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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
1 2026-07-24
Tolerogenic dendritic cell-mediated regulatory T cell differentiation by Chinese herbal formulation attenuates colitis progression
2025-04, Journal of advanced research IF:11.4Q1
研究论文 中药复方CDD-2103通过诱导耐受性树突状细胞分化调节性T细胞来缓解结肠炎进展 首次揭示中药复方CDD-2103通过上调氧化磷酸化相关基因促进耐受性树突状细胞积累和功能,进而增强调节性T细胞分化,并鉴定出活性成分巴马亭和黄连素 未在人体样本中验证CDD-2103的免疫调节机制,且活性成分的具体靶点及信号通路有待深入研究 探究中药复方CDD-2103及其活性成分在结肠炎小鼠模型中调节免疫耐受的机制 慢性TNBS诱导及T细胞转移诱导的Rag1-/-小鼠结肠炎模型 机器学习 结肠炎 单细胞转录组分析、液相色谱-质谱联用 NA 转录组数据 两种小鼠模型(慢性TNBS诱导和T细胞转移诱导的Rag1-/-小鼠) NA 单细胞RNA测序 NA NA
2 2026-07-23
Two duplicated GhMML3 genes coordinately control development of lint and fuzz fibers in cotton
2025-04-14, Plant communications IF:9.4Q1
research paper 本文发现两个重复的GhMML3基因通过剂量依赖性方式协同调控棉花长绒和短绒纤维的发育 首次揭示两个重复的GhMML3基因通过剂量依赖机制协同调控棉花两种纤维发育,并阐明其与关键纤维起始基因GhHD-1和GhMYB25的调控关系 未详细说明基因编辑突变体的脱靶效应评估及大田环境下的表型验证 解析棉花长绒和短绒纤维发育的遗传与分子调控机制 棉花(包括野生型J668和隐性裸籽突变体nNSM) machine learning NA CRISPR-Cas9基因编辑、基因过表达、转录组分析、单细胞RNA测序 NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据 包括J668、nNSM突变体、基因编辑突变体#mml3s及杂交后代群体 10x Genomics single-cell RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
3 2026-07-23
Multi-Omic Insight Into the Molecular Networks in the Pathogenesis of Coronary Artery Disease
2025-04, Journal of the American Heart Association IF:5.0Q1
研究论文 通过整合基因甲基化、表达和蛋白质水平的多组学数据,利用孟德尔随机化和共定位分析,识别与冠状动脉疾病相关的基因,并探讨其分子机制 创新性地结合多组学数据和孟德尔随机化方法,发现TAGLN2、APOB、GIP等基因与冠状动脉疾病风险的新关联,展示了多组学整合在揭示因果关系方面的优势 研究主要基于公开数据集,样本量有限,且未进行功能验证实验,结果可能受到混杂因素的影响 探索冠状动脉疾病的分子网络和潜在因果基因 冠状动脉疾病患者和对照组的基因甲基化、表达和蛋白质数据 机器学习 心血管疾病 孟德尔随机化,共定位分析,单细胞RNA测序 NA 多组学数据(甲基化、基因表达、蛋白质水平) 多项研究数据集,具体样本量未详述 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4 2026-07-23
Predicting Prognosis and Immunotherapy Response in Glioblastoma (GBM) With a 5-Gene CAF-Risk Signature
2025-04, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
研究论文 开发并验证了一个5基因癌症相关成纤维细胞(CAF)风险特征,用于预测胶质母细胞瘤(GBM)患者的预后和免疫治疗反应 首次构建并验证了基于CAF的5基因风险特征(ITGA5、MMP14、FN1、COL5A1和COL6A1),并证明其与免疫浸润和免疫治疗反应显著相关 摘要中未明确提及研究的局限性 探究CAF在GBM中的作用,通过开发CAF风险特征并探索其与免疫浸润和免疫治疗反应的相关性 胶质母细胞瘤(GBM)患者 机器学习 胶质母细胞瘤 RNA-seq、单细胞RNA测序 LASSO Cox回归模型 基因表达数据、临床数据 NA NA 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq NA NA
5 2026-07-10
Life-long microbiome rejuvenation improves intestinal barrier function and inflammaging in mice
2025-04-02, Microbiome IF:13.8Q1
研究论文 通过长期肠道微生物组年轻化干预,评估其对小鼠肠道屏障功能和炎症老化的改善作用 首次在非反刍哺乳动物中证明终生反复粪菌移植(FMT)可延缓衰老相关过程,并利用单细胞RNA测序揭示肠道细胞表型变化机制 研究仅在小鼠模型中进行,结果向人类转化的可行性尚未验证;未对特定细菌菌株或代谢产物进行因果验证 探索终生肠道微生物组年轻化策略是否能够延缓或预防哺乳动物的衰老进程 小鼠(年轻供体与同龄受体) 机器学习, 数字病理学 老年疾病 粪菌移植(FMT), 16S rRNA基因测序, 宏基因组学, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据, 微生物组数据 小鼠,具体数量未在摘要中提及 NA 单细胞RNA测序, 16S rRNA基因测序, 宏基因组学 NA NA
6 2026-07-10
Faecalibacterium prausnitzii-derived outer membrane vesicles reprogram gut microbiota metabolism to alleviate Porcine Epidemic Diarrhea Virus infection
2025-04-02, Microbiome IF:13.8Q1
研究论文 探讨粪杆菌外膜泡通过重编程肠道菌群代谢减轻猪流行性腹泻病毒感染的作用机制 首次发现粪杆菌外膜泡是缓解PEDV感染的主要功能成分,并揭示其通过增加磷脂酰胆碱水平、改变肠道细胞组成及抑制坏死性凋亡信号通路的新机制 研究仅基于猪仔模型,且未在人体中验证该益生菌及外膜泡的潜在应用 探究粪杆菌在减轻猪流行性腹泻病毒感染中的作用及其机制 粪杆菌及其外膜泡在PEDV感染猪仔模型中的作用 微生物组学 猪流行性腹泻 蛋白质组学、非靶向代谢组学、小RNA测序、宏基因组学、单细胞测序 NA 蛋白质、代谢物、RNA、DNA序列、单细胞数据 猪仔模型,具体数量未在摘要中提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 单细胞测序用于分析肠道细胞相对丰度
7 2026-07-05
LncRNA MIR181A1HG Deficiency Attenuates Vascular Inflammation and Atherosclerosis
2025-Apr-11, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 本研究探讨长链非编码RNA MIR181A1HG在血管炎症和动脉粥样硬化中的调控作用 首次发现MIR181A1HG通过隔离Foxp1远离目标基因启动子,激活NLRP3炎症小体,驱动血管内皮炎症和动脉粥样硬化,独立于miR-181a1/b1簇功能 未进一步研究其他潜在分子机制或临床人群样本验证 研究MIR181A1HG在调控血管炎症和动脉粥样硬化中的作用和分子机制 人类和小鼠动脉粥样硬化病变中的内皮细胞及免疫细胞 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序、荧光素酶报告基因检测、染色质免疫沉淀 NA 基因表达数据 人类和小鼠主动脉样本,MIR181A1HG敲除和过表达小鼠模型 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
8 2026-07-01
Biological sex affects gene expression and functional variation across the human genome
2025-Apr-14, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 利用480个淋巴母细胞系单细胞RNA-seq数据,鉴定人类基因组中性别偏倚表达基因及其功能变异 首次系统揭示性别对基因表达影响的广泛性,发现1200个性别偏倚基因,并建立核心基因集(21个基因)在多种组织和数据集中一致表达;通过机器学习识别关键转录因子(FOSL1、ZNF730等),发现X染色体数目调控这些因子 独立数据集的验证证据较弱,且性别偏倚eQTL复制率有限 探究生物性别如何影响人类基因组中的基因表达和功能变异 人类淋巴母细胞系及GTEx多组织样本 基因组学 自身免疫性疾病(如多发性硬化) 单细胞RNA-seq 机器学习、线性建模 单细胞转录组数据 480个淋巴母细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
9 2026-07-01
Unleashing the Power of Multiomics: Unraveling the Molecular Landscape of Peripheral Neuropathy
2025-04, Annals of clinical and translational neurology IF:4.4Q1
综述 追踪基因组技术在外周神经病变研究中的演变,强调多组学整合在揭示分子景观中的作用 全面分析新兴多组学技术(如RNA测序和蛋白质组学)与传统基因组方法的整合,推动对外周神经病变病理生理学的整体理解 多组学技术临床标准化面临挑战,需要稳健指南以最大化临床效用 综述基因组技术在外周神经病变中的应用,探索多组学整合对诊断和治疗的意义 外周神经病变的分子机制和遗传变异 自然语言处理 外周神经病变 NGS, ONT, 单细胞测序, RNA-seq, 蛋白质组学 NA 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 NA NA NA NA NA
10 2026-06-29
Crosstalk Between Gastric Cancer and Adjacent Mucosa Reveals EDN1-EDNRA-Mediated Regulation of Cancer Stemness and Immunomodulation Networks
2025-04, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序分析,揭示了胃癌与相邻黏膜(特别是胃黏膜)之间的细胞通讯网络,发现EDN1-EDNRA通路在肿瘤干细胞性和免疫调节中的关键作用 首次绘制了胃癌组织、相邻正常组织和胃黏膜之间的细胞交互图谱,并揭示了EDNRA在胃黏膜与肿瘤通讯中的新角色及其作为治疗靶点的潜力 研究主要基于公共数据集和体外实验,缺乏体内验证和更大队列样本的临床证据 探索胃癌与相邻黏膜之间的细胞通讯机制,特别是EDN1-EDNRA通路在肿瘤进展和免疫调节中的作用 胃癌组织、相邻正常组织和胃黏膜样本,以及胃癌细胞系(NCI-N87、MKN-28、GSE-1) 计算生物学, 单细胞分析 胃癌 单细胞RNA测序, 药理学抑制 NA 单细胞转录组数据 两个独立研究(GSE183904和GSE184198)的数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
11 2026-06-29
Oncolytic Virus Infection Modulates Lysine Acetyltransferase in Gliomas: Comprehensive Analysis and Experimental Validation of KAT8 in Glioma
2025-04, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2
研究论文 本文研究了溶瘤病毒EV-A71感染后胶质瘤细胞中赖氨酸乙酰转移酶8(KAT8)的表达变化,并分析了KAT8在胶质瘤中的表达、临床意义和功能 首次发现溶瘤病毒感染调节胶质瘤中的乳酰化酶,并鉴定了KAT8作为关键基因,同时通过多组学数据分析和体外实验验证了KAT8在胶质瘤中的预后价值和治疗潜力 未进行体内动物模型验证,且KAT8调控凋亡的具体分子机制未完全阐明 阐明溶瘤病毒感染后胶质瘤中乳酰化酶的表达变化,并评估KAT8作为胶质瘤生物标志物和治疗靶点的潜力 胶质瘤细胞和胶质瘤组织样本 生物信息学 胶质瘤 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 体外实验 NA 转录组学数据, 单细胞测序数据 TCGA和GTEx数据库的胶质瘤及正常脑组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
12 2026-06-26
Microvascular aberrations found in human polycystic kidneys are an early feature in a Pkd1 mutant mouse model
2025-04-01, Disease models & mechanisms IF:4.0Q1
研究论文 利用单细胞转录组学、三维成像和多模态磁共振成像技术,发现人类和多囊蛋白1突变小鼠多囊肾中的微血管异常,并揭示其早期特征 首次在人类和多囊蛋白1突变小鼠模型中共同鉴定出分子水平上独特的血液微血管亚群,并发现微血管异常出现在肾小管扩张的胎儿期,表明血管异常是早期事件 未提及具体限制信息 探究常染色体显性多囊肾病中肾脏微血管异常的起始时间和性质 人类多囊肾组织和多囊蛋白1突变小鼠肾脏 数字病理学 多囊肾病 单细胞转录组学、三维成像、几何拓扑分析、多模态磁共振成像 NA 单细胞转录组数据、图像数据 人类晚期多囊肾样本和多囊蛋白1突变小鼠出生后及胎儿肾脏样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
13 2026-06-20
Bioinformatic analysis and experimental verification reveal expansion of monocyte subsets with an interferon signature in systemic lupus erythematosus patients
2025-04-25, Arthritis research & therapy IF:4.4Q1
研究论文 通过生物信息学分析和实验验证,揭示系统性红斑狼疮患者中具有干扰素特征的单核细胞亚群扩增 首次在健康人外周血中发现SIGLEC1+IRF7+单核细胞亚群,并证实该亚群在SLE中富集且与疾病严重程度正相关 未提及具体局限性,但可能包括样本量较小、验证实验仅限于流式细胞术等 研究系统性红斑狼疮中单核细胞亚群的变化及其与干扰素特征的关系 系统性红斑狼疮患者和健康对照者的外周血单核细胞和单核细胞 生物信息学、免疫学 系统性红斑狼疮 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 转录组数据、单细胞RNA测序数据 系统性红斑狼疮患者和健康对照者的外周血样本 NA 单细胞RNA-seq, 流式细胞术 NA NA
14 2026-06-20
Bulk RNA-seq conjoined with ScRNA-seq analysis reveals the molecular characteristics of nucleus pulposus cell ferroptosis in rat aging intervertebral discs
2025-04-17, Arthritis research & therapy IF:4.4Q1
研究论文 通过批量RNA测序与单细胞RNA测序分析,揭示大鼠衰老椎间盘中髓核细胞铁死亡的特征和分子机制 首次通过单细胞RNA测序鉴定出5个髓核细胞亚群中铁死亡驱动因子ATF3以及共同分子标记Rps6+/Cxcl1- 未明确说明局限性,但基于摘要内容,可能包括样本仅来自大鼠尾部椎间盘,以及铁死亡驱动因子在其他物种中的验证不足 阐明椎间盘退变过程中髓核细胞铁死亡的关键驱动因子和细胞亚群特征 大鼠尾部椎间盘髓核组织及细胞 数字病理学 椎间盘退变 RNA-seq, ScRNA-seq NA 基因表达数据,组织染色图像 10月龄和20月龄大鼠尾椎间盘髓核组织 NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
15 2026-06-18
Single-cell transcriptomics reveals the immune mechanisms by which tonsillectomy improves clinical outcomes of recurrent Immuoglobulin A nephropathy after kidney transplant
2025-04, Molecular immunology IF:3.2Q3
研究论文 通过单细胞转录组学揭示扁桃体切除改善肾移植后复发性IgA肾病患者临床结局的免疫机制 首次利用单细胞mRNA测序和流式细胞术,系统分析了扁桃体组织及外周血单核细胞在扁桃体切除治疗复发性IgA肾病中的细胞类型和基因表达变化,发现了TCL1A和PI3k-Akt通路在B细胞介导的免疫调节中的关键作用 样本量较小,仅包含29例患者、1份扁桃体组织和3份PBMC样本,可能限制结论的普适性;且未包含未接受扁桃体切除的对照患者,难以完全排除其他因素对结果的影响 探究扁桃体切除在治疗肾移植后复发性IgA肾病中的细胞和分子机制,尤其是B细胞相关的免疫调节作用 复发性IgA肾病患者的扁桃体组织及外周血单核细胞 数字病理学 IgA肾病 单细胞mRNA测序,流式细胞术 NA 单细胞转录组数据,流式细胞术数据 29例复发性IgA肾病患者,包括1份扁桃体组织和3份PBMC样本 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞mRNA测序采用10x Genomics平台?但文中未明确提及,仅说明单细胞mRNA测序,因此输出NA
16 2026-06-17
Novel insights into kidney disease: the scRNA-seq and spatial transcriptomics approaches: a literature review
2025-04-08, BMC nephrology IF:2.2Q2
综述 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组学(ST)在肾脏疾病研究中的应用与发展 创新点在于通过整合scRNA-seq与ST技术,以前所未有的分辨率揭示肾脏疾病中的细胞异质性、新型细胞亚群及其空间组织,为靶向治疗和精准医学提供新见解 文献本身未明确提及局限性,但综述类文章通常受限于当前技术的分辨率、样本量或整合分析的挑战 总结scRNA-seq结合ST在肾脏疾病中的应用,阐明其在理解肾脏发育、稳态和疾病进展中的细胞与分子机制 肾脏疾病中的细胞亚群及其在肾微环境中的动态相互作用 数字病理学 肾脏疾病 scRNA-seq, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
17 2026-06-15
Long-lasting B cell convergence to distinct broadly reactive epitopes following vaccination with chimeric influenza virus hemagglutinins
2025-Apr-08, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和B细胞受体库测序,分析了嵌合血凝素(cHA)疫苗接种后诱导的B细胞反应,发现其针对血凝素茎部区域的广泛中和表位产生持久且特异的B细胞应答 首次通过单细胞RNA测序与B细胞受体库联合分析,揭示了cHA疫苗诱导的B细胞对茎部广泛保护性表位的长期克隆汇聚和记忆B细胞池重塑 未提及样本量大小及长期随访中可能存在的个体间应答差异 阐明cHA疫苗接种后B细胞的特异性、功能及亚群变化,以验证其诱导针对HA茎部广谱保护性表位的持久抗体反应 受试者(临床试验参与者)的B细胞,尤其是浆母细胞(PB)和记忆B细胞(MBC) 数字病理学 流感病毒感染 单细胞RNA测序, B细胞受体库测序 NA 单细胞转录组数据, BCR序列数据 一项I期临床试验的受试者样本,具体数量未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
18 2026-06-15
Tumor-derived arachidonic acid reprograms neutrophils to promote immune suppression and therapy resistance in triple-negative breast cancer
2025-Apr-08, Immunity IF:25.5Q1
研究论文 发现三阴性乳腺癌细胞中积累的中性脂质通过花生四烯酸重编程中性粒细胞,导致免疫抑制和治疗抵抗 首次揭示脂滴形成在抗PD-1和化疗抵抗中的关键作用,并阐明肿瘤来源的花生四烯酸通过细胞外囊泡重编程中性粒细胞的机制 NA 探究三阴性乳腺癌对免疫检查点阻断和化疗联合治疗获得性抵抗的机制 三阴性乳腺癌细胞、中性粒细胞 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
19 2026-06-15
Genome-Scale Metabolic Modeling of Human Pancreas with Focus on Type 2 Diabetes
2025-04, Omics : a journal of integrative biology IF:2.2Q3
研究论文 通过单细胞RNA测序数据与通用Human1模型整合,构建了非糖尿病和2型糖尿病状态下胰腺α、β、δ和PP细胞的特异性基因组规模代谢模型,并分析其代谢活动 首次在单细胞分辨率下构建了2型糖尿病胰岛细胞的基因组规模代谢模型,揭示了不同细胞类型中代谢活动的特异性变化 未提及 整合实验与计算生物学方法,深入理解2型糖尿病病理生理学并发现新的分子靶点 胰腺α、β、δ和PP细胞 机器学习 2型糖尿病 单细胞RNA测序 基因组规模代谢模型 单细胞转录组数据 未提及 未提及 单细胞RNA测序 未提及 未提及
20 2026-05-29
Artificial variables help to avoid over-clustering in single-cell RNA sequencing
2025-04-03, American journal of human genetics IF:8.1Q1
研究论文 提出一种名为“recall”的方法,通过人工变量避免单细胞RNA测序数据中的过度聚类问题 利用人工变量控制双重使用数据的影响(即“double dipping”),防止过度聚类,可适用于多种聚类算法 未明确说明 开发一种保护单细胞RNA测序分析免受过度聚类影响的方法 单细胞RNA测序数据中的细胞聚类 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 使用模拟和真实数据 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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