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当前共找到 717 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-16 |
Morphogenic, molecular and cellular adaptations for unidirectional airflow in the chicken lung
2025-04-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204346
PMID:40177910
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研究论文 | 通过多尺度3D成像和单细胞转录组学，揭示了鸡肺单向气流适应性的形态发生、分子和细胞特征 | 首次阐明了鸡肺中支气管末梢融合形成副支气管的过程，并发现了一种鸡特有的KRT14阳性肺泡腔细胞类型 | 研究主要基于鸡肺，对于其他鸟类或物种的泛化性有限，且功能验证尚未深入 | 探索禽类肺单向气流的发育机制及其与哺乳动物双向呼吸肺的差异 | 鸡肺的关键发育阶段样本 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 3D图像，单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 多关键发育阶段的鸡肺样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | 10x Chromium，10x Visium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒，Stereo-seq空间转录组学 |
| 2 | 2026-05-16 |
Restorative Effects of Short-Chain Fatty Acids on Corneal Homeostasis Disrupted by Antibiotic-Induced Gut Dysbiosis
2025-04, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.11.010
PMID:39732390
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research paper | 本研究探讨了抗生素诱导的肠道菌群失调对小鼠角膜稳态的影响，并发现短链脂肪酸可恢复角膜功能 | 首次系统揭示了肠道菌群通过短链脂肪酸信号调控角膜昼夜节律基因表达、屏障完整性和神经密度的分子机制 | 未在人体样本中验证，且短链脂肪酸对无菌小鼠的治疗效果未涉及 | 研究肠道菌群失调对角膜稳态的影响及短链脂肪酸的恢复作用 | 小鼠角膜组织及肠道菌群 | digital pathology | geriatric disease | RNA-seq, single-cell sequencing | NA | gene expression data | 未明确说明样本量 | Illumina | RNA-seq, single-cell RNA-seq | Illumina NovaSeq | RNA测序和单细胞测序 |
| 3 | 2026-05-15 |
Unveiling the dynamics of B lymphocytes in systemic lupus erythematosus patients treated with belimumab through longitudinal single-cell RNA sequencing
2025-04-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keae364
PMID:39037931
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研究论文 | 通过纵向单细胞RNA测序揭示贝利木单抗治疗系统性红斑狼疮患者中B淋巴细胞的动态变化 | 首次利用纵向单细胞转录组数据详细描绘了抗BAFF治疗过程中B细胞亚群的动态变化，包括初始B细胞、过渡型B细胞和记忆B细胞的时序波动，并发现NR4A1在治疗6个月后表达升高，可能参与限制自身反应性B细胞 | 样本量较小（仅4例韩国SLE患者），且未提供更多患者异质性和长期预后的关联信息 | 探究抗BAFF治疗（贝利木单抗）对系统性红斑狼疮患者中B淋巴细胞动态的影响，揭示其免疫学机制 | 4例韩国SLE患者的外周血单个核细胞（PBMCs），以及22例日本SLE患者的批量转录组数据 | 机器学习自然语言处理数字病理学 | 自身免疫性疾病系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组、批量转录组、流式细胞术蛋白水平数据 | 4例SLE患者（纵向采集7个时间点：治疗前及治疗后2周、1、3、6、12个月），另22例日本SLE患者（批量转录组数据） | 10x Genomics、Illumina | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 10x Chromium、Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞3'测序、Illumina NovaSeq批量RNA测序 |
| 4 | 2026-05-12 |
Impaired megakaryopoiesis due to aberrant macrophage polarization via BTK/Rap1/NF-κB pathway in sepsis-induced thrombocytopenia
2025-Apr-02, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.12.048
PMID:39741411
|
research paper | 该研究揭示了脓毒症诱导的血小板减少症中，巨噬细胞通过BTK/Rap1/NF-κB通路异常极化导致巨核细胞生成受损的机制 | 首次阐明BTK/Rap1/NF-κB通路在巨噬细胞极化调控中对巨核细胞生成和血小板计数的影响，并提供单细胞RNA测序证据 | 研究主要基于小鼠模型，需在人类样本中进一步验证；未明确其他潜在信号通路的参与 | 探索脓毒症诱导的血小板减少症的发病机制，特别是巨噬细胞的作用及BTK信号通路的影响 | 脓毒症血小板减少症患者和小鼠模型中的巨噬细胞与巨核细胞 | machine learning | geriatric disease | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 脓毒症患者和小鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 5 | 2026-05-09 |
Female-biased vascular smooth muscle cell gene regulatory networks predict MYH9 as a key regulator of fibrous plaque phenotype
2025-Apr-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.28.645955
PMID:40236025
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研究论文 | 利用性别特异性基因调控网络揭示了MYH9作为女性斑块中调节纤维斑块表型的关键因子 | 首次通过性别特异性基因调控网络分析，发现MYH9在女性血管平滑肌细胞中调控纤维斑块形成 | 研究样本量有限（119名男性和32名女性），可能影响结果的普遍性 | 探究动脉粥样硬化中纤维斑块的性别差异分子机制 | 来自心脏移植供体的血管平滑肌细胞和颈动脉斑块 | 机器学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 贝叶斯网络 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 151名心脏移植供体（119名男性和32名女性）的血管平滑肌细胞样本 | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 6 | 2026-05-08 |
Single-cell Rapid Capture Hybridization sequencing reliably detects isoform usage and coding mutations in targeted genes
2025-04-14, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279322.124
PMID:39794120
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研究论文 | 开发了一种单细胞快速捕获杂交测序方法(scRaCH-seq)，结合长读长测序技术，可靠地检测目标基因的异构体使用和编码突变 | 提出了一种高特异性和高效率的单细胞靶向转录本捕获方法，适用于已存储的索引单细胞cDNA，并可整合已有的短读长RNA-seq数据 | 未明确说明局限性，但可能涉及探针设计复杂性或对特定基因的覆盖深度限制 | 开发一种单细胞长读长测序方法，实现对目标基因突变状态和转录本使用的深入分析 | 慢性淋巴细胞白血病(CLL)患者样本中TP53和SF3B1基因 | 机器学习 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞快速捕获杂交测序、长读长测序、短读长单细胞RNA测序 | NA | 单细胞cDNA测序数据 | 慢性淋巴细胞白血病患者样本（具体数量未提及） | Oxford Nanopore Technologies | 单细胞RNA测序、长读长测序 | Oxford Nanopore Technologies平台 | 使用条形码引物进行池化和高效测序的Oxford Nanopore Technologies平台 |
| 7 | 2026-05-08 |
Long-read single-cell RNA sequencing enables the study of cancer subclone-specific genotypes and phenotypes in chronic lymphocytic leukemia
2025-04-14, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279049.124
PMID:39965935
|
研究论文 | 利用长读长单细胞RNA测序技术研究慢性淋巴细胞白血病中癌症亚克隆特异性基因型与表型 | 首次采用MAS-seq长读长单细胞RNA测序技术，大幅提高转录本覆盖度，从而更有效地将细胞关联到癌症亚克隆，并发现BTK突变亚克隆常伴有额外的CLL驱动基因突变 | 样本量有限，仅涉及6名患者；技术应用尚需在更大队列中验证 | 研究携带BTK突变的癌症亚克隆及其转录组行为差异，以及与其他CLL驱动突变共存情况 | 慢性淋巴细胞白血病患者的癌亚克隆细胞 | 数字病理学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 长读长单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6名慢性淋巴细胞白血病患者 | NA | 单细胞RNA测序 | MAS-seq | 长读长单细胞RNA测序技术 |
| 8 | 2026-05-08 |
Integrating short-read and long-read single-cell RNA sequencing for comprehensive transcriptome profiling in mouse retina
2025-04-14, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279167.124
PMID:40050124
|
研究论文 | 通过整合短读长和长读长单细胞RNA测序技术，对小鼠视网膜进行全面的转录组分析，识别大量新的转录本异构体并揭示细胞类型特异性的可变剪接模式 | 首次系统比较单细胞长读长与短读长RNA测序技术，在视网膜组织中揭示了38%之前未表征的转录本异构体，并证明长读长测序在精确识别异构体方面具有优势 | NA | 建立组织样本中转录本异构体表征的高效方法，并揭示视网膜细胞类型特异性的转录本多样性 | 小鼠视网膜细胞（约30,000个细胞） | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，短读长测序，长读长测序 | NA | 测序数据 | 约30,000个小鼠视网膜细胞 | Illumina, Oxford Nanopore Technologies | 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq, Oxford Nanopore Technologies | 1.54亿条Illumina短读长和1.40亿条Oxford Nanopore Technologies长读长 |
| 9 | 2026-05-08 |
Accurate fusion transcript identification from long- and short-read isoform sequencing at bulk or single-cell resolution
2025-04-14, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279200.124
PMID:40086881
|
研究论文 | 开发了一款名为CTAT-LR-Fusion的计算工具，用于从长读长和短读长RNA测序数据中准确检测融合转录本，适用于批量或单细胞样本 | 首次开发同时兼容长读长和短读长RNA-seq数据的融合转录本检测工具，并成功应用于单细胞分辨率下的融合转录本检测，显著提高了检测敏感性和准确性 | 未提及 | 开发一种新的计算方法，以提高融合转录本检测的准确性，并应用于癌症诊断和预后 | 9种肿瘤细胞系、黑色素瘤样本和3种转移性高级别浆液性卵巢癌样本中的肿瘤单细胞 | 机器学习 | 癌症 | RNA-seq, 长读长测序, 短读长测序 | NA | 序列数据 | 9种肿瘤细胞系和多个单细胞样本 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10 | 2026-05-08 |
De novo detection of somatic variants in high-quality long-read single-cell RNA sequencing data
2025-04-14, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279281.124
PMID:40107722
|
研究论文 | 提出LongSom流程，利用高质量长读长单细胞RNA测序数据检测体细胞变异，包括单核苷酸变异、拷贝数改变和基因融合，以重建肿瘤克隆异质性 | 无需匹配正常样本即可从头检测体细胞变异，并整合细胞突变谱重新注释基于标记基因的细胞类型 | 依赖高质量长读长单细胞RNA测序数据，可能受限于数据质量和测序深度 | 开发一种无需正常样本的计算流程，利用长读长单细胞RNA测序数据检测体细胞变异，以研究癌症进化、克隆异质性和治疗耐药性 | 人类卵巢癌样本 | 机器学习 | 卵巢癌 | 长读长单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 人类卵巢癌样本（具体数量未提供） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11 | 2026-05-08 |
De novo antibody identification in human blood from full-length single B cell transcriptomics and matching haplotype-resolved germline assemblies
2025-04-14, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.279392.124
PMID:40118521
|
研究论文 | 通过结合全基因组测序和单细胞转录组测序，从人体血液中从头鉴定抗体序列，并解析匹配的单倍型种系组装 | 首次将种系免疫球蛋白位点的全基因组测序与同供体B细胞的单细胞全长转录组测序结合，实现了母源和父源V、D、J等位基因的完全解析，并从头鉴定出针对麻疹病毒的抗体 | 未提及样本量大小或具体统计验证的局限性；可能依赖于单一疫苗接种后的B细胞群体，普适性待验证 | 探究种系免疫球蛋白单倍型对表达抗体库的贡献，实现从头抗体鉴定 | 人类血液中的B细胞及其种系免疫球蛋白基因座 | 机器学习和计算生物学 | 麻疹 | 长读长测序（组装种系IG位点）、单细胞全长转录组测序（B细胞） | NA | 序列数据 | 一名供体接种MMR疫苗后的B细胞样本 | Illumina, 10x Genomics | 全基因组测序, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq, 10x Chromium | 种系IG位点的长读长测序与10x Chromium单细胞全长转录组测序结合 |
| 12 | 2025-02-15 |
A single approach, multiple insights: Harnessing spatial transcriptomics and proteomics to identify novel therapeutic targets of alcohol-associated hepatitis
2025-Apr, Alcohol, clinical & experimental research
DOI:10.1111/acer.70007
PMID:39948688
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 13 | 2026-05-06 |
High-dimensional profiling of immune responses to kidney transplant reveals heterogeneous T helper 1 and B cell effectors associated with rejection
2025-Apr, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2024.10.009
PMID:39419342
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研究论文 | 通过对肾移植后免疫应答进行高维分析，揭示了与排斥反应相关的异质性T辅助1细胞和B细胞效应器 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了肾移植排斥反应中不同内型涉及的免疫亚群多样性，并整合了表型、转录和克隆状态分析 | 信息未提供 | 探究肾移植后免疫排斥反应的机制，区分不同排斥反应内型中的免疫亚群特征 | 76名肾移植患者的血液CD4 T细胞和B细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序，T/B细胞受体测序，血浆细胞因子谱分析，批量RNA测序 | NA | 测序数据，细胞因子表达数据 | 76名肾移植受者 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 14 | 2026-05-06 |
Graft-derived extracellular vesicles transport miRNAs to modulate macrophage polarization after heart transplantation
2025-Apr, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2024.11.021
PMID:39586401
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研究论文 | 本研究利用小鼠心脏移植模型和单细胞RNA测序，揭示移植物来源的细胞外囊泡通过携带miRNA调节巨噬细胞极化，影响心脏移植后免疫排斥反应 | 首次发现移植物CD63阳性巨噬细胞来源的细胞外囊泡携带microRNA-363和microRNA-709，通过Fcho2/Notch1信号通路诱导受体脾脏M1型巨噬细胞极化，揭示了器官间免疫通讯的新机制 | 基于小鼠模型，结论在人体的适用性需进一步验证；未详细说明EV分离和表征的具体方法；未探讨其他可能参与的免疫细胞类型 | 探究心脏移植后移植物与受体脾脏之间免疫细胞相互作用的动态机制 | 小鼠心脏移植模型中的CD45免疫细胞，包括移植心脏和脾脏中的单核细胞/巨噬细胞亚群 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 非监督聚类 | 单细胞转录组数据 | 小鼠异位移植模型，具体样本量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 15 | 2026-05-06 |
Eosinophilic esophagitis drives tissue fibroblast regenerative programs toward pathologic dysfunction
2025-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.11.028
PMID:39617290
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研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序等技术，揭示嗜酸性食管炎如何驱动组织成纤维细胞从再生程序转变为病理功能障碍 | 首次通过单细胞RNA测序结合功能实验，发现EoE成纤维细胞保留软骨细胞等硬细胞再生程序但失去脂肪细胞等软细胞分化能力，并揭示CD73和ATP代谢异常在致病机制中的关键作用 | 文中未明确提及局限性 | 探究慢性嗜酸性食管炎炎症诱导病理性成纤维细胞及其功能障碍的分子机制 | 嗜酸性食管炎患者和健康对照的食管成纤维细胞 | 数字病理学 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序、荧光激活细胞分选、成纤维细胞分化与迁移实验 | NA | 单细胞转录组数据、免疫染色图像、流式细胞数据 | EoE患者与健康对照的活检样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 16 | 2026-05-06 |
Esophageal epithelial Ikkβ deletion promotes eosinophilic esophagitis in experimental allergy mouse model
2025-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.12.1070
PMID:39724973
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研究论文 | 本研究利用条件性敲除食管上皮细胞中Ikkβ的小鼠模型，探讨上皮IKKβ/NF-κB信号在嗜酸性食管炎发病机制中的作用 | 首次证明食管上皮Ikkβ缺失会促进实验性过敏小鼠模型中嗜酸性食管炎的发展，并建立了更接近人类EoE的小鼠模型 | 未提及具体局限性 | 阐明上皮IKKβ/NF-κB信号在嗜酸性食管炎发病机制中的作用 | 条件性敲除食管上皮细胞中Ikkβ的小鼠（IkkβEEC-KO小鼠） | 数字病理学 | 嗜酸性食管炎 | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | 基因表达数据, 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 17 | 2026-05-06 |
Thymic and T-cell intrinsic critical roles associated with severe combined immunodeficiency and Omenn syndrome due to a heterozygous variant (G201R) in PSMB10
2025-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.12.1082
PMID:39734035
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研究论文 | 该论文报告了一例由PSMB10基因杂合变异（G201R）导致的严重联合免疫缺陷和Omenn综合征，并揭示了该变异在胸腺和T细胞内在中的关键作用 | 首次阐明PSMB10 G201R杂合变异通过显性负效应降低免疫蛋白酶体表达，影响CD8 T细胞阳性选择、T细胞受体库多样性和自身反应性T细胞的阴性选择，并证明胸腺植入可能带来治疗益处 | 仅基于单个患者及其家族研究，样本量有限；未进行更广泛的队列验证或动物模型实验来进一步证实机制 | 对携带PSMB10杂合变异的婴儿进行免疫学和分子特征描述，以理解该变异导致严重联合免疫缺陷和Omenn综合征的机制 | 一名携带PSMB10 p.G201R杂合变异的婴儿及其父母 | 机器学习 | 免疫缺陷病 | 流式细胞术、免疫印迹、人工胸腺类器官T细胞发育、单细胞RNA测序 | NA | 生物数据 | 1名患者及其父母的外周血单核细胞、EB病毒转化B细胞、成纤维细胞和CD34+细胞；人类胸腺组织用于单细胞测序 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium平台用于人类胸腺单细胞RNA测序 |
| 18 | 2026-05-06 |
Endothelial FOSL1 drives angiotensin II-induced myocardial injury via AT1R-upregulated MYH9
2025-Apr, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-024-01410-9
PMID:39592734
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研究论文 | 本研究揭示了FOSL1通过上调MYH9促进血管紧张素II诱导的心肌损伤的分子机制 | 首次发现FOSL1直接结合MYH9启动子并激活其转录，以及FOSL1/MYH9轴在Ang II诱导的血管重塑中的关键作用 | 未说明样本大小和人类验证实验 | 探究血管紧张素II诱导心肌损伤后血管重塑的分子机制 | 小鼠心脏内皮细胞和人脐静脉内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, 双荧光素酶报告基因, 染色质免疫沉淀 | NA | 基因表达数据, 序列数据 | 小鼠和细胞样本，具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 19 | 2026-05-05 |
Cell Type Resolved Expression of Duplicate Genes Retained From Whole Genome Duplication in Atlantic salmon
2025-04-30, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evaf076
PMID:40305003
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研究论文 | 利用单细胞转录组学解析大西洋鲑全基因组复制后保留的重复基因的细胞类型特异性表达 | 首次通过单细胞转录组学技术，在细胞类型水平上研究全基因组复制事件后重复基因的表达差异和进化后果，并揭示不同细胞类型对细菌感染的转录反应差异 | 研究仅针对肝脏组织，且统计能力因细胞类型异质性而有所降低 | 理解全基因组复制事件后重复基因的细胞特异性表达及其功能与进化意义 | 大西洋鲑肝脏组织中的主要细胞类型（如肝细胞和免疫细胞） | 数字病理学 | 细菌感染（由杀鲑气单胞菌引起） | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 大西洋鲑肝脏组织样本（具体数量未在摘要中提及） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 20 | 2026-05-05 |
Evidence of off-target probe binding in the 10x Genomics Xenium v1 Human Breast Gene Expression Panel compromises accuracy of spatial transcriptomic profiling
2025-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.31.646342
PMID:40236200
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研究论文 | 研究10x Genomics Xenium平台基因表达探针组中脱靶结合对空间转录组分析准确性的影响 | 开发了Off-target Probe Tracker（OPT）软件工具，通过探针序列比对识别脱靶结合，并利用正交的空间和单细胞转录组数据验证预测结果 | 未提及具体局限性，但研究仅针对乳腺癌组织样本和特定基因面板，可能限制推广性 | 评估基于探针的空间转录组技术中脱靶结合对基因表达谱准确性的影响，提高数据生物学可解释性 | 10x Genomics Xenium v1人类乳腺癌基因表达面板中的280个基因 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组测序，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 使用已发表的乳腺癌数据集，同一肿瘤块采集的Xenium、Visium CytAssist和3'单细胞RNA-seq样本 | 10x Genomics | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 10x Xenium, 10x Visium CytAssist | 10x Genomics Xenium v1 Human Breast Gene Expression Panel, Visium CytAssist, 10x 3'单细胞RNA测序 |