单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 726 篇文献，本页显示第 681 - 700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2025-10-07 |
Saltiness Enhancement of Soy Peptides by Modulating Amiloride-Insensitive Salt-Responsive Cells and Interacting with Cell Membranes
2025-Mar-05, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c12256
PMID:39993222
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研究论文 | 本研究探讨大豆肽E、DG和9AA通过调节阿米洛利不敏感盐响应细胞及与细胞膜相互作用的机制增强咸味感知 | 首次结合感官评价、钙成像、单细胞RNA测序和分子动力学模拟系统揭示大豆肽的咸味增强机制 | 仅研究三种大豆肽，未涵盖其他可能具有咸味增强潜力的肽类 | 探究大豆肽的咸味增强机制及其结构-功能关系 | 大豆肽E(EDEGEQPRPF)、DG(DEGEQPRPFP)和9AA(DEGEQPRPF) | 食品科学 | NA | 感官评价、钙成像、单细胞RNA测序、分子动力学模拟 | NA | 感官数据、成像数据、基因表达数据、分子模拟数据 | 三种大豆肽 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 682 | 2025-10-07 |
Single-cell Atlas of Developing Mouse Palates Reveals Cellular and Molecular Transitions in Periderm Cell Fate
2025-Mar-04, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf013
PMID:40037804
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了小鼠腭部发育过程中周皮细胞的细胞和分子转变机制 | 首次系统描绘了腭部发育过程中周皮细胞的四个亚群和两种不同的细胞命运轨迹，发现了claudin家族基因、Arhgap29和Pitx2在周皮细胞功能中的新作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究腭部发育过程中周皮细胞的分子机制和发育轨迹 | 发育中的小鼠腭部组织（胚胎期E10.5至E16.5） | 单细胞转录组学 | 腭裂 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠胚胎腭部组织（E10.5-E16.5多个时间点） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 683 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Tumor Heterogeneity and Immunosuppressive Microenvironment in Urothelial Carcinoma
2025-Mar, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.16436
PMID:39726326
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示尿路上皮癌的肿瘤异质性和免疫抑制微环境特征 | 首次在单细胞分辨率下系统比较了不同解剖来源尿路上皮癌的细胞组成差异，发现了具有EMT和癌症干细胞特征的EP9稀有上皮亚型及其预后价值 | 样本量较小（仅13例患者），缺乏功能验证实验 | 解析尿路上皮癌的细胞异质性和免疫微环境特征 | 膀胱尿路上皮癌、输尿管尿路上皮癌和肾盂尿路上皮癌患者组织样本 | 单细胞组学 | 尿路上皮癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 13例患者（4例膀胱UC，5例输尿管UC，4例肾盂UC） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 684 | 2025-10-07 |
Unveiling tumor-infiltrating immune cell-driven immune-mediated drug resistance in clear cell renal cell carcinoma: prognostic insights and therapeutic strategies
2025-Mar-01, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01890-z
PMID:40025304
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研究论文 | 本研究通过整合转录组和单细胞RNA测序数据，探索肿瘤浸润免疫细胞在透明细胞肾细胞癌中介导免疫耐药性的机制 | 构建了基于肿瘤浸润免疫细胞相关RNA的预后模型，在预测性能上优于53个已发表模型，并揭示了免疫代谢重编程与基因组改变的关联 | 研究依赖于回顾性队列数据，需要前瞻性临床验证 | 探索ccRCC中肿瘤浸润免疫细胞介导的耐药机制及其预后和治疗意义 | 透明细胞肾细胞癌患者及其肿瘤微环境 | 生物信息学 | 肾细胞癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 机器学习 | 机器学习算法 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 多个队列数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 685 | 2025-10-07 |
Association between cancer-associated fibroblasts and prognosis of neoadjuvant chemoradiotherapy in esophageal squamous cell carcinoma: a bioinformatics analysis based on single-cell RNA sequencing
2025-Mar-01, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03709-x
PMID:40025479
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析食管鳞癌新辅助放化疗后肿瘤微环境中癌症相关成纤维细胞与预后的关联 | 首次在单细胞水平系统表征NCRT后ESCC微环境中CAF亚型，并建立基于myCAFs标记基因的预后模型 | 需要进一步研究验证发现结果并探索其临床意义 | 研究新辅助放化疗对食管鳞癌微环境的影响 | 食管鳞状细胞癌(ESCC)患者样本 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | 预后特征模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 686 | 2025-10-07 |
Identification and multi-omics analysis of essential coding and long non-coding genes in colorectal cancer
2025-Mar, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.101938
PMID:40034256
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研究论文 | 通过整合CRISPR筛选和单细胞测序数据，识别结直肠癌中的必需编码基因和长非编码基因，并进行多组学分析 | 首次在单细胞水平系统识别结直肠癌必需基因，结合多组学数据揭示其在肿瘤微环境中的调控网络 | 研究主要基于细胞系数据，在体验证仍需进一步完善 | 识别结直肠癌中的必需基因并探索其作为治疗靶点的潜力 | 结直肠癌细胞系和组织样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | CRISPR/Cas9筛选, 单细胞RNA测序, 多组学分析 | 超几何检验, 个性化PageRank算法 | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | 8个全基因组CRISPR数据集和结直肠癌组织单细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR筛选 | NA | NA |
| 687 | 2025-10-07 |
Profiling Multiple CD8+ T-cell Functional Dimensions Enhances Breast Cancer Immune Assessment
2025-Mar-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0235
PMID:39715293
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研究论文 | 开发基于bulk RNA测序的FuncDimen模型评估CD8+ T细胞多功能维度，提升乳腺癌免疫评估 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据开发多维度功能评估模型，克服传统CD8+ T细胞丰度评估的局限性 | 临床应用中单细胞RNA测序技术存在限制 | 提升乳腺癌抗肿瘤免疫力评估和免疫治疗反应预测 | 乳腺癌患者CD8+ T细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 免疫荧光, 成像质谱流式 | FuncDimen模型, FuncAggre评分模型 | RNA测序数据, 免疫组化数据 | 乳腺癌队列和外部数据库样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 688 | 2024-09-13 |
From genes to geography: Mapping allergic disease landscapes with spatial transcriptomics
2025-Mar, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.08.025
PMID:39260791
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 689 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell RNA sequencing and network pharmacology to elucidate the effect of Yantiao Formula on alleviating ALI by regulating the polarization of alveolar macrophages
2025-Mar-13, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.119436
PMID:39914692
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和网络药理学方法，探讨验条方通过调节肺泡巨噬细胞极化缓解脓毒症诱导急性肺损伤的作用机制 | 首次结合单细胞RNA测序、网络药理学和分子对接技术系统研究验条方治疗急性肺损伤的多成分-多靶点作用机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，临床验证尚需进一步研究 | 探索验条方治疗脓毒症诱导急性肺损伤的潜在分子机制 | 验条方化学成分、脓毒症诱导急性肺损伤小鼠模型、NR8383细胞 | 生物信息学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序, 网络药理学, 分子对接, 免疫组织化学, UPLC | NA | 基因表达数据, 化学组分数据 | NA | Waters | UPLC, 单细胞RNA测序 | ACQUITY UPLC I-Class | ACQUITY UPLC I-Class系统用于化学成分表征 |
| 690 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing in autoimmune diseases: New insights and challenges
2025-Mar, Pharmacology & therapeutics
IF:12.0Q1
DOI:10.1016/j.pharmthera.2025.108807
PMID:39894174
|
综述 | 本文探讨单细胞RNA测序技术在自身免疫性疾病研究中的应用与挑战 | 系统阐述scRNA-seq如何揭示自身免疫性疾病中细胞异质性和细胞通讯网络的新机制 | 需要解决scRNA-seq技术本身的局限性才能实现进一步突破 | 研究单细胞RNA测序在自身免疫性疾病中的潜在应用价值 | 自身免疫性疾病相关的各类细胞类型 | 单细胞组学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 691 | 2025-10-07 |
Upregulation of LSP1 in AML cells enhances AML resistance to sorafenib and promotes apoptosis in CD8+ T cells
2025-Mar-26, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114255
PMID:39952006
|
研究论文 | 本研究通过RNA-seq和单细胞RNA-seq分析发现LSP1是AML的重要免疫相关标志物，影响索拉非尼耐药性和CD8+T细胞功能 | 首次揭示LSP1在AML免疫抑制微环境中的关键作用，及其对索拉非尼耐药性和CD8+T细胞凋亡的影响 | 未明确说明样本数量和研究人群的具体特征 | 探索AML免疫抑制肿瘤微环境的机制并寻找免疫治疗新靶点 | 急性髓系白血病(AML)细胞和CD8+T细胞 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 692 | 2024-10-04 |
A Single-Cell RNA Sequencing Atlas of the Chronic Obstructive Pulmonary Disease Distal Lung to Predict Cell-Cell Communication
2025-Mar, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0232LE
PMID:39356793
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 693 | 2025-10-07 |
Single-cell sequencing revealed the necessity of macrophages in brain microenvironment remodeling by breast cancer metastasis
2025-Mar, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102287
PMID:39837060
|
研究论文 | 通过单细胞测序揭示巨噬细胞在乳腺癌脑转移微环境重塑中的必要性 | 首次在小鼠乳腺癌脑转移模型中实施单细胞RNA测序，发现巨噬细胞亚群在中枢神经系统的变化及癌细胞对肿瘤微环境细胞互作的重塑 | 研究样本量有限，仅重新分析了三个脑外科标本数据并使用小鼠模型 | 全面研究乳腺癌脑转移的肿瘤微环境，识别促进脑转移的促肿瘤机制和关键分子 | 乳腺癌脑转移患者手术标本和小鼠模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 三个脑外科标本和一个小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 694 | 2025-10-07 |
Comprehensive analysis and experiments identified ANXA1 as an unfavorable prognosticator in glioma
2025-Mar, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102286
PMID:39842212
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证ANXA1在胶质瘤中的促癌作用及预后价值 | 首次结合单细胞测序数据和功能实验系统揭示ANXA1在胶质瘤恶性进展中的关键作用 | ANXA1在胶质瘤中的促癌机制及其与患者功能状态的相关性仍需进一步研究 | 探讨ANXA1在胶质瘤中的预后价值和生物学功能 | 胶质瘤患者样本、胶质瘤细胞系、动物模型 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 实时定量PCR, Western blotting, 单细胞测序, 慢病毒载体, 伤口愈合实验, Transwell实验 | NA | 基因表达数据, 实验数据 | 两个患者队列, GSE162631数据集样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 695 | 2025-10-07 |
CD47 is a tumor cell-derived exosomal signature and regulates tumor immune microenvironment and immunotherapy responses
2025-Mar, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102291
PMID:39864342
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研究论文 | 本研究揭示CD47作为肿瘤源性外泌体标志物，可区分免疫热肿瘤和冷肿瘤并预测免疫治疗反应 | 首次发现CD47是肿瘤源性外泌体特异性标志物，能够有效区分免疫热/冷肿瘤并预测免疫治疗敏感性 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证机制 | 探索肿瘤源性外泌体标志物在肿瘤免疫微环境调控和免疫治疗反应中的作用 | 卵巢癌、乳腺癌及其他妇科癌症患者 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌、乳腺癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析、组织芯片 | NA | 转录组数据、单细胞测序数据、临床数据 | 多个癌症队列的大规模数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 696 | 2025-10-07 |
Cellular heterogeneity and communication networks in gastric cancer: Single-cell analysis reveals β-hydroxybutyrylation-associated genes and immune infiltration characteristics
2025-Mar, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102270
PMID:39884220
|
研究论文 | 通过单细胞测序分析胃癌细胞异质性和通讯网络，揭示β-羟基丁酰化相关基因与免疫浸润特征 | 首次在胃癌中发现20个β-羟基丁酰化相关基因，并构建基于这些基因的风险评分模型 | 样本量相对有限，需要进一步验证 | 解析胃癌细胞异质性及其与肿瘤微环境的相互作用 | 胃癌细胞和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序 | 风险评分模型 | 单细胞基因表达数据 | 189,700个单细胞图谱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 697 | 2025-10-07 |
A Unique Signature for Cancer-Associated Fibroblasts in Melanoma Metastases
2025-03, Pigment cell & melanoma research
IF:3.9Q2
DOI:10.1111/pcmr.70002
PMID:39924882
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析黑色素瘤原发灶和肺转移灶中的癌症相关成纤维细胞，揭示了转移灶特异性CAF的独特特征 | 首次系统比较黑色素瘤原发灶和转移灶中CAF的转录特征，发现转移灶特异性CAF亚群及其与中性粒细胞的肿瘤依赖性串扰机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探索黑色素瘤转移过程中癌症相关成纤维细胞的异质性和功能特征 | 小鼠黑色素瘤原发灶和肺转移灶中的癌症相关成纤维细胞，以及人类黑色素瘤转移样本 | 单细胞生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约8400个CAF和正常成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 698 | 2025-10-07 |
Pan-cancer characterization of m6A-mediated regulation of T cell exhaustion dynamics and clinical relevancies in human cancers
2025-Mar-11, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2025.102465
PMID:39995977
|
研究论文 | 通过整合多组学数据对m6A修饰在T细胞耗竭动态调控中的泛癌作用进行系统性分析 | 首次在泛癌层面揭示m6A修饰与T细胞耗竭动态的相互作用，并基于此识别出三个具有不同临床预后的分子亚型 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证m6A调控T细胞耗竭的具体机制 | 探索m6A修饰在T细胞耗竭动态调控中的作用及其临床相关性 | 人类多种癌症类型中的T细胞耗竭动态 | 生物信息学 | 泛癌分析 | 单细胞RNA测序,多组学数据分析 | 多变量分析 | 多组学数据,单细胞RNA测序数据,免疫治疗数据集 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 699 | 2025-10-07 |
Liver transcriptome analysis reveals PSC-attributed gene set associated with fibrosis progression
2025-Mar, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101267
PMID:39996122
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研究论文 | 通过肝脏转录组分析识别与原发性硬化性胆管炎胆道纤维化进展相关的特异性基因特征 | 首次系统识别PSC特异性胆道纤维化基因特征，并通过单细胞RNA测序数据揭示不同细胞类型在纤维化中的特异性作用 | 样本量相对有限，需要进一步功能验证研究 | 识别与原发性硬化性胆管炎胆道纤维化进展相关的特异性基因特征 | 原发性硬化性胆管炎、原发性胆汁性胆管炎和代谢功能障碍相关脂肪性肝病患者的肝脏活检样本 | 转录组学 | 肝脏疾病 | RNA测序，单细胞RNA测序，差异基因表达分析 | NA | 转录组数据 | 47例肝脏活检（PSC 16例，PBC 15例，MASLD 16例），外部验证集73例PSC样本 | NA | RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 700 | 2025-10-07 |
Intratumoral Injection of Cytotoxic Drugs Plus Hapten Elicits Significant Immune Responses in Sentinel Lymph Nodes: Implications for Cancer Immunotherapy
2025-Mar-01, Pancreas
IF:1.7Q3
DOI:10.1097/MPA.0000000000002439
PMID:39999315
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析前哨淋巴结在胰腺癌原发灶经细胞毒性药物加半抗原瘤内注射治疗后的细胞和基因组变化 | 首次结合细胞毒性药物与半抗原进行瘤内注射，系统揭示前哨淋巴结微环境的动态重组机制 | 研究仅针对胰腺癌模型，未验证其他癌症类型的普适性 | 探索前哨淋巴结在癌症免疫治疗中的作用机制及远隔效应 | 胰腺癌患者的前哨淋巴结 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |