单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 728 篇文献，本页显示第 61 - 80 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-07-20 |
CRISPRi-based screens in iAssembloids to elucidate neuron-glia interactions
2025-Mar-05, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2024.12.016
PMID:39814010
|
研究论文 | 该研究开发了一种名为iAssembloids的3D共培养系统，用于研究神经元与胶质细胞之间的相互作用及其对神经元存活的影响 | 利用CRISPRi筛选技术在iAssembloids系统中揭示了GSK3β抑制NRF2介导的氧化应激反应的机制，并研究了APOE-ε4对神经元存活的影响 | 研究基于体外培养系统，可能与体内环境存在差异 | 阐明神经元与胶质细胞相互作用的分子机制 | iPSC衍生的神经元和胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | CRISPRi筛选、单细胞转录组学 | iAssembloids 3D共培养系统 | 基因表达数据 | NA |
| 62 | 2025-07-20 |
A single-cell atlas of circulating immune cells over the first 2 months of age in extremely premature infants
2025-Mar-05, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adr0942
PMID:40043141
|
研究论文 | 该研究通过单细胞多组学分析，描绘了极早产婴儿出生后头两个月循环免疫细胞的动态变化 | 首次对极早产婴儿外周免疫细胞进行纵向单细胞多组学分析，揭示了与足月婴儿不同的免疫发育轨迹 | 样本量较小(仅10例极早产婴儿)，且未评估临床感染结局与免疫特征的关联 | 阐明极早产婴儿早期外周免疫系统的发育特征 | 极早产婴儿(孕周<30周)的外周血免疫细胞 | 免疫学 | 早产儿疾病 | 单细胞RNA测序、T/B细胞受体测序、磷酸化蛋白质质谱流式技术 | NA | 单细胞多组学数据(转录组、蛋白质组、免疫组库) | 10例极早产婴儿+健康成人对照+早产/足月脐带血样本 |
| 63 | 2025-07-20 |
Molecular and cellular neurocardiology in heart disease
2025-Mar, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP284739
PMID:38778747
|
研究论文 | 本文更新并扩展了先前关于心脏神经生物学分子和细胞基础的白皮书，重点关注心脏自主神经发育、新的细胞内通路和神经可塑性的最新发现 | 讨论了利用患者特异性干细胞研究交感神经功能障碍的新方法，以及新型成像技术和空间转录组学在治疗心脏自主神经功能障碍中的潜在应用 | 文中提到了未解决的问题和争议领域，表明研究仍存在局限性 | 探讨心脏疾病的分子和细胞神经心脏病学基础 | 心脏自主神经系统、细胞内通路和神经可塑性 | 心脏病学 | 心血管疾病 | 患者特异性干细胞、新型成像技术、空间转录组学 | NA | 分子和细胞数据 | NA |
| 64 | 2025-07-20 |
Mixed exposure to PFOA and PFOS induces oocyte apoptosis and subfertility in mice by activating the Hippo signaling pathway
2025-Mar, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
DOI:10.1016/j.reprotox.2024.108829
PMID:39746460
|
研究论文 | 研究PFOA和PFOS混合物通过激活Hippo信号通路诱导小鼠卵母细胞凋亡和生育力下降的机制 | 首次揭示了PFOA和PFOS混合物通过激活Hippo信号通路导致卵母细胞凋亡和生育力下降的具体机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探究PFOA和PFOS混合物对卵母细胞质量和雌性生育力的影响机制 | 雌性小鼠及其卵母细胞 | 生殖毒理学 | 生育障碍 | 单细胞转录组分析 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明小鼠数量 |
| 65 | 2025-07-20 |
A single-cell sequencing-based analysis of a 13-year-old with maxillary sinus NUT carcinoma
2025-Mar, Oral oncology
IF:4.0Q2
|
研究论文 | 通过对一名13岁上颌窦NUT癌患者的肿瘤组织进行单细胞RNA测序，揭示了肿瘤微环境中的细胞异质性和潜在治疗靶点 | 首次在NUT癌中应用单细胞RNA测序技术，揭示了肿瘤上皮细胞的亚群特征和免疫微环境特点 | 仅分析了一例患者样本，结果可能不具备广泛代表性 | 探索NUT癌的肿瘤生物学特性和潜在治疗靶点 | 13岁上颌窦NUT癌患者的肿瘤组织 | 数字病理 | NUT癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | 1例患者肿瘤组织样本 |
| 66 | 2025-07-20 |
Biophysical modelling of intrinsic cardiac nervous system neuronal electrophysiology based on single-cell transcriptomics
2025-Mar, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP287595
PMID:40077928
|
研究论文 | 基于单细胞转录组数据开发心脏内在神经系统神经元电生理的计算模型库 | 首次基于单细胞转录组数据开发心脏内在神经系统神经元的电生理计算模型库，填补了分子水平基因表达与细胞水平电生理功能之间的研究空白 | 模型依赖于转录组数据的阈值选择，可能影响离子通道组合的准确性 | 研究心脏内在神经系统在心脏调节和病理中的功能作用 | 心脏内在神经系统神经元 | 计算生物学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序 | 神经元电生理计算模型 | 转录组数据 | NA |
| 67 | 2025-07-12 |
FLASH radiation reprograms lipid metabolism and macrophage immunity and sensitizes medulloblastoma to CAR-T cell therapy
2025-Mar, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-025-00905-6
PMID:39910249
|
研究论文 | 本文探讨了FLASH放疗对髓母细胞瘤中巨噬细胞免疫和脂质代谢的重编程作用，以及其对CAR-T细胞疗法的增敏效果 | 首次揭示了FLASH放疗通过调节巨噬细胞脂质代谢逆转肿瘤免疫抑制的机制，并展示了其与CAR-T细胞疗法的协同效应 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探究FLASH放疗对肿瘤免疫微环境的影响及其与免疫治疗的协同作用 | 髓母细胞瘤小鼠模型中的巨噬细胞和CAR-T细胞 | 肿瘤免疫治疗 | 髓母细胞瘤 | 单细胞转录组分析，CAR-T细胞疗法 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量的小鼠模型 |
| 68 | 2025-07-11 |
Parenchymal and inflammatory responses to ozone exposure in the aging healthy and surfactant protein C mutant lung
2025-Mar-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00261.2024
PMID:39832482
|
研究论文 | 本研究探讨了臭氧暴露对健康老年小鼠和表面活性蛋白C突变小鼠肺部的结构和免疫反应的影响 | 结合年龄因素和基因突变，研究臭氧暴露对肺部的影响，并利用空间转录组学分析炎症和细胞外基质组织信号的变化 | 研究仅关注急性臭氧暴露的影响，未涉及长期暴露的效果 | 理解臭氧暴露在老年和基因突变个体中对肺部结构和免疫功能的影响 | 年轻、中年和老年小鼠，以及表面活性蛋白C突变小鼠 | 呼吸病理学 | 呼吸系统疾病 | 流式细胞术、空间转录组学 | NA | 生物学数据 | 不同年龄段的小鼠（年轻：8-14周，中年：44-52周，老年：>80周）和SP-C突变小鼠 |
| 69 | 2025-07-11 |
Effects of maternal edible THC consumption on offspring lung growth and function in a rhesus macaque model
2025-Mar-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00360.2024
PMID:39903192
|
研究论文 | 本研究通过恒河猴模型探讨了母体食用THC对后代肺生长和功能的影响 | 首次在恒河猴模型中系统评估产前THC暴露对后代肺发育和功能的长期影响，并揭示了表观遗传调控机制 | 样本量较小，且仅评估了单一剂量THC的影响 | 评估产前THC暴露对后代肺发育和功能的潜在危害 | 恒河猴及其后代 | 发育生物学 | 呼吸系统疾病 | MRI, RNAseq, 全基因组亚硫酸氢盐测序, 空间转录组学 | 恒河猴动物模型 | 影像数据、分子生物学数据 | 接受THC或安慰剂处理的怀孕恒河猴及其后代 |
| 70 | 2025-07-04 |
[Research Advances in the Replication of Animal Models for Periodontal Diseases]
2025-Mar-20, Sichuan da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Sichuan University. Medical science edition
DOI:10.12182/20250360103
PMID:40599292
|
综述 | 本文综述了近年来牙周病动物模型的复制方法及其特点，并提出了一个整合空间转录组学、单细胞测序和荧光成像技术的多模态评估框架 | 提出了整合空间转录组学、单细胞测序和荧光成像技术的多模态评估框架，以克服现有研究挑战 | 当前可用的牙周炎动物模型难以同时捕捉疾病复杂性、追踪动态修复过程并满足转化需求 | 研究牙周病的病理机制及治疗方法 | 啮齿类动物模型 | 牙周病研究 | 牙周病 | 空间转录组学、单细胞测序、荧光成像 | NA | NA | NA |
| 71 | 2025-07-04 |
Human Neonatal MR1T Cells Have Diverse TCR Usage, are Less Cytotoxic and are Unable to Respond to Many Common Childhood Pathogens
2025-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.17.643805
PMID:40166301
|
research paper | 该研究探讨了新生儿MR1T细胞的TCR使用多样性、细胞毒性降低以及对常见儿童病原体反应能力的不足 | 揭示了新生儿MR1T细胞与成人相比具有更广泛的TCR使用多样性、较低的细胞毒性和对常见儿童病原体反应能力的限制 | 研究样本量较小（n=5），且仅针对特定MR1-5-OP-RU-tetramer(+)细胞进行分析 | 了解新生儿MR1T细胞的免疫特性及其在新生儿败血症中的作用 | 新生儿脐带血和成人外周血中的MR1T细胞 | 免疫学 | 新生儿败血症 | 单细胞RNA测序/TCR测序（scRNA-seq/scTCR-seq） | NA | 基因表达数据和TCR序列数据 | 5例新生儿脐带血样本和5例成人外周血样本 |
| 72 | 2025-07-03 |
Peripartum dapagliflozin improves late-life maternal cardiovascular outcomes in a murine model of superimposed preeclampsia
2025-Mar-29, American journal of obstetrics and gynecology
IF:8.7Q1
DOI:10.1016/j.ajog.2025.03.035
PMID:40164294
|
研究论文 | 本研究探讨了在妊娠期和产后立即使用SGLT2抑制剂达格列净对叠加子痫前期小鼠模型心血管结局的短期和长期影响 | 首次在叠加子痫前期模型中测试了SGLT2抑制剂在围产期的心血管保护作用，并揭示了其抗纤维化和代谢调节的分子机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，结果需要进一步在人类临床试验中验证 | 评估达格列净在妊娠期和产后对叠加子痫前期心血管结局的改善作用 | BPH/2J小鼠模型（叠加子痫前期） | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 连续超声心动图、空间转录组学、Masson三色染色 | BPH/2J小鼠模型 | 生理参数、分子标记、组织病理学数据 | BPH/2J妊娠小鼠（具体数量未明确说明） |
| 73 | 2025-07-01 |
The Dyson equalizer: adaptive noise stabilization for low-rank signal detection and recovery
2025-Mar, Information and inference : a journal of the IMA
DOI:10.1093/imaiai/iaae036
PMID:39830802
|
研究论文 | 本文提出了一种自适应噪声稳定化方法，用于低秩信号检测和恢复 | 开发了一种数据驱动的自适应归一化程序，能够均衡数据矩阵行和列的平均噪声方差，支持广泛的噪声分布、方差模式和信号结构 | 未明确说明方法在极端异方差情况下的性能表现 | 解决异方差噪声环境下低秩信号检测和恢复的问题 | 数据矩阵中的低秩信号 | 机器学习 | NA | 随机矩阵理论 | NA | 矩阵数据 | 应用于单细胞RNA测序和空间转录组数据（具体样本量未说明） |
| 74 | 2025-06-30 |
Single-cell transcriptomics predict novel potential regulators of acute epithelial restitution in the ischemia-injured intestine
2025-Mar-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00194.2024
PMID:39853303
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学预测了缺血损伤肠道中急性上皮修复的新潜在调控因子 | 识别了吸收性肠上皮细胞亚群中表达细胞迁移途径的关键基因，并预测了其上游调控因子CSF-1 | 研究结果基于猪模型，尚未在人体中验证 | 探索缺血损伤肠道中年龄依赖性上皮修复的调控机制 | 幼年和新生猪的缺血损伤肠道上皮细胞 | 分子生物学 | 肠道缺血损伤 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 幼年和新生猪的肠道上皮细胞样本 |
| 75 | 2025-06-27 |
Accurate trajectory inference in time-series spatial transcriptomics with structurally-constrained optimal transport
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.19.644194
PMID:40166168
|
研究论文 | 提出了一种基于最优传输的时空轨迹推断方法SOCS，用于时间序列空间转录组学数据，以保持生物结构单元的完整性和基因表达相似性 | SOCS方法通过最优传输技术，解决了现有方法在时间序列空间转录组学数据中无法保持生物结构单元完整性的问题 | 未提及具体的数据集或实验规模，可能影响方法的普适性验证 | 提高时间序列空间转录组学数据中轨迹推断的准确性和生物结构单元的保持 | 时间序列空间转录组学数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 最优传输 | 基因表达数据 | NA |
| 76 | 2025-06-27 |
Single-cell-guided identification of logic-gated antigen combinations for designing effective and safe CAR therapy
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.19.644074
PMID:40568068
|
研究论文 | 本文提出了一种计算方法，利用单细胞转录组数据识别癌症特异性抗原逻辑门组合，以设计更有效和安全的CAR疗法 | 首次系统量化了所有可能的CAR电路的疗效和安全性，并展示了共享电路和个性化电路在肿瘤靶向效果上的差异 | 即使优化的共享电路对某些患者仍然不足 | 克服CAR T细胞疗法在实体瘤治疗中的限制，提高疗效和安全性 | 乳腺癌患者样本中的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 342例临床患者样本，约200万个细胞（包括>62万个肿瘤细胞） |
| 77 | 2025-06-27 |
Unveiling a novel cancer hallmark by evaluation of neural infiltration in cancer
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf082
PMID:40052442
|
研究论文 | 评估肿瘤微环境中神经浸润的程度，揭示其作为癌症标志物的作用 | 提出了一种预测癌症相关神经浸润的评分（C-Neural score），并揭示了其在癌症进展和免疫治疗中的潜在作用 | 研究基于RNA-seq数据，未涉及其他分子层面的验证 | 评估神经浸润在肿瘤微环境中的作用，并探索其作为癌症标志物的潜力 | 多种癌症类型的肿瘤微环境 | 癌症研究 | 多种癌症 | RNA-seq，单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据，单细胞RNA测序数据 | 40个批量RNA-seq数据集（涵盖10种癌症类型），55个单细胞RNA测序数据集 |
| 78 | 2025-06-27 |
Assessing spatial sequencing and imaging approaches to capture the molecular and pathological heterogeneity of archived cancer tissues
2025-03, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6383
PMID:39846232
|
research paper | 评估空间转录组学和成像方法在捕捉存档癌症组织分子和病理异质性中的应用 | 开发了一个癌症异质性研究流程，优化了两种测序协议以处理具有挑战性的FFPE组织，并评估了多种成像方法 | 研究仅针对皮肤来源的组织，且样本存储时间跨度较大（4至14年），可能影响RNA质量 | 探索空间转录组学在存档癌症组织中解析分子和病理异质性的应用 | 存档的福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）皮肤组织 | digital pathology | skin cancer | spatial transcriptomics (ST), multiplex RNAScope, CODEX | NA | RNA sequencing data, imaging data | 存档时间跨度4至14年的FFPE组织样本 |
| 79 | 2025-06-24 |
Immunosuppressive microenvironment of liver restrains chemotherapeutic efficacy in triple-negative breast cancer
2025-Mar-06, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010871
PMID:40050043
|
研究论文 | 本研究探讨了三阴性乳腺癌（TNBC）肝转移灶化疗效果较差的免疫微环境机制 | 首次揭示肝转移灶中CD8+T细胞浸润受阻与巨噬细胞活化降低的关联机制，并提出NET抑制剂与巨噬细胞激活剂的联合治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证 | 探究TNBC肝转移灶化疗敏感性降低的免疫微环境机制 | 三阴性乳腺癌肝转移灶与原发灶 | 肿瘤免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、流式细胞术、伤口愈合实验、集落形成实验 | 小鼠肿瘤模型 | RNA测序数据、图像数据、流式数据 | 公共数据库单细胞数据及实验小鼠模型 |
| 80 | 2025-06-24 |
Decoding the blueprints of embryo development with single-cell and spatial omics
2025-03, Seminars in cell & developmental biology
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.semcdb.2025.01.002
PMID:39889540
|
综述 | 本文深入探讨了单细胞和空间组学技术在胚胎发育研究中的最新进展和应用 | 综述了单细胞和空间多组学方法的最新技术进展，并系统整理了它们在胚胎发育领域的应用 | 未提及具体的技术限制或研究不足 | 探讨单细胞和空间组学技术在胚胎发育研究中的应用和潜力 | 胚胎发育过程中的细胞分化和基因表达变化 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据、多组学数据 | NA |