单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
841	2025-02-24	The molecular structure of SHISA5 protein and its novel role in primary biliary cholangitis: From single-cell RNA sequencing to biomarkers 2025-Mar, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.139775 PMID:39800023	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术分析了原发性胆汁性胆管炎（PBC）患者和健康对照者的肝组织样本，揭示了SHISA5蛋白在PBC中的表达特征及其可能的生物学功能	首次通过单细胞RNA测序技术揭示了SHISA5蛋白在PBC中的表达特征，并预测了其分子结构及可能的生物学功能	研究样本量未明确说明，且功能分析基于预测，需进一步实验验证	探究SHISA5蛋白在原发性胆汁性胆管炎（PBC）中的表达特征及其生物学功能	PBC患者和健康对照者的肝组织样本	数字病理学	原发性胆汁性胆管炎	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	未明确说明
842	2025-02-24	Dectin-2 depletion alleviates osteoclast-induced bone loss in periodontitis via Syk/NOX2/ROS signaling 2025-Mar-01, Free radical biology & medicine DOI:10.1016/j.freeradbiomed.2025.01.011 PMID:39800085	研究论文	本研究探讨了Dectin-2在牙周炎中通过Syk/NOX2/ROS信号通路调控破骨细胞诱导的骨丢失的作用	首次揭示了Dectin-2在破骨细胞生成中的关键作用及其通过Syk/NOX2/ROS/MAPK信号轴调控的机制	研究主要基于细胞和小鼠模型，尚未在人体中进行验证	探索Dectin-2在破骨细胞生成和骨丢失中的作用，为牙周炎等骨疾病提供新的治疗靶点	RAW264.7细胞、骨髓来源的巨噬细胞（BMDMs）和Dectin-2基因敲除小鼠	生物医学	牙周炎	单细胞测序、转录组分析	NA	基因表达数据	NA
843	2025-02-24	YTHDF2-mediated m6A modification of ONECUT2 promotes stemness and oxaliplatin resistance in gastric cancer through transcriptionally activating TFPI 2025-Mar, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1 DOI:10.1016/j.drup.2024.101200 PMID:39823826	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序识别了胃癌中与奥沙利铂耐药相关的细胞亚群，并揭示了YTHDF2介导的m6A修饰通过转录激活TFPI促进胃癌干细胞特性和奥沙利铂耐药的分子机制	首次揭示了YTHDF2介导的m6A修饰通过调控ONECUT2影响胃癌干细胞特性和奥沙利铂耐药的分子机制，并验证了ONECUT2小分子抑制剂CSRM617的治疗潜力	研究主要基于细胞和小鼠模型，尚未在临床患者中验证ONECUT2抑制剂的有效性	探究胃癌中奥沙利铂耐药的分子机制，寻找新的治疗靶点	胃癌细胞和小鼠模型	肿瘤生物学	胃癌	单细胞RNA测序	小鼠模型	RNA测序数据	未明确说明样本数量，但涉及胃癌细胞和小鼠模型
844	2025-02-24	Sciatic nerve stimulation enhances NK cell cytotoxicity through dopamine signaling and synergizes immunotherapy in triple-negative breast cancer 2025-Mar, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1 DOI:10.1016/j.drup.2025.101212 PMID:39951881	研究论文	本研究探讨了坐骨神经刺激对三阴性乳腺癌（TNBC）抗肿瘤免疫反应和免疫治疗效果的影响	揭示了坐骨神经刺激通过多巴胺信号通路增强NK细胞毒性，并与免疫治疗协同作用的机制	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	研究坐骨神经刺激对TNBC抗肿瘤免疫反应和免疫治疗效果的影响	三阴性乳腺癌（TNBC）小鼠模型	癌症免疫治疗	乳腺癌	单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫组织化学	小鼠模型	基因表达数据、免疫细胞数据	未明确提及具体样本数量
845	2025-02-23	EGR1 regulates oxidative stress and aldosterone production in adrenal cells and aldosterone-producing adenomas 2025-Mar, Redox biology IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.redox.2025.103498 PMID:39826326	研究论文	本文探讨了早期生长反应1（EGR1）在肾上腺细胞生物学中的双重作用，即调节氧化应激和醛固酮生成	揭示了EGR1在肾上腺细胞中调节氧化应激和醛固酮生成的新机制，并探讨了其在醛固酮生成腺瘤（APAs）和其他肾上腺皮质肿瘤发病机制中的潜在意义	研究主要基于体外实验和动物模型，尚未在人体中进行大规模临床试验验证	探讨EGR1在肾上腺细胞中调节氧化应激和醛固酮生成的作用及其在APAs发病机制中的潜在意义	人类肾上腺细胞、醛固酮生成腺瘤（APAs）患者肾上腺组织、猪的肾上腺皮质	NA	内分泌高血压、醛固酮生成腺瘤	RNA测序、空间转录组学	NA	RNA测序数据、空间转录组数据	人类肾上腺细胞、APAs患者肾上腺组织、猪的肾上腺皮质
846	2025-02-23	Key glycometabolism during oocyte maturation and early embryonic development 2025-Mar-01, Reproduction (Cambridge, England) DOI:10.1530/REP-24-0275 PMID:39846956	综述	本文综述了葡萄糖代谢在卵母细胞成熟和早期胚胎发育中的关键作用，探讨了代谢监测如何革新胚胎选择和个性化辅助生殖技术	揭示了葡萄糖、脂肪酸、氨基酸和核苷酸在早期胚胎发育中的复杂相互作用，并强调了非侵入性代谢监测在辅助生殖技术中的潜在应用	本文为综述性文章，未涉及具体实验数据或新发现，主要基于现有研究进行总结和分析	探讨代谢过程在卵母细胞成熟和早期胚胎发育中的关键作用，以推动生殖医学和胚胎学的发展	哺乳动物卵母细胞和早期胚胎	生殖医学	NA	单细胞测序、代谢组学、生物信息学	NA	代谢数据	NA
847	2025-02-23	Desflurane attenuates renal ischemia-reperfusion injury by modulating ITGB1/CD9 and reducing oxidative stress in tubular epithelial cells 2025-Mar, Redox biology IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.redox.2025.103490 PMID:39854938	研究论文	本研究探讨了地氟醚（DFE）通过调节ITGB1/CD9信号通路和减轻氧化损伤在肾缺血再灌注（I/R）损伤中的保护作用	首次揭示了地氟醚通过调节ITGB1/CD9信号通路在肾I/R损伤中的保护机制	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	探讨地氟醚在肾缺血再灌注损伤中的保护作用及其机制	肾小管上皮细胞（TECs）和小鼠模型	生物医学	肾脏疾病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RT-qPCR、Western blot、TUNEL检测	小鼠模型	基因表达数据、蛋白质表达数据	未明确提及具体样本数量
848	2025-02-23	Differential expression of the MYC-Notch axis drives divergent responses to the front-line therapy in central and peripheral extensive-stage small-cell lung cancer 2025-Mar, MedComm IF:10.7Q1 DOI:10.1002/mco2.70112 PMID:39974662	研究论文	本研究比较了中央型和周围型广泛期小细胞肺癌（ES-SCLC）对一线治疗的反应差异，并通过单细胞RNA测序探讨了潜在的生物学机制	首次揭示了中央型和周围型ES-SCLC对一线治疗的不同反应，并发现MYC-Notch-non-NE轴的差异激活状态可能是导致这些差异的原因	样本量较小（9个治疗初期的ES-SCLC样本），需要更大规模的研究来验证结果	探讨中央型和周围型ES-SCLC对一线治疗的反应差异及其生物学机制	广泛期小细胞肺癌（ES-SCLC）患者	癌症研究	肺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	265名患者（临床数据）和9个治疗初期的ES-SCLC样本（scRNA-seq数据）
849	2025-02-22	Proliferation of renal macrophage via MR/CSF1 pathway induced with aldosterone and inhibited by esaxerenone 2025-Mar-06, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114208 PMID:39923576	研究论文	本研究探讨了醛固酮诱导的肾脏巨噬细胞增殖，重点关注其来源、亚型和调控机制	揭示了醛固酮诱导的肾脏巨噬细胞增殖的起源和亚型，并确定了MR/CSF1通路在这一过程中的关键调控作用	巨噬细胞的高可塑性和异质性使得其来源和亚型的研究仍存在不确定性	研究醛固酮诱导的肾脏巨噬细胞增殖的机制及其在肾脏损伤和修复中的作用	肾脏巨噬细胞	生物医学	肾脏疾病	免疫荧光、流式细胞术、单细胞测序	NA	细胞数据	NA
850	2025-02-22	A comprehensive pan-cancer examination of transcription factor MAFF: Oncogenic potential, prognostic relevance, and immune landscape dynamics 2025-Mar-06, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114105 PMID:39923580	研究论文	本文通过多组学分析全面探讨了转录因子MAFF在多种癌症中的表达、预后相关性及其在肿瘤免疫和微环境中的作用	首次进行了MAFF在泛癌症中的全面分析，揭示了其在肿瘤预后、免疫治疗反应和微环境中的关键作用	研究主要基于公开的转录组数据，缺乏实验验证的广泛性	探讨MAFF在多种癌症中的表达模式、预后价值及其与肿瘤免疫和微环境的关联	多种癌症类型中的MAFF表达及其相关基因	生物信息学	癌症	转录组分析、分子对接、基因集富集分析（GSEA）、基因集变异分析（GSVA）	NA	转录组数据、蛋白质数据	来自Genomic Data Commons (GDC)和UCSC XENA的多种癌症样本
851	2025-02-22	Active immunologic participation and metabolic shutdown of kidney structural cells during kidney transplant rejection 2025-Mar, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons IF:8.9Q1 DOI:10.1016/j.ajt.2024.10.015 PMID:39461479	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术研究了肾移植排斥反应中肾脏结构细胞的免疫参与和代谢关闭	首次通过单细胞RNA测序揭示了肾脏结构细胞在排斥反应中的主动免疫参与和代谢关闭现象	样本量较小，仅涉及18个肾移植活检样本	研究肾移植排斥反应中肾脏结构细胞的免疫和代谢反应	14名肾移植受者的18个肾移植活检样本	生物医学	肾移植排斥反应	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	18个肾移植活检样本
852	2025-02-22	Single-cell RNA-seq offer new insights into the cell fate decision of the primordial germ cells 2025-Mar, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.139136 PMID:39740725	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了原始生殖细胞（PGCs）在体外培养中的细胞命运决定机制	发现了细胞周期驱动细胞异质性，识别了参与PGC自我更新的活跃群体和衰老细胞命运的特征，并确定了Hippo、FoxO、AMPK和MAPK通路在这些群体中的活跃性	不同实验室或品种间PGCs培养条件的可重复性仍是一个挑战	研究体外培养PGCs的分子动力学，以建立稳定的PGCs细胞系网络	原始生殖细胞（PGCs）	生殖生物学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	NA
853	2025-02-21	ARP2/3 complex affects myofibroblast differentiation and migration in pancreatic ductal adenocarcinoma 2025-Mar-15, International journal of cancer IF:5.7Q1 DOI:10.1002/ijc.35246 PMID:39472297	研究论文	本研究探讨了ARP2/3复合物在胰腺导管腺癌（PDAC）中肌成纤维细胞分化和迁移的影响	揭示了ARP2/3复合物在癌症相关成纤维细胞（CAFs）迁移和分化中的关键作用，并提出了针对该复合物的治疗PDAC的新策略	研究主要基于小鼠模型和体外实验，需进一步验证其在人体中的效果	阐明ARP2/3复合物对PDAC进展中CAFs活动的影响及其与患者预后的关系	胰腺导管腺癌（PDAC）中的癌症相关成纤维细胞（CAFs）	癌症研究	胰腺癌	微阵列分析、RNA测序（RNA-seq）、单细胞RNA测序（sc-RNA-seq）	NA	基因表达数据	p48; LSL-Kras小鼠模型、人类永生化胰腺星状细胞（PSCs）和原发性PDAC来源的CAFs
854	2025-02-21	Schwann Cell-Secreted S100B Promotes Wound Healing via Paracrine Modulation 2025-Mar, Journal of dental research IF:5.7Q1 DOI:10.1177/00220345241296103 PMID:39711160	研究论文	本研究探讨了Schwann细胞在腭黏膜伤口愈合中的关键作用及其通过S100B/RAGE/NF-κB/Notch旁分泌轴的机制	揭示了Schwann细胞通过分泌S100B蛋白在腭黏膜伤口愈合中的关键作用，并阐明了其通过RAGE受体激活NF-κB和Notch信号通路的机制	研究主要基于非人灵长类动物模型，尚未在人类中进行验证	探究Schwann细胞在腭黏膜伤口愈合中的作用及其分子机制	腭黏膜、颊附着龈和皮肤的伤口愈合	生物医学	伤口愈合	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、蛋白质组学分析	NA	基因表达数据、蛋白质数据	非人灵长类动物、大鼠和猴子的皮肤样本
855	2025-02-21	Investigating subpopulation dynamics in clonal CHO-K1 cells with single-cell RNA sequencing 2025-Mar, Journal of biotechnology IF:4.1Q2 DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.01.010 PMID:39824362	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了具有不同稳定性表型的克隆CHO-K1细胞群体在90天培养期间的亚群动态	首次在克隆CHO-K1细胞中应用单细胞RNA测序技术，揭示了细胞群体中的亚群异质性及其对基因表达稳定性的影响	需要进一步的多组学研究来更好地表征这种异质性	研究克隆CHO-K1细胞群体中的亚群动态及其对基因表达稳定性的影响	两个具有不同稳定性表型的克隆CHO-K1细胞群体	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	两个克隆CHO-K1细胞群体在90天培养期间的样本
856	2025-02-21	Single-cell transcriptomics predict novel potential regulators of acute epithelial restitution in the ischemia-injured intestine 2025-Mar-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology DOI:10.1152/ajpgi.00194.2024 PMID:39853303	研究论文	本文通过单细胞转录组学预测了缺血损伤肠道中急性上皮修复的新潜在调节因子	利用单细胞转录组学技术识别了参与修复的肠细胞亚群，并预测了其上游调节因子CSF-1，为新生儿肠道损伤提供了新的治疗靶点	研究主要基于猪模型，尚未在人类中进行验证	研究新生儿肠道缺血损伤后上皮修复的机制，并寻找潜在的治疗靶点	新生和幼年猪的肠道上皮细胞	单细胞转录组学	肠道缺血损伤	单细胞转录组学	猪模型	单细胞RNA测序数据	新生和幼年猪的肠道上皮细胞样本
857	2025-02-21	Potential therapeutic effect of dimethyl fumarate on Treg/Th17 cell imbalance in biliary atresia 2025-Mar, Clinical immunology (Orlando, Fla.) DOI:10.1016/j.clim.2025.110439 PMID:39863040	研究论文	本研究探讨了二甲基富马酸（DMF）对胆道闭锁（BA）患者Treg/Th17细胞失衡的潜在治疗效果及其机制	首次将DMF应用于BA患者Treg/Th17细胞失衡的治疗研究，并揭示了其通过Nrf2/抗氧化反应元件（ARE）途径的作用机制	研究主要基于体外实验和小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证DMF的疗效	探索DMF对BA患者Treg/Th17细胞失衡的调节作用及其潜在机制	胆道闭锁（BA）患者的Treg和Th17细胞	免疫学	胆道闭锁	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、酶联免疫吸附试验（ELISA）、q-PCR、Western blot	小鼠模型	基因表达数据、细胞频率数据、生化标志物数据、细胞因子数据	BA患者和胆总管囊肿（CC）患者的肝脏样本、BA小鼠模型
858	2025-02-21	Identifying novel therapeutic targets in cystic fibrosis through advanced single-cell transcriptomics analysis 2025-Mar, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.109748 PMID:39921941	研究论文	本研究通过先进的单细胞转录组学分析，揭示了与囊性纤维化（CF）相关的新基因和调控网络，为开发更有效的治疗干预措施提供了新的潜在靶点	本研究采用了增强的分析方法，整合了多源数据并实施了严格的标准化和映射策略，以揭示CF相关基因表达的新见解	尽管研究揭示了新的基因和调控网络，但这些发现的临床转化仍需进一步研究	深入了解囊性纤维化（CF）相关的气道病理的分子机制，并识别新的治疗靶点	囊性纤维化（CF）患者和健康对照者的单细胞转录组数据	数字病理学	囊性纤维化	单细胞转录组学	NA	单细胞转录组数据	NA
859	2025-02-21	Single-cell transcriptomics reveals the alteration of immune cell profile in peripheral blood of Henoch-Schonlein purpura 2025-Mar, Clinical immunology (Orlando, Fla.) DOI:10.1016/j.clim.2025.110443 PMID:39924084	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和多参数流式细胞术，全面评估了健康供体和Henoch-Schönlein紫癜（HSP）患者的外周血单核细胞，揭示了HSP患者的广泛免疫激活状态	首次使用单细胞RNA测序技术揭示了HSP患者外周血中免疫细胞类型和状态的改变，特别是不同HSP亚型中特定免疫细胞亚群的富集情况	研究样本量未明确提及，且未探讨这些免疫细胞变化与疾病预后的直接关联	揭示HSP患者外周血中免疫细胞类型和状态的改变，以更好地理解HSP的免疫病理机制	健康供体和HSP患者的外周血单核细胞	免疫学	Henoch-Schönlein紫癜	单细胞RNA测序，多参数流式细胞术	NA	单细胞RNA测序数据，流式细胞术数据	未明确提及
860	2025-02-21	Unveiling ferroptosis genes and inhibitors in diabetic retinopathy through single-cell analysis and docking simulations 2025-Mar, Biochemistry and biophysics reports IF:2.3Q3 DOI:10.1016/j.bbrep.2025.101932 PMID:39968183	研究论文	本文通过单细胞分析和对接模拟揭示了糖尿病视网膜病变中的铁死亡基因和抑制剂	首次通过单细胞RNA测序数据集识别铁死亡相关基因，并利用分子对接和模拟技术探索药物与靶蛋白的相互作用稳定性	研究依赖于公开的单细胞RNA测序数据集，可能受限于数据的质量和样本量	探讨铁死亡在糖尿病视网膜病变中的作用，以推动对该复杂疾病的理解并开发创新治疗方法	糖尿病视网膜病变患者	生物信息学	糖尿病视网膜病变	单细胞RNA测序，分子对接，分子动力学模拟	NA	单细胞RNA测序数据	NA