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当前共找到 714 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-03-15 |
Predictive and personalized approaches for idiopathic pulmonary fibrosis: a Wnt-related gene set scoring framework integrating single-cell sequencing, spatial transcriptomics, and machine learning for diagnosis and prognosis
2025-Mar-13, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01571-8
PMID:40080215
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 82 | 2026-01-24 |
Integrative single-cell and bulk RNA-seq analysis identifies lactylation-related signature in osteosarcoma
2025-Mar-12, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01559-4
PMID:40072643
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA-seq数据，识别了骨肉瘤中与乳酸化相关的基因特征，旨在提高预后准确性和免疫治疗效果 | 首次结合单细胞测序AUCell评分和批量RNA-seq数据，系统识别骨肉瘤中乳酸化相关基因，并构建了具有强预测能力的九基因风险模型 | 基于公共数据集，缺乏独立验证队列；未进行实验验证基因功能 | 阐明乳酸化相关基因在骨肉瘤中的作用，改善预后评估和免疫治疗策略 | 骨肉瘤患者样本 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | LASSO, Cox回归模型 | 基因表达数据 | 未明确指定样本数量，使用公共数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 83 | 2026-01-24 |
Transcriptomic profiling reveals mechanism, therapeutic potential, and prognostic value of cancer stemness characteristic in nasopharyngeal carcinoma
2025-Mar-07, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01561-w
PMID:40053129
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和机器学习分析单细胞RNA-seq及批量转录组数据，结合基础实验，探索鼻咽癌中的干细胞特性，揭示了其与复发、转移和耐药性的关联 | 首次在鼻咽癌中识别并验证了癌症干细胞相关特征（STEM-signature），并发现四种干细胞相关miRNA（miR-300、miR-361-5p、miR-1246、miR-1290）能增强鼻咽癌细胞的干细胞特性，为治疗提供了新靶点 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证，且样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 探究鼻咽癌中癌症干细胞特性的机制、治疗潜力和预后价值 | 鼻咽癌细胞、单细胞RNA-seq数据、批量转录组数据、免疫细胞（如LAYN+CD8+ T细胞、CTLA4+CD4+ T细胞） | 生物信息学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA-seq、批量转录组分析、机器学习、LASSO Cox回归模型、NicheNet分析 | LASSO Cox回归模型 | 转录组数据（单细胞和批量） | 未明确指定样本数量，但涉及单细胞RNA-seq和批量转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 84 | 2026-01-24 |
The XCL1-XCR1 axis supports intestinal tissue residency and antitumor immunity
2025-Mar-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20240776
PMID:39841133
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研究论文 | 本研究揭示了XCL1-XCR1轴在调控肠道组织驻留记忆T细胞（TRM）空间分化和抗肿瘤免疫中的关键作用 | 首次发现CD8+ T细胞来源的XCL1对TRM形成至关重要，并证明该趋化因子轴通过非细胞自主方式引导肠道CD8+ TRM的空间分化和肿瘤控制 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据验证相对有限；肿瘤微环境中其他细胞类型的相互作用机制尚未完全阐明 | 探究组织驻留记忆T细胞分化与功能的细胞互作机制及其在抗肿瘤免疫中的作用 | 肠道CD8+ T细胞、常规树突状细胞1型（cDC1）、肿瘤浸润淋巴细胞（TIL） | 免疫学 | 肿瘤 | 靶向空间转录组学、小鼠遗传模型 | NA | 空间转录组数据、基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 85 | 2026-01-23 |
Segger: Fast and accurate cell segmentation of imaging-based spatial transcriptomics data
2025-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.14.643160
PMID:40161614
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研究论文 | 本文介绍了一种名为segger的快速准确细胞分割方法，用于成像空间转录组学数据 | 提出了一种基于异构图表示和图神经网络的细胞分割方法，将细胞分割视为转录本到细胞的链接预测任务，并利用单细胞RNA-seq信息改进转录本分配 | NA | 解决成像空间转录组学中转录本准确分配到细胞的问题 | 成像空间转录组学数据 | 计算机视觉 | NA | 成像空间转录组学 | 图神经网络 | 图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | NA |
| 86 | 2026-01-18 |
The Dyson equalizer: adaptive noise stabilization for low-rank signal detection and recovery
2025-Mar, Information and inference : a journal of the IMA
DOI:10.1093/imaiai/iaae036
PMID:39830802
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研究论文 | 本文提出了一种自适应噪声稳定化方法，用于低秩信号在异方差噪声下的检测与恢复 | 开发了一种基于随机矩阵理论和Dyson方程的自适应归一化程序，能均衡数据矩阵行列间的平均噪声方差，支持广泛的噪声分布和信号结构 | NA | 解决异方差噪声环境下低秩信号检测与恢复的挑战 | 数据矩阵中的低秩信号 | 机器学习 | NA | NA | NA | 矩阵数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 87 | 2026-01-17 |
LSD1 inhibition corrects dysregulated MHC-I and dendritic cells activation through IFNγ-CXCL9-CXCR3 axis to promote antitumor immunity in HNSCC
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.17.643710
PMID:40166238
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研究论文 | 本研究阐明了LSD1抑制通过IFNγ-CXCL9-CXCR3轴调控MHC-I和树突状细胞激活，从而增强头颈鳞状细胞癌抗肿瘤免疫的机制 | 首次揭示了LSD1抑制通过激活H3K4me2并直接与MHC-I相互作用来诱导抗肿瘤免疫的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外共培养实验，在人体内的直接验证尚不充分 | 阐明LSD1在头颈鳞状细胞癌抗肿瘤免疫中的作用机制 | 头颈鳞状细胞癌小鼠模型、人类头颈鳞状细胞癌细胞、外周血单个核细胞 | 肿瘤免疫学 | 头颈鳞状细胞癌 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | 小鼠模型、人类细胞系、TCGA数据库数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 88 | 2026-01-10 |
Molecular evidence for pre-chordate origins of ovarian cell types and neuroendocrine control of reproduction
2025-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.24.644836
PMID:40196654
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研究论文 | 本研究利用海星作为非脊索动物代表，通过单细胞RNA测序和高分辨率3D成像技术，揭示了卵巢细胞类型及其空间组织，为卵巢细胞类型的保守性起源和神经内分泌控制提供了分子证据 | 首次在非脊索动物（海星）中定义了卵巢细胞类型工具包，并发现卵巢内存在与哺乳动物相似的颗粒细胞样和膜细胞样细胞，以及一个与脊椎动物下丘脑-垂体-性腺轴相似的神经内分泌信号系统 | 研究基于海星这一特定物种，可能无法完全代表所有非脊索动物或脊索动物的卵巢进化过程，且未进行功能验证实验 | 从生物医学和进化角度理解卵子发生的机制，探索卵巢细胞类型及其信号相互作用的进化起源 | 海星（作为非脊索动物后口动物代表）的卵巢组织 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），高分辨率3D成像 | NA | 单细胞转录组数据，3D图像数据 | 未明确指定样本数量，但基于海星卵巢组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 89 | 2026-01-07 |
Intrinsic OASL expression licenses interferon induction during influenza A virus infection
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.14.643375
PMID:40166309
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研究论文 | 本文通过分析流感A病毒感染细胞的单细胞RNA测序数据，揭示了宿主因子OASL的内在表达对IFNL诱导的关键作用 | 开发了一种分析时间序列单细胞RNA测序数据的方法，以识别调控细胞间干扰素诱导异质性的宿主因子，并首次发现干扰素刺激基因OASL的内在表达是流感A病毒感染中IFNL稳健诱导所必需的 | 未明确说明样本量或实验设计的详细限制，可能局限于流感A病毒感染的特定模型 | 识别在病毒感染中调控细胞间干扰素诱导异质性的宿主因子 | 流感A病毒感染的细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 90 | 2026-01-02 |
Mediation of macrophage M1 polarization dynamics change by ubiquitin-autophagy-pathway regulated NLRP3 inflammasomes in PD-1 inhibitor-related myocardial inflammatory injury
2025-Mar-18, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-024-01979-1
PMID:40097836
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研究论文 | 本研究探讨了PD-1抑制剂相关心肌炎中，泛素-自噬通路调控的NLRP3炎症小体介导巨噬细胞M1极化动态变化的机制 | 揭示了PD-1抑制剂通过激活STAT1/NF-κB/NLRP3信号通路驱动巨噬细胞向M1表型极化，并首次阐明泛素-自噬通路通过降解NLRP3炎症小体促进炎症消退和巨噬细胞向M2表型转换的动态过程 | 研究主要基于动物和细胞模型，临床样本量有限，需要更大规模的前瞻性临床研究验证 | 阐明免疫检查点抑制剂（ICIs）诱导心肌炎的发病机制，探索潜在治疗靶点 | 肺癌患者（发生ICIs诱导心肌炎者）、动物模型、细胞模型 | NA | 肺癌、心肌炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 临床数据、单细胞测序数据 | 未明确具体样本数量，涉及本机构肺癌患者队列、动物模型和细胞模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 91 | 2026-01-01 |
Disturbed Flow Induces Reprogramming of Endothelial Cells to Immune-like and Foam Cells under Hypercholesterolemia during Atherogenesis
2025-Mar-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4397799/v1
PMID:40092444
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研究论文 | 本研究验证了“双重打击”假说，即紊乱血流是内皮细胞部分重编程的初始诱因，但需要高胆固醇血症才能诱导完全的内皮重编程和动脉粥样硬化斑块形成 | 首次在遗传谱系示踪模型中验证了血流诱导的内皮细胞重编程假说，并发现了内皮细胞向免疫样细胞和泡沫细胞转变的新现象 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证仍需进一步深入 | 探究紊乱血流和高胆固醇血症在动脉粥样硬化发生过程中对内皮细胞重编程的协同作用 | 小鼠动脉内皮细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学染色，谱系示踪 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 来自95只小鼠的98,553个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 92 | 2026-01-01 |
Disturbed Flow Induces Reprogramming of Endothelial Cells to Immune-like and Foam Cells under Hypercholesterolemia during Atherogenesis
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.06.641843
PMID:40093090
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和谱系追踪技术，验证了在动脉粥样硬化形成过程中，紊乱血流与高胆固醇血症共同诱导内皮细胞向免疫样细胞和泡沫细胞重编程的机制 | 首次提出并验证了“两阶段假说”，即紊乱血流是内皮细胞部分重编程的初始诱因，但需要高胆固醇血症才能诱导完全重编程和动脉粥样硬化斑块发展，并发现了内皮细胞向泡沫细胞转化的新现象 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证依赖于公开数据集，且实验时间点仅限于2周和4周，可能未覆盖长期动态变化 | 探究紊乱血流和高胆固醇血症在动脉粥样硬化形成中对内皮细胞重编程的协同作用机制 | 小鼠动脉内皮细胞，特别是暴露于紊乱血流的左颈总动脉区域 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学染色，谱系追踪 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 95只小鼠，共98,553个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 93 | 2025-12-26 |
The peripheral Atf3 + neuronal population is responsible for nerve regeneration at the early stage of nerve injury revealed by single-cell RNA sequencing
2025-03-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2024169
PMID:39539109
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠背根神经节在神经损伤早期出现的一个表达Atf3的新神经元亚群，该亚群与神经再生密切相关 | 首次在单细胞分辨率下鉴定出CCI诱导的Atf3高表达神经元亚群，并揭示其作为促再生群体的转录特征及与卫星胶质细胞的细胞间通讯网络 | 研究仅聚焦于损伤后第3天的早期阶段，未涵盖完整的再生过程动态变化 | 探究周围神经损伤后感觉神经元再生状态的转录组变化机制 | 小鼠背根神经节细胞 | 单细胞组学 | 周围神经损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 94 | 2025-12-26 |
High throughput identification of genetic regulators of microglial inflammatory processes in Alzheimer's disease
2025-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.09.642133
PMID:40161839
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研究论文 | 本研究通过CRISPRi筛选和单细胞RNA测序，系统探究了阿尔茨海默病GWAS变异如何调控人源诱导多能干细胞衍生小胶质细胞的炎症反应 | 首次将CRISPRi筛选与单细胞RNA测序（CROP-seq）结合，系统鉴定AD遗传风险因子对小胶质细胞炎症状态的调控功能 | 研究主要基于体外诱导的小胶质细胞模型，可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 阐明阿尔茨海默病遗传风险因子对小胶质细胞炎症反应的调控机制 | 人源诱导多能干细胞衍生的小胶质细胞 | 单细胞组学 | 阿尔茨海默病 | CRISPR抑制筛选, 单细胞RNA测序, CROP-seq | CRISPRi筛选模型 | 单细胞转录组数据 | 针对119个AD GWAS位点进行筛选 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 95 | 2025-12-21 |
Androgen Signaling in Type 2 Innate Lymphoid Cells Drives Sex Differences in Helicobacter -Induced Gastric Inflammation and Atrophy
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.14.643321
PMID:40166158
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研究论文 | 本研究揭示了雄激素通过调节2型先天淋巴细胞（ILC2s）的活化来抑制幽门螺杆菌诱导的胃部炎症，从而解释了男性胃癌发病率高于女性的机制 | 首次发现雄激素通过调控ILC2s来影响幽门螺杆菌感染后的胃部炎症反应，并揭示了性别差异在胃癌发病中的分子机制 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证 | 探究雄激素如何影响幽门螺杆菌感染后的胃部炎症反应，并解释性别差异在胃癌发病中的作用 | C57BL/6小鼠的胃部组织及免疫细胞 | 免疫学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 雄性及雌性C57BL/6小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 96 | 2025-12-20 |
Constructing a disease-specific ceRNA coregulatory network for keratoconus diagnosis and landscape of the immune environment
2025-Mar-22, International ophthalmology
IF:1.4Q3
DOI:10.1007/s10792-025-03488-4
PMID:40119981
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研究论文 | 本研究通过构建疾病特异性ceRNA共调控网络和免疫环境分析，为圆锥角膜的早期诊断提供了新的生物标志物和分子机制见解 | 首次整合疾病特异性PPI和ceRNA网络，结合ElasticNet算法开发诊断模型和诺模图，并应用多种反卷积方法解码圆锥角膜的免疫微环境 | 研究基于公共数据库的转录组数据，缺乏独立验证队列和实验验证 | 确定圆锥角膜的潜在疾病特异性基因生物标志物并描绘其免疫环境 | 圆锥角膜患者与对照组的转录组数据 | 生物信息学 | 圆锥角膜 | 转录组数据分析 | ElasticNet算法 | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2025-11-29 |
Sequencing-free whole genome spatial transcriptomics at molecular resolution in intact tissue
2025-Mar-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.06.641951
PMID:40161724
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研究论文 | 开发了一种名为RAEFISH的新型空间转录组技术，可在完整组织中实现全基因组覆盖和单分子空间分辨率 | 首次实现无需测序的全基因组空间转录组分析，同时保持单分子空间分辨率 | 技术尚未在更广泛的生物医学应用中验证 | 开发高覆盖度高分辨率的空间转录组技术 | 人类和小鼠的完整组织切片及培养细胞 | 空间转录组学 | NA | RAEFISH（反向挂锁扩增子编码荧光原位杂交） | NA | 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学，图像分析 | RAEFISH | 反向挂锁扩增子编码荧光原位杂交技术，可检测23,000种人类转录本或22,000种小鼠转录本 |
| 98 | 2025-11-29 |
New Multiomic Studies Shed Light on Cellular Diversity and Neuronal Susceptibility in Parkinson's Disease
2025-Mar, Movement disorders : official journal of the Movement Disorder Society
IF:7.4Q1
DOI:10.1002/mds.30097
PMID:39812497
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综述 | 本文综述了多组学技术在帕金森病细胞多样性和神经元易感性研究中的最新进展 | 整合空间转录组学、表观基因组学和蛋白质组学等多组学方法研究帕金森病 | NA | 揭示帕金森病中神经元易感性网络和疾病修饰因子 | 帕金森病患者和啮齿类动物模型中的神经元和胶质细胞 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,表观基因组学,蛋白质组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 99 | 2025-11-21 |
Diversity and heterogeneity in human pancreaticobiliary maljunction revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Mar-21, Pediatric surgery international
IF:1.5Q3
DOI:10.1007/s00383-025-05997-w
PMID:40116982
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类胰胆管合流异常的细胞多样性和异质性 | 首次在单细胞水平系统描绘胰胆管合流异常的细胞图谱，发现成纤维细胞亚型的主导作用及WNT/TWEAK信号通路异常激活 | 样本量较小（仅6例患者），需更大规模研究验证 | 阐明胰胆管合流异常的病因和发病机制 | 胰胆管合流异常患者和非患者的胆管组织 | 单细胞组学 | 胰胆管合流异常 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例患者（3例PBM，3例非PBM） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 100 | 2025-11-14 |
Efficient count-based models improve power and robustness for large-scale single-cell eQTL mapping
2025-Mar-05, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.01.18.25320755
PMID:40093202
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研究论文 | 提出了一种基于计数模型的高效单细胞eQTL定位框架jaxQTL，用于大规模单细胞转录组数据分析 | 开发了首个专门针对单细胞RNA-seq稀疏计数数据的高效eQTL定位框架，能够识别低表达eGenes和远端eQTLs | NA | 提高大规模单细胞eQTL定位的效率和准确性 | 单细胞转录组数据中的表达数量性状位点 | 生物信息学 | 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | 负二项模型 | 单细胞转录组计数数据 | 982个样本（OneK1K数据集） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |