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当前共找到 714 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2026-03-02 |
Single-cell RNA sequencing in autoimmune diseases: New insights and challenges
2025-03, Pharmacology & therapeutics
IF:12.0Q1
DOI:10.1016/j.pharmthera.2025.108807
PMID:39894174
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综述 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在自身免疫性疾病研究中的应用，包括其在理解细胞异质性、病因、诊断、治疗和预后方面的潜力 | 利用scRNA-seq技术在单细胞水平揭示自身免疫性疾病中的转录多样性，提供全面的细胞图谱，并识别诊断、预后标志物及潜在治疗靶点 | scRNA-seq技术本身存在局限性，需要进一步解决以推动研究进展 | 探讨scRNA-seq如何增强对自身免疫性疾病中细胞异质性的理解及其在临床实践中的应用潜力 | 自身免疫性疾病中的多种细胞类型 | 自然语言处理 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 62 | 2026-03-02 |
Dissecting tumor cell programs through group biology estimation in clinical single-cell transcriptomics
2025-Mar-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57377-6
PMID:40025015
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研究论文 | 本文介绍了一种名为BEANIE的非参数统计方法，用于临床单细胞转录组学中基因签名差异表达分析，以解决现有方法假阳性高、结构表示不足和混杂因素处理不当的问题 | BEANIE方法创新性地解决了临床单细胞RNA测序数据中患者特异性层次结构和样本驱动混杂因素的问题，在特异性上优于现有方法同时保持敏感性 | NA | 开发一种稳健的差异表达分析方法，用于临床癌症单细胞RNA测序研究中的病例/对照分析 | 乳腺癌、肺癌和黑色素瘤的临床单细胞转录组学数据 | 自然语言处理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 非参数统计方法 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 63 | 2026-03-02 |
Endogenously generated Dutch-type Aβ nonfibrillar aggregates dysregulate presynaptic neurotransmission in the absence of detectable inflammation
2025-Mar-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.25.639746
PMID:40060689
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研究论文 | 本研究探讨了荷兰型Aβ非纤维聚集物在转基因小鼠中如何影响突触前神经传递，而不引发可检测的炎症反应 | 揭示了非纤维Aβ聚集物在无斑块形成的情况下，通过干扰线粒体功能和突触传递导致认知缺陷，挑战了传统Aβ毒性主要源于纤维斑块的观点 | 研究基于转基因小鼠模型，可能不完全反映人类疾病情况，且未详细探讨其他细胞类型如星形胶质细胞的潜在作用 | 探究荷兰型Aβ突变导致的非纤维聚集物对突触功能和线粒体活性的影响，以理解Aβ毒性的非炎症机制 | 携带荷兰型Aβ突变的转基因小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序、免疫组化、显微镜成像、电子传递链催化测量 | 转基因小鼠模型 | RNA序列数据、图像数据、生理测量数据 | 未明确指定样本数量，但涉及转基因小鼠群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 64 | 2026-03-01 |
Spatial Transcriptomics Identifies Immune-Stromal Niches Associated with Cancer in Adult Dermatomyositis
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.19.644147
PMID:40166232
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研究论文 | 本研究通过整合空间和单细胞转录组学分析，揭示了成人皮肌炎中与癌症相关的独特免疫和基质微环境 | 首次提供了成人皮肌炎中免疫和基质细胞的空间映射，发现了与癌症相关的DM皮肤病变中分散的免疫浸润特征，以及非癌症相关DM中独特的细胞对和IFN-β表达 | NA | 探究成人皮肌炎的免疫和基质微环境特征及其与癌症的关联 | 成人皮肌炎患者的皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肌炎 | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 65 | 2026-03-01 |
Comprehensive biomarker profiles in hematological malignancies: improving diagnosis, prognosis, and treatment
2025-Mar, Biomarkers in medicine
IF:1.9Q3
DOI:10.1080/17520363.2025.2471745
PMID:40015744
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综述 | 本文全面概述了血液系统恶性肿瘤中生物标志物的最新进展及其在诊断、预后和治疗中的应用 | 整合了从传统形态学到先进分子技术（如PCR、NGS、质谱和单细胞RNA测序）的生物标志物发现历程，并强调了新兴技术在揭示先前无法检测的生物标志物方面的作用 | NA | 提供血液系统恶性肿瘤生物标志物的全面概述，探讨其诊断和治疗应用及未来发展方向 | 血液系统恶性肿瘤及其相关生物标志物 | NA | 血液系统恶性肿瘤 | 聚合酶链反应（PCR）、下一代测序（NGS）、质谱、单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 66 | 2026-02-26 |
Tumor cell villages define the co-dependency of tumor and microenvironment in liver cancer
2025-Mar-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.07.642107
PMID:40161587
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研究论文 | 本研究通过空间单细胞成像和单细胞RNA测序分析肝癌样本，揭示了肿瘤细胞村庄及其与微环境的共依赖性对肿瘤异质性和患者预后的影响 | 开发了一种基于深度学习的空间动态网络策略，首次将肿瘤细胞状态组织成村庄概念，并展示了其与微环境的特异性分子共依赖性 | 研究样本量有限（50个肿瘤生物样本），且主要聚焦于肝癌，可能不适用于其他癌症类型 | 探究肿瘤空间景观的形成机制及其对肿瘤适应性的影响 | 肝癌肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 肝癌 | 空间单细胞成像，单细胞RNA测序 | 深度学习 | 图像，RNA测序数据 | 超过200万个细胞，来自50个肿瘤生物样本 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 67 | 2026-02-23 |
Spatial analysis of IPMNs defines a paradoxical KRT17-positive, low-grade epithelial population harboring malignant features
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.18.643943
PMID:40166305
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析，识别了胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤中一个表达恶性特征的KRT17阳性低级别上皮细胞亚群 | 首次在组织学低级别IPMN中发现了一个表达恶性转录特征（如KRT17、S100A10和CEACAM5）的上皮细胞亚群，该亚群可能代表向高级别不典型增生进展的过渡状态 | 研究样本数量可能有限，且需要进一步验证该KRT17阳性亚群在更大队列中的临床意义和预测价值 | 探究IPMN进展过程中的转录变化，以改善患者风险分层和治疗决策 | 胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤患者样本，包括低级别不典型增生、高级别不典型增生和IPMN来源的癌组织 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单细胞RNA测序数据，免疫荧光图像 | 包含IPMN疾病全谱的患者样本，具体数量未明确说明 | Nanostring | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | Nanostring GeoMx | Nanostring GeoMx空间转录组平台 |
| 68 | 2026-02-15 |
Single-cell analyses reveal impaired type B spermatogonia differentiation and meiotic entry in C-Nap1-null testes
2025-Mar, Quantitative biology (Beijing, China)
DOI:10.1002/qub2.71
PMID:41675379
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析C-Nap1基因敲除小鼠睾丸细胞，揭示C-Nap1缺失导致B型精原细胞分化和减数分裂启动受损的分子机制 | 首次在单细胞分辨率下系统解析C-Nap1缺失对精原细胞分化轨迹的影响，并发现β-Catenin和Aurka等关键基因的表达异常 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；机制研究主要依赖相关性分析，缺乏直接的功能验证实验 | 探究C-Nap1基因在精子发生过程中的功能及其缺失导致男性不育的分子机制 | C-Nap1基因敲除小鼠的睾丸组织细胞 | 单细胞组学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序，RT-PCR，UMAP聚类分析，拟时序分析 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 野生型10,332个睾丸细胞，敲除型13,308个睾丸细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 69 | 2026-02-13 |
Metabolic state uncovers prognosis insights of esophageal squamous cell carcinoma patients
2025-Mar-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06087-0
PMID:40098145
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研究论文 | 本研究首次通过整合代谢物-蛋白质相互作用网络与多尺度转录组学数据，全面绘制了食管鳞状细胞癌微环境的代谢图谱 | 首次在ESCC微环境中全面映射代谢景观，基于代谢状态组成识别了与预后相关的独特亚型 | 研究主要基于转录组数据，缺乏直接的代谢物验证实验 | 探索ESCC微环境中代谢状态与患者预后的关系 | 食管鳞状细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 64个ESCC样本中的208,659个细胞，以及两个独立队列（n=79和119） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 70 | 2026-02-13 |
A Latent Activated Olfactory Stem Cell State Revealed by Single-Cell Transcriptomic and Epigenomic Profiling
2025-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.26.564041
PMID:37961539
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和表观基因组分析，揭示了嗅觉上皮干细胞在损伤诱导再生过程中的潜在激活状态 | 结合单细胞基因表达和可及染色质谱分析，识别了激活干细胞中的转录异质性，并发现了一组在损伤前就表观遗传学上准备就绪的静息细胞 | NA | 研究嗅觉上皮干细胞在损伤诱导再生过程中的分子机制 | 嗅觉上皮干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组和表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 71 | 2026-02-12 |
VISTA Uncovers Missing Gene Expression and Spatial-induced Information for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2025-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.26.609718
PMID:40166134
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研究论文 | 本文提出了一种名为VISTA的新方法，用于预测空间转录组学数据中未观测基因的表达水平，以解决现有技术基因覆盖限制的问题 | VISTA结合变分推断和几何深度学习，联合建模单细胞RNA-seq和空间转录组学数据，并引入不确定性量化，实现了对未观测基因表达的高效预测 | 方法依赖于单细胞RNA-seq和空间转录组学数据的联合可用性，且性能可能受数据质量和整合难度的影响 | 开发一种能够预测空间转录组学数据中未观测基因表达水平的方法，以增强空间诱导细胞状态和特征的分析能力 | 单细胞RNA-seq数据和亚细胞空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 变分推断, 几何深度学习 | 基因表达数据, 空间数据 | 四个空间转录组学数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 72 | 2026-02-10 |
TrAGEDy-trajectory alignment of gene expression dynamics
2025-Mar-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf073
PMID:40065693
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TrAGEDy的新方法，用于对齐单细胞转录组学中的独立轨迹，避免错误整合步骤 | TrAGEDy能够处理不对称生物过程的轨迹对齐，优于现有工具，在模拟和真实数据中均表现更优 | NA | 开发一种方法以对齐单细胞转录组学中的独立轨迹，用于比较不同生物过程 | T细胞和布氏锥虫血流形式的基因表达动态 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组学测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 73 | 2026-02-09 |
Identification of increased dedifferentiation along the Prom1+ cancer cells in Müllerian adenosarcoma with sarcomatous overgrowth
2025-Mar, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-02943-4
PMID:39920368
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和生物信息学分析，揭示了Müllerian腺肉瘤中Prom1+癌细胞亚群的异质性和去分化轨迹 | 首次在MASO中鉴定出Prom1+癌细胞沿发育轨迹的三个表型（分化样、中间样、去分化样），并发现HMGB2/3+亚型是主要的去分化样癌细胞，E2F1被确认为Prom1谱系去分化的关键转录因子 | 研究样本量较小（基于单细胞测序），且主要聚焦于Prom1谱系，可能未涵盖肿瘤的全部异质性 | 探究Müllerian腺肉瘤伴肉瘤样过度生长（MASO）的肿瘤病因和细胞异质性 | MASO肿瘤组织及配对正常组织 | 数字病理学 | 子宫肉瘤 | 单细胞RNA测序，免疫组化，体外实验 | 轨迹分析，转录因子调控网络 | 单细胞RNA-seq数据，TCGA数据，图像数据 | 未明确样本数量，但涉及MASO和配对正常组织的单细胞测序 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 74 | 2026-02-09 |
Single-cell RNA sequencing via endoscopic ultrasound-guided fine-needle biopsy for pancreatic tumors uncovered an aggressive subclone with a poor prognosis
2025-Mar, ESMO gastrointestinal oncology
DOI:10.1016/j.esmogo.2024.100113
PMID:41646484
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研究论文 | 本研究通过内镜超声引导下细针穿刺活检结合单细胞RNA测序技术，揭示了胰腺肿瘤中一个与不良预后相关的侵袭性亚克隆 | 首次利用内镜超声引导下细针穿刺活检样本进行单细胞RNA测序，成功识别出与胰腺癌晚期阶段相关的UBE2C高表达侵袭性亚克隆 | 样本量较小，仅对4名患者成功进行了单细胞RNA测序分析，可能影响结果的普遍性 | 评估内镜超声引导下细针穿刺活检用于单细胞RNA测序的可行性，并探索胰腺肿瘤的细胞异质性 | 胰腺肿瘤患者 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 20名患者，40份标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 75 | 2026-02-07 |
FLASH radiation reprograms lipid metabolism and macrophage immunity and sensitizes medulloblastoma to CAR-T cell therapy
2025-Mar, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-025-00905-6
PMID:39910249
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研究论文 | 本研究揭示了FLASH放疗通过重编程巨噬细胞脂质代谢，逆转髓母细胞瘤的免疫抑制，并增强CAR-T细胞疗法疗效的机制 | 首次阐明FLASH放疗通过抑制脂质氧化酶表达和氧化低密度脂质生成，降低PPARγ活性，从而促进巨噬细胞向促炎表型极化，并增强CAR-T细胞浸润与活化的机制 | 研究基于基因工程小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证；FLASH放疗对肿瘤免疫的影响机制仍需在其他肿瘤类型中进一步探索 | 探究FLASH放疗对肿瘤免疫微环境的影响及其与CAR-T细胞疗法联合治疗的潜力 | 髓母细胞瘤的基因工程小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞转录组分析 | 基因工程小鼠模型 | 转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 76 | 2026-02-05 |
A comprehensive analysis of scRNA-Seq and RNA-Seq unveils B cell immune suppression in the AAV-loaded brain
2025-Mar-05, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-025-09609-6
PMID:40044925
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研究论文 | 本研究通过整合转录组和单细胞RNA测序数据，结合孟德尔随机化分析，揭示了XBP1蛋白通过MDK-NCL配体-受体对及相关基因介导大脑中B细胞免疫抑制的潜在机制 | 首次利用scRNA-seq和RNA-seq数据结合孟德尔随机化分析，识别出XBP1在AAV载体诱导的大脑B细胞免疫抑制中的关键作用，并揭示了MDK-NCL配体-受体对的介导途径 | 研究主要基于转录组数据分析，缺乏体内或体外实验验证，且免疫抑制机制的具体调控网络和通路仍需进一步探索 | 探究AAV载体在大脑中引发的免疫反应，特别是B细胞免疫抑制的机制，以优化脑部基因治疗策略 | AAV载体处理的大脑组织，重点关注免疫细胞（如B细胞、小胶质细胞）及其转录组变化 | 生物信息学 | 神经疾病 | scRNA-seq, RNA-seq, 孟德尔随机化分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 77 | 2026-01-27 |
Evaluating genetic-ancestry inference from single-cell RNA-seq data
2025-Mar-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.25.645175
PMID:40196550
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研究论文 | 本文提出了一个评估从单细胞RNA测序数据推断遗传祖先方法的框架 | 首次系统评估了从scRNA-seq数据推断遗传祖先的准确性，并证明了现有工具（如ADMIXTURE）在此类稀疏数据上的有效性 | 研究依赖于有限的scRNA-seq数据集（4个），且变异检测受限于测序覆盖度和准确性 | 评估从单细胞RNA测序数据中推断遗传祖先的方法，以提高数据集的遗传多样性表征和减少分析偏差 | 单细胞RNA测序数据中的遗传多态性 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | ADMIXTURE | scRNA-seq测序数据 | 196名捐赠者，来自人类细胞图谱的4个scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 78 | 2026-01-26 |
Resolving spatiotemporal dynamics in bacterial multicellular populations: approaches and challenges
2025-Mar-27, Microbiology and molecular biology reviews : MMBR
IF:8.0Q1
DOI:10.1128/mmbr.00138-24
PMID:39853129
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综述 | 本文综述了研究细菌多细胞群体时空动态的方法与挑战，重点介绍单细胞技术在解析细菌生物膜（菌落）结构和功能中的应用 | 强调单细胞技术（如空间转录组学、单细菌RNA测序）在细菌多细胞性研究中的协同潜力，以单细胞分辨率解析群体结构和功能 | 未具体讨论技术整合的实际操作难点或数据解释的局限性 | 探索细菌多细胞群体的组装、动态和功能，以理解其进化过渡和复杂生命形式的出现 | 细菌多细胞群体，特别是分化的细菌生物膜（菌落）中的个体细胞 | 微生物学 | NA | 单细胞技术，包括显微技术、质谱成像、流式细胞术、空间转录组学、单细菌RNA测序 | NA | 空间和时间数据，单细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 79 | 2026-01-24 |
Dynamic cellular composition and immune landscape revealed by single-cell transcriptome profiling in a brain arteriovenous malformation
2025-Mar-27, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01590-5
PMID:40146346
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析，揭示了脑动静脉畸形中细胞组成和免疫景观的动态变化 | 首次在脑动静脉畸形中应用单细胞RNA测序技术，系统表征了细胞类型比例变化、基因表达差异和细胞通讯通路改变，发现了单核细胞-内皮细胞相互作用抑制和NK细胞相互作用促进的新机制 | 研究仅基于一个bAVM样本和三个健康对照样本，样本量较小，可能限制统计功效和结论的普适性 | 探究脑动静脉畸形的免疫机制和细胞功能变化 | 脑动静脉畸形组织和健康脑组织 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1个bAVM样本和3个健康对照样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 80 | 2026-01-24 |
Single-cell RNA sequencing revealed changes in the tumor microenvironment induced by radiotherapy for cervical cancer and the molecular mechanism of mast cells in immunosuppression
2025-Mar-14, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01564-7
PMID:40082276
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研究论文 | 本研究首次应用单细胞RNA测序技术，分析了宫颈癌患者放疗前后组织样本，揭示了放疗诱导的肿瘤微环境变化及肥大细胞在免疫抑制中的分子机制 | 首次将单细胞RNA测序技术应用于宫颈癌放疗前后组织分析，揭示了放疗诱导的细胞异质性变化及肥大细胞在肿瘤免疫抑制和基质重塑中的关键作用 | 样本量较小（仅3名患者），可能限制结果的普遍性；未涉及长期随访或治疗效果的临床验证 | 研究宫颈癌放疗后肿瘤微环境的变化，以改善放疗治疗效果 | 宫颈癌患者放疗前后的组织样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3名宫颈癌患者的放疗前后组织样本，共52,506个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |