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当前共找到 722 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-24 |
Human long noncoding RNA VILMIR is induced by major respiratory viral infections and modulates the host interferon response
2025-04-15, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00141-25
PMID:40130878
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研究论文 | 本研究通过大规模转录组数据分析，发现了一种新型长链非编码RNA VILMIR，它在多种主要呼吸道病毒感染后被上调，并调控宿主干扰素反应 | 首次鉴定并表征了长链非编码RNA VILMIR作为干扰素刺激基因，在流感、SARS-CoV-2和RSV感染中上调，并证明其调控宿主干扰素反应 | 研究主要基于细胞系和体外实验，体内功能和具体分子机制尚需进一步探究 | 识别在人类主要呼吸道病毒感染中起关键作用的新型长链非编码RNA靶点 | 人类上皮细胞系（如A549）、免疫细胞系（SUP-T1、THP-1）以及COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液样本 | 自然语言处理 | 呼吸道病毒感染 | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 多个细胞系及COVID-19患者样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2 | 2026-03-20 |
Transcriptional profiles of mouse oligodendrocyte precursor cells across the lifespan
2025-Apr, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-00840-2
PMID:40164771
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研究论文 | 本研究通过构建转基因小鼠品系并进行单细胞RNA测序，揭示了少突胶质前体细胞在整个生命周期中从静息到增殖和分化关键转变的转录变化 | 构建了Matn4-mEGFP转基因小鼠品系，首次在单细胞分辨率下解析了OPCs在整个生命周期中不同状态下的转录组变化，并发现衰老通过激活HIF-1α和WNT通路影响OPCs功能 | 研究主要基于小鼠模型，人体OPCs的衰老机制可能有所不同；体外药理学实验的结果需要在体内模型中进一步验证 | 探究衰老如何影响少突胶质前体细胞的增殖和分化能力，及其对髓鞘稳态和修复的影响 | 小鼠少突胶质前体细胞 | 单细胞组学 | 神经系统衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 跨多个年龄段的皮质OPCs单细胞测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3 | 2026-03-19 |
Mucosal tissue NK cells tune their function between optimal anti-pathogen activity and tissue protection
2025-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.04.647286
PMID:40291684
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研究论文 | 本研究揭示了阴道黏膜组织中NK细胞在稳态下具有独特的效应减弱和组织驻留表型，但在感染时能迅速响应并平衡抗病原体活性与组织修复功能 | 首次系统表征人类阴道组织NK细胞的独特功能表型，并发现其在HSV-2感染中兼具抗病毒应答和组织损伤限制的双重功能 | 研究主要聚焦于阴道组织，其他黏膜部位的NK细胞功能可能有所不同；小鼠模型与人类系统的完全等效性仍需进一步验证 | 探究黏膜组织NK细胞在感染过程中如何平衡抗病原体功能与组织保护作用 | 人类阴道组织NK细胞和小鼠阴道组织NK细胞 | 免疫学 | 疱疹病毒感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），高参数流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞术数据 | 人类阴道组织样本和小鼠感染模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4 | 2026-03-15 |
Integrative analysis of single-cell transcriptomics and genetic associations identify cell states associated with vascular disease
2025-04, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
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研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序数据和遗传关联分析，识别了与血管疾病相关的细胞状态 | 开发了新的计算方法整合GWAS数据与单核表达谱，揭示了VSMC和成纤维细胞在疾病中的表型连续体 | 样本量相对较小（正常n=7，动脉瘤n=9，动脉粥样硬化n=2），且仅针对人类升主动脉组织 | 识别血管疾病早期功能障碍相关的特定血管亚群和中间细胞状态 | 人类升主动脉组织（正常、动脉瘤性和动脉粥样硬化） | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 18个样本（7个正常，9个动脉瘤，2个动脉粥样硬化） | NA | 单核RNA-seq | NA | NA |
| 5 | 2026-03-14 |
Multi-omics analysis to explore the molecular mechanisms related to keloid
2025-04, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.burns.2025.107396
PMID:39874886
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探索瘢痕疙瘩的分子机制，识别了关键基因和免疫细胞参与 | 结合bulk RNA测序、孟德尔随机化、免疫浸润分析和单细胞RNA测序，首次系统识别DUSP1和HOXA5作为瘢痕疙瘩的关键枢纽基因，并揭示IL17信号通路和免疫细胞（如肥大细胞和巨噬细胞）的关键作用 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；样本来源和数量可能限制结果的普适性；多组学数据的整合分析可能存在技术偏差 | 识别瘢痕疙瘩的潜在致病机制、枢纽基因和免疫细胞参与，为靶向治疗提供新见解 | 瘢痕疙瘩组织 | 生物信息学 | 皮肤肿瘤（瘢痕疙瘩） | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 免疫浸润分析, GSEA, GSVA, 网络分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6 | 2026-03-14 |
Identification and validation of immune-related biomarkers and polarization types of macrophages in keloid based on bulk RNA-seq and single-cell RNA-seq analysis
2025-04, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.burns.2025.107413
PMID:39923303
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研究论文 | 本研究基于bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq分析，识别并验证了瘢痕疙瘩中免疫相关生物标志物及巨噬细胞极化类型 | 结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，利用WGCNA和三种机器学习方法识别出BMP1和IL1R1作为新型生物标志物，并揭示了瘢痕疙瘩中M2巨噬细胞显著增加而M1减少的极化异常 | 研究依赖于公共数据库数据，样本量可能有限，且实验验证仅通过WB和IF进行，需要进一步功能研究确认机制 | 识别瘢痕疙瘩的免疫相关生物标志物和巨噬细胞极化类型，为治疗提供新见解 | 瘢痕疙瘩组织样本 | 生物信息学 | 瘢痕疙瘩 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, WGCNA, 机器学习(LASSO, SVM-RFE, RF), 蛋白质印迹, 免疫荧光 | LASSO, SVM-RFE, 随机森林 | RNA-seq数据 | 多个GEO数据集(GSE83286, GSE212954, GSE92566, GSE90051)，具体样本数未明确说明 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7 | 2026-03-13 |
Stable isotope tracing in human plasma-like medium reveals metabolic and immune modulation of the glioblastoma microenvironment
2025-Apr-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.29.542774
PMID:37398280
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研究论文 | 本研究优化了一种结合人血浆样培养基的体外稳定同位素示踪方法，用于人胶质瘤外植体和胶质瘤干细胞系，以揭示胶质母细胞瘤微环境中的代谢和免疫调控特征 | 开发了一种在生理营养水平和完整肿瘤微环境下评估胶质瘤代谢的可行方法，结合人血浆样培养基和稳定同位素示踪技术，揭示了传统培养条件中被抑制的代谢和免疫程序 | 该方法仍为体外模型，可能无法完全模拟体内复杂的生理和免疫相互作用 | 研究胶质瘤在完整肿瘤微环境下的代谢特征及其与免疫微环境的相互作用 | 人胶质瘤外植体和胶质瘤干细胞系 | 代谢组学 | 胶质母细胞瘤 | 稳定同位素示踪技术、空间转录组学 | NA | 代谢数据、转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 8 | 2026-03-06 |
The dynamic immune behavior of primary and metastatic ovarian carcinoma
2025-Apr-25, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00818-8
PMID:40281242
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研究论文 | 本研究结合单细胞测序和空间转录组学，探索高级别浆液性卵巢癌中导致免疫抑制的分子机制 | 首次结合单细胞测序与空间转录组学技术，系统比较原发性与转移性卵巢癌的免疫微环境动态变化，并揭示上皮细胞与免疫细胞间的交互作用在免疫抑制中的关键角色 | 研究未明确说明样本量大小，且可能仅限于高级别浆液性卵巢癌亚型，未涵盖其他卵巢癌类型 | 揭示高级别浆液性卵巢癌免疫抑制的分子机制，为免疫调节药物临床试验设计提供依据 | 高级别浆液性卵巢癌患者的原发性肿瘤和网膜转移肿瘤 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9 | 2026-03-06 |
SORBET: Automated cell-neighborhood analysis of spatial transcriptomics or proteomics for interpretable sample classification via GNN
2025-Apr-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.30.573739
PMID:38260586
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研究论文 | 本文介绍了SORBET，一种几何深度学习框架，用于分析空间转录组学或蛋白质组学数据，通过图卷积网络进行可解释的样本分类 | SORBET是首个在空间转录组学数据上进行表型预测的示例，利用新颖的数据增强技术和定制可解释性分析，无需将完整细胞谱压缩为有限注释 | NA | 开发一种自动化细胞邻域分析框架，以整合空间信息与多重分子数据，准确预测表型，如免疫治疗反应 | 转移性黑色素瘤、非小细胞肺癌和结直肠癌样本 | 机器学习 | 黑色素瘤, 非小细胞肺癌, 结直肠癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | 图卷积网络(GCN) | 空间转录组学数据, 空间蛋白质组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | CosMx, Imaging Mass Cytometry (IMC), Co-detection by indexing (CODEX) | CosMx空间转录组学数据集, Imaging Mass Cytometry (IMC)和CODEX空间蛋白质组学数据集 |
| 10 | 2026-03-06 |
Mapping dynamic regulation of gene expression using single-cell transcriptomics and application to complex disease genetics
2025-Apr-10, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2024.100397
PMID:39741416
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研究论文 | 本研究开发了一种基于单细胞转录组学的遗传模型，用于量化基因表达的动态遗传调控及其细胞类型特异性，并应用于精神分裂症等复杂疾病遗传学分析 | 开发了细胞类型特异性和细胞状态调整的基因表达遗传模型，能够量化基因表达的动态遗传调控并评估其细胞类型特异性，为复杂疾病机制提供新见解 | NA | 利用单细胞转录组学数据揭示遗传变异如何影响人类生理和疾病相关的生物过程，并应用于复杂疾病遗传学研究 | 诱导多能干细胞分化为中脑神经元的单细胞转录组数据，以及英国生物库中超过1,500种表型数据 | 自然语言处理 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11 | 2026-03-06 |
An expandable synthetic library of human paired antibody sequences
2025-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012932
PMID:40258041
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研究论文 | 本文介绍了IgHuAb，一种用于高通量生成配对人类抗体序列的大型语言模型，并基于此创建了模拟自然抗体序列特征的合成抗体库SynAbLib | 开发了首个基于大型语言模型的高通量配对人类抗体序列生成方法，并构建了具有更高序列多样性的合成抗体库 | 未提及具体实验验证的抗体数量或功能活性数据 | 解决当前单细胞测序方法在配对抗体序列数据获取中的低通量和高成本问题，以更好地理解人类抗体序列的潜在多样性 | 人类抗体序列 | 自然语言处理 | NA | 单细胞测序 | 大型语言模型 | 序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 12 | 2026-03-04 |
Loss of Kmt2c / d promotes gastric cancer initiation and confers vulnerability to mTORC1 inhibition and anti-PD1 immunotherapy
2025-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.27.645747
PMID:40236091
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研究论文 | 本研究通过基因工程小鼠模型揭示了Kmt2c/d功能缺失在胃癌发生中的作用，并发现其对mTORC1抑制剂和抗PD1免疫疗法敏感 | 首次证明Kmt2c/d缺失与Pten缺失协同驱动侵袭性胃癌快速发生，并发现Kmt2c/d缺失通过调控核糖体蛋白转录和MHC-I表达，创造了mTORC1抑制剂与免疫疗法的联合治疗机会 | 研究基于小鼠模型，其结论在人类胃癌中的直接适用性需要进一步验证 | 探究Kmt2c/d基因在胃癌发生中的功能及其对治疗策略的影响 | 基因工程小鼠模型中的胃上皮细胞及由此产生的胃腺癌 | 癌症生物学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，组织学染色，基因敲除 | 基因工程小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据，组织学图像 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 13 | 2026-03-02 |
STAT3 signaling enhances tissue expansion during postimplantation mouse development
2025-Apr-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115506
PMID:40188437
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研究论文 | 本研究探讨了STAT3信号在小鼠胚胎植入后发育过程中对组织扩张的增强作用 | 揭示了STAT3在胚胎植入后发育中的时间控制作用，特别是在需要快速细胞分裂的组织中，如植入后外胚层和造血谱系 | 研究主要基于小鼠模型，人类相关性仅通过突变与矮小症的关联间接提及 | 研究STAT3信号在小鼠胚胎植入后发育过程中的功能 | 小鼠胚胎、胚胎干细胞、植入后外胚层和造血谱系 | 发育生物学 | NA | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 小鼠胚胎和胚胎干细胞样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 14 | 2026-03-02 |
Single cell RNA sequencing after moderate traumatic brain injury: effects of therapeutic hypothermia
2025-Apr-18, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03430-6
PMID:40251570
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探究了中度创伤性脑损伤后治疗性低温对脑皮层细胞类型特异性转录反应的影响 | 首次在创伤性脑损伤模型中应用单细胞RNA测序技术，全面评估治疗性低温对不同细胞亚型的特异性调控作用，揭示了温度敏感的胶质细胞和血管细胞过程在神经保护中的重要性 | 研究仅关注了损伤后24小时的时间点，未评估长期效应；样本来源于小鼠模型，可能无法完全反映人类疾病情况 | 探究治疗性低温在创伤性脑损伤后的细胞类型特异性保护机制 | C57BL/6小鼠的脑皮层组织，包括损伤周围区域 | 单细胞转录组学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | C57BL/6小鼠的脑皮层组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 15 | 2026-03-02 |
ATM-dependent DNA damage response constrains cell growth and drives clonal hematopoiesis in telomere biology disorders
2025-Apr-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI181659
PMID:40179146
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研究论文 | 本研究通过分析166名端粒生物学疾病患者的造血细胞，揭示了ATM依赖的DNA损伤应答在疾病发病机制中的关键作用，并提出了潜在的治疗干预策略 | 首次在端粒生物学疾病患者中系统性地描述了克隆性造血的特征，并利用单细胞测序等多模态方法证明了端粒功能障碍通过激活ATM依赖的DDR通路导致细胞衰老和凋亡，同时发现ATM抑制能选择性改善TBD细胞适应性 | 研究样本主要来自患者队列，缺乏大规模前瞻性验证；ATM抑制剂的长期安全性和对染色体不稳定的潜在影响仍需进一步评估 | 探究端粒生物学疾病中造血结局的分子机制，特别是克隆性造血的驱动因素 | 166名儿科和成人端粒生物学疾病患者的造血细胞 | 基因组学 | 血液系统疾病 | 单细胞测序，端粒功能障碍诱导灶分析，细胞生长测定 | NA | 基因组数据，单细胞数据 | 166名患者 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 16 | 2026-03-02 |
EcDNA-borne PVT1 fusion stabilizes oncogenic mRNAs
2025-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.01.646515
PMID:40236070
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研究论文 | 本研究揭示了染色体外DNA（ecDNA）扩增通过结构变异产生基因融合，特别是PVT1与致癌基因的融合，增强RNA稳定性并促进癌症进展 | 首次发现ecDNA上的PVT1融合通过SRSF1蛋白相互作用稳定致癌mRNA，并证明其在MYC成瘾癌症模型中的关键作用 | 未明确提及具体癌症类型或样本量限制，机制细节可能需进一步验证 | 探究ecDNA结构变异如何通过基因融合驱动癌症发展 | 人类癌症中的染色体外DNA（ecDNA）及其基因融合事件 | 基因组学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组和转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 17 | 2026-03-02 |
Timing neural development and regeneration
2025-Apr, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2025.102976
PMID:40010202
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综述 | 本文综述了哺乳动物神经祖细胞时间身份调控机制的最新进展，及其在胶质细胞向神经元重编程策略中的潜在应用 | 整合时间身份调控与促神经因子过表达以增强重编程效率和扩展神经元亚型生成谱系 | NA | 探讨神经祖细胞时间身份的调控机制及其在神经发育与再生治疗中的应用 | 哺乳动物中枢神经系统中的神经祖细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 18 | 2026-03-01 |
Mutual Regulation of Cardiovascular and Hematopoietic Development
2025-Apr-22, Current cardiology reports
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s11886-025-02236-5
PMID:40261519
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综述 | 本文探讨了心血管与造血系统在发育中的相互调控关系，特别聚焦于心内膜造血这一进化保守过程及其在心脏发育和巨噬细胞形成中的作用 | 通过单细胞RNA测序技术揭示了心内膜细胞具有独立于已知造血器官的内在造血程序，并阐明了心内膜来源巨噬细胞在心脏形态发生中的独特贡献 | NA | 探讨心血管与造血系统发育的分子机制和调控相互作用 | 心内膜造血过程、心脏发育、巨噬细胞形成 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 19 | 2026-02-19 |
Identifiability for Gaussian Processes with Holomorphic Kernels
2025-Apr, ... International Conference on Learning Representations
PMID:41695776
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研究论文 | 本文为在零附近全纯的高斯过程核开发了一个新的理论框架，以确定核参数的可识别性 | 针对在零附近全纯的核（如平方指数核、周期核和有理二次核及其组合），开发了一个新的理论框架来研究其参数可识别性，填补了现有研究主要关注Matérn型核的空白 | NA | 确定高斯过程核参数的可识别性，以支持参数在应用中的有意义的解释 | 高斯过程的核参数，特别是那些在零附近全纯的核 | 机器学习 | NA | NA | 高斯过程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20 | 2026-02-15 |
Loss of ATG7 in microglia impairs UPR, triggers ferroptosis, and weakens amyloid pathology control
2025-Apr-07, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230173
PMID:39945772
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研究论文 | 本研究探讨了在阿尔茨海默病小鼠模型中，特异性敲除小胶质细胞的Atg7基因如何通过影响未折叠蛋白反应和氧化应激，导致铁死亡，从而削弱对淀粉样斑块的控制 | 揭示了Atg7缺失通过降低未折叠蛋白反应和增加氧化应激，在小胶质细胞中诱导铁死亡的新机制，特别是在淀粉样斑块存在的蛋白毒性压力下 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；且未详细探讨Atg7缺失在其他神经退行性疾病中的普遍性 | 探究Atg7在小胶质细胞中对淀粉样斑块控制的作用机制 | 阿尔茨海默病小鼠模型中的小胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、生化分析、免疫荧光分析 | NA | RNA测序数据、生化数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |