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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 241 | 2025-05-10 |
Identifying Aberrant 1CM-Related Pathways by Multi-Omics Analysis and Validating Tumor Inhibitory Effect of One-Carbon Donor Betaine in Gastric Cancer
2025-Apr-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083841
PMID:40332533
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研究论文 | 通过多组学分析识别胃癌中异常的1CM相关通路,并验证一碳供体甜菜碱对胃癌的抑制作用 | 首次通过多组学联合分析揭示胃癌中1CM相关通路的异常激活,并发现甜菜碱作为一碳供体对胃癌细胞的抑制作用 | 样本量有限,特别是转录组测序仅使用了6对组织样本,需要更大规模的验证 | 阐明胃癌中代谢重编程的分子机制,特别是1CM相关通路的作用 | 胃癌患者和健康个体的血浆样本、胃癌组织 | 代谢组学 | 胃癌 | 代谢组学分析、转录组测序、单细胞测序、Random Forest分析 | NA | 代谢组数据、转录组数据、单细胞数据 | 334例血浆样本(胃癌患者和健康个体)、6对组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 242 | 2025-05-10 |
The Complementary Role of Morphology in Understanding Microglial Functional Heterogeneity
2025-Apr-17, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083811
PMID:40332469
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综述 | 本文探讨了小胶质细胞在稳态、发育阶段和疾病状态下的异质性,重点整合了转录组数据和形态学分析 | 通过整合转录组数据和形态学分析,深入理解小胶质细胞的异质性及其在不同条件下的功能 | 未提及具体实验样本量或数据来源的详细描述 | 揭示小胶质细胞的异质性及其在发育和疾病中的功能 | 小胶质细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据、形态学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 243 | 2025-05-10 |
IRF5 Mediates Artery Inflammation in Salt-Sensitive Hypertension by Regulating STAT1 and STAT2 Phosphorylation to Increase ESM1 Transcription: Insights from Bioinformatics and Mechanistic Analysis
2025-Apr-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083722
PMID:40332339
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研究论文 | 本研究揭示了IRF5通过调节STAT1和STAT2的磷酸化促进ESM1转录,从而在盐敏感性高血压中调节动脉炎症的分子机制 | 首次发现IRF5通过调控STAT1和STAT2磷酸化促进ESM1转录的机制,并验证了其在盐敏感性高血压中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证较少 | 探究盐敏感性高血压中动脉炎症的分子机制 | 盐敏感性高血压小鼠模型和人/小鼠主动脉内皮细胞 | 生物信息学与分子机制研究 | 心血管疾病 | scRNA-seq, RNA测序, ChIP-qPCR, 荧光素酶报告基因检测 | DOCA-盐诱导高血压小鼠模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 未明确说明具体样本数量,包括小鼠模型和人/小鼠主动脉内皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 244 | 2025-05-10 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of the Potential Mechanisms of Follicular Development in Stra8-Deficient Mice
2025-Apr-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083734
PMID:40332359
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析探讨Stra8缺陷小鼠卵泡发育的潜在机制 | 使用单细胞RNA测序技术构建了野生型和Stra8缺陷小鼠卵巢细胞的全面转录图谱,揭示了Stra8在生殖细胞分化和卵泡形成中的复杂作用 | 研究仅限于胚胎期E14.5和E16.5阶段的小鼠卵巢细胞,未涉及其他发育阶段或其他物种 | 探讨Stra8缺陷对小鼠卵泡发育的影响及其分子机制 | 野生型和Stra8缺陷小鼠的卵巢细胞 | 生殖生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 14,755个单细胞,来自野生型和Stra8缺陷小鼠的卵巢 | NA | NA | NA | NA |
| 245 | 2025-05-10 |
Novel Link Between Myeloid-Specific Adenosine Deaminase 2 and CXCL10-CXCR3 Axis in Infectious ARDS
2025-Apr-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083678
PMID:40332245
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research paper | 研究发现骨髓特异性腺苷脱氨酶2(ADA2)与CXCL10-CXCR3轴在感染性ARDS中的新联系 | 揭示了ADA2与CXCL10及其受体CXCR3之间的新联系,以及在COVID-19相关ARDS中的关键作用 | 研究基于已发表的转录组数据,未进行实验验证 | 探究ARDS的病理生理特征及其与COVID-19的关联 | COVID-19引起的ARDS患者肺部单核细胞 | 生物医学 | ARDS, COVID-19 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 已发表数据集中的COVID-19相关ARDS肺部样本 | NA | NA | NA | NA |
| 246 | 2025-05-10 |
Integrating Machine Learning and Bulk and Single-Cell RNA Sequencing to Decipher Diverse Cell Death Patterns for Predicting the Prognosis of Neoadjuvant Chemotherapy in Breast Cancer
2025-Apr-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083682
PMID:40332226
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研究论文 | 整合机器学习和批量及单细胞RNA测序技术,解析乳腺癌新辅助化疗预后中的多种细胞死亡模式 | 首次整合机器学习和批量及单细胞RNA测序技术,构建基于程序性细胞死亡相关基因的预后风险模型,用于预测乳腺癌新辅助化疗的临床结果 | 研究依赖于回顾性数据,需要前瞻性研究进一步验证模型的预测能力 | 探索程序性细胞死亡模式与乳腺癌新辅助化疗预后之间的关系,并构建预测模型 | 921名接受新辅助化疗的乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 免疫组化(IHC) | 机器学习算法组合 | RNA测序数据, 临床数据 | 921名乳腺癌患者来自7个多中心队列 | NA | NA | NA | NA |
| 247 | 2025-05-10 |
Current Research Trends in Glioblastoma: Focus on Receptor Tyrosine Kinases
2025-Apr-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083503
PMID:40332008
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review | 本文综述了当前胶质母细胞瘤(GBM)研究中受体酪氨酸激酶(RTK)的研究趋势及其在多组学方法中的应用 | 整合多组学技术(包括基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学)来全面理解RTK在GBM中的作用,揭示了新的治疗靶点和生物标志物 | RTK信号通路的复杂性需要更广泛的整合视角,目前的研究仍面临挑战 | 通过多组学方法提高GBM患者的诊断准确性和治疗效果 | 胶质母细胞瘤(GBM)及其受体酪氨酸激酶(RTK)信号通路 | digital pathology | glioblastoma | multi-omics (genomics, transcriptomics, proteomics, metabolomics), single-cell transcriptomics | NA | molecular data (genomic, transcriptomic, proteomic, metabolomic) | NA | NA | NA | NA | NA |
| 248 | 2025-05-10 |
Stress-Induced Cholesterol Metabolic Dysregulation and Differentiation Trajectory Shift in Oligodendrocytes Synergistically Drive Demyelination
2025-Apr-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083517
PMID:40332029
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、谱系追踪和功能干预,揭示了应激诱导的少突胶质细胞胆固醇代谢紊乱和分化轨迹改变共同驱动脱髓鞘的新机制 | 从少突胶质细胞的动态角度揭示了'代谢失衡、分化阻滞和免疫激活'三者协同驱动应激性脱髓鞘的新机制 | 研究仅在小鼠模型中开展,尚未在人类样本中验证 | 探究应激诱导脱髓鞘的动态调控网络 | 少突胶质细胞(OLG) | 神经科学 | 抑郁症 | 单细胞转录组学、谱系追踪 | 约束应激小鼠模型 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 249 | 2025-05-10 |
Single-Cell RNA Sequencing of Baseline Immune Profiles After Third Vaccination Associated with Subsequent SARS-CoV-2 Infection in Naïve Individuals
2025-Apr-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083494
PMID:40331973
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析疫苗接种后基线免疫特征与后续SARS-CoV-2感染的关系 | 揭示了疫苗接种后长期保护与突破性感染个体基线免疫亚群的分子特征差异 | 样本来自先前纵向研究,可能受限于原始研究设计 | 识别与增强SARS-CoV-2保护相关的分子特征 | 接种ChAdOx1/ChAdOx1/BNT162b2疫苗后未感染和突破性感染个体 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 酶联免疫斑点试验(ELISPOT) | NA | 基因表达数据 | 来自先前纵向研究的受试者样本(数量未明确说明) | NA | NA | NA | NA |
| 250 | 2025-05-08 |
A Spatial Multi-Omic Framework Identifies Gliomas Permissive to TIL Expansion
2025-Apr-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6314842/v1
PMID:40313763
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研究论文 | 该研究通过多模态分析方法识别了允许肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)扩增的胶质瘤的空间和分子特征 | 整合了多种高通量技术(如单细胞RNA测序、空间蛋白质组学等)进行多模态分析,揭示了TIL扩增的基因组和空间决定因素 | 研究主要针对高级别胶质瘤,结果在其他免疫排斥性癌症中的普适性需要进一步验证 | 识别TIL扩增的基因组和空间决定因素,为基于T细胞的免疫治疗提供选择平台 | 高级别胶质瘤 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 光谱流式细胞术、TCR测序、单细胞RNA-seq、Xenium转录组学、CODEX空间蛋白质组学 | NA | 多组学数据(基因组、转录组、蛋白质组) | 未明确提及具体样本数量,但涉及高级别胶质瘤的TIL生成与非生成肿瘤对比 | NA | NA | NA | NA |
| 251 | 2025-05-07 |
Global and Current Research Trends of Single-Cell Sequencing in Cancer: A Bibliometric and Visualization Study
2025-Apr-18, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67880
PMID:40323789
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研究论文 | 本文通过文献计量学方法分析了2010年至2023年间单细胞测序在癌症研究中的全球趋势、合作网络和知识传播 | 首次全面分析了单细胞测序在癌症研究中的全球趋势和合作网络,识别了关键研究领域和未来研究方向 | 研究仅基于Web of Science数据库,可能未涵盖所有相关文献 | 阐明单细胞测序在癌症研究中的发展趋势、合作模式和知识传播 | 单细胞测序在癌症研究中的应用 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 文献数据 | 5,680篇出版物,涉及34,074位作者、3,129个机构和75个国家 | NA | NA | NA | NA |
| 252 | 2025-10-07 |
Tumor-infiltrating mast cells as potential chemoimmunotherapy enhancer in triple-negative breast cancer
2025-Apr-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011899
PMID:40306958
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研究论文 | 本研究通过整合小鼠和人类单细胞测序数据,揭示了肿瘤浸润肥大细胞在TNBC肿瘤免疫微环境中的关键调控作用 | 首次发现肿瘤浸润肥大细胞通过富集和激活多种免疫细胞群发挥抗肿瘤作用,为TNBC的化疗免疫联合治疗提供了新靶点 | NA | 探索三阴性乳腺癌肿瘤免疫微环境中细胞动态与临床反应的关系 | 三阴性乳腺癌的肿瘤免疫微环境细胞 | 单细胞分析 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 253 | 2025-10-07 |
Construction of a Prognostic Model for Lysosome-dependent Cell Death in Gastric Cancer Based on Single-cell RNA-seq and Bulk RNA-seq Data
2025-Apr-20, Biomedical and environmental sciences : BES
IF:3.0Q2
DOI:10.3967/bes2024.159
PMID:40320925
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研究论文 | 基于单细胞RNA-seq和bulk RNA-seq数据构建胃癌中溶酶体依赖性细胞死亡的预后模型 | 首次结合单细胞和批量RNA-seq数据识别与溶酶体依赖性细胞死亡相关的胃癌预后基因 | 研究样本量有限,功能验证实验仅针对部分基因 | 识别胃癌中与溶酶体依赖性细胞死亡相关的预后基因并构建风险模型 | 胃癌患者和胃癌细胞系 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 加权基因共表达网络分析, Cox回归分析, LASSO回归 | 风险预后模型 | 基因表达数据 | TCGA-STAD数据集和GSE183904单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 254 | 2025-10-07 |
A humanized mouse model system mimics prenatal Zika infection and reveals premature differentiation of neural stem cells
2025-Apr-16, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6033583/v1
PMID:40321761
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研究论文 | 开发人源化小鼠模型模拟产前寨卡病毒感染及其对神经干细胞的影响 | 建立首个免疫健全的人源化小鼠模型系统,能够模拟从轻度到重度的产前寨卡病毒感染表型谱 | 动物模型与人类生理存在固有差异,需进一步验证临床转化价值 | 开发可靠且具有临床转化潜力的实验系统研究产前寨卡病毒感染机制 | 人源化小鼠模型及寨卡病毒感染后的脑组织 | 传染病学 | 先天性寨卡综合征 | 单细胞RNA测序 | 动物模型 | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 255 | 2025-10-07 |
Practical microenvironment classification in diffuse large B cell lymphoma using digital pathology
2025-Apr-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102030
PMID:40112808
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研究论文 | 本研究开发了一种基于数字病理学的弥漫性大B细胞淋巴瘤微环境分类方法 | 首次使用免疫组化标记和数字病理学建立DLBCL微环境分类算法,与转录组分类具有80%以上一致性 | 未明确说明样本量大小和研究队列的具体特征 | 开发可临床应用的DLBCL微环境分类系统 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 免疫组化、数字病理、单细胞测序、反卷积分析 | 分类算法 | 病理图像、转录组数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 256 | 2025-10-07 |
A spatially resolved transcriptome landscape during thyroid cancer progression
2025-Apr-15, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102043
PMID:40157360
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研究论文 | 本研究整合空间转录组学和单细胞RNA测序技术,描绘了甲状腺癌进展过程中肿瘤微环境的时空动态变化 | 首次通过整合空间转录组和单细胞RNA测序揭示甲状腺癌进展中的空间动态变化,识别了三个不同的甲状腺细胞元簇和阶段特异性肿瘤边缘重塑 | NA | 探究甲状腺癌进展过程中肿瘤微环境的空间动态变化 | 甲状腺癌组织样本,包括癌旁甲状腺组织、甲状腺乳头状癌、局部晚期甲状腺乳头状癌和未分化甲状腺癌 | 空间转录组学 | 甲状腺癌 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 257 | 2025-10-07 |
De novo detection of somatic variants in high-quality long-read single-cell RNA sequencing data
2025-Apr-14, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279281.124
PMID:40107722
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研究论文 | 开发了一种名为LongSom的计算工作流程,利用高质量长读长单细胞RNA测序数据检测体细胞变异 | 无需正常样本即可从头检测体细胞变异,能够同时检测遗传和转录组变异,包括线粒体SNV、拷贝数变异和基因融合 | 需要高质量的长读长单细胞RNA测序数据,方法验证仅限于卵巢癌样本 | 重建肿瘤克隆异质性,研究癌症进化、克隆异质性和治疗耐药性 | 人类卵巢癌样本 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 长读长单细胞RNA测序 | 计算工作流程 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 258 | 2025-10-07 |
De novo antibody identification in human blood from full-length single B cell transcriptomics and matching haplotype-resolved germline assemblies
2025-Apr-14, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279392.124
PMID:40118521
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研究论文 | 本研究通过结合全长单B细胞转录组测序和匹配的单倍型解析种系组装,从人血中鉴定新抗体 | 首次将种系IG位点基因组测序与同一供体B细胞单细胞转录组测序相结合,实现了IGH位点的完全单倍型分型组装 | 研究仅针对MMR疫苗接种后的B细胞反应,样本来源和免疫挑战类型有限 | 理解种系IG单倍型如何影响表达的抗体库 | 人类B细胞及其表达的抗体 | 免疫基因组学 | 传染病 | 单细胞全长转录组测序,基因组测序,单倍型组装 | NA | 基因组序列,转录组序列 | 来自同一供体的B细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq,基因组测序 | NA | NA |
| 259 | 2025-10-07 |
Comparative spatial transcriptomics reveals root dryland adaptation mechanism in rice and HMGB1 as a key regulator
2025-Apr-06, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.04.001
PMID:40195115
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研究论文 | 本研究通过比较空间转录组学揭示了水稻旱地适应的根发育机制,并鉴定出HMGB1作为关键调控因子 | 首次生成水稻胚芽鞘节和根尖的空间转录组图谱,揭示旱稻根伸长和增粗的分子机制 | 研究仅聚焦于根部的特定区域,未涵盖全株的适应性机制 | 探究水稻旱地适应的分子和发育机制 | 旱稻和灌溉稻的根部组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,表型分析,细胞学分析 | NA | 空间转录组数据,表型数据 | 旱稻和灌溉稻的胚芽鞘节和根尖样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 260 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analyses of PBMCs reveal the immunological characteristics of individuals with phlegm-dampness constitution
2025-Apr, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-024-1113-3
PMID:40126771
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究痰湿体质人群外周血单个核细胞的免疫学特征 | 首次应用单细胞RNA测序技术揭示中医痰湿体质的分子免疫学基础 | 初步研究样本量有限,需要更大规模验证 | 探索中医体质分类的分子免疫学机制 | 痰湿体质人群的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 痰湿体质人群PBMC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |