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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-06 |
An international perspective on the future of systemic sclerosis research
2025-Mar, Nature reviews. Rheumatology
DOI:10.1038/s41584-024-01217-2
PMID:39953141
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综述 | 本文从国际视角探讨系统性硬化症研究的未来发展方向 | 整合单细胞RNA测序、空间生物学、人工智能等前沿技术,提出全球合作研究框架 | 未提供具体研究数据,主要基于现有研究进展的展望性分析 | 推动系统性硬化症的机制理解和个性化治疗发展 | 系统性硬化症患者群体 | 自然语言处理 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序、新一代测序、空间生物学、转录组学、基因组学、蛋白质组学、代谢组学、微生物组分析、人工智能 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 82 | 2025-10-06 |
Tracking HIV persistence across T cell lineages during early ART-treated HIV-1-infection using a reservoir-marking humanized mouse model
2025-Mar-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57368-7
PMID:40044684
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研究论文 | 开发HIV-1诱导谱系追踪系统,通过单细胞RNA测序追踪早期ART治疗期间HIV在不同T细胞谱系中的持久性 | 首创HIV-1诱导谱系追踪系统,可永久标记感染细胞并检测稀有潜伏感染细胞 | 基于人源化小鼠模型,可能与人类真实感染情况存在差异 | 研究HIV在ART治疗期间在不同T细胞谱系中的持久性机制 | HIV-1感染的人源化小鼠模型中的CD4 T细胞 | 单细胞组学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | 人源化小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 人源化小鼠模型中的稀有潜伏感染细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 83 | 2025-10-06 |
CRISPRi-based screens in iAssembloids to elucidate neuron-glia interactions
2025-Mar-05, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.12.016
PMID:39814010
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研究论文 | 开发了一种基于CRISPRi筛选的iAssembloids系统,用于研究神经元与胶质细胞相互作用的分子机制 | 首次将CRISPRi筛选技术应用于3D共培养的iPSC衍生神经元和胶质细胞系统,建立了可扩展的因果分子机制研究平台 | 基于体外培养系统,可能无法完全模拟体内大脑环境的复杂性 | 阐明神经元与胶质细胞相互作用的分子机制,特别是对神经元存活和死亡的控制 | iPSC衍生的神经元和胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | CRISPRi筛选,单细胞转录组学 | iAssembloids 3D共培养系统 | 基因表达数据,功能筛选数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2025-10-06 |
A single-cell atlas of circulating immune cells over the first 2 months of age in extremely premature infants
2025-Mar-05, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adr0942
PMID:40043141
|
研究论文 | 本研究通过纵向多组学分析描绘了极早产儿出生后前两个月循环免疫细胞的发育轨迹 | 首次利用微量血液样本对极早产儿进行纵向单细胞多组学分析,揭示了其外周免疫发育的独特轨迹 | 样本量较小(仅10名极早产儿),需要更大规模研究验证 | 阐明极早产儿出生后前两个月外周免疫系统的发育特征 | 极早产儿、健康成人、早产和足月脐带血样本 | 单细胞组学 | 早产相关免疫缺陷 | 单细胞RNA测序、T和B细胞受体测序、磷酸化蛋白质质谱流式细胞术 | NA | 单细胞多组学数据 | 10名极早产儿,加上健康成人、早产和足月脐带血对照样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序, 单细胞BCR测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 85 | 2025-10-06 |
Molecular and cellular neurocardiology in heart disease
2025-Mar, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP284739
PMID:38778747
|
综述 | 本文更新并拓展了关于心脏病分子与细胞神经生物学的研究,重点关注心脏自主神经发育、新型细胞内通路和神经可塑性 | 利用患者特异性干细胞研究交感神经功能障碍,以及新型成像技术和空间转录组学在心脏自主神经疾病治疗靶点发现中的应用 | 文中强调了未解决的问题和存在争议的领域 | 探讨心脏疾病的分子与细胞神经生物学机制 | 心脏自主神经系统、神经化学通路、患者特异性干细胞 | 神经心脏病学 | 心脏病 | 空间转录组学、干细胞技术、新型成像技术 | NA | 分子与细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 86 | 2025-10-06 |
Mixed exposure to PFOA and PFOS induces oocyte apoptosis and subfertility in mice by activating the Hippo signaling pathway
2025-Mar, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
DOI:10.1016/j.reprotox.2024.108829
PMID:39746460
|
研究论文 | 本研究探讨了PFOA和PFOS混合物暴露通过激活Hippo信号通路诱导小鼠卵母细胞凋亡和生育力下降的机制 | 首次揭示了PFOA和PFOS混合物通过激活Hippo信号通路导致卵母细胞凋亡和生育力下降的具体分子机制 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证 | 探究PFOA和PFOS混合物对卵母细胞质量和雌性生育能力的影响机制 | 雌性小鼠的卵母细胞 | 生殖毒理学 | 生育障碍 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 87 | 2025-10-06 |
A single-cell sequencing-based analysis of a 13-year-old with maxillary sinus NUT carcinoma
2025-Mar, Oral oncology
IF:4.0Q2
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析13岁上颌窦NUT癌患者的肿瘤异质性和免疫微环境特征 | 首次在NUT癌中应用单细胞测序技术揭示肿瘤上皮细胞的异质性和免疫微环境特征 | 仅分析单例患者样本,样本量有限 | 探索NUT癌的肿瘤生物学特性和潜在治疗靶点 | 13岁上颌窦NUT癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | NUT癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1例患者肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 88 | 2025-10-06 |
Biophysical modelling of intrinsic cardiac nervous system neuronal electrophysiology based on single-cell transcriptomics
2025-Mar, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP287595
PMID:40077928
|
研究论文 | 基于单细胞转录组数据开发心脏内在神经系统神经元电生理计算模型库 | 首次基于单细胞转录组数据建立心脏内在神经系统神经元电生理模型库,填补分子水平基因表达与细胞水平电生理数据之间的空白 | 模型依赖于转录组数据的阈值设定,且电生理数据稀缺可能限制模型验证 | 研究心脏内在神经系统神经元电生理特性及其在心脏调控中的功能作用 | 心脏内在神经系统神经元 | 计算生物学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | 计算电生理模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 89 | 2025-10-06 |
FLASH radiation reprograms lipid metabolism and macrophage immunity and sensitizes medulloblastoma to CAR-T cell therapy
2025-Mar, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-025-00905-6
PMID:39910249
|
研究论文 | 本研究揭示FLASH放疗通过重编程巨噬细胞脂质代谢逆转肿瘤免疫抑制,并增强CAR-T细胞疗法对髓母细胞瘤的疗效 | 首次发现FLASH放疗通过调节脂质代谢影响巨噬细胞免疫表型,并证明其与CAR-T细胞疗法的协同作用 | 研究基于基因工程小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探索FLASH放疗对肿瘤免疫的影响及其与CAR-T细胞疗法的联合治疗效果 | 髓母细胞瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞转录组分析 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2025-10-06 |
Parenchymal and inflammatory responses to ozone exposure in the aging healthy and surfactant protein C mutant lung
2025-Mar-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00261.2024
PMID:39832482
|
研究论文 | 本研究探讨臭氧暴露对年轻、中年和老年小鼠肺组织的结构和免疫反应影响,特别关注表面活性蛋白C突变的影响 | 首次结合年龄因素和SP-C基因突变,利用空间转录组学分析臭氧暴露对肺组织的区域特异性影响 | 研究仅使用小鼠模型,结果向人类外推需谨慎;仅考察了急性暴露效应,缺乏长期暴露数据 | 理解臭氧暴露在老年和遗传易感群体中加剧肺损伤的机制 | 年轻(8-14周)、中年(44-52周)和老年(>80周)小鼠,包括野生型和SP-C突变型 | 呼吸毒理学 | 呼吸系统疾病 | 流式细胞术, 空间转录组学 | 动物模型 | 图像, 转录组数据, 流式细胞数据 | 多年龄段小鼠群体(具体数量未明确) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 91 | 2025-10-06 |
Effects of maternal edible THC consumption on offspring lung growth and function in a rhesus macaque model
2025-Mar-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00360.2024
PMID:39903192
|
研究论文 | 本研究通过恒河猴模型探讨母体食用THC对后代肺发育和功能的影响 | 首次在灵长类动物模型中系统评估产前食用THC对后代肺发育的长期影响,并整合影像学、肺功能测试和多组学分析 | 样本量有限,仅使用恒河猴模型,结果外推到人类需谨慎 | 确定子宫内THC暴露是否对后代肺发育和功能产生有害影响 | 怀孕恒河猴及其后代婴儿 | NA | NA | 磁共振成像, 肺功能测试, 批量RNA测序, 全基因组亚硫酸氢盐测序, 空间RNA测序 | NA | 影像数据, 生理功能数据, 分子数据 | 怀孕恒河猴及其后代婴儿 | NA | 批量RNA测序, 全基因组亚硫酸氢盐测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 92 | 2025-10-06 |
[Research Advances in the Replication of Animal Models for Periodontal Diseases]
2025-Mar-20, Sichuan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Sichuan University. Medical science edition
DOI:10.12182/20250360103
PMID:40599292
|
综述 | 本文综述了近年来牙周病动物模型建模方法与特点,并提出整合空间转录组学等技术的多模态评估框架 | 提出整合空间转录组学、单细胞测序和荧光成像技术的多模态评估框架以解决现有模型局限 | 现有牙周炎动物模型难以同时捕捉疾病复杂性、追踪动态修复过程并满足转化需求 | 研究牙周病动物模型的建模方法与评估体系 | 啮齿类动物牙周病模型 | NA | 牙周病 | 空间转录组学, 单细胞测序, 荧光成像 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞测序 | NA | NA |
| 93 | 2025-10-06 |
Human Neonatal MR1T Cells Have Diverse TCR Usage, are Less Cytotoxic and are Unable to Respond to Many Common Childhood Pathogens
2025-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.17.643805
PMID:40166301
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序分析新生儿和成人MR1T细胞的差异,发现新生儿MR1T细胞具有更丰富的TCR多样性、较低的细胞毒性和对常见儿童病原体反应能力不足的特点 | 首次系统比较新生儿与成人MR1T细胞的TCR多样性、功能表型和病原体识别能力差异,并通过结构生物学揭示新生儿MAIT TCR与抗原结合亲和力降低的分子机制 | 样本量较小(新生儿和成人各5例),且仅研究了脐带血来源的细胞 | 探究新生儿MR1T细胞的免疫特性及其与新生儿感染易感性的关系 | 新生儿脐带血和成人外周血中的MR1T细胞 | 免疫学 | 新生儿败血症 | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序, 结构生物学分析 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据, 结构生物学数据 | 5例新生儿脐带血样本和5例成人外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 94 | 2025-10-06 |
The Dyson equalizer: adaptive noise stabilization for low-rank signal detection and recovery
2025-Mar, Information and inference : a journal of the IMA
DOI:10.1093/imaiai/iaae036
PMID:39830802
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研究论文 | 本文开发了一种自适应噪声稳定化方法,用于异方差噪声下的低秩信号检测与恢复 | 提出基于Dyson方程的自适应归一化程序,能够均衡数据矩阵行列间的平均噪声方差,支持广泛的噪声分布和信号结构 | NA | 解决异方差噪声环境下低秩信号的检测与恢复问题 | 含噪声数据矩阵中的低秩信号 | 机器学习 | NA | 随机矩阵理论 | Dyson均衡器 | 矩阵数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 95 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics predict novel potential regulators of acute epithelial restitution in the ischemia-injured intestine
2025-Mar-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00194.2024
PMID:39853303
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研究论文 | 通过单细胞转录组学预测缺血损伤肠道中急性上皮修复的新型潜在调节因子 | 首次在猪模型中通过单细胞转录组学识别出表达细胞迁移通路的吸收性肠细胞亚群,并预测CSF-1作为年龄依赖性修复反应的上游调节因子 | 研究基于猪模型,需进一步验证在人类中的适用性;初步体外实验需要更深入的体内验证 | 探索缺血损伤肠道上皮修复的年龄依赖性机制,识别潜在治疗靶点 | 幼年和新生猪的缺血损伤肠道黏膜上皮细胞 | 单细胞生物学 | 肠道缺血损伤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 幼猪缺血空肠恢复期黏膜上皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 96 | 2025-10-06 |
Unveiling a novel cancer hallmark by evaluation of neural infiltration in cancer
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf082
PMID:40052442
|
研究论文 | 通过评估肿瘤微环境中的神经浸润程度,揭示其作为癌症标志物的作用 | 提出癌症相关神经浸润评分(C-Neural评分),首次系统评估神经浸润作为癌症标志物的重要性 | 研究基于回顾性数据分析,需要更多实验验证 | 探索神经浸润在肿瘤微环境中的作用及其作为癌症标志物的潜力 | 10种癌症类型的肿瘤样本 | 生物信息学 | 癌症 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 预测评分模型 | 基因表达数据 | 40个批量RNA-seq数据集和55个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 97 | 2025-10-06 |
Accurate trajectory inference in time-series spatial transcriptomics with structurally-constrained optimal transport
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.19.644194
PMID:40166168
|
研究论文 | 提出一种基于最优传输的时空轨迹推断方法SOCS,用于时间序列空间转录组数据 | 开发了保持生物结构完整性的轨迹推断方法,能够维持空间连续生物单元在时间上的结构一致性 | NA | 改进时间序列空间转录组数据中的轨迹推断准确性 | 空间连续生物单元(如卵巢滤泡、肾小管和肾小球) | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 最优传输 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 98 | 2025-10-06 |
Assessing spatial sequencing and imaging approaches to capture the molecular and pathological heterogeneity of archived cancer tissues
2025-03, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6383
PMID:39846232
|
研究论文 | 评估空间转录组学和成像方法在捕获存档癌症组织分子和病理异质性方面的应用 | 首次系统评估多种空间转录组协议和成像方法在FFPE存档组织中的表现,整合基因表达谱与病理信息绘制新的分子图谱 | 研究仅使用皮肤来源的组织样本,存储时间范围为4-14年 | 评估空间转录组技术在存档癌症组织中解析异质性的技术性能和应用价值 | 福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)的皮肤癌组织 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 空间转录组学, 单分子成像, 多重蛋白成像 | NA | 空间转录组数据, 成像数据 | 不同存储时间(4-14年)的FFPE组织样本,涵盖不同RNA质量 | NA | 空间转录组学, 单分子RNA成像, 多重蛋白成像 | NA | 两种测序基础的空间转录组协议, multiplex RNAScope, CODEX |
| 99 | 2025-10-06 |
In mice, discrete odors can selectively promote the neurogenesis of sensory neuron subtypes that they stimulate
2025-Mar-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.10.579748
PMID:38405728
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研究论文 | 研究发现特定气味能选择性促进小鼠嗅觉感觉神经元亚型的神经发生 | 首次证明离散气味能特异性加速对其敏感的嗅觉神经元亚型的生成速率 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在其它哺乳动物中验证 | 探究嗅觉刺激如何影响特定嗅觉感觉神经元亚型的神经发生 | 小鼠嗅觉感觉神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 亚型特异性神经元出生日期标记 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 100 | 2025-10-06 |
Immunosuppressive microenvironment of liver restrains chemotherapeutic efficacy in triple-negative breast cancer
2025-Mar-06, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010871
PMID:40050043
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研究论文 | 本研究揭示了三阴性乳腺癌肝转移灶化疗疗效减弱的免疫微环境机制 | 首次通过单细胞RNA测序比较肝转移灶与原发灶免疫微环境差异,发现巨噬细胞活化不足导致CD8+T细胞浸润受阻是肝转移灶化疗耐药的关键机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床样本验证有限;免疫抑制机制可能涉及更多未探索的细胞类型和信号通路 | 探究三阴性乳腺癌肝转移灶化疗疗效减弱的免疫微环境机制 | 三阴性乳腺癌肝转移灶和原发灶的肿瘤微环境 | 单细胞测序分析 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,伤口愈合实验,集落形成实验,流式细胞术 | 小鼠肿瘤模型 | 单细胞RNA测序数据,组织切片图像,流式细胞数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |