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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221 | 2025-10-06 |
How fish intestinal cells responded to dietary methylmercury exposure? A single-cell transcriptomic analysis
2025-Apr-15, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2025.125967
PMID:40043872
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示鱼类肠道细胞对膳食甲基汞暴露的异质性响应 | 首次在单细胞分辨率下系统解析鱼类肠道不同细胞群体对甲基汞的特异性响应机制 | 研究仅针对金头鲷单一物种,未验证其他鱼类或更广泛生物体系的普适性 | 探究膳食甲基汞暴露下鱼类肠道细胞的分子响应机制 | 金头鲷肠道细胞 | 单细胞转录组学 | 重金属毒性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 222 | 2025-10-06 |
Paradoxical Effect of Myosteatosis on the Immune Checkpoint Inhibitor Response in Metastatic Renal Cell Carcinoma
2025-Apr, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.13758
PMID:40052383
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研究论文 | 探讨肌脂肪变性对转移性肾细胞癌患者免疫检查点抑制剂疗效的差异性影响 | 首次发现肌脂肪变性在不同免疫治疗方案(PD-1抑制剂+CTLA-4抑制剂 vs PD-1抑制剂+TKI)中对预后的相反效应 | 回顾性研究设计,样本量较小(90例患者),单中心数据 | 评估低骨骼肌质量和肌脂肪变性对mRCC患者一线免疫治疗预后的影响 | 转移性肾细胞癌患者 | 肿瘤免疫学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 多变量生存分析模型 | 临床数据,单细胞RNA测序数据 | 90例mRCC患者(59例接受PD-1+CTLA-4抑制剂,31例接受PD-1+TKI治疗) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 223 | 2025-10-06 |
Single-Cell Proteomic Characterization of Drug-Resistant Prostate Cancer Cells Reveals Molecular Signatures Associated with Morphological Changes
2025-Apr, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2025.100949
PMID:40090465
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研究论文 | 本研究通过单细胞蛋白质组学技术深入表征了前列腺癌耐药细胞的蛋白质组特征及其与形态变化的关联 | 采用优化的高通量数据非依赖性采集方法实现单细胞水平蛋白质组分析,平均每个细胞鉴定超过1300种蛋白质,并发现与细胞大小变化相关的蛋白质亚群 | 研究主要聚焦于PC3细胞系,需要在更广泛的细胞模型和临床样本中验证发现 | 揭示前列腺癌耐药细胞的蛋白质组特征及其分子机制 | 前列腺癌耐药细胞和亲代PC3细胞 | 单细胞蛋白质组学 | 前列腺癌 | 单细胞蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 数据非依赖性采集 | NA | 蛋白质组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞蛋白质组学, 单细胞RNA-seq | NA | 高通量数据非依赖性采集方法,通量达每天60个样本 |
| 224 | 2025-10-06 |
Deciphering the role of pyroptosis-related genes and natural killer T cells in sepsis pathogenesis: a comprehensive bioinformatics and Mendelian randomization analysis
2025-Apr, Journal of physiology and pharmacology : an official journal of the Polish Physiological Society
IF:2.0Q3
DOI:10.26402/jpp.2025.2.10
PMID:40350654
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研究论文 | 通过生物信息学和孟德尔随机化分析揭示焦亡相关基因和自然杀伤T细胞在脓毒症发病机制中的作用 | 首次整合多组学数据和孟德尔随机化方法系统分析焦亡相关基因与NKT细胞在脓毒症中的因果关系 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步实验验证 | 阐明焦亡相关基因和自然杀伤T细胞在脓毒症发病机制中的具体作用 | 脓毒症患者基因表达数据和免疫细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 孟德尔随机化分析, 机器学习 | 机器学习, ROC分析, 生存分析 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE57065、GSE95233、GSE65682、GSE167363) | NA | 单细胞RNA测序, 基因表达分析 | NA | NA |
| 225 | 2025-10-06 |
Mycoplasma ovipnuemoniae impairs the immune response of sheep and suppresses neutrophil function by inhibiting S100A9
2025-Apr, Veterinary microbiology
IF:2.4Q1
DOI:10.1016/j.vetmic.2025.110446
PMID:40022823
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序系统分析了绵羊感染绵羊肺炎支原体后肺组织的免疫反应机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统分析绵羊肺炎支原体感染后肺组织11种细胞类型的转录组变化,并发现S100A9通过激活ERK信号通路和活性氧爆发促进中性粒细胞清除病原体的新机制 | 研究仅关注28天感染期,未探讨更长期感染效应;体外实验验证需进一步体内实验证实 | 阐明绵羊肺炎支原体感染对宿主肺部免疫系统的损伤机制 | 感染绵羊肺炎支原体的绵羊肺组织细胞 | 单细胞转录组学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 感染28天的绵羊肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 226 | 2025-05-10 |
Targeting VSIG4+ tissue-resident macrophages enhances T cell cytotoxicity and immunotherapy efficacy in cancer
2025-Apr-29, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.04.011
PMID:40339578
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研究论文 | 本研究探讨了VSIG4+组织驻留巨噬细胞在癌症中的作用及其对T细胞细胞毒性和免疫治疗效果的增强作用 | 发现VSIG4过表达的TRM衍生TAM亚群在多种癌症中存在,并揭示了VSIG4通过直接或间接方式促进免疫抑制效应的机制,同时鉴定出MEF2C作为维持VSIG4表达的关键转录因子 | 研究主要基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探索TRM衍生的TAM亚群在癌症中的作用及其对免疫治疗的影响 | VSIG4+组织驻留巨噬细胞及其衍生的TAM亚群 | 肿瘤免疫学 | 睾丸癌、肝细胞癌、肺癌、胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、谱系追踪 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 227 | 2025-05-10 |
Single-Cell RNA Sequencing Outperforms Single-Nucleus RNA Sequencing in Analyzing Pancreatic Cell Diversity and Gene Expression in Goats
2025-Apr-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083916
PMID:40332786
|
研究论文 | 本研究比较了单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq)在分析山羊胰腺细胞多样性和基因表达方面的效果 | 首次在山羊胰腺研究中比较了scRNA-seq和snRNA-seq的效果,发现scRNA-seq在检测细胞类型多样性和关键基因表达谱方面更优 | 研究仅使用了3只10日龄健康雌性山羊的胰腺组织,样本量较小 | 比较scRNA-seq和snRNA-seq在山羊胰腺研究中的效果 | 山羊胰腺组织 | 基因组学 | NA | scRNA-seq, snRNA-seq | NA | RNA测序数据 | 3只10日龄健康雌性山羊的胰腺组织 | NA | NA | NA | NA |
| 228 | 2025-05-10 |
Personalized Stem Cell-Based Regeneration in Spinal Cord Injury Care
2025-Apr-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083874
PMID:40332538
|
综述 | 本文探讨了干细胞工程和再生医学在脊髓损伤治疗中的新进展,特别是通过神经干细胞/祖细胞、诱导多能干细胞和间充质干细胞的移植 | 结合患者特异性变异、生物工程创新和转录组学引导的精准医学,定义了脊髓损伤治疗的新前沿 | 患者特异性因素如细胞衰老、遗传和表观遗传变异、损伤微环境和合并症影响干细胞疗法的疗效 | 探索干细胞疗法在脊髓损伤治疗中的临床应用 | 脊髓损伤患者 | 再生医学 | 脊髓损伤 | 单细胞转录组学、CRISPR介导的低免疫原性工程、生物材料递送平台 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 229 | 2025-05-10 |
Identifying Aberrant 1CM-Related Pathways by Multi-Omics Analysis and Validating Tumor Inhibitory Effect of One-Carbon Donor Betaine in Gastric Cancer
2025-Apr-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083841
PMID:40332533
|
研究论文 | 通过多组学分析识别胃癌中异常的1CM相关通路,并验证一碳供体甜菜碱对胃癌的抑制作用 | 首次通过多组学联合分析揭示胃癌中1CM相关通路的异常激活,并发现甜菜碱作为一碳供体对胃癌细胞的抑制作用 | 样本量有限,特别是转录组测序仅使用了6对组织样本,需要更大规模的验证 | 阐明胃癌中代谢重编程的分子机制,特别是1CM相关通路的作用 | 胃癌患者和健康个体的血浆样本、胃癌组织 | 代谢组学 | 胃癌 | 代谢组学分析、转录组测序、单细胞测序、Random Forest分析 | NA | 代谢组数据、转录组数据、单细胞数据 | 334例血浆样本(胃癌患者和健康个体)、6对组织样本 | NA | NA | NA | NA |
| 230 | 2025-05-10 |
The Complementary Role of Morphology in Understanding Microglial Functional Heterogeneity
2025-Apr-17, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083811
PMID:40332469
|
综述 | 本文探讨了小胶质细胞在稳态、发育阶段和疾病状态下的异质性,重点整合了转录组数据和形态学分析 | 通过整合转录组数据和形态学分析,深入理解小胶质细胞的异质性及其在不同条件下的功能 | 未提及具体实验样本量或数据来源的详细描述 | 揭示小胶质细胞的异质性及其在发育和疾病中的功能 | 小胶质细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据、形态学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 231 | 2025-05-10 |
IRF5 Mediates Artery Inflammation in Salt-Sensitive Hypertension by Regulating STAT1 and STAT2 Phosphorylation to Increase ESM1 Transcription: Insights from Bioinformatics and Mechanistic Analysis
2025-Apr-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083722
PMID:40332339
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研究论文 | 本研究揭示了IRF5通过调节STAT1和STAT2的磷酸化促进ESM1转录,从而在盐敏感性高血压中调节动脉炎症的分子机制 | 首次发现IRF5通过调控STAT1和STAT2磷酸化促进ESM1转录的机制,并验证了其在盐敏感性高血压中的作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证较少 | 探究盐敏感性高血压中动脉炎症的分子机制 | 盐敏感性高血压小鼠模型和人/小鼠主动脉内皮细胞 | 生物信息学与分子机制研究 | 心血管疾病 | scRNA-seq, RNA测序, ChIP-qPCR, 荧光素酶报告基因检测 | DOCA-盐诱导高血压小鼠模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 未明确说明具体样本数量,包括小鼠模型和人/小鼠主动脉内皮细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 232 | 2025-05-10 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis of the Potential Mechanisms of Follicular Development in Stra8-Deficient Mice
2025-Apr-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083734
PMID:40332359
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析探讨Stra8缺陷小鼠卵泡发育的潜在机制 | 使用单细胞RNA测序技术构建了野生型和Stra8缺陷小鼠卵巢细胞的全面转录图谱,揭示了Stra8在生殖细胞分化和卵泡形成中的复杂作用 | 研究仅限于胚胎期E14.5和E16.5阶段的小鼠卵巢细胞,未涉及其他发育阶段或其他物种 | 探讨Stra8缺陷对小鼠卵泡发育的影响及其分子机制 | 野生型和Stra8缺陷小鼠的卵巢细胞 | 生殖生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 14,755个单细胞,来自野生型和Stra8缺陷小鼠的卵巢 | NA | NA | NA | NA |
| 233 | 2025-05-10 |
Novel Link Between Myeloid-Specific Adenosine Deaminase 2 and CXCL10-CXCR3 Axis in Infectious ARDS
2025-Apr-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083678
PMID:40332245
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research paper | 研究发现骨髓特异性腺苷脱氨酶2(ADA2)与CXCL10-CXCR3轴在感染性ARDS中的新联系 | 揭示了ADA2与CXCL10及其受体CXCR3之间的新联系,以及在COVID-19相关ARDS中的关键作用 | 研究基于已发表的转录组数据,未进行实验验证 | 探究ARDS的病理生理特征及其与COVID-19的关联 | COVID-19引起的ARDS患者肺部单核细胞 | 生物医学 | ARDS, COVID-19 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 已发表数据集中的COVID-19相关ARDS肺部样本 | NA | NA | NA | NA |
| 234 | 2025-05-10 |
Integrating Machine Learning and Bulk and Single-Cell RNA Sequencing to Decipher Diverse Cell Death Patterns for Predicting the Prognosis of Neoadjuvant Chemotherapy in Breast Cancer
2025-Apr-13, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083682
PMID:40332226
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研究论文 | 整合机器学习和批量及单细胞RNA测序技术,解析乳腺癌新辅助化疗预后中的多种细胞死亡模式 | 首次整合机器学习和批量及单细胞RNA测序技术,构建基于程序性细胞死亡相关基因的预后风险模型,用于预测乳腺癌新辅助化疗的临床结果 | 研究依赖于回顾性数据,需要前瞻性研究进一步验证模型的预测能力 | 探索程序性细胞死亡模式与乳腺癌新辅助化疗预后之间的关系,并构建预测模型 | 921名接受新辅助化疗的乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 免疫组化(IHC) | 机器学习算法组合 | RNA测序数据, 临床数据 | 921名乳腺癌患者来自7个多中心队列 | NA | NA | NA | NA |
| 235 | 2025-05-10 |
Current Research Trends in Glioblastoma: Focus on Receptor Tyrosine Kinases
2025-Apr-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083503
PMID:40332008
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review | 本文综述了当前胶质母细胞瘤(GBM)研究中受体酪氨酸激酶(RTK)的研究趋势及其在多组学方法中的应用 | 整合多组学技术(包括基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学)来全面理解RTK在GBM中的作用,揭示了新的治疗靶点和生物标志物 | RTK信号通路的复杂性需要更广泛的整合视角,目前的研究仍面临挑战 | 通过多组学方法提高GBM患者的诊断准确性和治疗效果 | 胶质母细胞瘤(GBM)及其受体酪氨酸激酶(RTK)信号通路 | digital pathology | glioblastoma | multi-omics (genomics, transcriptomics, proteomics, metabolomics), single-cell transcriptomics | NA | molecular data (genomic, transcriptomic, proteomic, metabolomic) | NA | NA | NA | NA | NA |
| 236 | 2025-05-10 |
Stress-Induced Cholesterol Metabolic Dysregulation and Differentiation Trajectory Shift in Oligodendrocytes Synergistically Drive Demyelination
2025-Apr-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083517
PMID:40332029
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、谱系追踪和功能干预,揭示了应激诱导的少突胶质细胞胆固醇代谢紊乱和分化轨迹改变共同驱动脱髓鞘的新机制 | 从少突胶质细胞的动态角度揭示了'代谢失衡、分化阻滞和免疫激活'三者协同驱动应激性脱髓鞘的新机制 | 研究仅在小鼠模型中开展,尚未在人类样本中验证 | 探究应激诱导脱髓鞘的动态调控网络 | 少突胶质细胞(OLG) | 神经科学 | 抑郁症 | 单细胞转录组学、谱系追踪 | 约束应激小鼠模型 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 237 | 2025-05-10 |
Single-Cell RNA Sequencing of Baseline Immune Profiles After Third Vaccination Associated with Subsequent SARS-CoV-2 Infection in Naïve Individuals
2025-Apr-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26083494
PMID:40331973
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析疫苗接种后基线免疫特征与后续SARS-CoV-2感染的关系 | 揭示了疫苗接种后长期保护与突破性感染个体基线免疫亚群的分子特征差异 | 样本来自先前纵向研究,可能受限于原始研究设计 | 识别与增强SARS-CoV-2保护相关的分子特征 | 接种ChAdOx1/ChAdOx1/BNT162b2疫苗后未感染和突破性感染个体 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 酶联免疫斑点试验(ELISPOT) | NA | 基因表达数据 | 来自先前纵向研究的受试者样本(数量未明确说明) | NA | NA | NA | NA |
| 238 | 2025-05-08 |
A Spatial Multi-Omic Framework Identifies Gliomas Permissive to TIL Expansion
2025-Apr-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6314842/v1
PMID:40313763
|
研究论文 | 该研究通过多模态分析方法识别了允许肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)扩增的胶质瘤的空间和分子特征 | 整合了多种高通量技术(如单细胞RNA测序、空间蛋白质组学等)进行多模态分析,揭示了TIL扩增的基因组和空间决定因素 | 研究主要针对高级别胶质瘤,结果在其他免疫排斥性癌症中的普适性需要进一步验证 | 识别TIL扩增的基因组和空间决定因素,为基于T细胞的免疫治疗提供选择平台 | 高级别胶质瘤 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 光谱流式细胞术、TCR测序、单细胞RNA-seq、Xenium转录组学、CODEX空间蛋白质组学 | NA | 多组学数据(基因组、转录组、蛋白质组) | 未明确提及具体样本数量,但涉及高级别胶质瘤的TIL生成与非生成肿瘤对比 | NA | NA | NA | NA |
| 239 | 2025-05-07 |
Global and Current Research Trends of Single-Cell Sequencing in Cancer: A Bibliometric and Visualization Study
2025-Apr-18, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/67880
PMID:40323789
|
研究论文 | 本文通过文献计量学方法分析了2010年至2023年间单细胞测序在癌症研究中的全球趋势、合作网络和知识传播 | 首次全面分析了单细胞测序在癌症研究中的全球趋势和合作网络,识别了关键研究领域和未来研究方向 | 研究仅基于Web of Science数据库,可能未涵盖所有相关文献 | 阐明单细胞测序在癌症研究中的发展趋势、合作模式和知识传播 | 单细胞测序在癌症研究中的应用 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 文献数据 | 5,680篇出版物,涉及34,074位作者、3,129个机构和75个国家 | NA | NA | NA | NA |
| 240 | 2025-10-07 |
Tumor-infiltrating mast cells as potential chemoimmunotherapy enhancer in triple-negative breast cancer
2025-Apr-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011899
PMID:40306958
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研究论文 | 本研究通过整合小鼠和人类单细胞测序数据,揭示了肿瘤浸润肥大细胞在TNBC肿瘤免疫微环境中的关键调控作用 | 首次发现肿瘤浸润肥大细胞通过富集和激活多种免疫细胞群发挥抗肿瘤作用,为TNBC的化疗免疫联合治疗提供了新靶点 | NA | 探索三阴性乳腺癌肿瘤免疫微环境中细胞动态与临床反应的关系 | 三阴性乳腺癌的肿瘤免疫微环境细胞 | 单细胞分析 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |