40320925
|
研究论文 | 基于单细胞RNA-seq和bulk RNA-seq数据构建胃癌中溶酶体依赖性细胞死亡的预后模型 | 首次结合单细胞和批量RNA-seq数据识别与溶酶体依赖性细胞死亡相关的胃癌预后基因 | 研究样本量有限，功能验证实验仅针对部分基因 | 识别胃癌中与溶酶体依赖性细胞死亡相关的预后基因并构建风险模型 | 胃癌患者和胃癌细胞系 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 加权基因共表达网络分析, Cox回归分析, LASSO回归 | 风险预后模型 | 基因表达数据 | TCGA-STAD数据集和GSE183904单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 242 | 2025-10-07 |
A humanized mouse model system mimics prenatal Zika infection and reveals premature differentiation of neural stem cells
2025-Apr-16, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6033583/v1
PMID:40321761
|
研究论文 | 开发人源化小鼠模型模拟产前寨卡病毒感染及其对神经干细胞的影响 | 建立首个免疫健全的人源化小鼠模型系统，能够模拟从轻度到重度的产前寨卡病毒感染表型谱 | 动物模型与人类生理存在固有差异，需进一步验证临床转化价值 | 开发可靠且具有临床转化潜力的实验系统研究产前寨卡病毒感染机制 | 人源化小鼠模型及寨卡病毒感染后的脑组织 | 传染病学 | 先天性寨卡综合征 | 单细胞RNA测序 | 动物模型 | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 243 | 2025-10-07 |
Practical microenvironment classification in diffuse large B cell lymphoma using digital pathology
2025-Apr-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102030
PMID:40112808
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于数字病理学的弥漫性大B细胞淋巴瘤微环境分类方法 | 首次使用免疫组化标记和数字病理学建立DLBCL微环境分类算法，与转录组分类具有80%以上一致性 | 未明确说明样本量大小和研究队列的具体特征 | 开发可临床应用的DLBCL微环境分类系统 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 免疫组化、数字病理、单细胞测序、反卷积分析 | 分类算法 | 病理图像、转录组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 244 | 2025-10-07 |
A spatially resolved transcriptome landscape during thyroid cancer progression
2025-Apr-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102043
PMID:40157360
|
研究论文 | 本研究整合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，描绘了甲状腺癌进展过程中肿瘤微环境的时空动态变化 | 首次通过整合空间转录组和单细胞RNA测序揭示甲状腺癌进展中的空间动态变化，识别了三个不同的甲状腺细胞元簇和阶段特异性肿瘤边缘重塑 | NA | 探究甲状腺癌进展过程中肿瘤微环境的空间动态变化 | 甲状腺癌组织样本，包括癌旁甲状腺组织、甲状腺乳头状癌、局部晚期甲状腺乳头状癌和未分化甲状腺癌 | 空间转录组学 | 甲状腺癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 245 | 2025-10-07 |
Deconvoluting single-cell transcriptomics reveals cellular programs regulated by cell-cell communication in colorectal cancer
2025-Apr-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.09.648030
PMID:40321215
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荟萃分析 | 通过单细胞转录组数据解析结直肠癌中细胞间通讯调控的细胞程序 | 开发新型分析框架，采用分层语言建模识别反映单细胞信号状态的基因表达模块，并应用因果发现方法系统揭示配体-受体信号调控机制 | NA | 解析结直肠癌肿瘤微环境中细胞间通讯网络的分子机制 | 结直肠癌患者肿瘤微环境中的各类细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 分层语言模型，因果发现方法 | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 153名患者的279个样本 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 246 | 2025-10-07 |
De novo detection of somatic variants in high-quality long-read single-cell RNA sequencing data
2025-Apr-14, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279281.124
PMID:40107722
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研究论文 | 开发了一种名为LongSom的计算工作流程，利用高质量长读长单细胞RNA测序数据检测体细胞变异 | 无需正常样本即可从头检测体细胞变异，能够同时检测遗传和转录组变异，包括线粒体SNV、拷贝数变异和基因融合 | 需要高质量的长读长单细胞RNA测序数据，方法验证仅限于卵巢癌样本 | 重建肿瘤克隆异质性，研究癌症进化、克隆异质性和治疗耐药性 | 人类卵巢癌样本 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 长读长单细胞RNA测序 | 计算工作流程 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 247 | 2025-10-07 |
De novo antibody identification in human blood from full-length single B cell transcriptomics and matching haplotype-resolved germline assemblies
2025-Apr-14, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279392.124
PMID:40118521
|
研究论文 | 本研究通过结合全长单B细胞转录组测序和匹配的单倍型解析种系组装，从人血中鉴定新抗体 | 首次将种系IG位点基因组测序与同一供体B细胞单细胞转录组测序相结合，实现了IGH位点的完全单倍型分型组装 | 研究仅针对MMR疫苗接种后的B细胞反应，样本来源和免疫挑战类型有限 | 理解种系IG单倍型如何影响表达的抗体库 | 人类B细胞及其表达的抗体 | 免疫基因组学 | 传染病 | 单细胞全长转录组测序,基因组测序,单倍型组装 | NA | 基因组序列,转录组序列 | 来自同一供体的B细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq,基因组测序 | NA | NA |
| 248 | 2025-10-07 |
Comparative spatial transcriptomics reveals root dryland adaptation mechanism in rice and HMGB1 as a key regulator
2025-Apr-06, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.04.001
PMID:40195115
|
研究论文 | 本研究通过比较空间转录组学揭示了水稻旱地适应的根发育机制，并鉴定出HMGB1作为关键调控因子 | 首次生成水稻胚芽鞘节和根尖的空间转录组图谱，揭示旱稻根伸长和增粗的分子机制 | 研究仅聚焦于根部的特定区域，未涵盖全株的适应性机制 | 探究水稻旱地适应的分子和发育机制 | 旱稻和灌溉稻的根部组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，表型分析，细胞学分析 | NA | 空间转录组数据，表型数据 | 旱稻和灌溉稻的胚芽鞘节和根尖样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 249 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analyses of PBMCs reveal the immunological characteristics of individuals with phlegm-dampness constitution
2025-Apr, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-024-1113-3
PMID:40126771
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究痰湿体质人群外周血单个核细胞的免疫学特征 | 首次应用单细胞RNA测序技术揭示中医痰湿体质的分子免疫学基础 | 初步研究样本量有限，需要更大规模验证 | 探索中医体质分类的分子免疫学机制 | 痰湿体质人群的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 痰湿体质人群PBMC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 250 | 2025-10-07 |
SLC27A2 marks lipid peroxidation in nasal epithelial cells driven by type 2 inflammation in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2025-Apr, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01440-1
PMID:40195539
|
研究论文 | 本研究揭示了SLC27A2/FATP2通过介导脂质过氧化在慢性鼻窦炎伴鼻息肉发病机制中的关键作用 | 首次发现SLC27A2标记鼻息肉上皮细胞中的脂质过氧化，并阐明其与2型炎症的关联机制 | 研究主要聚焦于分子机制，临床转化应用仍需进一步验证 | 探究慢性鼻窦炎伴鼻息肉的发病分子机制 | 鼻息肉上皮细胞 | 分子生物学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 251 | 2025-10-07 |
Integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq data identifies BHLHE40 as a key gene in pancreatic cancer progression and gemcitabine resistance
2025-Apr, Seminars in oncology
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.seminoncol.2025.152338
PMID:40250076
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，鉴定BHLHE40作为胰腺癌进展和吉西他滨耐药的关键基因 | 首次发现BHLHE40通过调控SAT1促进胰腺癌化疗耐药和免疫逃逸的分子机制 | 基于公共数据库分析，需要实验验证BHLHE40靶向治疗的具体效果 | 研究胰腺导管腺癌进展和化疗耐药的分子机制，寻找新的治疗靶点 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本和公共数据库数据 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,ChIP-seq,多组学分析 | NA | 基因表达数据,表观遗传数据,临床数据 | TCGA和GEO公共数据库中的胰腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 252 | 2025-10-07 |
Identification of novel hub gene and biological pathways associated with ferroptosis in In-Stent restenosis
2025-Apr-15, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149287
PMID:39880339
|
研究论文 | 通过整合分析GEO数据库和单细胞测序数据，识别支架内再狭窄中铁死亡相关的关键基因和生物通路 | 首次将铁死亡机制与支架内再狭窄联系起来，鉴定SP1作为关键调控因子并构建ceRNA调控网络 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 揭示铁死亡在血管平滑肌细胞调控新生内膜形成中的分子靶点 | 支架内再狭窄患者数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 253 | 2025-10-07 |
Single-cell Rapid Capture Hybridization sequencing reliably detects isoform usage and coding mutations in targeted genes
2025-Apr-14, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279322.124
PMID:39794120
|
研究论文 | 开发了一种单细胞快速捕获杂交测序方法，用于可靠检测目标基因的异构体使用和编码突变 | 开发了scRaCH-seq方法，通过探针面板捕获目标转录本，结合长读长测序技术实现对特定基因突变状态和转录本使用的深度分析 | 方法主要针对目标基因进行分析，可能无法覆盖全转录组的复杂性 | 开发高特异性、高效率的单细胞长读长测序方法，用于分析目标基因的突变状态和转录本使用 | 慢性淋巴细胞白血病患者的单细胞样本 | 单细胞基因组学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞长读长测序，快速捕获杂交测序 | NA | 单细胞cDNA，长读长测序数据 | NA | Oxford Nanopore Technologies | 单细胞RNA-seq，长读长测序 | Oxford Nanopore平台 | 使用条形码引物进行混合和高效测序 |
| 254 | 2025-10-07 |
Deficiency of Secreted Phosphoprotein 1 Alleviates Hyperoxia-induced Bronchopulmonary Dysplasia in Neonatal Mice
2025-Apr, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02088-1
PMID:38951356
|
研究论文 | 本研究探讨分泌磷蛋白1(SPP1)在新生儿高氧诱导支气管肺发育不良中的作用机制 | 首次揭示SPP1通过PI3K-AKT和ERK/MAPK通路调控氧化应激和炎症反应加剧BPD进展 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究SPP1在支气管肺发育不良发病机制中的作用 | 新生小鼠、肺泡肌成纤维细胞、BPD患者样本 | 分子生物学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序, GO分析, KEGG富集分析 | NA | 基因表达数据, 细胞功能数据 | 新生小鼠模型和细胞模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 255 | 2025-10-07 |
High expression of SERPINE1 and CTSL in keratinocytes in pressure injury caused by ischemia-reperfusion injury
2025-Apr, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2025.102746
PMID:39864211
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据分析识别缺血再灌注损伤导致的压力性损伤潜在生物标志物 | 首次整合转录组测序、单细胞测序数据库和GeneCards数据库，结合三种机器学习算法识别SERPINE1和CTSL作为压力性损伤的新型生物标志物 | 研究仅基于大鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探索缺血再灌注损伤导致压力性损伤的分子机制和生物标志物 | 压力性损伤大鼠模型皮肤组织 | 生物信息学 | 压力性损伤 | 转录组测序, 单细胞测序, 免疫组织化学, 机器学习 | 三种机器学习算法 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 压力性损伤大鼠模型 | NA | 转录组测序, 单细胞测序 | NA | NA |
| 256 | 2025-10-07 |
Trends in Research of Odontogenic Keratocyst and Ameloblastoma
2025-Apr, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241282256
PMID:39876078
|
综述 | 本文综述了牙源性角化囊肿和成釉细胞瘤研究的最新进展与技术趋势 | 整合单细胞组学、空间转录组学、三维培养技术和人工智能在牙源性肿瘤研究中的创新应用 | 牙源性角化囊肿的可靠体外和体内模型仍然稀缺 | 总结牙源性角化囊肿和成釉细胞瘤研究的最新进展与发展趋势 | 牙源性角化囊肿和成釉细胞瘤 | 数字病理学 | 口腔颌面部肿瘤 | 单细胞组学, 空间转录组学, 三维培养, 人工智能 | 机器学习, 深度学习 | 影像组学, 病理组学 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 257 | 2025-10-07 |
Transcriptome associated with single-cell analysis reveal the role of S-palmitoylation in coronary artery disease
2025-Apr-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-99648-8
PMID:40307438
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研究论文 | 通过生物信息学方法结合单细胞测序分析，揭示S-棕榈酰化在冠状动脉疾病中的关键作用 | 首次通过整合差异表达基因、WGCNA分析和单细胞测序，鉴定出CXCL12、KRTAP4-7和PPP2R2B作为CAD中关键的棕榈酰化枢纽基因 | 研究主要基于生物信息学分析，需要实验验证来确认机制 | 阐明S-棕榈酰化在冠状动脉疾病中的作用机制 | 冠状动脉疾病相关的基因和细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，WGCNA，PPI网络分析，机器学习，免疫浸润分析 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 基于GSE113079和GSE121893数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 258 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing unveils the transcriptomic landscape of castration-resistant prostate cancer-associated fibroblasts and their association with prognosis and immunotherapy response
2025-Apr-30, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14212-x
PMID:40307786
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示去势抵抗性前列腺癌相关成纤维细胞的转录组特征及其与预后和免疫治疗反应的关系 | 首次在单细胞水平揭示CRPC-CAFs的转录组特征，发现TGF-β信号通路和ECM重塑功能上调，并证实抗TGF-β治疗可增强免疫治疗效果 | 需要进一步验证CRPC-CAFs作为治疗靶点的临床可行性 | 探究去势抵抗性前列腺癌相关成纤维细胞的分子特征及其在肿瘤进展和免疫治疗中的作用 | 前列腺癌相关成纤维细胞(CAFs)，特别是去势抵抗性前列腺癌(CRPC)中的CAFs | 数字病理 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，bulk RNA-seq，基因调控网络分析 | NA | 单细胞转录组数据，批量RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 259 | 2025-10-07 |
Multiple-omics analysis of aggrephagy-related cellular patterns and development of an aggrephagy-related signature for hepatocellular carcinoma
2025-Apr-30, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-025-03816-z
PMID:40307857
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研究论文 | 通过多组学分析构建了肝细胞癌中聚集自噬相关特征并评估其临床意义 | 首次在肝细胞癌中系统分析聚集自噬相关基因，结合单细胞转录组数据揭示其在肿瘤微环境中的细胞特异性表达模式 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证机制 | 探索聚集自噬在肝细胞癌中的调控机制和临床意义 | 肝细胞癌患者样本和肿瘤微环境细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 组织芯片 | Cox回归, LASSO回归, AUCell算法 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | TCGA和GEO数据库的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 260 | 2025-10-07 |
High-resolution single-cell RNA-seq data and heterogeneity analysis of human ESCs and ffEPSCs
2025-Apr-22, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-05024-6
PMID:40263373
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研究论文 | 通过对无饲养层扩展多能干细胞和人类胚胎干细胞进行单细胞转录组分析，揭示多能性异质性和早期发育机制 | 首次结合Smart-seq2单细胞RNA测序和T2T数据库的重复序列分析，揭示了从原始多能性向扩展多能状态转变的关键分子通路和阶段特异性重复元件 | NA | 理解人类早期发育和多能性细胞异质性 | 无饲养层扩展多能干细胞(ffEPSCs)和人类胚胎干细胞(ESCs) | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 重复序列分析 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | Smart-seq2 | Smart-seq2单细胞RNA测序技术 |